2024/06/10 更新

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ヤナカ　サエコ
谷中 冴子
YANAKA SAEKO
所属
薬学研究院 臨床薬学部門 准教授
職名
准教授
連絡先
メールアドレス
電話番号
0926426554
プロフィール
グローバルヘルスケア分野での活動を通じた研究・教育
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学位

  • 博士（生命科学）

経歴

  • 2011年4月〜2013年3月 日本学術振興会特別研究員（DC2） 東京大学大学院新領域創成科学研究科に所属 2013年4月〜2015年6月日本学術振興会特別研究員（PD）　（公財）サントリー生命科学財団、京都大学工学研究科に所属 2015年7月〜2017年10月 自然科学研究機構　分子科学研究所　特任助教 2017年11月〜 自然科学研究機構　分子科学研究所　助教

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ：構造生物学的アプローチによる動的な分子集合体を介した抗体の機能発現の分子機構の解明

    研究キーワード：抗体、分子集合、構造生物学

    研究期間： 2015年7月 - 2026年9月

受賞

  • 物理系薬学部会奨励賞

    2021年3月   日本薬学会 物理系薬学部会   抗体の3次元構造と相互作用のダイナミクスを解明する方法の開発と抗体の高機能化への展開

  • 第32回井上研究奨励賞

    2015年2月   井上科学振興財団  

  • 若手ポスター賞Ⅰ

    2013年11月   日本核磁気共鳴学会  

  • 若手奨励賞

    2013年6月   日本蛋白質科学会  

  • 第四回"Merck Award for Young Biochemistry Researcher"優秀賞

    2011年9月   メルク株式会社  

  • 修士論文発表会・優秀研究論文賞

    2010年3月   東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻  

  • 英語論文発表会・最優秀賞

    2008年12月   東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻  

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論文

  • Negative interference with antibody-dependent cellular cytotoxicity mediated by rituximab from its interactions with human serum proteins

    Saeko Yanaka, Rina Yogo, Hirokazu Yagi, Masayoshi Onitsuka, Natsumi Wakaizumi, Yuki Yamaguchi, Susumu Uchiyama, Koichi Kato

    Frontiers in Immunology   14   2023年1月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3389/fimmu.2023.1090898

  • Quantitative Visualization of the Interaction between Complement Component C1 and Immunoglobulin G: The Effect of CH1 Domain Deletion

    Saeko Yanaka, Shigetaka Nishiguchi, Rina Yogo, Hiroki Watanabe, Jiana Shen, Hirokazu Yagi, Takayuki Uchihashi, Koichi Kato

    International Journal of Molecular Sciences   23 ( 4 )   2090 - 2090   2022年2月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/ijms23042090

  • Glutamine-free mammalian expression of recombinant glycoproteins with uniform isotope labeling: an application for NMR analysis of pharmaceutically relevant Fc glycoforms of human immunoglobulin G1 国際誌

    Saeko Yanaka, Hirokazu Yagi, Rina Yogo, Masayoshi Onitsuka, Koichi Kato

    Journal of Biomolecular NMR   76 ( 1-2 )   17 - 22   2022年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10858-021-00387-5

  • NMR assignments of the N-glycans of the Fc fragment of mouse immunoglobulin G2b glycoprotein. 国際誌

    Saeko Yanaka, Yoshiki Yamaguchi, Takeshi Takizawa, Yohei Miyanoiri, Rina Yogo, Ichio Shimada, Koichi Kato

    Biomolecular NMR assignments   15 ( 1 )   187 - 192   2021年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s12104-020-10004-5

  • Biophysical characterization of dynamic structures of immunoglobulin G. 査読 国際誌

    Saeko Yanaka, Rina Yogo, Koichi Kato

    Biophysical reviews   2020年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s12551-020-00698-1

  • On-Membrane Dynamic Interplay between Anti-GM1 IgG Antibodies and Complement Component C1q 査読

    Saeko Yanaka, Rina Yogo, Hiroki Watanabe, Yuki Taniguchi, Tadashi Satoh, Naoko Komura, Hiromune Ando, Hirokazu Yagi, Nobuhiro Yuki, Takayuki Uchihashi, Koichi Kato

    International Journal of Molecular Sciences   21 ( 1 )   147 - 147   2019年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/ijms21010147

  • The Fab portion of immunoglobulin G contributes to its binding to Fcγ receptor III 査読

    9 ( 1 )   11957   2019年12月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1038/s41598-019-48323-w

