コキタ トモユキ
小北 智之
KOKITA TOMOYUKI
所属
農学研究院 資源生物科学部門 教授
農学部 生物資源環境学科（併任）
生物資源環境科学府 資源生物科学専攻（併任）
教育学部
（併任）
職名
教授
連絡先
電話番号
0928024804
プロフィール
水産科学・海洋生物科学分野を担当する教員として、魚類の生態学、遺伝学、進化学の教育研究に従事している。
ORCID
学位
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博士（農学）
経歴
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2003年1月-2003年9月 （財）熱帯海洋生態研究振興財団 研究員 2000年1月-2002年12月 日本学術振興会特別研究員（PD）
2003年1月-2003年9月 （財）熱帯海洋生態研究振興財団 研究員 2000年1月-2002年12月 日本学術振興会特別研究員（PD）
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2012年4月-2021年9月 福井県立大学 海洋生物資源学部 准教授 2009年4月-2012年3月 福井県立大学 海洋生物資源学部 講師 2008年4月-2009年3月 福井県立大学 生物資源学部 講師 2007年4月-2008年3月 福井県立大学 生物資源学部 助教 2003年10月-2007年3月 福井県立大学 生物資源学部 助手
研究テーマ・研究キーワード
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研究テーマ：魚類を対象とした生態ゲノミクス
研究キーワード：生態遺伝学、行動遺伝学、進化生態学、行動生態学、魚類学
研究期間： 2021年10月
受賞
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奨励賞
2008年9月 日本魚類学会
論文
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Artificial interspecific hybridization of the two distant anemonefish species and phenotypic characterization of the F1 hybrid 査読 国際誌
Haruka Yoshida, Tomoyuki Kokita
Ichthyological Research 2024年3月
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Plate reduction in southern Japanese freshwater populations of threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) 査読 国際誌
Hiyu Kanbe, Takuya K. Hosoki, Tomoyuki Kokita, Seiichi Mori, Jun Kitano
Ecology and Evolution 2023年5月
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Gudgeon fish with and without genetically determined countershading coexist in heterogeneous littoral environments of an ancient lake 査読 国際誌
Tomoyuki Kokita, Kohtaro Ueno, Yo Y. Yamasaki, Masanari Matsuda, Ryoichi Tabata, Atsushi J. Nagano, Tappei Mishina, Katsutoshi Watanabe
Ecology and Evolution 11 ( 19 ) 13283 - 13294 2021年10月
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Multiple waves of freshwater colonization of the three-spined stickleback in the Japanese Archipelago 査読
Ryo Kakioka, Seiichi Mori, Tomoyuki Kokita, Takuya K. Hosoki, Atsushi J. Nagano, Asano Ishikawa, Manabu Kume, Atsushi Toyoda, Jun Kitano
BMC Evolutionary Biology 20 ( 1 ) 2020年12月
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Nearly year-round reproduction among individuals of a Japanese freshwater threespine stickleback population 査読
Akihiko Yamamoto, Seiichi Mori, Yukiharu Hasegawa, Tomoyuki Kokita
Ichthyological Research 67 ( 4 ) 533 - 540 2020年11月
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Multiple waves of freshwater colonization of the three-spined stickleback in the Japanese Archipelago 査読
Ryo Kakioka, Seiichi Mori, Tomoyuki Kokita, Takuya K. Hosoki, Atsushi J. Nagano, Asano Ishikawa, Manabu Kume, Atsushi Toyoda, Jun Kitano
BMC Evolutionary Biology 20 143 2020年11月
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Accumulation of Deleterious Mutations in Landlocked Threespine Stickleback Populations 査読
Kohta Yoshida, Mark Ravinet, Takashi Makino, Atsushi Toyoda, Tomoyuki Kokita, Seiichi Mori, Jun Kitano
Genome Biology and Evolution 12 ( 4 ) 479 - 492 2020年4月
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Genomic and phenotypic consequences of two independent secondary contact zones between allopatric lineages of the anadromous ice goby Leucopsarion petersii 査読
Shotaro Hirase, Tomoyuki Kokita, Atsushi J. Nagano, Kiyoshi Kikuchi
Heredity 124 ( 1 ) 223 - 235 2020年1月
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Geographical distribution and population genetic structure of the gobiid fish Gymnogobius sp. 2, formerly known as Gymnogobius cf. castaneus “Toyama-endemic” 査読
67 ( 1 ) 212 - 220 2020年1月
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A key metabolic gene for recurrent freshwater colonization and radiation in fishes 査読
Asano Ishikawa, Naoki Kabeya, Koki Ikeya, Ryo Kakioka, Jennifer N. Cech, Naoki Osada, Miguel C. Leal, Jun Inoue, Manabu Kume, Atsushi Toyoda, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Yo Y. Yamasaki, Yuto Suzuki, Tomoyuki Kokita, Hiroshi Takahashi, Kay Lucek, David Marques, Yusuke Takehana, Kiyoshi Naruse, Seiichi Mori, Oscar Monroig, Nemiah Ladd, Carsten J. Schubert, Blake Matthews, Catherine L. Peichel, Ole Seehausen, Goro Yoshizaki, Jun Kitano
