理学研究院 物理学部門
(併任)理学部 物理学科, 理学府 物理学専攻
ライフサイエンス / 生物物理学、自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
応用力学研究所 附属大気海洋環境研究センター
(併任)総合理工学府 総合理工学専攻
環境・農学 / 環境動態解析、自然科学一般 / 大気水圏科学
理学研究院 物理学部門
(併任)低温センター, 理学部 物理学科, 理学府 物理学専攻
自然科学一般 / 磁性、超伝導、強相関系、ナノテク・材料 / ナノ材料科学
工学研究院 地球資源システム工学部門
(併任)工学部 地球資源システム工学科, 工学府 共同資源工学専攻, 工学府 地球資源システム工学専攻
エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学、自然科学一般 / 固体地球科学、自然科学一般 / 地球人間圏科学、環境・農学 / 環境影響評価、社会基盤(土木・建築・防災) / 地盤工学、エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学
理学研究院 物理学部門
(併任)理学部 物理学科, 理学府 物理学専攻
自然科学一般 / 素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする理論、エネルギー / 原子力工学
数理学研究院 解析部門
(併任)理学部 数学科, 数理学府 数理学専攻
自然科学一般 / 数理解析学
理学研究院 化学部門
(併任)理学部 化学科, 理学府 化学専攻, ネガティブエミッションテクノロジー研究センター ユビキタス光エネルギー研究部門, 分子システム科学センター
ナノテク・材料 / 分析化学、自然科学一般 / 半導体、光物性、原子物理、ナノテク・材料 / 機能物性化学、ナノテク・材料 / 基礎物理化学、ナノテク・材料 / 光工学、光量子科学
理学研究院 地球惑星科学部門
(併任)総合研究博物館, 理学部 地球惑星科学科, 理学府 地球惑星科学専攻
自然科学一般 / 固体地球科学
理学研究院 地球惑星科学部門
(併任)国際宇宙惑星環境研究センター, 理学部 地球惑星科学科, 理学府 地球惑星科学専攻
自然科学一般 / 宇宙惑星科学、自然科学一般 / 大気水圏科学
数理学研究院 解析部門
(併任)理学部 数学科, 数理学府 数理学専攻
自然科学一般 / 基礎解析学