MATSUMOTO SHUNSUKE
Organization
Faculty of Agriculture Department of Bioscience and Biotechnology Assistant Professor
School of Agriculture Department of Bioresource and Bioenvironment（Joint Appointment）
Graduate School of Bioresource and Bioenvironmental Sciences Department of Bioscience and Biotechnology（Joint Appointment）
Title
Assistant Professor
Contact information
Tel
0928024717
Profile
CRISPR-Casシステムは、原核生物が持つ獲得免疫機構であり、現在それを応用したゲノム編集技術が急速に開発されています。私は当研究室で独自に見出したCRISPR-Casシステムについて、生化学、構造生物学、細胞生物学などさまざまな手法を駆使して、（1）Casタンパク質の作動機構の原子分解能レベルでの解明、（2）Casタンパク質の機能-構造情報を基にデザインした改変体の創出、（3）様々な生物に適応できるゲノム編集技術の開発そして（4）迅速かつ高感度な核酸検出法への応用を目指しています．
真核生物の細胞には、生体膜で仕切られた様々な細胞小器官（オルガネラ）が高度に発達し、さまざまな生物現象を支えています。オルガネラが正常に機能するためには、合成されたタンパク質が正確に各オルガネラに配送される必要があります。近年私たちは、タンパク質のオルガネラ局在化における配送やり直しの仕組みを見出し、その分子機構を出芽酵母を用いて解析しています。
External link
Degree
-
Systems Life Sciences
Research History
-
就職実績有, 京都産業大学 2014年４月〜2020年7月
Research Interests・Research Keywords
-
Research theme：Proofreading mechanism of protein mislocalition
Keyword：Protein sorting, proofreading of protein mislocalization, mitochondria, Msp1
Research period： 2022.6
-
Research theme：Structural biology of novel CRISPR-Cas related proteins
Keyword：CRISPR, CRISPR-associated proteins, Structural biology
Research period： 2020.8 - 2022.3
Awards
-
2022年度 JAICI賞
2022.12 一般社団法人化学情報協会
-
2022年度 日本生化学会奨励賞
2022.11 日本生化学会
Papers
-
GET pathway mediates transfer of mislocalized tail-anchored proteins from mitochondria to the ER Reviewed International journal
Matsumoto S., Ono S., Shinoda S., Kakuta C., Okada S., Ito T., Numata T., Endo T.
Journal of Cell Biology ( 221 ) e202104076 2022.6
-
Msp1 Clears Mistargeted Proteins by Facilitating Their Transfer from Mitochondria to the ER. Reviewed International journal
Matsumoto, S., Nakatsukasa, K., Kakuta, C., Tamura, Y., Esaki, M., Endo, T.
Molecular Cell 76 ( 1 ) 191 - 205 2019.8
-
Tethering an N-Glycosylation Sequon-Containing Peptide Creates a Catalytically Competent Oligosaccharyltransferase Complex. Reviewed International journal
Matsumoto, S., Taguchi, Y., Shimada, A., Igura, M., Kohda, D.
Biochemistry 56 ( 4 ) 602 - 611 2017.1
-
Crystal structures of an archaeal oligosaccharyltransferase provide insights into the catalytic cycle of N-linked protein glycosylation. Reviewed International journal
Matsumoto, S., Shimada, A., Nyirenda, J., Igura, M., Kawano, Y., Kohda, D.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 110 ( 44 ) 17868 - 17873 2013.10
-
Defective import of mitochondrial metabolic enzyme elicits ectopic metabolic stress Reviewed International journal
Nishio, K., Kawarasaki, T., Sugiura, Y., Matsumoto, S., Konoshima, A., Takano, Y., Hayashi, M., Okumura, F., Kamura, T., Mizushima, T., Nakatsukasa, K.
Science Advances 9 ( 15 ) eadf1956 2023.4
-
Myristoyl group-aided protein import into the mitochondrial intermembrane space. Reviewed International journal
Ueda, E., Tamura, Y., Sakaue, H., Kawano, S., Kakuta, C., Matsumoto, S., Endo, T.
Scientific Reports 9 1185 2019.2
-
Structural elucidation of an asparagine-linked oligosaccharide from the hyperthermophilic archaeon. Reviewed International journal
Fujinami, D., Nyirenda, J., Matsumoto, S., Kohda, D.
