2024/09/09 更新

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ナカシマ タカシ
中島 崇
NAKASHIMA TAKASHI
所属
農学研究院 生命機能科学部門 助教
システム生命科学府 システム生命科学専攻(併任)
農学部 生物資源環境学科(併任)
生物資源環境科学府 生命機能科学専攻(併任)
職名
助教
電話番号
0926424215
プロフィール
遺伝子情報の翻訳反応に関わるタンパク質−核酸複合体の高次構造解析
外部リンク

学位

  • 博士(理学)

経歴

  • 日本学術振興会特別研究員 北海道大学(博士研究員) 新潟大学(博士研究員)

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ:古細菌ヘリカーゼの構造基盤

    研究キーワード:ヘリカーゼ,酵素,RNA

    研究期間: 2006年4月 - 2013年3月

  • 研究テーマ:遺伝子の翻訳と転写に関わるタンパク質核酸複合体の立体構造解析

    研究キーワード:タンパク質合成,翻訳,立体構造解析,タンパク質結晶学

    研究期間: 2004年8月

論文

  • A three-dimensional model of RNase P in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 査読 国際誌

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   493 ( 2 )   1063 - 1068   2017年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.09.085

  • Functional characterization of archaeal homologs of human nuclear RNase P proteins Rpp21 and Rpp29 provides insights into the molecular basis of their cooperativity in catalysis 査読 国際誌

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   482 ( 1 )   68 - 74   2017年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.10.142

  • Structural basis for recognition of a kink-turn motif by an archaeal homologue of human RNase P protein Rpp38 査読 国際誌

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   474 ( 3 )   541 - 546   2016年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.04.118

  • Functional implication of archaeal homologues of human RNase P protein pair Pop5 and Rpp30 査読 国際誌

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   159 ( 1 )   31 - 40   2016年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/jb/mvv067

  • Mutation of the gene encoding the ribonuclease P RNA in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis causes decreased growth rate and impaired processing of tRNA precursors 査読 国際誌

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   468 ( 4 )   660 - 665   2015年12月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.11.012

  • Archaeal ribonuclease P proteins have potential for biotechnological applications where precise hybridization of nucleic acids is needed 査読 国際誌

    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY   79 ( 12 )   2014 - 2017   2015年12月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/09168451.2015.1058699

  • On archaeal homologs of the human RNase P proteins Pop5 and Rpp30 in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis. 査読 国際誌

    Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, makoto kimura, Ueda T, Suematsu K

    Biosci Biotechnol Biochem.   23   1 - 8   2015年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Enhancement of RNA annealing and strand displacement found in archaeal ribonuclease P proteins is conserved in Escherichia coli protein C5 and yeast protein Rpr2. 査読 国際誌

    Takashi Nakashima, makoto kimura, Yoshimitsu Kakuta, Imai T, Ueda T, Hazeyama K, Furutani T

    Biosci Biotechnol Biochem.   78 ( 10 )   1700 - 1702   2014年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Pentatricopeptide repeat motifs in the processing enzyme PRORP1 in Arabidopsis thaliana play a crucial role in recognition of nucleotide bases at TψC loop in precursor tRNAs. 査読 国際誌

    450 ( 4 )   1541 - 1546   2014年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Characterization of the peripheral structures of archaeal RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3.

    Toshihumi Ueda, Hiroshi Yamaguchi, Mitsuru Miyanoshita, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, makoto kimura

    J Biochem.   155 ( 1 )   25 - 33   2014年1月

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    記述言語:英語  

  • Characterization of the peripheral structures of archaeal RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Takashi Nakashima, makoto kimura, Yoshimitsu Kakuta

    J Biochem   2014年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Extra-structural elements in the RNA recognition motif in archaeal Pop5 play a crucial role in the activation of RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Takashi Nakashima, M. IshiHara, T. Ueda, Etsuko Nishimoto, Yoshimitsu Kakuta, makoto kimura

    Biochem Biophys Res Commun.   440 ( 4 )   594 - 598   2013年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Structural modeling of RNase P RNA of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Zwieb C, Nakao Y, Nakashima T, Takagi H, Goda S, Andersen ES, Kakuta Y, Kimura M.

    Biochem Biophys Res Commun.   414 ( 3 )   2011年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • The contribution of peripheral stem-loops to the catalytic activity of archaeal RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Hara T, Terada A, Yamaguchi H, Nakashima T, Kakuta Y, Kimura M.

    Biosci Biotechnol Biochem.   75 ( 4 )   2011年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • The sturctural mechanism of the inhibition of archaeal RelE toxin by iots cognate RelB antitoxin. 査読 国際誌

    M.Shinohara, J.X. Guo, M. Mori, T. Nakashima, H. Takagi, E. Nishimoto, S. Yamashita, K. Tsumoto, Y. Kakuta, and M. Kimura

    Biochem. Biophys. Res. Commun.   2010年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Structural changes in ribonuclease P RNA in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 induced on interaction with proteins. 査読 国際誌

    Kosaka S, Hada K, Nakashima T, Kimura M.

    Biosci Biotechnol Biochem.   2010年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • The C-terminal portion of an archaeal toxin, aRelE, plays a crucial role in protein synthesis inhibition. 査読 国際誌

    Kikutake C, Shinohara M, Takagi H, Nakashima T, Kimura M.

    Biosci Biotechnol Biochem.   2009年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Zhang X, Nakashima T, Kakuta Y, Yao M, Tanaka I, Kimura M.