  • Dynamic Views of the Fc Region of Immunoglobulin G Provided by Experimental and Computational Observations 査読

    Saeko Yanaka, Rina Yogo, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura, Yohei Miyanoiri, Hirokazu Yagi, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato

    Antibodies   8 ( 3 )   2019年7月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/antib8030039

  • Stable isotope labeling approaches for NMR characterization of glycoproteins using eukaryotic expression systems. 査読

    Yanaka S, Yagi H, Yogo R, Yagi-Utsumi M, Kato K

    Journal of biomolecular NMR   71 ( 3 )   193 - 202   2018年2月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s10858-018-0169-2

  • NMR Detection of Semi-Specific Antibody Interactions in Serum Environments. 査読

    Yanaka S, Yamazaki T, Yogo R, Noda M, Uchiyama S, Yagi H, Kato K

    Molecules (Basel, Switzerland)   22 ( 10 )   2017年9月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/molecules22101619

  • Identification of potential C1-binding sites in the immunoglobulin CL domains

    Saeko Yanaka, Atsuji Kodama, Shigetaka Nishiguchi, Rina Hiramine, Jiana Shen, Pornthip Boonsri, Duckyong Sung, Yukiko Isono, Hirokazu Yagi, Yohei Miyanoiri, Takayuki Uchihashi, Koichi Kato

    International Immunology   2024年4月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/intimm/dxae017

  • Quantitative Analysis of Therapeutic Antibody Interactions with Fcγ Receptors Using High-Speed Atomic Force Microscopy.

    47 ( 1 )   334 - 338   2024年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    This study employed high-speed atomic force microscopy to quantitatively analyze the interactions between therapeutic antibodies and Fcγ receptors (FcγRs). Antibodies are essential components of the immune system and are integral to biopharmaceuticals. The focus of this study was on immunoglobulin G molecules, which are crucial for antigen binding via the Fab segments and cytotoxic functions through their Fc portions. We conducted real-time, label-free observations of the interactions of rituximab and mogamulizumab with the recombinant FcγRIIIa and FcγRIIa. The dwell times of FcγR binding were measured at the single-molecule level, which revealed an extended interaction duration of mogamulizumab with FcγRIIIa compared with that of rituximab. This is linked to enhanced antibody-dependent cellular cytotoxicity that is attributed to the absence of the core fucosylation of Fc-linked N-glycan. This study also emphasizes the crucial role of the Fab segments in the interaction with FcγRIIa as well as that with FcγRIIIa. This approach provided quantitative insight into therapeutic antibody interactions and exemplified kinetic proofreading, where cellular discrimination relies on ligand residence times. Observing the dwell times of antibodies on the effector molecules has emerged as a robust indicator of therapeutic antibody efficacy. Ultimately, these findings pave the way for the development of refined therapeutic antibodies with tailored interactions with specific FcγRs. This research contributes to the advancement of biopharmaceutical antibody design and optimizing antibody-based treatments for enhanced efficacy and precision.

    DOI： 10.1248/bpb.b23-00751

  • Mutational and Environmental Effects on the Dynamic Conformational Distributions of Lys48-Linked Ubiquitin Chains

    Methanee Hiranyakorn, Maho Yagi-Utsumi, Saeko Yanaka, Naoya Ohtsuka, Norie Momiyama, Tadashi Satoh, Koichi Kato

    International Journal of Molecular Sciences   24 ( 7 )   6075   2023年3月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/ijms24076075

  • The B Domain of Protein A Retains Residual Structures in 6 M Guanidinium Chloride as Revealed by Hydrogen/Deuterium-Exchange NMR Spectroscopy. 国際誌

    Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato, Kunihiro Kuwajima

    Protein science : a publication of the Protein Society   e4569   2023年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/pro.4569

  • The Fab portion of immunoglobulin G has sites in the CL domain that interact with Fc gamma receptor IIIa

    Yuki Yamaguchi, Natsumi Wakaizumi, Mine Irisa, Takahiro Maruno, Mari Shimada, Koya Shintani, Haruka Nishiumi, Rina Yogo, Saeko Yanaka, Daisuke Higo, Tetsuo Torisu, Koichi Kato, Susumu Uchiyama

    mAbs   14 ( 1 )   2022年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1080/19420862.2022.2038531

  • Four-dimensional Structures and Molecular Designs of Glycans

    Saeko Yanaka

    Trends in Glycoscience and Glycotechnology   34 ( 201 )   E85 - E90   2022年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.4052/tigg.2042.1e

