Updated on 2024/10/07

Information

 

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KUSUMI JUNKO
 
Organization
Faculty of Social and Cultural Studies Department of Environmental Changes Professor
Graduate School of Integrated Sciences for Global Society Department of Integrated Sciences for Global Society(Joint Appointment)
School of Interdisciplinary Science and Innovation Department of Interdisciplinary Science and Innovation(Joint Appointment)
Title
Professor
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Profile
Evolutionary genetics (Molecular evolution/population genetics), focusing on the evolutionary changes at the molecular level
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Research Areas

  • Life Science / Evolutionary biology

Degree

  • Doctor of Science

Research History

  • 大学院比較社会文化研究院 環境変動部門 生物多様性講座 教授

    2023.5 - Present

      More details

    Country:Japan

    researchmap

  • Kyushu University Faculty of Social and Cultural Studies Associate Professor

    2010.10 - 2023.4

      More details

  • JT生命誌研究館 学術研究員

    JT生命誌研究館

    2008.4 - 2010.3

Research Interests・Research Keywords

  • Research theme:Co-evolution of the symbiosis system of hydras and their symbionts

    Keyword:hydra, green alga, symbiosis

    Research period: 2023.5

  • Research theme:A new model of molecular compensatory evolution

    Keyword:compensatory evolution population genetics

    Research period: 2013.4

  • Research theme:Co-evolution, Co-speciation of figs and figwasps

    Keyword:Population genetics, Molecular evolution, Molecular phylogeny, Evolution of mutualisms; plant insect interactions,

    Research period: 2008.4

  • Research theme:Population genetic analysis of a widespread coniferous tree Taxodium distichum [L.] Rich. in the Mississippi River Alluvial Valley and Florida

    Keyword:Taxodium distichum、genetic diversity, nucleotide polymorphism, microsatellite

    Research period: 2007.4 - 2022.3

Papers

  • Symbiont specificity differs among green hydra strains Reviewed

    Ryo Miyokawa, Maki Hanada, Yumiko Togawa, Taichi Q. Itoh, Yoshitaka Kobayakawa, Junko Kusumi

    Royal Society Open Science   9 ( 10 )   2022.10

     More details

    Language:Others   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1098/rsos.220789

  • Immature symbiotic system between horizontally transmitted green algae and brown hydra. Reviewed International journal

    Ryo Miyokawa, Hiroyuki J Kanaya, Taichi Q Itoh, Yoshitaka Kobayakawa, Junko Kusumi

    Scientific reports   11 ( 1 )   2921 - 2921   2021.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-021-82489-6

  • Effects of gene duplication, epistasis, recombination and gene conversion on the fixation time of compensatory mutations Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Motoshi Ichinose, Masaru Iizuka

    Journal of Theoretical Biology   467   134 - 141   2019.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.jtbi.2019.02.001

  • Inferring the demographic history of Japanese cedar, Cryptomeria japonica, using amplicon sequencing Reviewed International journal

    Natsuki Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Ryutaro Miyagi, Etsuko Moritsuka, Aya Takahashi, Koichiro Tamura, Yoshihiko Tsumura, Kosuke M. Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    Heredity   2019.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41437-019-0198-y

  • Inferences of population structure and demographic history for Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequencing analysis Reviewed International journal

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kosuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    American journal of Botany   103 ( 11 )   - 1937   2016.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3732/ajb.1600046

  • Evolutionary rate variation in two conifer species, Taxodium distichum (L.) Rich. var. distichum (baldcypress) and Cryptomeria japonica (Thunb. ex L.f.) D. Don (Sugi, Japanese cedar) Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Yoshihiko Tsumura, Hidenori Tachida

    Genes & Genetic Systems   90   305 - 315   2015.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: http://doi.org/10.1266/ggs.14-00079

  • Isolation and characterization of 15 polymorphic microsatellite markers for the fig-pollinating wasp, Blastophaga nipponica (Hymenoptera: Agaonidae) Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Zhi-Hui Su

    Applied Entomology and Zoology   2014.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s13355-014-0267-x

  • Models of compensatory molecular evolution: Effects of back mutation

    Motoshi Ichinose, Masaru Iizuka, Junko Kusumi, Masasuke Takefu

    JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY   323   2013.1

     More details

    Language:English  

    DOI: 10.1016/j.jtbi.2013.01.011

  • Population genetic structure of a widespread coniferous tree, Taxodium distichum [L.] Rich. (Cupressaceae), in the Mississippi River Alluvial Valley and Florida Reviewed International journal

    Ayako Tanaka & Masato Ohtani & Yoshihisa Suyama & Nobuyuki Inomata & Yoshihiko Tsumura & Beth A. Middleton & Hidenori Tachida & Junko Kusumi

    Tree Genetics & Genomes   2012.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Phylogenetic analyses suggest a hybrid origin of the figs (Moraceae: Ficus) that are endemic to the Ogasawara (Bonin) Islands, Japan Reviewed International journal

    Junko Kusumi; Hiroshi Azuma; Hsy-Yu Tzeng; Lien-Siang Chou; Yan-Qiong Peng; Keiko Nakamura; Zhi-Hui Su

    Molecular Phylogenetics and Evolution   63 ( 1 )   2012.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.bbr.2011.03.031

  • Multilocus patterns of nucleotide polymorphism and demographic change in Taxodium distichum (Cupressaceae) in the lower Mississippi River alluvial valley Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Zidong, Li, Tomoyuki Kado, Yoshihiko Tsumura, Beth A. Middleton and Hidenori Tachida

    American journal of botany   97 ( 11 )   2010.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3732/ajb.1000082

  • Relaxation of Functional Constraint on Light-Independent Protochlorophyllide Oxidoreductase in Thuja Reviewed International journal

    Molecular Biology and Evolution   23 ( 5 )   2006.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/molbev/msj097

  • Compositional properties of green-plant plastid genomes. Reviewed International journal

    Junko Kusumi and Hidenori Tachida

    Journal of Molecular evolution   60 ( 4 )   417 - 425   2005.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s00239-004-0086-8

  • Molecular evolution of nuclear genes in Cupressaceae, a group of conifer trees. Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Yoshihiko Tsumura, Hiroshi Yoshimaru and Hidenori Tachida

    Molecular biology and evolution   19 ( 5 )   736 - 747   2002.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Evidence for hybridization-driven heteroplasmy maintained across generations in a ricefish endemic to a Wallacean ancient lake Reviewed International journal

    Handung Nuryadi , Ixchel F. Mandagi , Kawilarang W. A. Masengi , Junko Kusumi , Nobuyuki Inomata and Kazunori Yamahira

    Biology letters   20 ( 3 )   2024.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1098/rsbl.2023.0385

  • Ghost introgression in ricefishes of the genus Adrianichthys in an ancient Wallacean lake Reviewed

    Kazunori Yamahira, Hirozumi Kobayashi, Ryo Kakioka, Javier Montenegro, Kawilarang W. A. Masengi, Noboru Okuda, Atsushi J. Nagano, Rieko Tanaka, Kiyoshi Naruse, Shoji Tatsumoto, Yasuhiro Go, Satoshi Ansai, Junko Kusumi

    Journal of Evolutionary Biology   2023.9

     More details

    Language:Others   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/jeb.14223

  • Multiple colonizations and hybridization of a freshwater fish group on a satellite island of Sulawesi Reviewed International journal

    Ixchel F. Mandagi, Bayu K. A. Sumarto, Handung Nuryadi, Daniel F. Mokodongan, Sjamsu A. Lawelle, Kawilarang W.A. Masengi, Atsushi J. Nagano, Ryo Kakioka, Jun Kitano, Satoshi Ansai, Junko Kusumi, Kazunori Yamahira

    Molecular Phylogenetics and Evolution   184   107804 - 107804   2023.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.ympev.2023.107804

  • Seasonal gene expression signatures of delayed fertilization in Fagaceae Reviewed International journal

    Molecular Ecology   32 ( 17 )   4801 - 4813   2023.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/mec.17079

  • Deeply divergent freshwater fish species within a single river system in central Sulawesi. Reviewed International journal

    Ilham V Utama, Ixchel F Mandagi, Sjamsu A Lawelle, Kawilarang W A Masengi, Keiichi Watanabe, Naomi Sawada, Atsushi J Nagano, Junko Kusumi, Kazunori Yamahira

    Molecular phylogenetics and evolution   173   107519 - 107519   2022.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.ympev.2022.107519

  • Pollinator sharing, copollination, and speciation by host shifting among six closely related dioecious fig species Reviewed

    Zhi-Hui Su, Ayako Sasaki, Junko Kusumi, Po-An Chou, Hsy-Yu Tzeng, Hong-Qing Li, Hui Yu

    Communications Biology   5 ( 1 )   2022.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s42003-022-03223-0

  • Discovery of a genetically distinct lineage in medaka species within Lake Towuti in central Sulawesi Reviewed

    Kazunori Yamahira, Daniel F. Mokodongan, Maki Konishi, Ixchel F. Mandagi, Kawilarang W. A. Masengi, Sjamsu A. Lawelle, Junko Kusumi, Nobuyuki Inomata

    ICHTHYOLOGICAL RESEARCH   2022.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s10228-021-00856-9

  • Species divergence and repeated ancient hybridization in a Sulawesian lake system Reviewed International journal

    Ixchel F. M, agi, Ryo Kakioka, Javier Montenegro, Hirozumi Kobayashi, Kawilarang W. A. Masengi, Nobuyuki Inomata, Atsushi J. Nagano, Atsushi Toyoda, Satoshi Ansai, Masatoshi Matsunami, Ryosuke Kimura, Jun Kitano, Junko Kusumi, Kazunori Yamahira

    Journal of Evolutionary Biology   34 ( 11 )   1767 - 1780   2021.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/jeb.13932

