2024/10/07 更新

お知らせ

 

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ナカムラ　ケイジ
中村 佳司
NAKAMURA KEIJI
所属
医学研究院 基礎医学部門 講師
医学部 医学科（併任）
職名
講師
連絡先
メールアドレス
電話番号
0726426128
プロフィール
腸管出血性大腸菌を中心とした病原性細菌の病原性進化や多様性獲得に関与する遺伝的背景の解明とバクテリオファージの生物学的特性を解析することを目的として研究を行っている。
外部リンク

学位

  • 博士（獣医学）

経歴

  • 大阪大学微生物病研究所（特任研究員）

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ：新規サテライトファージとヘルパーファージ間相互作用の解明

    研究キーワード：サテライトファージ, ヘルパーファージ, 比較ゲノム解析

    研究期間： 2021年7月 - 2024年6月

  • 研究テーマ：大規模ゲノム情報を利用した大腸菌における血清型変換の全貌解明

    研究キーワード：大腸菌, O抗原・H抗原, 血清型変換, 比較ゲノム解析, 志賀毒素産生性大腸菌

    研究期間： 2021年4月 - 2024年3月

  • 研究テーマ：腸管出血性大腸菌におけるプロファージ間相互作用と宿主菌進化へのインパクトの解明

    研究キーワード：腸管出血性大腸菌, 比較ゲノム解析, 志賀毒素ファージ, サテライトファージ, ヘルパーファージ

    研究期間： 2019年7月 - 2021年6月

受賞

  • 日本細菌学会九州支部若手奨励賞

    2016年9月   日本細菌学会九州支部総会  

  • 細菌学若手コロッセウム優秀賞

    2015年11月   細菌学若手コロッセウム  

論文

  • Diversity of Shiga toxin transducing phages in Escherichia coli O145:H28 and the different Shiga toxin 2 production levels associated with short- or long-tailed phages

    Keiji Nakamura, Itsuki Taniguchi, Yasuhiro Gotoh, Junko Isobe, Keiko Kimata, Yukiko Igawa, Tomoko Kitahashi, Yohei Takahashi, Ryohei Nomoto, Kaori Iwabuchi, Yo Morimoto, Sunao Iyoda, Tetsuya Hayashi

    Frontiers in Microbiology   15   1453887   2024年8月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語  

    DOI： 10.3389/fmicb.2024.1453887

  • Identification of key yeast species and microbe–microbe interactions impacting larval growth of Drosophila in the wild 査読

    12   2023年12月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Microbiota consisting of various fungi and bacteria have a significant impact on the physiological functions of the host. However, it is unclear which species are essential to this impact and how they affect the host. This study analyzed and isolated microbes from natural food sources of Drosophila larvae, and investigated their functions. Hanseniaspora uvarum is the predominant yeast responsible for larval growth in the earlier stage of fermentation. As fermentation progresses, Acetobacter orientalis emerges as the key bacterium responsible for larval growth, although yeasts and lactic acid bacteria must coexist along with the bacterium to stabilize this host–bacterial association. By providing nutrients to the larvae in an accessible form, the microbiota contributes to the upregulation of various genes that function in larval cell growth and metabolism. Thus, this study elucidates the key microbial species that support animal growth under microbial transition.

    DOI： 10.7554/elife.90148.3

  • Systematic analysis of plasmids of the Serratia marcescens complex using 142 closed genomes. 国際誌

    Debora Satie Nagano, Itsuki Taniguchi, Tomoyuki Ono, Keiji Nakamura, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi

    Microbial genomics   9 ( 11 )   2023年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.001135

  • Virulence of Shigatoxigenic and Enteropathogenic Escherichia coli O80:H2 in Galleria mellonella Larvae: Comparison of the Roles of the pS88 Plasmids and STX2d Phage 査読 国際共著

    Rie Ikeda, Fanny Laforêt, Céline Antoine, Mare Adachi, Keiji Nakamura, Audrey Habets, Cassandra Kler, Klara De Rauw, Tetsuya Hayashi, Jacques G. Mainil, Damien Thiry

    Veterinary Sciences   10 ( 7 )   420   2023年6月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： doi.org/10.3390/vetsci10070420

  • Phylogenic position and low genomic diversity of “ Candidatus Rickettsia kotlanii ” inferred by complete genome sequences of two Japanese isolates 査読

    2023年4月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/1348-0421.13065

  • Escherichia cryptic clade I is an emerging source of human intestinal pathogens 査読