  • DMSO-Quenched H/D-Exchange 2D NMR Spectroscopy and Its Applications in Protein Science. 国際誌

    Kunihiro Kuwajima, Maho Yagi-Utsumi, Saeko Yanaka, Koichi Kato

    Molecules (Basel, Switzerland)   27 ( 12 )   2022年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/molecules27123748

  • Fungal β‐Mannosyloxymannitol Glycolipids and Their Analogues: Synthesis and Mincle‐Mediated Signaling Activity

    2022 ( 20 )   2022年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/ejoc.202200109

  • Efficient Visible/NIR Light-driven Uncaging of Hydroxylated Thiazole Orange-based Caged Compounds in Aqueous Media

    Ryu Hashimoto, Masafumi Minoshima, Souhei Sakata, Fumihito Ono, Hirokazu Ishii, Yuki Watakabe, Tomomi Nemoto, Saeko Yanaka, Koichi Kato, Kazuya Kikuchi

    Chemical Science   13 ( 25 )   7462 - 7467   2022年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1039/d2sc02364d

  • Biophysical Characterization of Novel DNA Aptamers against K103N/Y181C Double Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase. 国際誌

    Siriluk Ratanabunyong, Supaphorn Seetaha, Supa Hannongbua, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato, Atchara Paemanee, Kiattawee Choowongkomon

    Molecules (Basel, Switzerland)   27 ( 1 )   2022年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/molecules27010285

  • Desiccation-induced fibrous condensation of CAHS protein from an anhydrobiotic tardigrade. 国際誌

    Maho Yagi-Utsumi, Kazuhiro Aoki, Hiroki Watanabe, Chihong Song, Seiji Nishimura, Tadashi Satoh, Saeko Yanaka, Christian Ganser, Sae Tanaka, Vincent Schnapka, Ean Wai Goh, Yuji Furutani, Kazuyoshi Murata, Takayuki Uchihashi, Kazuharu Arakawa, Koichi Kato

    Scientific reports   11 ( 1 )   21328 - 21328   2021年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-021-00724-6

  • Tardigrade Secretory-Abundant Heat-Soluble Protein Has a Flexible β-Barrel Structure in Solution and Keeps This Structure in Dehydration. 国際誌

    125 ( 32 )   9145 - 9154   2021年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Secretory-abundant heat-soluble (SAHS) proteins are unique heat-soluble proteins of Tardigrada and are believed to play an essential role in anhydrobiosis, a latent state of life induced by desiccation. To investigate the dynamic properties, molecular dynamics (MD) simulations of a SAHS protein, RvSAHS1, were performed in solution and under dehydrating conditions. For comparison purposes, MD simulations of a human liver-type fatty-acid binding protein (LFABP) were performed in solution. Furthermore, high-speed atomic force microscopy observations were conducted to ascertain the results of the MD simulations. Three properties of RvSAHS1 were found as follows. (1) The entrance region of RvSAHS1 is more flexible and can be more extensive in solutions compared with that of a human LFABP because there is no salt bridge between the βD and βE strands. (2) The intrinsically disordered domain in the N-terminal region significantly fluctuates and can form an amphiphilic α-helix. (3) The size of the entrance region gets smaller along with dehydration, keeping the β-barrel structure. Overall, the obtained results provide atomic-level dynamics of SAHS proteins.

    DOI： 10.1021/acs.jpcb.1c04850

  • Structural and Functional Roles of the N-Glycans in Therapeutic Antibodies

    Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Koichi Kato

    Comprehensive Glycoscience   534 - 542   2021年6月

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    記述言語：その他  

    DOI： 10.1016/b978-0-12-819475-1.00044-4

  • Investigation of RT1t49 aptamer binding to human immunodeficiency virus 1 reverse transcriptase

    {Supa Hannongbua}

    JOURNAL OF CURRENT SCIENCE AND TECHNOLOGY   11 ( 1 )   2021年4月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.14456/JCST.2021.8

  • Metal complex lipids for fluid-fluid phase separation in co-assembled phospholipid membranes. 国際誌

    Ryo Ohtani, Yuka Anegawa, Hikaru Watanabe, Yutaro Tajima, Masanao Kinoshita, Nobuaki Matsumori, Kenichi Kawano, Saeko Yanaka, Koichi Kato, Masaaki Nakamura, Masaaki Ohba, Shinya Hayami

