15th RIES-Hokudai International Symposium

2015年12月  

日本学術振興会特別研究員DC2/PD採用

2014年4月   日本学術振興会   細胞骨格微小管の集団運動における力学刺激の効果に関する研究

北海道大学平成25年度理学研究院研究者養成支援金

2013年7月   北海道大学   細胞骨格の動的自己組織化に関する研究

Adaptation of Patterns of Motile Filaments under Dynamic Boundary Conditions 査読 国際誌

Inoue, Daisuke; Gutmann, Greg; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Konagaya, Akihiko; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kakugo, Akira

ACS nano   2019年10月

Actin Filaments Regulate Microtubule Growth at the Centrosome 査読 国際誌

The EMBO journal   38 ( 11 )   e99630   2019年3月

Self-Repair Protects Microtubules from their Destruction by Molecular Motors 国際誌

bioRxiv   499020   2018年12月

Construction of Artificial Cilia from Microtubules and Kinesins through a Well-Designed Bottom-up Approach 査読 国際誌

Sasaki, Ren; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Anan, Shizuka; Kimura, Atsushi P; Konagaya, Akihiko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Nanoscale   10 ( 14 )   6323 - 6332   2018年2月

High-Resolution Imaging of a Single Gliding Protofilament of Tubulins by HS-AFM 査読 国際誌

Scientific reports   7 ( 1 )   6166   2017年7月

Sensing Surface Mechanical Deformation Using Active Probes Driven by Motor Proteins 査読 国際誌

Inoue, Daisuke; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Sada, Kazuki; Gong, Jian Ping; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira;

Nature communications   7   12557   2016年7月

Depletion Force Induced Collective Motion of Microtubules Driven by Kinesin 査読 国際誌

Inoue, Daisuke; Mahmot, Bulbul; Kabir, Arif Md Rashedul; Farhana, Tamanna Ishrat; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira

Nanoscale   7 ( 43 )   18054 - 18061   2015年7月

Growth of Ring-Shaped Microtubule Assemblies through Stepwise Active Self-Organisation 査読 国際誌

Inoue, Daisuke; Kabir, Arif Md Rashedul; Mayama, Hiroyuki; Gong, Jian Ping; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Soft Matter   9 ( 29 )   7061 - 7068   2013年5月

Formation of Ring-Shaped Assembly of Microtubules with a Narrow Size Distribution at an Air–Buffer Interface 査読 国際誌

8   10863 - 10867   2012年11月

Autonomous assembly and disassembly of gliding molecular robots regulated by a DNA-based molecular controller

Kawamata, I; Nishiyama, K; Matsumoto, D; Ichiseki, S; Keya, JJ; Okuyama, K; Ichikawa, M; Kabir, AMR; Sato, Y; Inoue, D; Murata, S; Sada, K; Kakugo, A; Nomura, SIM

SCIENCE ADVANCES   10 ( 22 )   eadn4490   2024年5月   （ ISSN:2375-2548 ）

Confined-microtubule assembly shapes three-dimensional cell wall structures in xylem vessels 査読 国際誌

Takema Sasaki, Kei Saito, Daisuke Inoue, Henrik Serk, Yuki Sugiyama, Edouard Pesquet, Yuta Shimamoto, Yoshihisa Oda

Nature Communications   14 ( 1 )   2024年1月

Cooperative cargo transportation by a swarm of molecular machines 査読 国際誌

Akter, Mousumi; Keya, Jakia; Kayano, Kentaro; Kabir, Arif Md Rashedul; #Inoue, Daisuke, Hess, Henry; Sada, Kazuki; Kuzuya, Akinori; Asanuma, Hiroyuki; Kakugo, Akira

Science Robotics   2022年3月

Radial Alignment of Microtubules through Tubulin Polymerization in an Evaporating Droplet 査読 国際誌

Keya, Jakia; Kudoh, Hiroki; Kabir, Arif; Inoue, Daisuke; Miyamoto, Nobuyoshi; Tani, Tomomi; Kakugo, Akira; Shikinaka, Kazuhiro

PLOS ONE   2020年3月

Regulation of Biomolecular-Motor-Driven Cargo Transport by Microtubules under Mechanical Stress 査読 国際誌

Syeda Rubaiya Nasrin, Tanjina Afrin, Arif Md. Rashedul Kabir, Daisuke Inoue, Takayuki Torisawa, Kazuhiro Oiwa, Kazuki Sada, and Akira Kakugo

