Updated on 2024/09/26

Information

 

写真a

 
MAYANAGI KOUTA
 
Organization
Faculty of Pharmaceutical Sciences Department of Pharmaceutical Health Care and Sciences Lecturer
Abolition organization Multi-scale Research Center for Medical Science(Joint Appointment)
Graduate School of Pharmaceutical Sciences Department of Clinical Pharmacy(Joint Appointment)
Title
Lecturer
Profile
Three Dimensional Electron Microscopy of Macromolecules

Degree

  • PhD

Research Interests・Research Keywords

  • Research theme:Cryo-EM single particle analysis of DNA-protein complexes

    Keyword:Cryo-Electron microscopy, Single particle analysis, Macromolecule, Image analysis, Structral Biology

    Research period: 1991.4

Papers

  • Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy Reviewed International journal

    Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Mariko Hakamata, Shaban Amina Kaboso, Yoshitaka Tateishi, Kosuke Ito and Sohkichi Matsumoto

    Nucleic Acids Research   2023.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gkad1149

  • DNA polymerase D temporarily connects primase to the CMG-like helicase before interacting with proliferating cell nuclear antigen Reviewed International journal

    Nucleic Acids Research   2021.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gkab243.

  • Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA, an archaeal replisome complex, revealed by cryo-electron microscopy Reviewed International journal

    Kouta Mayanagi, Keisuke Oki, Naoyuki Miyazaki, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Kosuke Morikawa, Kenji Iwasaki, Daisuke Kohda, Tsuyoshi Shirai, Yoshizumi Ishino

    BMC Biology   2020.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Structural visualization of key steps in nucleosome reorganization by human FACT Reviewed International journal

    Kouta Mayanagi,Kazumi Saikusa, Naoyuki Miyazaki,Satoko Akashi, Kenji Iwasaki, Yoshifumi Nishimura, Kosuke Morikawa, Yasuo Tsunaka

    Scientific Reports   9 ( 1 )   10183   2019.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-019-46617-7.

  • Elucidating functions of DP1 and DP2 subunits from the Thermococcus kodakarensis family D DNA polymerase Reviewed International journal

    Takashima N, Ishino S, Oki K, Takafuji M, Yamagami T, Matsuo R, Mayanagi K, Ishino Y.

    Extremophiles   23 ( 1 )   161 - 172   2019.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s00792-018-1070-3

  • Direct visualization of DNA baton pass between replication factors bound to PCNA Reviewed International journal

    Kouta Mayanagi, Sonoko Ishino, Tsuyoshi Shirai, Takuji Oyama, Shinichi Kiyonari, Daisuke Kohda, Kosuke Morikawa Yoshizumi Ishino

    Scientific Reports   8 ( 1 )   2018.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-018-34176-2

  • Switching mechanism of DNA replication fork complex revealed by single particle analysis International journal

    Mayanagi K, Ishino S Takafuji M, Mitsuoka K, Shirai T, Kiyonari S, Nishida H, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y.

    European Microscopy Congress   3   57 - 58   2016.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (international conference proceedings)  

  • The tetrameric MotA complex as the core of the flagellar motor stator from hyperthermophilic bacterium Reviewed International journal

    Takekawa N, Terahara N, Kato T, Gohara M, Mayanagi K, Hijikata A, Onoue Y, Kojima S, Shirai T, Namba K, Homma M

    Scientific Reports   2016.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/srep31526

  • Structure of the EndoMS-DNA Complex as Mismatch Restriction Endonuclease Reviewed International journal

    Nakae S, Hijikata A, Tsuji T, Yonezawa K, Kouyama KI, Mayanagi K, Ishino S, Ishino Y, Shirai T

    Structure   24   1960 - 1971   2016.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Filopodia formation by crosslinking of F-actin with fascin in two different binding manners Reviewed International journal

    Aramaki S, Mayanagi K, Jin M, Aoyama K, Yasunaga T

    Cytoskeleton   2016.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/cm.21309

  • Architecture of the DNA polymerase B-proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-DNA ternary complex. International journal

    Mayanagi K, Kiyonari S, Nishida H, Saito M, Kohda D, Ishino Y, Shirai T, Morikawa K,

    PNAS   108 ( 5 )   2011.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Structural determinant for switching between the polymerase and exonuclease modes in the PCNA-replicative DNA polymerase complex Reviewed International journal

    Hirokazu. Nishida, Kouta. Mayanagi, Shinichi. Kiyonari, Yuichi. Sato, Takuji. Oyama, Yoshizumi. Ishino, Kosuke. Morikawa

    PNAS   106   2009.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Mechanism of replication machinery assembly as revealed by the DNA ligase-PCNA-DNA complex architecture Reviewed International journal

    Kouta Mayanagi, Shinichi Kiyonari, Mihoko Saito, Tsuyoshi Shirai, Yoshizumi Ishino, Kosuke Morikawa

    PNAS   106   2009.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Formation and branch migration of Holliday junctions mediated by eukaryotic recombinases Reviewed International journal

    Yasuto Murayama, Yumiko Kurokawa, Kouta Mayanagi, and Hiroshi Iwasaki

    Nature   451 ( 7181 )   2008.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Functional significance of octameric RuvA for a branch migration complex from Thermus thermophilus. Reviewed International journal

    Yoshie Fujiwara, Kouta Mayanagi, and Kosuke Morikawa

    BBRC   366 ( 2 )   2007.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Electron microscopic single particle analysis of a tetrameric RuvA/RuvB/Holliday junction DNA complex Reviewed International journal

    Kouta Mayanagi, Yoshie Fujiwara, Tomoko Miyata, and Kosuke Morikawa

    BBRC   365   2007.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Open clamp structure in the clamp-loading complex visualized by electron microscopic image analysis. Reviewed International journal

    Tomoko Miyata, Hirofumi Suzuki, Takuji Oyama, Kouta Mayanagi, Yoshizumi Ishino, and Kosuke Morikawa

    PNAS   102 ( 39 )   13795 - 13800   2005.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1073/pnas.0506447102

  • The Clamp-loading Complex for Processive DNA Replication Reviewed International journal

    Tomoko Miyata, Takuji Oyama, Kouta Mayanagi, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, and Kosuke Morikawa

    11 ( 7 )   632 - 636   2004.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/nsmb788

  • Three-dimensional electron microscopy of the reverse gyrase from Sulfolobus tokodaii Reviewed International journal

    Kyoko Matoba, Kouta Mayanagi, Syo Nakasu, Akihiko Kikuchi, and Kosuke Morikawa

    BBRC   297 ( 4 )   2002.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Three-dimensional structure of non-activated cGMP phosphodiesterase 6 and comparison of its image with those of activated forms Reviewed International journal

    Naoko Kajimura, Matsuyo Yamazaki, Kosuke Morikawa, Akio Yamazaki, and Kouta Mayanagi

    J. Struct. Biol.   139 ( 1 )   2002.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Three-dimensional electron microscopy of the clamp loader small subunit from Pyrococcus furiosus Reviewed International journal

    Mayanagi, K., Miyata, T., Oyama, T., Ishino, Y., and Morikawa, K

    J. Struct. Biol.   134 ( 1 )   2001.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Two different oligomeric states of the RuvB branch migration motor protein as revealed by electron microscopy Reviewed International journal

    Miyata, T., Yamada, K., Iwasaki, H., Shinagawa, H., Morikawa, K., and Mayanagi. K

    J. Struct. Biol.   131 ( 2 )   2000.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Three-dimensional electron microscopy of the photosystem II core complex Reviewed International journal

    Mayanagi, K., Ishikawa, T., Toyoshima, C., Inoue, Y., and Nakazato, K

    J. Struct. Biol.   123 ( 3 )   1998.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Inhibition of G protein-coupled receptor 68 using homoharringtonine attenuates chronic kidney disease-associated cardiac impairment

    Yoshida, Y; Fukuoka, K; Sakugawa, M; Kurogi, M; Hamamura, K; Hamasaki, K; Tsurusaki, F; Sotono, K; Nishi, T; Fukuda, T; Kumamoto, T; Oyama, K; Ogino, T; Tsuruta, A; Mayanagi, K; Yamashita, T; Fuchino, H; Kawahara, N; Yoshimatsu, K; Kawakami, H; Koyanagi, S; Matsunaga, N; Ohdo, S

    TRANSLATIONAL RESEARCH   269   31 - 46   2024.7   ISSN:1931-5244 eISSN:1878-1810

     More details

    Language:English   Publisher:Translational Research  

    Chronic kidney disease (CKD) induces cardiac inflammation and fibrosis and reduces survival. We previously demonstrated that G protein-coupled receptor 68 (GPR68) promotes cardiac inflammation and fibrosis in mice with 5/6 nephrectomy (5/6Nx) and patients with CKD. However, no method of GPR68 inhibition has been found that has potential for therapeutic application. Here, we report that Cephalotaxus harringtonia var. nana extract and homoharringtonine ameliorate cardiac inflammation and fibrosis under CKD by suppressing GPR68 function. Reagents that inhibit the function of GPR68 were explored by high-throughput screening using a medicinal plant extract library (8,008 species), and we identified an extract from Cephalotaxus harringtonia var. nana as a GPR68 inhibitor that suppresses inflammatory cytokine production in a GPR68 expression-dependent manner. Consumption of the extract inhibited inflammatory cytokine expression and cardiac fibrosis and improved the decreased survival attributable to 5/6Nx. Additionally, homoharringtonine, a cephalotaxane compound characteristic of C. harringtonia, inhibited inflammatory cytokine production. Homoharringtonine administration in drinking water alleviated cardiac fibrosis and improved heart failure and survival in 5/6Nx mice. A previously unknown effect of C. harringtonia extract and homoharringtonine was revealed in which GPR68-dependent inflammation and cardiac dysfunction were suppressed. Utilizing these compounds could represent a new strategy for treating GPR68-associated diseases, including CKD.