  • Copy number analyses of DNA repair genes reveal the role of poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) in tree longevity Reviewed International journal

    Yuta Aoyagi Blue, Junko Kusumi, Akiko Satake

    iScience   24 ( 7 )   102779 - 102779   2021.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.isci.2021.102779

  • Mitochondrial introgression by ancient admixture between two distant lacustrine fishes in Sulawesi Island Reviewed International journal

    Mizuki Horoiwa, Ixchel F. Mandagi, Nobu Sutra, Javier Montenegro, Fadly Y. Tantu, Kawilarang W. A. Masengi, Atsushi J. Nagano, Junko Kusumi, Nina Yasuda, Kazunori Yamahira

    PLOS ONE   16 ( 6 )   e0245316 - e0245316   2021.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0245316

  • Evaluating the genetic diversity in two tropical leguminous trees, Dalbergia cochinchinensis and D. nigrescens, in lowland forests in Cambodia and Thailand using MIG-seq. Reviewed

    Moeko Hirata, Chika Mitsuyuki, Etsuko Moritsuka, Phourin Chhang, Shuichiro Tagane, Hironori Toyama, Heng Sokh, Sukid Rueangruea, Somran Suddee, Yoshihisa Suyama, Tetsukazu Yahara, Kousuke M Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    Genes & genetic systems   96 ( 1 )   41 - 53   2021.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1266/ggs.20-00026

  • A sleep-like state in Hydra unravels conserved sleep mechanisms during the evolutionary development of the central nervous system Reviewed

    Hiroyuki J Kanaya, Sungeon Park, Ji-Hyung Kim, Junko Kusumi, Sofian Krenenou, Etsuko Sawatari, Aya Sato, Jongbin Lee, Hyunwoo Bang, Yoshitaka Kobayakawa, Chunghun Lim, Taichi Q Itoh

    Science Advances   6 ( 41 )   2020.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1126/sciadv.abb9415

  • Population genetic analysis of two species of Distylium D. racemosum growing in East Asian evergreen broad-leaved forests and D. lepidotum endemic to the Ogasawara (Bonin) Islands Reviewed

    Hitomi Yagi, Jie Xu, Natsuki Moriguchi, Ryutaro Miyagi, Etsuko Moritsuka, Eri Sato, Kyoko Sugai, Suzuki Setsuko, Takeshi Torimaru, Shin ichi Yamamoto, Aya Takahashi, Koichiro Tamura, Hidenori Tachida, Kosuke M. Teshima, Junko Kusumi

    Tree Genetics and Genomes   15 ( 6 )   2019.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s11295-019-1386-x

  • Evidence for sympatric speciation in a Wallacean ancient lake Reviewed

    Nobu Sutra, Junko Kusumi, Javier Montenegro, Hirozumi Kobayashi, Shingo Fujimoto, Kawilarang W.A. Masengi, Atsushi J. Nagano, Atsushi Toyoda, Masatoshi Matsunami, Ryosuke Kimura, Kazunori Yamahira

    Evolution   2019.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/evo.13821

  • Horizontal Transmission of Symbiotic Green Algae Between Hydra Strains Reviewed

    Ryo Miyokawa, Takuya Tsuda, Hiroyuki J. Kanaya, Junko Kusumi, Hidenori Tachida, Yoshitaka Kobayakawa

    Biological Bulletin   235 ( 2 )   113 - 122   2018.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1086/699705

  • Gall Inducers Arose from Inquilines Phylogenetic Position of a Gall-Inducing Species and Its Relatives in the Inquiline Tribe Synergini (Hymenoptera: Cynipidae) Reviewed

    @Tatsuya Ide, Junko Kusumi, @Kazuki Miura, Yoshihisa Abe

    Annals of the Entomological Society of America   111 ( 1 )   6 - 12   2018.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/aesa/sax065

  • The Effect of Two Amino acid Residue Substitutions via RNA Editing on Dark-operative Protochlorophyllide Oxidoreductase in the Black Pine Chloroplasts Reviewed

    @Haruki Yamamoto, Junko Kusumi, @Hisanori Yamakawa, @Yuichi Fujita

    Scientific Reports   7 ( 1 )   2017.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-017-02630-2

  • Evolutionary Origin of OwlRep, a Megasatellite DNA Associated with Adaptation of Owl Monkeys to Nocturnal Lifestyle Reviewed International journal

    @Hidenori Nishihara, @Roscoe Stanyon, Junko Kusumi, @Hirohisa Hirai, @Akihiko Koga

    Genome Biology and Evolution   10 ( 1 )   157 - 165   2017.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/gbe/evx281

  • Genome-wide sequence data suggest the possibility of pollinator sharing by host shift in dioecious figs (Moraceae, Ficus) Reviewed

    Nakatada Wachi, Junko Kusumi, Hsy-Yu Tzeng, Zhi-Hui Su

    MOLECULAR ECOLOGY   25 ( 22 )   5732 - 5746   2016.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1111/mec.13876

  • A model of compensatory molecular evolution involving multiple sites in RNA molecules Reviewed

    Junko Kusumi, Motoshi Ichinose, Masasuke Takefu, Robert Piskol, Wolfgang Stephan, Masaru Iizuka

    JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY   388   96 - 107   2016.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.jtbi.2015.10.008

  • Extremely low nucleotide polymorphism in Pinus krempfii Lecomte, a unique flat needle pine endemic to Vietnam Invited Reviewed International journal

    Baosheng Wang, Marjan Khalili Mahani, Wei Lun Ng, Junko Kusumi, Hai Hong Phi, Nobuyuki Inomata, Xiao-Ru Wang, ALFRED EDWARD SZMIDT

    Ecology and Evolution   2014.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/ece3.1091

  • Genetic Structure of Pelagic and Littoral Cichlid Fishes from Lake Victoria

    Miyuki Takeda, Junko Kusumi, Shinji Mizoiri, Mitsuto Aibara, Semvua Isa Mzighani, Tetsu Sato, Yohey Terai, Norihiro Okada, Hidenori Tachida

    PLOS ONE   8 ( 9 )   2013.9

     More details

    Language:English  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0074088

  • MULTILOCUS PATTERNS OF NUCLEOTIDE POLYMORPHISM AND DEMOGRAPHIC CHANGE IN TAXODIUM DISTICHUM (CUPRESSACEAE) IN THE LOWER MISSISSIPPI RIVER ALLUVIAL VALLEY Reviewed

    Junko Kusumi, Li Zidong, Tomoyuki Kado, Yoshihiko Tsumura, Beth A. Middleton, Hidenori Tachida

    AMERICAN JOURNAL OF BOTANY   97 ( 11 )   1848 - 1857   2010.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3732/ajb.1000082

  • The Tol1 transposable element of the medaka fish moves in human and mouse cells Reviewed International journal

    Akihiko Koga, Atsuko Shimada, Toshiya Kuroki, Hiroshi Hori, Junko Kusumi, Yoriko Kyono-Hamaguchi and Satoshi Hamaguchi

    Journal of Human genetics   52   2007.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1007/s10038-007-0161-2

  • Phylogenetic relationships in Taxodiaceae and Cupressaceae sensu stricto based on matK gene, chlL gene, trnL-trnF IGS region, and trnL intron sequences. Reviewed International journal

    Junko Kusumi, Yoshihiko Tsumura, Hiroshi Yoshimaru and Hidenori Tachida

    American Journal of Botany   87 ( 10 )   1480 - 1488   2000.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.2307/2656874

  • Characterization of a Nonsense Mutation in FAD7, the Gene Which Encodes ω-3 Desaturase in Arabidopsis thaliana Reviewed

    111 ( 1101 )   87 - 91   1998.3

     More details

    Language:English  

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Books

  • 集団生物学

    巌佐 庸, 舘田 英典, 矢原 徹一, 岩見 真吾, 粕谷 英一, 渡慶次 睦範, 荒谷 邦雄, 楠見 淳子, 細谷 忠嗣( Role: Joint author)

    共立出版  2015.7 

     More details

    Language:Japanese   Book type:Scholarly book

Presentations

  • 針葉樹ヌマスギ、スギの進化速度

    楠見 淳子, 舘田 英典

    日本遺伝学会第86回大会  2014.9 

     More details

    Event date: 2014.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:長浜バイオ大学   Country:Japan  

    針葉樹は巨大なゲノムサイズ、膨大な非コード領域の蓄積など被子植物とは異なるゲノムの特徴を有しており、植物の進化学的研究において興味深い材料である。本研究では、スギ、ヌマスギの189核遺伝子の非同義、同義置換率及びその比(ω)を推定した。同義置換を中立と仮定すると、ヌマスギ、スギそれぞれの年あたりの突然変異率は0.67×10-9/site/year、0.59×10-9/site/yearと推定された。これは草本性双子葉植物の1/25~1/15に相当する。また、ωの平均値はスギ、ヌマスギでそれぞれ0.106, 0.107となり、平均的には2種は同程度の制約のもとで進化していることが示唆された。

  • 小笠原固有イチジク属植物の起源

    浦志 知恵, 楠見 淳子, 蘇 智慧

    第16回日本進化学会年会  2014.8 

     More details

    Event date: 2014.8

    Language:Japanese  

    Venue:大阪府 高槻市   Country:Japan  

    イチジク属植物とイチジクコバチ類は互恵性の高い種特異的な相利共生関係にあり、共進化・共種分化しているといわれている。本研究では、小笠原固有のイチジク属植物3種 オオヤマイチジク(Ficus iidaiana)、 オオトキワイヌビワ(F. nishimurae)、トキワイヌビワ (F. boninsimae) の起源を明らかにすることを目的として、日本、台湾に分布する近縁種を含めた分子系統解析を行った。葉緑体DNAの解析では日本に分布するイヌビワ(F. erecta)が小笠原固有種3種に最も近縁であることが示されたが、核遺伝子ではイヌビワとオオトキワイヌビワ、トキワイヌビワは姉妹群を形成しなかった。4倍体種であるオオヤマイチジクでは、複数の遺伝子座でイヌビワに近縁な遺伝子と、他の小笠原固有種に近縁な遺伝子が同一個体のゲノム中に存在しており、雑種形成と倍数化を経て種形成されたことが示唆された。また、トキワイヌビワから採取されたイチジクコバチ (Blastophaga sp. ) の系統的位置について解析したところ、中国南西部、東南アジアに分布するコバチと近縁であることが示唆された。