    Angewandte Chemie (International ed. in English)   60 ( 24 )   13603 - 13608   2021年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/anie.202102774

  • Comprehensive characterization of oligosaccharide conformational ensembles with conformer classification by free-energy landscape via reproductive kernel Hilbert space

    Tokio Watanabe, Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato

    Physical Chemistry Chemical Physics   2021年3月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1039/d0cp06448c

  • A feasibility study of inverse contrast-matching small-angle neutron scattering method combined with size exclusion chromatography using antibody interactions as model systems. 国際誌

    Nobuhiro Sato, Rina Yogo, Saeko Yanaka, Anne Martel, Lionel Porcar, Ken Morishima, Rintaro Inoue, Taiki Tominaga, Takao Arimori, Junichi Takagi, Masaaki Sugiyama, Koichi Kato

    Journal of biochemistry   2021年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/jb/mvab012

  • Characterization of new DNA Aptamers for anti-HIV-1 Reverse Transcriptase. 国際誌

    Supa Hannongbua, Siriluk Ratanabunyong, Niran Aeksiri, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato, Kiattawee Choowongkomol

    Chembiochem : a European journal of chemical biology   22 ( 5 )   915 - 923   2020年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/cbic.202000633

  • Silkworm Pupae Function as Efficient Producers of Recombinant Glycoproteins with Stable-Isotope Labeling. 国際誌

    Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Rina Yogo, Akari Ikeda, Masayoshi Onitsuka, Toshio Yamazaki, Tatsuya Kato, Enoch Y Park, Jun Yokoyama, Koichi Kato

    Biomolecules   10 ( 11 )   2020年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/biom10111482

  • Residual Structure of Unfolded Ubiquitin as Revealed by Hydrogen/Deuterium-Exchange 2D NMR. 国際誌

    Maho Yagi-Utsumi, Mahesh S Chandak, Saeko Yanaka, Methanee Hiranyakorn, Takashi Nakamura, Koichi Kato, Kunihiro Kuwajima

    Biophysical journal   119 ( 10 )   2029 - 2038   2020年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bpj.2020.10.003

  • NMR Characterization of Conformational Interconversions of Lys48-Linked Ubiquitin Chains 査読

    Methanee Hiranyakorn, Saeko Yanaka, Tadashi Satoh, Thunchanok Wilasri, Benchawan Jityuti, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato

    International Journal of Molecular Sciences   21 ( 15 )   5351 - 5351   2020年7月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/ijms21155351

  • Pseudo-membrane jackets: Two-dimensional coordination polymers achieving visible phase separation in cell membrane. 査読 国際誌

    Ryo Ohtani, Kenichi Kawano, Masanao Kinoshita, Saeko Yanaka, Hikaru Watanabe, Kenji Hirai, Shiroh Futaki, Nobuaki Matsumori, Hiroshi Uji-I, Masaaki Ohba, Koichi Kato, Shinya Hayami

    Angewandte Chemie (International ed. in English)   59 ( 41 )   17931 - 17937   2020年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/anie.202006600

  • Characterization of amyloid β fibril formation under microgravity conditions. 査読 国際誌

    6   17 - 17   2020年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Amyloid fibrils are self-assembled and ordered proteinaceous supramolecules structurally characterized by the cross-β spine. Amyloid formation is known to be related to various diseases typified by neurogenerative disorders and involved in a variety of functional roles. Whereas common mechanisms for amyloid formation have been postulated across diverse systems, the mesoscopic morphology of the fibrils is significantly affected by the type of solution condition in which it grows. Amyloid formation is also thought to share a phenomenological similarity with protein crystallization. Although many studies have demonstrated the effect of gravity on protein crystallization, its effect on amyloid formation has not been reported. In this study, we conducted an experiment at the International Space Station (ISS) to characterize fibril formation of 40-residue amyloid β (Aβ(1-40)) under microgravity conditions. Our comparative analyses revealed that the Aβ(1-40) fibrilization progresses much more slowly on the ISS than on the ground, similarly to protein crystallization. Furthermore, microgravity promoted the formation of distinct morphologies of Aβ(1-40) fibrils. Our findings demonstrate that the ISS provides an ideal experimental environment for detailed investigations of amyloid formation mechanisms by eliminating the conventionally uncontrollable factors derived from gravity.