    DOI: 10.1016/j.trsl.2024.02.004

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  • The complex etiology of autism spectrum disorder due to missense mutations of CHD8 Reviewed International journal

    Molecular Psychiatry   2024.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41380-024-02491-y

  • Time-Dependent Differences in Vancomycin Sensitivity of Macrophages Underlie Vancomycin- Induced Acute Kidney Injury Reviewed International journal

    Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics   388 ( 1 )   218 - 227   2024.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1124/jpet.123.001864

  • Oral administration of vancomycin alleviates heart failure triggered by chronic kidney disease Reviewed International journal

    Biochemical and Biophysical Research Communications   675   92 - 98   2023.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2023.07.015

  • Oral administration of vancomycin alleviates heart failure triggered by chronic kidney disease Reviewed International journal

    Kohei Fukuoka, Yuya Yoshida, Kurumi Sotono, Naoki Nishikawa, Kengo Hamamura, Kosuke Oyama, Akito Tsuruta, Kota Mayanagi, Satoru Koyanagi, Naoya Matsunaga, Shigehiro Ohdo

    Biochem Biophys Res Commun   675   92 - 98   2023.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2023.07.015

  • Chemical Acetylation of Mitochondrial Transcription Factor A Occurs on Specific Lysine Residues and Affects Its Ability to Change Global DNA Topology Reviewed International journal

    Yuan Fang, Masaru Akimoto, Kouta Mayanagi, Atsushi Hatano, Masaki Matsumoto, Shigeru Matsuda, Takehiro Yasukawa, Dongchon Kang

    Mitochondrion   53   99 - 108   2020.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.mito.2020.05.003

  • Single-particle analysis of full-length human poly(ADP-ribose) polymerase 1 Reviewed International journal

    Kouyama K, Mayanagi K, Nakae S, Nishi Y, Miwa M, Shirai T

    Biophys Physicobiol   16   59 - 67   2019.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.2142/biophysico.16.0_59

  • Revealing the intracellular ultrastructure of filopodia with cryo-electron tomography Reviewed

    Aramaki S, Mayanagi K, Aoyama K, Yasunaga T

    Microscopy (Oxf)   2016.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (other academic)  

  • The centromeric nucleosome-like CENP-T-W-S-X complex induces positive supercoils into DNA Reviewed International journal

    Kozo Takeuchi, Tatsuya Nishino, Kota Mayanagi, Naoki Horikoshi, Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Tetsuya Hori, Hitoshi Kurumizaka, Tatsuo Fukagawa

    Nucleic Acids Research   42 ( 3 )   1644 - 1655   2014.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gkt1124

  • Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, Swi5-Sfr1 complex. Reviewed International journal

    Naoyuki Kuwabara, Yasuto Murayama, Hiroshi Hashimoto, Yuuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Mamoru Sato, Kouta Mayanagi, Hiroshi Iwasaki and Toshiyuki Shimizu.

    Structure   20 ( 3 )   2012.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • The GINS complex from the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum may function as a homotetramer in DNA replication Reviewed International journal

    Hiromi Ogino, Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, Akihiko Yamagishi and Yoshizumi Ishino

    Extremophiles   15   2011.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s00792-011-0383-2

  • Relationship between heat-induced fibrillogenicity and hemolytic activity of thermostable direct hemolysin and a related hemolysin of Vibrio parahaemolyticus Reviewed International journal

    Ohnishi K, Nakahira K, Unzai S, Mayanagi K, Hashimoto H, Shiraki K, Honda T, Yanagihara I,

    FEMS MicroBiol Lett.   318 ( 1 )   2011.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Architectures of archaeal GINS complexes, essential DNA replication initiation factors Reviewed International journal

    Takuji Oyama, Sonoko Ishino, Seiji Fujino, Hiromi Ogino, Tsuyoshi Shirai, Kouta Mayanagi, Mihoko Saito, Naoko Nagasawa, Yoshizumi Ishino and Kosuke Morikawa

    BMC Biology   9   2011.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1186/1741-7007-9-28

  • Structure and functional characterization of Vibrio parahaemolyticus thermostable direct hemolysin (TDH) Reviewed International journal

    Yanagihara I, Nakahira K, Yamane T, Kaieda S, Mayanagi K, Hamada D, Fukui T, Ohnishi K, Kajiyama S, Shimizu T, Sato M, Ikegami T, Ikeguchi M, Honda T, Hashimoto H.

    JBC   285 ( 21 )   2010.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Effects of antibody affinity and antigen valence on molecular forms of immune complexes. Reviewed International journal

    Masayuki Oda, Susumu Uchiyama, Masanori Noda, Yoshinori Nishi, Maiko Koga, Kouta Mayanagi, Carol V. Robinson, Kiichi Fukui, Yuji Kobayashi, Kosuke Morikawa, and Takachika Azuma

    Molecular Immunology   47   2009.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Atomic structures and functional implications of the archaeal RecQ-like helicase Hjm Reviewed International journal

    Takuji Oyama, Hayato Oka, Kouta Mayanagi, Tsuyoshi Shirai, Kyoko Matoba, Ryosuke Fujikane, Yoshizumi Ishino, Kosuke Morikawa,

    BMC Structural Biology   9   2009.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Visualization of intrinsically disordered regions of proteins by high-speed atomic force microscopy Reviewed International journal

    Atsushi Miyagi, Yasuo Tsunaka, Takayuki Uchihashi, Kouta Mayanagi, Susumu Hirose, Kosuke Morikawa, and Toshio Ando.

    Chemphyschem   9 ( 13 )   2008.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Tetrameric structure of Thermostable Direct Hemolysin from Vibrio parahaemolyticus revealed by Ultracentrifugation, Small Angle X-ray Scattering and Electron Microscopy Reviewed International journal

    Daizo Hamada, Takashi Higurashi, Kouta Mayanagi, Tomoko Miyata, Takashi Fukui, Tetsuya Iida, Takeshi Honda, and Itaru Yanagihara

    J. Mol. Biol.   365 ( 1 )   2006.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Comparison of MukB homodimer versus MukBEF complex molecular architectures by electron microscopy reveals a higher-order multimerization. Reviewed International journal

    Kyoko Matoba, Mitsuyoshi Yamazoe, Kouta Mayanagi, Kosuke Morikawa, Sota Hiraga

    BBRC   333   2005.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Thermostable direct hemolysin of Vibrio parahaemolyticus is a bacterial reversible amyloid toxin. Reviewed International journal

    Takahashi Fukui, Kentaro Shiraki, Daizo Hamada, Kojiro Hara, Tomoko Miyata, Shinsuke Fujiwara, Kouta Mayanagi, Keiko Yanagihara, Tetsuya Iida, Eiichiro Fukusaki, Tadayuki Imanaka, Takeshi Honda, and Itaru Yanagihara.