  • A model of compensatory molecular evolution with indirect compensation Invited International conference

    Junko Kusumi, Motoshi Ichinose, Masasuke Takefu, Wolfgang Stephan, Masaru Iizuka

    SMBE Satellite Meeting / NIG International Symposium: The Causes of Genome Evolution  2014.3 

     More details

    Event date: 2014.3

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Inference of population structure in Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequence analysis International conference

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Junko Kusumi, Kosuke Teshima, Hidenori Tachida

    SMBE Satellite Meeting / NIG International Symposium: The Causes of Genome Evolution  2014.3 

     More details

    Event date: 2014.3

    Language:English  

    Country:Japan  

  • アンプリコンシークエンス解析による針葉樹ヌマスギの集団構造解析

    池崎 由佳, 手島 康介, 陶山 佳久, Beth A. Middleton, 津村 義彦, 舘田 英典, 楠見 淳子

    日本進化学会第18回大会  2016.8 

     More details

    Event date: 2013.9

    Language:Japanese  

    Venue:東京工業大学 (東京都目黒区)   Country:Japan  

    ヌマスギは沼や河川域に生息する湿地性針葉樹である。 ヌマスギの3変種のうちbald-cypressとpond-cypressは北アメリカ南東部において分布が重なっており、形態や生育環境に違いはあるものの遺伝的分化の程度は低いとされてきた。一方、bald-cypressは先行研究(SSR解析)によりミシシッピ川沿岸部とフロリダとの間で地域間分化が示唆されている。本研究では、2変種(bald-cypress, pond-cypress)を含む、3地域(Texas, Mississippi River, Florida)、12集団96個体を用い、48核遺伝子座の塩基配列多型から変種間、地域間分化の程度を推定した。STRUCTUREプログラムによる集団構造解析から、ヌマスギは3つの遺伝的グループ(Bald_Mississippi&Texas, Bald_Florida, Pond_Florida)に分かれることが示された。AMOVAを使い分化の程度を調べたところ、平均的には変種間が地域間よりも高い固定指数値(FCT)を示した。これは、変種間では5つの遺伝子座でFCTが0.2を超える値を持つことによる。また、分化に貢献する適応候補遺伝子を探すため、Arlequin及びBayescanプログラムを用いたFSTのoutlier検出を行ったところ、地域間・変種間でそれぞれ4つの候補遺伝子が検出された。

  • 次世代シーケンサーを用いた針葉樹ヌマスギの集団構造に関する多個体、多遺伝子座での解析

    池崎 由佳, 手島 康介, 陶山 佳久, Beth A. Middleton, 津村 義彦, 舘田 英典, 楠見 淳子

    日本遺伝学会第85回大会  2013.9 

     More details

    Event date: 2013.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:慶應義塾大学 日吉キャンパス   Country:Japan  

    ヌマスギは北米南東部に広く分布する針葉樹で、二種類の変種bald cypressとpond cypressが存在する。本研究ではミシシッピ川沿岸部、フロリダ、テキサスの2変種を含む12集団96個体を用い、48核遺伝子座の配列を次世代シーケンサー(454 GS FLX)により決定した。quality controlの結果から、総read数の76.3%のreadを用い、重複遺伝子と思われる遺伝子を除いた37遺伝子の解析を行った。その結果、平均π(total)の値は0.00427であった。固定指数(Fst)は、生育地域間で0.0391、変種間で0.0376であり共に分化の程度は低いことを示した。

  • クロマツPinus thunbergiiにおけるRNA編集による光環境に応答したプロトクロロフィリド還元酵素の活性調節

    山本 治樹, 楠見 淳子, 藤田 祐一

    日本植物生理学会  2013.3 

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    Event date: 2013.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山 岡山大学   Country:Japan  

    裸子植物の芽生えは、葉緑体DNAにコードされる暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素(DPOR)の活性により暗所においてもクロロフィルを合成し、緑化することができる。いくつかの裸子植物ではDPORのサブユニットをコードする遺伝子の1つchlBにおいてRNA編集による転写後修飾を受けることが報告されている。RNA編集による塩基置換を介したChlBのアミノ酸置換は、DPORの機能発現に重要な意味をもつと推察されているが、その実験的根拠は得られていない。本研究では、明所もしくは暗所で生育したクロマツPinus thunbergiiの実生における、DPORの3つのサブユニット遺伝子chlL, chlN, chlBの発現量、chlBのmRNAにおけるRNA編集の効率の解析を行った。その結果、暗所においてDPOR遺伝子の発現量、およびchlBのRNA編集効率が明所に比べ有意に高いことが確認された。また、RNA編集前のアミノ酸配列をもつ変異ChlBはDPORの触媒コンポーネントNB蛋白質(ChlNとChlBのヘテロ4量体)を形成しないことが明らかとなった。この結果は、RNA編集によるアミノ酸置換はNB蛋白質の形成を介し、DPORの活性を制御していることを示唆している。クロマツの実生では環境の光条件に応答したchlBのRNA編集の効率変化によりDPOR活性を制御し緑化を調節していると考えられる。

  • 北米産針葉樹ヌマスギ2 変種間の遺伝的分化に関する核遺伝子の塩基配列分析

    池崎由佳, 陶山 佳久, 津村 義彦, Beth A. Middleton, 舘田 英典, 楠見 淳子

    日本遺伝学会  2012.9 

     More details

    Event date: 2012.9 - 2013.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学 百年講堂   Country:Japan  

    SSRマーカーを用いた解析により、北米南東部に分布する針葉樹ヌマスギの2変種bald cypressとpond cypressの間の遺伝的分化の程度は低く、むしろ主要分布域であるミシシッピ川沿岸部とフロリダ地域の間に有意な分化が認められている。本研究では、両地域の2変種のサンプル(13集団、135個体)を用い、5核遺伝子座の配列を決定し解析した。その結果、AMT遺伝子座では変種間に高い固定指数(Fst)が検出された。AMTでのFst値が変種間の分化によるものかを検討するため中立モデルを使って検定したところ、観測値のP値は0.0495となり、AMT遺伝子が変種間分化に寄与している可能性が示唆された。

  • イヌビワ(Ficus erecta)と送粉コバチ(Blastophaga nipponica)の集団構造及び遺伝子流動の比較解析

    楠見 淳子, 蘇 智慧

    日本遺伝学会第84回大会  2012.9 

     More details

    Event date: 2012.9

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学   Country:Japan  

    イチジク属植物とイチジクコバチ類の送粉共生系は種特異性が高く、相互に依存した繁殖システムを持つ。従って、それぞれの分散や地域集団間の遺伝子流動の程度は互いに影響しあうことが予想される。本研究では、日本と台湾のイヌビワ、イヌビワコバチを用い、SSR多型及びオルガネラゲノムの塩基配列多型解析を行い、両者の遺伝的集団構造を比較した。SSRの解析では、イヌビワとイヌビワコバチの集団構造がほぼ一致しており、両者の2集団間のFstの値に有意な正の相関があることが示された。一方、ミトコンドリア塩基配列多型から推定されたイヌビワコバチの遺伝的分化のパターンは、SSR多型の結果とは一部矛盾する結果が得られた。

  • イチジク属植物、送粉コバチ、寄生コバチの種レベルでの遺伝的分化の比較

    楠見淳子・蘇智慧

    日本応用動物昆虫学会  2011.3 

     More details

    Event date: 2011.3

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 小笠原産イチジク属固有種の起源

    楠見淳子, 蘇智慧

    日本遺伝学会  2009.9 

     More details

    Event date: 2009.9

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:信州大学・松本   Country:Japan  

  • ミヤマクワガタ Lucanus maculifemoratus の分子系統解析

    三原康暉・荒谷邦雄・楠見淳子

    日本甲虫学会第12回大会  2022.12 

     More details

    Event date: 2023.12

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン開催   Country:Japan  

  • 日本産ナミモンコケシキスイCryptarcha strigataの形態および分子による分類学的再検討

    伊藤直哉・舘 卓司・楠見淳子・戸田守・荒谷邦雄

    日本甲虫学会第12回大会  2022.12 

     More details

    Event date: 2023.12

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン開催   Country:Japan  

  • ミヤマクワガタ Lucanus maculifemoratus の分子系統解析

    三原康暉・荒谷邦雄・楠見淳子

    日本甲虫学会第12回大会  2022.12 

     More details

    Event date: 2023.12

    Language:Japanese  

    Venue:オンライン開催   Country:Japan  

    researchmap

  • 日本産ナミモンコケシキスイ複合種群(甲虫目ケシキスイ科)の分類学的再検討

    #伊藤直哉、@小川浩太、@楠見淳子、@舘卓司、@荒谷邦雄

    日本昆虫学会第83回大会  2023.9 

     More details

    Event date: 2023.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:佐賀大学農学部   Country:Japan  

  • The genetic diversity and population structure of Cybister rugosus

    2023.9 

     More details

    Event date: 2023.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 分子・形態・交配実験に基づいた日本産ナミモンコケシキスイ種群(昆虫綱甲虫目ケシキスイ科)の分類学的再検討

    #伊藤 直哉,@小川 浩太,@楠見 淳子,@舘 卓司,@荒谷 邦雄

    日本動物学会第94回山形大会  2023.9 

     More details

    Event date: 2023.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:山形大学小白川キャンパス   Country:Japan  

  • 刺胞動物ヒドラと共生緑藻の細胞内共生における相互作用 Invited

    #御代川 涼, @伊藤 太一, @小早川 義尚, @楠見 淳子

    日本植物学会第85回大会  2021.9 

     More details

    Event date: 2022.9 - 2022.5

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:オンライン   Country:Japan  

  • 一年草・多年草・樹木間でDNA修復能力に違いがあるか?:DNA修復遺伝子コピー数比較による分析

    青柳 優太, 楠見 淳子, 佐竹 暁子

    第51回種生物学シンポジウム  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  • 九州南部から琉 球列島に分布するアカホシテ ントウ属 Chilocorus の分類学的再検討

    福田悠人, 細谷忠嗣, 楠見淳子, 荒谷邦雄

    日本甲虫学会第10回大会  2019.12 

     More details

    Event date: 2019.11 - 2019.12

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学 伊都キャンパス   Country:Japan  

  • Horizontal transmission of Chlorococcum causes morphological and gene expression changes in Hydra vulgaris 105 strain International conference

    MIYOKAWA, R., TSUDA, T., KANAYA, H. J., KUSUMI, J., TACHIDA, H., AND KOBAYAKAWA, Y.