    Protein Science   2008年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure of protein Ph1481p in complex with protein Ph1877p of archaeal RNase P from Pyrococcus horikoshii OT3: implication of dimer formation of the holoenzyme 査読 国際誌

    Shin Kawano, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Isao Tanaka, Makoto Kimura

    Journal of Moleculer Biology   2006年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of a 23S rRNA binding domain of the ribosomal protein L2 from Bacillus stearothermophilus 国際誌

    T. Nakashima, M. Kimura, A. Nakagawa and I. Tanaka

    Journal of Structural Biology   124 ( 1 )   99 - 101   1998年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1006/jsbi.1998.4053

  • Age‐related nitration/dysfunction of myogenic stem cell activator HGF

    Elgaabari, A; Imatomi, N; Kido, H; Nakashima, T; Okuda, S; Manabe, Y; Sawano, S; Mizunoya, W; Kaneko, R; Tanaka, S; Maeno, T; Matsuyoshi, Y; Seki, M; Kuwakado, S; Zushi, K; Daneshvar, N; Nakamura, M; Suzuki, T; Sunagawa, K; Anderson, JE; Allen, RE; Tatsumi, R

    AGING CELL   23 ( 2 )   e14041   2024年2月   ISSN:1474-9718 eISSN:1474-9726

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Aging Cell  

    Mechanical perturbation triggers activation of resident myogenic stem cells to enter the cell cycle through a cascade of events including hepatocyte growth factor (HGF) release from its extracellular tethering and the subsequent presentation to signaling-receptor c-met. Here, we show that with aging, extracellular HGF undergoes tyrosine-residue (Y) nitration and loses c-met binding, thereby disturbing muscle homeostasis. Biochemical studies demonstrated that nitration/dysfunction is specific to HGF among other major growth factors and is characterized by its locations at Y198 and Y250 in c-met-binding domains. Direct-immunofluorescence microscopy of lower hind limb muscles from three age groups of rat, provided direct in vivo evidence for age-related increases in nitration of ECM-bound HGF, preferentially stained for anti-nitrated Y198 and Y250-HGF mAbs (raised in-house) in fast IIa and IIx myofibers. Overall, findings highlight inhibitory impacts of HGF nitration on myogenic stem cell dynamics, pioneering a cogent discussion for better understanding age-related muscle atrophy and impaired regeneration with fibrosis (including sarcopenia and frailty).

    DOI: 10.1111/acel.14041

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Additional Cover

    Alaa Elgaabari, Nana Imatomi, Hirochika Kido, Takashi Nakashima, Shoko Okuda, Yoshitaka Manabe, Shoko Sawano, Wataru Mizunoya, Ryuki Kaneko, Sakiho Tanaka, Takahiro Maeno, Yuji Matsuyoshi, Miyumi Seki, So Kuwakado, Kahona Zushi, Nasibeh Daneshvar, Mako Nakamura, Takahiro Suzuki, Kenji Sunagawa, Judy E. Anderson, Ronald E. Allen, Ryuichi Tatsumi

    Aging Cell   2024年2月

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/acel.14117

    researchmap

  • A pilot study on nitration/dysfunction of NK1 segment of myogenic stem cell activator HGF. 招待 査読 国際誌

    #Alaa Elgaabari, #Nana Imatomi, #Hirochika Kido, #Miyumi Seki, #Sakiho Tanaka, #Yuji Matsuyoshi, @Takashi Nakashima, @Shoko Sawano, @Wataru Mizunoya, @Takahiro Suzuki, @Mako Nakamura, @Judy E Anderson, @Ryuichi Tatsumi

    Biochemistry and biophysics reports   31   101295 - 101295   2022年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrep.2022.101295

  • A pilot study on nitration/dysfunction of NK1 segment of myogenic stem cell activator HGF

    Alaa Elgaabari, Nana Imatomi, Hirochika Kido, Miyumi Seki, Sakiho Tanaka, Yuji Matsuyoshi, Takashi Nakashima, Shoko Sawano, Wataru Mizunoya, Takahiro Suzuki, Mako Nakamura, Judy E. Anderson, Ryuichi Tatsumi

    Biochemistry and Biophysics Reports   2022年9月

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrep.2022.101295

  • Diurnal variations in expression of photosynthesis-related proteins in the harmful Raphidophyceae Chattonella marina var. antiqua 査読

    Xuchun Qiu, Koki Mukai, Yohei Shimasaki, Min Wu, Chen Chen, Yijiang Lu, Hirofumi Ichinose, Takashi Nakashima, Yoko Kato-Unoki, Yuji Oshima

    Journal of Experimental Marine Biology and Ecology   527   2020年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.jembe.2020.151361

  • Crystal structures of the archaeal RNase P protein Rpp38 in complex with RNA fragments containing a K-turn motif. 国際誌

    Kosuke Oshima, Xuzhu Gao, Seiichiro Hayashi, Toshifumi Ueda, Takashi Nakashima, Makoto Kimura

    Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications   74 ( Pt 1 )   57 - 64   2018年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S2053230X17018039

  • Crystal structures of the archaeal RNase P protein Rpp38 in complex with RNA fragments containing a K-turn motif 招待 査読 国際誌

    Oshima Kosuke, #Gao Xuzhu, #Hayashi Seiichiro, Ueda Toshifumi, Nakashima Takashi, Kimura Makoto

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS   74   57 - 64   2018年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S2053230X17018039

  • A three-dimensional model of RNase P in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3. 国際誌

    Xuzhu Gao, Kosuke Oshima, Toshifumi Ueda, Takashi Nakashima, Makoto Kimura

    Biochemical and biophysical research communications   493 ( 2 )   1063 - 1068   2017年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2017.09.085

  • Variations in the expression of photosynthesis-related proteins in field Chattonella marina cells during a harmful algal bloom 査読

    Xuchun Qiu, Kokl Mukai, Yohei Shimasaki, Michito Tsuyama, Tadashi Matsubara, Takashi Nakashima, Hirofumi Ichinose, Yu Nakajima, Ibuneo Honjo, Yuji Oshima

    Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University   62 ( 2 )   373 - 380   2017年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Structural basis for recognition of a kink-turn motif by an archaeal homologue of human RNase P protein Rpp38 査読

    Kosuke Oshima, Yosuke Kakiuchi, Yoshikazu Tanaka, Toshifumi Ueda, Takashi Nakashima, Makoto Kimura, Min Yao

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   474 ( 3 )   541 - 546   2016年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.04.118

  • Functional implication of archaeal homologues of human RNase P protein pair Pop5 and Rpp30. 国際誌

    Masato Hamasaki, Kohsuke Hazeyama, Fumihiko Iwasaki, Toshifumi Ueda, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Journal of biochemistry   159 ( 1 )   31 - 40   2016年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/jb/mvv067