    Biochemistry   44 ( 29 )   2005.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Mammalian Mcm2/4/6/7 complex forms a toroidal structure Reviewed International journal

    Norikazu Yabuta, Naoko Kajimura, Kouta Mayanagi, Michio Sato, Takahito Gotow, Yasuo Uchiyama, Yukio Ishimi and Hiroshi Nojima

    Genes to Cells   8 ( 5 )   2003.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Crystal structure of the RuvA-RuvB complex: A structural basis for the Holliday junction migrating motor machinery Reviewed International journal

    Kazuhiro Yamada, Tomoko Miyata, Daisuke Tsuchiya, Takuji Oyama, Yoshie Fujiwara, Takayuki Ohnishi, Hiroshi Iwasaki, Hideo Shinagawa, Mariko Ariyoshi, Kouta Mayanagi, and Kosuke Morikawa

    Mollecular Cell   10 ( 3 )   2002.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Two-state conformational changes in Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor regulated by calcium Reviewed International journal

    Kozo Hamada, Tomoko Miyata, Kouta Mayanagi, Junji Hirota and Katsuhiko Mikoshiba

    J. Biol. Chem.   277 ( 24 )   2002.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • A unique beta-hairpin protruding from AAA+ ATPase domain of RuvB motor protein is involved in the interaction with RuvA DNA recognition protein for branch migration of Holliday junctions Reviewed International journal

    Han, Y.-W., Iwasaki, H., Miyata, T., Mayanagi, K., Yamada, K., Morikawa, K., and Shinagawa, H

    J. Biol. Chem.   276 ( 37 )   2001.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Ca2+-induced switching of troponin and tropomyosin on actin filaments as revealed by electron cryo-microscopy Reviewed International journal

    Narita, A., Yasunaga, T., Ishikawa, T., Mayanagi, K., and Wakabayashi, T

    J. Mol. Biol.   308 ( 2 )   2001.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Crystal structure of the Holliday junction migration motor protein RuvB from Thermus thermophilus HB8 Reviewed International journal

    Yamada, K., Kunishima, N., Mayanagi, K., Ohnishi, T., Nishino, T., Iwasaki, H., Shinagawa, H., and Morikawa. K.

    Proc. Natl. Acad. Sci. U S A   98 ( 4 )   2001.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Both RadA and RadB are involved in homologous recombination in Pyrococcus furiosus Reviewed International journal

    Komori, K., Miyata, T., DiRuggiero, J., Holley-Shanks, R., Hayashi, I., Cann, I.K., Mayanagi, K., Shinagawa, H., Ishino. Y

    J Biol Chem.   275 ( 43 )   2000.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Guanidine hydrochloride- induced changes of the E2 inner core of the Bacillus stearothermophilus pyruvate dehydrogenase complex Reviewed International journal

    123 ( 4 )   564 - 567   1998.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Wall conditioning and its effect on RFP plasma performance in REPUTE-1 Reviewed International journal

    Shinohara, S., Yamagishi, K., Ohdachi, S., Ejiri, A., Mayanagi, K., Shimazu, Y., and Miyamoto, K

    Plasma Physics and Controlled Fusion   34   1992.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

▼display all

Books

  • クライオ電子顕微鏡ハンドブック

    真柳浩太 他 (監修 難波 啓一、加藤 貴之、牧野 文信)( Role: Joint author)

    エヌ・ティー・エス  2023.1 

     More details

    Language:Japanese   Book type:Scholarly book

  • 構造決定法

    真柳浩太, 廣明秀一, 白井 剛 他

    講談社  2010.12 

     More details

    Language:Japanese   Book type:Scholarly book

  • 生命の謎を解く —タンパク質研究からのアプローチ−

    関口睦夫、森川耿右、楯真一、真柳浩太、藤博幸、日高真純、岡崎賢二、陣上久人、藤井郁雄( Role: Joint author)

    共立出版  2004.6 

     More details

    Language:Japanese   Book type:Scholarly book

Presentations

  • BINDS九州大学拠点におけるクライオEM構造解析支援及び高度化 Invited

    真柳浩太

    徳島大学・九州大学BINDS合同シンポジウム  2023.10 

     More details

    Event date: 2023.10

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:徳島大学   Country:Japan  

  • 九州大学病院キャンパスにおけるクライオ電子顕微鏡施設の現状 Invited

    真柳浩太

    日本生物物理学会九州支部主催・九州大学生体防御医学研究所共催セミナー「構造生物学の新展開:in vitroからin cell, in vivoへ」  2023.7 

     More details

    Event date: 2023.7

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学   Country:Japan  

  • 電子顕微鏡で「見た」アーキアのDNA 複製装置の仕組み Invited

    真柳浩太

    第34 回日本Archaea 研究会講演会  2022.7 

     More details

    Event date: 2022.7

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • Key steps in nucleosome reorganization by human FACT as revealed by cryo-EM single particle analysis

    Kouta Mayanagi, Kazumi Saikusa, Naoyuki Miyazaki, Satoko Akashi, Kenji Iwasaki, Yoshifumi Nishimura, Kosuke Morikawa, and Yasuo Tsunaka

    Gordon Research Conference 3D Electron Microscopy  2022.6 

     More details

    Event date: 2022.6 - 2023.6

    Language:English  

    Country:Japan  

  • 最先端電子顕微鏡カメラで「見る」生体高分子複合体の立体構造 Invited

    真柳浩太

    バイオインタラクション研究会 第16回ワークショップ  2022.3 

     More details

    Event date: 2022.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都   Country:Japan  

  • Cryo-EM network aiming to support drug discovery in the Kyushu / West Japan area Invited

    2021.11 

     More details

    Event date: 2021.11

    Language:English   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Country:Japan  

  • クライオ電子顕微鏡によるPolD-PCNA-DNA複合体の構築様式及び切換え機構の解析

    真柳 浩太,沖 啓輔,宮崎 直幸,石野 園子,山上 健,岩崎 憲治,森川 耿右,神田 大輔,白井 剛,石野 良純

    第42回日本分子生物学会年会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • FACTによって引き起こされるヘキサゾーム構造の電子顕微鏡解析

    津中 康央, 真柳 浩太, 七種 和美, 宮崎 直幸, 明石 知子, 岩崎 憲治, 西村 善文, 森川 耿右

    2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • FACT-ヌクレオソーム複合体の単粒子解析 Invited

    真柳浩太

    第2回 エピジェネティック因子の構造と機能をつなぐ会  2018.9 

     More details

    Event date: 2019.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学(福岡)   Country:Japan  

  • Direct Visualization of DNA Baton Pass between Replication Factors Bound to Archaeal Okazakisome. International conference

    Kouta Mayanagi, Sonoko Ishino, Tsuyoshi Shirai, Takuji Oyama, Shinichi Kiyonari, Daisuke Kohda, Kosuke Morikawa, Yoshizumi Ishino

    15th International Congress on Thermophiles  2019.9 

     More details

    Event date: 2019.9

    Language:English  

    Country:Japan  

  • クライオ電顕で「見る」古細菌複製フォーク複合体の機能構造 Invited

    真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純

    第41回日本分子生物学会年会  2018.11 

     More details

    Event date: 2018.11

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

    DNAの複製には多数の蛋白質が関わり、一般的に互いに結合して複合体を形成し、その機能を担っている。これらの超分子複合体は柔軟な構造を持ち、構成因子を刻一刻とダイナミックに変化させるものも多く、結晶構造解析が一般的に困難である。個々の分子の実像が観察可能なクライオ電顕を用いた単粒子解析法は、このようなターゲットに対して非常に有効である。特に近年の「電子直接検出(DED)カメラ」の発展により、結晶構造解析に迫る分解能の解析が可能となり、大変に注目されている。我々はこれまで、構造解析に適した超好熱古細菌の系を中心に、レプリソームの機能構造連関を単粒子解析を用いて研究してきた。本講演では最新のク ライオ電顕技術を用いて得られたPolDとDNAクランプ、及び基質DNAから構成される複合体の構造的知見について報告する。 PolBが大変に良く研究されPCR等への応用が進んでいるのに対し、PolDは優れた伸長活性、校正反応活性を有しながら、特に構造に関する研究が進んでいない。近年、ようやく構成サブユニットDP1及びDP2の部分結晶構造が報告されたが、全体構造の解析例は皆無であり、サブユニット組成さえ未知である。PolDもPolB同様、生体中ではDNAクランプPCNAに結合することでその機能を活性化させる。 ゲル濾過により機能構造であるPolD-PCNA-DNA複合体を精製、凍結ロボットによって非晶質の氷中に包埋し、クライオ電子顕微鏡を用いて複合体の粒子像を撮影した。高感度、且つ高速の「動画撮影」が可能なDEDカメラを用い、さらに粒子像のコントラストを向上させる「位相板」を使用することで分解能の向上を図った。解析の結果、複合体の全体構造及びDP1、DP2の配置が明らかになった。また溶液中に2通りの構造が混在していることがわかった。両構造ともアルファーヘリックスが明確に可視化されており、更に結晶構造には含まれていない領域の可視化にも成功している。