    Miki Okuno, Yoko Arimizu, Seina Miyahara, Yuki Wakabayashi, Yasuhiro Gotoh, Shuji Yoshino, Tetsuya Harada, Kazuko Seto, Takeshi Yamamoto, Keiji Nakamura, Tetsuya Hayashi, Yoshitoshi Ogura

    BMC Biology   21 ( 1 )   2023年4月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1186/s12915-023-01584-4

  • Nationwide analysis of antimicrobial resistance in pathogenic Escherichia coli strains isolated from diseased swine over 29 years in Japan 査読

    Masahiro Kusumoto, Yukino Tamamura-Andoh, Yuna Hikoda-Kogiku, Asami Magome, Erina Okuhama, Keisuke Sato, Yoshino Mizuno, Nobuo Arai, Ayako Watanabe-Yanai, Taketoshi Iwata, Yoshitoshi Ogura, Yasuhiro Gotoh, Keiji Nakamura, Tetsuya Hayashi, Masato Akiba

    Frontiers in Microbiology   14   2023年3月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3389/fmicb.2023.1107566

  • Dynamic changes in Shiga toxin (Stx) 1 transducing phage throughout the evolution of O26:H11 Stx-producing Escherichia coli 査読

    Bungo Yano, Itsuki Taniguchi, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi, Keiji Nakamura

    Scientific Reports   13 ( 1 )   2023年3月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1038/s41598-023-32111-8

  • Global population structure, genomic diversity and carbohydrate fermentation characteristics of clonal complex 119 (CC119), an understudied Shiga toxin-producing E. coli (STEC) lineage including O165:H25 and O172:H25 査読

    Microbial Genomics   9 ( 3 )   2023年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000959

  • Alteration of a Shiga toxin-encoding phage associated with a change in toxin production level and disease severity in Escherichia coli. 国際誌

    Tatsuya Miyata, Itsuki Taniguchi, Keiji Nakamura, Yasuhiro Gotoh, Dai Yoshimura, Takehiko Itoh, Shinichiro Hirai, Eiji Yokoyama, Makoto Ohnishi, Sunao Iyoda, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi

    Microbial genomics   9 ( 2 )   2023年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000935

  • Escherichia coli O80 in Healthy Cattle: Absence of Shigatoxigenic and Enteropathogenic E. coli O80:H2 and (Phylo) Genomics of Non-Clonal Complex 165 E. coli O80 査読

    Microorganisms   11 ( 2 )   230 - 230   2023年1月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3390/microorganisms11020230

  • Omics profiles of fecal and oral microbiota change in irritable bowel syndrome patients with diarrhea and symptom exacerbation.

    Yukari Tanaka, Riu Yamashita, Junko Kawashima, Hiroshi Mori, Ken Kurokawa, Shinji Fukuda, Yasuhiro Gotoh, Keiji Nakamura, Tetsuya Hayashi, Yoshiyuki Kasahara, Yukuto Sato, Shin Fukudo

    Journal of gastroenterology   57 ( 10 )   748 - 760   2022年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s00535-022-01888-2

  • Insertion Sequence (IS)-Excision Enhancer (IEE)-Mediated IS Excision from the lacZ Gene Restores the Lactose Utilization Defect of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli O121:H19 Strains and Is Responsible for Their Delayed Lactose Utilization Phenotype 査読 国際誌

    Keiji Nakamura, Kazuko Seto, Junko Isobe, Itsuki Taniguchi, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi

    Applied and Environmental Microbiology   88 ( 16 )   e0076022   2022年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/aem.00760-22

  • Helicobacter cinaedi is a human-adapted lineage in the Helicobacter cinaedi/canicola/'magdeburgensis' complex. 国際誌

    Yasuhiro Gotoh, Yuya Atsuta, Takako Taniguchi, Ruriko Nishida, Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Naoaki Misawa, Tetsuya Hayashi

    Microbial genomics   8 ( 5 )   2022年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000830

  • Global population structure of the Serratia marcescens complex and identification of hospital-adapted lineages in the complex 査読

    Tomoyuki Ono, Itsuki Taniguchi, Keiji Nakamura, Debora Satie Nagano, Ruriko Nishida, Yasuhiro Gotoh, Yoshitoshi Ogura, Mitsuhiko P. Sato, Atsushi Iguchi, Kazunori Murase, Dai Yoshimura, Takehiko Itoh, Ayaka Shima, Damien Dubois, Eric Oswald, Akira Shiose, Naomasa Gotoh, Tetsuya Hayashi

    Microbial Genomics   8 ( 3 )   2022年3月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000793

