SHIRAISHI MIYAKO
Organization
Faculty of Pharmaceutical Sciences Department of Pharmaceutical Health Care and Sciences Assistant Professor
Title
Assistant Professor
External link
ORCID
Degree
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PhD in Agriculture
Research History
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Osaka University
Awards
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九州大学学生表彰受賞
2017.3
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平成28年度生物資源環境科学府賞
2017.3
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平成28年度日本農芸化学会西日本支部奨励賞（学生）
2017.1
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The International Society for Extremophiles Poster Award
2016.9 The International Society for Extremophiles The International Society for Extremophiles Poster Award
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2013年日本蛋白質科学会 若手ポスター賞
2013.6 日本蛋白質科学会
Papers
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Inhibition of lung microbiota-derived proapoptotic peptides ameliorates acute exacerbation of pulmonary fibrosis. Reviewed International journal
Corina N D'Alessandro-Gabazza, Taro Yasuma, Tetsu Kobayashi, Masaaki Toda, Ahmed M Abdel-Hamid, Hajime Fujimoto, Osamu Hataji, Hiroki Nakahara, Atsuro Takeshita, Kota Nishihama, Tomohito Okano, Haruko Saiki, Yuko Okano, Atsushi Tomaru, Valeria Fridman D'Alessandro, Miyako Shiraishi, Akira Mizoguchi, Ryoichi Ono, Junpei Ohtsuka, Masayuki Fukumura, Tetsuya Nosaka, Xuenan Mi, Diwakar Shukla, Kensuke Kataoka, Yasuhiro Kondoh, Masaki Hirose, Toru Arai, Yoshikazu Inoue, Yutaka Yano, Roderick I Mackie, Isaac Cann, Esteban C Gabazza
Nature communications 13 ( 1 ) 1558 - 1558 2022.3
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Endonuclease V from the archaeon Thermococcus kodakarensis is an inosine-specific ribonuclease. Reviewed International journal
Miyako Shiraishi, Michihi Hidaka, Shigenori Iwai
Bioscience, biotechnology, and biochemistry 2021.12
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Mutational analysis of Thermococcus kodakarensis endonuclease III reveals the roles of evolutionarily conserved residues Reviewed
Miyako Shiraishi, Kento Mizutani, Junpei Yamamoto, Shigenori Iwai
DNA Repair 90 102859 2020.6
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Development CRISPR-Cas12-based rapid EGFR mutation detection kit.
Kei Kunimasa, Yuya Bando, Miyako Shiraishi, Emi Aizawa, Kazumi Nishino, Motohiro Tamiya, Takoko Inoue, Hanako Kuhara, Hayato Kawachi, Kika Kuno, Fumio Imamura, Shigenori Iwai, Toru Kumagai, Keiichiro SUzuki
JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 38 ( 15 ) 2020.5
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Molecular Basis of Substrate Recognition of Endonuclease Q from the Euryarchaeon Pyrococcus furiosus. Reviewed
Shiraishi M, Iwai S
Journal of bacteriology 202 ( 2 ) 2020.1
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The mesophilic archaeon Methanosarcina acetivorans counteracts uracil in DNA with multiple enzymes: EndoQ, ExoIII, and UDG. Reviewed
Shiraishi M, Ishino S, Heffernan M, Cann I, Ishino Y
Scientific reports 8 ( 1 ) 15791 2018.10
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Fluorescence detection of DNA mismatch repair in human cells. Reviewed
Ito S, Shiraishi M, Tsuchihashi K, Takatsuka R, Yamamoto J, Kuraoka I, Iwai S
Scientific reports 8 ( 1 ) 12181 2018.8
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A functional endonuclease Q exists in the bacterial domain: identification and characterization of endonuclease Q from Bacillus pumilus Reviewed
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 81 ( 5 ) 931 - 937 2017.5
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PCNA is involved in the EndoQ-mediated DNA repair process in Thermococcales Reviewed
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Kotaro Yoshida, Takeshi Yamagami, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino
SCIENTIFIC REPORTS 6 25532 2016.5
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EndoQ and EndoV work individually for damaged DNA base repair in Pyrococcus furiosus Reviewed
Sonoko Ishino, Naruto Makita, Miyako Shiraishi, Takeshi Yamagami, Yoshizumi Ishino
BIOCHIMIE 118 264 - 269 2015.11
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A novel endonuclease that may be responsible for damaged DNA base repair in Pyrococcus furiosus Reviewed
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Yuriko Egashira, Shinichi Kiyonari, Yoshizumi Ishino
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 43 ( 5 ) 2853 - 2863 2015.3
Presentations
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古細菌群に保存される真核生物型ヌクレオチド除去修復因子ＸＰＢの機能解析
玉村百香, 白石都, 岩井成憲
第46回日本分子生物学会年会 2023.12
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アーキアの損傷塩基除去修復に関わる新規酵素の発見
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
日本生化学会 九州支部例会 2013.5
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超好熱性アーキアPyrococcus furiosusから同定された新規な修復エンドヌクレアーゼ