  • Mutation of the gene encoding the ribonuclease P RNA in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis causes decreased growth rate and impaired processing of tRNA precursors. 国際誌

    Toshifumi Ueda, Sonoko Ishino, Kotaro Suematsu, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Yutaka Kawarabayasi, Yoshizumi Ishino, Makoto Kimura

    Biochemical and biophysical research communications   468 ( 4 )   660 - 5   2015年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.11.012

  • Archaeal ribonuclease P proteins have potential for biotechnological applications where precise hybridization of nucleic acids is needed. 国際誌

    Mitsuru Miyanoshita, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   79 ( 12 )   2014 - 7   2015年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/09168451.2015.1058699

  • On archaeal homologs of the human RNase P proteins Pop5 and Rpp30 in the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis. 国際誌

    Kotaro Suematsu, Toshifumi Ueda, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   79 ( 6 )   952 - 9   2015年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/09168451.2014.1003130

  • Pentatricopeptide repeat motifs in the processing enzyme PRORP1 in Arabidopsis thaliana play a crucial role in recognition of nucleotide bases at TψC loop in precursor tRNAs. 国際誌

    450 ( 4 )   1541 - 6   2014年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Proteinaceous RNase P (PRORP1) in Arabidopsis thaliana is an endoribonuclease that catalyzes hydrolysis to remove the 5'-leader sequence of precursor tRNAs (pre-tRNAs). PRORP1 is composed of pentatricopeptide repeat (PPR) motifs, a central linker region, and a metal nuclease domain, the NYN domain. The PPR motifs are single-stranded RNA-binding motifs that recognize bases in a modular fashion. To obtain insight into the mechanism by which the PPR motifs in PRORP1 recognize a target sequence in catalysis, N-terminal successive deletion mutants were overproduced in Escherichia coli, and the resulting proteins were characterized in terms of enzymatic activity using chloroplast pre-tRNA(Phe) as a substrate. Although Δ89, in which all PPR motifs are present, retained the pre-tRNA cleavage activity, Δ129 devoid of the first PPR motif (PPR1) had significantly reduced cleavage activity. Likewise, deletions of the second (PPR2) or third PPR (PPR3) motif abolished the cleavage activity, suggesting that PPR motifs play a crucial role in catalysis. A proposed recognition code for PPR motifs predicted that PPR2-PPR5 in PRORP1 recognize C, A/U, A, and U, respectively, whose sequence is in good agreement with C56-A57-A58-A59 in the TψC loop in pre-tRNA(Phe). Mutational analyses of nucleotide residues in the TψC loop as well as nucleotide-specifying residues (NSRs) in PPR motifs further suggested that PPR2 and PPR3 in PRORP1 favorably recognize nucleotide bases C56 and A57 at the TψC loop in pre-tRNA(Phe), respectively. This prediction and previous biochemical data were combined to construct a fitting model of tRNA onto PRORP1, showing that the mechanism by which PRORP1 recognizes pre-tRNAs appears to be distinct from that by bacterial RNase P.

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.07.030

  • Characterization of putative toxin/antitoxin systems in Vibrio parahaemolyticus. 査読 国際誌

    J Appl Microbiol.   117 ( 1 )   185 - 195   2014年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Characterization of the peripheral structures of archaeal RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3. 国際誌

    Toshifumi Ueda, Hiroki Yamaguchi, Mitsuru Miyanoshita, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Journal of biochemistry   155 ( 1 )   25 - 33   2014年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/jb/mvt092

  • Extra-structural elements in the RNA recognition motif in archaeal Pop5 play a crucial role in the activation of RNase P RNA from Pyrococcus horikoshii OT3. 国際誌

    Kohsuke Hazeyama, Masato Ishihara, Toshifumi Ueda, Etsuko Nishimoto, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Biochemical and biophysical research communications   440 ( 4 )   594 - 8   2013年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.09.140

  • Thiobencarb herbicide reduces growth, photosynthetic activity, and amount of Rieske iron-sulfur protein in the diatom Thalassiosira pseudonana. 国際誌

    Yohei Shimasaki, Michito Tsuyama, Rumana Tasmin, Xuchun Qiu, Motoyuki Shimizu, Yusuke Sato, Yasuhiro Yamasaki, Yoko Kato-Unoki, Atsushi Nukata, Takashi Nakashima, Hirofumi Ichinose, Hiroyuki Wariishi, Tsuneo Honjo, Yuji Oshima

    Journal of biochemical and molecular toxicology   27 ( 9 )   437 - 44   2013年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/jbt.21505

  • Crystallographic survey of active sites of an unclassified glutathione transferase from Bombyx mori. 国際誌

    Yoshimitsu Kakuta, Kazuhiro Usuda, Takashi Nakashima, Makoto Kimura, Yoichi Aso, Kohji Yamamoto

    Biochimica et biophysica acta   1810 ( 12 )   1355 - 60   2011年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbagen.2011.06.022

  • Structural modeling of RNase P RNA of the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3. 国際誌

    Christian Zwieb, Yuji Nakao, Takashi Nakashima, Hisanori Takagi, Shuichiro Goda, Ebbe Sloth Andersen, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Biochemical and biophysical research communications   414 ( 3 )   517 - 22   2011年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2011.09.098

  • Crystal structure of the branching enzyme I (BEI) from Oryza sativa L with implications for catalysis and substrate binding. 国際誌

    Junji Noguchi, Kimiko Chaen, Nhuan Thi Vu, Taiki Akasaka, Hiroaki Shimada, Takashi Nakashima, Aiko Nishi, Hikaru Satoh, Toshiro Omori, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Glycobiology   21 ( 8 )   1108 - 16   2011年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/glycob/cwr049

  • Molecular characterization of an insecticide-induced novel glutathione transferase in silkworm. 国際誌

    Kohji Yamamoto, Hirofumi Ichinose, Yoichi Aso, Yutaka Banno, Makoto Kimura, Takashi Nakashima

    Biochimica et biophysica acta   1810 ( 4 )   420 - 6   2011年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbagen.2011.01.003

  • Immunological Characterization of Honey Proteins and Identification of MRJP 1 as an IgE-Binding Protein. 査読 国際誌

    Hayashi T, Takamatsu N, Nakashima T, Arita T.