    International Workshop "At the roots of bilaterian complexity: insights from early emerging metazoans"  2019.9 

     More details

    Event date: 2019.9

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Germany  

  • ブナ科植物における開花遺伝子の種間比較と発現分析

    澤崎 佑太, 御代川 涼, 北島 薫, 楠見 淳子, 佐竹 暁子

    日本生態学会第66回全国大会  2019.3 

     More details

    Event date: 2019.3

    Language:Japanese  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • 日本産オニクワガタ属の分類学的再検討

    WU YAJIAO, 荒谷邦雄, 細谷忠嗣, 楠見淳子

    甲虫学会第9回大会  2018.12 

     More details

    Event date: 2018.12

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  • イスノキ(Distylium racemosum)と近縁種シマイスノキ(D. lepidotum)の集団遺伝学的解析

    八木瞳, 許傑, 森口夏季, 宮城龍太郎, 森塚絵津子, 佐藤衣里, 須貝杏子, 鈴木節子, 西村尚之, 山本 進一, 高橋文, 田村浩一郎, 手島康介, 楠見淳子, 舘田英典

    日本遺伝学会  2018.9 

     More details

    Event date: 2018.9

    Language:Japanese  

    Venue:奈良先端科学技術大学院大学   Country:Japan  

  • ヒドラにおける共生クロロコッカムの水平伝播と遺伝子発現変動解析

    御代川 涼, 津田 卓也, 金谷 啓之, 楠見 淳子, 舘田 英典, 小早川 義尚

    日本動物学会第89回大会  2018.9 

     More details

    Event date: 2018.9

    Language:Japanese  

    Venue:北海道大学   Country:Japan  

  • グリーンヒドラとクロレラの共生関係の特異性.

    御代川 涼, 津田 卓也, 楠見 淳子, 舘田 英典, 小早川 義尚

    日本進化学会第20回大会  2018.8 

     More details

    Event date: 2018.8

    Language:Japanese  

    Venue:東京大学駒場キャンパス   Country:Japan  

  • 北部九州および周辺地域に分布するヒラタクワガタ二系統群の集団遺伝学的解析

    土肥聖知, 楠見淳子, 荒谷邦雄, 細谷忠嗣

    甲虫学会  2017.11 

     More details

    Event date: 2017.11

    Language:Japanese  

    Venue:ふじのくに地球環境史ミュージアム (静岡市)   Country:Japan  

    従来、北部九州には日本本土に分布する日本亜種 D.t.pilifer(以下ホンド系統群)が分布 していると考えられてきたが、ミトコンドリア DNA の CO 領域の解析から北部九州の一部 地域に対馬、壱岐、五島列島のそれぞれに分布する対馬亜種 D.t.castanicolor、壱岐亜種 D. t. tatsutai、五島列島亜種 D. t. karasuyamai に相当する個体群(以下ツシマ系統群)の一 部が侵入している可能性があることが示唆された。後者の 3 亜種は互いに形態が似ており、 分類学的問題も指摘されている。こうした現状にあって本研究では、北部九州におけるこれ ら二系統群間の遺伝子浸透の有無およびツシマ系統群の侵入状況を明らかにすることを目 的とし、遺伝的集団構造の解析を行った。その結果北部九州のヒラタクワガタを対象にした ミトコンドリア DNA の COI 領域を用いた解析では、ツシマ系統群とホンド系統群に分か れることがわかり、先行研究の結果と一致した。また核遺伝子のマイクロサテライト多型を 用いた帰属性解析では対馬、壱岐・五島列島、北部九州、南部九州の大きく 4 つのグルー プに分けられる可能性があることが示され、北部九州にはツシマ系統群のうち、地理的に近 い壱岐・五島列島亜種の個体群の一部が分布していると考えられた。

  • 東南アジアに生息するカブトガニ科2種の遺伝的集団構造

    野上 凌, 西田 伸, Yusli Wardianto, Handoko Adi Susanto, Ali Masher, Irfan Yulianto, Irzal Azhar, Ming Che Yang, 楠見 淳子

    日本遺伝学会  2017.9 

     More details

    Event date: 2017.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学   Country:Japan  

    東南アジアに生息するマルオカブトガニ(マルオ)とミナミカブトガニ(ミナミ)は、ほぼ同所的に生息し、類似した生息環境や生活環を持つ一方で、マルオはマングローブ林を産卵地として利用するなど種固有の生態的特徴を有する。これら2種について、6地域(マレー半島西岸・北、南スマトラ・西、東ジャワ・東カリマンタン)、計201個体を用い、mtDNA AT-rich領域および核ゲノムの非コード領域の塩基配列を決定した。その結果、マルオでは地域間に明瞭な遺伝的分化が示されたが、ミナミでは遺伝的分化は示されなかった。これら2種の集団構造の違いは、産卵地および分散能力の違いが強く影響している可能性が示唆された。

  • クロロコッカムとヒドラの水平伝播での共生関係構築における遺伝子発現解析

    御代川涼, 津田拓也, 楠見淳子, 舘田英典, 小早川義尚

    日本遺伝学会  2017.9 

     More details

    Event date: 2017.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学   Country:Japan  

    日本で普通に見られるHydra vulgarisというヒドラには、クロロコッカム属の緑藻と共生関係にある系統が存在し、ヒドラポリプ間で共生緑藻が水平伝播することが確認されている。水平伝播により共生関係を構築したヒドラは、体長が小さくなり、増殖率が大きくなる変化が起きる。
    本研究では、水平伝播における共生メカニズムを調べるために、“105”系統の共生緑藻を持っていない野生状態のヒドラと、水平伝播によって新たに共生体を獲得した105系統のヒドラ(105G系統)のRNA-seqを用いて、発現変動遺伝子の検出を行った。その結果、オプシン関連の遺伝子に発現変動が見られた。

  • 東南アジア熱帯低地林におけるマメ科樹木のMIG-seq法による集団遺伝学的解析

    平田萌子, 満行知花, Phourin Chhang, 田金秀一郎, 遠山弘法, 森塚絵津子, 楠見淳子, Heng Sokh, 矢原徹一, 陶山佳久, 手島康介, 舘田英典

    日本遺伝学会  2017.9 

     More details

    Event date: 2017.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学   Country:Japan  

    東南アジアの熱帯低地林に生育するマメ科樹木のDalbergia cochinchinensisとD. nigrescensの集団遺伝学的解析を行った。カンボジア及びタイの集団から合計97個体をサンプルし、MIG-seq法によりゲノム中の約800箇所の塩基配列を決定した。主成分分析の結果D. nigrescensのタイ集団はカンボジア集団から強く分化していること、カンボジア集団の集団内分化の程度はD. nigrescensよりD. cochinchinensisの方が高いことがわかった。なお塩基多様度は両種で同程度であったが、タンパク質翻訳領域10遺伝子座を用いた先行研究よりも高い値を示した。分布パターンの異なるこれら二種ではこのように遺伝的変異パターンが異なることを明らかにした。

  • Genetic variation of MHC genes in the Japanese finless porpoise (Neophocaena asiaeorientalis sunameri) International conference

    Mitsuhiro Aizu, Shin Nishida, Junko Kusumi, Yuko Tajima, Masao Amano, Motoi Yoshioka, Tadasu K. Yamada, Kunio Araya

    The 21th Biennial Conference on the Biology of Marine Mammals  2015.12 

     More details

    Event date: 2015.12

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:United States  

  • アンプリコンシークエンス解析による塩基配列多型データに基づく針葉樹スギ(Cryptomeria japonica)の集団構造の推定

    森口夏季, 内山憲太郎, 宮城竜太郎, 高橋 文, 田村浩一郎, 津村義彦, 手島 康介, 楠見 淳子, 舘田 英典

    日本遺伝学会第87回大会  2015.9 

     More details

    Event date: 2015.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)   Country:Japan  

    スギは日本列島に広く分布する針葉樹で、それぞれ日本海側と太平洋側に分布するウラスギ・オモテスギの2系統が存在する。これらは遺伝的に分化しており、系統内でも地理的な分化があることが示されている。本研究では、スギの2系統を含む4集団(鯵ヶ沢・美女平・下和田・屋久島)計96個体を用い、約140核遺伝子座の配列を次世代シーケンサーで決定した。このうち30遺伝子座は近縁種ヌマスギで既に多型解析が行われている。得られた60kbpの配列データから約2,000個の多型サイトを検出した。塩基多様度πtotalは全座位の平均で0.0036、集団分化の程度を表すFSTの平均は0.06であった。特に屋久島集団は他集団から分化している傾向にあった。