Science 364 ( 6443 ) 886 - 889 2019年5月
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Armour plate diversity in Japanese freshwater Threespine stickleback (Gasterosteus aculeatus) 査読
Yo Y. Yamasaki, Seiichi Mori, Tomoyuki Kokita, Jun Kitano
Evolutionary Ecology Research 20 ( 1 ) 51 - 67 2019年1月
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Evolution of gigantism and size-based female mate choice in ice goby (Leucopsarion petersii) populations in a semi-enclosed sea basin 査読
Tomoyuki Kokita, Sayaka Takahashi, Masaki Kinoshita
Biological Journal of the Linnean Society 120 ( 3 ) 563 - 577 2017年3月
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Genomic architecture of habitat-related divergence and signature of directional selection in the body shapes of Gnathopogon fishes 査読
Ryo Kakioka, Tomoyuki Kokita, Hiroki Kumada, Katsutoshi Watanabe, Noboru Okuda
Molecular Ecology 24 ( 16 ) 4159 - 4174 2015年8月
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Population structure and cryptic replacement of local populations in the endangered bitterling Acheilognathus cyanostigma 査読
Junya Kitazima, Masanari Matsuda, Seiichi Mori, Tomoyuki Kokita, Katsutoshi Watanabe
Ichthyological Research 62 ( 2 ) 122 - 130 2015年1月
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The origins of limnetic forms and cryptic divergence in Gnathopogon fishes (Cyprinidae) in Japan 査読
Ryo Kakioka, Tomoyuki Kokita, Ryoichi Tabata, Seiichi Mori, Katsutoshi Watanabe
Environmental Biology of Fishes 96 ( 5 ) 631 - 644 2013年5月
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Molecular signatures of lineage-specific adaptive evolution in a unique sea basin: the example of an anadromous goby Leucopsarion petersii 招待
Tomoyuki Kokita, Sayaka Takahashi, Hiroki Kumada
Molecular Ecology 22 ( 5 ) 1341 - 1355 2013年3月
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A RAD-based linkage map and comparative genomics in the gudgeons (genus Gnathopogon, Cyprinidae) 査読
Ryo Kakioka, Tomoyuki Kokita, Hiroki Kumada, Katsutoshi Watanabe, Noboru Okuda
BMC Genomics 14 32 2013年1月
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Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago 査読
TOMOYUKI KOKITA, KENJI NOHARA
Molecular Ecology 20 ( 1 ) 143 - 164 2011年1月
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Heterochronic differences in fin development between latitudinal populations of the medaka Oryzias latipes (Actinopterygii: Adrianichthyidae) 査読
MAIKO KAWAJIRI, TOMOYUKI KOKITA, KAZUNORI YAMAHIRA
Biological Journal of the Linnean Society 97 ( 3 ) 571 - 580 2009年6月
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Isolation and characterization of 11 polymorphic microsatellite loci in the whitegirdled goby (Pterogobius zonoleucus) and cross-species amplification in the serpentine goby (P. elapoides) 査読
K. NOHARA, T. KOKITA, O. TOMINAGA, T. SEIKAI
Molecular Ecology Resources 9 ( 2 ) 610 - 612 2008年11月
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Isolation and characterization of polymorphic trinucleotide and dinucleotide microsatellite loci for the ice goby, Leucopsarison petersii 査読
TOMOYUKI KOKITA, SAYAKA TAKAHASHI
Molecular Ecology Resources 8 ( 2 ) 305 - 307 2008年6月
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Population genetic structure of the neon damselfish (Pomacentrus coelestis) in the northwestern Pacific Ocean 査読
Shang-Yin V. Liu, Tomoyuki Kokita, Chang-Feng Dai
Marine Biology 154 ( 4 ) 745 - 753 2008年6月
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Isolation and characterization of highly polymorphic microsatellite loci in a pelagic-spawning reef fish Hypodytes rubripinnis 査読
T. KOKITA, K. MATSUOKA, O. TOMINAGA, T. SEIKAI
Molecular Ecology Notes 6 ( 1 ) 210 - 211 2006年3月
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Latitudinal compensation in female reproductive rate of a geographically widespread reef fish 査読