    Biocsi. Biotechnol. Biochem.   2011年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • The structural mechanism of the inhibition of archaeal RelE toxin by its cognate RelB antitoxin. 国際誌

    Masaaki Shinohara, Jin Xu Guo, Misako Mori, Takashi Nakashima, Hisanori Takagi, Etsuko Nishimoto, Shoji Yamashita, Kouhei Tsumoto, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Biochemical and biophysical research communications   400 ( 3 )   346 - 51   2010年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2010.08.061

  • The C-terminal portion of an archaeal toxin, aRelE, plays a crucial role in protein synthesis inhibition. 国際誌

    Chie Kikutake, Masaaki Shinohara, Hisanori Takagi, Takashi Nakashima, Makoto Kimura

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   73 ( 12 )   2766 - 8   2009年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Biochemical and crystallographic characterization of the starch branching enzyme I (BEI) from Oryza sativa L. 国際誌

    Nhuan Thi Vu, Hiroaki Shimada, Yoshimitsu Kakuta, Takashi Nakashima, Hiroko Ida, Toshiro Omori, Aiko Nishi, Hikaru Satoh, Makoto Kimura

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   72 ( 11 )   2858 - 66   2008年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Biochemical and crystallographic characterization of the starch branching enzyme I (BEI) from Oryza sativa L. 査読 国際誌

    Vu NT, Shimada H, Kakuta Y, Nakashima T, Ida H, Omori T, Nishi A, Satoh H, Kimura M.

    Biosci Biotechnol Biochem. 2008 Nov;72(11):2858-66. Epub 2008 Nov 7.   2008年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin protein Alba from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3. 国際誌

    Kazumasa Hada, Takashi Nakashima, Takuo Osawa, Hiroaki Shimada, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    Bioscience, biotechnology, and biochemistry   72 ( 3 )   749 - 58   2008年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin protein Alba from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3. 査読 国際誌

    Hada K, Nakashima T, Osawa T, Shimada H, Kakuta Y, Kimura M.

    Biosci Biotechnol Biochem   2008年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT3 査読

    Xiaodong Zhang, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Min Yao, Isao Tanaka, Makoto Kimura

    PROTEIN SCIENCE   17 ( 1 )   136 - 145   2008年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1110/ps.073107008

  • Crystal structures of the Nicotiana glutinosa ribonuclease NT in complex with nucleoside monophosphates. 国際誌

    Shin Kawano, Yoshimitsu Kakuta, Takashi Nakashima, Makoto Kimura

    Journal of biochemistry   140 ( 3 )   375 - 81   2006年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structures of the Nicotiana glutinosa ribonuclease NT in complex with nucleoside monophosphates. 査読 国際誌

    Shin Kawano, Yoshimitsu Kakuta, Takashi Nakashim. Makoto Kimura

    Journal of Biochemistry   2006年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • In vitro reconstitution of the GTPase-associated centre of the archaebacterial ribosome: the functional features observed in a hybrid form with Escherichia coli 50S subunits. 国際誌

    Takaomi Nomura, Kohji Nakano, Yasushi Maki, Takao Naganuma, Takashi Nakashima, Isao Tanaka, Makoto Kimura, Akira Hachimori, Toshio Uchiumi

    The Biochemical journal   396 ( 3 )   565 - 71   2006年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • In vitro reconstitution of the GTPase-associated center of the archaebacterial ribosome: the functional features observed in a hybrid form with Escherichia coli 50S subunits. 査読 国際誌

    T. Nomura, K. Nakano, Y. Maki, T. Naganuma, T. Nakashima, I. Tanaka, M. Kimura, A. Hachimori, and T. Uchiumi

    Biochemical Journal   2006年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Crystal structure of protein Ph1481p in complex with protein Ph1877p of archaeal RNase P from Pyrococcus horikoshii OT3: implication of dimer formation of the holoenzyme. 国際誌

    Shin Kawano, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Isao Tanaka, Makoto Kimura

    Journal of molecular biology   357 ( 2 )   583 - 91   2006年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Molecular basis of alanine discrimination in editing site. 国際誌

    Masaaki Sokabe, Ayuko Okada, Min Yao, Takashi Nakashima, Isao Tanaka

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   102 ( 33 )   11669 - 74   2005年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Ribosomal protein L5 has a highly twisted concave surface and flexible arms responsible for rRNA binding 査読 国際誌

    T. Nakashima, M. Yao, S. Kawamura, K. Iwasaki, M. Kimura and I. Tanaka

    RNA   7 ( 5 )   692 - 701   2001年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1017/S1355838201002345

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書籍等出版物

  • Structure and function of archaeal ribonuclease P. In Nucleic Acids and Molecular Biology

    @Makoto Kimura, #Kosuke Oshima, #Xuzhu Gao, #Dan Jiang, @Takashi Nakashima, #Toshifumi Ueda( 担当: 共著)

    Springer  2017年10月 

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    担当ページ:vol.32, 159-175   記述言語:英語   著書種別:学術書

    DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-319-65795-0_7

  • Structure and evolution of the 23S rRNA binding domain of protein L2 in The Ribosome: Structure, Function, Antibiotics, and Cellular Interactions

    I. Tanaka, A. Nakagawa, T. Nakashima, M. Taniguchi, H. Hosaka and M. Kimura( 担当: 共著)

    ASM Press  2000年1月 

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    担当ページ:85- 92   記述言語:英語   著書種別:学術書

講演・口頭発表等

  • 腸炎ビブリオ (Vibrio parahaemolyticus) 由来トキシン/アンチトキシンシステム Vp1843/Vp1842 複合体の結晶構造解析

    @中島 崇,#伊藤 寛倫,#張 晶,@木村 誠,@沼田倫征,@石野良純

    日本結晶学会 2021年会  2021年11月 

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    開催年月日: 2021年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北海道大学(オンラインハイブリッド)   国名:日本国  