  • アンプリコンシークエンス解析による塩基配列多型データに基づく針葉樹スギ(Cryptomeria japonica)の集団構造の推定

    森口夏季, 内山憲太郎, 宮城竜太郎, 高橋 文, 田村浩一郎, 津村義彦, 手島 康介, 楠見 淳子, 舘田 英典

    日本遺伝学会第88回大会  2016.9 

     More details

    Event date: 2015.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:静岡県三島市   Country:Japan  

    スギは日本列島に広く分布する針葉樹であり、日本海側と太平洋側に分布するウラスギ・オモテスギの2変種が存在する。先行研究によりこれらの変種内には地理的な分化があることが示されている。本研究では、スギの2変種を含む4集団(鯵ヶ沢・美女平・下和田・屋久島)計96個体を用い、約140核遺伝子座の配列をIllumina MiSeqを用いて決定した。得られた60kbpの配列データから約2,000個の多型サイトを検出した。主成分分析では第一主成分で屋久島集団が他集団から分離し、屋久島集団の強い分化を示唆する先行研究の結果と一致した。また第三主成分ではウラスギとオモテスギが分離し、変種間の遺伝的分化を確認した。

  • 日本沿岸に生息するスナメリNeophocaena asiaeorientalis sunameri のMHC 遺伝子DRB 遺伝子座を中心とした多型解析

    會津光博, 西田 伸, 楠見 淳子, 田島 木綿子, 天野 雅男, 吉岡 基, 山田 格, 荒谷 邦雄

    日本生態学会第62回大会  2015.3 

     More details

    Event date: 2015.3

    Language:Japanese  

    Venue:鹿児島大学 郡元キャンパス   Country:Japan  

    スナメリは沿岸性の小型鯨類であり、日本沿岸個体群に関しては分布の不連続性や頭骨形態の差異、さらにmtDNA CR領域、マイクロサテライト解析により5つの地域個体群(仙台湾~東京湾、伊勢・三河湾、瀬戸内海~玄界灘、大村湾、有明海・橘湾)の存在が示唆されている。地域個体群の動態には地域固有の環境要因が関わっているため、保護管理ユニットを設定し、保全に向けた施策を考えていく上では機能的な遺伝子の解析が求められる。この点、免疫に関与するMHC遺伝子領域は非常に多型性に富み、その遺伝的多様性を把握することは、地域個体群の持続可能性を考える上で有用である。日本沿岸個体群のクラスⅡDQB遺伝子の解析では、大村湾と有明海•橘湾を除いた個体群間で有意な遺伝的分化と高い平均ヘテロ接合度が報告されている(Hayashi et al. 2006)。しかしながら、MHC遺伝子領域には多数の遺伝子が存在しており、その多様性の解明には複数の遺伝子の変異量の把握が求められる。そこで本研究では、クラスⅡDQB遺伝子に加え、クラスⅡDRB遺伝子の多型解析を行った。DRB遺伝子に関して88個体を解析した結果、5種類のアリルを識別し、非常に低い平均ヘテロ接合度(Ho=0.244)が検出された。一方でDQB遺伝子に関して86個体を解析した結果、8種類のアリルを識別し、高い平均へテロ接合度(Ho=0.669)が検出された。遺伝子間で検出された多型パターンの違いは、遺伝子間の淘汰圧の違い等を示唆すると考えられ、網羅的なMHC遺伝子の多型解析の必要性が示された。

  • タマバチ科におけるゴール形成能力の喪失と再獲得-分子系統学的アプローチ

    井手 竜也, 楠見 淳子, 三浦 一芸, 阿部 芳久

    日本昆虫学会第74回大会  2014.9 

     More details

    Event date: 2014.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:広島大学 教育学部   Country:Japan  

    1300種以上からなるタマバチ科の多くの種はゴール形成者であるが、約200種が所属するヤドカリタマバチ族は、自らゴールを形成せず他者が形成したゴールに寄生する同居者として、ゴール形成者から派生したとされている。本族は形態学的特徴に基づいて他の族と識別されてきたが、2011年にヤドカリタマバチ族の形態を有しながら、ゴール形成能力を有する種、アラカシミヤドカリタマバチが発見された。そこで本種の系統学的位置を検討するため、ミトコンドリアDNAのCOI、cytb領域および核DNAの28SrRNA領域の部分塩基配列に基づき系統解析を行った。その結果、本種がヤドカリタマバチ族のSynergusとSaphonecrusからなる1つのクレードに含まれることが支持され、本族において喪失したゴール形成能力が本種を含む系統において再獲得されたという可能性が示唆された。また、クヌギ、ウバメガシの堅果のゴールから発見された本族の未記載種2種が、アラカシミヤドカリタマバチの姉妹群として支持された。これにより、これら2種もゴール形成能力を有している可能性が高まった。

  • イチジク属植物とイチジクコバチの地域的分化 Invited

    蘇 智慧, 楠見 淳子

    昆虫DNA研究会  2014.5 

     More details

    Event date: 2014.5

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京大学本郷キャンパス   Country:Japan  

    イチジク属(Ficus:クワ科)植物は、熱帯を中心におよそ750種分布している。日本はイチジク属の分布域の北限にあたり、琉球列島を中心に16種が生息している。イチジク属植物は花嚢とよばれる袋状の閉じた花序をつけ、その内側に多数の花を咲かせる。送粉者であるイチジクコバチは、花嚢に入ったあと、授粉と同時に花に産卵し、ふ化した幼虫は子房を食べて成長する。次世代のコバチが花嚢内で羽化・交配し、雌成虫が花粉を持って他の花嚢へと移動することでライフサイクルを完成する。このようにイチジク属植物とイチジクコバチは、繁殖を互いに強く依存し合い、「1種対1種」という種特異性の高い絶対的共生関係を構築している。
    この「1種対1種」関係を維持しながら種分化するとしたら、同調した種分化や系統分化が起こることが予想される。これまでの分子系統学的解析の結果は、高次分類群間ではおおむねこの仮説を支持しているものの、種間レベルでは系統関係の不一致のほかに、植物の雑種形成や送粉コバチの隠蔽種など多くの不明瞭な点が指摘されている。本研究は東アジアに広く分布しているイヌビワ (Ficus erecta)とその送粉コバチであるイヌビワコバチ(Blastophaga nipponica) を対象に、分子系統解析と集団遺伝解析の手法を用いて、両者の種内の遺伝的多様性と地域的集団間の分化を調べ、種内における同調的分化を検証した。
    イヌビワとイヌビワコバチは、中国南部から台湾、琉球列島、日本列島の関東にかけて分布しており、済州島にも生息している。本研究は、日本の5地域(伊豆、関西、九州、沖縄、八重山)と台湾で材料の採集を行った。各植物個体の葉および花嚢を採集し、葉の一部からDNAを抽出した。イヌビワコバチは、植物1個体あたり、1~4個の花嚢から採取した。同じ親由来の個体が重複するのを避けるため、花嚢1つあたり1匹の雌を用いることとし、1個体ごとにDNAを抽出した。
    まず葉緑体DNA 6 領域(rps16イントロン、trnGイントロン、petBイントロン、trnLイントロン、trnL-trnFスペーサー、atpB-rbcLスペーサー)およそ 3500 塩基を用いて集団のハプロタイプの分布について解析を行った。その結果から、日本産のイヌビワは南方から北進して分布域を拡大し、本州に到達したあと、比較的短期間で広がったと考えられた。また、台湾産のイヌビワは日本産のものより多様性に富んでいること、両者の間にある程度分化が起きていることが判明した。
    イヌビワの葉緑体DNA塩基配列の種内変異が少ないため、より多型性の高いマイクロサテライトマーカー (9個) を用いて集団遺伝解析を行った。その結果、5つの遺伝的集団が確認され、それらは地域的集団と一致することが判明した。また、集団間の遺伝的分化の程度を示す統計量(FST)を計算したところ、地域集団間の遺伝的分化が有意にあることが示された。さらに、地域集団間のFSTとその地理的距離にも有意な相関が見られ、イヌビワの遺伝子流動(花粉や種子の移動)は地理的距離が大きいほど制限される度合いが強いことが考えられた。
    一方、イヌビワコバチの集団間の遺伝的分化程度を解析したところ、イヌビワと同様に集団間の遺伝的分化が起きていることがわかった。特に台湾集団と日本の集団との間では、遺伝的分化が高い。イヌビワとイヌビワコバチの集団の遺伝構成、集団間分化の程度を比較すると、イヌビワの方がより地域集団に分化しやすい傾向があることが示唆された。また、イヌビワとイヌビワコバチは集団間で互いに類似した遺伝的分化が起きており、相関も見られた。この結果から、イヌビワとイヌビワコバチの地域集団間の分化や遺伝子流動は相互に影響しあっている可能性があると考えられる。

  • アラカシミヤドカリタマバチ(膜翅目:タマバチ科)のゴール形成能力は再獲得されたものか-ミトコンドリアDNAによる本種の系統学的位置の推定

    井手 竜也, 楠見 淳子, 三浦一芸, 阿部 芳久

    第58回日本応用動物昆虫学会大会  2014.3 

     More details

    Event date: 2014.3

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:高知市 高知市文化プラザ「かるぽーと」   Country:Japan  

