2024/11/26 更新

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ホリサワ ケンイチ
堀澤 健一
HORISAWA KENICHI
所属
生体防御医学研究所 細胞機能制御学部門 准教授
医学系学府 医学専攻(併任)
医学系学府 医科学専攻(併任)
職名
准教授
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学位

  • 博士(理学)

経歴

  • 株式会社羊土社

    株式会社羊土社

  • 慶應義塾大学理工学部

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ:肝再生と代謝の関連性の研究

    研究キーワード:肝臓、代謝、再生

    研究期間: 2018年8月 - 2020年7月

  • 研究テーマ:脂質代謝と転写のクロストークに関する研究

    研究キーワード:脂質代謝、転写

    研究期間: 2016年4月 - 2019年3月

  • 研究テーマ:肝臓の発生および肝細胞ダイレクトリプログラミングの分子機構の解明

    研究キーワード:肝臓、臓器発生、ダイレクトリプログラミング、エピジェネティクス、プロテオミクス

    研究期間: 2013年12月 - 2018年11月

受賞

  • 上原記念生命科学財団 研究助成金

    2022年3月  

  • 上原記念生命科学財団 研究助成金

    2022年3月  

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  • 臨床医学振興財団 医学研究資金助成

    2021年12月  

  • 日揮・実吉奨学会 研究助成

    2010年6月  

  • 武田科学振興財団 一般研究奨励

    2008年11月  

  • Certificate

    2006年8月  

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論文

  • Transcription factor-mediated direct cellular reprogramming yields cell-type specific DNA methylation signature 査読 国際誌

    Kenichi Horisawa Shizuka Miura Hiromitsu Araki Fumihito Miura Takashi Ito Atsushi Suzuki

    Scientific Reports   13 ( 1 )   22317   2023年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-023-49546-8

  • Direct Conversion of Human Endothelial Cells Into Liver Cancer-Forming Cells Using Nonintegrative Episomal Vectors 査読 国際誌

    Goya, T; Horisawa, K; Udono, M; Ohkawa, Y; Ogawa, Y; Sekiya, S; Suzuki, A

    HEPATOLOGY COMMUNICATIONS   6 ( 7 )   1725 - 1740   2022年2月   eISSN:2471-254X

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Hepatology Communications  

    Liver cancer is an aggressive cancer associated with a poor prognosis. Development of therapeutic strategies for liver cancer requires fundamental research using suitable experimental models. Recent progress in direct reprogramming technology has enabled the generation of many types of cells that are difficult to obtain and provide a cellular resource in experimental models of human diseases. In this study, we aimed to establish a simple one-step method for inducing cells that can form malignant human liver tumors directly from healthy endothelial cells using nonintegrating episomal vectors. To screen for factors capable of inducing liver cancer-forming cells (LCCs), we selected nine genes and one short hairpin RNA that suppresses tumor protein p53 (TP53) expression and introduced them into human umbilical vein endothelial cells (HUVECs), using episomal vectors. To identify the essential factors, we examined the effect of changing the amounts and withdrawing individual factors. We then analyzed the proliferation, gene and protein expression, morphologic and chromosomal abnormality, transcriptome, and tumor formation ability of the induced cells. We found that a set of six factors, forkhead box A3 (FOXA3), hepatocyte nuclear factor homeobox 1A (HNF1A), HNF1B, lin-28 homolog B (LIN28B), MYCL proto-oncogene, bHLH transcription factor (L-MYC), and Kruppel-like factor 5 (KLF5), induced direct conversion of HUVECs into LCCs. The gene expression profile of these induced LCCs (iLCCs) was similar to that of human liver cancer cells, and these cells effectively formed tumors that resembled human combined hepatocellular–cholangiocarcinoma following transplantation into immunodeficient mice. Conclusion: We succeeded in the direct induction of iLCCs from HUVECs by using nonintegrating episomal vectors. iLCCs generated from patients with cancer and healthy volunteers will be useful for further advancements in cancer research and for developing methods for the diagnosis, treatment, and prognosis of liver cancer.

    DOI: 10.1002/hep4.1911

    Web of Science

    Scopus

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  • Direct reprogramming of human umbilical vein- and peripheral blood-derived endothelial cells into hepatic progenitor cells. 招待 査読 国際誌

    #Inada H., Udono M., Matsuda-Ito K., Horisawa K., Ohkawa Y., Miura S., Goya T., #Yamamoto J., @Nagasaki M., @Ueno K., Saitou D., Suyama M., Maehara Y., Kumamaru W., Ogawa Y., Sekiya S., Suzuki A.

    Nat comm   11   2020年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-020-19041-z

  • The Dynamics of Transcriptional Activation by Hepatic Reprogramming Factors. 査読 国際誌

    Horisawa K., Udono M., @Ueno K., Ohkawa Y., @Nagasaki M., Sekiya S., Suzuki A.

    Mol Cell   79   660 - 676   2020年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.molcel.2020.07.012

  • Generation of Nanog reporter mice that distinguish pluripotent stem cells from unipotent primordial germ cells 招待 査読 国際誌

    #Terada, Maiko; Kawamata, Masaki; #Kimura, Ryota; Sekiya, Sayaka; Nagamatsu, Go; Hayashi, Katsuhiko; Horisawa, Kenichi; Suzuki, Atsushi

    GENESIS   57 ( 11-12 )   2019年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/dvg.23334

  • Prolonged inhibition of hepatocellular carcinoma cell proliferation by combinatorial expression of defined transcription factors. 査読 国際誌

    Takashima Y, Horisawa K, Udono M, Ohkawa Y, Suzuki A.

    Cancer Sci.   109 ( 11 )   3543 - 3553   2018年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/cas.13798.

  • Kupffer cells induce Notch-mediated hepatocyte conversion in a common mouse model of intrahepatic cholangiocarcinoma. 招待 査読 国際誌

    Sci Rep.   6   34691 - 34691   2016年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: doi: 10.1038/srep34691.

  • Endosomal escape efficiency of fusogenic B18 and B55 peptides fused with anti-EGFR single chain Fv as estimated by nuclear translocation. 査読 国際誌

    @Niikura K, Horisawa K, @Doi N

    J Biochem.   159 ( 1 )   123 - 132   2016年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/jb/mvv083.

  • A fusogenic peptide from a sea urchin fertilization protein promotes intracellular delivery of biomacromolecules by facilitating endosomal escape. 査読 国際誌

    @Niikura K, Horisawa K, @Doi N

    J Control Release   212   85 - 93   2015年8月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.jconrel.2015.06.020

  • Electrochemical detection of tyrosine derivatives and protein tyrosine kinase activity using boron-doped diamond electrodes 査読 国際誌

    @Chiku M., Horisawa K., @Doi N., @Yanagawa H., @Einaga Y.

    BIOSENSORS & BIOELECTRONICS   26 ( 1 )   235 - 240   2010年9月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bios.2010.06.027

  • 3 '-Untranslated region of doublecortin mRNA is a binding target of the Musashi1 RNA-binding protein 査読 国際誌

    Horisawa K., @Imai T., @Okano H., @Yanagawa H.

    FEBS LETTERS   583 ( 14 )   2429 - 2434   2009年7月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.febslet.2009.06.045

  • Use of cDNA Tiling Arrays for Identifying Protein Interactions Selected by In Vitro Display Technologies 査読 国際誌

    Horisawa K., @Doi N., @Yanagawa H.

    PLOS ONE   3 ( 2 )   2008年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0001646

  • Affinity selection of DNA-binding protein complexes using mRNA display 査読 国際誌

    @Tateyama S., Horisawa K., @Takashima H., @Miyamoto-Sato E., @Doi N., @Yanagawa H.

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   34 ( 3 )   2006年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gnj025

  • Cell-free cotranslation and selection using in vitro virus for high-throughput analysis of protein-protein interactions and complexes 査読 国際誌

    @Miyamoto-Sato E., @Ishizaka M., Horisawa K., @Tateyama S., @Takashima H., @Fuse S., @Sue K., @Hirai N., @Masuoka K., @Yanagawa H.

    GENOME RESEARCH   15 ( 5 )   710 - 717   2005年5月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1101/gr.3510505

  • Application of quantitative real-time PCR for monitoring the process of enrichment of clones on in vitro protein selection 査読 国際誌

    Horisawa K., @Doi N., @Takashima H., @Yanagawa H.

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   137 ( 2 )   121 - 124   2005年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • In vitro selection of Jun-associated proteins using mRNA display 査読 国際誌

    Horisawa K., @Tateyama S., @Ishizaka M., @Matsumura N., @Takashima H., @Miyamoto-Sato E., @Doi N., @Yanagawa H.