  • The global population structure and evolutionary history of the acquisition of major virulence factor-encoding genetic elements in Shiga toxin-producing Escherichia coli O121:H19. 査読 国際誌

    Microbial genomics   7 ( 12 )   2021年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000716

  • Development of a homogeneous time-resolved FRET (HTRF) assay for the quantification of Shiga toxin 2 produced by E. coli 査読

    Keiji Nakamura, Chikashi Tokuda, Hideyuki Arimitsu, Yoshiki Etoh, Mitsuhiro Hamasaki, Yuichiro Deguchi, Itsuki Taniguchi, Yasuhiro Gotoh, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi

    PeerJ   9   e11871 - e11871   2021年7月

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    記述言語：その他   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.7717/peerj.11871

  • Prophages integrating into prophages: A mechanism to accumulate type III secretion effector genes and duplicate Shiga toxin-encoding prophages in Escherichia coli 査読 国際誌

    Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Yasuhiro Gotoh, Tetsuya Hayashi

    PLOS Pathogens   17 ( 4 )   e1009073 - e1009073   2021年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1371/journal.ppat.1009073

  • Genetic characterization of Shigatoxigenic and enteropathogenic Escherichia coli O80:H2 from diarrhoeic and septicaemic calves and relatedness to human Shigatoxigenic E. coli O80:H2 査読

    Journal of Applied Microbiology   2020年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/jam.14759

  • Bordetella Dermonecrotic Toxin Is a Neurotropic Virulence Factor That Uses CaV3.1 as the Cell Surface Receptor 査読 国際誌

    Shihono Teruya, Yukihiro Hiramatsu, Keiji Nakamura, Aya Fukui-Miyazaki, Kentaro Tsukamoto, Noriko Shinoda, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Keisuke Ishigaki, Naoaki Shinzawa, Takashi Nishida, Fuminori Sugihara, Yusuke Maeda, Yasuhiko Horiguchi

    mBio   11 ( 2 )   2020年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/mbio.03146-19

  • Escherichia coli O8:H8 Carrying a Novel Variant of the Heat-Labile Enterotoxin LT2 Gene Caused Outbreaks of Diarrhea 査読 国際誌

    Kai Ishimaru, Mari Sasaki, Hiroshi Narimatsu, Yoko Arimizu, Yasuhiro Gotoh, Keiji Nakamura, Tetsuya Hayashi, Yoshitoshi Ogura

    Open Forum Infectious Diseases   7 ( 1 )   ofaa021   2020年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/ofid/ofaa021

  • Differential dynamics and impacts of prophages and plasmids on the pangenome and virulence factor repertoires of Shiga toxin-producing Escherichia coli O145:H28 査読

    Microbial Genomics   6 ( 1 )   2020年1月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000323

  • O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia albertii: their diversity and similarity to Escherichia coli gene clusters and the development of an O-genotyping method 査読 国際誌

    Tadasuke Ooka, Kazuko Seto, Yoshitoshi Ogura, Keiji Nakamura, Atsushi Iguchi, Yasuhiro Gotoh, Mikiko Honda, Yoshiki Etoh, Tetsuya Ikeda, Wakana Sugitani, Takayuki Konno, Kimiko Kawano, Naoko Imuta, Kiyotaka Yoshiie, Yukiko Hara-Kudo, Koichi Murakami, Tetsuya Hayashi, Junichiro Nishi

    Microbial Genomics   5 ( 11 )   2019年11月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/mgen.0.000314

  • Comparison of the sequencing bias of currently available library preparation kits for Illumina sequencing of bacterial genomes and metagenomes 査読 国際誌

    Mitsuhiko P Sato, Yoshitoshi Ogura, Keiji Nakamura, Ruriko Nishida, Yasuhiro Gotoh, Masahiro Hayashi, Junzo Hisatsune, Motoyuki Sugai, Itoh Takehiko, Tetsuya Hayashi

    DNA Research   26 ( 5 )   391 - 398   2019年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1093/dnares/dsz017

  • BspR/BtrA, an Anti-σ Factor, Regulates the Ability of Bordetella bronchiseptica To Cause Cough in Rats 招待 査読 国際誌

    4 ( 2 )   2019年4月

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/mSphere.00093-19

  • Genomic characterization of β-glucuronidase–positive escherichia coli O157:H7 producing Stx2a 招待 査読 国際誌

    24 ( 12 )   2219 - 2227   2018年12月

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.3201/eid2412.180404

  • Amylibacter kogurei sp. Nov., a novel marine alphaproteobacterium isolated from the coastal sea surface microlayer of a marine inlet 査読