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
第13回 日本蛋白質科学会年会 2013.6
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アーキアに見出された損傷塩基修復酵素Endonuclease Qの特性
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
第26回日本Archaea研究会 2013.7
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A novel endonuclease responsible for damaged DNA repair in archaeal order Thermococcales
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
2016.3
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A novel DNA repair pathway found in achaeal order Thermococcales International conference
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
Molecular Biology of Archaea 5 2016.8
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A Novel DNA Repair Pathway for Damaged Bases in Thermococcales International conference
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
Extremophiles2016 (11th International Congress) 2016.9
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Endonuclease Q Acts on Various Mutagenic Bases in Hyperthermophilic Archaea International conference
Shiraishi, M, Ishino, S. Yamagami, T, Egashira, Y, Kiyonari, S, Iwai, S, Ishino, Y
Thermophiles2019 (15th International Congress) 2019.9
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アーキアから見出された新規修復タンパク質、エンドヌクレアーゼQの基質認識機構
白石 都, 岩井成憲
第42回日本分子生物学会年会 2019.12
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Thermococcus kodakarensis由来エンドヌクレアーゼIIIとその変異体を用いた機能解析
水谷謙斗, 山元淳平, 岩井成憲, 白石都
第42回日本分子生物学会年会 2019.12
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Characterization of archaeal Endonuclease V
The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2021.11
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アーキア型RPA及びRadAのRNAに対する機能解析
日比寛菜, 白石都, 岩井成憲
極限環境生物学会2021年度(第22回)年会 2021.11
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Cdt1およびCdt1結合性クロマチン制御因子によるクロマチン構造変換機構の解明
坂井花菜, 辻田沙伎, 東寅彦, 勝木陽子, 杉本のぞみ, 白石都, 藤田雅俊
第45回日本分子生物学会年会 2022.11
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アーキア研究から見出された新しいDNA修復因子と機能
白石 都
第45回日本分子生物学会年会 2022.12
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クリックケミストリーを用いたCRISPR-Cas模倣型タンパク質の開発とイメージングへの応用
中村惇, 白石都, 山本純平, 鈴木啓一郎
第46回日本分子生物学会年会 2023.12
Industrial property rights
| Patent | Number of applications: 1 | Number of registrations: 2 |
| Utility model | Number of applications: 0 | Number of registrations: 0 |
| Design | Number of applications: 0 | Number of registrations: 0 |
| Trademark | Number of applications: 0 | Number of registrations: 0 |
Academic Activities
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Screening of academic papers
Role(s)： Peer review
2021
Research Projects
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ヒトCdt1がライセンス化において果たすクロマチン構造制御のメカニズムの解明
2024
Grant type：Donation
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古細菌由来の核酸関連酵素を用いた等温核酸増幅促進法の開発
2023
Grant type：Donation
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2023
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
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Cdt1の新たな活性によって誘導されるヌクレオソームの構造解析
2023
令和5年度 出産・育児復帰者支援
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
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古細菌が持つ独特なヌクレオチド除去修復機構の解明
Grant number：22K14832 2022 - 2025
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
Grant type：Scientific research funding
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典型的なDNA修復因子が示す新規RNA結合活性の意義
2022
Grant type：Donation
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古細菌が持つXPBとXPDの役割の解明
2020
Grant type：Donation
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生物界に幅広く存在するEndonuclease Vの普遍的役割の解明
2019
Grant type：Donation
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等温反応かつ正確なDNA増幅法の開発
2018
Grant type：Donation
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超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来Endonuclease Qが介するDNA修復経路の解明
2017
Grant type：Donation
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超好熱性アーキアに存在する極限環境下の特異的DNA修復機構の解明
2014 - 2016
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
Class subject
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染色体生物学とそのがん研究への応用
2024.4 - 2024.9 First semester
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創薬科学総論
2023.10 - 2024.3 Second semester
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生物薬学研究
2023.4 - 2024.3 Full year
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染色体生物学とそのがん研究への応用
2023.4 - 2023.9 First semester
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創薬科学総論
2022.10 - 2023.3 Second semester
Travel Abroad
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2021.11 - 2022.2
Staying countory name 1：United States Staying institution name 1：University of Illinois at Urbana-Champaign
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2014.5 - 2016.12
Staying countory name 1：United States Staying institution name 1：University of Illinois at Urbana-Champaign