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   32 ( 21 )   2004年12月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gnh167

  • Highly stable and efficient mRNA templates for mRNA-protein fusions and C-terminally labeled proteins 査読 国際誌

    @Miyamoto-Sato E., @Takashima H., @Fuse S., @Sue K., @Ishizaka M., @Tateyama S., @Horisawa K., @Sawasaki T., @Endo Y., @Yanagawa H.

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   31 ( 15 )   2003年8月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gng078

  • Hepatocytes differentiate into intestinal epithelial cells through a hybrid epithelial/mesenchymal cell state in culture 国際誌

    Miura, S; Horisawa, K; Iwamori, T; Tsujino, S; Inoue, K; Karasawa, S; Yamamoto, J; Ohkawa, Y; Sekiya, S; Suzuki, A

    NATURE COMMUNICATIONS   15 ( 1 )   3940 - 3940   2024年5月   eISSN:2041-1723

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Nature Communications  

    Hepatocytes play important roles in the liver, but in culture, they immediately lose function and dedifferentiate into progenitor-like cells. Although this unique feature is well-known, the dynamics and mechanisms of hepatocyte dedifferentiation and the differentiation potential of dedifferentiated hepatocytes (dediHeps) require further investigation. Here, we employ a culture system specifically established for hepatic progenitor cells to study hepatocyte dedifferentiation. We found that hepatocytes dedifferentiate with a hybrid epithelial/mesenchymal phenotype, which is required for the induction and maintenance of dediHeps, and exhibit Vimentin-dependent propagation, upon inhibition of the Hippo signaling pathway. The dediHeps re-differentiate into mature hepatocytes by forming aggregates, enabling reconstitution of hepatic tissues in vivo. Moreover, dediHeps have an unexpected differentiation potential into intestinal epithelial cells that can form organoids in three-dimensional culture and reconstitute colonic epithelia after transplantation. This remarkable plasticity will be useful in the study and treatment of intestinal metaplasia and related diseases in the liver.

    DOI: 10.1038/s41467-024-47869-2

    Web of Science

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  • PRMT1 Sustains <i>De Novo</i> Fatty Acid Synthesis by Methylating PHGDH to Drive Chemoresistance in Triple-Negative Breast Cancer 査読 国際誌

    Yamamoto, T; Hayashida, T; Masugi, Y; Oshikawa, K; Hayakawa, N; Itoh, M; Nishime, C; Suzuki, M; Nagayama, A; Kawai, Y; Hishiki, T; Matsuura, T; Naito, Y; Kubo, A; Yamamoto, A; Yoshioka, Y; Kurahori, T; Nagasaka, M; Takizawa, M; Takano, N; Kawakami, K; Sakamoto, M; Wakui, M; Yamamoto, T; Kitagawa, Y; Kabe, Y; Horisawa, K; Suzuki, A; Matsumoto, M; Suematsu, M

    CANCER RESEARCH   84 ( 7 )   1065 - 1083   2024年4月   ISSN:0008-5472 eISSN:1538-7445

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Cancer Research  

    Triple-negative breast cancer (TNBC) chemoresistance hampers the ability to effectively treat patients. Identification of mechanisms driving chemoresistance can lead to strategies to improve treatment. Here, we revealed that protein arginine methyltransferase-1 (PRMT1) simultaneously methylates D-3-phosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH), a critical enzyme in serine synthesis, and the glycolytic enzymes PFKFB3 and PKM2 in TNBC cells. 13C metabolic flux analyses showed that PRMT1-dependent methylation of these three enzymes diverts glucose toward intermediates in the serine-synthesizing and serine/glycine cleavage pathways, thereby accelerating the production of methyl donors in TNBC cells. Mechanistically, PRMT1-dependent methylation of PHGDH at R54 or R20 activated its enzymatic activity by stabilizing 3-phos-phoglycerate binding and suppressing polyubiquitination. PRMT1-mediated PHGDH methylation drove chemoresistance independently of glutathione synthesis. Rather, activation of the serine synthesis pathway supplied a-ketoglutarate and citrate to increase palmitate levels through activation of fatty acid synthase (FASN). Increased palmitate induced protein S-palmitoylation of PHGDH and FASN to further enhance fatty acid synthesis in a PRMT1-dependent manner. Loss of PRMT1 or pharmacologic inhibition of FASN or protein S-palmitoyltransferase reversed chemoresistance in TNBC. Furthermore, IHC coupled with imaging MS in clinical TNBC specimens substantiated that PRMT1-mediated methylation of PHGDH, PFKFB3, and PKM2 correlates with chemoresistance and that metabolites required for methylation and fatty acid synthesis are enriched in TNBC. Together, these results suggest that enhanced de novo fatty acid synthesis mediated by coordinated protein arginine methylation and protein S-palmitoylation is a therapeutic target for overcoming chemoresistance in TNBC. Significance: PRMT1 promotes chemoresistance in TNBC by methylating metabolic enzymes PFKFB3, PKM2, and PHGDH to augment de novo fatty acid synthesis, indicating that targeting this axis is a potential treatment strategy.

    DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-23-2266

    Web of Science

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  • Transcription factor-mediated direct cellular reprogramming yields cell-type specific DNA methylation signature 査読

    Horisawa, K; Miura, S; Araki, H; Miura, F; Ito, T; Suzuki, A

    SCIENTIFIC REPORTS   13 ( 1 )   22317   2023年12月   ISSN:2045-2322 eISSN:2045-2322

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Scientific Reports  

    Direct reprogramming, inducing the conversion of one type of somatic cell into another by the forced expression of defined transcription factors, is a technology with anticipated medical applications. However, due to the many unresolved aspects of the induction mechanisms, it is essential to thoroughly analyze the epigenomic state of the generated cells. Here, we performed comparative genome-wide DNA methylation analyses of mouse embryonic fibroblasts (MEFs) and cells composing organoids formed by intestinal stem cells (ISCs) or induced ISCs (iISCs) that were directly induced from MEFs. We found that the CpG methylation state was similar between cells forming ISC organoids and iISC organoids, while they differed widely from those in MEFs. Moreover, genomic regions that were differentially methylated between ISC organoid- and iISC organoid-forming cells did not significantly affect gene expression. These results demonstrate the accuracy and safety of iISC induction, leading to the medical applications of this technology.

    DOI: 10.1038/s41598-023-49546-8

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    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41598-023-49546-8

  • The role of pioneer transcription factors in the induction of direct cellular reprogramming

    Horisawa, K; Suzuki, A

    REGENERATIVE THERAPY   24   112 - 116   2023年12月   ISSN:2352-3204

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Regenerative Therapy  

    Regenerative medicine is a highly advanced medical field that aims to restore tissues and organs lost due to diseases and injury using a person's own cells or those of others. Direct cellular reprogramming is a promising technology that can directly induce cell-fate conversion from terminally differentiated cells to other cell types and is expected to play a pivotal role in applications in regenerative medicine. The induction of direct cellular reprogramming requires one or more master transcription factors with the potential to reconstitute cell type-specific transcription factor networks. The set of master transcription factors may contain unique transcription factors called pioneer factors that can open compacted chromatin structures and drive the transcriptional activation of target genes. Therefore, pioneer factors may play a central role in direct cellular reprogramming. However, our understanding of the molecular mechanisms by which pioneer factors induce cell-fate conversion is still limited. This review briefly summarizes the outcomes of recent findings and discusses future perspectives, focusing on the role of pioneer factors in direct cellular reprogramming.

    DOI: 10.1016/j.reth.2023.06.002

    Web of Science

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  • 特集 クロマチンによる転写制御機構の最前線 Ⅳ.転写制御と生命現象 ダイレクトリプログラミングと転写制御

    堀澤 健一, 鈴木 淳史

    生体の科学   74 ( 3 )   245 - 249   2023年6月   ISSN:03709531 eISSN:18835503

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    出版者・発行元:株式会社医学書院  

    DOI: 10.11477/mf.2425201683

    CiNii Research

  • Meiosis-specific ZFP541 repressor complex promotes developmental progression of meiotic prophase towards completion during mouse spermatogenesis. 招待 査読 国際誌

    @Horisawa-Takada Y., @Kodera C., @Takemoto K., @Sakashita A., Horisawa K., @Maeda R., @Shimada R., @Usuki S., @Fujimura S., @Tani N., @Matsuura K., @Akiyama T., Suzuki A., @Niwa H., @Tachibana M., @Ohba T., @Katabuchi H., @Namekawa S., @Araki K., @Ishiguro K.

    Nat comm   12 ( 1 )   2021年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-021-23378-4

  • In vitro selection of bispecific diabody fragments using covalent bicistronic DNA display. 査読 国際誌

    @Nakayama M, @Komiya S, @Fujiwara K, Horisawa K, @Doi N

    Biochem Biophys Res Commun.   478 ( 2 )   606 - 611   2016年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.07.113.