Carbohydrate Research 2 ( 413 ) 55 - 62 2015.9
Presentations
-
膜タンパク質局在化における配送校正機構の解明 Invited
松本 俊介、小野 鈴花、遠藤 斗志也
第95回日本生化学会大会 2022.11
-
ミトコンドリア外膜に誤配送されたテイルアンカー型タンパク質の配送校正機構 Invited
松本俊介、小野鈴花、遠藤斗志也
第２２回日本蛋白質科学会年会 2022.6
-
Proofreading of protein mislocalization mediated by a mitochondrial AAA-ATPase Msp1 Invited
Shunsuke Matsumoto, Suzuka Ono, Toshiya Endo
2021.12
-
テイルアンカー型タンパク質の局在化における配送校正機構の解析
松本 俊介
令和4年度日本生化学会 九州支部例会 2022.6
-
ミトコンドリアAAA-ATPアーゼMsp1による誤配送タンパク質の配送校正機構 Invited
松本俊介、小野鈴花、遠藤斗志也
第94回日本生化学会大会 2021.11
-
２つのAAA-ATPアーゼによるミトコンドリア外膜に誤局在したテイルアンカータンパク質の分解機構 Invited
松本俊介， 中務邦雄， 田村康， 江崎雅俊， 遠藤斗志也
第41回日本分子生物学会年会 2018.11
-
Degradation pathway mediated by the two AAA-ATPase Msp1 and Cdc48 for the mistargeted tail-anchored proteins on the mitochondrial outer membrane
2018.6
MISC
-
Msp1-mediated proofreading mechanism for localization of tail-anchored membrane proteins Reviewed
Shunsuke Matsumoto
Journal of Biochemistry 2023.3
-
Proofreading of protein localization mediated by a mitochondrial AAA-ATPase Msp1 Reviewed
Shunsuke Matsumoto, Toshiya Endo
Journal of Biochemistry 2023.3
-
テイルアンカー型タンパク質のオルガネラ局在化における配送校正機構 Reviewed
松本 俊介
2023.2
-
膜タンパク質の局在化における配送校正機構 Reviewed
松本 俊介
化学と生物 2022.10
-
ミトコンドリアAAA-ATPアーゼMsp1による誤配送タンパク質の配送校正機構 Reviewed
松本俊介, 遠藤斗志也
生化学 2022.6
-
N型糖鎖修飾におけるアスパラギン側鎖アミド基の活性化機構の構造基盤 Reviewed
松本俊介、神田大輔
日本生物物理学会 学会誌 2014.6
Professional Memberships
-
日本蛋白質科学会、日本細胞生物学会、日本生化学会、日本農芸化学会
Research Projects
-
タンパク質局在化における校正機構の分子構造基盤の解明
Grant number：23H02437 2023 - 2025
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(B)
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
-
独自のメタゲノムデータに基づく新規CRISRP-Cas系の機能構造解析と探索
Grant number：23K17995 2023 - 2025
日本学術振興会 科学研究費助成事業 挑戦的研究（萌芽）
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
-
新規CRISPR-Casシステムを利用したゲノム編集ツール開発
2022 - 2023
令和４年度大学院農学研究院若手教員支援事業（共同研究プロジェクト支援）
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
-
木下基礎科学研究基金助成／タンパク質の誤配送を校正する膜引き抜き酵素の構造学的研究
2022
Grant type：Donation
-
第33回加藤記念研究助成/新規CRISPR/Casシステムの機能構造解析とゲノム編集ツール開発
2022
Grant type：Donation
-
日本応用酵素協会研究助成/膜引き抜きATPアーゼを介した細胞内タンパク質配送の校正機構の解明
2022
Grant type：Donation
-
新規Casタンパク質の機能構造解析とゲノム編集技術への応用
2021 - 2022
令和３年度農学研究院若手教員支援事業(チャレンジ研究支援(I型))
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
-
武田科学振興財団ライフサイエンス研究助成/タンパク質の細胞内配送の校正に関わる新規因子の探索と機構解明
2021
Grant type：Donation
-
ミトコンドリアタンパク質輸送における校正機構の解明
2020.4 - 2023.3
九州大学
Authorship：Principal investigator
真核生物の細胞内でつくられるタンパク質は，それぞれ働く場所が決まっており，そのタンパク質が働くべき場所に運ばれることが，正常な細胞機能には不可欠である．これまでは，本来の局在場所とは異なる別の場所に誤配送されたタンパク質は細胞の品質管理システムにより，速やかに分解除去されると考えられてきた．申請者は，ミトコンドリア外膜に存在するAAA-ATPアーゼMsp1がミトコンドリア移行に失敗した前駆体を外膜から引き抜くことで，分解ではなく配送のやり直しの機会を与える因子であることを見出した．本研究は，Msp1を介したミトコンドリアタンパク質輸送における「校正機構」の分子基盤を解明することを目的とする．
-
ミトコンドリアタンパク質輸送における校正機構の解明
Grant number：20K15794 2020 - 2022
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
-
ミトコンドリア外膜のAAA-ATPase Msp1によるタンパク質品質管理機構
Grant number：16K21471 2016 - 2019
科学研究費助成事業 若手研究(A,B)
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
-
ミトコンドリア内膜トランスロケータＴＩＭ２３とＴＩＭ２２複合体の構造生物学的解析
2015 - 2018
日本学術振興会 特別研究員
Authorship：Principal investigator Grant type：Joint research
Class subject
-
Microbiology
2024.4 - 2024.9 First semester
-
生物機能分子化学Ⅰ（E科目）
2024.4 - 2024.6 Spring quarter
-
Microbiology Ⅱ
2023.6 - 2023.8 Summer quarter
-
生物機能分子化学Ⅱ
2023.4 - 2023.9 First semester
-
生物機能分子化学Ⅰ
2022.4 - 2022.9 First semester