ACS Applied Bio Materials   2020年3月

DNA-Assisted Swarm Control in a Biomolecular Motor System 査読 国際誌

Keya, Jakia Jannat; Suzuki, Ryuhei; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Asanuma, Hiroyuki; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kuzuya, Akinori; Kakugo, Akira

Nature communications   9 ( 1 )   453   2018年1月

Motility of Microtubules on the Inner Surface of Water-in-Oil Emulsion Droplets 査読 国際誌

Tsuji, Mikako; Rashedul Kabir, Arif Md; Ito, Masaki; Inoue, Daisuke; Kokado, Kenta; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Langmuir   33 ( 43 )   12108 - 12113   2017年10月

Role of Confinement in the Active Self-Organization of Kinesin-Driven Microtubules 査読 国際誌

Islam, Md Sirajul; Kuribayashi-Shigetomi, Kaori; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Sensors and Actuators B: Chemical   247   53 - 60   2017年8月

Control of Swarming of Molecular Robots 査読 国際誌

Keya, Jakia Jannat; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kuzuya, Akinori; Kakugo, Akira

Scientific reports   8   11756   2017年7月

Parallel Interaction Detection Algorithms for a Particle-based Live Controlled Real-time Microtubule Gliding Simulation System Accelerated by GPGPU 査読 国際誌

Gutmann, Gregory; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko

New Generation Computing   35 ( 2 )   157 - 180   2017年4月

Understanding the Emergence of Collective Motion of Microtubules Driven by Kinesins: Role of Concentration of Microtubules and Depletion Force 査読 国際誌

Saito, Ai; Farhana, Tamanna Ishrat; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Konagaya, Akihiko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

RSC advances   7 ( 22 )   13191 - 13197   2017年2月

Construction and Gilding of Metal‐Organic Frameworks and Microtubule Conjugates 査読 国際誌

1 ( 16 )   5358 - 5362   2016年10月

Mechanical Oscillation of Dynamic Microtubule Rings 査読 国際誌

Ito, Masaki; Kabir, Arif Md Rashedul; Islam, Md Sirajul; Inoue, Daisuke; Wada, Shoki; Sada, Kazuki; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira

RSC advances   6 ( 73 )   69149 - 69155   2016年7月

Enhanced Dynamic Instability of Microtubules in a ROS Free Inert Environment 査読 国際誌

Islam, Md Sirajul; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Biophysical chemistry   211   1 - 8   2016年4月

Using a Master and Slave Approach for GPGPU Computing to Achieve Optimal Scaling in a 3D Real-Time Simulation 査読 国際誌

Gutmann, Gregory; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko;

2016 IEEE 11th Annual International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems (NEMS)   95 - 100   2016年4月

Investigation of the Microtubule Dynamics with Probabilistic Data Association Filter 査読 国際誌

Mahemuti, Bulibuli; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko

2016 IEEE 11th Annual International Conference on Nano/Micro Engineered and Molecular Systems (NEMS)   101 - 106   2016年4月

Real-Time 3D Microtubule Gliding Simulation Accelerated by GPU Computing 査読 国際誌

Gutmann, Gregory; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko

International Journal of Automation and Computing   13 ( 2 )   108 - 116   2016年2月

Intelligence of Reconstructed Biomolecular Motor System 査読 国際誌

Inoue, Daisuke; Rashedul Kabir, Arif; Kakugo, Akira

Proceedings of the 9th EAI International Conference on Bio-inspired Information and Communications Technologies (formerly BIONETICS)   381 - 382   2015年12月

Buckling of Microtubules on a 2D Elastic Medium 査読 国際誌

Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Afrin, Tanjina; Mayama, Hiroyuki; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Scientific reports   5   17222   2015年11月

Drag Force on Micron-Sized Objects with Different Surface Morphologies in a Flow with a Small Reynolds Number 査読 国際誌

Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Kishimoto, Yuri; Hotta, Jun-ichi; Sasaki, Keiji; Kitamura, Noboru; Gong, Jian Ping; Mayama, Hiroyuki; Kakugo, Akira

Polymer Journal   47 ( 8 )   564   2015年8月

Controlling the Bias of Rotational Motion of Ring-Shaped Microtubule Assembly 査読 国際誌