  • PURE mRNA display for in vitro selection of single-chain antibodies. 査読 国際誌

    @Nagumo Y, @Fujiwara K, Horisawa K, @Yanagawa H, @Doi N

    J Biochem.   5 ( 159 )   519 - 526   2016年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: doi: 10.1093/jb/mvv131

  • Development of μtas for high-throughput screening of nad(p)-dependent oxidoreductases. 査読 国際誌

    @Shimokihara S, @Shitara S, @Oyobiki R, @Watanabe T, @Einaga Y, @Matsumoto Y, @Fujiwara K, Horisawa K, @Doi N

    1302 - 1304   2015年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

  • Toward high-throughput screening of NAD(P)-dependent oxidoreductases using boron-doped diamond microelectrodes and microfluidic devices. 査読 国際誌

    @Oyobiki R, @Kato T, @Katayama M, @Sugitani A, @Watanabe T, @Einaga Y, @Matsumoto Y, Horisawa K, @Doi N

    Anal Chem.   86 ( 19 )   9570 - 9575   2014年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ac501907x.

  • Structural basis for inhibition of the MDM2:p53 interaction by an optimized MDM2-binding peptide selected with mRNA display. 査読 国際誌

    @Nagata T, @Shirakawa K, @Kobayashi N, @Shiheido H, @Tabata N, @Sakuma-Yonemura Y, Horisawa K, @Katahira M, @Doi N, @Yanagawa H

    PLoS One.   9 ( 10 )   e109163 - e109163   2014年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0109163

  • MIP-2A Is a Novel Target of an Anilinoquinazoline Derivative for Inhibition of Tumour Cell Proliferation 査読 国際誌

    @Tokunaga M., @Shiheido H., @Tabata N., @Sakuma-Yonemura Y., @Takashima H., Horisawa K., @Doi N., @Yanagawa H.

    PLOS ONE   8 ( 9 )   2013年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0076774

  • Hereditary Spastic Paraplegia Protein Spartin Is an FK506-Binding Protein Identified by mRNA Display 査読 国際誌

    @Tokunaga M., @Shiheido H., @Hayakawa I., @Utsumi A., @Sakuma-Yonemura Y., @Tabata N., @Takashima H., @Doi N., Horisawa K., @Sakuma-Yonemura Y., @Tabata N., @Yanagawa H.

    CHEMISTRY & BIOLOGY   20 ( 7 )   935 - 942   2013年7月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.chembiol.2013.05.011

  • DNA Display Selection of Peptide Ligands for a Full-Length Human G Protein-Coupled Receptor on CHO-K1 Cells 査読 国際誌

    @Doi N., @Yamakawa N., @Matsumoto H., @Yamamoto Y., @Nagano T., @Matsumura N., Horisawa K., @Yanagawa H.

    PLOS ONE   7 ( 1 )   2012年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0030084

  • Construction of glomerular epithelial cells in vitro for removal of immune complex 査読 国際誌

    @Wang PC., Horisawa K., @Matsumura M.

    Journal of Artificial Organs   2   170 - 175   1999年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • 免疫複合体の除去能を強化した腎糸球体上皮細胞の構築 査読

    @王碧昭, @堀澤健一, @高躍華, @松村正利

    人工臓器   28   11 - 14   1999年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • 免疫複合体の除去に効果的な培養細胞腎糸球体上皮細胞の構築:人工腎臓への新しい試み 招待 査読

    @王碧昭, @堀澤健一, @高躍華, @松村正利, @沖垣達

    重井医学年報   19   13 - 19   1997年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

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書籍等出版物

  • 生体の科学 特集 クロマチンによる転写制御機構の最前線 Ⅳ.転写制御と生命現象 「ダイレクトリプログラミングと転写制御」

    堀澤健一、鈴木淳史( 担当: 共著)

    医学書院  2023年6月 

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    担当ページ:第74巻 第3号   記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • 生体の科学 特集 クロマチンによる転写制御機構の最前線 Ⅳ.転写制御と生命現象 「ダイレクトリプログラミングと転写制御」

    堀澤健一, 鈴木淳史( 担当: 共著)

    医学書院  2023年6月 

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    記述言語:日本語   著書種別:学術書

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  • ダイレクトリプログラミング最前線(鈴木淳史・編) 第2編 第8章 ダイレクトリプログラミングを用いたがん細胞制御と腫瘍抑制

    堀澤 健一、鈴木 淳史( 担当: 共著)

    株式会社 エヌ・ディー・エス  2020年8月 

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    記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • 細胞工学別冊 ダイレクトリプログラミング :目的細胞別 遺伝子導入・培養条件・機能解析リファレンス

    堀澤 健一, 鈴木 淳史( 担当: 共著)

    学研メディカル秀潤社  2015年3月 

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    記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • “Chapter 4: Applications of the In Vitro Virus (IVV) Method for Various Protein Functional Analyses” Protein Engineering - Technology and Application

    ( 担当: 共著)

    2013年5月 

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    担当ページ:pp.85-110   記述言語:英語   著書種別:学術書

  • “Chapter 10: Musashi Proteins in Neural Stem/Progenitor Cells” Neural Stem Cells and Therapy

    ( 担当: 共著)

    2012年2月 

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    担当ページ:pp.205-222   記述言語:英語   著書種別:学術書

  • 「In vitro virus法」 ナノバイオ大事典テクノロジー編

    堀澤 健一, 土居 信英( 担当: 共著)

    テクノシステム  2007年1月 

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    担当ページ:p.69   記述言語:日本語   著書種別:学術書

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講演・口頭発表等

  • ダイレクトリプログラミング誘導転写因子の発現量と相関する3次元ゲノム構造変化の解析

    堀澤健一

    先進ゲノム支援拡大班会議  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • ダイレクトリプログラミング誘導転写因子の発現量と相関する3次元ゲノム構造変化の解析

    堀澤健一

    先進ゲノム支援拡大班会議  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:横浜   国名:日本国  

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  • 細胞運命の直接転換と形質維持における転写因子の機能

    堀澤健一 鈴木淳史

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 転写因子の組み合わせによる細胞の運命決定機構の解明

    #鈴木 陵雅 堀澤 健一 三浦 静 大川 恭行 鈴木 淳史

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 細胞運命の直接転換と形質維持における転写因子の機能

    堀澤健一 鈴木淳史

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:神戸   国名:日本国  

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  • 転写因子の組み合わせによる細胞の運命決定機構の解明

    鈴木 陵雅 堀澤 健一 三浦 静 大川 恭行 鈴木 淳史

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    開催年月日: 2023年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:神戸   国名:日本国  

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  • 細胞運命の直接転換と形質維持に関する転写因子の役割 招待

    堀澤健一 鈴木淳史

    第96回日本生化学会大会  2023年11月 

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    開催年月日: 2023年10月 - 2023年11月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:福岡国際会議場(福岡)   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングは、iPS細胞の様な初期化状態を経ることなく、終末分化した体細胞から他の系譜の細胞を直接分化誘導する技術であり、細胞移植療法などの医療への応用が期待されている。準備できる細胞の量や、分化誘導に際しての時間的・費用的コストなどの点でiPS細胞に対して優位性があるだけでなく、生体内においてin situで標的細胞を誘導する手法も開発されており、iPS細胞を補完する次世代の再生医療技術として旺盛に研究が進められている。ダイレクトリプログラミングは多くの場合、標的細胞の分化や機能維持に関与する転写因子のセットを異所的に強制発現することで実現する。我々が研究を進めている誘導肝細胞様細胞(iHepC)においては、Hnf4aに加えてFoxa1、Foxa2、Foxa3のいずれか1つを導入することにより細胞運命の人為的な転換を引き起こすことができる。これまでの我々の研究によって、Hnf4aとFoxaが協調的に働くメカニズムが明らかになってきた。特にパイオニア因子として知られるFoxaの文字通り先導的なクロマチン結合は、標的遺伝子の制御領域に結合してクロマチンを弛緩させ、それに続いて共結合因子であるHnf4aを近傍にリクルートし転写を活性化させるという、リプログラミング進行のトリガーであることが示された。しかし、導入転写因子の働きにはまだ不明な部分も多い。例えば、リプログラミング過程で転写が抑制される遺伝子に対してもFoxaの結合は見られるが、その制御に直接的に関与しているのか? 転写制御の際にクロマチン状態をどのように変化させているのか? 導入されたホスト体細胞内において、制御対象とする標的遺伝子をどの様に選別しているのか? 分化転換後の細胞の機能維持に対してどのような影響を与えているのか? など、まだ非常に多くの謎が 残されている。本発表では、iHepCに対する次世代シークエンサー解析を主体とした様々な解析から解き明かされてきた、導入転写因子の挙動や働きについて紹介し、ダ イレクトリプログラミングにおける転写因子セットの役割について議論したい。