  • 担子菌酵母および植物由来フェニルアラニンアンモニアリアーゼの特異的阻害剤Z302を利用した生化学的解析と結晶構造解析

    @中島崇,#吉村昂大,#冨高大暉,@山田直隆,@石野良純

    2019年度西日本・中四国支部合同大会  2019年11月 

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    開催年月日: 2019年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:琉球大学人文社会学部(沖縄県西原町)   国名:日本国  

    その他リンク: http://nishinihon.jsbba.or.jp/presentation/presentation2019/329.html

  • 腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)由来トキシン/アンチトキシンシステムVp1843/Vp1842複合体の結晶構造解析

    中島崇、#伊藤寛倫、#張晶、木村誠

    日本分子生物学会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ由来トキシン・VpParEの阻害様式に関する研究

    伊藤寛倫, 張晶, 中島 崇

    第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神奈川県横浜市 パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキア(Pyrococcus horikoshii)リボヌクレアーゼP構成タンパク質Rpp21とRpp29の協調作用の分子基盤

    泉健太, 江丹, 中島 崇

    第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神奈川県横浜市 パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNaseP構成タンパク質Rpp38のRNA活性化に関する結晶構造及びRNaseP高次構造モデルの構築

    江丹, 泉健太, 中島 崇

    第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神奈川県横浜市 パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボ核タンパク質酵素RNaseP再構成ホロ酵素の精製と結晶化

    高緒柱, 中島 崇

    第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神奈川県横浜市 パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 超好熱性古細菌RNaseP構成タンパク質Rpp38のRNA活性化の構造基盤

    高緒柱, 中島 崇

    平成28年度日本結晶学会年会  2016年11月 

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    開催年月日: 2016年11月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:茨城県水戸市 茨城県立県民文化センター   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 再構成ホロ酵素の精製と結晶化

    高緒柱, 中島 崇

    日本農芸化学会西日本支部大会  2016年9月 

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    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ由来トキシン・VpParEのDNAジャイレース阻害活性とその様式

    伊藤寛倫, 張晶, 中島 崇

    日本農芸化学会西日本支部大会  2016年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ由来アンチトキシン/トキシンの生理機能に関する研究

    張晶, 伊藤寛倫, 中島 崇

    日本農芸化学会西日本支部大会  2016年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp29の基質結合への関与

    泉健太, 江丹, 中島 崇

    日本農芸化学会西日本支部大会  2016年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP構成タンパク質PhoRpp21の機能解析

    江丹, 泉健太, 中島 崇

    日本農芸化学会西日本支部大会  2016年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNaseP構成タンパク質複合体Rpp21-Rpp29のRNA活性化機構

    江丹, 泉健太, 中島 崇

    第16回日本蛋白質科学会年会  2016年6月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:福岡国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアPyrococcus horikoshii OT3リボヌクレアーゼP構成タンパク質RPP38のRNA活性化における構造基盤

    中島 崇

    第16回日本蛋白質科学会年会  2016年6月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:福岡国際会議場   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)トキシン/アンチトキシンの標的分子に関する研究

    伊藤寛倫, 張晶, 中島 崇

    2016年6月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年6月 - 2016年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡国際会議場   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)由来トキシン/アンチトキシンの機能解析と結晶化

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • シロイヌナズナ由来RNaseP様タンパク質酵素(PRORP)の基質認識機構に関する研究

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp21の機能解析

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp29のRNA結合部位の同定

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNaseP 構成タンパク質Rpp38の機能解析

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • Functional characterization of a toxin/antitoxin in Vibrio parahaemolyticus

    2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  • 超好熱性アーキア(Thermococcus kodakarensis)RNase P構成タンパク質の構造と機能に関する研究

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    微生物学の新たな発展、ゲノムから機能・実用に関する九州シンポジウム  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県宮崎市  ANAホリディ・イン リゾート宮崎   国名:日本国  

  • 変異体を用いたアーキアRNasePのin vivo機能の解析

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第88回日本生化学会大会  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアのリボヌクレアーゼP構成タンパク質複合体Rpp-21-Rpp29とRNAの相互作用に関する研究

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第88回日本生化学会大会  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNaseP構成タンパク質Rpp38-RNA複合体の結晶構造

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第88回日本生化学会大会  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)のトキシン/アンチトキシンの機能解析

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    日本農芸化学会2015年度中四国・西日本支部合同大会  2015年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • シロイヌナズナ由来前駆体tRNAプロセシング酵素PRORPの基質認識機構に関する研究

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    日本農芸化学会2015年度中四国・西日本支部合同大会  2015年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp38によるRNA活性化の作用機構に関する研究

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    日本農芸化学会2015年度中四国・西日本支部合同大会  2015年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp29の構造機能相関

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    日本農芸化学会2015年度中四国・西日本支部合同大会  2015年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボヌクレアーゼP 構成タンパク質Rpp21のRNA活性化部位の同定

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    日本農芸化学会2015年度中四国・西日本支部合同大会  2015年9月 

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    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 腸炎ビブリオ由来トキシン/アンチトキシンの特定とその機能

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第52回化学関連支部合同九州大会  2015年6月 

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    開催年月日: 2015年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNase P構成タンパク質複合体Rpp21-Rpp29のRNA活性化機構

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第52回化学関連支部合同九州大会  2015年6月 

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    開催年月日: 2015年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアRNase P構成タンパク質Rpp38のRNA活性化の構造基盤

    中島 崇, 角田 佳充, 木村 誠

    第52回化学関連支部合同九州大会  2015年6月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:北九州国際会議場   国名:日本国  

  • RNase P 構成タンパク質Rpp38とRNAの相互作用様式と複合体の結晶化

    中島 崇, 大嶋 浩介, 濱崎 真人, 角田 佳充, 木村 誠

    日本生化学会九州支部例会  2012年5月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2012年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡大学   国名:日本国  

  • Biochemical Characterization of The Interaction Between RNase P RNA and PhoRpp38, in The Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 国際会議

    RNA2011 SIXTEENTH Annual meeting of the RNA society  2011年6月 

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    開催年月日: 2011年6月

    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • 超好熱古細菌リボヌクレアーゼP構成サブユニット間相互作用

