担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Reproductive Medicine and Biology  

Purpose: TRANSLIN (TSN) and its binding partner TSNAX have been reported to contribute to a wide spectrum of biological activities including spermatogenesis. TSN accompanies specific mRNA transport in male germ cells through intercellular bridges. A testis-expressed protein TSNAXIP1 was reported to interact with TSNAX. However the role of TSNAXIP1 in spermatogenesis remained unclear. This study aimed to elucidate the role of TSNAXIP1 in spermatogenesis and male fertility in mice.

Methods: TSNAXIP1 knockout (KO) mice were generated using the CRISPR-Cas9 system. The fertility, spermatogenesis, and sperm of TSNAXIP1 KO males were analyzed.

Results: TSNAXIP1, and especially its domains, are highly conserved between mouse and human. Tsnaxip1 was expressed in testis, but not in ovary. TSNAXIP1 KO mice were generated, and TSNAXIP1 KO males were found to be sub-fertile with smaller testis and lower sperm count. Although no overt abnormalities were observed during spermatogenesis, lack of TSNAXIP1 induced sperm head malformation, resulting in a unique flower-shaped sperm head. Moreover, abnormal anchorage of the sperm neck was frequently observed in TSNAXIP1 null sperm.

Conclusion: A testis-expressed gene TSNAXIP1 has important roles in sperm head morphogenesis and male fertility. Moreover, TSNAXIP1 could be a causative gene for human infertility.

DOI： 10.1002/rmb2.12520

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：International Journal of Molecular Sciences  

Epigenetic regulation via epigenetic factors in collaboration with tissue-specific transcription factors is curtail for establishing functional organ systems during development. Brain development is tightly regulated by epigenetic factors, which are coordinately activated or inactivated during processes, and their dysregulation is linked to brain abnormalities and intellectual disability. However, the precise mechanism of epigenetic regulation in brain development and neurogenesis remains largely unknown. Here, we show that Tip60/KAT5 deletion in neural stem/progenitor cells (NSCs) in mice results in multiple abnormalities of brain development. Tip60-deficient embryonic brain led to microcephaly, and proliferating cells in the developing brain were reduced by Tip60 deficiency. In addition, neural differentiation and neuronal migration were severely affected in Tip60-deficient brains. Following neurogenesis in developing brains, gliogenesis started from the earlier stage of development in Tip60-deficient brains, indicating that Tip60 is involved in switching from neurogenesis to gliogenesis during brain development. It was also confirmed in vitro that poor neurosphere formation, proliferation defects, neural differentiation defects, and accelerated astrocytic differentiation in mutant NSCs are derived from Tip60-deficient embryonic brains. This study uncovers the critical role of Tip60 in brain development and NSC maintenance and function in vivo and in vitro.

DOI： 10.3390/ijms24032113

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担当区分：筆頭著者,　最終著者,　責任著者   記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

During spermatogenesis, nuclear architecture of male germ cells is dynamically changed and epigenetic modifications, in particular methylation of histones, highly contribute to its regulation as well as differentiation of male germ cells. Although several methyltransferases and demethylases for histone H3 are involved in the regulation of spermatogenesis, roles of either histone H4 lysine 20 (H4K20) methyltransferases or H4K20 demethylases during spermatogenesis still remain to be elucidated. Recently, RSBN1 which is a testis-specific gene expressed in round spermatids was identified as a demethylase for dimethyl H4K20. In this study, therefore, we confirm the demethylase function of RSBN1 and compare distributions between RSBN1 and methylated H4K20 in the seminiferous tubules. Unlike previous report, expression analyses for RSBN1 reveal that RSBN1 is not a testis-specific gene and is expressed not only in round spermatids but also in elongated spermatids. In addition, RSBN1 can demethylate not only dimethyl H4K20 but also trimethyl H4K20 and could convert both dimethyl H4K20 and trimethyl H4K20 into monomethyl H4K20. When distribution pattern of RSBN1 in the seminiferous tubule is compared to that of methylated H4K20, both dimethyl H4K20 and trimethyl H4K20 but not monomethyl H4K20 are disappeared from RSBN1 positive germ cells, suggesting that testis-specific distribution patterns of methylated H4K20 might be constructed by RSBN1. Thus, novel expression and function of RSBN1 could be useful to comprehend epigenetic regulation during spermatogenesis.