    Shu Kuan Wong, Susumu Yoshizawa, Yu Nakajima, Marie Johanna Cuadra, Yuichi Nogi, Keiji Nakamura, Hideto Takami, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Hiroshi Xavier Chiura, Koji Hamasaki

    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology   68 ( 9 )   2872 - 2877   2018年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1099/ijsem.0.002911

  • The eukaryotic host factor 14-3-3 inactivates adenylate cyclase toxins of Bordetella bronchiseptica and B. Parapertussis, but not B. pertussis 査読 国際誌

    Aya Fukui-Miyazaki, Hirono Toshima, Yukihiro Hiramatsu, Keisuke Okada, Keiji Nakamura, Keisuke Ishigaki, Naoaki Shinzawa, Hiroyuki Abe, Yasuhiko Horiguchi

    mBio   9 ( 4 )   2018年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/mBio.00628-18

  • Draft genome sequence of Saccharospirillum sp. strain MSK14-1, isolated from surface seawater collected at Aburatsubo Inlet in Japan 査読 国際誌

    Masumi Hasegawa, Yu Nakajima, Shu Kuan Wong, Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Kazuhiro Kogure, Susumu Yoshizawa

    Genome Announcements   6 ( 22 )   2018年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1128/genomeA.00469-18

  • Response to “Standardized methods must be used to compare the properties of botulinum toxin serotypes” 査読 国際誌

    61 ( 12 )   560 - 560   2017年12月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1111/1348-0421.12552

  • Characterization of the functional activity of botulinum neurotoxin subtype B6 査読

    Kohda Tomoko, Nakamura Keiji, Hosomi Koji, Torii Yasushi, Kozaki Shunji, Mukamoto Masafumi

    Microbiology and immunology   61 ( 11 )   482 - 489   2017年11月

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    記述言語：英語  

    Characterization of the functional activity of botulinum neurotoxin subtype B6
    Clostridium botulinum produces the highly potent neurotoxin, botulinum neurotoxin (BoNT), which is classified into seven serotypes (A–G); the subtype classification is confirmed by the diversity of amino acid sequences among the serotypes. BoNT from the Osaka05 strain is associated with type B infant botulism and has been classified as BoNT/B subtype B6 (BoNT/B6) by phylogenetic analysis and the antigenicity of its C-terminal heavy chain (HC) domain. However, the molecular bases for its properties, including its potency, are poorly understood. In this study, BoNT/B6 holotoxin was purified and the biological activity and receptor binding activity of BoNT/B6 compared with those of the previously-characterized BoNT/B1 and BoNT/B2 subtypes. The derivative BoNT/B6 was found to be already nicked and in an activated form, indicating that endogenous protease production may be higher in this strain than in the other two strains. BoNT/B1 exhibited the greatest lethal activity in mice, followed by BoNT/B6, which is consistent with the sensitivity of PC12 cells. No significant differences were seen in the enzymatic activities of the BoNT/Bs against their substrate. HC/B1 and HC/B6 exhibited similar binding affinities to synaptotagmin II (SytII), which is a specific protein receptor for BoNT/B. Binding to the SytII/ganglioside complex is functionally related to the toxic action; however, the receptor recognition sites are conserved. These results suggest that the distinct characteristics and differences in biological sensitivity of BoNT/B6 may be attributable to the function of its Hc.domain.

    DOI： 10.1111/1348-0421.12540

  • Complete and draft genome sequences of eight oceanic Pseudomonas aeruginosa strains 査読

    Yohei Kumagai, Susumu Yoshizawa, Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Kazuhiro Kogure

    Genome Announcements   5 ( 44 )   2017年11月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1128/genomeA.01255-17

  • Protective effects of in vivo-expressed autotransporters against Bordetella pertussis infection 査読 国際誌

    Koichiro Suzuki, Naoaki Shinzawa, Keisuke Ishigaki, Keiji Nakamura, Hiroyuki Abe, Aya Fukui-Miyazaki, Kazuyoshi Ikuta, Yasuhiko Horiguchi

    MICROBIOLOGY and IMMUNOLOGY   61 ( 9 )   371 - 379   2017年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/1348-0421.12504

  • Draft genome sequences of Tersicoccus phoenicis DSM 30849T, isolated from a cleanroom for spacecraft assembly, and Tersicoccus sp. strain Bi-70, isolated from a freshwater lake 査読

    Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Kazuhiro Kogure

    Genome Announcements   5 ( 13 )   2017年1月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1128/genomeA.00079-17

  • 百日咳毒素の感染における役割の分析(Analysis of roles of pertussis toxin in infection)