  • DNA-蛋白質複合体の単粒子解析 Invited

    真柳浩太

    生理研研究会2018  2018.11 

     More details

    Event date: 2018.11

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡崎   Country:Japan  

    我々はこれまで主にDNAの複製・修復・組換えや、転写に関わる超分子複合体の構造を単粒子解析を用いて解析してきた。これらの超分子複合体は、反応の各段階で構成因子の会合及び解離を適宜行うことで、適切に複合体を再編成させて、一連の反応を綿密に制御している。従ってその機構を理解するためには,個々の構成因子の結晶構造だけでは不十分であり、複合体全体の構造解析が必須であるが、DNAを含み且つこのように常に構造変化を伴う複合体の結晶化は容易ではない。「単粒子解析法」は、試料の結晶化の必要がなく、このような超分子複合体の立体構造解析に最適である。特に近年「電子直接検出カメラ」の開発により分解能が飛躍的に向上し、結晶構造解析と互角となっている。
     FACTはヌクレオソーム中のヒストンH2A/H2Bを引き抜くことでヌクレオソーム構造を破壊し、クロマチンのリモデリングを行う。近年、この反応を担うFACTのMidドメインとヒストンの結晶構造が2報発表されたが結果は一致せず、ヌクレオソーム全体との複合体の解析が待たれる状況であった。我々は収差補正機構を備えた最先端のクライオ電子顕微鏡、電子直接検出カメラ、位相板等を用いてMidドメインとヌクレオソームの構造解析を行った。対象となる粒子は16万〜20万程度とやや小さいため、特に位相板の使用が効果的であった。立体構造解析の結果、FACTとヌクレオソームの反応の生成物であるヘキサソームの構造が得られた。更に、MidのC末端から伸びる天然変性領域であるAIDセグメントがDNAと置き換わる形でヌクレオソームに侵入する様子を捉えることに成功し、ヌクレオソームの不安定化の機構の一端を明らかにすることができた。

  • クライオ電顕で見る超分子複合体の立体構造 Invited

    真柳浩太

    第42回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム  2018.8 

     More details

    Event date: 2018.8

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:佐賀   Country:Japan  

    近年、超解像技術の発展等により、細胞中の様々な因子の局在、動態については光学顕微鏡によって非常に詳細な情報がリアルタイムでモニター可能となっている。一方それら各因子の構造についても、おもに結晶構造解析による網羅的解析がなされ、既に膨大な原子座標データが蓄積されている。しかしながら、両者はその間に横たわるナノメータレンジの解析手段のギャップの存在によって、必ずしも有機的に結びつけられていない。
       生体内で蛋白質は、互いに結合して複合体を形成し、その機能を担っていることが多い。これらの超分子複合体はその構造、構成因子を刻一刻変化させるものも多く、またその大きさも正に前述のナノメータレンジに相当することから、これまで結晶構造解析などによる解析が一般的に困難であった。電子顕微鏡は細胞レベルから原子レベルまで、非常にワイドなスケールレンジを誇り、このギャップを埋め得る有望な手段である。特に個々の分子の実像を直視できる電子顕微鏡の特性を活かした、「単粒子解析法」は、試料の結晶化の必要がなく、超分子複合体の立体構造解析に最適である。
     本手法では生体超分子複合体を、急速凍結により溶液中の機能構造を保ったまま薄い氷中に保持し、電子顕微鏡で撮影した多数の粒子像から、計算機を用いてその立体構造を再構成する。その際、生体試料が一般的に電子線に脆弱であるため、電子線量を極度に下げた「暗い」撮影条件で画像を記録する必要があり、電子顕微鏡の装置自体は高分解能であるにも拘らず、これまで単粒子解析法による原子レベルの解析が大変に困難であった。
     実際、昨年ノーベル賞を受賞したR. Henderson博士は1995年に、分子量10万程度の複合体の画像を一万粒子ほど解析することで、3Åの原子分解能が得られると“予言”していたものの、5、6年前までメガダルトンを超えるリボソームのような巨大分子ですら、数十万〜数百万の粒子を解析しても原子分解能に到達するのが困難であった。
     近年、高感度で且つ高速の動画撮影が可能な「電子直接検出カメラ(DED)」が開発されたことにより、従来「静止画」で撮影していた電顕画像データを動画で撮影したところ、露光中に被写体である粒子が動いていたことが確認され、フレーム毎にこの動きを戻して補正することで、飛躍的に分解能が向上することが示された。このことにより、単粒子解析法は今では結晶構造解析と互角の分解能を実現できるまでになった。本講演ではこの単粒子解析法を概説したのち、本手法を用いて得られた成果等について報告する。
      我々はこれまで主にDNAの複製・修復・組換えや、転写に関わる超分子複合体の構造を単粒子解析を用いて解析してきた。これらの超分子複合体は、反応の各段階で構成因子の会合及び解離を適宜行うことで、適切に複合体を再編成させて、一連の反応を綿密に制御している。従ってその機構を理解するためには,個々の構成因子の結晶構造だけでは不十分であり、複合体全体の構造解析が必須であるが、DNAを含み且つこのように常に構造変化を伴う複合体の結晶化は容易ではない。そのため、個々の因子の結晶構造から全体の構造を組み上げて推察する方法も多くとられてきたが、我々が解析してきた単粒子解析による「全体」構造は多くの場合、これら提唱モデルと異なっていた。
    1) オカザキソームの解析
     ラギング鎖の複製は主に3つの因子、ポリメラーゼ、フラップエンドヌクレアーゼ、リガーゼによって行われ、これらが順次切り替わることで、オカザキ断片の生成・連結が進行する。その際、ポリメラーゼを活性化するPCNAクランプが3量体であることから、3因子全てを同時に1つのPCNAクランプ上に保持し効率を向上させる「ツールベルトモデル」が提唱されていた。我々はこれまで、Pol-PCNA-DNA(参考文献5), Lig-PCNA-DNA(参考文献6), FEN-PCNA-DNA等の構造や、因子が切り替わる遷移状態のLig-FEN-PCNA-DNAの構造を解析してきたが、何れの結果も従来のモデルでは説明が困難であり、PCNAが単なる留め金ではなく、これまで考えられていた以上に因子の切り替えの制御に寄与している事が明らかになった。
    2) ヌクレオソーム・リモデリング因子複合体の解析
     オカザキソームの解析には従来のCCDカメラを用いたのに対して、本サンプルはDEDカメラで解析を行った。またサンプルの大きさが20万程度と小さいため、このような対象に有効な「位相板」を活用した。その結果大幅に分解能を向上させることができ、ヌクレオソーム不安定化の機構を明らかにすることができた。

  • Single particle analysis of PolD‒PCNA‒DNA complex

    第40回日本分子生物学会年会  2017.12 

     More details

    Event date: 2017.12

    Language:Japanese  

    Venue:神戸   Country:Japan  

    DNA polymerase PolB of the hyperthermophilic archaea is widely used in genetic engineering tools such as PCR, because of its outstanding stability under high temperature. All Archaea, except Crenarchaea have PolD in addition to PolB. Several recent studies have proved that PolD but not PolB is essential for genome replication. Though PolD has an excellent elongation as well as proofreading activity, it has never been applied to biotechnological tools such as PCR, due to the limited structural knowledge. Recently, the crystal structures of the core region of the PolD subunits DP1 and DP2 have been reported. However, the overall structure of PolD is not known in detail, till now.
    We have successfully established a purification method of the full length PolD, and by mixing PCNA and primed DNA, we could purify the reconstituted PolD-PCNA-DNA complex, by gel filtration. The 3D structure of this complex was investigated by cryo electron microscopic single particle analysis. In order to improve the resolution of the 3D map, frozen hydrated samples were examined by Titan Krios cryo EM equipped with a Volta phase plate, and images were recorded with a direct electron detector (DED) camera.
    The obtained 3D map exhibited not only the double helical structure of DNA, but also fine structures corresponding to the α helices of PolD. We could construct the atomic model of the whole complex by docking the individual crystal structures of PCNA, DP1, and DP2 into the obtained 3D map.
    ave successfully established an purification method of the full length PolD, and by mixing PCNA and primed DNA, we could purify the reconstituted PolD-PCNA-DNA complex, by gel filtration. The 3D structure of this complex was investigated by cryo electron microscopic single particle analysis. In order to improve the resolution of the 3D map, frozen hydrated samples were examined by Titan Krios cryo EM equipped with a Volta phase plate, and images were recorded with an electron detector camera. The obtained 3D map exhibited not only the double helical structure of the DNA, but also fine structures corresponding to the α helices of the PolD. We could construct the atomic model of the whole complex by docking the individual crystal structures of PCNA, DP1, and DP2, into the obtained 3D map.