DOI： 10.1371/journal.pone.0253897

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Splicing can be epigenetically regulated and involved in cellular differentiation in somatic cells, but the interplay of epigenetic factors and the splicing machinery during spermatogenesis re- mains unclear. To study these interactions in vivo, we generated a germline deletion of MORF-related gene on chromosome 15 (MRG15), a multifunctional chromatin organizer that binds to methylated histone H3 lysine 36 (H3K36) in introns of transcriptionally active genes and has been implicated in regulation of histone acetyla- tion, homology-directed DNA repair, and alternative splicing in somatic cells. Conditional KO (cKO) males lacking MRG15 in the germline are sterile secondary to spermatogenic arrest at the round spermatid stage. There were no significant alterations in meiotic division and histone acetylation. Specific mRNA sequences disappeared from 66 germ cell-expressed genes in the absence of MRG15, and specific intronic sequences were retained in mRNAs of 4 genes in the MRG15 cKO testes. In particular, introns were retained in mRNAs encoding the transition proteins that replace histones during sperm chromatin condensation. In round spermatids, MRG15 colocalizes with splicing factors PTBP1 and PTBP2 at H3K36me3 sites between the exons and single intron of transition nuclear protein 2 (Tnp2). Thus, our results reveal that MRG15 is essential for pre- mRNA splicing during spermatogenesis and that epigenetic regula- tion of pre-mRNA splicing by histone modification could be useful to understand not only spermatogenesis but also, epigenetic disor- ders underlying male infertile patients.

DOI： 10.1073/pnas.1611995113

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.celrep.2014.07.060

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1371/journal.pone.0072689

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   出版者・発行元：BMC Genomics  

The Golgi apparatus is a crucial component of the inner membrane system in eukaryotic cells, playing a central role in protein biosynthesis. Dysfunction of the Golgi apparatus has been linked to neurodegenerative diseases. Accurate identification of sub-Golgi protein types is therefore essential for developing effective treatments for such diseases. Due to the expensive and time-consuming nature of experimental methods for identifying sub-Golgi protein types, various computational methods have been developed as identification tools. However, the majority of these methods rely solely on neighboring features in the protein sequence and neglect the crucial spatial structure information of the protein.To discover alternative methods for accurately identifying sub-Golgi proteins, we have developed a model called GASIDN. The GASIDN model extracts multi-dimension features by utilizing a 1D convolution module on protein sequences and a graph learning module on contact maps constructed from AlphaFold2.The model utilizes the deep representation learning model SeqVec to initialize protein sequences. GASIDN achieved accuracy values of 98.4% and 96.4% in independent testing and ten-fold cross-validation, respectively, outperforming the majority of previous predictors. To the best of our knowledge, this is the first method that utilizes multi-scale feature fusion to identify and locate sub-Golgi proteins. In order to assess the generalizability and scalability of our model, we conducted experiments to apply it in the identification of proteins from other organelles, including plant vacuoles and peroxisomes. The results obtained from these experiments demonstrated promising outcomes, indicating the effectiveness and versatility of our model. The source code and datasets can be accessed at https://github.com/SJNNNN/GASIDN.

DOI： 10.1186/s12864-024-10954-3

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Journal of Veterinary Medicine Series C: Anatomia Histologia Embryologia  

Mouse embryos in the early-implantation stage require manipulation under a microscope. While the extraction of DNA, RNA and proteins from a single sample allows for both determination of genetic type and analysis of gene expression, whole mount analysis is not possible. In this study, we explored the applicability of PCR using extraembryonic tissues, especially the decidual side tissue after isolating the embryos from implantation sites to establish a method for determining the genetic type of embryos. The implantation site was resected at each day from the date of vaginal plug confirmation, separated into embryos and deciduae. Genomic DNA were isolated separately from the embryos and the deciduae. PCR was performed using these genomic DNA, and the band patterns were compared after electrophoresis. As a result, we demonstrated that detecting embryo-derived cells in the decidua allows determination of the sex and presence of transgenes without harming the mouse embryos themselves, from 8.5 days of age. This method enables the determination of the genetic type of mouse embryos without damaging. This technique would expand the adaptations for analysis of mouse implanted embryos.