Wada, Shoki; Kabir, Arif Md Rashedul; Kawamura, Ryuzo; Ito, Masaki; Inoue, Daisuke; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Biomacromolecules   16 ( 1 )   374 - 378   2014年12月

Effect of Length and Rigidity of Microtubules on the Size of Ring-Shaped Assemblies Obtained through Active Self-Organization 査読 国際誌

Wada, Shoki; Kabir, Arif Md Rashedul; Ito, Masaki; Inoue, Daisuke; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

Soft Matter   11 ( 6 )   1151 - 1157   2014年12月

Tracking Single Microtubules by Using B-spline Curves and Hausdorff Distance 査読 国際誌

Han, Yuexing; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko

Image Processing Theory, Tools and Applications (IPTA), 2014 4th International Conference on   2014年10月

Real-Time 3d Microtubule Gliding Simulation 査読 国際誌

Gutmann, Greg; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Konagaya, Akihiko

Life System Modeling and Simulation   13 - 22   2014年9月

Formation of Ring-Shaped Microtubule Assemblies through Active Self-Organization on Dynein 査読 国際誌

Ito, Masaki; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Torisawa, Takayuki; Toyoshima, Yoko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira;

Polymer journal   46 ( 4 )   220   2013年12月

Vitrification of Primordial Germ Cells Using Whole Embryos for Gene‐Banking in Loach, M isgurnus anguillicaudatus 査読 国際誌

28 ( 6 )   919 - 924   2012年12月

Active Self-Organization of Microtubules in an Inert Chamber System 査読 国際誌

Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Sada, Kazuki; Gong, Jian Ping

Polymer Journal   44 ( 6 )   607   2012年4月

Prolongation of the Active Lifetime of a Biomolecular Motor for In Vitro Motility Assay by Using an Inert Atmosphere 査読 国際誌

Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira; Kamei, Akiko; Gong, Jian Ping

Langmuir   27 ( 22 )   13659 - 13668   2011年11月

精密分子集積技術を用いた、分子人工筋肉の合成 招待

井上大介

2022年吉田学術教育振興会贈呈式  2022年11月 

サイエンス＆バイオビジュアリゼーション 招待

井上大介

身心一体科学研究会公開講演会2022  2022年9月 

In vitro 細胞骨格モデルによる 微小管-アクチンクロストークの可視化 招待

井上大介

身心一体科学研究会公開講演会2022  2022年9月 

細胞骨格のマイクロ・ナノスケールでの空間配置制御法 招待

井上大介

第８６回日本植物学会  2022年9月 

Control of Microtubules in Collective Motion by Microflow Channel 国際会議

@Inoue Daisuke

2022年3月 

細胞骨格の微細加工技術 招待

＠井上 大介

分子サイバネティクス領域セミナー  2022年2月 

Fantastic Voyage in VRCell world 国際会議

@Inoue Daisuke

VIZBI - Visualizing Biological Data  2021年3月 

Designing artificial microtubule nucleus by DNA nanotube 国際会議

@Inoue Daisuke

ASCB Cell Bio Virtual 2020  2020年5月 

微小管のIn vitro自己組織化 招待

@井上大介

植物細胞生物研究会2020  2020年10月 

Artificial γ-TuRC made by DNA origami

第58回日本生物物理学会年会  2020年9月 

Design of microtubule lattice structures using DNA origami seeds 国際会議

@Inoue Daisuke

EMBO/EMBL Symposium Microtubules from atoms to complex systems  2020年6月 

Design of microtubule lattice structures using programmable DNA origami seeds 国際会議

@Daisuke Inoue, Franky Djutanta, Rizal F. Hariadi

The 20th RIES-HOKUDAI International Symposium  2019年12月 

Road to cytoskeleton mastery

2023年12月 

細胞骨格の高次階層構造を再現するIn vitroシステム

井上大介

第46回日本分子生物学会  2023年12月 

サルコメア合成に向けた、細胞骨格とDNAナノテクノロジーを融合した再構築系の探求 招待

井上大介

第61回日本生物物理学会年会  2023年11月 

In vitro synthesis and edition of kinesin biomolecular motors 国際会議

The 23th RIES-HOKUDAI International Symposium  2022年7月 

アクチン自己組織化の時空間的制御による、リポソームの極性化

井上大介

第６回分子ロボティクス年次大会  2022年11月 

In vitro synthesis and design of kinesin-1 and kinesin-14

2022年9月 

Design of cytoskeletons by micro/nano fabrication 招待

2022年5月 

微小流路による微小管集団運動の制御

＠井上 大介

令和3年度若手研究者・博士課程学生支援プログラム エネルギーウィーク2022  2022年1月 

In vitro control of the self-organization of cell designer, cytoskeletons 招待

2021年12月 

In vitro assays of cytoskeleton 招待 国際会議

@Inoue Daisuke

International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS) 2021  2021年12月 

