Theoretical morphological analysis of differential morphospace occupation patterns for terrestrial and aquatic gastropods 査読 国際誌

#Araki, A., Noshita, K.

Evolution   2023年6月

Exploring the mechanical and morphological rationality of tree branch structure based on 3D point cloud analysis and the finite element method 査読

Satoru Tsugawa, Kaname Teratsuji, Fumio Okura, Koji Noshita, Masaki Tateno, Jingyao Zhang, Taku Demura

Scientific Reports   12 ( 1 )   2022年12月

Smoking enhances the expression of angiotensin-converting enzyme 2 involved in the efficiency of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection. 査読 国際誌

Rigel Suzuki, Yuki Ono, Koji Noshita, Kwang Su Kim, Hayato Ito, Yuhei Morioka, Tomokazu Tamura, Daisuke Okuzaki, Tetsuzo Tagawa, Tomoyoshi Takenaka, Tomoharu Yoshizumi, Teppei Shimamura, Shingo Iwami, Takasuke Fukuhara

Microbiology and immunology   67 ( 1 )   22 - 31   2022年10月

A proposal of a new automated method for SfM/MVS 3D reconstruction through comparisons of 3D data by SfM/MVS and handheld laser scanners 査読 国際誌

@Kaneda, A., @Nakagawa, T., @Tamura, K., Noshita, K., @Nakao, H.

PLoS ONE   17   e0270660   2022年7月

A proposal of a new automated method for SfM/MVS 3D reconstruction through comparisons of 3D data by SfM/MVS and handheld laser scanners 査読

Akihiro Kaneda, Tomomi Nakagawa, Kohei Tamura, Koji Noshita, Hisashi Nakao

PLOS ONE   17 ( 7 )   e0270660 - e0270660   2022年7月

Tracing founder haplotypes of Japanese apple varieties: application in genomic prediction and genome-wide association study 査読 国際誌

Mai F. Minamikawa, Miyuki Kunihisa, Koji Noshita, Shigeki Moriya, Kazuyuki Abe, Takeshi Hayashi, Yuichi Katayose, Toshimi Matsumoto, Chikako Nishitani, Shingo Terakami, Toshiya Yamamoto, Hiroyoshi Iwata

Horticulture Research   8 ( 1 )   49 - 49   2021年12月

Detection of significant antiviral drug effects on COVID-19 with reasonable sample sizes in randomized controlled trials: A modeling study 査読

Shoya Iwanami, Keisuke Ejima, Kwang Su Kim, Koji Noshita, Yasuhisa Fujita, Taiga Miyazaki, Shigeru Kohno, Yoshitsugu Miyazaki, Shimpei Morimoto, Shinji Nakaoka, Yoshiki Koizumi, Yusuke Asai, Kazuyuki Aihara, Koichi Watashi, Robin N. Thompson, Kenji Shibuya, Katsuhito Fujiu, Alan S. Perelson, Shingo Iwami, Takaji Wakita

PLOS Medicine   18 ( 7 )   e1003660 - e1003660   2021年7月

GIS-Based Analysis for UAV-Supported Field Experiments Reveals Soybean Traits Associated With Rotational Benefit 査読

Yuya Fukano, Wei Guo, Naohiro Aoki, Shinjiro Ootsuka, Koji Noshita, Kei Uchida, Yoichiro Kato, Kazuhiro Sasaki, Shotaka Kamikawa, Hirofumi Kubota

Frontiers in Plant Science   12   2021年5月

Phylogeography and shell morphology of the pelagic snail Limacina helicina in the Okhotsk Sea and western North Pacific 査読

Keisuke Shimizu, Koji Noshita, Katsunori Kimoto, Takenori Sasaki

Marine Biodiversity   51 ( 2 )   2021年4月

Climate-smart crops: key root anatomical traits that confer flooding tolerance 査読

Takaki Yamauchi, Koji Noshita, Nobuhiro Tsutsumi

Breeding Science   71 ( 1 )   51 - 61   2021年1月

Field‐based individual plant phenotyping of herbaceous species by unmanned aerial vehicle 査読

10 ( 21 )   12318 - 12326   2020年11月

Field‐based individual plant phenotyping of herbaceous species by unmanned aerial vehicle 査読 国際誌

10   12318 - 12326   2020年10月

A theoretical morphological model for quantitative description of the three-dimensional floral morphology in water lily (Nymphaea) 査読

Shiryu Kirie, Hideo Iwasaki, Koji Noshita, Hiroyoshi Iwata

PLOS ONE   15 ( 10 )   e0239781 - e0239781   2020年10月

Comparison of shape quantification methods for genomic prediction, and genome-wide association study of sorghum seed morphology 査読