    中島崇、大嶋浩介、角田佳充、津本浩平、木村誠

    日本農芸化学会  2011年3月 

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    開催年月日: 2011年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都女子大学   国名:日本国  

  • 酵母リボヌクレアーゼPとMRP構成タンパク質の調製と結晶化

    今井崇喜、森美佐子、茶円喜美子、中島崇、角田佳充、中尾実樹、木村誠

    日本農芸化学会  2011年3月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2011年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都女子大学   国名:日本国  

  • The role of carboxyl-terminal basic amino acids in the protein synthesis suppressor RelE

    2009年3月 

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    開催年月日: 2009年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  • 超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii由来Ski2pタイプRNAヘリカーゼの結晶構造

    中島崇,張小冬,角田佳充,木村誠

    蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム  2007年9月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:湯布院(熊本)   国名:日本国  

  • Crystallization and Structural analysis of Archaeal Homolog of Ski-2 type RNA helicase from th Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus horikoshii 国際会議

    Takashi Nakashima, Xiaodong Zhang, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    AsCA '06/CrSJ (Joint Conference of the Asian Crystallographic Association and the Crystallographic Society of Japan)  2006年11月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • Ski2様RNAヘリカーゼ活性発現の構造基盤

    張小冬,中島崇,角田佳充,木村誠

    日本農芸化学会中四国・西日本支部合同大会  2007年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:山口大学(山口)   国名:日本国  

  • 超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii由来Ski2pタイプRNAヘリカーゼの結晶構造

    中島崇,張小冬,角田佳充,木村誠

    第9回RNA学会年会  2007年7月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:名古屋国際会議場(名古屋)   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキア由来ミスマッチ修復酵素Endonuclease MSとPCNAとの複合体の機能構造解析

    #井戸川倫子、#水島淑華、@中島崇、@石野園子、@山上健、@松本俊介、@石野良純、@沼田倫征

    令和5年(2023年)度日本結晶学会年会  2023年10月 

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    開催年月日: 2023年10月 - 2024年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宇部市文化会館・山口大学常盤キャンパス 山口市   国名:日本国  

  • Thermococcus kodakarensis由来DNA末端切断タンパク質複合体の機能構造解析

    #宇田敬史朗, @山上健,@石野園子,@松本俊介,@中島崇,@石野良純, @沼田倫征

    令和5年(2023年)度日本結晶学会年会  2023年11月 

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    開催年月日: 2023年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宇部市文化会館・山口大学常盤キャンパス   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来NurA-HerA複合体の構造解析

    #宇田敬史朗, @沼田倫征, @石野園子, @山上健, @松本俊介, @中島崇, @石野良純

    極限環境生物学会2022年度(第23回)年会  2022年11月 

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    開催年月日: 2022年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東洋大学 川越キャンパス   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来APエンドヌクレアーゼの 調製法の確立と立体構造解析

    #佐藤星賢,@石野園子,@松本俊介,@中島崇,@山上健,@石野良純,@沼田倫征

    2022年度日本農芸化学回西日本支部大会  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎大学文教キャンパス 環境科学部・教養教育講義棟(長崎市文教町1-14)   国名:日本国  

  • 筋幹細胞の活性化抑制機構の発見:活性化因子HGFのニトロ化による不活化 国際会議

    #城戸潤力, 今冨菜々, 奥田晶子, 真鍋宜隆, @中島崇, 澤野祥子, @水野谷航, @中村真子, @辰巳隆一

    日韓合同国際シンポジウム(AFELiSA2019)  2019年11月 

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    開催年月日: 2019年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:米子コンベンションセンター(鳥取県米子市)   国名:日本国  

  • 超好熱性アーキアリボ核タンパク質複合体酵素・RNasePの高次構造解析を目指して

    中島 崇, 高緒柱

    平成28年度日本生化学会九州支部例会  2016年5月 

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    開催年月日: 2016年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:鹿児島市鹿児島大学郡元キャンパス   国名:日本国  

  • Crystal structure of an archaeal Ski2-like protein from pyrococcus horikoshii OT3

    Takashi Nakashima, Zhang Xiaodong, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    13th annual meeting of the RNA society  2008年8月 

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    開催年月日: 2008年8月 - 2008年11月

    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:ドイツ連邦共和国  

  • Structural analysis of ph1481p-ph1877p complex in ribonuclease P

    2005年10月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

    Structural analysis of ph1481p-ph1877p complex in ribonuclease P

  • 超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii由来RNAヘリカーゼの結晶構造解析

    張小冬,中島崇,角田佳充,木村誠

    平成18年度日本農芸化学会西日本支部および日本栄養・食糧学会九州・沖縄支部合同大会  2006年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:佐賀県,佐賀大学   国名:日本国  

  • Crystallization and Structural analysis of Archaeal Homolog of Ski-2 type RNA helicase from th Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 国際会議

    Takashi Nakashima, Xiaodong Zhang, Yoshimitsu Kakuta, Makoto Kimura

    RNA2006 Izu  2006年12月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • 超好熱古細菌Pyrococcus horikoshii由来Ski2p-タイプRNAヘリカーゼの結晶構造

    中島崇,張小冬,角田佳充,木村誠

    平成19年度日本生化学会九州支部例会  2007年5月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:宮崎県,宮崎県立図書館   国名:日本国  

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MISC

  • MAD法によるリボソーム構成タンパク質L2の結晶構造解析

    中島 崇

    2001年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:機関テクニカルレポート,技術報告書,プレプリント等  

所属学協会

  • 日本生化学会

  • 日本RNA学会

  • 日本農芸化学会

  • 日本結晶学会

  • 日本分子生物学会

学術貢献活動

  • 大会実行委員会

    日本農芸化学会2020年度大会  ( 福岡国際会議場 ) 2020年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 座長(Chairmanship)

    日本農芸化学会西日本・中四国支部合同大会(第55回講演会)  ( 琉球大学人文社会学部(沖縄県西原町) ) 2019年11月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 大会実行委員会 国際学術貢献

    ( 九州大学(福岡市) ) 2019年9月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:200

  • 事務局

    日本農芸化学会西日本支部  ( 九州 ) 2013年4月 - 2014年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 運営