  • 電子顕微鏡で「見る」生体超分子の構造−革新的発展を続ける単粒子解析 Invited

    真柳浩太

    JASIS 2017 ライフサイエンスイノベーション  2017.9 

     More details

    Event date: 2017.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:千葉   Country:Japan  

  • Single particle analysis of DNA replication fork complex International conference

    Kouta Mayanagi

    10th International 3R (DNA, Replication, Recombination, and Repair) Symposium  2016.11 

     More details

    Event date: 2016.11

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Switching mechanism of the replisome as revealed by single particle analysis Invited

    Mayanagi K, Ishino S Takafuji M, Mitsuoka K, Shirai T, Kiyonari S, Nishida H, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y.

    2016.9 

     More details

    Event date: 2016.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Switching mechanism of DNA replication fork complex revealed by single particle analysis International conference

    Mayanagi K, Ishino S Takafuji M, Mitsuoka K, Shirai T, Kiyonari S, Nishida H, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y.

    The 16th European Microscopy Congress  2016.8 

     More details

    Event date: 2016.8 - 2016.9

    Language:English  

    Country:France  

  • Molecular switching of DNA replication fork complex revealed by single particle analysis Invited International conference

    Kouta Mayanagi

    The 1st APPA-PSSJ joint workshop  2016.6 

     More details

    Event date: 2016.6 - 2018.6

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移•制御機構の解明

    真柳浩太

    さきがけ-ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術- 研究領域 研究成果報告会  2015.11 

     More details

    Event date: 2015.11

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京   Country:Japan  

  • DNA複製フォーク複合体の分子構築及び切換え機構の研究 Invited

    真柳 浩太

    蛋白研セミナー  2014.2 

     More details

    Event date: 2014.2

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:大阪大学蛋白質研究所   Country:Japan  

  • DNA複製に関与する超分子複合体の単粒子解析 Invited

    真柳 浩太

    日本顕微鏡学会第57回シンポジウム  2013.11 

     More details

    Event date: 2013.11

    Language:Japanese  

    Venue:名古屋   Country:Japan  

  • Electron microscopic analysis of molecular architecture and switching mechanism of DNA replication fork complex International conference

    Kouta Mayanagi

    ICSG2013-SLS  2013.7 

     More details

    Event date: 2013.7 - 2013.8

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Molecular architecture and switching mechanism of DNA replication fork complex International conference

    2013.6 

     More details

    Event date: 2013.6

    Language:English  

    Venue:Colby-Sawyer College New London, NH   Country:United States  

  • 単粒子解析による複製関連複合体の制御機構の研究 Invited

    真柳 浩太

    遺伝研研究集会  2012.10 

     More details

    Event date: 2012.10

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:遺伝研   Country:Japan  

  • Molecular architecture and switching mechanism of DNA replication fork complex as revealed by single particle analysis International conference

    Kouta Mayanagi

    Structural Biology & DNA Repair (Current Opinion Conferences)  2011.10 

     More details

    Event date: 2011.10 - 2011.11

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Netherlands  

  • 単粒子解析によるDNA 複製の制御機構の研究/ The regulation mechanism of DNA replication revealed by single particle analysis

    真柳 浩太、清成 信一、西田 洋一、齊藤 美保子、神田 大輔、石野 良純、白井 剛、森川 耿右

    第11回日本蛋白質科学会年会  2011.6 

     More details

    Event date: 2011.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:ホテル阪急エキスポパーク   Country:Japan  

  • Molecular architecture of the PolB-PCNA-DNA complex as revealed by the electron microscopic single particle analysis International conference

    Kouta Mayanagi, Shinichi Kiyonari, Hirokazu Nishida, Mihoko Saito, Daisuke Kohda, Yoshizumi Ishino, Tsuyoshi Shirai, and Kosuke Morikawa

    The 7th Global COE International Symposium & 6th Young Investigators Forum  2011.2 

     More details

    Event date: 2011.2

    Country:Indonesia  

  • 電子顕微鏡単粒子解析による複製関連複合体の反応制御機構の研究 Invited

    真柳浩太、西田洋一、清成信一、斉藤美保子、神田大輔、石野良純、白井剛、森川耿右

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会  2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • DNA Pol-PCNA-DNA複合体の電子顕微鏡単粒子解析

    真柳浩太, 西田洋一, 清成信一, 神田大輔, 白井 剛, 石野良純, 森川耿右

    第10回日本蛋白質科学会年会  2010.6 

     More details

    Event date: 2010.10

    Venue:札幌   Country:Japan  

  • 単粒子解析によるDNA複製関連複合体の構造研究 Invited

    真柳浩太

    第51回 日本顕微鏡学会 九州支部総会・学術講演会  2009.12 

     More details

    Event date: 2009.12

    Venue:北九州   Country:Japan  

  • Mechanism of replication machinery assembly as revealed by the single particle analysis of DNA ligase-PCNA-DNA complex International conference

    K. Mayanagi, , N. Hirokazu, Y. Ishino, K. Morikawa,

    Gordon Research Conferences on Three Dimensional Electron microscopy  2009.6 

     More details

    Country:Japan  

  • グリーンファルマ構造解析センター

    真柳浩太

    第1回クライオ電子顕微鏡 施設技術交流会  2022.11 

     More details

    Event date: 2022.11

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:札幌   Country:Japan  

  • Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA complex in a hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis

    2020.11 

     More details

    Event date: 2020.11

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • クロマチンリモデリング因子CHD8の機能異常によるASD発症の分子基盤の解明

    白石 大智, 片山 雄太, 西山 正章, 真柳 浩太 ,神田 大輔, 浦 聖恵, 鯨井 智也, 胡桃坂仁志, 中山 敬一

    第42回日本分子生物学会年会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • Thermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの調製法の改良とその生化学的解析

    山上 健, 沖 啓輔, 高島 夏希, 高藤 三加, 真柳 浩太, 石野 園子, 石野 良純

    第42回日本分子生物学会年会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • 単粒子電子顕微鏡による全長ヒトポリ(ADP-リボース)合成酵素1の2量体構造

    三輪 正直, 香山 賢一, 真柳 浩太, 中江 摂, 西 義介, 白井 剛

    第42回日本分子生物学会年会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • PolD上での相互作用因子スウィッチングによるアーキア特有のレプリソーム機能変換機構の提唱

    沖 啓輔, 山上 健, 永田 麻梨子, 真柳 浩太, 沼田 倫征, 石野 園子, 石野 良純

    第42回日本分子生物学会年会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • Interactions of helicase, DNA polymerase, and primase to form functional replisome in the hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakarensis. International conference

    Keisuke Oki, Mariko Nagata, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Tomoyui Numata, Kouta Mayanagi, and Yoshizumi Ishino

    15th International Congress on Thermophiles  2019.9 

     More details

    Event date: 2019.9

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Integrative Analysis Combining AFM, NMR, and EM Revealed Two-State Conformational Exchange of a Single-subunit Oligosaccharyltransferase from Archaeoglobus fulgidus. International conference

    Yuki Kawasaki, Hirotaka Ariyama, Daisuke Fujinami, Hajime Motomura, Ashutosh Srivastava, Florence Tama, Daisuke Noshiro, Toshio Ando, Kouta Mayanagi, Daisuke Kohda

    15th International Congress on Thermophiles  2019.9 

     More details

    Event date: 2019.9

    Language:English  

    Country:Japan  

  • 統合的なAFM, NMR, 電顕単粒子解析により明らかにされたオリゴ糖転移酵素の動的構造.

