応用力学研究所 附属大気海洋環境研究センター

自然科学一般 / 大気水圏科学

経済学研究院 経済工学部門

自然科学一般 / 応用数学、統計数学

工学研究院 地球資源システム工学部門

自然科学一般 / 固体地球科学、エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学

理学研究院 物理学部門

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理、ナノテク・材料 / 応用物性

国際宇宙惑星環境研究センター

自然科学一般 / 宇宙惑星科学、フロンティア（航空・船舶） / 航空宇宙工学、自然科学一般 / 素粒子、原子核、宇宙線、宇宙物理にする理論

数理学研究院 解析部門

自然科学一般 / 幾何学、自然科学一般 / 基礎解析学

理学研究院 物理学部門

自然科学一般 / 数理物理、物性基礎

理学研究院 地球惑星科学部門

自然科学一般 / 固体地球科学

マス・フォア・インダストリ研究所 産業数理統計研究部門

自然科学一般 / 応用数学、統計数学

比較社会文化研究院 環境変動部門

自然科学一般 / 固体地球科学