    九州大学農学研究院YoungAgri-Scientist Seminar 全13回  ( 九州大学農学部5号館117室 ) 2012年10月 - 2012年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:800

  • 運営

    九州大学農学研究院YoungAgri-Scientist Seminar  ( 九州大学農学部5号館117室 ) 2012年10月 - 2012年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:50

  • 運営

    蛋白質と酵素の構造と機能に関する 九州シンポジウム  ( 福岡市東区 ) 2011年9月 - 2011年10月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • プログラム編成委員会

    日本農芸化学会西日本支部会  ( 沖縄 ) 2009年8月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 農芸化学Frontiersシンポジウム事務局庶務

    日本農芸化学会2009年度大会  ( 福岡県糟屋郡久山町 ) 2009年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:100

  • 大会実行委員会総務補助(準備委員会書記)

    日本農芸化学会2009年度大会  ( 福岡国際会議場 ) 2009年3月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 座長(Chairmanship)

    農芸化学会西日本支部会  ( 長崎大学文教キャンパス ) 2008年9月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 座長(Chairmanship)

    農芸化学会支部会  ( 九州大学大学院農学研究院 ) 2004年10月 - 現在

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    種別:大会・シンポジウム等 

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 加齢性筋萎縮・再生不全の先駆的理解と栄養機能学的制御

    研究課題/領域番号:21H02347  2021年4月 - 2024年3月

    科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    辰巳 隆一, 中島 崇, 鈴木 貴弘, 前原 一満

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    資金種別:科研費

    代表者はこれまでに、骨格筋の肥大・再生・維持を妨げる「筋幹細胞の活性化阻害機構」として活性化因子 HGFのニトロ化 (不活化) を見出した。一方、加齢に伴い筋細胞が萎縮する他、線維化や脂肪化も散見される。 本研究では、これらの加齢性変化が上記の「HGFのニトロ化」に起因すると着想し、これを新規ツール(ニトロ化HGFに対する抗体)を用いて検証する。また、加齢性筋萎縮・再生不全の積極的な治療法・予防法の創出を目指して、脱ニトロ化酵素遺伝子の同定に挑戦すると共に、この遺伝子の発現誘導およびニトロ化を抑制する機能性食品成分を検索する。以って愛玩動物(およびヒト)の健康寿命の延伸に寄与することを目指す。

    CiNii Research

  • 加齢性筋萎縮・再生不全の先駆的理解と栄養機能学的制御

    2021年 - 2023年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

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    担当区分:研究分担者  資金種別:科研費

  • 小孔形成レクチンを基盤とした細胞傷害能を有する新規機能性分子の構築

    2016年 - 2018年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者  資金種別:科研費

  • 前駆体tRNAプロセシング酵素の構造と機能の解明とその有効利用

    2015年 - 2017年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者  資金種別:科研費

  • RNasePタンパク質の相互作用

    2007年

    科学研究費助成事業  若手研究(B)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • タンパク3000プロジェクト個別的解析プログラム「転写・翻訳」

    2002年4月 - 2006年12月

    文部科学省(日本) 

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    担当区分:研究分担者 

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担当授業科目

  • 生物解析・機器分析法-Ⅱ

    2024年6月 - 2024年8月   夏学期

  • 科学英語II

    2024年4月 - 2024年9月   前期

  • 生物化学II

    2023年12月 - 2024年2月   冬学期

  • 無機分析・物理化学実験

    2023年10月 - 2024年3月   後期

  • 生物解析・機器分析法-Ⅱ

    2023年6月 - 2023年8月   夏学期

  • 卒業論文

    2023年4月 - 2024年3月   通年

  • 有機化学実験

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • 科学英語II

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • プロジェクト演習

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • 生物機能分子化学I

    2023年4月 - 2023年6月   春学期

  • 無機分析・物理化学実験

    2022年10月 - 2023年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2022年10月 - 2023年3月   後期

  • 卒業論文

    2022年4月 - 2023年3月   通年

  • 生物機能分子化学II

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • プロジェクト演習

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • 有機化学実験

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • 科学英語II

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • 基礎科学実習

    2021年12月 - 2022年2月   冬学期

  • 生物解析・機器分析

    2021年10月 - 2022年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2021年10月 - 2022年3月   後期

  • 卒業論文

    2021年4月 - 2022年3月   通年

  • 有機化学実験

    2021年4月 - 2021年9月   前期

  • プロジェクト演習

    2021年4月 - 2021年9月   前期

  • 科学英語II

    2021年4月 - 2021年9月   前期

  • 生物解析・機器分析

    2020年10月 - 2021年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2020年10月 - 2021年3月   後期

  • 卒業論文

    2020年4月 - 2021年3月   通年

  • プロジェクト演習

    2020年4月 - 2020年9月   前期

  • 生物解析・機器分析

    2019年10月 - 2020年3月   後期

  • 同位元素実験

    2019年10月 - 2020年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2018年10月 - 2019年3月   後期

  • 同位元素実験

    2018年10月 - 2019年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2018年10月 - 2019年3月   後期

  • 卒業論文

    2018年4月 - 2019年3月   通年

  • プロジェクト演習

    2018年4月 - 2018年9月   前期

  • 科学英語II

    2018年4月 - 2018年9月   前期

  • 生物解析・機器分析

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • 同位元素実験

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • 分子生物学

    2017年4月 - 2017年9月   前期

  • 生物解析・機器分析

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 同位元素実験

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 同位元素実験

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 無機分析・物理化学実験

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 同位元素実験

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 自然科学総合実験

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 卒業論文

    2014年4月 - 2015年3月   通年

  • プロジェクト演習

    2014年4月 - 2014年9月   前期

  • 生物化学実験

    2014年4月 - 2014年9月   前期

  • 無機分析・物理化学実験

    2013年10月 - 2014年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2013年10月 - 2014年3月   後期