DOI： 10.1111/ahe.12976

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Frontiers in Bioscience - Landmark  

Background: Peroxisomes are membrane-bound organelles that contain one or more types of oxidative enzymes. Aberrant localization of peroxisomal proteins can contribute to the development of various diseases. To more accurately identify and locate peroxisomal proteins, we developed the ProSE-Pero model. Methods: We employed three methods based on deep representation learning models to extract the characteristics of peroxisomal proteins and compared their performance. Furthermore, we used the SVMSMOTE balanced dataset, SHAP interpretation model, variance analysis (ANOVA), and light gradient boosting machine (LightGBM) to select and compare the extracted features. We also constructed several traditional machine learning methods and four deep learning models to train and test our model on a dataset of 160 peroxisomal proteins using tenfold cross-validation. Results: Our proposed ProSE-Pero model achieves high performance with a specificity (Sp) of 93.37%, a sensitivity (Sn) of 82.41%, an accuracy (Acc) of 95.77%, a Matthews correlation coefficient (MCC) of 0.8241, an F1 score of 0.8996, and an area under the curve (AUC) of 0.9818. Additionally, we extended our method to identify plant vacuole proteins and achieved an accuracy of 91.90% on the independent test set, which is approximately 5% higher than the latest iPVP-DRLF model. Conclusions: Our model surpasses the existing In-Pero model in terms of peroxisomal protein localization and identification. Additionally, our study showcases the proficient performance of the pre-trained multitasking language model ProSE in extracting features from protein sequences. With its established validity and broad generalization, our model holds considerable potential for expanding its application to the localization and identification of proteins in other organelles, such as mitochondria and Golgi proteins, in future investigations.

DOI： 10.31083/j.fbl2812322

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：BMC Bioinformatics  

Plant vacuoles are essential organelles in the growth and development of plants, and accurate identification of their proteins is crucial for understanding their biological properties. In this study, we developed a novel model called GraphIdn for the identification of plant vacuole proteins. The model uses SeqVec, a deep representation learning model, to initialize the amino acid sequence. We utilized the AlphaFold2 algorithm to obtain the structural information of corresponding plant vacuole proteins, and then fed the calculated contact maps into a graph convolutional neural network. GraphIdn achieved accuracy values of 88.51% and 89.93% in independent testing and fivefold cross-validation, respectively, outperforming previous state-of-the-art predictors. As far as we know, this is the first model to use predicted protein topology structure graphs to identify plant vacuole proteins. Furthermore, we assessed the effectiveness and generalization capability of our GraphIdn model by applying it to identify and locate peroxisomal proteins, which yielded promising outcomes. The source code and datasets can be accessed at https://github.com/SJNNNN/GraphIdn .

DOI： 10.1186/s12859-023-05475-x

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記述言語：英語   出版者・発行元：John Wiley & Sons Australia, Ltd  

トランスリン関連因子X相互作用蛋白質1(TSNAXIP1)が、マウスでの造精と雄の妊孕能に関して果たしている役割を解明した。TSNAXIP1のオルソログのペプチド配列を調べた結果、マウスとヒトの間では、特にそのドメインが高度に保存されていることが示された。マウスにおけるTsnaxip1遺伝子発現を逆転写PCR法で解析した結果、精巣に発現しているが卵巣には発現していないことが判明した。CRISPR-Cas9システムを利用しTSNAXIP1ノックアウト(KO)マウスを作成した結果、雄のKOマウスは精巣が小型で精子の数も少ないという妊孕能の低い個体になった。造精中には明白な異常は観察されなかったものの、TSNAXIP1が欠乏することで精子の頭部には奇形が生じ、その結果、花のような特徴的な形状の頭部となっていた。また精子頸部の連結部(anchorage)の異常も高頻度で観察された。精巣に発現する遺伝子であるTSNAXIP1は精子頭部の形態形成に重要な役割を有していた。加えて、TSNAXIP1はヒト不妊症の原因遺伝子となる可能性も考えられた。

CiNii Research

CiNii Research

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Scientific Reports  

Acute lung injury (ALI) is a serious respiratory disease, which can lead to acute respiratory failure or death. It is closely related to the pathogenesis of New Coronavirus pneumonia (COVID-19). Many researches showed that traditional Chinese medicine (TCM) had a good effect on its intervention, and network pharmacology could play a very important role. In order to construct "disease-gene-target-drug" interaction network more accurately, deep learning algorithm is utilized in this paper. Two ALI-related target genes (REAL and SATA3) are considered, and the active and inactive compounds of the two corresponding target genes are collected as training data, respectively. Molecular descriptors and molecular fingerprints are utilized to characterize each compound. Forest graph embedded deep feed forward network (forgeNet) is proposed to train. The experimental results show that forgeNet performs better than support vector machines (SVM), random forest (RF), logical regression (LR), Naive Bayes (NB), XGBoost, LightGBM and gcForest. forgeNet could identify 19 compounds in Erhuang decoction (EhD) and Dexamethasone (DXMS) more accurately.