    新居 佑規, 中村 佳司, 鈴木 孝一朗, 安倍 裕順, 新澤 直明, 堀口 安彦

    日本細菌学雑誌   71 ( 1 )   74 - 74   2016年2月

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    記述言語：英語  

  • The bvg-repressed gene brtA, encoding biofilm-associated surface adhesin, is expressed during host infection by Bordetella bronchiseptica 査読 国際誌

    Sayaka Nishikawa, Naoaki Shinzawa, Keiji Nakamura, Keisuke Ishigaki, Hiroyuki Abe, Yasuhiko Horiguchi

    MICROBIOLOGY and IMMUNOLOGY   60 ( 2 )   93 - 105   2016年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/1348-0421.12356

  • Bordetella pertussis感染症に対する新規の抗原の探索(Seeking novel antigens against Bordetella pertussis infection)

    鈴木 孝一朗, 新澤 直明, 中村 佳司, 堀口 安彦

    日本細菌学雑誌   71 ( 1 )   99 - 99   2016年2月

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    記述言語：英語  

  • Detection of genes expressed in Bordetella bronchiseptica colonizing rat trachea by in vivo expressed-tag immunoprecipitation method 査読 国際誌

    Hiroyuki Abe, Shigeki Kamitani, Aya Fukui-Miyazaki, Naoaki Shinzawa, Keiji Nakamura, Yasuhiko Horiguchi

    MICROBIOLOGY and IMMUNOLOGY   59 ( 5 )   249 - 261   2015年5月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/1348-0421.12247

  • Polymorphisms influencing expression of dermonecrotic toxin in Bordetella bronchiseptica 査読 国際誌

    Keisuke Okada, Hiroyuki Abe, Fumio Ike, Yoshitoshi Ogura, Tetsuya Hayashi, Aya Fukui-Miyazaki, Keiji Nakamura, Naoaki Shinzawa, Yasuhiko Horiguchi

    PloS one   10 ( 2 )   e0116604   2015年2月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1371/journal.pone.0116604

  • Improved detection methods by genetic and immunological techniques for botulinum C/D and D/C mosaic neurotoxins 招待 査読 国際誌

    Keiji Nakamura, Tomoko Kohda, Yoshiyuki Seto, Masafumi Mukamoto, Shunji Kozaki

    VETERINARY MICROBIOLOGY   162 ( 2-4 )   881 - 890   2013年3月

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    記述言語：日本語  

    DOI： 10.1016/j.vetmic.2012.11.009

  • P19 embryonal carcinoma cells exhibit high sensitivity to botulinum type C and D/C mosaic neurotoxins 査読

    Kentaro Tsukamoto, Hideyuki Arimitsu, Sadayuki Ochi, Keiji Nakamura, Yoshikazu Tanaka, Nipawan Nuemket, Koki Taniguchi, Shunji Kozaki, Takao Tsuji

    MICROBIOLOGY and IMMUNOLOGY   56 ( 10 )   664 - 672   2012年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1111/j.1348-0421.2012.00490.x

  • Unique Biological Activity of Botulinum D/C Mosaic Neurotoxin in Murine Species 招待 査読 国際誌

    Keiji Nakamura, Tomoko Kohda, Yuto Shibata, Kentaro Tsukamoto, Hideyuki Arimitsu, Mitsunori Hayashi, Masafumi Mukamoto, Nobuyuki Sasakawa, Shunji Kozaki

    INFECTION AND IMMUNITY   80 ( 8 )   2886 - 2893   2012年8月

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    記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Unique biological activity of botulinum D/C mosaic neurotoxin in murine species
    Clostridium botulinum types C and D cause animal botulism by the production of serotype-specific or mosaic botulinum neurotoxin (BoNT). The D/C mosaic BoNT (BoNT/DC), which is produced by the isolate from bovine botulism in Japan, exhibits the highest toxicity to mice among all BoNTs. In contrast, rats appeared to be very resistant to BoNT/DC in type C and D BoNTs and their mosaic BoNTs. We attempted to characterize the enzymatic and receptor-binding activities of BoNT/DC by comparison with those of type C and D BoNTs (BoNT/C and BoNT/D). BoNT/DC and D showed similar toxic effects on cerebellar granule cells (CGCs) derived from the mouse, but the former showed less toxicity to rat CGCs. In recombinant murine-derived vesicleassociated membrane protein (VAMP), the enzymatic activities of both BoNTs to rat isoform 1 VAMP (VAMP1) were lower than those to the other VAMP homologues. We then examined the physiological significance of gangliosides as the binding components for types C and D, and mosaic BoNTs. BoNT/DC and C were found to cleave an intracellular substrate of PC12 cells upon the exogenous addition of GM1a and GT1b gangliosides, respectively, suggesting that each BoNT recognizes a different ganglioside moiety. The effect of BoNT/DC on glutamate release from CGCs was prevented by cholera toxin B-subunit (CTB) but not by a site-directed mutant of CTB that did not bind to GM1a. Bovine adrenal chromaffin cells appeared to be more sensitive to BoNT/DC than to BoNT/C and D. These results suggest that a unique mechanism of receptor binding of BoNT/DC may differentially regulate its biological activities in animals. © 2012, American Society for Microbiology.