Tomoyuki Kokita
Environmental Biology of Fishes 71 ( 3 ) 213 - 224 2004年11月
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Potential latitudinal variation in egg size and number of a geographically widespread reef fish, revealed by common-environment experiments 査読
T. Kokita
Marine Biology 143 ( 3 ) 593 - 601 2003年9月
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Genetic comparison of two color-morphs of Apogon properuptus from southern Japan 査読
Kohji Mabuchi, Noboru Okuda, Tomoyuki Kokita, Mutsumi Nishida
Ichthyological Research 50 ( 3 ) 293 - 296 2003年8月
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Male secondary sexual traits are hydrodynamic devices for enhancing swimming performance in a monogamous filefish Paramonacanthus japonicus 査読
Tomoyuki Kokita, Taketo Mizota
Journal of Ethology 20 ( 1 ) 35 - 42 2002年6月
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The Role of Female Behavior in Maintaining Monogamy of a Coral-Reef Filefish 査読
Tomoyuki Kokita
Ethology 108 ( 2 ) 157 - 168 2002年2月
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Bluff Body (Fundamental Problem & Vehicle) 査読
Takashi NOMURA, Yoji SUZUKI, Mutsumi UEMURA, Nobuyuki KOBAYASHI, Li Mingshui, Wang Weihua, Ni Zhangsong, Chen Xin, H. Kawai, K. Fujinami, Hiroaki NISHIMURA, Yoshihito TANIIKE, Tomoyuki Kokita, Taketo Mizota, Songpol PHONGKUMSING, Kichiro KIMURA, Yozo FUJINO, Minoru SUZUKI, Katsuji TANEMOTO, Tatsuo MAEDA
Wind Engineers, JAWE 2001 ( 89 ) 481 - 508 2001年10月
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Rapid response of an obligately corallivorous filefish Oxymonacanthus longirostris (Monacanthidae) to a mass coral bleaching event 査読
T. Kokita, A. Nakazono
Coral Reefs 20 ( 2 ) 155 - 158 2001年9月
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Sexual conflict over mating system: the case of a pair-territorial filefish without parental care 査読
Tomoyuki Kokita, Akinobu Nakazono
Animal Behaviour 62 ( 1 ) 147 - 155 2001年7月
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Seasonal variation in the diel spawning time of the coral reef fish Oxymonacanthus longirostris (Monacanthidae):parental control of progeny development 査読
T Kokita, A Nakazono
Marine Ecology Progress Series 199 263 - 270 2000年6月
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Spawning substrate selection by female longnose filefish,Oxymonacanthus longirostris 査読
Tomoyuki Kokita, Akinobu Nakazono
Ichthyological Research 46 ( 4 ) 429 - 432 1999年12月
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Pair territoriality in the longnose filefish,Oxymonacanthus longirostris 査読
Tomoyuki Kokita, Akinobu Nakazono
Ichthyological Research 46 ( 3 ) 297 - 302 1999年9月
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Long distance dispersal of larval and juvenile rockfish, Sebastes thompsoni, with drifting seaweed in the Tohoku area, northwest Pacific, estimated by analysis of otolith microstructure 査読
Tomoyuki Kokita, Michio Omori
Bulletin of Marine Science 65 ( 1 ) 105 - 118 1999年7月
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Early life history traits of the gold-eye rockfish, Sebastes thompsoni , in relation to successful utilization of drifting seaweed 査読
T. Kokita, M. Omori
Marine Biology 132 ( 4 ) 579 - 589 1998年12月
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Plasticity in the mating system of the longnose filefish,Oxymonacanthus longirostris, in relation to mate availability 査読
Tomoyuki Kokita, Akinobu Nakazono
Journal of Ethology 16 ( 2 ) 81 - 89 1998年9月
書籍等出版物
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Fish diversity of Japan : evolution, zoogeography, and conservation
（ 担当： 共著）
Springer 2022年1月
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魚類学の百科事典（一般社団法人日本魚類学会 編）
小北智之
丸善出版 2018年10月
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魚類行動生態学入門（桑村哲生，安房田智司 編著）
小北智之
東海大学出版会 2013年11月
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生態学事典 （巌佐庸，松本忠夫，菊沢喜八郎，日本生態学会 編）
小北智之
共立出版 2003年6月
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魚類の社会行動1（桑村哲生、狩野賢司 編）
小北智之
海游舎 2001年11月