DOI： 10.1038/s41598-022-24385-1

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記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.2108/zs210046

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/mrd.23396

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1093/biolre/ioaa017

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Autophagy is essential for cellular survival and energy homeostasis under nutrient deprivation. Despite the emerging importance of nuclear events in autophagy regulation, epigenetic control of autophagy gene transcription remains unclear. Here, we report fasting-induced Fibroblast Growth Factor-21 (FGF21) signaling activates hepatic autophagy and lipid degradation via Jumonji-D3 (JMJD3/KDM6B) histone demethylase. Upon FGF21 signaling, JMJD3 epigenetically upregulates global autophagy-network genes, including Tfeb, Atg7, Atgl, and Fgf21, through demethylation of histone H3K27-me3, resulting in autophagy-mediated lipid degradation. Mechanistically, phosphorylation of JMJD3 at Thr-1044 by FGF21 signal-activated PKA increases its nuclear localization and interaction with the nuclear receptor PPARα to transcriptionally activate autophagy. Administration of FGF21 in obese mice improves defective autophagy and hepatosteatosis in a JMJD3-dependent manner. Remarkably, in non-alcoholic fatty liver disease patients, hepatic expression of JMJD3, ATG7, LC3, and ULK1 is substantially decreased. These findings demonstrate that FGF21-JMJD3 signaling epigenetically links nutrient deprivation with hepatic autophagy and lipid degradation in mammals.

DOI： 10.1038/s41467-020-14384-z

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/s41375-019-0462-4

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/mrd.23108

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

Jumonji D3 (JMJD3) histone demethylase epigenetically regulates development and differentiation, immunity, and tumorigenesis by demethylating a gene repression histone mark, H3K27-me3, but a role for JMJD3 in metabolic regulation has not been described. SIRT1 deacetylase maintains energy balance during fasting by directly activating both hepatic gluconeogenic and mitochondrial fatty acid β-oxidation genes, but the underlying epigenetic and gene-specific mechanisms remain unclear. In this study, JMJD3 was identified unexpectedly as a gene-specific transcriptional partner of SIRT1 and epigenetically activated mitochondrial β-oxidation, but not gluconeogenic, genes during fasting. Mechanistically, JMJD3, together with SIRT1 and the nuclear receptor PPARα, formed a positive autoregulatory loop upon fasting-activated PKA signaling and epigenetically activated β-oxidation-promoting genes, including Fgf21, Cpt1a, and Mcad. Liver-specific downregulation of JMJD3 resulted in intrinsic defects in β-oxidation, which contributed to hepatosteatosis as well as glucose and insulin intolerance. Remarkably, the lipid-lowering effects by JMJD3 or SIRT1 in diet-induced obese mice were mutually interdependent. JMJD3 histone demethylase may serve as an epigenetic drug target for obesity, hepatosteatosis, and type 2 diabetes that allows selective lowering of lipid levels without increasing glucose levels.

DOI： 10.1172/JCI97736.

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1007/s00429-016-1299-5

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1095/biolreprod.116.145458

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.3389/fnbeh.2015.00157

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.neuroscience.2014.03.055

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1016/j.bbrc.2013.09.125

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1073/pnas.1206410109

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1371/journal.pone.0017066

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

開催年月日： 2024年9月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

開催地：名古屋大学   国名：日本国  

開催年月日： 2024年9月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：長崎大学   国名：日本国  

開催年月日： 2024年7月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Dublin   国名：アイルランド  

開催年月日： 2024年7月

記述言語：英語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：Humburg   国名：ドイツ連邦共和国  

開催年月日： 2023年12月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：神戸ポートアイランド   国名：日本国  