  • 細胞運命の直接転換と形質維持に関する転写因子の役割 招待

    堀澤健一 鈴木淳史

    第96回日本生化学会大会  2023年11月 

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    開催年月日: 2023年10月 - 2023年11月

    記述言語:日本語  

    開催地:福岡国際会議場(福岡)   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングは、iPS細胞の様な初期化状態を経ることなく、終末分化した体細胞から他の系譜の細胞を直接分化誘導する技術であり、細胞移植療法などの医療への応用が期待されている。準備できる細胞の量や、分化誘導に際しての時間的・費用的コストなどの点でiPS細胞に対して優位性があるだけでなく、生体内においてin situで標的細胞を誘導する手法も開発されており、iPS細胞を補完する次世代の再生医療技術として旺盛に研究が進められている。ダイレクトリプログラミングは多くの場合、標的細胞の分化や機能維持に関与する転写因子のセットを異所的に強制発現することで実現する。我々が研究を進めている誘導肝細胞様細胞(iHepC)においては、Hnf4aに加えてFoxa1、Foxa2、Foxa3のいずれか1つを導入することにより細胞運命の人為的な転換を引き起こすことができる。これまでの我々の研究によって、Hnf4aとFoxaが協調的に働くメカニズムが明らかになってきた。特にパイオニア因子として知られるFoxaの文字通り先導的なクロマチン結合は、標的遺伝子の制御領域に結合してクロマチンを弛緩させ、それに続いて共結合因子であるHnf4aを近傍にリクルートし転写を活性化させるという、リプログラミング進行のトリガーであることが示された。しかし、導入転写因子の働きにはまだ不明な部分も多い。例えば、リプログラミング過程で転写が抑制される遺伝子に対してもFoxaの結合は見られるが、その制御に直接的に関与しているのか? 転写制御の際にクロマチン状態をどのように変化させているのか? 導入されたホスト体細胞内において、制御対象とする標的遺伝子をどの様に選別しているのか? 分化転換後の細胞の機能維持に対してどのような影響を与えているのか? など、まだ非常に多くの謎が 残されている。本発表では、iHepCに対する次世代シークエンサー解析を主体とした様々な解析から解き明かされてきた、導入転写因子の挙動や働きについて紹介し、ダ イレクトリプログラミングにおける転写因子セットの役割について議論したい。

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  • Elucidation of Reprogramming Mechanism in Induced Fetal Intestinal Progenitor Cells

    #Ryoga Suzuki , Kenichi Horisawa , Shizuka Miura , Yasuyuki Ohkawa , Atsushi Suzuki

    2022年7月 

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    開催年月日: 2022年7月

    記述言語:英語  

    国名:日本国  

  • Elucidation of Reprogramming Mechanism in Induced Fetal Intestinal Progenitor Cells

    Ryoga Suzuki, Kenichi Horisawa, Shizuka Miura, Yasuyuki Ohkawa, Atsushi Suzuki

    第24回生医研リトリート2022  2022年7月 

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    開催年月日: 2022年7月

    記述言語:英語  

    開催地:唐津ホテル&リゾーツ   国名:日本国  

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  • 誘導腸幹細胞の線維芽細胞からの直接誘導過程におけるエピジェネティックリモデリングの解析

    堀澤健一、三浦静、荒木啓充、三浦史仁、伊藤隆司、鈴木淳史

    第15回日本エピジェネティクス研究会年会  2022年6月 

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    開催年月日: 2022年6月

    記述言語:日本語  

    開催地:九州大学病院キャンパス   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングとは、初期化を経ずに目的の細胞を直接誘導する技術であり、再生医療など幅広い分野での応用が期待されている。我々は、マウス胎仔線維芽細胞(MEF)にFoxa3/Cdx2/Gata6/Hnf4aの4つの転写因子を強制発現し、特定培養条件下で分化誘導させることにより、生体由来の腸幹細胞(ISC)と同じ様に腸上皮オルガノイドを形成できる成体型誘導腸幹細胞(iISC)の作製に成功した(Miura & Suzuki, 2017)。iISC由来の腸上皮オルガノイドは、その形態や遺伝子発現がISC由来オルガノイドに酷似しているだけでなく、全ての腸上皮組織構成細胞への多分化能と自己複製能、移植マウスにおける組織再構築能を有していた。 iPS細胞の誘導過程では大規模なDNA脱メチル化を始めとするドラスティックなエピゲノムのリモデリングが起こることが知られる(Kim et al., 2010)。一方でダイレクトリプログラミング過程におけるエピジェネティックリモデリングはまだ報告が少なく、それぞれの細胞への分化誘導過程において何が起こるのか不明な部分が多い。そこで本研究では、MEF、ISC、iISCの3種類の細胞について、Post-bisulfite adaptor-tagging (PBAT)法によるメチローム解析を行い、リプログラミング時のDNAメチル化の変動や生体由来細胞との差異、転写への影響などについて詳細な比較解析を行なった。その結果、iISCリプログラミングではDNAメチル化、脱メチル化がそれぞれ同時に進行し、ISCと類似したメチル化状態に収束することが分かった。

  • 誘導腸幹細胞の線維芽細胞からの直接誘導過程におけるエピジェネティックリモデリングの解析

    堀澤健一, 三浦静, 荒木啓充, 三浦史仁, 伊藤隆司, 鈴木淳史

    第15回日本エピジェネティクス研究会年会  2022年6月 

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    開催年月日: 2022年6月

    記述言語:日本語  

    開催地:九州大学病院キャンパス   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングとは、初期化を経ずに目的の細胞を直接誘導する技術であり、再生医療など幅広い分野での応用が期待されている。我々は、マウス胎仔線維芽細胞(MEF)にFoxa3/Cdx2/Gata6/Hnf4aの4つの転写因子を強制発現し、特定培養条件下で分化誘導させることにより、生体由来の腸幹細胞(ISC)と同じ様に腸上皮オルガノイドを形成できる成体型誘導腸幹細胞(iISC)の作製に成功した(Miura & Suzuki, 2017)。iISC由来の腸上皮オルガノイドは、その形態や遺伝子発現がISC由来オルガノイドに酷似しているだけでなく、全ての腸上皮組織構成細胞への多分化能と自己複製能、移植マウスにおける組織再構築能を有していた。 iPS細胞の誘導過程では大規模なDNA脱メチル化を始めとするドラスティックなエピゲノムのリモデリングが起こることが知られる(Kim et al., 2010)。一方でダイレクトリプログラミング過程におけるエピジェネティックリモデリングはまだ報告が少なく、それぞれの細胞への分化誘導過程において何が起こるのか不明な部分が多い。そこで本研究では、MEF、ISC、iISCの3種類の細胞について、Post-bisulfite adaptor-tagging (PBAT)法によるメチローム解析を行い、リプログラミング時のDNAメチル化の変動や生体由来細胞との差異、転写への影響などについて詳細な比較解析を行なった。その結果、iISCリプログラミングではDNAメチル化、脱メチル化がそれぞれ同時に進行し、ISCと類似したメチル化状態に収束することが分かった。

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  • 肝細胞誘導転写因子のダイナミクス解析

    堀澤 健一, 鈴木淳史

    第14回日本エピジェネティクス研究会年会  2021年3月 

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    開催年月日: 2021年3月

    記述言語:日本語  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングは体細胞から直接、他系譜の細胞を誘導する技術であり、再生医療分野などへの応用が期待されている。細胞の分化転換のために転写因子セットの強制発現が行われるが、異所的に発現した転写因子が互いにどの様に影響し合いクロマチンににアプローチすることで分化誘導を引き起こしているのか、その分子機序の多くは不明である。 本研究ではHnf4αおよびFoxa1,2,3のいずれか1つという、2種の転写因子により誘導される誘導肝細胞様細胞(iHep細胞)をモデルとした。導入した転写因子、ヒストン修飾、RNAポリメラーゼII(Pol2)のChIP-seqやFAIRE-seqを行うことで、クロマチン状態の変化や転写因子の局在・挙動を解析すると同時に、RNA-seqによる転写状態の時系列的変化を計測することで、リプログラミング時の核内ダイナミクスを重層的なデータから解析した。 その結果、Foxaがパイオニア因子として働きクロマチンを開放することが、Hnf4αの結合を促進させ肝臓関連遺伝子の発現を亢進するという、予測された分子機構を確認することができた。また、リプログラミング過程で転写因子の結合位置が動的に変化することや、Foxa1/2が遺伝子遠位の制御領域に結合するのに対してFoxa3は遺伝子近位のプロモーター部位に結合すること、その様に結合部位が全く異なるにもかかわらず全てのFoxaがほぼ同じ遺伝子セットを標的とすること、Foxa3がPol2と物理的に連動してgenebody上を移動し転写誘導を行なっていることなど、多くの新規の分子メカニズムを明らかにすることができた。