Lisa Sakamoto, Hiromi Kajiya-Kanegae, Koji Noshita, Hideki Takanashi, Masaaki Kobayashi, Toru Kudo, Kentaro Yano, Tsuyoshi Tokunaga, Nobuhiro Tsutsumi, Hiroyoshi Iwata

PloS one   14 ( 11 )   2019年11月

Application of deep learning for the occupational health of VDT workers 査読

Mitsuo Uchida, Koji Noshita, Hiroshi Koyama

Sangyo eiseigaku zasshi = Journal of occupational health   61 ( 6 )   256 - 260   2019年11月

What is cost-efficient phenotyping? Optimizing costs for different scenarios 査読

Plant Science   282   14 - 22   2019年5月

Genotype-aggregated planting improves yield in Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus) due to self/non-self-discrimination 査読

Yuya Fukano, Wei Guo, Koji Noshita, Shoko Hashida, Shotaka Kamikawa

Evolutionary Applications   12 ( 3 )   508 - 518   2019年3月

Application of a deep learning for occupational health and safety recognition a pilot study in a logistics industry 査読

Mitsuo Uchida, Koji Noshita, Yasuhiro Tsutsui, Hiroshi Koyama

Sangyo eiseigaku zasshi = Journal of occupational health   60 ( 6 )   191 - 195   2018年12月

Characterization of peach tree crown by using high-resolution images from an unmanned aerial vehicle 査読

Yue Mu, Yuichiro Fujii, Daisuke Takata, Bangyou Zheng, Koji Noshita, Kiyoshi Honda, Seishi Ninomiya, Wei Guo

Horticulture Research   5 ( 1 )   2018年12月

Phylogeography of the pelagic snail Limacina helicina (Gastropoda Thecosomata) in the subarctic western North Pacific 査読

Keisuke Shimizu, Katsunori Kimoto, Koji Noshita, Masahide Wakita, Tetsuichi Fujiki, Takenori Sasaki

Journal of Molluscan Studies   84 ( 1 )   30 - 37   2018年2月

Aerial imagery analysis – Quantifying appearance and number of sorghum heads for applications in breeding and agronomy 査読

871   2018年1月

A heart-brain-kidney network controls adaptation to cardiac stress through tissue macrophage activation 査読

Katsuhito Fujiu, Munehiko Shibata, Yukiteru Nakayama, Fusa Ogata, Sahohime Matsumoto, Koji Noshita, Shingo Iwami, Susumu Nakae, Issei Komuro, Ryozo Nagai, Ichiro Manabe

Nature medicine   23 ( 5 )   611 - 622   2017年5月

Geometric analysis and estimation of the growth rate gradient on gastropod shells 査読

Koji Noshita, Keisuke Shimizu, Takenori Sasaki

Journal of Theoretical Biology   389   11 - 19   2016年1月

Quantification and geometric analysis of coiling patterns in gastropod shells based on 3D and 2D image data 査読

Koji Noshita

Journal of Theoretical Biology   363   93 - 104   2014年12月

Functional constraints on coiling geometry and aperture inclination in gastropods 査読

Koji Noshita, Takahiro Asami, Takao Ubukata

Paleobiology   38 ( 2 )   322 - 334   2012年3月

Spiral Shell Form A computer software package for theoretical morphological analysis of spiral shell form 査読

Koji Noshita

Geoscience Reports of the Shizuoka University   ( 37 )   57 - 73   2010年7月

Model-based plant phenomics on morphological traits using morphometric descriptors 招待 査読 国際誌

Noshita, K., #Murata, H., @Kirie, S.

BREEDING SCIENCE   72 ( 1 )   19 - 30   1900年

幾何学的形態測定学とRを使った解析例 in 文化進化の考古学（中尾 央，松木 武彦，三中 信宏 編）

野下 浩司，田村 光平（ 担当： 共著）

勁草書房  2017年8月 

Characterization of foliage structures using persistent homology analysis 国際会議

Noshita, K.

IPPS2022  2022年9月 

細胞形状と動きの形態測定学的解析

野下 浩司

数理生物学会  2022年9月 

腹足類殻の異なる形態空間占有パターンの理論形態学的解析

#荒木 周,野下 浩司

第172回古生物学会例会  2023年2月 

フェノタイピングの問題としての「かたち」の定量化：暗黙知の形式化へ向けて 招待

野下 浩司

社会課題は数理科学で解決できる！？ -試みと課題-  2021年10月 

「かたち」のモデル化・定量化のための幾何学 招待

野下 浩司

生命医科学における数理科学の最前線：データサイエンスから代数・幾何・記号学まで - さらなる展開を目指して  2021年10月 

草姿・草型のフェノタイピング：3次元計測と「かたち」の数理モデル化 招待

野下 浩司

日本植物学会 第８５回大会 シンポジウム 植物科学を変える先端分析技術と大規模データ統合解析  2021年9月 

輪郭形状解析におけるレジストレーション:軸と対称不整合についての比較

野下 浩司

数理生物学会  2021年9月 

Morphometrics and its applications 招待 国際会議

Noshita, K.