講演・口頭発表等
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クマノミ温帯集団の低温適応進化に関わる遺伝子の探索
吉田陽香・平瀬祥太郎・小北智之
令和６年度日本水産学会春季大会 2024年3月
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Multiple hybrid zones of coastal marine gobies around the Japanese archipelago: natural laboratories for marine hybridization 国際会議
Shotaro Hirase, Shuya Kato, Tomoyuki Kokita
2023年11月
MISC
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日本魚類学会による『研究材料として魚類を使用する際のガイドライン』の紹介 査読
小北智之
応用生態工学 2024年4月
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魚の遺伝的な個体差を探る～養殖用の優良品種作出へ向けて～
小北智之
『水産増養殖と環境まちづくり』．福井県立大学編 2020年4月
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滋賀県ハリヨの危機 査読
森 誠一, 小北智之, 松田征也
魚類学雑誌 2016年4月
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魚類における適応・種分化の進化遺伝機構：研究最前線と今後の展望 査読
小北智之, 渡辺勝敏
魚類学雑誌 2015年4月
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エコゲノミクスにおける網羅的遺伝子発現解析—魚類での研究例から 査読
小北智之
生物科学 2013年4月
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自然集団の適応的分化の検出：モデル系としての日本在来魚
小北智之, 山平寿智
月刊海洋 2010年4月
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サンゴの白化とサンゴ食魚類の未来
小北智之
みどりいし 2010年3月
所属学協会
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日本動物行動学会
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一般社団法人 日本進化学会
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一般社団法人 日本魚類学会
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一般社団法人 日本生態学会
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公益社団法人 日本水産学会
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European Society for Evolutionary Biology
委員歴
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日本魚類学会 評議員 国内
2023年9月 - 現在
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日本水産学会 幹事 国内
2020年4月 - 2022年3月
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日本水産学会 中部支部幹事 国内
2020年4月 - 2022年3月
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日本魚類学会 評議員 国内
2017年9月 - 2021年9月
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日本魚類学会 代議員 国内
2017年9月 - 2021年9月
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日本魚類学会 幹事 国内
2016年1月 - 2017年9月
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日本魚類学会 庶務幹事 国内
2016年1月 - 2017年9月
学術貢献活動
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魚類学雑誌
2023年9月 - 現在
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Ichthyological Research
2023年9月 - 現在
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学術論文等の審査
役割：査読
2023年
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Ichthyological Research 国際学術貢献
2020年1月 - 2023年9月
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魚類学雑誌
2020年1月 - 2023年9月
共同研究・競争的資金等の研究課題
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トゲウオ科魚類をモデルとした繁殖行動形質の適応的多様化のゲノム基盤
研究課題/領域番号：21H02552 2021年 - 2023年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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淡水魚類の保全ゲノミクス：自然史と危機診断を結ぶ枠組みの構築
研究課題/領域番号：20H03009 2020年 - 2022年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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タナゴ亜科魚類の種多様化を駆動する繁殖ニッチ分化の進化遺伝機構
研究課題/領域番号：20K06784 2020年 - 2022年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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産卵回遊の分子生態メカニズム：嗅覚記憶仮説の検証
研究課題/領域番号：19K22462 2019年 - 2021年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 挑戦的研究（萌芽）
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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交雑起源の新規集団のゲノム進化に関する包括的研究
研究課題/領域番号：18H02493 2018年 - 2020年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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クマノミ類をモデル系とした海洋適応放散の進化遺伝機構
研究課題/領域番号：18K06385 2018年 - 2020年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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古代湖・琵琶湖における湖沼適応の起源と集団ゲノミクス
研究課題/領域番号：17H03720 2017年 - 2019年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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タナゴ亜科魚類が獲得した新奇形質の適応的多様化機構
研究課題/領域番号：16K07479 2016年 - 2019年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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性ホルモン依存的な雄の繁殖戦略多様化の進化遺伝機構：トゲウオ科魚類を例として