    DOI： 10.1128/IAI.00302-12

  • Characterization of the monoclonal antibody response to botulinum neurotoxin type A in the complexed and uncomplexed forms 査読

    Haiyang Zhao, Keiji Nakamura, Tomoko Kohda, Masafumi Mukamoto, Shunji Kozaki

    Japanese Journal of Infectious Diseases   65 ( 2 )   138 - 145   2012年4月

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    記述言語：英語  

  • Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin Insight into the ganglioside binding mechanism 査読

    Nipawan Nuemket, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao, Isao Tanaka

    Biochemical and Biophysical Research Communications   411 ( 2 )   433 - 439   2011年7月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1016/j.bbrc.2011.06.173

  • Preliminary X-ray crystallographic study of the receptor-binding domain of the D/C mosaic neurotoxin from Clostridium botulinum 査読

    Nipawan Nuemket, Yoshikazu Tanaka, Kentaro Tsukamoto, Takao Tsuji, Keiji Nakamura, Shunji Kozaki, Min Yao, Isao Tanaka

    Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications   66 ( 5 )   608 - 610   2010年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1107/S1744309110012182

  • Characterization of the D/C mosaic neurotoxin produced by Clostridium botulinum associated with bovine botulism in Japan 査読 国際誌

    Nakamura Keiji, Kohda Tomoko, Umeda Kaoru, Yamamoto Hideyuki, Mukamoto Masafumi, Kozaki Shunji

    VETERINARY MICROBIOLOGY   140 ( 1-2 )   147 - 154   2010年1月

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    記述言語：日本語  

    DOI： 10.1016/j.vetmic.2009.07.023

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講演・口頭発表等

  • Prophages integrating into prophages: A mechanism to accumulate type III secretion effector genes and duplicate Shiga toxin-encoding prophages in Escherichia coli 国際会議

    Keiji Nakamura, Yoshitoshi Ogura, Yasuhiro Gotoh, and Tetsuya Hayashi

    VTEC2023  2023年5月 

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    開催年月日： 2023年5月

    記述言語：英語  

    国名：カナダ  

  • 隠れた志賀毒素産生性大腸菌系統, Clonal complex (CC119)の集団構造とCC119菌株の糖代謝特性

    中村佳司、勢戸和子、李謙一、後藤恭宏、伊豫田淳、林哲也

    第９６回日本細菌学会総会  2023年3月 

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    開催年月日： 2023年3月 - 2023年6月

    記述言語：日本語  

    開催地：アクリエひめじ   国名：日本国  

  • 挿入配列の切り出しによる大腸菌 O121:H19の乳糖分解性の再活性化

    中村佳司, 勢戸和子, 磯部順子, 林哲也

    第95回日本細菌学会総会  2022年3月 

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    開催年月日： 2022年3月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • プロファージ内プロファージによる大腸菌への3型分泌エフェクターと志賀毒素遺伝子の蓄積メカニズム

    中村佳司, 小椋義俊, 後藤恭宏, 林哲也

    第94回日本細菌学会総会  2021年3月 

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    開催年月日： 2021年3月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • 志賀毒素産生性大腸菌O145:H28におけるプロファージとプラスミドのダイナミクス

    中村佳司, 村瀬一典, 佐藤光彦, 後藤恭宏, 小椋義俊, 林哲也

    第14回日本ゲノム微生物学会年会  2020年3月 

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    開催年月日： 2020年3月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • EHEC O121:H19の継代培養中に生じる乳糖分解性の変化に関わる遺伝的メカニズムの解明

    中村佳司, 谷口愛樹, 西田留梨子, 後藤恭宏, 小椋義俊, 林哲也

    第93回日本細菌学会総会  2020年2月 

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    開催年月日： 2020年2月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • EHEC O121:H19の乳糖分解性に関与する遺伝因子と系統内のバリエーション