Mathematical methods for the studies of flow, shape, and dynamics  2021年8月 

植物の「かたち」を測る・モデル化する：数理モデルの構築・定量化の理論提案・植物フェノタイピング技術の開発

野下 浩司

超分野植物科学研究会（TDPS） 第1回研究会  2021年6月 

葉群の空間パターンとしての草姿・草型の定量的表現：相同性が自明でない場合の形態測定学に向けて．

野下 浩司

第16回 生物数学の理論とその応用 ～生命現象の定量的理解に向けて～  2020年1月 

Quantitative Representation of Plant Style as Spacial Pattern of Foliage for Morphometrics on ill-defined Homology 国際会議

Noshita, K.

Phenome2020  2020年2月 

“異常巻き”を含む貝殻巻きパタンの定量的解析・モデル化

野下 浩司

2020年度日本数理生物学会年会  2020年9月 

kaigara：貝殻理論形態学Pythonパッケージ

野下 浩司

古生物学会  2021年2月 

３次元空間における植物葉面再構築と輪郭形状解析

野下 浩司

日本生態学会第68回全国大会  2021年3月 

草姿・草型の数理モデル化と高効率フェノタイピングへの応用 招待

野下 浩司

農業情報学会2021年度 年次大会  2021年5月 

軟体動物殻形態の理論モデルによる「かたち」と「かたち作り」の定量化 招待

野下 浩司

第14回バイオミネラリゼーションワークショップ  2019年11月 

植物フェノタイピング向け仮想データセットの生成と解析

野下 浩司

定量生物学の会 北海道キャラバン2019  2019年11月 

A unified framework for image-based plant phenotyping under controlled growth environment: From image acquisition to phenotype interpretation 国際会議

6th International Plant Phenotyping Symposium  2019年10月 

Outline-based morphometrics and geometric analysis for leaf shapes in a three-dimensional space 国際会議

Noshita, K., Guo, W.

6th International Plant Phenotyping Symposium  2019年10月 

3D high through-put phenotyping for Smart agriculture 招待 国際会議

Noshita, K

International Smart Agriculture Symposium  2019年9月 

植物形態の計測とモデル化

野下 浩司

日本数理生物学会  2019年9月 

貝殻巻きパタンの定量化：”異常巻き”への拡張

野下 浩司

日本生態学会  2019年3月 

3D Point Cloud Phenotyping of Soybean Growth in Early Stage 国際会議

Noshita, K., Guo, W., Kaga A. and Iwata, H.

PAG XXV  2017年1月 

An image processing pipeline for acquiring 3D morphological information from “noisy” point cloud data 招待 国際会議

2017年9月 

生物を通して読み解く形態と機能の関係性 招待

野下 浩司

日本ロボット学会  2018年7月 

Model-based morphometrics for plant phenotyping 国際会議

Noshita, K. and Guo, W.

SMB-JSMB 2018  2018年7月 

野外における植物3次元形態の再構築と計測 招待

野下浩司，郭　　威

電気学会 電子・情報・システム部門大会  2018年9月 

Model-based phenotyping of soybean canopies in early stage under a field condition with a photogrammetry studio 国際会議

Noshita, K., Guo, W.

IPPS2018  2018年10月 

3D field phenotyping of canopy development in soybean 招待 国際会議

Noshita, K.

PBIO Seminar  2018年11月 

Topics from special edition 社会医学におけるAI研究

内田 満夫, 野下 浩司, 渡辺 由佳子, 小山 洋

細胞   2019年6月

深層学習の利活用による植物表現型解析技術の展望

大倉 史生, 野下 浩司, 木下 俊則, 戸田 陽介

植物科学の最前線   2019年1月

野外における作物の3次元形態の再構築 (特集 植物Phenotyping)