    DOI： 10.1038/s41526-020-0107-y

  • Current status and issues of protein solution biophysics-Session 1SDP. 査読 国際誌

    Saeko Yanaka, Susumu Uchiyama

    Biophysical reviews   12 ( 2 )   263 - 264   2020年4月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1007/s12551-020-00671-y

  • Editorial for the Special Issue of Biophysical Reviews focused on the Biophysical Society of Japan with select scientific content from the 57th BSJ annual meeting, Miyazaki, Japan. 査読 国際誌

    Tamiki Komatsuzaki, Haruki Nakamura, Jeremy Tame, Saeko Yanaka, Takeharu Nagai, Kuniaki Nagayama

    Biophysical reviews   12 ( 2 )   183 - 185   2020年3月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1007/s12551-020-00691-8

  • Newly developed Laboratory-based Size exclusion chromatography Small-angle x-ray scattering System (La-SSS) 査読

    Rintaro Inoue, Tatsuo Nakagawa, Ken Morishima, Nobuhiro Sato, Aya Okuda, Reiko Urade, Rina Yogo, Saeko Yanaka, Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato, Kazuki Omoto, Kazuki Ito, Masaaki Sugiyama

    Scientific Reports   9 ( 1 )   12610   2019年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-019-48911-w

  • Structural and thermodynamic basis for the recognition of the substrate-binding cleft on hen egg lysozyme by a single-domain antibody 査読

    Hiroki Akiba, Hiroko Tamura, Masato Kiyoshi, Saeko Yanaka, Kenji Sugase, Jose M. M. Caaveiro, Kouhei Tsumoto

    Scientific Reports   9 ( 1 )   15481   2019年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-019-50722-y

  • Remodeling of the Oligosaccharide Conformational Space in the Prebound State To Improve Lectin-Binding Affinity. 査読 国際誌

    Tatsuya Suzuki, Saeko Yanaka, Tokio Watanabe, Gengwei Yan, Tadashi Satoh, Hirokazu Yagi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato

    Biochemistry   59 ( 34 )   3180 - 3185   2019年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1021/acs.biochem.9b00594

  • Mutational and Combinatorial Control of Self-Assembling and Disassembling of Human Proteasome α Subunits 査読

    20 ( 9 )   2308 - 2308   2019年5月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/ijms20092308

  • Enabling adoption of 2D-NMR for the higher order structure assessment of monoclonal antibody therapeutics. 査読

    mAbs   2018年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1080/19420862.2018.1544454

  • Backbone 1H, 13C, and 15N assignments of the extracellular region of human Fcγ receptor IIIb. 査読 国際誌

    12 ( 1 )   201 - 204   2018年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s12104-018-9809-4

  • Structure and Dynamics of Immunoglobulin G Glycoproteins. 査読

    Yagi H, Yanaka S, Kato K

    Advances in experimental medicine and biology   1104   219 - 235   2018年1月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/978-981-13-2158-0_11

  • Theoretical and Experimental Studies on Inclusion Complexes of Pinostrobin and β-Cyclodextrins. 査読

    86 ( 1 )   2018年1月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/scipharm86010005

  • Conformational effects of N-glycan core fucosylation of immunoglobulin G Fc region on its interaction with Fcγ receptor IIIa. 査読

    7 ( 1 )   13780   2017年10月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-017-13845-8

  • Formation of the chaperonin complex studied by 2D NMR spectroscopy. 査読

    Takenaka T, Nakamura T, Yanaka S, Yagi-Utsumi M, Chandak MS, Takahashi K, Paul S, Makabe K, Arai M, Kato K, Kuwajima K

    PloS one   12 ( 10 )   e0187022   2017年10月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1371/journal.pone.0187022

  • Characterization of conformational deformation-coupled interaction between immunoglobulin G1 Fc glycoprotein and a low-affinity Fcγ receptor by deuteration-assisted small-angle neutron scattering. 査読

    12   1 - 4   2017年8月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrep.2017.08.004

  • Elucidation of potential sites for antibody engineering by fluctuation editing 査読

    Saeko Yanaka, Yoshitaka Moriwaki, Kouhei Tsumoto, Kenji Sugase

    SCIENTIFIC REPORTS   7 ( 1 )   9597   2017年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-017-10246-9

  • Exploration of the Conformational Dynamics of Major Histocompatibility Complex Molecules 査読

    Saeko Yanaka, Kenji Sugase

    FRONTIERS IN IMMUNOLOGY   8   632   2017年5月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.3389/fimmu.2017.00632

  • Hyper-Assembly of Self-Assembled Glycoclusters Mediated by Specific Carbohydrate-Carbohydrate Interactions 査読