雌雄の組織・細胞は性差を持つことが示されているが、性染色体上遺伝子による性差構築には不明な点が多い。UTXとUTYは性染色体上に位置するH3K27脱メチル化酵素であり、その活性は大きく異なっている。UTXの脱メチル化活性は高く、UTYの脱メチル化活性は低いことに加え、UTXはX染色体不活化を逃れる遺伝子であるため、X染色体を2本持つ雌と、X染色体とY染色体を1本ずつ持つ雄を比較すると、理論上雌の方が高いH3K27脱メチル化活性を持つ。先行研究によって、H3K27メチル化制御は性分化における重要なエピジェネティック制御であることが示されている。そのため、UTX、UTYも性分化制御に関わっている可能性が考えられる。そこで、本研究では、UTXとUTYの脱メチル化活性の差が性決定に関与しているか調べることを目的とする。 　これまでにUTXの活性を低く転換させるアミノ酸部位及びアミノ酸変異を同定し、CRISPR-Cas9法を用いてマウス受精卵に対してゲノム編集を行うことで変異マウスを作製した。変異マウスを交配することで、雄型H3K27脱メチル化活性を持つ雌マウスを含む様々なH3K27脱メチル化活性を持つマウスを作製した。これらの変異マウスから性分化期にあたる胎齢13.5日齢の胎仔生殖腺をサンプルとして回収し、形態観察並びにRNAシークエンスとリアルタイムPCRによる遺伝子解析・比較を行った。形態観察の結果、H3K27脱メチル化活性を転換させても性転換などの形態的変化は確認できなかった。しかし、RNAシークエンスの結果、主成分分析において、変異導入雄が雌型に近づくという結果が得られた。変異導入雄の遺伝子発現に関する解析を進めたところ、アンドロゲン産生に必須の酵素であるCYP17A1の遺伝子発現量がUTX変異によって減少したことが明らかになった。また、性分化に関係する遺伝子についてリアルタイムPCR行った結果、精巣分化に関わるSox9、卵巣分化に関わるWnt4の発現量に変化が見られた。 　これらの結果から、UTXはマウス性分化のエピジェネティック制御に関与する可能性が示唆された。

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：幕張メッセ（千葉県）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学（東京）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学（東京）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学（東京）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：東京大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：東京大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：東京大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：幕張メッセ（千葉県）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：幕張メッセ（千葉県）   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：幕張メッセ（千葉県）   国名：日本国  

開催年月日： 2022年4月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：福岡   国名：日本国  

開催年月日： 2019年7月

記述言語：英語  

開催地：San Jose, CA   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2019年6月

記述言語：英語  

開催地：Los Angels, CA   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2018年9月

記述言語：日本語  

開催地：北海道   国名：日本国  

開催年月日： 2018年6月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：福岡   国名：日本国  

精子形成の起源となる精子幹細胞の制御機構を解析し、ヒストンH3リジン27（H3K27）の脱メチル化酵素が幹細胞老化に関与することを見出した。生殖細胞特異的にH3K27脱メチル化酵素JMJD3を欠損した雄マウスは長期にわたり良好な繁殖能力を示し、実際に、精巣内の精子幹細胞数増加、脱分化的幹細胞供給の増加が見られた。精巣以外の組織を含めたJMDJ3による幹細胞制御機構を調べたところ、神経幹細胞の分化に寄与することが明らかとなったほか、飢餓ストレスを与えた際に肝臓においてミトコンドリア脂肪酸酸化経路を活性化することが示された。精巣においてもエネルギー代謝経路、オートファジー経路とJMJD3の関連が幹細胞老化に関わることが示され、幹細胞制御に応用できる可能性が示唆された。

開催年月日： 2018年6月

記述言語：英語  

開催地：Melbourne   国名：オーストラリア連邦  

開催年月日： 2017年9月

記述言語：英語  

開催地：沖縄   国名：日本国  

開催年月日： 2017年9月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：富山   国名：日本国  

開催年月日： 2017年9月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

開催地：山口   国名：日本国  

開催年月日： 2017年6月

記述言語：英語  

開催地：Boston, MA   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2016年11月 - 2016年12月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：パシフィコ横浜   国名：日本国  