研究課題/領域番号：15K07195 2015年 - 2017年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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温帯古代湖・琵琶湖の魚類群集における湖沼適応の実態と遺伝基盤の解明
研究課題/領域番号：26291079 2014年 - 2016年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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繁殖寄生と関連した卵形の適応進化機構：タナゴ亜科魚類を用いたエコゲノミクス
研究課題/領域番号：25440206 2013年 - 2015年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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性ホルモンシグナリングの集団分化から探る魚類の繁殖システム多様化の遺伝基盤
研究課題/領域番号：24570105 2012年 - 2014年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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非モデル魚における集団特異的適応遺伝子の検出:網羅的遺伝子発現解析と自然選択解析
研究課題/領域番号：22780180 2010年 - 2011年
科学研究費助成事業 若手研究(A,B)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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種内表現型多型のスケールアップ効果:湖沼生態系に与える影響の実験的検証
研究課題/領域番号：20370009 2008年 - 2011年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
担当区分：研究分担者 資金種別：科研費
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魚類資源における日本海―太平洋間の適応的分化の検出:エコゲノミクス解析
研究課題/領域番号：20780139 2008年 - 2009年
科学研究費助成事業 若手研究(A,B)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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浅海魚類資源における適応的形質の緯度間変異に関する生態遺伝学的研究
研究課題/領域番号：17780156 2005年 - 2007年
科学研究費助成事業 若手研究(A,B)
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
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海産魚類の繁殖形質における地域的適応の検出
研究課題/領域番号：00J00307 2000年 - 2002年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
担当授業科目
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魚類学II
2023年12月 - 2024年2月 冬学期
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動物・海洋生物科学演習第二
2023年10月 - 2024年3月 後期
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課題協学科目
2023年10月 - 2024年3月 後期
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魚類学I
2023年10月 - 2023年12月 秋学期
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生物統計解析
2023年10月 - 2023年12月 秋学期
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水産増殖学
2023年6月 - 2023年8月 夏学期
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動物・海洋生物科学特別研究第二
2023年4月 - 2024年3月 通年
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動物・海洋生物科学プロジェクト演習
2023年4月 - 2024年3月 通年
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動物・海洋生物科学特別研究第一
2023年4月 - 2024年3月 通年
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動物・海洋生物科学演習第一
2023年4月 - 2023年9月 前期
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水産増殖学実験
2023年4月 - 2023年9月 前期
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魚類学Ⅱ
2022年12月 - 2023年2月 冬学期
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海洋観測乗船実習
2022年10月 - 2023年3月 後期
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乗船実習Ⅱ
2022年10月 - 2023年3月 後期
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動物生産科学概論
2022年10月 - 2023年3月 後期
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水産資源増殖学特論
2022年10月 - 2022年12月 秋学期
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魚類学Ⅰ
2022年10月 - 2022年12月 秋学期
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水産増殖学
2022年6月 - 2022年8月 夏学期
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水産増殖学実験
2022年4月 - 2022年9月 前期
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魚類学Ⅱ
2021年12月 - 2022年2月 冬学期
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水産増殖学
2021年10月 - 2022年3月 後期
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魚類学Ⅰ
2021年10月 - 2021年12月 秋学期
FD参加状況
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2022年4月 役割：参加 名称：新任教員研修
主催組織：全学
他大学・他機関等の客員・兼任・非常勤講師等
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2022年 神戸大学大学院理学研究科 区分:非常勤講師 国内外の区分:国内
学期、曜日時限または期間：２０２２年度、前期（集中講義）
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2021年 福井県立大学海洋生物資源学部 区分:非常勤講師 国内外の区分:国内
学期、曜日時限または期間：2022年度、後期
学内運営に関わる各種委員・役職等
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2023年4月 - 2024年3月 研究院 農学研究院・動物海洋生物科学講座・講座長
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2023年4月 - 2024年3月 学府 生物資源環境科学府・動物・海洋生物科学教育コース・コース長
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2022年4月 - 2023年3月 学部 農学部・動物生産科学コース・コース長