平成25年度科学技術分野の文部科学大臣表彰　若手科学者賞

2013年4月   文部科学省   骨格筋分化を制御する高次クロマチン構造変換機構の研究

Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL-seq with single-thin sections 査読 国際誌

Kazumitsu Maehara, Kosuke Tomimatsu, Akihito Harada, Kaori Tanaka, Shoko Sato, Seiji Okada, Tetsuya Handa, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

Mol Syst Biol.   2020年12月

Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input. 査読 国際誌

Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shoko Sato, Masaru Nakao, Naoki Goto, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura

Nature protocols   15 ( 10 )   3334 - 3360   2020年10月

A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input 査読

Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Tetsuya Handa, Yasuhiro Arimura, Jumpei Nogami, Yoko Hayashi-Takanaka, Katsuhiko Shirahige, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

Nature Cell Biology   21 ( 2 )   287 - 296   2019年2月

Histone H3.3 sub-variant H3mm7 is required for normal skeletal muscle regeneration 査読

Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yusuke Ono, Hiroyuki Taguchi, Kiyoshi Yoshioka, Yasuo Kitajima, Yan Xie, Yuko Sato, Takeshi Iwasaki, Jumpei Nogami, Seiji Okada, Tetsuro Komatsu, Yuichiro Semba, Tatsuya Takemoto, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa

Nature Communications   9 ( 1 )   2018年4月

Sensitive detection of fluorescence in western blotting by merging images 査読

Yukari Kondo, Shinichiro Higa, Takeshi Iwasaki, Tomoya Matsumoto, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yoshihiro Baba, Masatoshi Fujita, Yasuyuki Ohkawa

PLoS One   13 ( 1 )   2018年1月

Temporal regulation of chromatin during myoblast differentiation 査読 国際誌

Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa, Anthony N. Imbalzano

Seminars in Cell and Developmental Biology   72   77 - 86   2017年12月

Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells 査読

Yuichiro Semba, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shinya Oki, Chikara Meno, Jun Ueda, Kazuo Yamagata, Atsushi Suzuki, Mitsuho Onimaru, Jumpei Nogami, Seiji Okada, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa

Nucleic Acids Research   45 ( 15 )   8758 - 8772   2017年9月

The requirement of Mettl3-promoted MyoD mRNA maintenance in proliferative myoblasts for skeletal muscle differentiation. 査読 国際誌

Kensuke Kudou, Tetsuro Komatsu, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Hiroshi Saeki, Eiji Oki, Yoshihiko Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Open biology   7 ( 9 )   2017年9月

Crystal Structure and Characterization of Novel Human Histone H3 Variants, H3.6, H3.7, and H3.8 査読

Hiroyuki Taguchi, Yan Xie, Naoki Horikoshi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Jumpei Nogami, Koichi Sato, Yasuhiro Arimura, Akihisa Osakabe, Tomoya Kujirai, Takeshi Iwasaki, Yuichiro Semba, Taro Tachibana, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Biochemistry   56 ( 16 )   2184 - 2196   2017年4月

Crystal structure of the overlapping dinucleosome composed of hexasome and octasome 査読

Daiki Kato, Akihisa Osakabe, Yasuhiro Arimura, Yuka Mizukami, Naoki Horikoshi, Kazumi Saikusa, Satoko Akashi, Yoshifumi Nishimura, Sam Yong Park, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Atsushi Matsumoto, Hidetoshi Kono, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Hitoshi Kurumizaka

Science   356 ( 6334 )   205 - 208   2017年4月

Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis 査読

Jun Ueda, Akihito Harada, Takashi Urahama, Shinichi Machida, Kazumitsu Maehara, Masashi Hada, Yoshinori Makino, Jumpei Nogami, Naoki Horikoshi, Akihisa Osakabe, Hiroyuki Taguchi, Hiroki Tanaka, Hiroaki Tachiwana, Tatsuma Yao, Minami Yamada, Takashi Iwamoto, Ayako Isotani, Masahito Ikawa, Taro Tachibana, Yuki Okada, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka, Kazuo Yamagata