  • 同位元素実験

    2013年10月 - 2014年3月   後期

  • 卒業論文

    2013年4月 - 2014年3月   通年

  • コアセミナー

    2013年4月 - 2013年9月   前期

  • 無機分析・物理化学実験

    2012年10月 - 2013年3月   後期

  • 生物解析・機器分析

    2012年10月 - 2013年3月   後期

  • 卒業論文

    2012年4月 - 2013年3月   通年

  • 卒業論文

    2012年4月 - 2013年3月   通年

  • 卒業論文

    2011年4月 - 2012年3月   通年

  • 基礎物理化学実験

    2010年10月 - 2011年3月   後期

  • 卒業論文

    2010年4月 - 2011年3月   通年

  • 科学英語II

    2010年4月 - 2010年9月   前期

  • 基礎物理化学実験

    2009年10月 - 2010年3月   後期

  • 卒業研究

    2009年4月 - 2010年3月   通年

  • 科学英語II

    2009年4月 - 2009年9月   前期

  • 基礎物理化学実験

    2008年10月 - 2009年3月   後期

  • コアセミナー

    2008年4月 - 2008年9月   前期

  • 科学英語II

    2008年4月 - 2008年9月   前期

  • 基礎物理化学実験

    2007年10月 - 2008年3月   後期

  • 生物化学実験

    2007年10月 - 2008年3月   後期

  • 卒業研究

    2007年4月 - 2008年3月   通年

  • 科学英語II

    2007年4月 - 2007年9月   前期

  • 物理化学実験

    2006年10月 - 2007年3月   後期

  • 生物化学実験

    2006年10月 - 2007年3月   後期

  • 科学英語II

    2006年4月 - 2006年9月   前期

  • 生物化学実験

    2005年10月 - 2006年3月   後期

  • 物理化学実験

    2005年10月 - 2006年3月   後期

  • 生物化学実験

    2004年10月 - 2005年3月   後期

  • 物理化学実験

    2004年10月 - 2005年3月   後期

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FD参加状況

  • 2024年3月   役割:参加   名称:有体物管理センターの業務および成果有体物収入の配分率の変更について

    主催組織:全学

  • 2023年11月   役割:参加   名称:農学研究院FD:遺伝子組換え実験の安全管理について

    主催組織:部局

  • 2022年3月   役割:参加   名称:農学研究院FD:リポジトリ登録を対象とした大学改革推進経費の新指標案について

    主催組織:部局

  • 2022年3月   役割:参加   名称:農学研究院FD:国費特別プログラム「未来の農を描くビジョンデザイン実践プログラム」実施に向けて

    主催組織:部局

  • 2021年7月   役割:参加   名称:農学研究院FD「科研費を獲りにいこう! 科研費獲得の技術と工夫」

    主催組織:部局

  • 2020年12月   役割:参加   名称:大学の研究評価の現状と農学研究院の「部局独自の評価基準」案における業績分析

    主催組織:部局

  • 2020年9月   役割:参加   名称:科研費を獲りにいこう! 勝ち抜く気合と技術

    主催組織:部局

  • 2017年2月   役割:参加   名称:科研費「特設分野研究」について

    主催組織:部局

  • 2012年11月   役割:参加   名称:JSPSグローバル人材育成推進事業(特色型)

    主催組織:部局

  • 2010年7月   役割:参加   名称:農学研究院サバティカル(特別研究期間)の運用につい

    主催組織:部局

  • 2010年4月   役割:参加   名称:学府再編に伴うカリキュラムの改正について

    主催組織:部局

  • 2010年1月   役割:参加   名称:九州大学全学シラバスの利用法について

    主催組織:部局

  • 2009年7月   役割:参加   名称:自己点検・評価/外部評価の結果とカリキュラム

    主催組織:部局

  • 2009年4月   役割:参加   名称:GPA制度について

    主催組織:部局

  • 2009年3月   役割:参加   名称:英語による授業の質の向上を目指して

    主催組織:部局

  • 2008年6月   役割:参加   名称:セクシュアル・ハラスメント、アカデミック・ハラスメ

    主催組織:部局

  • 2008年4月   役割:参加   名称:科学技術政策が農学研究に期待するもの

    主催組織:部局

  • 2007年9月   役割:参加   名称:安全管理について

    主催組織:部局

  • 2007年4月   役割:参加   名称:新任教員の研修

    主催組織:全学

  • 2006年12月   役割:参加   名称:農学研究院BSCについて

    主催組織:部局

  • 2006年12月   役割:参加   名称:英語による特別コースについて

    主催組織:部局

  • 2006年10月   役割:参加   名称:教職員のメンタルヘルスケアについて

    主催組織:部局

  • 2006年9月   役割:参加   名称:味の素における生産革命の展開

    主催組織:部局

  • 2006年7月   役割:参加   名称:安全管理について

    主催組織:全学

  • 2006年7月   役割:参加   名称:九州大学におけるe-ラーニングの実施事例

    主催組織:全学

  • 2006年6月   役割:参加   名称:法人化の農学研究院の目指すべき方向性

    主催組織:部局

  • 2006年5月   役割:参加   名称:平成18年度農学研究院第1回FD

    主催組織:部局

  • 2005年4月   役割:参加   名称:新任教員の研修

    主催組織:全学

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その他教育活動及び特記事項

  • 2015年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2013年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2012年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2009年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2009年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2008年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2008年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2007年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2007年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2006年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2006年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2005年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

  • 2005年  その他特記事項  ティーチングアシスタントの指導

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    ティーチングアシスタントの指導

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社会貢献・国際連携活動概要

  • 未活動

学内運営に関わる各種委員・役職等

  • 2024年4月 - 2025年3月   研究院 安全衛生部会WG協力員

  • 2022年4月 - 2024年3月   研究院 安全衛生部会WG協力員

  • 2018年5月 - 2020年5月   その他 九州大学農学部同窓会評議員

  • 2017年6月 - 2025年3月   研究院 安全衛生部会WG協力員

  • 2017年6月 - 2018年3月   研究院 安全衛生部会WG協力員

  • 2014年5月 - 2016年5月   その他 九州大学農学部同窓会評議員

  • 2013年4月 - 2014年3月   学部 学生相談員

  • 2012年6月 - 2013年3月   研究院 サバティカル運営委員会

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