近年、スプライシングがエピジェネティックに制御され、細胞分化に関わることが報告された。しかし、精子形成過程におけるエピジェネティック制御因子とスプライシング機構との相関関係ついては明らかにされていない。この関係性を明らかにするために、本研究ではクロマチン制御因子の一つMRG15の精子形成における役割を解析した。MRG15はトリメチル化ヒストンH3リジン36（H3K36me3）を認識し、ヒストンアセチル化制御を介した転写制御、DNA損傷に応答した相同組み換え修復、選択的スプライシング制御など多様な機能をもつ。MRG15は様々な組織において発現しているが、精巣において特に高発現を示し、パキテン期精母細胞で発現が始まり、円形精細胞で最も高い発現を示した。生殖細胞特異的MRG15欠損コンディショナルノックアウトマウスを作製したところ、雄マウスは不妊となった。その精子形成は円形精細胞で停止しており、ヒストンH4のアセチル化、減数分裂に異常には見られなかった。精細胞で重要な役割を果たすTpn1/2、Prm1/2の発現を調べたところ、MRG15欠損によりイントロンを含んだままのTnp2転写産物が蓄積していた。RNA-seq解析から、MRG15欠損により、66遺伝子から特異的配列が消失し、4遺伝子にイントロン配列が残存するスプライシング異常が見られた。さらに詳細な解析からTnp2を含めたこれら70遺伝子のほとんどにおいてMRG15がエキソン-イントロン境界領域に修飾されたH3K36me3を認識し、スプライシング制御因子PTBPを引き寄せることでpre-mRNAスプライシングを制御することが示された。以上のことから、MRG15を介したヒストン修飾によるエピジェネティックスプライシング制御が精子形成に必須であることが明らかとなった。本結果は精子形成の理解だけでなく後天的不妊の原因解明に役立つ可能性がある。

開催年月日： 2016年10月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：産業医科大学   国名：日本国  

精子形成過程において、生殖細胞が分化する間、クロマチン構造、エピジェネティック修飾など核内構造が劇的に変化する。しかし、生殖細胞の各分化段階におけるクロマチン制御およびエピジェネティック制御と精子形成との関連については未だに不明な点が多い。本研究ではクロマチン制御因子の一つMRG15の精子形成における役割を解析した。MRG15はトリメチル化ヒストンH3リジン36（H3K36me3）を認識し、ヒストンアセチル化制御を介した転写制御、DNA損傷に応答した相同組み換え修復、選択的スプライシング制御など多様な機能をもつ。MRG15は様々な組織において発現しているが、精巣において特に高発現を示す。精巣におけるMRG15の発現を調べたところ、パキテン期精母細胞で発現が始まり、円形精細胞で最も高い発現を示した。生殖細胞特異的MRG15欠損コンディショナルノックアウトマウスを作製したところ、雄マウスは不妊であった。その精子形成は円形精細胞で停止しており、ヒストンH4のアセチル化、減数分裂に異常には見られなかった。精細胞で重要な役割を果たすTpn1/2、Prm1/2の発現を調べたところ、MRG15欠損によりイントロンを含んだままのTnp2転写産物が蓄積していることが分かった。ChIPおよびChIP-seqの結果からMRG15はH3K36me3を認識し、スプライシング制御因子PTBPを引き寄せることでTnp2のpre-mRNAスプライシングを制御していることが示唆された。以上のことから、MRG15を介したヒストン修飾によるエピジェネティックスプライシング制御が精子形成制御に重要な役割を持つことが示された。

開催年月日： 2015年5月

記述言語：日本語  

開催地：東京   国名：日本国  

精子形成過程において、生殖細胞が分化する間、クロマチン構造、エピジェネティック修飾など核内構造が劇的に変化する。しかし、生殖細胞の各分化段階におけるクロマチン制御およびエピジェネティック制御と精子形成との関連については未だに不明な点が多い。本研究ではクロマチン制御因子の一つMRG15の精子形成における役割を解析した。MRG15はトリメチル化ヒストンH3リジン36（H3K36me3）を認識し、ヒストンアセチル化制御を介した転写制御、DNA損傷に応答した相同組み換え修復、選択的スプライシング制御など多様な機能をもつ。MRG15は様々な組織において発現しているが、精巣において特に高発現を示す。精巣におけるMRG15の発現を調べたところ、パキテン期精母細胞で発現が始まり、円形精細胞で最も高い発現を示した。生殖細胞特異的MRG15欠損コンディショナルノックアウトマウスを作製したところ、雄マウスは不妊であった。その精子形成は円形精細胞で停止しており、ヒストンH4のアセチル化、減数分裂に異常には見られなかった。精細胞で重要な役割を果たすTpn1/2、Prm1/2の発現を調べたところ、MRG15欠損によりイントロンを含んだままのTnp2転写産物が蓄積していることが分かった。ChIPおよびChIP-seqの結果からMRG15はH3K36me3を認識し、スプライシング制御因子PTBPを引き寄せることでTnp2のpre-mRNAスプライシングを制御していることが示唆された。以上のことから、MRG15を介したヒストン修飾によるエピジェネティックスプライシング制御が精子形成制御に関わっていることが示された。