Cell Reports   18 ( 3 )   593 - 600   2017年1月

The requirement of Mettl3-promoted MyoD mRNA maintenance in proliferative myoblasts for skeletal muscle differentiation 査読

Kensuke Kudou, Tetsuro Komatsu, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Hiroshi Saeki, Eiji Oki, Yoshihiko Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Open Biology   7 ( 9 )   2017年1月

Identification of immunoglobulin gene sequences from a small read number of mRNA-seq using hybridomas 査読

Yuki Kuniyoshi, Kazumitsu Maehara, Takeshi Iwasaki, Masayasu Hayashi, Yuichiro Semba, Masatoshi Fujita, Yuko Sato, Hiroshi Kimura, Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa

PLoS One   11 ( 10 )   2016年10月

Tissue-specific expression of histone H3 variants diversified after species separation 査読

Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yuko Sato, Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

Epigenetics and Chromatin   8 ( 1 )   2015年9月

Spatial re-organization of myogenic regulatory sequences temporally controls gene expression 査読

Akihito Harada, Chandrashekara Mallappa, Seiji Okada, John T. Butler, Stephen P. Baker, Jeanne B. Lawrence, Yasuyuki Ohkawa, Anthony N. Imbalzano

Nucleic Acids Research   43 ( 4 )   2008 - 2021   2015年2月

Incorporation of histone H3.1 suppresses the lineage potential of skeletal muscle 査読

Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yuko Sato, Daijiro Konno, Taro Tachibana, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

Nucleic Acids Research   43 ( 2 )   775 - 786   2015年1月

A co-localization model of paired ChIP-seq data using a large ENCODE data set enables comparison of multiple samples 査読

Kazumitsu Maehara, Jun Odawara, Akihito Harada, Tomohiko Yoshimi, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Koichi Akashi, Taro Tachibana, Toshio Sakata, Yasuyuki Ohkawa

Nucleic Acids Research   41 ( 1 )   54 - 62   2013年1月

Chd2 interacts with H3.3 to determine myogenic cell fate 査読

Akihito Harada, Seiji Okada, Daijiro Konno, Jun Odawara, Tomohiko Yoshimi, Saori Yoshimura, Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Toshiaki Tsubota, Hitoshi Kurumizaka, Koichi Akashi, Taro Tachibana, Anthony N. Imbalzano, Yasuyuki Ohkawa

EMBO Journal   31 ( 13 )   2994 - 3007   2012年7月

Production of a Monoclonal Antibody for Histone H2b Isoform H2b3b. 査読 国際誌

Egashira S, Tachibana T, Nakamura M, Ohkawa Y, Harada A.

Monoclon Antib Immunodiagn Immunother,   43 ( 2 )   75 - 80   2024年4月

Genome-wide ATAC-see screening identifies TFDP1 as a modulator of global chromatin accessibility. 査読 国際誌

Ishii S, Kakizuka T, Park SJ, Tagawa A, Sanbo C, Tanabe H, Ohkawa Y, Nakanishi M, Nakai K, Miyanari Y.

Nat Genet.   56 ( 3 )   473 - 482   2024年2月

Genome-wide mapping and cryo-EM structural analyses of the overlapping tri-nucleosome composed of hexasome-hexasome-octasome moieties. 査読 国際誌

Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Morishima K, Shimizu M, Kobayashi Y, Nozawa K, Takizawa Y, Sugiyama M, Ohkawa Y, Kurumizaka H.

Commun Biol.   7 ( 1 )   61   2024年1月

Cryo-EM and biochemical analyses of the nucleosome containing the human histone H3 variant H3.8. 査読 国際誌

Hirai S, Kujirai T, Akatsu M, Ogasawara M, Ehara H, Sekine SI, Ohkawa Y, Takizawa Y, Kurumizaka H.