  • 肝細胞へのダイレクトリプログラミングにおける転写因子機能の解析

    堀澤 健一, 鈴木 淳史

    第38回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会  2021年1月 

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    開催年月日: 2021年1月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

    ダイレクトリプログラミングは体細胞から直接、他系譜の細胞を誘導する技術であり、再生医療分野などへの応用が期待されている。多くの場合、細胞の運命転換を人工的に誘導するために、転写因子セットの強制発現という手法が用いられる。異所的に発現した複数種の転写因子が、互いにどの様に影響し合い、クロマチンに対してどの様にアプローチをすることで分化誘導を引き起こしているのか、その分子機序は未だ不明な部分が多い。 本研究ではHnf4αおよびFoxa1,2,3のいずれか1つという、2種の転写因子を導入することで誘導される誘導肝細胞様細胞(iHep細胞)をモデルとして[1]、ダイレクトリプログラミングの際に核内で起こるダイナミックな変化の解明を目標とした。導入した2種の転写因子、種々のヒストン修飾、RNAポリメラーゼII(Pol2)を標的としたChIP-seqやFAIRE-seqを行うことで、クロマチン状態の変化や転写関連分子の局在・挙動を解析すると同時に、RNA-seqによるトランスクリプトームの時系列的変化を計測することで、ダイレクトリプログラミング時の核内ダイナミクスを重層的なデータから解析した。 その結果、Foxaがパイオニア因子として働きクロマチンを開放することが、Hnf4αの結合を促進させ肝臓関連遺伝子の発現を亢進するという、あらかじめ予測された分子機構を実験的に確認することができた。また、リプログラミング過程で転写因子の結合位置が動的に変化することや、Foxa1および2が遺伝子遠位のエンハンサーと思われる部位に結合するのに対してFoxa3は遺伝子近位のプロモーター部位に結合すること、その様に結合部位が全く異なるにもかかわらず全てのFoxaがほぼ同じ遺伝子セットを標的とすること、Foxa3はPol2と連動してgenebody上を移動することで転写誘導を行なっていることなど、多くの新規の分子メカニズムを明らかにすることができた[2]。今回はそのなかでも特に、Foxaファミリー間の分子挙動の差異とFoxa3の特徴的な転写亢進の分子メカニズムについて紹介する。 [1] Sekiya S. & Suzuki A., (2011) Nature, 475, 390-393. [2] Horisawa K. et al., (2020) Mol. Cell, 79, 660-676.

  • 肝細胞への直接運命転換における解析

    #従野 雅義、堀澤 健一、鈴木 淳史

    細胞ダイバース 第3回若手ワークショップ  2020年2月 

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    開催年月日: 2020年2月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:静岡県熱海市   国名:日本国  

    肝臓は代謝や解毒など生命の維持に必要不可欠な機能を担っている臓器であるが、一度肝硬変に なってしまうと正常肝に戻すことが困難であり、末期肝がんや、急性肝不全など肝機能の回復が必 要な患者に対して生体肝移植がほぼ唯一の治療法となっている。しかし、ドナーへの侵襲性の高さ や、移植した細胞への免疫反応などの問題から、代替治療法の開発が期待されている。これらの問 題点を解決し得る 1 つの手法が、患者本人の細胞からダイレクトリプログラミング法や人工多能性 幹細胞(induced pluripotent stem cells: iPS 細胞)を介して作製した肝細胞を利用した細胞移植療法 である。 所属研究室では、ダイレクトリプログラミング法を用いて、マウスの線維芽細胞に肝臓の発生・ 分化に必須な転写因子である Foxa1, 2, 3 のいずれか 1 つと Hnf4αを導入することで、肝細胞様細 胞(induced hepatocyte-like cells: iHep 細胞)の作製に世界で初めて成功した。iHep 細胞は生体の肝 細胞と似た性質を持ち、細胞移植や薬剤代謝試験などに使用できることから、肝疾患治療や薬剤開 発への貢献が期待される。 しかし、iHep 細胞へのダイレクトリプログラミングの過程における分子機序についてはほとん どが明らかとなっていない。そこで、私たちは分子機序の解明を目的に様々な解析を行ってきた。本 ワークショップでは、その結果についてご紹介したい。

  • Trans-omic analysis for metabolic remodeling during liver regeneration

    2020年2月 

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    開催年月日: 2020年2月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • Trans-omic analysis for metabolic remodeling during liver regeneration 国際会議

    Kenichi Horisawa, Shizuka Miura, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Atsushi Suzuki

    The 29th Hot Spring Harbor International Symposium  2020年2月 

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    開催年月日: 2020年2月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    国名:日本国  

  • 肝再生に伴う脂質代謝変動のリピドーム解析

    堀澤健一 三浦静 鈴木淳史

    新学術領域研究「細胞社会ダイバーシティーの統合的解明と制御」 第4回公開シンポジウム  2019年6月 

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    開催年月日: 2019年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 肝細胞へのダイレクトリプログラミングを阻害する転写因子の同定

    #従野 雅義、堀澤 健一、鈴木 淳史

    新学術領域研究「クロマチン潜在能」 第1回 ワークショップ  2019年6月 

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    開催年月日: 2019年6月 - 2020年6月

    記述言語:日本語  

    開催地:愛知県蒲郡市   国名:日本国  

  • 部分肝切除後の肝再生に伴う代謝変動のメタボローム解析

    堀澤健一 三浦静 鈴木淳史

    新学術領域研究「クロマチン潜在能」 第1回 ワークショップ  2019年6月 

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    開催年月日: 2019年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:愛知県蒲郡市   国名:日本国  

  • 体細胞から肝細胞様細胞を誘導する転写因子の挙動および機能の解析

    堀澤健一,@植野和子,関谷明香,@成相直樹,@長﨑正朗,大川恭行,鈴木淳史

    AMED-CREST「エピゲノム」領域会議  2017年2月 

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    開催年月日: 2017年2月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:CIVI研修センター(東京)   国名:日本国  

    我々は、2つの転写因子(Hnf4a および Foxa1, 2 または 3)を分化した体細胞に強制発現することで、iPS 細胞の様な初期化状態を経るこ となく、肝細胞様の性質を有する細胞(iHep 細胞)を直接的に誘導することに成功した。この様な細胞の人為的分化転換技術は「ダイレク トリプログラミング」と呼ばれ、再生医療への応用が期待されている。しかし、強制発現した転写因子がゲノム上で時空間的にどのような 挙動を取り、最終的に iHep 細胞の分化を引き起こすのか、その分子メカニズムはほとんど明らかになっていなかった。そのため我々は、 iHep 細胞のダイレクトリプログラミング現象の包括的な理解を目指し、リプログラミング過程にける導入転写因子の挙動、クロマチン状態 および遺伝子発現変動の解析を、次世代シークエンサーを用いることでゲノムワイドに行った。その結果、Foxa が先行して標的部位に結合し、 続いて リクルートした Hnf4a と協調的に働くことで肝細胞特異的な遺伝子発現状態を惹起するという、iHep 細胞誘導の分子メカニズムの一 端を明らかにした。また、これまで相同的に働くと考えられてきた Foxa ファミリー転写因子が、ファミリー間で非常に異なる挙動を示しつ つも、最終的には同じ肝細胞特異的遺伝子セットの発現を活性化することも見出した。今回得られた知見は、高効率かつ安全なヒト iHep 細 胞樹立を実現するうえで重要な情報であり、再生医療への貢献が期待される。

  • iHep細胞の誘導過程における H3K4me3/H3K27me3 bivalent状態の解析

    堀澤健一,@植野和子,関谷明香,@成相直樹,@長﨑正朗,大川恭行,鈴木淳史

    AMED-CREST「エピゲノム」領域会議  2016年1月 

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    開催年月日: 2016年1月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:メルパルク熊本(熊本)   国名:日本国  

    我々は、体細胞に2つの転写因子(Hnf4a および Foxa1, 2 または 3)を強制発現することで、iPS 細胞の様な初期化状態を経ることなく、分 化した肝細胞様の細胞(iHep 細胞)を in vitro で直接誘導することに成功した。この様な細胞の人為的分化転換技術は「ダイレクトリプログラ ミング」と呼ばれ、再生医療への応用が期待されている。しかし、転写因子の強制発現後、どのような細胞内の変化が iHep 細胞の分化を引き 起こすのか、詳細なメカニズムはほとんど明らかになっていなかった。我々は、転写因子導入に起因するエピゲノム変動が、ダイレクトリプロ グラミングを理解する鍵であると考え、ChIP-Seq を中心としたエピゲノム解析を推進してきた。その結果、転写因子導入から 48 時間後のリプ ログラミング初期の細胞(右図 , 48hr)において、H3K4me3 および H3K27me3 シグナルが共に上昇した bivalent 領域が生じ、iHep 細胞の樹 立に伴いその bivalent 状態が解消される可能性が示唆された。そこで本研究では、bivalent 領域を有する代表的な細胞である ES および iPS 細 胞とのエピゲノムの比較を行うと共に、bivalent 状態の誘導が強制発現した転写因子のゲノムへの結合に起因するものかを検証した。また、 Proximity ligation assay(PLA)を行い、転写因子導入 48 時間後の細胞における bivalent 領域の増減を実験的にも検証した。