開催年月日： 2014年10月

記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Beijing   国名：中華人民共和国  

開催年月日： 2014年8月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：帯広畜産大学   国名：日本国  

開催年月日： 2024年11月

記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

開催地：マリンメッセ福岡   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：東京大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：早稲田大学   国名：日本国  

開催年月日： 2023年7月

記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

開催地：東京大学   国名：日本国  

開催年月日： 2022年6月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：福岡   国名：日本国  

開催年月日： 2021年9月

記述言語：日本語  

開催地：米子   国名：日本国  

開催年月日： 2019年9月

記述言語：日本語   会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等  

開催地：北海道大学・札幌・北海道   国名：日本国  

開催年月日： 2018年5月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：久留米   国名：日本国  

開催年月日： 2018年5月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：宮崎   国名：日本国  

開催年月日： 2017年12月

記述言語：日本語  

開催地：神戸   国名：日本国  

開催年月日： 2017年9月

記述言語：英語  

開催地：沖縄   国名：日本国  

開催年月日： 2017年9月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：富山   国名：日本国  

開催年月日： 2016年11月 - 2016年12月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：パシフィコ横浜   国名：日本国  

精子形成には細胞間架橋が必要不可欠であり、欠損すると雄性不妊になる。精巣特異的細胞間架橋には、一精祖細胞由来の全生殖細胞を結合するIntercellular bridge（ICB）、精細管基底膜近くのセルトリ細胞間密着結合Blood-testis barrier（BTB）、セルトリ細胞と隣接セルトリ細胞および伸長期精子細胞との細胞間接着装置 Ectoplasmic Specialization（ES）などがある。これら細胞間架橋は細胞同士を物理的につなぎ精細管基底膜上の立体構造を構築するだけでなく、ICBは細胞間情報伝達、BTBは自己免疫作用から非自己細胞の隔離、ESはセルトリ細胞から生殖細胞への栄養補給などの機能が考えられているが、これら細胞間架橋の機能は未だ不明な点が多い。我々はこれら構造体の構造と機能の解明を目的に、マウス精巣からこれら細胞間架橋の濃縮精製法を開発した。濃縮精製物のプロテオミクス解析の結果、X染色体にコードされた精巣特異的新規遺伝子KIAA1210が同定された。抗体を作製しマウス精巣に対して免疫組織化学的染色を行ったところ、KIAA1210はESおよびアクロソーム、精母細胞に局在することが分かった。さらに、この新規タンパク質はマウスとヒト間で高いホモロジーを示し、DNAに関係する興味深いドメインを有するタンパク質である。KIAA1210に対する抗体を用いた免疫沈降（IP）-プロテオミクス解析により結合タンパク質を同定したところ、ドメインの予想作用を裏付けるタンパク質が同定された。また、Crisper-Cas9システムを用いてノックアウトマウスが誕生し現在解析中である。この新規タンパク質とその複合体の機能解明がES関連研究を飛躍させる事を期待する。

開催年月日： 2016年10月

記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：産業医科大学   国名：日本国  

精巣では生殖細胞同士が連結したまま増殖と成熟を繰り返し絶え間なく精子を産出している。精細管の内部で構築されている立体構造の要となる細胞間架橋には、生殖細胞間結合のIntercellular bridge（ICB,　細胞間架橋）、精細管基底膜近くのセルトリ細胞同士の密着結合Blood-testis barrier（BTB, 血液精巣関門）、さらにセルトリ細胞が隣接するセルトリ細胞および伸長期精子細胞との接合部に形成している細胞間接着装置 ectoplasmic specialization（ES）などがある。セルトリ細胞間のESはbasal ES、精子細胞とのものをApical ESと呼ぶ。こうした細胞間架橋は細胞同士を物理的に繋ぎ合わせ精細管基底膜上の立体構造を維持するだけでなく、ICBでは低分子輸送など細胞間情報伝達に働いていると考えられる。中でも、BTBに隣接したbasal ESにおいては、精母細胞がBTBを越えて内腔に移動する際に消失し、その後、新たに再形成される。一方、Apical ESでは精子細胞の伸長期に出現し、精子遊離前に消失する。このようにESは出現・消滅する動的な構造体であるが、その制御機構や関連分子について未明である。我々は膜タンパク質を濃縮する方法を改良し、マウス精巣からこれら細胞間架橋の濃縮精製を行った。濃縮精製物のプロテオミクス解析の結果、X染色体にコードされた精巣特異的新規遺伝子KIAA1210が同定された。抗体を作製しマウス精巣に対して免疫組織化学的染色を行った。その際、既知ESおよびアクロソームのマーカータンパク質の抗体を用いて共染色を行い、我々が同定したタンパク質がESおよびアクロソーム局在新規タンパク質であることが分かった。さらに、この新規タンパク質はマウスとヒト間で高いホモロジーを示し、DNAに関係する興味深いドメインを有するタンパク質である。現在、KIAA1210の機能解明に向け、抗体を用いて免疫沈降を行い、プロテオミクス解析により結合タンパク質を同定し機能解析を行っている。また、Crisper-Cas9システムを用いてノックアウトマウスを行っている。この新規タンパク質とその複合体の機能解明がES関連研究を飛躍させる事を期待する。