    タマバチ科の多くの種はゴールを形成するが、ヤドカリタマバチ族は自らゴールを作らず、他者が形成したゴールに住み込み寄生(同居)をおこなう。例外的に、アラカシミヤドカリタマバチSynergus itoensisはアラカシの堅果に自らゴールを形成する。野外調査によって、これと酷似したゴールがクヌギ、ウバメガシから発見され、それぞれから本族の未記載種が得られた。ゴールの特徴および他に形成者と思われる種の脱出が認められなかったことから、これらの種もゴール形成をおこなうことが予測された。アラカシミヤドカリタマバチの系統学的位置およびクヌギ、ウバメガシの未記載種2種との系統学的関係を推定するため、ミトコンドリアDNA(COI+cytb領域)の塩基配列(973bp)に基づき、ヨーロッパおよびアジアの種を含めた系統樹を構築した。その結果、アラカシミヤドカリタマバチはSynergusとSaphonecrusからなる1つのクレードに含まれた。このクレード内で、上記未記載種2種は本種と1つのクレードを形成した。本種によるゴール形成は住み込み寄生をおこなうヤドカリタマバチ族内で再獲得された性質である可能性が考えられた。ゴール形成をおこなうことが疑われた未記載種2種は本種と近縁であることが示唆された。また、得られたヤドカリタマバチ族の分子系統樹において、分布域や同居する寄主による明確なクレードは見られなかった。

  • DNA・形態情報に基づくオオクワガタ日本亜種(Dorcus hopei binodulosus)とその近縁タクサにおける保全単位検出の試み

    加藤 啓佑, 楠見 淳子, 細谷 忠嗣, 五箇 公一, 立田 晴記, 荒谷 邦雄

    日本甲虫学会  2013.12 

     More details

    Event date: 2013.12

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:愛知 豊橋市自然史博物館   Country:Japan  

    オオクワガタ日本亜種(Dorcus hopei binodulosus)およびその近縁タクサを対象に、マイクロサテライトマーカーによるDNA多型解析と幾何学的形態測定学的手法を用いて抽出した形態形質情報に基づいてオオクワガタ日本亜種およびその近縁タクサの分化の様相を把握することを試みた。

  • Genetic Population Structure of Finless Porpoise in Japanese Coastal Waters Invited International conference

    Mitsuhiro Aizu, Junko Kusumi, Shin Nishida, Yuko Tajima, Tadasu K. Yamada, Masao Amano, Kunio Araya

    International Whaling Comission  2013.6 

     More details

    Event date: 2013.6

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Korea, Republic of  

  • 母系・両系DNAマーカーを用いた日本沿岸に生息するスナメリの遺伝的集団構造の解明

    會津 光博, 西田 伸, 楠見 淳子, 田島 木綿子, 山田 格, 天野 雅男, 荒谷 邦雄

    日本生態学会  2013.3 

     More details

    Event date: 2013.3

    Language:Japanese  

    Venue:静岡 静岡県コンベンションアーツセンター   Country:Japan  

    スナメリNeophocaena phocaenoidesは沿岸性の小型鯨類であり、日本沿岸個体群に関しては、分布の不連続性、頭骨形態の差異、および
    mtDNAコントロール領域(345bp)の解析により少なくとも5つの地域集団(仙台湾~東京湾、伊勢・三河湾、瀬戸内海~玄界灘、大村湾、有明海~橘湾)の存在が示唆されている。本研究では両系遺伝するマイクロサテライトDNA(MS-DNA)10座位と、mtDNAコントロール領域のより長い配列(853bp)を用いた解析を行うことで、雌雄の遺伝情報に基づいた日本沿岸個体群の遺伝的構造の解明とその形成史の解明を目指した。

  • マイクロサテライト(SSR)マーカーによるオオクワガタ日本集団Dorcus hopei binodulosus とその近縁タクサに関する遺伝的解析

    加藤啓佑・楠見淳子・細谷忠嗣・荒谷邦雄

    日本昆虫学会 第72回大会  2012.9 

     More details

    Event date: 2012.9 - 2012.10

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:玉川大学(町田市)   Country:Japan  

    オオクワガタ日本集団は人為的影響による野外個体群の減少に加え、逸出した外国産近縁タクサとの交雑による遺伝子浸透も懸念されている。こうした現状にあって、日本集団を含む近縁タクサ間を識別する遺伝的指標の確立や、各タクサ内の遺伝的分化の様相の把握、保全のための進化的重要単位(ESU)の検出は重要な課題である。しかし、既往のミトコンドリアDNA解析の結果では、タクサ間の識別が不明瞭な上に(五箇, 2004)、母系マーカーであるため交雑の検証も不確実であった。そこで本研究では多型性が高く、両系で交雑の検出にも応用しうるSSRマーカーを新規に7座位開発し、日本集団を含むD. hopeiと近縁なD. grandisの2種全5亜種を解析した。その結果、5つの遺伝的グループの存在が示唆され、これらはD. h. binodulosus (日本)、D. h. binodu- losus (北朝鮮・中国北部)、D. h. hopei (中国)、D. g. formosanus (台湾)、D. g. grandis+D. g. moriyai (ベトナム~インド)に対応した。SSRマーカーによる解析結果は従来不明瞭だったタクサ間の識別に加え、同亜種とみなされている日本と北朝鮮・中国北部の集団は区別可能で、日本集団がESUとして位置づけられることを示唆している。

  • マイクロサテライトマーカーによるトラフグ属魚類の種判別

    豊田 晋司, 楠見 淳子, 小早川みどり, 望岡 典隆

    日本水産学会秋季大会  2012.9 

     More details

    Event date: 2012.9

    Language:Japanese  

    Venue:独立行政法人水産大学校(下関市)   Country:Japan  

  • RNA editingによる暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素の活性調節

    山本治樹, 楠見淳子, 藤田祐一

    日本植物生理学会  2012.3 

     More details

    Event date: 2012.3

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都産業大学   Country:Japan  

    クロロフィル(Chl)生合成系には進化的起源の異なる2つのプロトクロロフィリド還元酵素が存在し、このうち暗所作動型酵素(DPOR)が暗所でのChl生合成能を決定づけている。DPORはL-蛋白質(ChlL)とNB-蛋白質(ChlN-ChlB)という各々ニトロゲナーゼのFe-蛋白質とMoFe-蛋白質と類似した2つのコンポーネントから構成される。被子植物を除く真核光合成生物においてDPORは葉緑体DNAにコードされ、クロマツやカラマツなどの針葉樹ではchlNとchlBがmRNAの段階でRNA editingによってアミノ酸置換を伴う塩基置換が導入される。本研究では、ラン藻Leptolyngbya boryanaのDPORを用いてRNA-editingによるアミノ酸置換の影響を検討した。L. boryanaのchlB欠損株においてediting前と後のそれぞれのアミノ酸配列を持つNB-蛋白質を発現させ、暗所で生育させた細胞のChl含量によりDPOR活性を評価した。その結果、editing後のNB-蛋白質を発現する形質転換体においてのみ有意にChl含量が増加した。さらにラン藻粗抽出液での活性測定もこの結果を支持していた。これらの結果は暗所における緑化がRNA editingによるNB-蛋白質の活性調節を介して制御されていることを示唆している。

  • マイクロサテライトマーカー解析によるトラフグ属魚類の種同定

    豊田 晋司, 楠見 淳子, 小早川みどり, 望岡 典隆

    日本水産学会  2013.3 

     More details

    Event date: 2012.3

    Language:Japanese  

    Venue:東京 東京海洋大学   Country:Japan  

  • 日本産オオクワガタ Dorcus hopei binodulosus (鞘翅目:クワガタムシ科)とその近縁タクサにおけるマイクロサテライトマーカーの開発

    加藤啓佑・楠見淳子・細谷忠嗣・荒谷邦雄

    昆虫学会九州支部大会  2011.12 

     More details

    Event date: 2011.12

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:鹿児島大学   Country:Japan  

    日本産オオクワガタDorcus hopei binodulosusは北海道南部から九州・対馬の主として里山に分布しているが、人為的影響のため各地で野外個体群の減少が著しい。一方、飼育・流通個体の数は極めて多く、入手も容易であるため、すでに国内他地域産や近縁タクサの飼育個体の逸出・放虫が生じており、交雑による遺伝子浸透も懸念されている。こうした現状にあって、日本産オオクワガタの遺伝的多様性や地域個体群間の遺伝的分化の様相を把握し、保全のための進化的重要単位を検出することは極めて重要な課題である。しかし、本種に関しては一般的に他種では有効なミトコンドリアDNAのCOI・II領域には遺伝的変異が少なく地域性が検出できないことが示唆されている(五箇, 2004)。そこで、本研究では塩基の反復配列数の違いを利用した遺伝マーカーであり、多型性が高い上、両系マーカーであるため交雑の検出にも応用しうるマイクロサテライトマーカーを用いた解析を試みた。残念なことに、クワガタムシ科ではマイクロサテライトに関する既往の研究例がなく、新たなマーカーの開発を進める必要があった。マーカーの開発にはdual-Suppression PCR法を用い、1次スクリーニングの結果、6カ所のマイクロサテライトが見つかり、このうち2座位でマーカーとして利用できうる多型が認められた。これらのマーカーを用い、日本産オオクワガタ、中国産オオクワガタD.h.hopei、グランディスオオクワガタD.grandis (2亜種)の2種4亜種で解析を行ったところ、指標となりうる多型が見つかった。

  • 葉緑体にコードされる暗所作動型プロトクロロフィリド還元酵素のRNA editingによる活性制御

    山本治樹, 楠見淳子, 久留宮祥平, 大橋理恵, 藤田祐一

    日本植物生理学会  2011.3 

     More details

    Event date: 2011.3

    Language:Others   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東北大学 仙台市   Country:Japan  

  • 刺胞動物ヒドラの時計と睡眠

    金谷啓之, PARK Sungeon, KIM Ji-hyung, 楠見淳子, KRENENOU Sofian, 猿渡悦子, 佐藤文, LEE Jongbin, BANG Hyunwoo, 小早川義尚, LIM Chunghun, 伊藤太一