In vitro synthesis and design of kinesin biomolecular motors by cell-free protein expression system 国際会議

@Inoue Daisuke, Ohashi Keisuke, Takasuka Taichi, Kakugo, Akira

ASCB Cell Bio Virtual 2021  2021年12月 

Emergence of monopolar motile clusters of chiral microtubules in collective motion 招待

@Inoue Daisuke

2021年7月 

Mechanical response of microtubules in collective motion 招待 国際会議

@Inoue Daisuke

NUS seminar  2020年8月 

生体分子モーターは微小管格子構造のダイナミクスを促進する

@井上大介,トリクラン サラ, ガイヤール ジャレミー, ブランシュワン ローハン, テリー マニュエル

第69回高分子年次大会  2020年5月 

バイオセルフアセンブリーによるものづくりプロセスのアップデート 招待

@井上 大介

2020年1月 

Development of technique for programmable synapse formation of neurons 招待 国際会議

Viroholics seminar  2019年9月 

Examining neuronal viral exocytosis on a nanoarray combining NAPPA and PS-beads-based nano-patterning method 国際会議

Wesley Tierney, Daisuke Inoue, Ian Hogue

Vioroly Immunology Microbiomes and Infectious Disease,  2019年7月 

Controlling microtubule lattice structures using programmable DNA origami seeds 国際会議

10th-anniversary-cytomorpholab  2019年5月 

Biomolecular motors induce lattice defects and promote monomer exchange in microtubules 国際会議

Daisuke Inoue, Sarah Triclin, Jeremie Gaillard, Laurent Blanchoin, Manuel Thery

BioPhest2019  2019年3月 

Defining mictrotubule lattice structures using programmable DNA origami seeds 国際会議

Daisuke Inoue, Franky Djutanta, Rizal F. Hariadi

2019年3月 

中心体アクチンネットワークによる微小管の形成制御

Daisuke Inoue, Dorian Obino, Francesca Farina, Jérémie Gaillard, Christophe Guerin, Laurent Blanchoin, Ana-Maria Lennon-Dumenil, Manuel Théry

第５６回日本生物物理学会  2018年9月 

Mechanical response of microtubules in collective motion 招待 国際会議

Plant cell biology seminar  2018年7月 

Centrosomal actin regulates microtubule nucleation 国際会議

EMBO/EMBL Symposium Microtubules from atoms to complex systems  2018年5月 

Coordinate regulation of assembly of centrosomal microtubules and actin network 招待 国際会議

Daisuke Inoue, Francesca Farina, Jeremie Gaillard, Laurent Blanchoin, Manuel Thery

2017年11月 

Regulation of microtubules nucleation and growth by co-localized actin network 国際会議

Daisuke Inoue, Francesca Farina, Jeremie Gaillard, Laurent Blanchoin, Manuel Thery

France-Japan Workshop 2017 on Functional Nanomaterials and Biomaterials  2017年7月 

Swarming filaments amplify their mechanically ideal alignment 国際会議

France-Japan Workshop 2017 on Functional Nanomaterials and Biomaterials  2017年7月 

Role of in vitro centrosomal actin network on regulation of microtubule dynamics 国際会議

Daisuke Inoue, Jeremie Gaillard, Laurent Blanchoin, Manuel Thery

EMBO/EMBL Symposium Microtubules from atoms to complex systems  2016年5月 

Collective self-organization of microtubules propelled by kinesin under external mechanical stimuli 国際会議

Inoue Daisuke, Nitta Takahiro, Kabir Arif Md. Rashedul, Sada Kazuki, Kakugo Akira

