理学研究院 物理学部門
(併任)理学府 物理学専攻, 理学部 物理学科
自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
システム情報科学研究院 情報学部門
(併任)工学部 電気情報工学科, システム情報科学府 情報理工学専攻
情報通信 / 数理情報学、情報通信 / 情報セキュリティ、自然科学一般 / 応用数学、統計数学
数理学研究院 代数幾何部門
(併任)数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科
自然科学一般 / 代数学
基幹教育院 自然科学理論系部門
(併任)数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科
自然科学一般 / 代数学
基幹教育院 自然科学理論系部門
(併任)マス・フォア・イノベーション連係学府, 数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科
自然科学一般 / 基礎解析学、自然科学一般 / 代数学、自然科学一般 / 応用数学、統計数学
先導物質化学研究所 融合材料部門
(併任)総合理工学府 九州大学・アントワープ大学 総合理工学国際連携専攻, 総合理工学府 総合理工学専攻
ナノテク・材料 / ナノ構造物理、自然科学一般 / 半導体、光物性、原子物理、ナノテク・材料 / ナノマイクロシステム
マス・フォア・インダストリ研究所 基礎理論研究部門
(併任)マス・フォア・イノベーション連係学府, 数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科
自然科学一般 / 幾何学
工学研究院 附属環境工学研究教育センター
エネルギー / 地球資源工学、エネルギー学、自然科学一般 / 固体地球科学
数理学研究院 代数幾何部門
(併任)数理学府 数理学専攻, 理学部 数学科
自然科学一般 / 幾何学、自然科学一般 / 幾何学
応用力学研究所 地球環境力学部門
(併任)総合理工学府 総合理工学専攻
自然科学一般 / 大気水圏科学