ゲノム科学、エピゲノミクス、合成ゲノミクス
キーワード：ゲノム、エピゲノム、オミクス、合成ゲノミクス
2004.04～2025.03.
| 伊藤 隆司（いとう たかし） | データ更新日：2024.03.28 |
主な研究テーマ
従事しているプロジェクト研究
ゲノム配列の新解釈による設計自由度と進化可能性の獲得
2019.10～2025.03, 代表者：伊藤隆司, 九州大学
出芽酵母をモデルに、CRISPR-Casシステムと２ハイブリッド法と塩基修飾酵素を用いて、ゲノム中の標的領域を重複させる技術、標的領域のゲノム配列に選択圧をかける技術、標的領域の全体に亘って突然変異を導入する技術を開発します。これら３つの新技術を活用して、遺伝子重複による適応進化の構成的理解を深めるとともに、進化可能性に富んだゲノムを制約なく設計・合成するための方法論の創出を目指します。.
2019.10～2025.03, 代表者：伊藤隆司, 九州大学
出芽酵母をモデルに、CRISPR-Casシステムと２ハイブリッド法と塩基修飾酵素を用いて、ゲノム中の標的領域を重複させる技術、標的領域のゲノム配列に選択圧をかける技術、標的領域の全体に亘って突然変異を導入する技術を開発します。これら３つの新技術を活用して、遺伝子重複による適応進化の構成的理解を深めるとともに、進化可能性に富んだゲノムを制約なく設計・合成するための方法論の創出を目指します。.
先進メチローム解析の支援と高度化
2017.06～2022.03, 代表者：伊藤隆司.
2017.06～2022.03, 代表者：伊藤隆司.
International Human Epigenome Consortium
2011.10～2017.03, 代表者：NA, NA
国際ヒトエピゲノムコンソーシアムThe International Human Epigenome Consortium (IHEC：通称アイヘック)は、様々な病気や生命現象に関わるヒトエピゲノムの情報を世界各国の研究者で協調・分担して解析し、いまだかつてない高精度のヒトエピゲノム地図をつくることを目的とした国際的な研究組織です。2013年現在は、米国、EU、イタリア、韓国、ドイツ、カナダ、日本がIHECに正式参加しています。IHECの参加メンバーは、解析する細胞・組織を分担し、解析技術を標準化し、アウトリーチ活動も一緒に行い、研究を推進しています。.
2011.10～2017.03, 代表者：NA, NA
国際ヒトエピゲノムコンソーシアムThe International Human Epigenome Consortium (IHEC：通称アイヘック)は、様々な病気や生命現象に関わるヒトエピゲノムの情報を世界各国の研究者で協調・分担して解析し、いまだかつてない高精度のヒトエピゲノム地図をつくることを目的とした国際的な研究組織です。2013年現在は、米国、EU、イタリア、韓国、ドイツ、カナダ、日本がIHECに正式参加しています。IHECの参加メンバーは、解析する細胞・組織を分担し、解析技術を標準化し、アウトリーチ活動も一緒に行い、研究を推進しています。.
研究業績
作品・ソフトウェア・データベース等
| 1. | Hiromitsu Araki, Takashi Ito, Methylica, 2019.03, We have developed Methylica, a GUI-based tool for independent component analysis (ICA) of methylome data generated by either whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) or Illumina methylation arrays. Methylica not only performs ICA-based sample clustering but also identifies an independent component (IC) (i.e. methylomic signature) characteristic to a user-defined subset of the samples. Major contributors to such an IC can serve as methylation markers for the subset, which may imply underlying biological processes. Methylica would thus be a powerful tool to ana-lyze methylome data of samples comprising multiple subsets, such as those of cancers.. |
学会活動
学協会役員等への就任
2022.06～2025.05, 日本エピジェネティクス研究会, 代表幹事.
2014.11, 日本生化学会, 評議員.
2011.04～2021.03, 日本学術振興会産学研究委員会ゲノムテクノロジー第164委員会, 幹事.
2007.04～2019.06, 日本エピジェネティクス研究会, 幹事.
学会大会・会議・シンポジウム等における役割
2022.06.09～2022.06.10, 第15回日本エピジェネティクス研究会年会, 年会長.
2019.12.03～2019.12.06, 第42回日本分子生物学会年会, プログラム委員長.
2019.06.25～2019.06.27, The 13th International Workshop on Advanced Genomics, 組織委員・座長.
2017.06.27～2017.06.29, The 12th International Workshop on Advanced Genomics, 組織委員.
2017.06.27～2017.06.29, The 12th International Workshop on Advanced Genomics, 座長.