    川崎由貴, 有山弘高, 藤浪大輔, 本村肇, Ashutosh Srivastava, Florence Tama, 能代大輔, 安藤敏夫, 真柳浩太, 神田大輔

    第38回日本糖質学会年会  2019.8 

     More details

    Event date: 2019.8

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名古屋大学   Country:Japan  

  • 超好熱性アーキア由来クランプPCNA 上で働くDNA 複製タンパク質の生化学および構造の解析

    石野園子、真柳浩太、白井剛、清成信一、今井奈美子、大山拓次、山上健、石野良純

    日本農芸化学会2019年度大会  2019.3 

     More details

    Event date: 2019.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京   Country:Japan  

  • Replisome structure and its functions in Archaea Invited International conference

    Yoshizumi Ishino, Keisuke Oki, Mariko Nagata, Kouta Mayanagi, Tsuyoshi Shirai, Takuji Oyama, Kosuke Morikawa, Takeshi Yamagami, and Sonoko Ishino

    OKAZAKI Fragment Memorial Symposium: Celebrating the 50th anniversary of the discontinuous DNA replication model  2018.12 

     More details

    Event date: 2018.12

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAホリメラーセの構造と機能の相関

    #高島 夏希, 石野 園子, 高藤 三加, 真柳 浩太, #原 智彦, 山上 健, 石野 良純

    第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会・合同大会  2015.12 

     More details

    Event date: 2018.12

    Language:Japanese  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • ヌクレオソーム構造変換におけるFACT酸性天然変性領域の新たな分子機能

    津中康央, 真柳浩太, 七種和美, 七種和美, 宮崎直幸, 明石知子, 岩崎憲治, 西村善文, 森川耿右

    第41回日本分子生物学会年会  2018.11 

     More details

    Event date: 2018.11

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの分子解剖による機能分布の解明

    沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 高島夏希, 真柳浩太, 白井剛, 石野園子, 石野良純

    第41回日本分子生物学会年会  2018.11 

     More details

    Event date: 2018.11

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • Integrative approach combining electron microscopy and high-speed AFM revealed the dynamic conformational exchange of the oligosaccharyltransferase in lipid bilayers International conference

    Yuki Kawasaki, Kouta Mayanagi, Ashutosh Srivastava, Hirotaka Ariyama, Florence Tama, Toshio Ando, and Daisuke Kohda

    2018.10 

     More details

    Event date: 2018.10 - 2019.10

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Family D DNA polymerase tethers primase and helicase in the replisome in Thermococcus kodakarensis International conference

    Keisuke Oki, Takeshi Yamagami, Mariko Nagata, Natsuki Takashima, Kouta Mayanagi, Sonoko Ishino, and Yoshizumi Ishino

    12th International Congress on Extremophiles  2018.9 

     More details

    Event date: 2018.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Italy  

  • Biochemical and Structural analyses of replication proteins bound to PCNA International conference

    Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Tsuyoshi Shirai, Shinichi Kiyonari, Namiko Imai, Takuji Oyama, and Yoshizumi Ishino

    12th International Congress on Extremophiles  2018.9 

     More details

    Event date: 2018.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Italy  

  • Single particle analysis of FACT-Nucleosome complex International conference

    Kouta Mayanagi

    2018.2 

     More details

    Event date: 2018.2

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移・制御機構の解明

    真柳浩太

    第10回さきがけ構造生命領域会議  2017.12 

     More details

    Event date: 2017.12

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:奈良   Country:Japan  

  • FACT-Nucleosome複合体の単粒子解析

    真柳浩太

    新学術領域「染色体OS」第5回領域会議  2017.9 

     More details

    Event date: 2017.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:大阪   Country:Japan  

  • DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移・制御機構の解明

    真柳浩太

    第9回さきがけ構造生命領域会議  2017.5 

     More details

    Event date: 2017.5

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:金沢   Country:Japan  

  • Single particle analysis of FACT-Nucleosome complex International conference

    Kouta Mayanagi

    2017.2 

     More details

    Event date: 2017.2 - 2018.2

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:United Kingdom  

  • DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移・制御機構の解明

    真柳浩太

    さきがけ – ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術- 研究領域研究成果報告会  2017.1 

     More details

    Event date: 2017.1

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京   Country:Japan  

  • 電顕単粒子解析による生体高分子複合体の立体構造決定

    真柳浩太

    第8回構造生物学に関する先端技術講演会  2017.1 

     More details

    Event date: 2017.1

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • 電子顕微鏡による染色体動態を担う超分子複合体の構築原理及び制御・遷移 機構の研究

    真柳浩太

    新学術領域研究 「染色体オーケストレーションシステム」 第3回 領域会議,  2016.7 

     More details

    Event date: 2016.7

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:山形   Country:Japan  

  • Molecular anatomy of DNA polymerase D for functional elucidation of each subunit, DP1 and DP2

    2016.6 

     More details

    Event date: 2016.6

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Single particle analysis of DNA replication fork complex Invited International conference

    Kouta Mayanagi

    2015.11 

     More details

    Event date: 2015.11

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • オリゴ糖転移酵素AglBのナノディスクへの再構成と電顕単粒子解析

    #川崎由貴, 眞柳浩太, 神田大輔

    平成27年度日本生化学会九州支部例会  2015.5 

     More details

    Event date: 2015.5

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • Divergently evolved activation mechanism of the replicative helicase in the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum

    Hiromi Ogino, Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Takuji Oyama, Tsyoshi Shirai, Kosuke Morikawa, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, Daisuke Kohda, Yoshizumi Ishino

    2013.12 

     More details

    Event date: 2013.12

    Language:English  

    Country:Japan  

  • 好熱性アーキアThermoplasma acidophilumにおける複製ヘリカーゼ活性化機構の分岐進化

    尾木野弘実, 石野 園子, 真柳 浩太, 大山 拓次, 白井 剛, 森川 耿右, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, 神田 大輔, 石野 良純

    第14回極限環境生物学会  2013.10 

     More details

    Event date: 2013.10

    Language:Japanese  

    Venue:川崎   Country:Japan  

  • Electron microscopic structure analysis of protein-DNA complexes International conference

    Kouta Mayanagi

    The 3rd International conference on New Frontier of the Research on RecA-family recombinases and their accessory proteins  2013.10 

     More details

    Event date: 2013.10

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 組み換えhuman poly(ADP-ribose) polymerase 1の精製と予備的構造解析

    第86回日本生化学会大会  2013.9 

     More details

    Event date: 2013.9

    Language:Japanese  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • Activation mechanism of the replicative helicase in the thermophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum

    Hiromi Ogino, Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Takuji Oyama, Tsyoshi Shirai, Kosuke Morikawa, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, Daisuke Kohda, Yoshizumi Ishino

    Thermophiles 2013  2013.9 

     More details

    Event date: 2013.9

    Language:English  

    Country:Germany  

  • Thermoplasma acidophilum由来Cdc6/Orc1とホモ4量体のGINSによるMCMとの相乗的な活性化

    尾木野弘実, 石野 園子, 真柳 浩太, 大山 拓次, 白井 剛, 森川 耿右, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, 石野 良純

    第35回日本分子生物学会年会  2012.12 

     More details

    Event date: 2012.12

    Language:Japanese  

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • The molecular switching mechanism of replication factors as revealed by electron microscopic single particle analysis 電子顕微鏡単粒子解析による複製因子の切換機構の研究

    真柳浩太、清成信一、西田洋一、斉藤美保子、神田大輔、白井剛、石野良純、森川耿右

    分子生物学会  2011.12 

     More details

    Event date: 2011.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • Homotetramer of Gins protein from the thermoacidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum as a functional form in DNA replication

    2011.10 

     More details

    Event date: 2011.10

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 相同組換えに関わるSwi5-Sfr1 複合体の構造機能解析/ Strucutual analysis of Swi5-Sfr1 complex, mediators for homologous recombination.

    桑原 直之、橋本 博、小甲 裕一、池口 満徳、佐藤 衛、真柳 浩太、村山 泰人、岩崎 博史、清水 敏之

    第11回日本蛋白質科学会年会  2011.6 

     More details

    Event date: 2011.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:ホテル阪急エキスポパーク   Country:Japan  

  • 相同組換えに関わるSwi5-Sfr1複合体の構造機能解析

    桑原直之,橋本博,小甲裕一,池口満徳,佐藤衛,真柳浩太,村山泰斗,岩崎博史,清水敏之

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会  2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisの複製フォーク複合体解明に向けてのMCM, GINS複合体解析

    藤野誠司,石野園子,井田梨沙,尾木野弘実,冨田宏矢,金井保,跡見晴幸,真柳 浩太,大山 拓次,森川 耿右,石野 良純

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会  2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • Homotetrameric GINS from the thermoacidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum

    2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 超好熱古細菌リボヌクレアーゼPの高次構造解析を目指した再構成酵素の精製

    中尾祐士,服部淳子,原唯史,山口浩輝,郷田秀一郎,真柳浩太,神田大輔,角田佳充,木村誠

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会  2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • Modeling of 3R complexes from structure database.