    時間生物学  2020.9 

     More details

    Language:Others  

    Country:Japan  

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MISC

  • 緑藻はどのようにヒドラと共生してきたか Reviewed

    御代川 涼, 小早川 義尚, 濱田 麻友子, 楠見 淳子

    2022.3

     More details

    Language:Japanese  

    Repository Public URL: https://hdl.handle.net/2324/7174468

  • 東南アジア熱帯低地林におけるマメ科樹木のMIG‐seq法による集団遺伝学的解析

    平田萌子, 満行知佳, CHHANG Phourin, 田金秀一郎, 遠山弘法, 森塚絵津子, 楠見淳子, SOKH Heng, 矢原徹一, 陶山佳久, 手島康介, 舘田英典

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   2017.8

     More details

    Language:Japanese  

  • Analysis of population structure of Cryptomeria japonica based on amplicon sequenced data

    Natsuki Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Ryutaro Miyagi, Aya Takahashi, Koichiro Tamura, Yoshihiko Tsumura, Kosuke M. Teshima, Junko Kusumi, Tachida Hidenori

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2016.12

     More details

    Language:English  

  • Analysis of population structure of Cryptomeria japonica based on amplicon sequenced data Reviewed

    Natsuki Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Ryutaro Miyagi, Aya Takahashi, Koichiro Tamura, Yoshihiko Tsumura, Kosuke Teshima, Junko Kusumi, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2015.12

     More details

    Language:English  

  • Inference of the history and population structure of Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequence analysis Reviewed

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kousuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2014.12

     More details

    Language:English  

  • Evolutionary rate in conifers (Cupressaceae) Reviewed

    Junko Kusumi, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2014.12

     More details

    Language:English  

  • Inference of population structure of Taxodium distichum, a coniferous tree in North America, based on amplicon sequence analysis Reviewed

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Kousuke Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2013.12

     More details

    Language:English  

  • The analysis of variety-specific genetic differentiation of Taxodium distichum: a coniferous tree on North America Reviewed

    Yuka Ikezaki, Yoshihisa Suyama, Beth A. Middleton, Yoshihiko Tsumura, Hidenori Tachida, Junko Kusumi

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2012.12

     More details

    Language:English  

  • Comparative population structure and gene flow of Ficus erecta and its pollinating fig-wasp (Blastophaga nipponica) Reviewed

    Junko Kusumi, Su Zhi-Hui

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2012.12

     More details

    Language:English  

  • The origin of fig species endemic to the Bonin Islands Reviewed

    Junko Kusumi, Zhi-Hui Su

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2009.12

     More details

    Language:English  

  • Population genetic structure of the widespread coniferous tree Taxodium distichum in the Mississippi River Alluvial Valley and the Florida Peninsula Reviewed

    Ayako Tanaka, Masato Ohtani, Junko Kusumi, Nobuyuki Inomata, Yoshihiko Tsumura, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2009.12

     More details

    Language:English  

  • Multilocus patterns of nucleotide polymorphism and past population structure in Taxodium distichum Reviewed

    Li Zidong, Junko Kusumi, Tomoyuki Kado, Yoshihiko Tsumura, A. Beth Middleton, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2007.12

     More details

    Language:English  

  • Diversifying selection in a resistance gene family of Cryptomeria japonica Reviewed

    Sayaka Mansai, Miho Tamura, Manami Sasaki, Norihiro Futamura, Kenji Shinohara, Yoshihik Tsumura, Junko Kusumi, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2007.12

     More details

    Language:English  

  • Population genetic analysis of a conifer, Taxodium distichum Reviewed

    Li Zidong, Tomoyuki Kado, Junko Kusumi, Yoshihiko Tsumura, Hidenori Tachida

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2006.12

     More details

    Language:English  

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Professional Memberships

  • Society for Molecular Biology &Evolution

  • THE GENETICS SOCIETY OF JAPAN

      More details

  • SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN

      More details

Committee Memberships

  • Councilor   Domestic

    2015.4 - 2016.12   

Academic Activities

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2023

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:3

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2022

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:2

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2021

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:2

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2020

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:5

  • Genes & Genetic Systems International contribution

    2019.11 - 2025.3

     More details

    Type:Academic society, research group, etc. 

  • 世話人

    第18回遺伝学談話会  ( 九州大学伊都キャンパス ) 2019.10

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

    Number of participants:40

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2019

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:5

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2018

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:3

  • 座長(Chairmanship)

    日本遺伝学会  ( 九州大学 ) 2012.9

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

  • プログラム委員

    日本遺伝学会  ( 九州大学 ) 2012.9

     More details

    Type:Competition, symposium, etc. 

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Research Projects

  • Evolution of symbiotic systems between hydra and green algae

    Grant number:24K09560  2024.4 - 2028.3

    Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

      More details

    Grant type:Scientific research funding

    CiNii Research

  • 神経細胞を完全に喪失した「寝たきりヒドラ」は眠るのか?

    Grant number:22K19313  2022 - 2024

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • 脳を持たないヒドラで探る眠りの起源と変遷

    2021.4 - 2025.3

    九州大学(日本) 

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

  • 流域圏生態系におけるヒトと自然の共生

    Grant number:21H05181  2021 - 2025

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  学術変革領域研究(A)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • 脳を持たないヒドラで探る眠りの起源と変遷

    Grant number:21H02527  2021 - 2024

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • microRNAとそのターゲット遺伝子間に生じる補償的進化の検証

    Grant number:19K06789  2019 - 2024

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • スラウェシ島産メダカ類の多様化・種分化の遺伝的基盤の解明

    2018.4

      More details

    Authorship:Collaborating Investigator(s) (not designated on Grant-in-Aid) 

  • 刺胞動物と緑藻との共生の起源・共進化過程の解明

    Grant number:16K07465  2016 - 2018

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • 湿地性針葉樹ヌマスギの水環境適応を担う遺伝子基盤の解明

    Grant number:16K07466  2016 - 2018

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 国内外来種の見えない脅威の可視化とリスク管理―ペット昆虫問題の拡大防止に向けて

    Grant number:26430205  2014 - 2016

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Grant type:Scientific research funding

  • アンプリコンシークエンス解析を用いた樹木集団進化に関する集団遺伝学的研究

    Grant number:26291082  2014 - 2016

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • 非モデル生物を用いた異質倍数体形成を介した植物の種分化の分子機構解明

    Grant number:25650129  2013 - 2015

    科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • RAD-seq法による異質倍数体種のゲノムワイドな多型解析

    2013

    九州大学教育研究プログラム・研究拠点形成プロジェクト

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:On-campus funds, funds, etc.

  • 最終氷期以降の分布拡大に伴う森林樹木の遺伝的適応に関する集団遺伝学的研究

    Grant number:22370083  2010 - 2012

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

      More details

    Grant type:Scientific research funding

  • 欠失変異体の適応度データに基づく遺伝子欠失の進化過程の解析

    2007 - 2009

    日本学術振興会  特別研究員

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Joint research

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Class subject

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅳ

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • Comprehensive Science of Biological Environment D

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • 包括的生物環境科学D

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅳ Ⅷ

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • 生命の科学B

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅷ

    2023.12 - 2024.2   Winter quarter

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) Ⅱ Ⅳ

    2023.10 - 2024.3   Second semester

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…Ⅱ Ⅳ

    2023.10 - 2024.3   Second semester

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅲ

    2023.10 - 2023.12   Fall quarter

  • 生命の科学B

    2023.10 - 2023.12   Fall quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅶ

    2023.10 - 2023.12   Fall quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅱ

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性 Ⅲ、Ⅶ)

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅱ Ⅵ

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 基幹教育セミナー

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 保全遺伝学

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 基幹教育セミナー

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅵ

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) Ⅰ Ⅲ

    2023.4 - 2023.9   First semester

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…Ⅰ Ⅲ

    2023.4 - 2023.9   First semester

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅰ

    2023.4 - 2023.6   Spring quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅴ

    2023.4 - 2023.6   Spring quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅰ Ⅴ

    2023.4 - 2023.6   Spring quarter

  • 生命の科学B

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅳ

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅳ

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅷ

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅷ

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • Comprehensive Science of Biological Environment D

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • 包括的生物環境科学D

    2022.12 - 2023.2   Winter quarter

  • 生命の科学B

    2022.10 - 2022.12   Fall quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅲ

    2022.10 - 2022.12   Fall quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅲ

    2022.10 - 2022.12   Fall quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅶ

    2022.10 - 2022.12   Fall quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅶ

    2022.10 - 2022.12   Fall quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅵ

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • Comprehensive Science of Biological Environment C

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 保全遺伝学

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 基幹教育セミナー

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅱ

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅱ

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅵ

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…Ⅲ

    2022.4 - 2022.9   First semester

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) Ⅰ

    2022.4 - 2022.9   First semester

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) Ⅲ

    2022.4 - 2022.9   First semester

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…Ⅰ

    2022.4 - 2022.9   First semester

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅴ

    2022.4 - 2022.6   Spring quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅰ

    2022.4 - 2022.6   Spring quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅰ

    2022.4 - 2022.6   Spring quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅴ

    2022.4 - 2022.6   Spring quarter

  • 包括的生物環境科学D

    2021.12 - 2022.2   Winter quarter

  • 生命の科学B

    2021.12 - 2022.2   Winter quarter

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)II,IV

    2021.10 - 2022.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)II IV

    2021.10 - 2022.3   Second semester

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) II,IV

    2021.10 - 2022.3   Second semester

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…II,IV

    2021.10 - 2022.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2021.10 - 2021.12   Fall quarter

  • 基幹教育セミナー

    2021.6 - 2021.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2021.6 - 2021.8   Summer quarter

  • 保全遺伝学

    2021.6 - 2021.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)Ⅰ,III

    2021.4 - 2021.9   First semester

  • 総合演習(包括的生物環境科学コース) Ⅰ,III

    2021.4 - 2021.9   First semester

  • Integrated Seminar(Comprehensive Science of Bio…Ⅰ,III

    2021.4 - 2021.9   First semester

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅰ,III

    2021.4 - 2021.9   First semester

  • Biodiversity Science A(Plant Diversity)Ⅰ

    2021.4 - 2021.6   Spring quarter

  • 生命の科学B

    2020.12 - 2021.2   Winter quarter

  • 包括的生物環境科学D

    2020.12 - 2021.2   Winter quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2020.10 - 2021.3   Second semester

