シライシ ミヤコ
白石 都
SHIRAISHI MIYAKO
ORCID
研究分野
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ライフサイエンス / 応用生物化学
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ライフサイエンス / 応用微生物学
学位
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博士（農学）
経歴
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九州大学 大学院薬学研究院 助教
2022年5月 - 現在
国名：日本国
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大阪大学 大学院 基礎工学研究科 助教
2018年9月 - 2022年5月
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大阪大学
研究テーマ・研究キーワード
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研究テーマ：複製前複合体
研究キーワード：複製前複合体
研究期間： 2024年
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研究テーマ：好熱菌
研究キーワード：好熱菌
研究期間： 2024年
受賞
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九州大学学生表彰受賞
2017年3月
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平成28年度生物資源環境科学府賞
2017年3月
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平成28年度日本農芸化学会西日本支部奨励賞（学生）
2017年1月
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The International Society for Extremophiles Poster Award
2016年9月 The International Society for Extremophiles The International Society for Extremophiles Poster Award
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2013年日本蛋白質科学会 若手ポスター賞
2013年6月 日本蛋白質科学会
論文
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Endonuclease Q as a robust enhancer for nucleic acid amplification
Shiraishi, M; Nabeshima, N; Suzuki, K; Fujita, M; Iwai, S
ANALYTICAL BIOCHEMISTRY 692 115569 2024年9月 （ ISSN:0003-2697 eISSN:1096-0309 ）
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Inhibition of lung microbiota-derived proapoptotic peptides ameliorates acute exacerbation of pulmonary fibrosis. 査読 国際誌
Corina N D'Alessandro-Gabazza, Taro Yasuma, Tetsu Kobayashi, Masaaki Toda, Ahmed M Abdel-Hamid, Hajime Fujimoto, Osamu Hataji, Hiroki Nakahara, Atsuro Takeshita, Kota Nishihama, Tomohito Okano, Haruko Saiki, Yuko Okano, Atsushi Tomaru, Valeria Fridman D'Alessandro, Miyako Shiraishi, Akira Mizoguchi, Ryoichi Ono, Junpei Ohtsuka, Masayuki Fukumura, Tetsuya Nosaka, Xuenan Mi, Diwakar Shukla, Kensuke Kataoka, Yasuhiro Kondoh, Masaki Hirose, Toru Arai, Yoshikazu Inoue, Yutaka Yano, Roderick I Mackie, Isaac Cann, Esteban C Gabazza
Nature communications 13 ( 1 ) 1558 - 1558 2022年3月
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Endonuclease v from the archaeon Thermococcus kodakarensis is an inosine-specific ribonuclease 査読 国際誌
Shiraishi M., Hidaka M., Iwai S.
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 86 ( 3 ) 313 - 320 2021年12月 （ ISSN:09168451 ）
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Mutational analysis of Thermococcus kodakarensis endonuclease III reveals the roles of evolutionarily conserved residues 査読
Miyako Shiraishi, Kento Mizutani, Junpei Yamamoto, Shigenori Iwai
DNA Repair 90 102859 2020年6月
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Development CRISPR-Cas12-based rapid EGFR mutation detection kit.