    中村佳司, 谷口愛樹, 西田留梨子, 後藤恭宏, 小椋義俊, 林哲也

    第23回腸管出血性大腸菌感染症研究会  2019年11月 

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    開催年月日： 2019年11月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • 腸管出血性大腸菌O121:H19の乳糖分解性に関与する遺伝因子の特定

    中村佳司, 谷口愛樹, 西田留梨子, 後藤恭宏, 小椋義俊, 伊豫田淳, 大西真, 林哲也

    第162回日本獣医学会学術集会  2019年9月 

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    開催年月日： 2019年9月

    記述言語：日本語  

    国名：その他  

  • 腸管出血性大腸菌O145:H28の比較ゲノム解析

    中村佳司, 村瀬一典, 西田留梨子, 伊藤武彦, Mainil Jacques, 吉野修司, 磯部順子, 勢戸和子, 江藤良樹, 富永潔, 緒方喜久代, 斉藤志保子, 八柳潤, 黒木真理子, 木全恵子, 前田詠里子, 亀山光博, 成松浩志, 矢端順子, 伊豫田淳, 大西真, 大岡唯祐, 後藤恭宏, 小椋義俊, 林哲也

    第69回日本細菌学会九州支部総会  2016年9月 

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    開催年月日： 2016年9月

    記述言語：日本語  

    開催地：宮崎市民プラザ・オルブライトホール   国名：日本国  

    【目的】腸管出血性大腸菌 (enterohemorrhagic Escherichia coli, EHEC)は志賀毒素 (Shiga toxin, Stx1およびStx2)など、様々な病原因子を産生する。EHECの代表的なO血清群であるO157、O26、O111、O103、O121、O145、O45のうち、当研究室では前5者の全ゲノムを解読し、病原性進化機構の解明などを進めている。本研究ではO145の全ゲノム配列決定とO145菌株内でのゲノム多様性の実体解明を目的とした比較ゲノム解析を行った。 【方法】血便患者由来O145株(10942株)の全ゲノム配列を決定し、アノテーションや病原関連遺伝子の同定等を行った。また、ベルギー株を含む49株のドラフトゲノム配列を取得し、全ゲノム系統解析を実施するとともにStx2ファージ挿入部位を決定した。さらに、各菌株のStx2産生量をELISA法で定量した。 【結果】10942株の染色体は5,374 kbで、93 kbの病原プラスミドを保持していた。EHECの他の血清型と同様に、染色体上に多数のプロファージを有し、３型分泌系エフェクターなどの病原因子レパートリーも他のEHECと類似していた。ベルギー株も含めた全ゲノム系統解析から、O145には複数の亜系統が存在しており、いずれの亜系統にも国内株が含まれることが明らかとなった。また、Stx2ファージの挿入部位は亜系統によって異なり、Stx2産生量において各菌株間に明らかな違いが見られた。 【考察】O157などと同様に、O145も水平伝播により多数の病原遺伝子を獲得し、EHECへ進化したと推察された。また、O145における菌株間のゲノム多様性は比較的高く、日本国内にも複数の亜系統が分布していると考えられた。O145株に挿入されたStx2ファージのゲノム多型と各菌株のStx2産生量の違いの関連性については、詳細に解析する必要があるため、現在、全株においてStx2ファージ領域の配列決定を行っている。

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MISC

  • めざせ!細菌学の★2016 百日咳の病態発生機序解明に向けた感染動物モデルの確立

    中村 佳司, 神谷 重樹, 安倍 裕順, 新澤 直明, 堀口 安彦

    日本細菌学雑誌   2016年2月

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    記述言語：日本語  

所属学協会

  • 日本細菌学会

  • 日本獣医学会

  • 日本ゲノム微生物学会

学術貢献活動

  • 学術論文等の審査

    役割：査読

    2021年

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    種別：査読等 

    外国語雑誌　査読論文数：2

  • 学術論文等の審査

    役割：査読

    2020年

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    種別：査読等 

    外国語雑誌　査読論文数：1

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 広域食中毒発生時の早期探知のための調査の迅速化及びゲノム解析技術を利用した調査法の確立に資する研究