開催年月日： 2015年12月

記述言語：英語  

開催地：神戸ポートアイランド   国名：日本国  

開催年月日： 2012年6月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Yokohama   国名：日本国  

開催年月日： 2010年6月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：San Francisco   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2010年4月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Houston   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2009年6月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Barcelona   国名：スペイン  

開催年月日： 2009年4月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Philadelphia   国名：アメリカ合衆国  

開催年月日： 2007年6月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Cairns   国名：オーストラリア連邦  

開催年月日： 2005年2月

会議種別：口頭発表（一般）  

開催地：Banff, Alberta   国名：カナダ  

記述言語：英語  

記述言語：日本語  

記述言語：日本語  

記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)北隆館  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)北隆館  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)ニュー・サイエンス社  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)北隆館  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)ニュー・サイエンス社  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)ニュー・サイエンス社  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定されるが,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。最近の研究から,どちらの性決定様式にもヒストンH3リジン27(H3K27)メチル化制御が関わることが報告された。しかし哺乳類の性制御におけるH3K27メチル化制御には不明な点が残されている。そこで,性染色体にコードされるH3K27脱メチル化酵素UTX/UTYに注目した。UTXの酵素活性をゲノム編集によりUTY型に変換させた遺伝子組換えマウスを作製したところ,UTXの酵素活性はむしろ性スペクトラム制御に関わることを示唆する興味深い結果を得たので報告する。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)北隆館  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定され,哺乳類では性染色体の組合せがXXの場合はメスに,XYの場合はオスになり,鳥類では性染色体の組合せがZWの場合はメスに,ZZの場合はオスになる。一方で,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。また,魚類の一部は社会的環境により性を転換する。これら遺伝的性決定と温度依存的性決定,そして環境依存的性転換は一見全く異なる仕組みであるが,最近の研究から,どの性決定様式にもエピジェネティック制御が関わることが報告された。本稿ではそれぞれの性分化に関わるエピジェネティック制御機構を紹介し,種を超えて共通した性分化制御が存在するのかどうか考察したい。(著者抄録)

記述言語：日本語   出版者・発行元：(株)ニュー・サイエンス社  

脊椎動物の雌雄の性決定様式は種によって異なり多様である。哺乳動物や鳥類における雌雄の性決定は染色体の遺伝的性によって決定され,哺乳類では性染色体の組合せがXXの場合はメスに,XYの場合はオスになり,鳥類では性染色体の組合せがZWの場合はメスに,ZZの場合はオスになる。一方で,多くの爬虫類では孵卵の際の温度に依存して性が決定される。また,魚類の一部は社会的環境により性を転換する。これら遺伝的性決定と温度依存的性決定,そして環境依存的性転換は一見全く異なる仕組みであるが,最近の研究から,どの性決定様式にもエピジェネティック制御が関わることが報告された。本稿ではそれぞれの性分化に関わるエピジェネティック制御機構を紹介し,種を超えて共通した性分化制御が存在するのかどうか考察したい。(著者抄録)

記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）  

種別：査読等 

外国語雑誌　査読論文数：1

国内会議録　査読論文数：8

種別：大会・シンポジウム等 

種別：査読等 

国内会議録　査読論文数：8

種別：大会・シンポジウム等 

種別：査読等 

国内会議録　査読論文数：5

種別：大会・シンポジウム等 

種別：大会・シンポジウム等