    Mayanagi K, Saito M, Oyama T, Ishino Y, Shirai T

    2010.9 

     More details

    Event date: 2010.9

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 「九州圏構造生物学拠点構想」

    阿部義人, 稲葉謙次, 真柳浩太

    2008.12 

     More details

    Event date: 2008.12

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • Visualization of Intrinsically Disordered Regions of Proteins by High-Speed Atomic Force Microscopy

    A. Miyagi, Y. Tsunaka, T. Uchihashi, K. Mayanagi, S. Hirose, K. Morikawa, T. Ando

    2008.12 

     More details

    Event date: 2008.12

    Country:Japan  

  • 抗酸菌の天然変性ヒストン様タンパク質 その機能と休眠菌形成における役割(Mycobacterial intrinsically disordered histone-like protein, its function and role in mycobacterial dormancy)

    Nishiyama Akihito, Shimizu Masahiro, Kodera Noriyuki, Ozeki Yuriko, Mayanagi Kouta, Yamaguchi Takehiro, Matsumoto Sohkichi

    生物物理  2023.10  (一社)日本生物物理学会

     More details

    Language:English  

  • Architecture of the DNA ligase-PCNA-DNA complex and implications for mechanism assembling replication machinery

    GCOE:生命科学系 GCOEネットワーク・フォーラム2009  2009.2 

     More details

    Venue:東京   Country:Japan  

  • DNA リガーゼ-PCNA-DNA複合体の単粒子解析

    真柳浩太, 清成信一, 斉藤美保子,  白井 剛, 石野良純, 森川耿右

    第9回日本蛋白質科学会年会  2009.5 

     More details

    Venue:熊本   Country:Japan  

  • DNA 複製ポリメラーゼの複製-校正モード変換の分子基盤

    西田洋一,  真柳浩太, 清成信一, 石野良純, 森川耿右

    第9回日本蛋白質科学会年会  2009.5 

     More details

    Venue:熊本   Country:Japan  

  • 高速AFMによる蛋白質天然変性領域の観察

    宮城 篤, 津中康央, 内橋貴之, 真柳浩太, 広瀬進, 西野達哉, 安藤敏夫, 森川耿右

    日本蛋白質科学会 第9回年会  2009.5 

     More details

    Venue:熊本   Country:Japan  

  • 大腸菌膜に発現させたオリゴ糖転移酵素の精製と結晶化

    井倉真由美, 真柳浩太, ニレンダ ジェイムス, 神田大輔

    日本蛋白質科学会 第9回年会  2009.5 

     More details

    Venue:熊本   Country:Japan  

  • RecQに関連する古細菌由来Hjmヘリカーゼの結晶構造とその機能

    大山拓次, 真柳浩太, 白井 剛, 藤兼亮輔, 石野良純, 森川耿右

    日本蛋白質科学会 第9回年会  2009.5 

     More details

    Venue:熊本   Country:Japan  

  • 複製関連超分子複合体の電子顕微鏡単粒子解析 Invited

    真柳浩太

    WSフォーラム −タンパク質・ペプチド研究の現状と展望−  2009.11 

     More details

    Venue:福岡   Country:Japan  

  • The switching mechanism of replication factors as revealed by the molecular architecture of the DNA ligase-PCNA-DNA complex

    2009.12 

     More details

    Country:Japan  

  • 大腸菌に発現させたAsn結合型糖鎖修飾を決定するオリゴ糖転移の精製と結晶化

    井倉真由美, 真柳浩太, 神田大輔

    第10回日本蛋白質科学会年会  2010.6 

     More details

    Venue:札幌   Country:Japan  

  • クライオ電子線トモグラフィーによる遺伝的な重金属でラベルしたLC4の検出

    金 明月, 柳澤 春明, 小屋迫 光太郎, 神谷律, 真柳 浩太, 安永 卓生

    第49回日本生物物理学会年会  2011.9 

     More details

    Language:Japanese  

    Venue:姫路   Country:Japan  

  • 電子線クライオトモグラフィー法による神経細胞NG108-15の超微細構造観察

    荒牧 慎二, 青山 一弘, 真柳 浩太, 安永 卓生

    第49回日本生物物理学会年会  2011.9 

     More details

    Language:Japanese  

    Venue:姫路   Country:Japan  

  • The GINS complex from the thermoacidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum may function as a homotetramer in DNA replication

    Hiromi Ogino, Sonoko Ishino, Kouta Mayanagi, Gyri Teien Haugland, Nils-Kare Birkeland, Akihiko Yamagishi, Yoshizumi Ishino

    2011.12 

     More details

    Language:English  

    Country:Japan  

  • TEM 及びSTEM を用いたクライオ電子線トモグラフィーによる神経細胞の超微細構造観察

    荒牧 慎二, 青山 一弘, 真柳 浩太, 安永 卓生

    2011年日本生物物理学会九州支部例会  2011.12 

     More details

    Language:Japanese  

    Venue:福岡県飯塚市   Country:Japan  

  • 3D ultrastructure within intact cells explored by electron cryo-tomography in TEM and STEM

    Shinji Aramaki, Kazuhiro Aoyama, Kouta Mayanagi, Takuo Yasunaga

    The 10th Asia-Pacific Microscopy Conference (APMC10)  2012.2 

     More details

    Language:English  

    Country:Australia  

▼display all

MISC

  • 負染色法による超分子複合体の単粒子解析 Reviewed

    真柳浩太

    顕微鏡   2021.8

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

    DOI: 10.11410/kenbikyo.56.2_81

  • 超分子複合体の電子顕微鏡単粒子解析

    真柳浩太

    バイオサイエンスとインダストリー   2005.6

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • 電子顕微鏡によるDNA結合蛋白質複合体の単粒子解析

    真柳浩太、宮田知子

    細胞工学   2001.10

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • 単粒子解析法で迫るDNA複製フォーク複合体の機能構造連関

    真柳 浩太

    顕微鏡   2014.8

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • DNAクランプ/複製DNAポリメラーゼ複合体におけるDNA合成・ 修正スイッチング機構

    西田洋一, 真柳浩太, 石野良純, 森川耿助

    日本結晶学会誌   2011.5

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • 真核生物のリコンビナーゼによるホリディ構造の形成と分岐点移動

    村山泰斗、黒川裕美子、真柳浩太、岩崎博史

    細胞工学   2006.6

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • 電子顕微鏡単粒子解析で「見る」超分子複合体

    真柳浩太

    バイオサイエンスとインダストリー   2005.6

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • DNAにクランプをはめ込むしくみ—単粒子解析で見えた生き生きとした姿

    鈴木博文、宮田知子、真柳浩太、石野良純、大山拓次、森川耿右

    生物物理   2005.6

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

▼display all

Professional Memberships

  • 日本生物物理学会

  • 日本分子生物学会

  • 日本蛋白質科学会

  • 日本顕微鏡学会

Committee Memberships

  • Organizer   Domestic

    2006.4 - Present   

Academic Activities

  • シンポジウムオーガナイザー

    第96回 日本生化学会大会  ( 福岡 ) 2023.10 - 2023.11

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • オーガナイザー

    第2回 クライオ電子顕微鏡施設技術交流会  ( 福岡 ) 2023.10

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • クライオEMセッション オーガナイザー・座長、 ポスターセッション責任者

    日本顕微鏡学会 第79回学術講演会  ( 松江 ) 2023.6

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2023

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2021

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2020

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

  • オーガナイザー、講師

    日本顕微鏡学会 生体構造解析分科会 「生体構造トモグラフィー」ワークショップ  ( 九州大学・生体防御医学研究所 ) 2011.5

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

    Number of participants:18

  • オーガナイザー

    日本顕微鏡学会第67回学術講演会 「生体構造の電子線トモグラフィー解析」  ( 福岡国際会議場 ) 2011.5

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • 座長(Chairmanship)

    日本顕微鏡学会第67回学術講演会  ( 福岡国際会議場 ) 2011.5 - 2011.6

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • 座長(Chairmanship)

    日本生物物理学会第46回年会  ( 福岡 ) 2008.12

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • 座長(Chairmanship)

    日本顕微鏡学会 第50回シンポジウム 医学生物系セッションII  ( 福岡 ) 2005.11

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • オーガナイザー

    日本顕微鏡学会 第50回シンポジウム 医学生物系セッションII  ( 福岡 ) 2005.11

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

▼display all

Research Projects

  • 結核菌の休眠誘導の構造基盤解明

    Grant number:23H02417  2023 - 2025

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • 革新的先端研究開発支援事業 (AMED-CREST) 天然変性蛋白質(IDP)を標的とする、中分子化合物による、新しい創薬フィールドの開拓

    2022.10 - 2028.3

    国立研究開発法人日本医療研究開発機構(AMED) 

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

  • 生命科学・創薬研究支援基盤事業 化合物ライブラリーの整備・提供とスクリーニン グ系構築等による支援と高度化 補助事業課題名:グリーンファルマ創薬構造解析による支援高度化の推進

    2022.4 - 2027.3

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

  • 研究開発課題:「天然変性蛋白質(IDP)を標的とする、中分子化合物による、新しい創薬フィールドの開拓」 分担研究開発課題:「IDR創薬を指向した最先端クライオ電子顕微鏡によるIDP-超分子複合体の単粒子解析」