EMBO/EMBL Symposium Microtubules from atoms to complex systems  2016年5月 

微小管の動的自己組織化における外部力学刺激の影響 招待

井上大介

植物科学セミナー  2015年5月 

生体分子モーターの能動的自己組織化によるATP駆動型運動素子の創製と実用化に向けて

井上大介、伊藤正樹、Arif Md. Rashedul Kabir、角五 彰、Gong Jian Ping

化学工業   2012年6月

生体分子モーターの動的自己組織化が生むエキゾチック機能

井上大介、角五彰、Gong Jian Ping

化学工業   2011年6月

Molecular swarm robots: recent progress and future challenges 査読

Kabir, Arif Md. Rashedul; Inoue, Daisuke; Kakugo, Akira

2020年6月

ATP駆動型バイオアクチュエーター

上西恭平、井上大介、佐田和己、角五彰

ゲルテクノロジーハンドブック   2014年10月

Inside back cover image for Chemical Communications, issue 8, 2020

Inoue, Daisuke

2020年1月

Inside cover image for ACS Nano, vol13, 2019

Inoue, Daisuke; Gutmann, Greg; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Konagaya, Akihiko; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kakugo, Akira

2019年11月

Front cover image for The EMBO Journal, vol38, 2019

2019年6月

Illustrations for DNA origami and biomolecular motor based artificial muscle

Inoue, Daisuke

2019年5月

Front cover image for Nanoscale, issue 14, 2018

Sasaki, Ren; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Anan, Shizuka; Kimura, Atsushi P; Konagaya, Akihiko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira

2018年2月

Illustration for "Dissipation of contractile forces: the missing piece in cell mechanics.", Molecular Biology of the Cell, 28, 1825-1832, 2017

Inoue, Daisuke

2017年7月

Front cover image for Nanoscale, issue 43, 2015

Inoue, Daisuke; Mahmot, Bulbul; Kabir, Arif Md Rashedul; Farhana, Tamanna Ishrat; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira

2015年7月

Front cover image for SoftMatter, issue 42, 2012

Kabir Arif, Md Rashedul, Wada Shoki, Inoue Daisuke, Tamura Yoshiki, Kajihara Tamaki, Mayama Hiroyuki, Sada Kazuki, Kakugo Akira, Gong Jian Ping

2012年9月

学術論文等の審査

役割：査読

2021年

マイクロコンタクトプリンティング法を用いた人工細胞骨格モデルの構築

2021年

QRプログラム わかばチャレンジ

ATP駆動型アクティブ流体による高感度バイオセンサーデバイスのデザイン

2021年

令和３年度 エネルギー研究教育機構 若手研究者・博士課程学生支援プログラム

DNAプレ-プログラミングによる生体分子モーターマイクロ・ナノデバイスの構築

研究課題/領域番号：20K15141  2020年 - 2023年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

日揮・実吉奨学会研究助成金 / 動くDNAナノ構造体のアセンブリ技術の構築

2020年

DNAオリガミを用いた細胞骨格微小管の構造デザインおよびその知見の人工材料応用

2019年3月 - 2021年4月

細胞のデザイナー“細胞骨格”に習う自己組織化デザイン

2019年 - 2023年

日本学術振興会  卓越研究員事業

風戸研究奨励費/DNAオリガミを用いた細胞骨格微小管のデザイン

2019年

上原記念生命科学財団リサーチフェローシップ

2016年

微小管の動的自己組織化における空間的制約効果の影響

2015年

ナノテクプラットフォーム研究設備の試行的利用

微小管能動的自己組織化における力学刺激の効果

2014年 - 2015年

日本学術振興会  特別研究員

微小管の脱動的自己組織化における外部刺激の影響に感する研究

2013年

理学研究院研究者養成支援金採用

生命科学入門I

2022年10月 - 2022年12月   秋学期

生命科学実習

2022年6月 - 2022年8月   夏学期

分子生物学

2022年6月 - 2022年8月   夏学期

生命科学入門II

2022年6月 - 2022年8月   夏学期

バイオマテリアルエンジニアリング

2022年6月 - 2022年8月   夏学期

生命科学入門I

2021年10月 - 2021年12月   秋学期

「動く次世代材料"アクティブマター"」未来構想アートアンドサイエンスカフェにて一般来場者向けに講演

九州大学芸術工学部  九州大学大橋キャンパス  2022年8月

九州大学高校生向け公開講座で実験補助を担当

九州大学芸術工学部  九州大学大橋キャンパス  2022年6月

「アクティブマターから創発する生物的デザイン」:未来構想アートアンドサイエンスカフェにて一般来場者向けに講演

九州大学芸術工学部  九州大学大橋キャンパス  2021年7月