    Gengwei Yan, Takumi Yamaguchi, Tatsuya Suzuki, Saeko Yanaka, Sota Sato, Makoto Fujita, Koichi Kato

    CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL   12 ( 9 )   968 - 972   2017年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1002/asia.201700202

  • Conformational Analysis of a High-Mannose-Type Oligosaccharide Displaying Glucosyl Determinant Recognised by Molecular Chaperones Using NMR-Validated Molecular Dynamics Simulation. 査読 国際誌

    Tatsuya Suzuki, Megumi Kajino, Saeko Yanaka, Tong Zhu, Hirokazu Yagi, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato

    Chembiochem : a European journal of chemical biology   18 ( 4 )   396 - 401   2017年2月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1002/cbic.201600595

  • Quantitative analysis of protein-ligand interactions by NMR 査読

    Ayako Furukawa, Tsuyoshi Konuma, Saeko Yanaka, Kenji Sugase

    PROGRESS IN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY   96   47 - 57   2016年8月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1016/j.pnmrs.2016.02.002

  • Peptide-dependent Conformational Fluctuation Determines the Stability of the Human Leukocyte Antigen Class I Complex 査読

    Saeko Yanaka, Takamasa Ueno, Yi Shi, Jianxun Qi, George F. Gao, Kouhei Tsumoto, Kenji Sugase

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   289 ( 35 )   24680 - 24690   2014年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1074/jbc.M114.566174

  • Hyperthin nanochains composed of self-polymerizing protein shackles 査読

    Ryo Matsunaga, Saeko Yanaka, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto

    NATURE COMMUNICATIONS   4   2211   2013年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/ncomms3211

  • Interleukin-11 Links Oxidative Stress and Compensatory Proliferation 査読

    Takashi Nishina, Sachiko Komazawa-Sakon, Saeko Yanaka, Xuehua Piao, Dong-Mei Zheng, Jiang-Hu Piao, Yuko Kojima, Shunhei Yamashina, Emiko Sano, Tracy Putoczki, Takahiro Doi, Takashi Ueno, Junji Ezaki, Hiroko Ushio, Matthias Ernst, Kouhei Tsumoto, Ko Okumura, Hiroyasu Nakano

    SCIENCE SIGNALING   5 ( 207 )   ra5   2012年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1126/scisignal.2002056

  • Non-core Region Modulates Interleukin-11 Signaling Activity GENERATION OF AGONIST AND ANTAGONIST VARIANTS 査読

    Saeko Yanaka, Emiko Sano, Norio Naruse, Kin-ichiro Miura, Mutsumi Futatsumori-Sugai, Jose M. M. Caaveiro, Kouhei Tsumoto

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   286 ( 10 )   8085 - 8093   2011年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1074/jbc.M110.152561

  • Contribution of the flexible loop region to the function of staphylococcal enterotoxin B 査読

    Saeko Yanaka, Motonori Kudou, Yoshikazu Tanaka, Takumi Sasaki, Sumiyo Takemoto, Atsuko Sakata, Yukio Hattori, Tomoyuki Koshi, Shiro Futaki, Kouhei Tsumoto, Toshihiro Nakashima

    PROTEIN ENGINEERING DESIGN & SELECTION   23 ( 5 )   415 - 421   2010年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/protein/gzq006

  • Impact of Intrinsic Cooperative Thermodynamics of Peptide-MHC Complexes on Antiviral Activity of HIV-Specific CTL 査読

    Chihiro Motozono, Saeko Yanaka, Kouhei Tsumoto, Masafumi Takiguchi, Takamasa Ueno

    JOURNAL OF IMMUNOLOGY   182 ( 9 )   5528 - 5536   2009年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.4049/jimmunol.0803471

  • Isothiocyanate inhibits restitution and wound repair after injury in the stomach: Ex vivo and in vitro studies 査読

    Regina Ragasa, Eiji Nakamura, Lisa Marrone, Saeko Yanaka, Shusaku Hayashi, Koji Takeuchi, Susan J. Hagen

    JOURNAL OF PHARMACOLOGY AND EXPERIMENTAL THERAPEUTICS   323 ( 1 )   1 - 9   2007年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1124/jpet.107.121640

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講演・口頭発表等

  • Investigation of conformational dynamics and interactions of antibodies towards their functional improvement 招待 国際会議