  • 総合演習 包括的生物環境科学 II IV

    2020.10 - 2021.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2020.10 - 2020.12   Fall quarter

  • 基幹教育 セミナー

    2020.6 - 2020.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2020.6 - 2020.8   Summer quarter

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2020.4 - 2020.9   First semester

  • 総合演習 包括的生物環境科学 I III

    2020.4 - 2020.9   First semester

  • 包括的生物環境科学D

    2019.12 - 2020.2   Winter quarter

  • 生命の科学B

    2019.12 - 2020.2   Winter quarter

  • 総合演習 II IV

    2019.10 - 2020.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2019.10 - 2020.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2019.10 - 2019.12   Fall quarter

  • 基幹教育 セミナー

    2019.6 - 2019.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2019.6 - 2019.8   Summer quarter

  • 総合演習 I III

    2019.4 - 2019.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2019.4 - 2019.9   First semester

  • 包括的生物環境科学D

    2018.12 - 2019.2   Winter quarter

  • 生命の科学B

    2018.12 - 2019.2   Winter quarter

  • 総合演習 II IV

    2018.10 - 2019.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2018.10 - 2019.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2018.10 - 2018.12   Fall quarter

  • 基幹教育 セミナー

    2018.6 - 2018.8   Summer quarter

  • 包括的生物環境科学C

    2018.6 - 2018.8   Summer quarter

  • 総合演習 I III

    2018.4 - 2018.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2018.4 - 2018.9   First semester

  • 生命の科学B

    2017.10 - 2018.3   Second semester

  • Integrated Sciences for Global Society

    2017.10 - 2018.3   Second semester

  • 総合演習 II IV

    2017.10 - 2018.3   Second semester

  • 包括的生物環境科学D

    2017.10 - 2018.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2017.10 - 2018.3   Second semester

  • 包括的生物環境科学C

    2017.4 - 2017.9   First semester

  • 地球社会統合科学

    2017.4 - 2017.9   First semester

  • 基幹教育 セミナー

    2017.4 - 2017.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2017.4 - 2017.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2017.4 - 2017.9   First semester

  • 総合演習 II IV

    2016.10 - 2017.3   Second semester

  • Integrated Sciences for Global Society

    2016.10 - 2017.3   Second semester

  • 包括的生物環境科学C

    2016.10 - 2017.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2016.10 - 2017.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2016.10 - 2017.3   Second semester

  • 基幹教育 セミナー

    2016.4 - 2016.9   First semester

  • 地球社会統合科学

    2016.4 - 2016.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2016.4 - 2016.9   First semester

  • 包括的生物環境科学A

    2016.4 - 2016.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2016.4 - 2016.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2015.10 - 2016.3   Second semester

  • 総合演習 II IV

    2015.10 - 2016.3   Second semester

  • 自然科学総合実験

    2015.10 - 2016.3   Second semester

  • 包括的生物環境科学C

    2015.10 - 2016.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2015.4 - 2015.9   First semester

  • 包括的生物環境科学A

    2015.4 - 2015.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2015.4 - 2015.9   First semester

  • 基幹教育 セミナー

    2015.4 - 2015.9   First semester

  • 自然科学総合実験

    2014.10 - 2015.3   Second semester

  • 総合演習 II IV

    2014.10 - 2015.3   Second semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  II IV

    2014.10 - 2015.3   Second semester

  • 生命の科学B

    2014.10 - 2015.3   Second semester

  • 自然科学総合実験

    2014.4 - 2014.9   First semester

  • 包括的生物環境科学

    2014.4 - 2014.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2014.4 - 2014.9   First semester

  • 生物多様性科学 A(植物の多様性)  I III

    2014.4 - 2014.9   First semester

  • 自然科学総合実験

    2013.10 - 2014.3   Second semester

  • 総合演習 II IV

    2013.10 - 2014.3   Second semester

  • 自然資料学(生物資料解析論) II IV

    2013.10 - 2014.3   Second semester

  • 調査研究方法論

    2013.4 - 2014.3   Full year

  • 集団生物学

    2013.4 - 2013.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2013.4 - 2013.9   First semester

  • 自然資料学(生物資料解析論) I III

    2013.4 - 2013.9   First semester

  • 総合演習 II IV

    2012.10 - 2013.3   Second semester

  • 自然科学総合実験

    2012.10 - 2013.3   Second semester

  • 調査研究方法論

    2012.4 - 2013.3   Full year

  • 集団生物学

    2012.4 - 2012.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2012.4 - 2012.9   First semester

  • 自然資料学(生物資料解析論) I III

    2012.4 - 2012.9   First semester

  • 自然科学総合実験

    2011.10 - 2012.3   Second semester

  • 総合演習 II IV

    2011.10 - 2012.3   Second semester

  • 自然資料学(生物資料解析論)II IV

    2011.10 - 2012.3   Second semester

  • 調査研究方法論

    2011.4 - 2012.3   Full year

  • 集団生物学

    2011.4 - 2011.9   First semester

  • 総合演習 I III

    2011.4 - 2011.9   First semester

  • 自然資料学(生物資料解析論) I III

    2011.4 - 2011.9   First semester

  • 自然資料学(生物資料解析論)

    2010.10 - 2011.3   Second semester

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FD Participation

  • 2023.5   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2023.3   Role:Participation   Title:令和4年度の授業評価結果、学習到達度評価の結果について

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2022.5   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2022.3   Role:Participation   Title:令和3年度の授業評価結果、学習到達度評価の結果について

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2021.5   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2021.4   Role:Participation   Title:修士課程の入試について:オンライン入試の導入に関する意見交換会

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2021.3   Role:Participation   Title:九州大学オンライン授業のグッドプラクティス 〜 リアルタイム型授業編〜

    Organizer:University-wide

  • 2021.3   Role:Participation   Title:大学院学際教育の質向上に関するFD

    Organizer:University-wide

  • 2020.8   Role:Participation   Title:PBL型の「地球社会統合科学」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2020.6   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2020.1   Role:Participation   Title:共通科目『地球社会統合科学』の展開

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.11   Role:Participation   Title:「安全保障輸出管理の概要と電子申請システムによる手続きについて」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.11   Role:Participation   Title:安全保障輸出管理の概要と電子申請システムによる手続きについて

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.10   Role:Participation   Title:ハラスメントの基礎知識と予防・対応について−九州大学におけるハラスメント対策−

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.10   Role:Participation   Title:「ハラスメントの基礎知識と予防・対応について−九州大学におけるハラスメント対策−」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.9   Role:Participation   Title:ジャーナルをめぐる現状と研究倫理に関するFD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.9   Role:Participation   Title:ジャーナルをめぐる現状と研究倫理に関するFD・SD —盗用・剽窃、ハゲタカジャーナルなどへの注意喚起—」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.4   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2019.3   Role:Participation   Title:M2B学習支援システム講習会

    Organizer:University-wide

  • 2019.1   Role:Participation   Title:クロスロードとPBLで鍛える「描く力」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2018.7   Role:Participation   Title:クロスロードによる震災研究から——大学院学際PBL科目の開発に向けて

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2018.4   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2018.3   Role:Participation   Title:地球社会統合科学府FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2017.12   Role:Participation   Title:PBL/TBL セミナー「PBL と TBL の両者を活かす」

    Organizer:University-wide

  • 2017.10   Role:Participation   Title:TBL入門セミナー

    Organizer:University-wide

  • 2017.1   Role:Participation   Title:フィールド調査における安全対策とリスク管理

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.12   Role:Participation   Title:「英語による教授能力」向上のための研修

    Organizer:University-wide

  • 2016.9   Role:Participation   Title:新学部対応FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.5   Role:Participation   Title:統合的学際教育の実践に向けて——第1回FD 越境問題を多角的に考える

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.3   Role:Participation   Title:授業評価に基づく教育改善FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.3   Role:Participation   Title:ハラスメント防止のためのFD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.3   Role:Participation   Title:基幹教育セミナーFD

    Organizer:University-wide

  • 2016.2   Role:Participation   Title:大介護時代の働き方〜ワーク・ライフバランス〜

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2015.3   Role:Participation   Title:地球社会統合科学府カリキュラムFD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2014.8   Role:Participation   Title:新GPA制度実施のためのFD

    Organizer:University-wide

  • 2014.3   Role:Participation   Title:新学府科目実施FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2012.8   Role:Participation   Title:大学院生の修学および指導上の問題についてー学生相談の経験からー

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2012.3   Role:Participation   Title:平成23年度 第4回 全学FD

    Organizer:University-wide

  • 2011.4   Role:Participation   Title:平成23年度第1回全学FD(新任教員研修)

    Organizer:University-wide

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Visiting, concurrent, or part-time lecturers at other universities, institutions, etc.

  • 2019  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:夏学期、月曜1、2限

  • 2018  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:夏学期、月曜1、2限

  • 2017  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:前期、水曜2限

  • 2016  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:前期、水曜2限

  • 2015  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:前期、水曜2限

  • 2014  福岡女子大学  Classification:Part-time lecturer  Domestic/International Classification:Japan 

    Semester, Day Time or Duration:前期、水曜2限

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Social Activities

  • ニュートンコース 『私たちの遺伝子』(小中学生向け講義)

    福岡市科学館  福岡市科学館  2022.12

     More details

    Audience: General, Scientific, Company, Civic organization, Governmental agency

    Type:Seminar, workshop

Travel Abroad

  • 2014.3

    Staying countory name 1:Taiwan, Province of China   Staying institution name 1:国立中興大学森林学系