  • 肝細胞様細胞へのダイレクトリプログラミングにおける発現変動遺伝子座のエピゲノム解析

    堀澤健一,@植野和子,関谷明香,@成相直樹,@長﨑正朗,大川恭行,鈴木淳史

    AMED-CREST「エピゲノム」領域会議  2015年2月 

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    開催年月日: 2015年2月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:千里ライフサイエンスセンター(大阪)   国名:日本国  

    我々は、マウス胎仔線維芽細胞(MEF)にHnf4αおよびFoxA1~3のいずれかの2転写因子を強制発現する ことで、肝細胞様の性質を有するinduced hepatocyte-like cell(iHep細胞)の誘導に成功した。しかしダイ レクトリプログラミング過程、また樹立したiHep細胞におけるエピジェネティックな状態は全く不明であった。 そこで我々は、樹立したiHep細胞、および誘導過程(遺伝子導入48時間後)のiHep細胞を解析対象とし、ヒス トン修飾を始めとする多数のエピジェネティックマークに対する大規模なChIP-Seq解析、およびRNA-Seqに よる発現解析を行った。その結果、肝細胞に類似したiHep細胞の遺伝子発現プロファイルと、リプログラム過程 におけるH3K4me3、H3K27me3を始めとしたヒストン修飾の大規模変動を明らかにすることができた(口頭 発表:鈴木淳史)。本発表では、それらのデータを可視化して様々な遺伝子座で行った詳細な解析のうち、肝細胞およびMEFに特徴的に発現する代表的な遺伝子のlocusについての解析結果を報告する。この結果をもとに リプログラミング誘導因子と遺伝子発現変動、ヒストン修飾などとの関連性について議論を深めたい。

  • ダイレクトリプログラミングで作製された腸上皮オルガノイドの単一細胞プロファイリング

    三浦静 堀澤健一 鈴木淳史

    第22回日本再生医療学会総会  2023年3月 

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    開催年月日: 2023年3月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:国立京都国際会館(京都)   国名:日本国  

    近年、我々は、iPS細胞を経ずに直接分化転換を行うダイレクトリプログラミングという方法を用いて、マウス胎仔由来線維芽細胞にHnf4α、Foxa3、Gata6、Cdx2を組み合わせて導入することで、胎仔腸由来の前駆細胞と同様の性質を持つ細胞を誘導することに成功している(Miura and Suzuki, Cell Stem Cell, 2017)。この誘導腸前駆細胞は、球状のオルガノイド(Spherical organoid;SO)を形成し、腸幹細胞を含む成体型のオルガノイド(Budding organoid;BO)へと成長した。誘導した腸幹細胞は、4種類の腸上皮細胞に分化する能力(多分化能)を有し、かつ、長期間自己と同じ細胞を作り続ける能力(自己複製能)も有していた。また、網羅的遺伝子発現解析によって、これらのオルガノイドは生体由来の細胞とよく似た遺伝子発現を示すことも明らかになった。一方、誘導腸幹細胞由来のBOが成体マウスの腸幹細胞由来のBOと1細胞レベルで同様の遺伝子発現パターンを示すのかは明らかになっていない。そこで本研究では、誘導腸幹細胞由来のBOと成体マウスの腸幹細胞由来のBOのscRNA-seq解析を行い、1細胞レベルでの遺伝子発現パターンを比較した。その結果、誘導腸幹細胞由来のBOは成体マウスの腸幹細胞由来のBOとよく似た遺伝子発現パターンを示し、同様の細胞集団によって構成されていることがわかった。このことから、ダイレクトリプログラミング法を用いて細胞を作製することにより、生体由来の細胞と1細胞レベルで非常によく似た細胞の作製が可能になることが判明した。今後は、生体由来の細胞の代わりとして移植医療や創薬研究へ利用することが期待される。

  • ダイレクトリプログラミングで作製された腸上皮オルガノイドの単一細胞プロファイリング

    三浦静 堀澤健一 鈴木淳史

    第22回日本再生医療学会総会  2023年3月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2023年3月

    記述言語:日本語  

    開催地:国立京都国際会館(京都)   国名:日本国  

    近年、我々は、iPS細胞を経ずに直接分化転換を行うダイレクトリプログラミングという方法を用いて、マウス胎仔由来線維芽細胞にHnf4α、Foxa3、Gata6、Cdx2を組み合わせて導入することで、胎仔腸由来の前駆細胞と同様の性質を持つ細胞を誘導することに成功している(Miura and Suzuki, Cell Stem Cell, 2017)。この誘導腸前駆細胞は、球状のオルガノイド(Spherical organoid;SO)を形成し、腸幹細胞を含む成体型のオルガノイド(Budding organoid;BO)へと成長した。誘導した腸幹細胞は、4種類の腸上皮細胞に分化する能力(多分化能)を有し、かつ、長期間自己と同じ細胞を作り続ける能力(自己複製能)も有していた。また、網羅的遺伝子発現解析によって、これらのオルガノイドは生体由来の細胞とよく似た遺伝子発現を示すことも明らかになった。一方、誘導腸幹細胞由来のBOが成体マウスの腸幹細胞由来のBOと1細胞レベルで同様の遺伝子発現パターンを示すのかは明らかになっていない。そこで本研究では、誘導腸幹細胞由来のBOと成体マウスの腸幹細胞由来のBOのscRNA-seq解析を行い、1細胞レベルでの遺伝子発現パターンを比較した。その結果、誘導腸幹細胞由来のBOは成体マウスの腸幹細胞由来のBOとよく似た遺伝子発現パターンを示し、同様の細胞集団によって構成されていることがわかった。このことから、ダイレクトリプログラミング法を用いて細胞を作製することにより、生体由来の細胞と1細胞レベルで非常によく似た細胞の作製が可能になることが判明した。今後は、生体由来の細胞の代わりとして移植医療や創薬研究へ利用することが期待される。

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  • 誘導腸前駆細胞におけるリプログラミング機構の解明

    #鈴⽊陵雅 堀澤健⼀ 三浦静 ⼤川恭⾏ 鈴⽊淳史

    第45回 日本分子生物学会年会  2022年11月 

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:幕張メッセ   国名:日本国  

  • 誘導腸前駆細胞におけるリプログラミング機構の解明

    鈴⽊陵雅 堀澤健⼀ 三浦静 ⼤川恭⾏ 鈴⽊淳史

    第45回 日本分子生物学会年会  2022年11月 

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

    記述言語:日本語  

    開催地:幕張メッセ   国名:日本国  

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  • 培養下における肝細胞から腸幹/前駆細胞への運命転換

    三浦静 #辻野智史 堀澤健一 #井上和也 #唐澤皐月 鈴木淳史

    第29回肝細胞研究会  2022年8月 

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    開催年月日: 2022年8月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:KFC Hall & Rooms (東京)   国名:日本国  

    肝細胞は、培養下で容易に脱分化し、「脱分化型肝細胞」として増殖・維持が可能なことが古くから知られている。また最近では、複数の低分子化合物が培養下における肝細胞の脱分化を促進することも判明した。我々は、低分子化合物を用いずに成体マウス由来肝細胞を培養し、長期増殖可能な脱分化型肝細胞 (dedifferentiated hepatocyte: dedi-Hep)を取得する方法を確立した。二次元培養下で増殖するdedi-Hepは、三次元培養下で凝集体を形成すると機能的な肝細胞への再分化が可能であり、これらを高チロシン血症モデルマウスの肝臓に移植すると、成熟した肝細胞として肝組織を再構築することも可能であった。一方、脱分化した肝細胞が肝臓以外の他系統細胞へ分化できるかについてはこれまで明らかになっていない。そこで本研究では、dedi-Hepを腸幹/前駆細胞の培養環境下におくことで、dedi-Hepが腸上皮細胞への分化能を有するかを解析した。その結果、dedi-Hepは内腔を有するオルガノイドを形成し、それらオルガノイドを形成する細胞は腸上皮細胞マーカーを発現することが判明した。また、形成されたオルガノイドを大腸炎モデルマウスに移植すると、大腸の上皮組織を長期間再構築することも可能であった。以上から、成体マウスの肝細胞は、培養下における脱分化を経て、腸幹/前駆細胞へその細胞運命を転換できることが明らかとなった。

