システム情報科学研究院 情報学部門

（併任）工学部 電気情報工学科, システム情報科学府 情報理工学専攻

情報通信 / 知能情報学、自然科学一般 / 素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする理論、自然科学一般 / 素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする理論、情報通信 / 知能情報学、情報通信 / ソフトコンピューティング

時空量子連携研究機構

自然科学一般 / 素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする理論、フロンティア（航空・船舶） / 航空宇宙工学

数理学研究院 代数幾何部門

（併任）数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科

自然科学一般 / 代数学

理学研究院 物理学部門

（併任）超伝導システム科学研究センター, 理学府 物理学専攻, 理学部 物理学科

自然科学一般 / 磁性、超伝導、強相関系

工学研究院 化学工学部門

（併任）工学府 化学工学専攻, 工学部 化学工学科

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理、ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / 移動現象、単位操作、ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / 流体工学

理学研究院 物理学部門

（併任）理学府 物理学専攻, 理学部 物理学科

自然科学一般 / 数理物理、物性基礎、自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理

数理学研究院 解析部門

（併任）マス・フォア・イノベーション連係学府, 数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科

自然科学一般 / 応用数学、統計数学

応用力学研究所 附属大気海洋環境研究センター

自然科学一般 / 大気水圏科学

工学研究院 環境社会部門

（併任）工学府 土木工学専攻, 工学部 土木工学科

社会基盤（土木・建築・防災） / 防災工学、自然科学一般 / 大気水圏科学、自然科学一般 / 大気水圏科学、社会基盤（土木・建築・防災） / 防災工学

マス・フォア・インダストリ研究所 先進暗号数理デザイン室

（併任）マス・フォア・イノベーション連係学府, 数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科

自然科学一般 / 代数学、情報通信 / 情報セキュリティ