Kei Kunimasa, Yuya Bando, Miyako Shiraishi, Emi Aizawa, Kazumi Nishino, Motohiro Tamiya, Takoko Inoue, Hanako Kuhara, Hayato Kawachi, Kika Kuno, Fumio Imamura, Shigenori Iwai, Toru Kumagai, Keiichiro SUzuki
JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 38 ( 15 ) 2020年5月
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Molecular Basis of Substrate Recognition of Endonuclease Q from the Euryarchaeon Pyrococcus furiosus. 査読
Shiraishi M, Iwai S
Journal of bacteriology 202 ( 2 ) 2020年1月
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The mesophilic archaeon Methanosarcina acetivorans counteracts uracil in DNA with multiple enzymes: EndoQ, ExoIII, and UDG. 査読
Shiraishi M, Ishino S, Heffernan M, Cann I, Ishino Y
Scientific reports 8 ( 1 ) 15791 2018年10月
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Fluorescence detection of DNA mismatch repair in human cells. 査読
Ito S, Shiraishi M, Tsuchihashi K, Takatsuka R, Yamamoto J, Kuraoka I, Iwai S
Scientific reports 8 ( 1 ) 12181 2018年8月
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A functional endonuclease Q exists in the bacterial domain: identification and characterization of endonuclease Q from Bacillus pumilus 査読
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 81 ( 5 ) 931 - 937 2017年5月
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PCNA is involved in the EndoQ-mediated DNA repair process in Thermococcales 査読
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Kotaro Yoshida, Takeshi Yamagami, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino
SCIENTIFIC REPORTS 6 25532 2016年5月
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EndoQ and EndoV work individually for damaged DNA base repair in Pyrococcus furiosus 査読
Sonoko Ishino, Naruto Makita, Miyako Shiraishi, Takeshi Yamagami, Yoshizumi Ishino
BIOCHIMIE 118 264 - 269 2015年11月
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A novel endonuclease that may be responsible for damaged DNA base repair in Pyrococcus furiosus 査読
Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Yuriko Egashira, Shinichi Kiyonari, Yoshizumi Ishino
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 43 ( 5 ) 2853 - 2863 2015年3月
講演・口頭発表等
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古細菌群に保存される真核生物型ヌクレオチド除去修復因子ＸＰＢの機能解析
玉村百香, 白石都, 岩井成憲
第46回日本分子生物学会年会 2023年12月
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アーキアの損傷塩基除去修復に関わる新規酵素の発見
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
日本生化学会 九州支部例会 2013年5月
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超好熱性アーキアPyrococcus furiosusから同定された新規な修復エンドヌクレアーゼ
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
第13回 日本蛋白質科学会年会 2013年6月
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アーキアに見出された損傷塩基修復酵素Endonuclease Qの特性
白石 都, 石野園子, 牧田成人, 江頭由里子, 清成信一, 山上 健, 石野良純
第26回日本Archaea研究会 2013年7月
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A novel endonuclease responsible for damaged DNA repair in archaeal order Thermococcales
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
2016年3月
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A novel DNA repair pathway found in achaeal order Thermococcales 国際会議
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
Molecular Biology of Archaea 5 2016年8月
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A Novel DNA Repair Pathway for Damaged Bases in Thermococcales 国際会議
Shiraishi, M, Ishono, S, Egashira, Y, Kiyonari, S, Yamagami, T, Cann, I, Ishino, Y
Extremophiles2016 (11th International Congress) 2016年9月
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Endonuclease Q Acts on Various Mutagenic Bases in Hyperthermophilic Archaea 国際会議
Shiraishi, M, Ishino, S. Yamagami, T, Egashira, Y, Kiyonari, S, Iwai, S, Ishino, Y
Thermophiles2019 (15th International Congress) 2019年9月
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アーキアから見出された新規修復タンパク質、エンドヌクレアーゼQの基質認識機構
白石 都, 岩井成憲
第42回日本分子生物学会年会 2019年12月
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Thermococcus kodakarensis由来エンドヌクレアーゼIIIとその変異体を用いた機能解析
