工学研究院 地球資源システム工学部門
(併任)シンクロトロン光利用研究センター, 工学研究院 附属環境工学研究教育センター, 工学部 地球資源システム工学科, 工学府 地球資源システム工学専攻, エネルギー研究教育機構
エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学、環境・農学 / 環境負荷低減技術、保全修復技術、環境・農学 / 環境材料、リサイクル技術、ナノテク・材料 / グリーンサステイナブルケミストリー、環境化学、ナノテク・材料 / ナノバイオサイエンス、ライフサイエンス / 応用微生物学
熱帯農学研究センター
(併任)農学研究院 附属国際農業教育・研究推進センター, 生物資源環境科学府 環境農学専攻
環境・農学 / 農業環境工学、農業情報工学、環境・農学 / 地域環境工学、農村計画学
農学研究院 資源生物科学部門
(併任)生物資源環境科学府 資源生物科学専攻, 農学部 生物資源環境学科, 熱帯農学研究センター
環境・農学 / 園芸科学
農学研究院 環境農学部門
(併任)生物資源環境科学府 環境農学専攻, 農学部 生物資源環境学科
ライフサイエンス / 医療薬学、ライフサイエンス / 食品科学、ナノテク・材料 / 分析化学、環境・農学 / 循環型社会システム
農学研究院 資源生物科学部門
(併任)アジア埋蔵文化財研究センター, 生物資源環境科学府 資源生物科学専攻, 農学部 生物資源環境学科, 生物資源環境科学府 附属水産実験所
環境・農学 / 生物資源保全学、環境・農学 / 自然共生システム
工学研究院 地球資源システム工学部門
(併任)工学研究院 附属環境工学研究教育センター, 工学部 地球資源システム工学科, 工学府 地球資源システム工学専攻, シンクロトロン光利用研究センター
環境・農学 / 環境負荷低減技術、保全修復技術、エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学
経済学研究院 産業マネジメント部門
(併任)経済学府 産業マネジメント専攻, 農学研究院 附属昆虫科学・新産業創生研究センター, 農学研究院 附属アクアバイオリソース創出センター
環境・農学 / 昆虫科学、人文・社会 / 経営学
農学研究院 環境農学部門
(併任)熱帯農学研究センター, 共創学部 共創学科, 生物資源環境科学府 環境農学専攻, 農学部 生物資源環境学科
ライフサイエンス / 森林科学、環境・農学 / 環境動態解析
農学研究院 生命機能科学部門
(併任)植物フロンティア研究センター, 生物資源環境科学府 生命機能科学専攻, 農学部 生物資源環境学科
環境・農学 / 遺伝育種科学
農学研究院 環境農学部門
(併任)生物資源環境科学府 環境農学専攻, 農学部 生物資源環境学科
環境・農学 / 地域環境工学、農村計画学