    2023年4月 - 2026年3月

    国立感染症研究所（日本） 

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    担当区分：研究分担者 

    食中毒は国民に対して甚大で直接的な影響を及ぼす。そのため食中毒の発生予防や発生した際には迅速 な原因究明を実施し、その健康被害の拡大抑止が必要不可欠である。特に腸管出血性大腸菌(EHEC)によ る食中毒は、その届出数や重症度も相まって日本の食中毒対策として最も警戒が必要となっている。こ れまで EHEC 感染症の事例調査のため各種の分子型別法が開発・利用されてきた。MLVA 法が迅速性、精微 性に優れていることから、国内では主に MLVA 法を用いた解析が行われている。本研究計画では地衛研における MLVA 法運用のさらなる効率化迅速化を目指した技術導入および精度向上、MLVA 型別データと発 生動向を利用した EHEC 食中毒アラート発出システムの構築、その評価を実施する。また世界的には食中毒を含む感染症の分子疫学解析が全ゲノム情報を用いたものとなっており、食品や動物由来株を含めたゲノムデータベースの拡充化を進めることで MLVA 法との優劣性を明らかにし、 将来的な運用に資する基盤を構築する。またゲノムデータを利用した原因究明に利用可能な ゲノム解析パイプラインを構築し、その試用を通じて評価および改良を進める。 さらに EHEC 感染症の起因菌と食材等感染源の関連性解析および本研究で構築された食中毒アラートシス テム及び検査解析スキーム評価のため、他の地域からの食品流通などの影響を受けにくい離島でのコホ ートを確立し、それらの解析・評価を進める。

  • 広域食中毒発生時の早期探知のための調査の迅速化及びゲノム解析技術を利用した調 査法の確立に資する研究

    研究課題/領域番号：23KA0501  2023年 - 2026年

    科学研究費助成事業  厚生労働科学研究費補助金 (厚生労働省)

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    担当区分：研究分担者  資金種別：科研費以外の競争的資金

  • 大規模ゲノム情報を利用した大腸菌における血清型変換の全貌解明

    2021年4月 - 2024年3月

    九州大学（日本） 

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    担当区分：研究代表者 

    大腸菌の血清型別に利用されるO抗原とH抗原は、合成遺伝子領域の組換えによって変化すること（血清型変換）が知られている。しかし、特定の大腸菌進化系統における血清型の変換は報告されているものの、大腸菌全体を俯瞰した血清型変換の実態は解析されていない。申請者は腸管出血性大腸菌O26:H11が属するClonal complex 29（CC29）のゲノム解析を行う過程で、CC29系統内で4度のO抗原の血清型変換が起こったこと、O抗原に加えてH抗原の変換も起こった菌群が存在することを見出した。この知見はCCレベルで血清型変換を解析することの有効性を示唆する。そこで、本研究では、10万を超える大腸菌のゲノム情報を活用して、大腸菌の各CCで生じた血清型変換の頻度とタイミング、変換を引き起こした組換え領域の多様性、変換が多発するCCのゲノム特性を解析することにより、大腸菌における血清型変換の全貌解明を目指す。

  • 大規模ゲノム情報を利用した大腸菌における血清型変換の全貌解明

    研究課題/領域番号：21K07006  2021年 - 2023年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    資金種別：科研費

  • 腸管出血性大腸菌におけるプロファージ間相互作用と宿主菌進化へのインパクトの解明

    研究課題/領域番号：18K07116  2018年 - 2020年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 腸管出血性大腸菌におけるプロファージ間相互作用と宿主菌進化へのインパクトの解明

    研究課題/領域番号：18K07116  2018年 - 2020年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    資金種別：科研費

  • 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

    2016年4月 - 2021年3月

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    担当区分：連携研究者 

  • 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

    研究課題/領域番号：16H06279  2016年 - 2021年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    資金種別：科研費

  • 長鎖DNA断片導入による、汎用実験動物に感染する百日咳菌の作出

    研究課題/領域番号：16K15276  2016年 - 2017年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    資金種別：科研費

  • 百日咳における発作性咳嗽に関連する菌側遺伝子の解析

    研究課題/領域番号：16K19124  2016年 - 2017年

    科学研究費助成事業  若手研究(B)

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 百日咳における咳嗽発作の発症メカニズムの解明

    研究課題/領域番号：26293096  2014年 - 2016年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    資金種別：科研費

  • 気管支敗血症菌の新規病原因子の解析

    研究課題/領域番号：26860288  2014年 - 2015年

    科学研究費助成事業  若手研究(B)

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    担当区分：研究代表者  資金種別：科研費

  • 牛ボツリヌス症由来菌の産生する毒素の性状解析と特異診断法の確立

    2011年 - 2012年

    日本学術振興会  特別研究員

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    担当区分：研究代表者  資金種別：共同研究

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学内運営に関わる各種委員・役職等

  • 2023年4月 - 2025年3月   学部 ⾺出地区事業場安全・衛⽣委員会委員