  • 培養下における肝細胞から腸幹/前駆細胞への運命転換

    三浦静 辻野智史 堀澤健一 井上和也 唐澤皐月 鈴木淳史

    第29回肝細胞研究会  2022年8月 

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    開催年月日: 2022年8月

    記述言語:日本語  

    開催地:KFC Hall & Rooms (東京)   国名:日本国  

    肝細胞は、培養下で容易に脱分化し、「脱分化型肝細胞」として増殖・維持が可能なことが古くから知られている。また最近では、複数の低分子化合物が培養下における肝細胞の脱分化を促進することも判明した。我々は、低分子化合物を用いずに成体マウス由来肝細胞を培養し、長期増殖可能な脱分化型肝細胞 (dedifferentiated hepatocyte: dedi-Hep)を取得する方法を確立した。二次元培養下で増殖するdedi-Hepは、三次元培養下で凝集体を形成すると機能的な肝細胞への再分化が可能であり、これらを高チロシン血症モデルマウスの肝臓に移植すると、成熟した肝細胞として肝組織を再構築することも可能であった。一方、脱分化した肝細胞が肝臓以外の他系統細胞へ分化できるかについてはこれまで明らかになっていない。そこで本研究では、dedi-Hepを腸幹/前駆細胞の培養環境下におくことで、dedi-Hepが腸上皮細胞への分化能を有するかを解析した。その結果、dedi-Hepは内腔を有するオルガノイドを形成し、それらオルガノイドを形成する細胞は腸上皮細胞マーカーを発現することが判明した。また、形成されたオルガノイドを大腸炎モデルマウスに移植すると、大腸の上皮組織を長期間再構築することも可能であった。以上から、成体マウスの肝細胞は、培養下における脱分化を経て、腸幹/前駆細胞へその細胞運命を転換できることが明らかとなった。

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  • 培養下における肝細胞から腸幹/前駆細胞への運命転換

    三浦静 #辻野智史 堀澤健一 #井上和也 #唐澤皐月 鈴木淳史

    第21回日本再生医療学会総会  2022年3月 

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    開催年月日: 2022年3月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

    肝細胞は、培養下で容易に脱分化し、「脱分化型肝細胞」として増殖・維持が可能なことが古くから知られている。また最近では、複数の低分子化合物が培養下における肝細胞の脱分化を促進することも判明した。我々は、低分子化合物を用いずに成体マウス由来肝細胞を培養し、長期増殖可能な脱分化型肝細胞(dedifferentiated hepatocyte: dedi-Hep)を取得する方法を確立した。二次元培養下で増殖するdedi-Hepは、三次元培養下で凝集体を形成すると機能的な肝細胞への再分化が可能であり、これらを高チロシン血症モデルマウスの肝臓に移植すると、成熟した肝細胞として肝組織を再構築することも可能であった。一方、脱分化した肝細胞が肝臓以外の他系統細胞へ分化できるかについてはこれまで明らかになっていない。そこで本研究では、dedi-Hepを腸幹/前駆細胞の培養環境下におくことで、dedi-Hepが腸上皮細胞への分化能を有するかを解析した。その結果、dedi-Hepは内腔を有するオルガノイドを形成し、それらオルガノイドを形成する細胞は腸上皮細胞マーカーを発現することが判明した。また、形成されたオルガノイドを大腸炎モデルマウスに移植すると、大腸の上皮組織を長期間再構築することも可能であった。以上から、成体マウスの肝細胞は、培養下における脱分化を経て、腸幹/前駆細胞へその細胞運命を転換できることが明らかとなった。

  • 培養下における肝細胞から腸幹/前駆細胞への運命転換

    三浦静 辻野智史 堀澤健一 井上和也 唐澤皐月 鈴木淳史

    第21回日本再生医療学会総会  2022年3月 

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    開催年月日: 2022年3月

    記述言語:日本語  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

    肝細胞は、培養下で容易に脱分化し、「脱分化型肝細胞」として増殖・維持が可能なことが古くから知られている。また最近では、複数の低分子化合物が培養下における肝細胞の脱分化を促進することも判明した。我々は、低分子化合物を用いずに成体マウス由来肝細胞を培養し、長期増殖可能な脱分化型肝細胞(dedifferentiated hepatocyte: dedi-Hep)を取得する方法を確立した。二次元培養下で増殖するdedi-Hepは、三次元培養下で凝集体を形成すると機能的な肝細胞への再分化が可能であり、これらを高チロシン血症モデルマウスの肝臓に移植すると、成熟した肝細胞として肝組織を再構築することも可能であった。一方、脱分化した肝細胞が肝臓以外の他系統細胞へ分化できるかについてはこれまで明らかになっていない。そこで本研究では、dedi-Hepを腸幹/前駆細胞の培養環境下におくことで、dedi-Hepが腸上皮細胞への分化能を有するかを解析した。その結果、dedi-Hepは内腔を有するオルガノイドを形成し、それらオルガノイドを形成する細胞は腸上皮細胞マーカーを発現することが判明した。また、形成されたオルガノイドを大腸炎モデルマウスに移植すると、大腸の上皮組織を長期間再構築することも可能であった。以上から、成体マウスの肝細胞は、培養下における脱分化を経て、腸幹/前駆細胞へその細胞運命を転換できることが明らかとなった。

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  • Wet研究者でもできる webアプリによる遺伝子発現解析

    堀澤健一

    第3回KBC勉強会  2019年10月 

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    開催年月日: 2019年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡市   国名:日本国  

  • 配偶子認識蛋白質Bindinに存在するB18ペプチドおよびCoreドメインは細胞膜の透過性を向上させる

    新倉啓介, 堀澤 健一, 土居信英

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

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    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 酸化還元酵素のハイスループットなスクリーニング系の構築

    及木遼, 片山道信, 加藤太亮, 杉谷藍, 渡辺剛志, 栄長泰明, 松本佳宣, 堀澤 健一, 土居信英

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

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    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Supercharged ß-グルコシターゼの定向進化

    齋藤香往里, 杉田惟, 堀澤 健一, 土居信英

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

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    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • mRNA ディスプレイ法により選択された高親和性MDM2結合ペプチドMIPに基づくMDM2-p53相互作用阻害剤の開発

    白川貴惠, 永田崇, 小林直弘, 始平堂弘和, 新倉啓介, 片平正人, 堀澤 健一, 土居信英, 柳川弘志

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • mRNAディスプレイ法によるRNA結合タンパク質の試験管内選択

    市川士朗, 田中淳子, 堀澤 健一, 柳川弘志, 土居信英

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • RNA結合タンパク質Msi1と新規標的mRNAの相互作用解析

    堀澤 健一、@松尾 薫、@今井 貴雄、@岡野 栄之、@柳川 弘志

    第12回日本RNA学会年会  2010年8月 

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    開催年月日: 2010年8月

    記述言語:日本語  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 細胞リプログラミング制御の最前線 細胞運命の直接転換と形質維持に関する転写因子の役割

    堀澤 健一, 鈴木 淳史

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2023年10月  (公社)日本生化学会

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    記述言語:日本語  

  • ダイレクトリプログラミングにより作製したヒト肝前駆細胞による肝線維化の抑制

    河野 雄紀, 三浦 静, 川又 理樹, 堀澤 健一, 吉丸 耕一朗, 松浦 俊治, 田尻 達郎, 鈴木 淳史

    日本小児外科学会雑誌  2022年4月  (一社)日本小児外科学会

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    記述言語:日本語  

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MISC

  • The role of pioneer transcription factors in the induction of direct cellular reprogramming 査読

    Kenichi Horisawa, Atsushi Suzuki

    Regenerative Therapy   2023年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.1016/j.reth.2023.06.002

  • Direct cell-fate conversion of somatic cells: Toward regenerative medicine and industries 査読

    Kenichi Horisawa, Atsushi Suzuki

    Proceedings of the Japan Academy, Ser. B, Physical and Biological Sciences   2020年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

    DOI: https://doi.org/10.2183/pjab.96.012

  • Cell-Based Regenerative Therapy for Liver Disease 査読

    Horisawa Kenichi, Atsushi SUZUKI

    Innovative Medicine Basic Research and Development, Springer   2015年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • Specific and quantitative labeling of biomolecules using click chemistry. 査読

    Front Physiol.   2014年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • The Musashi family RNA-binding proteins in stem cells 査読

    Horisawa Kenichi, Takao Imai, Hideyuki Okano, Hiroshi Yanagawa

    Biomolecular Concepts   2010年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • ダイレクトリプログラミングの転写収斂メカニズム解析