2015.05.20～2015.05.22, The 11th International Workshop on Advanced Genomics, 組織委員.
2013.05.23～2013.05.23, The 10th International Workshop on Advanced Genomics, 座長（Chairmanship）.
2013.05.23～2013.05.23, The 10th International Workshop on Advanced Genomics, 組織委員.
学会誌・雑誌・著書の編集への参加状況
2006.01, Molecular Genetics and Genomics, 国際, 編集委員.
2006.01, DNA Research, 国際, 編集委員.
学術論文等の審査
| 年度 | 外国語雑誌査読論文数 | 日本語雑誌査読論文数 | 国際会議録査読論文数 | 国内会議録査読論文数 | 合計 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2020年度 | 10 | 10 | |||
| 2019年度 | 10 | 10 | |||
| 2018年度 | 10 | 10 | |||
| 2017年度 | 10 | 10 | |||
| 2016年度 | 10 | 10 | |||
| 2015年度 | 7 | 7 | |||
| 2014年度 | 5 | 5 | |||
| 2013年度 | 4 | 0 | 0 | 0 | 4 |
その他の研究活動
海外渡航状況, 海外での教育研究歴
Crowne Plaza Brussels - Le Palace, Belgium, 2016.09～2016.09.
Pusan National University, SouthKorea, 2016.07～2016.07.
Renaissance Vancouver Harbourside Hotel, Canada, 2014.10～2014.10.
Stanford University, UnitedStatesofAmerica, 2013.09～2013.09.
Kaiserin Friedrich-Haus, Germany, 2013.11～2013.11.
外国人研究者等の受入れ状況
2020.12～2021.05, 1ヶ月以上, Minia University, Egypt, 外国政府・外国研究機関・国際機関.
2013.07～2013.07, 2週間以上1ヶ月未満, University of Kansas, UnitedStatesofAmerica, 外国政府・外国研究機関・国際機関.
研究資金
科学研究費補助金の採択状況(文部科学省、日本学術振興会)
2022年度～2023年度, 挑戦的研究（萌芽）, 代表, エピジェネティクスの基本動作原理に基づくメチロームの合成.
2019年度～2020年度, 挑戦的研究（萌芽）, 代表, 不活性化Cas9によるゲノム不安定性誘導機構の解明とそれに基づく構造多型の操作.
2017年度～2021年度, 新学術領域研究, 代表, 次世代エピゲノム解析技術の開発とその応用.
2017年度～2018年度, 挑戦的研究（萌芽）, 代表, 染色体機能要素のリコーディングによる遺伝子ゲノム操作の革新.
2017年度～2020年度, 基盤研究(A), 代表, CRISPRを利用した4Dヌクレオーム解析.
2016年度～2017年度, 挑戦的萌芽研究, 代表, 新しい原理に基づくヌクレオソーム中心と転写因子結合部位の網羅的統合解析.
2015年度～2016年度, 挑戦的萌芽研究, 代表, サブシングルセル解析による二倍体メチロームの解明.
2014年度～2017年度, 基盤研究(A), 代表, CRISPRを利用したエピゲノムの読み出しと書き込み.
2014年度～2014年度, 挑戦的萌芽研究, 代表, ＤＮＡメチル化紋様形成機構の構成的理解：合成エピゲノミクスへの挑戦.
2013年度～2013年度, 挑戦的萌芽研究, 代表, 人工遺伝子回路によって誘導される適応現象のトランスオミクス解析.
2011年度～2013年度, 基盤研究(B), 代表, ５ヒドロキシメチルシトシンの解析：ゲノムワイドマッピングと結合タンパク質の探索.
競争的資金(受託研究を含む)の採択状況
2019年度～2024年度, 戦略的創造研究推進事業 (文部科学省), 代表, ゲノム配列の新解釈による設計自由度と進化可能性の獲得.
2017年度～2021年度, 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業, 代表, 先進メチローム解析の支援と高度化.
2014年度～2016年度, 研究開発施設共用等促進費補助金・創薬等支援技術基盤プラットフォーム, 代表, メチローム解析の高度化と支援.
2013年度～2017年度, 研究成果展開事業 先端計測分析技術・機器開発プログラム, 代表, 高感度エピゲノム解析のためのマイクロ化学システム開発.
2011年度～2016年度, 戦略的創造研究推進事業 (文部科学省), 分担, ヒト消化器上皮細胞の標準エピゲノム解析と解析技術開発.
2009年度～2013年度, 革新的タンパク質・細胞解析研究イニシアティブ 革新的細胞解析研究プログラム（セルイノベーション）, 代表, 細胞解析研究革新のための高性能エピゲノムシーケンス技術の開発.
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