水谷謙斗, 山元淳平, 岩井成憲, 白石都
第42回日本分子生物学会年会 2019年12月
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Characterization of archaeal Endonuclease V
The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2021年11月
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アーキア型RPA及びRadAのRNAに対する機能解析
日比寛菜, 白石都, 岩井成憲
極限環境生物学会2021年度(第22回)年会 2021年11月
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Cdt1およびCdt1結合性クロマチン制御因子によるクロマチン構造変換機構の解明
坂井花菜, 辻田沙伎, 東寅彦, 勝木陽子, 杉本のぞみ, 白石都, 藤田雅俊
第45回日本分子生物学会年会 2022年11月
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アーキア研究から見出された新しいDNA修復因子と機能
白石 都
第45回日本分子生物学会年会 2022年12月
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クリックケミストリーを用いたCRISPR-Cas模倣型タンパク質の開発とイメージングへの応用
中村惇, 白石都, 山本純平, 鈴木啓一郎
第46回日本分子生物学会年会 2023年12月
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古細菌群に保存される真核生物型ヌクレオチド除去修復因子ＸＰＢの機能解析
玉村百香, 白石都, 岩井成憲
第46回日本分子生物学会年会 2023年12月
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クリックケミストリーを用いたCRISPR-Cas模倣型タンパク質の開発とイメージングへの応用
中村惇, 白石都, 山本純平, 鈴木啓一郎
第46回日本分子生物学会年会 2023年12月
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アーキア研究から見出された新しいDNA修復因子と機能
白石 都
第45回日本分子生物学会年会 2022年12月
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Cdt1およびCdt1結合性クロマチン制御因子によるクロマチン構造変換機構の解明
坂井花菜, 辻田沙伎, 東寅彦, 勝木陽子, 杉本のぞみ, 白石都, 藤田雅俊
第45回日本分子生物学会年会 2022年11月
産業財産権
| 特許権 | 出願件数: 1件 | 登録件数: 2件 |
| 実用新案権 | 出願件数: 0件 | 登録件数: 0件 |
| 意匠権 | 出願件数: 0件 | 登録件数: 0件 |
| 商標権 | 出願件数: 0件 | 登録件数: 0件 |
委員歴
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Frontiers in Microbiology (Biology of Archaea) Review Editor
2019年7月 - 現在
団体区分：学協会
学術貢献活動
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学術論文等の審査
役割：査読
2021年
共同研究・競争的資金等の研究課題
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ヒトCdt1がライセンス化において果たすクロマチン構造制御のメカニズムの解明
2024年
資金種別：寄附金
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古細菌由来の核酸関連酵素を用いた等温核酸増幅促進法の開発
2023年
資金種別：寄附金
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2023年
担当区分：研究代表者 資金種別：学内資金・基金等
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Cdt1の新たな活性によって誘導されるヌクレオソームの構造解析
2023年
令和5年度 出産・育児復帰者支援
担当区分：研究代表者 資金種別：学内資金・基金等
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研究課題/領域番号：22K14832 2022年 - 2025年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
白石 都
資金種別：科研費
真正細菌と真核生物に属さず独立した生物群を構成する古細菌は生命の起源に近い始原的な性質を持つ。原始的な地球で誕生し、高紫外線量下で生存してきた古細菌群は損傷に対する何らかの強力な対応機構を有していると考えられる。真正細菌および真核生物は、紫外線で生じるDNA損傷を修復するヌクレオチ ド除去修復（NER）機構を有しているが、古細菌はNER機構が長らく不明のままである。本研究では、生化学的・細胞生物学的手法により古細菌が持つNER機構を明らかにし、古細菌群の高い環境適応性を支える分子基盤を理解するとともに、核酸関連因子の新規機能の発掘、さらに核酸化学およびゲノム工学分野の進展に繋げる。
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典型的なDNA修復因子が示す新規RNA結合活性の意義
2022年
資金種別：寄附金
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古細菌が持つXPBとXPDの役割の解明
2020年
資金種別：寄附金
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生物界に幅広く存在するEndonuclease Vの普遍的役割の解明
2019年
資金種別：寄附金
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等温反応かつ正確なDNA増幅法の開発
2018年
資金種別：寄附金
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超好熱性アーキアPyrococcus furiosus由来Endonuclease Qが介するDNA修復経路の解明
2017年
資金種別：寄附金
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超好熱性アーキアに存在する極限環境下の特異的DNA修復機構の解明
2014年 - 2016年
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
担当区分：研究代表者 資金種別：科研費
担当授業科目
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染色体生物学とそのがん研究への応用
2024年4月 - 2024年9月 前期
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創薬科学総論
2023年10月 - 2024年3月 後期
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生物薬学研究
2023年4月 - 2024年3月 通年
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染色体生物学とそのがん研究への応用
2023年4月 - 2023年9月 前期
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創薬科学総論
2022年10月 - 2023年3月 後期
海外渡航歴
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2021年11月 - 2022年2月
滞在国名1：アメリカ合衆国 滞在機関名1：University of Illinois at Urbana-Champaign
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2014年5月 - 2016年12月
滞在国名1：アメリカ合衆国 滞在機関名1：University of Illinois at Urbana-Champaign