九州大学-研究者情報 [手島康介 (教授) 理学研究院生物科学部門]

Teshima KM, Innan H, The coalescent with selection on copy number variants, Genetics, 190, 3, 1077-86, 2012.05, We develop a coalescent-based simulation tool to generate patterns of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a wide region encompassing both the original and duplicated genes. Selection on the new duplicated copy and interlocus gene conversion between the two copies are incorporated. This simulation enables us to explore how selection on duplicated copies affects the pattern of SNPs. The fixation of an advantageous duplicated copy causes a strong reduction in polymorphism not only in the duplicated copy but also in its flanking regions, which is a typical signature of a selective sweep by positive selection. After fixation, polymorphism gradually increases by accumulating neutral mutations and eventually reaches the equilibrium value if there is no gene conversion. When gene conversion is active, the number of SNPs in the duplicated copy quickly increases by transferring SNPs from the original copy; therefore, the time when we can recognize the signature of selection is decreased. Because this effect of gene conversion is restricted only to the duplicated region, more power to detect selection is expected if a flanking region to the duplicated copy is used..

主要総説, 論評, 解説, 書評, 報告書等

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主要学会発表等

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1.	手島康介, 集団遺伝学的解析：理論編, ゲノム多様性データの統計解析, 2014.12.
2.	手島康介, Chakraborty Ranajit, Y-STRハプロタイプ間の不一致マーカー数の分布に関する研究, 日本遺伝学会, 2014.09.
3.	佐藤衣里, 亀井敦哉, 鈴木節子, 須貝杏子, 酒井敦, 猪股伸幸, 山本進一, 手島康介, 舘田英典, 常緑広葉樹イスノキ(Distylium racemosum)及びシマイスノキ(D. lepidotum)の集団遺伝学的解析, 日本遺伝学会, 2013.09.

作品・ソフトウェア・データベース等

1.	手島康介, 印南秀樹, mbs, 2009.05 集団サイズの変化や自然選択の影響を受けた遺伝子を作成するシミュレーションプログラム, [URL].

学会活動

所属学会名

日本バイオインフォマティクス学会

森林遺伝育種学会

日本進化学会

日本遺伝学会

学協会役員等への就任

2018.10, 日本進化学会, 編集委員.

2021.04～2023.03, 日本遺伝学会, 評議員.

学会大会・会議・シンポジウム等における役割

2023.09.22～2023.09.23, 第4回木村資生記念進化学セミナー, 企画立案・運営等.

2023.08.31～2023.09.03, 日本進化学会第 25 回大会, パネル司会・セッションチェア等, 審査・評価.

2019.08.03～2019.08.05, 木村資生記念進化学セミナー, 企画立案・運営等, その他.

2018.09.01～2018.09.03, 木村資生記念進化学セミナー, 企画立案・運営等, その他.

2017.08.02～2017.08.05, 木村資生記念進化学セミナー, 企画立案・運営等, その他.

2016.12.05～2016.12.06, ゲノム多様性解析ワークショップ, 企画立案・運営等, その他.

2015.12.16～2015.12.17, ゲノム多様性データの統計解析, 企画立案・運営等, その他.

2014.12.04～2014.12.05, ゲノム多様性データの統計解析, 企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等, その他.

2013.12.20～2013.12.21, ゲノム多様性のデータ解析, 企画立案・運営等, その他.

2009.09.16～2009.09.18, 日本遺伝学会, その他.

学会誌・雑誌・著書の編集への参加状況

2018.10, 日本進化学ニュースレター, 国内, 編集委員.

学術論文等の審査

年度	外国語雑誌査読論文数	合計
2023年度	1	1
2022年度	2	2
2020年度	1	1
2019年度	2	2
2018年度	3	3
2017年度	4	4
2016年度	7	7

研究資金

科学研究費補助金の採択状況(文部科学省、日本学術振興会)

2023年度～2025年度, 基盤研究(C), 代表, ゲノムデータから適応進化領域を網羅的に探索する方法の開発.

2020年度～2023年度, 基盤研究(C), 分担, 卵子が持つ精子DNA損傷を修復する能力の分子機構の解明.

2019年度～2021年度, 基盤研究(C), 代表, 連続的に分布する生物の集団遺伝学.

2018年度～2018年度, 基盤研究(B), 分担, 最終氷期以降の分布拡大に伴う森林樹木の遺伝的適応に関する集団遺伝学的研究.

2015年度～2017年度, 基盤研究(A), 分担, 霊長類感覚多重遺伝子族の大規模集団解析による嗅覚・味覚・色覚の総体的進化像の解明.

2014年度～2017年度, 基盤研究(B), 分担, アンプリコンシークエンス解析を用いた樹木集団進化に関する集団遺伝学的研究.

2015年度～2017年度, 基盤研究(C), 霊長類感覚多重遺伝子族の大規模集団解析による嗅覚・味覚・色覚の総体的進化像の解明.

2014年度～2017年度, 基盤研究(C), アンプリコンシークエンス解析を用いた樹木集団進化に関する集団遺伝学的研究.

2013年度～2016年度, 若手研究(B), 代表, 非平衡状態にある非モデル生物の集団史の推定.

2012年度～2015年度, 基盤研究(C), 分担, 昆虫ゲノムにおける転移因子の動向による異種交雑の指標確立.

2012年度～2014年度, 基盤研究(A), 分担, 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学.

2012年度～2014年度, 基盤研究(C), 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学.

2010年度～2012年度, 基盤研究(C), 最終氷期以降の分布拡大に伴う森林樹木の遺伝的適応に関する集団遺伝学的研究.

2009年度～2011年度, 若手研究(B), 遺伝子重複によるゲノム進化の解明.

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pure2017年10月2日から、「九州大学研究者情報」を補完するデータベースとして、Elsevier社の「Pure」による研究業績の公開を開始しました。

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