野下 浩司

アグリバイオ = Agricultural biotechnology   2018年3月

野外における作物の3次元形態の再構築. in アグリバイオ

野下 浩司

2018年3月

巻貝殻形態の理論形態学的解析パッケージ--Spiral Shell Form

野下 浩司

静岡大学地球科学研究報告   2010年7月

日本進化学会

農業情報学会

植物器官の周期的出現パタンとその変調による個体の「かたち」の多様性の統合的理解

研究課題/領域番号：22H04727  2022年 - 2023年

日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究（研究領域提案型）

植物３次元形態の数理モデル化によるフェノタイピング基盤技術の開発

研究課題/領域番号：21K14947  2021年 - 2023年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

大規模画像データに基づくゲノムと環境の相互作用を考慮した成長予測モデルの構築

2021年

戦略的創造研究推進事業 (文部科学省)

３次元形態計測と数理モデル化による植物フェノタイピングプラットフォームの高度化

2021年

理研-九⼤ 科学技術ハブ共同研究 プログラム

複雑臓器制御系の数理的包括理解と超早期精密医療への挑戦

2020年 - 2025年

戦略的な研究開発の推進 ムーンショット型研究開発事業

シーボルト標本を用いた江戸の自然の科学的復元

研究課題/領域番号：20KK0011  2020年 - 2023年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  国際共同研究強化(B)

博物館資料の3Ｄ形態学：形状認識の定量化、高精度化、および展示公開への活用

研究課題/領域番号：20H01381  2020年 - 2022年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

「かたち」に関する数理科学基盤の構築および諸分野への社会実装

2020年 - 2022年

科学技術振興機構 未来社会創造事業

マルチドローン画像を用いた4D空間マッピングによる植物計測法の開発

2020年

戦略的創造研究推進事業 (文部科学省)

三次元データベースと数理解析・モデル構築による分野統合的研究の促進

研究課題/領域番号：19H05738  2019年 - 2023年

日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究（研究領域提案型）

作物３D形態ベンチマークデータセットの構築による植物フェノタイピング研究の加速

研究課題/領域番号：19K15946  2019年 - 2020年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

植物３次元形態データセットの作成と全体構造を記述する特徴量の開発

2019年

九州大学　数理・データサイエンスに関する教育・研究支援プログラム

貝殻らせん成長メカニズムの解明：進化発生古生物学創成に向けて

研究課題/領域番号：18H01323  2018年 - 2022年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

Systems Bone Biology～骨・軟骨疾患の発症予測から疾患予防へ

研究課題/領域番号：18KT0018  2018年 - 2020年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

マルチスケールデータ融合による草姿・草型の超解像フェノタイピング技術の開発

2016年 - 2019年

戦略的創造研究推進事業 (文部科学省)

形態の適応と形成過程の数理的研究

研究課題/領域番号：12J00760  2012年 - 2014年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

形態の適応と形成過程の数理的研究

2012年 - 2014年

日本学術振興会  特別研究員

数理生物学演習

2023年4月 - 2023年9月   前期

数理生物学

2023年4月 - 2023年9月   前期

数学共創概論Ⅰ

2023年4月 - 2023年9月   前期

数理生物学演習

2022年4月 - 2022年9月   前期

数理生物学

2022年4月 - 2022年9月   前期

数学共創概論Ⅰ

2022年4月 - 2022年9月   前期

数理生物学演習

2021年4月 - 2021年9月   前期

数理生物学

2021年4月 - 2021年9月   前期

数学共創概論Ⅰ

2021年4月 - 2021年9月   前期

集団生物学

2020年10月 - 2021年3月   後期

数理生物学演習

2020年4月 - 2020年9月   前期

自然科学総合実験（基礎）

2019年10月 - 2020年3月   後期

数理生物学演習

2019年4月 - 2019年9月   前期

生命理学特論I

2018年10月 - 2019年3月   後期

数理生物学演習

2018年4月 - 2018年9月   前期

2022年  奈良文化財研究所 埋蔵文化財センター 遺跡・調査技術研究室 客員研究員  国内外の区分:国内 

2021年  名古屋大学 生命理学専攻 異分野融合生物学講座 招へい教員  国内外の区分:国内 

2021年  奈良文化財研究所 埋蔵文化財センター 遺跡・調査技術研究室 客員研究員  国内外の区分:国内 

学期、曜日時限または期間：令和3（2021）年9月 -

2018年  Computational Plant Science Lab, UGA  区分:客員教員  国内外の区分:国外 

学期、曜日時限または期間：2018年 9月17日 - 2018年 12月11日

貝殻形態の多様性を数理モデルで解明する in 第33回 metaPhorestセミナー AKI INOMATAx野下浩司　貝のカタチ

2018年5月

ダイズ群落の3D計測への取り組み in 公開セミナー　基礎研究で未来の『食と農業』を切り拓く

CREST「農業ビッグデータ」  十勝さらべつ熱中小学校，北海道  2017年8月