    堀澤 健一

    上原記念生命科学財団研究報告集   37   1 - 5   2023年12月

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公財)上原記念生命科学財団  

  • ダイレクト細胞リプログラミングの誘導においてパイオニア転写因子が有する役割(The role of pioneer transcription factors in the induction of direct cellular reprogramming)

    Horisawa Kenichi, Suzuki Atsushi

    Regenerative Therapy   24   112 - 116   2023年12月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:(一社)日本再生医療学会  

  • 【クロマチンによる転写制御機構の最前線】転写制御と生命現象 ダイレクトリプログラミングと転写制御

    堀澤 健一, 鈴木 淳史

    生体の科学   74 ( 3 )   245 - 249   2023年6月   ISSN:0370-9531

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    記述言語:日本語   出版者・発行元:(公財)金原一郎記念医学医療振興財団  

    <文献概要>本稿では,終末分化した体細胞から人為的な分化転換により,細胞の初期化を介さずに直接的に別の系譜の細胞を誘導する"ダイレクトリプログラミング"について,その背景で働く転写・クロマチン制御に関する最新知見を概説し,今後の研究を展望する。

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産業財産権

特許権   出願件数: 3件   登録件数: 1件
実用新案権   出願件数: 0件   登録件数: 0件
意匠権   出願件数: 0件   登録件数: 0件
商標権   出願件数: 0件   登録件数: 0件

所属学協会

  • 日本分子生物学会

  • 日本RNA学会

  • 日本プロテオーム学会

  • 日本エピジェネティクス研究会

  • 日本分子生物学会

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  • 日本プロテオーム学会

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  • 日本エピジェネティクス研究会

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  • 日本RNA学会

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委員歴

  • 九州大学   動物実験委員会委員  

    2024年4月 - 2025年3月   

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    団体区分:その他

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  • 九州大学   情報解析基盤室 運営委員(代理)  

    2023年11月 - 2025年3月   

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    団体区分:その他

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  • 九州大学   動物実験委員会委員  

    2023年4月 - 2024年3月   

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    団体区分:その他

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学術貢献活動

  • 運営 国際学術貢献

    The 33rd Hot Spring Harbor International Symposium Frontiers in Stem Cell Research and Reprogramming(予定)  ( 九州大学コラボステーションI視聴覚ホール(福岡) ) 2024年10月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:230

  • The 33rd Hot Spring Harbor International Symposium Frontiers in Stem Cell Research and Reprogramming(予定) 国際学術貢献

    ( 九州大学コラボステーションI視聴覚ホール(福岡) Japan ) 2024年10月

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    種別:大会・シンポジウム等 

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  • 座長

    第25回生医研リトリート  ( 九州大学百年講堂(福岡) ) 2023年7月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 第25回生医研リトリート

    ( 九州大学百年講堂(福岡) Japan ) 2023年7月

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    種別:大会・シンポジウム等 

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  • 座長

    第24回生医研リトリート  ( 唐津ホテル&リゾーツ佐賀唐津(佐賀) ) 2022年7月

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    種別:大会・シンポジウム等 

  • 第24回生医研リトリート

    ( 唐津ホテル&リゾーツ佐賀唐津(佐賀) Japan ) 2022年7月

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    種別:大会・シンポジウム等 

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  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2021年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:2

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2020年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:1

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2019年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:2

  • Journal of Biochemistry 国際学術貢献

    2018年4月 - 2022年3月

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    種別:学会・研究会等 

  • Journal of Biochemistry 国際学術貢献

    2018年4月 - 2022年3月

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    種別:査読等 

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  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2018年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:4

  • 運営幹事

    応用幹細胞リトリート2017・Winter  2017年12月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:70

  • 運営 国際学術貢献

    2017年10月 - 2017年11月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:230

  • 運営

    第19回生医研リトリート2016  ( ホテルセキア(熊本県南関町) ) 2016年7月

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    種別:大会・シンポジウム等 

    参加者数:153

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2016年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:1

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2015年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:1

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 転写因子発現の厳密な制御に基づく再現性の高いダイレクトリプログラミング技術の創出

    研究課題/領域番号:23K11851  2023年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    堀澤 健一

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

    本研究は再生医療の新たなツールとして期待されるダイレクトリプログラミングについて、その再現性と信頼性を向上させることを最終的な目標とする。
    ダイレクトリプログラミングは通常、特定の転写因子セットを体細胞に強制発現することで人為的な分化誘導を引き起こす。しかし、転写因子の発現量や発現比といった定量的な情報については、これまでほとんど明らかになっておらず、技術的な再現性や信頼性に課題が残されていた。
    そこで本研究では、転写因子の発現量を厳密に制御する系を導入し詳細な解析を行うことで、定量的な情報に基づいた高再現性・高信頼性を有する臨床医療に応用し得るダイレクトリプログラミング技術の実現を目指す。

    CiNii Research

  • 医学研究資金助成/再生医療の実現に向けた肝細胞ダイレクトリプログラミングにおける転写収斂メカニズムの解析

    2021年

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    資金種別:寄附金

  • 研究助成金/ダイレクトリプログラミングの転写収斂メカニズム解析

    2021年

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    資金種別:寄附金

  • 脂質代謝が駆動する転写活性化とダイレクトリプログラミングの解析

    研究課題/領域番号:16K08592  2016年 - 2018年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • クロマチン制御を介したダイレクトリプログラミング機構の解明

    2016年

    QRプログラム(わかば)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:学内資金・基金等

  • ゲノム・エピゲノム研究拠点形成

    2014年

    九州大学P&P・Aタイプ

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    担当区分:研究分担者  資金種別:学内資金・基金等

  • 未分化維持因子Musashi1による神経細胞の分化・回路形成制御の解析

    研究課題/領域番号:24500447  2012年 - 2014年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • ケミカルプローブによるメチル化標的転写因子のプロテオミクス解析

    研究課題/領域番号:24116523  2012年 - 2013年

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • オンチップ共発現マイクロアレイによる転写制御ネットワークの精密解析

    研究課題/領域番号:22658111  2010年 - 2011年

    科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

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    担当区分:連携研究者  資金種別:科研費

  • 学事振興資金 個人研究A/神経幹細胞におけるMusashi1蛋白質新規標的Dccの発現制御の解明

    2010年

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    資金種別:寄附金

  • 研究助成/メチルプロテオームの解明に向けたアルギニンメチル化標的タンパク質の特異的選択技術の開発

    2010年

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    資金種別:寄附金

  • In vitro virus法を用いた翻訳後修飾酵素の標的探索技術の開発

    2009年

    JST シーズ発掘試験 A発掘型

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    担当区分:研究代表者  資金種別:受託研究

  • アルギニンメチル化酵素群における標的タンパク質の網羅的探索技術の開発

    研究課題/領域番号:20710153  2008年 - 2009年

    科学研究費助成事業  若手研究(B)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • 慶應義塾大学医学部再生医学・治療研究開発センタープロジェクト(研究代表:福田恵一)

    2008年

    文部科学省 ハイテクリサーチセンター整備事業

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    担当区分:研究分担者  資金種別:受託研究

  • 一般研究奨励/アルギニンメチル化酵素群における標的タンパク質の網羅的探索技術の開発

    2008年

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    資金種別:寄附金

  • IVV法とタイリングアレイ技術による機能性蛋白質の高感度探索手法の開発

    2005年

    JST シーズ育成試験

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    担当区分:研究代表者  資金種別:受託研究

  • 異分野連携研究助成/ダイマーを形成する転写因子ネットワークの解析

    2005年

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    資金種別:寄附金

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他大学・他機関等の客員・兼任・非常勤講師等

  • 2014年  慶應義塾大学理工学部  区分:客員教員  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:1年間

その他教育活動及び特記事項

  • 2023年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2022年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2021年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2020年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2019年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2018年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2017年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2016年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2015年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

  • 2014年  その他特記事項  医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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    医学部 3年次早期研究室配属生の指導

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メディア報道

  • User's Voice「肝細胞へのダイレクトリプログラミングを誘導する転写因子の作用機序解明へ」 新聞・雑誌

    NEXT 2021年12月号  2021年12月

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    User's Voice「肝細胞へのダイレクトリプログラミングを誘導する転写因子の作用機序解明へ」

  • 第10面「感度100倍以上に 慶大 RNAと結合、反応増幅」 新聞・雑誌

    日経産業新聞  2008年4月

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    第10面「感度100倍以上に 慶大 RNAと結合、反応増幅」

学内運営に関わる各種委員・役職等

  • 2024年4月 - 2025年3月   研究所 動物実験委員会委員

  • 2023年11月 - 2025年3月   研究所 情報解析基盤室 運営委員(代理)

  • 2023年4月 - 2024年3月   研究所 動物実験委員会委員