    2022 - 2027

    AMED-CREST 革新的先端研究開発支援事業ユニットタイプ

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Contract research

  • 柔軟な構造領域を介した相互作用によるDNA結合タンパク質複合体の制御機構の研究

    Grant number:21K06050  2021 - 2023

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 天然変性ヒストン様蛋白質による、結核菌の個性の創出と多様性獲得の分子機構

    Grant number:20H03483  2020 - 2023

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • クライオ電子顕微鏡によるオカザキソームの機能構造連関の研究

    Grant number:18K06089  2018 - 2020

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 電子顕微鏡による染色体動態を担う超分子複合体の構築原理及び制御・遷移機構の研究

    Grant number:16H01410  2016 - 2017

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 生体分子構造データのグラフによる統一の試み

    Grant number:25280109  2013 - 2015

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • JST 戦略的創造研究推進事業(さきがけ)、領域:「ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術」、課題名:「DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移・制御機構の解明」

    2012.10 - 2016.3

      More details

    Authorship:Principal investigator 

  • クランプによるレプリソームの制御機構の機能構造連関の研究

    Grant number:24370046  2012 - 2015

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • DNA複製フォーク複合体の構築原理及び遷移・制御機構の解明

    2012 - 2015

    戦略的創造研究推進事業(さきがけ)「ライフサイエンスの革新を目指した構造生命科学と先端的基盤技術」

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Contract research

  • 電子顕微鏡による超分子複合体の構造解析用新規ラベル技術の開発

    Grant number:24651151  2012 - 2013

    科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • レプリソームの構築・再編成及び機能制御機構の構造生物学的研究

    Grant number:21570114  2009 - 2011

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト

    2009 - 2010

    九州大学教育研究プログラム研究拠点形成プロジェクト

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:On-campus funds, funds, etc.

  • 実践による超分子ネットワークモデリングシステムの開発

    2008 - 2010

    科学技術振興機構 バイオインフォマティクス推進事業

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Contract research

  • 実践による超分子複合体モデリングシステムの開発

    2005 - 2008

    科学技術振興機構 バイオインフォマティクス推進事業

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Contract research

▼display all

Class subject

  • 生物薬学演習 I

    2023.4 - 2023.9   First semester

  • 生物薬学演習 II

    2023.4 - 2023.9   First semester

  • 生命医科学特論III/ Topics in medical life science III

    2021.6 - 2021.8   Summer quarter

  • 生命医科学特論III/ Topics in medical life science III

    2020.6 - 2020.8   Summer quarter

  • 生命医科学特論III/ Topics in medical life science III

    2019.6 - 2019.8   Summer quarter

  • 生命医科学特論III

    2018.6 - 2018.8   Summer quarter

  • 生命医科学特論III

    2017.10 - 2017.12   Fall quarter

  • 蛋白質化学特論

    2017.4 - 2017.9   First semester

▼display all

Participation in international educational events, etc.

  • 2016.3

    西風塾 KAIST Seo研究室合同

    (西風塾&KAIST)国際研究発表会

      More details

    Venue:大分

  • 2011.2

    National University of Singapore & Kyushu Univ. GCOE program

    The 7th Global COE International Symposium and 6th Young Investigators Forum

      More details

    Venue:Singapore & Bintan Indonesia

  • 2010.9

    九州大学P&P 超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト

    超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト研究合宿

Other educational activity and Special note

  • 2023  Special Affairs 

  • 2023  Special Affairs 

  • 2022  Special Affairs 

  • 2022  Special Affairs 

  • 2022  Special Affairs 

  • 2022  Special Affairs 

  • 2021  Special Affairs 

  • 2021  Special Affairs 

  • 2020  Special Affairs 

  • 2020  Special Affairs 

  • 2019  Special Affairs 

  • 2018  Special Affairs 

  • 2017  Special Affairs 

  • 2017  Special Affairs 

  • 2016  Special Affairs 

  • 2014  Special Affairs 

  • 2014  Special Affairs 

  • 2013  Special Affairs 

  • 2012  Special Affairs 

  • 2012  Special Affairs 

  • 2012  Special Affairs 

  • 2011  Special Affairs 

  • 2010  Special Affairs 

  • 2010  Special Affairs 

▼display all

Social Activities

  • 第2回 CRYO ARM オーナーズミーティング 電子顕微鏡の問題点改善、性能向上に向けてメーカーへの提案・指導・情報交換

    日本電子株式会社  日本電子株式会社 昭島本社 開発館ホール  2023.12

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Other

  • 令和5年度九州大学大学院薬学研究院 公開講座 (兼 日本薬剤師研修センター集合研修会) 10月22日及び29日の2日間に渡り、地域の薬剤師及び一般市民を対象に「産学官が取り組む創薬開発 過去から現在そして未来へ」をタイトルに4人の演者による公開講座をオーガナイズした。

    九州大学大学院薬学研究院、財団法人日本薬剤師研修センター  九州大学  2023.10

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Lecture

    新型コロナを始めとするパンデミックが猛威を振るう昨今、生命科学、創薬研究において産
    官学の連携による迅速な応用研究、開発研究の推進がこれまで以上に重要になっています。そ
    の一方で、一見創薬と関係なく見える生命科学基礎研究が、年月を経て重要な実用研究へと発
    展するケースも多く、長期的視野も極めて大事です。我が国においても、以前からこのような
    政府、企業、アカデミアによる連携の試みはなされてきており、現在もBINDS等の大規模な国
    家プロジェクトが走っています。本公開講座は、このような産官学の連携に長年携わり、多様
    なバックグラウンドを持つ講師の方々に、これまでのこうした連携の歩み、現状、そこでのご
    自身のご活動等について講演していただき、未来への展望について共に考えていく機会となる
    ことを目的にしています。

  • 学生、研究者、企業関係者を対象に第1回 九州大学Cryo-EM講習会を「位相板」のテーマで2023年1月18日の日程で行った。 参加者の中心は本学学生であったが、 若手教員の参加もあった。クライオ電顕像のコントラストを著しく向上させる位相板のあ使い方について電子顕微鏡メーカーから講師を招いて行った。

    九州大学 薬学研究院  グリーンファルマ構造解析センター  2023.1

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Seminar, workshop

  • 学生、研究者、企業関係者を対象に第2回 九州大学Cryo-EM講習会をMicroEDのテーマで2023年1月25日ー26日の日程で行った。 参加者の中心は本学学生であったが、他大学教員や外資電子顕微鏡カメラメーカ等の民間企業からの参加もあった。 MicroED用のサンプル作成法、顕微鏡のセットアップ法等を中心に行った。

    九州大学 薬学研究院  グリーンファルマ構造解析センター  2023.1

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Seminar, workshop

    X線を用いた通常の結晶構造解析では解析が困難な微結晶から電子線回折を用いて立体構造を解析するMicroEDの回折データ収集法の実技型ワークショップを開催した。対象は通常のクライオ電顕の操作を習得している学内外の研究者。
    実際に九州大学薬学研究院に設置のクライオ電顕を用いてデータ収集を行った。

  • CRYO ARM オーナーズミーティング 電子顕微鏡の問題点改善、性能向上に向けてメーカーへの提案・指導・情報交換

    日本電子株式会社  日本電子株式会社 東京支店  2022.12

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Other

  • JASIS 2017 ライフサイエンス イノベーションゾーン 基調講演 「電子顕微鏡で「見る」生体超分子複合体の構造 – 革新的発展を続ける単粒子解析」 公開ディスカッション 「バイオサイエンス研究を加速するクライオ電顕および未来電顕技術とは」

    幕張メッセ  2017.9

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Lecture

    生体内で蛋白質は、互いに結合して複合体を形成し、その機能を担っていることが多い。これらの超分子複合体はその構造、構成因子を刻一刻変化させるものも多く、結晶構造解析が一般的に困難である。試料の結晶化の必要がなく、個々の分子の実像を直視できる電子顕微鏡の特性を活かした「単粒子解析法」はこのような系の解析に最適である。本手法では生体超分子複合体を、急速凍結により溶液中の機能構造を保ったまま薄い氷中に保持し、電子顕微鏡で撮影した多数の粒子像から、計算機を用いてその立体構造を再構成する。
     このように超分子複合体の構造解析手法として有望視され、徐々に発展してきた単粒子解析法であるが、電子顕微鏡の装置自体は高分解能であるにも拘らず、これまで原子レベルの解析が大変に困難であった。
     近年、高感度で且つ高速の動画撮影が可能な「電子直接検出カメラ」が開発された。露光中の試料の「ぶれ」を補正することが可能となり、分解能がこの数年で飛躍的に向上し、結晶構造解析と互角になった。単粒子解析法の紹介と、本手法をDNA-タンパク質複合体の構造解析に適応して得られた成果等について報告する。

▼display all