    Saeko Yanaka, Koichi Kato

    2023年3月 

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    開催年月日： 2023年3月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

    国名：日本国  

  • Integrative approach for the observation of conformational dynamics and interactions of antibodies 招待 国際会議

    Saeko Yanaka, Koichi Kato

    The 7th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR  2022年10月 

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    開催年月日： 2022年10月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

    国名：日本国  

  • Multifaceted observation of conformational dynamics and interactions of antibodies 招待 国際会議

    S. Yanaka, R. Yogo, H. Yagi, K. Kato

    ABA-APPA-TBS Joint Congress in Taiwan  2022年6月 

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    開催年月日： 2022年6月

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

    国名：日本国  

  • 血清環境における抗体の分子間相互作用と機能の解明

    與語理那, 谷中冴子, 矢木宏和, 加藤晃一

    日本薬学会年会要旨集(Web)  2021年3月 

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    開催年月日： 2021年3月

    記述言語：その他  

    国名：その他  

  • 安定同位体標識を利用したNMRによる抗体の「品質」の解析

    谷中冴子, 谷中冴子, 與語理那, 與語理那, 矢木宏和, 加藤晃一, 加藤晃一

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)  2019年12月 

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    開催年月日： 2019年12月

    記述言語：その他  

    国名：その他  

  • 抗体のNMR解析のための安定同位体標識法の開発と応用

    谷中冴子, 與語理那, 山崎俊夫, 宮ノ入洋平, 矢木宏和, 加藤晃一

    2019年11月 

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    開催年月日： 2019年11月

    記述言語：その他  

    国名：その他  

  • 膜を舞台にする抗体機能の高速原子間力顕微鏡解析

    與語理那, 谷中冴子渡辺大輝, 矢木宏和, 内橋貴之, 加藤晃一

    日本薬学会年会要旨集(CD-ROM)  2019年3月 

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    開催年月日： 2019年3月

    記述言語：その他  

    国名：その他  

  • IgGとFc受容体の相互作用におけるFab領域の新規結合部位の同定

    與語理那, 與語理那, 山口祐希, 渡辺大輝, 矢木宏和, 佐藤匡史, 中西真人, 鬼塚正義, 大政健史, 嶋田麻里, 丸野孝浩, 鳥巣哲生, 渡邊史生, 肥後大輔, 内橋貴之, 内橋貴之, 谷中冴子, 谷中冴子, 内山進, 内山進, 加藤晃一, 加藤晃一

    日本生化学会大会(Web)  2019年3月 

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    開催年月日： 2019年3月

    記述言語：その他  

    国名：その他  

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MISC

  • 抗体医薬の作動メカニズムの分子基盤 査読

    谷中冴子、加藤晃一

    2023年7月

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    記述言語：日本語  

  • 最先端基盤技術 II.タンパク質工学と抗体医薬 8.抗体のエフェクター活性と定常部を介した抗体の高機能化 査読

    谷中冴子、加藤晃一

    2022年12月

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    記述言語：日本語  

  • 核磁気共鳴分光法と分子動力学計算を通じて観る糖鎖の動的構造とレクチンの糖鎖認識の理解 (第1土曜特集 レクチン医学最前線) -- (レクチン-糖鎖相互作用の物理化学的理解)

    矢木 宏和, 鈴木 達哉, 谷中 冴子, 山口 拓実, 加藤 晃一

    医学のあゆみ   2019年6月

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    記述言語：日本語  

  • 抗体のNMR研究の趨向と展望

    加藤晃一, 谷中冴子

    2018年10月

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    記述言語：日本語  

  • NMRと計算科学の統合による糖鎖の3次元構造ダイナミクスの解析

    矢木宏和, 鈴木達哉, 鈴木達哉, 谷中冴子, 谷中冴子, 山口拓実, 山口拓実, 加藤晃一, 加藤晃一

    バイオイメージング   2018年8月

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    記述言語：日本語  

  • The Dynamic Peptide Recognition And Stabilization Mechanism Of Human Leukocyte Antigen B*35:01

    Saeko Yanaka, Takamasa Ueno, Kouhei Tsumoto, Kenji Sugase

    PROTEIN SCIENCE   2014年7月

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    記述言語：英語  

  • 若手の会によるフォーラム開催の報告

    谷中 冴子, 飯島 玲生

    生化學   2012年5月

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    記述言語：日本語  

  • Isothiocyanate blocks restitution and wound repair in the mammalian stomach by inhibiting both monocarboxylate and bicarbonate transport activity

    Regina Ragasa, Eiji Nakamura, Lisa M. Marrone, Saeko Yanaka, Shusaku Hayashi, Koji Takeuchi, Susan J. Hagen

    GASTROENTEROLOGY   2007年4月

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    記述言語：英語  

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所属学協会

  • 日本生化学会

  • 日本生物物理学会

  • 日本薬学会

  • 日本蛋白質科学会

  • 日本核磁気共鳴学会

委員歴

  • 日本蛋白質科学会   理事   国内

    2022年6月 - 2024年6月   

  • 日本生物物理学会   代議員   国内

    2021年6月 - 2025年6月   

学術貢献活動

  • 実行委員

    第61回日本生物物理学会年会  2023年11月

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    種別：大会・シンポジウム等 

  • 募金委員 国際学術貢献

    2021年8月

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    種別：大会・シンポジウム等 

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 実験科学と情報科学の融合によるバイオ医薬品設計の技術開発

    2023年 - 2025年

    日本医療研究開発機構（AMED）　創薬基盤推進研究事業

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    担当区分：研究代表者  資金種別：受託研究

  • 物質-生命の境界探査

    2022年9月 - 2027年3月

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    担当区分：連携研究者 

  • 抗体医薬の高機能化に向けた抗体の分子経絡の解読と改変

    研究課題/領域番号：22H02755  2022年 - 2025年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

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    資金種別：科研費

  • 分子中に秘められた新規相互作用部位の探査と改変を通じた次世代抗体創成の基盤構築

    2021年 - 2025年

    日本医療研究開発機構（AMED）次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発 国際競争力のある次世代抗体医薬品製造技術開発

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    担当区分：研究代表者  資金種別：受託研究

  • 糖鎖とタンパク質が織りなす抗体のアロステリックネットワークの探査

    2020年 - 2021年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 先端計測アプローチの統合による抗体の構造動態と機能発現の連関機構の解明

    研究課題/領域番号：19H01017  2019年 - 2022年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

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    資金種別：科研費

  • 抗体とFc受容体の新規相互作用様式の解明と抗体工学への展開

    2018年 - 2019年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 抗体の分子認識を契機とする補体系の活性化を活写する

    2017年 - 2018年

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 多元的構造生物学アプローチによるプロテアソーム形成機構の解明と創薬への展開

    研究課題/領域番号：15H02491  2015年 - 2018年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

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    資金種別：科研費

  • 生命分子の動的秩序形成におけるミクロ‐マクロ相関の探査と設計原理の探求

    研究課題/領域番号：25102008  2013年 - 2017年

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

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    資金種別：科研費

  • 抗原抗体相互作用の動的構造解析を基盤とした高機能抗体の設計

    2013年 - 2015年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • ヒト主要組織適合複合体の揺らぎと細胞の抗原提示能に関する研究

    研究課題/領域番号：11J06193  2011年 - 2012年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

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教育活動概要

  • グローバルヘルスケア分野を通じた教育活動

担当授業科目

  • 生命薬学IB

    2024年10月 - 2025年3月   後期

  • 生命薬学IA

    2024年4月 - 2024年9月   前期

  • 生命薬学IB

    2023年10月 - 2024年3月   後期

  • 生命薬学IA

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • 創薬科学総論III

    2022年4月 - 2022年9月   前期

FD参加状況

  • 2023年11月   役割：企画   名称：第２回薬学部局FD講演会「機関間連携」

    主催組織：部局

  • 2023年8月   役割：企画   名称：男女共同参画FD

    主催組織：部局

他大学・他機関等の客員・兼任・非常勤講師等

  • 2023年  自然科学研究機構　生命創成探究センター  区分:兼任教員  国内外の区分:国内 

  • 2023年  鹿児島大学理学部  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

  • 2022年  自然科学研究機構 生命創成探究センター/分子科学研究所  区分:兼任教員  国内外の区分:国内 

その他教育活動及び特記事項

  • 2023年  クラス担任  学部

社会貢献・国際連携活動概要

  • グローバルヘルスケア分野を通じた社会貢献・国際連携活動

学内運営に関わる各種委員・役職等

  • 2023年4月 - 2024年3月   研究院 FD委員

  • 2022年11月 - 2023年10月   その他 評議員

  • 2022年6月 - 2024年6月   その他 理事

  • 2021年9月 - 2024年8月   その他 代議員

  • 2015年4月 - 2019年3月   その他 専門調査員