J Biochem.   2023年9月

FOXK1 promotes nonalcoholic fatty liver disease by mediating mTORC1-dependent inhibition of hepatic fatty acid oxidation 査読 国際誌

Shun Fujinuma, Hirokazu Nakatsumi, Hideyuki Shimizu, Shigeaki Sugiyama, Akihito Harada, Takeshi Goya, Masatake Tanaka, Motoyuki Kohjima, Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Mikako Yagi, Dongchon Kang, Mari Kaneko, Mayo Shigeta, Takeshi Bamba, Yasuyuki Ohkawa, Keiichi I. Nakayama

Cell Reports   42 ( 5 )   112530 - 112530   2023年5月

Design and implementation of a hybrid cloud system for large-scale human genomic research. 査読 国際誌

Masao Nagasaki, Yayoi Sekiya, Akihiro Asakura, Ryo Teraoka, Ryoko Otokozawa, Hiroki Hashimoto, Takahisa Kawaguchi, Keiichiro Fukazawa, Yuichi Inadomi, Ken T Murata, Yasuyuki Ohkawa, Izumi Yamaguchi, Takamichi Mizuhara, Katsushi Tokunaga, Yuji Sekiya, Toshihiro Hanawa, Ryo Yamada, Fumihiko Matsuda.

Hum Genome Var.   10 ( 1 )   6   2023年2月

STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity. 査読 国際誌

Hiroaki Ohishi, Seiru Shimada, Satoshi Uchino, Jieru Li, Yuko Sato, Manabu Shintani, Hitoshi Owada, Yasuyuki Ohkawa, Alexandros Pertsinidis, Takashi Yamamoto, Hiroshi Kimura, Hiroshi Ochiai.

Nat Commun.   13 ( 1 )   7672   2022年12月

Prostaglandin E2 receptor Ptger4b regulates female-specific peptidergic neurons and female sexual receptivity in medaka. 査読 国際誌

Thomas Fleming, Yukiko Kikuchi, Mikoto Nakajo, Masaya Tachizawa, Tomoaki Inazumi, Soken Tsuchiya, Yukihiko Sugimoto, Daisuke Saito, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Takashi Baba, Ken-Ichirou Morohashi, Kataaki Okubo

Commun Biol.   5 ( 1 )   1215   2022年11月

Drosophila transcription factor NF-Y suppresses transcription of the lipase 4 gene, a key gene for lipid storage. 招待 査読 国際誌

Yasuhide Yoshioka, Keisuke Anzai, Ryosuke Kowada, Ken Hiratsuka, Teppei Hirayabu, Masashi Yasuda, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Hideki Yoshida, Masamitsu Yamaguchi

Exp Cell Res.   420 ( 1 )   113307   2022年11月

Tmsb10 triggers fetal Leydig differentiation by suppressing the RAS/ERK pathway 査読 国際誌

Miki Inoue, Takashi Baba, Fumiya Takahashi, Miho Terao, Shogo Yanai, Yuichi Shima, Daisuke Saito, Kei Sugihara, Takashi Miura, Shuji Takada, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Ken-Ichirou Morohashi

Commun Biol.   5 ( 1 )   974   2022年9月

Identification of a drug-response gene in multiple myeloma through longitudinal single-cell transcriptome sequencing. 査読 国際誌

Toru Masuda, Shojiro Haji, Yasuhiro Nakashima, Mariko Tsuda, Daisaku Kimura, Akiko Takamatsu, Norifusa Iwahashi, Hironobu Umakoshi, Motoaki Shiratsuchi, Chie Kikutake, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Yoshihiro Ogawa

iScience   25 ( 8 )   104781   2022年7月

A spinal microglia population involved in remitting and relapsing neuropathic pain 査読 国際誌

Keita Kohno, Ryoji Shirasaka, Kohei Yoshihara, Satsuki Mikuriya, Kaori Tanaka, Keiko Takanami, Kazuhide Inoue, Hirotaka Sakamoto, Yasuyuki Ohkawa, Takahiro Masuda, Makoto Tsuda.

Science   376 ( 6588 )   86 - 90   2022年4月

Uterus-specific transcriptional regulation underlies eggshell pigment production in Japanese quail. 査読 国際誌

Satoshi Ishishita, Shumpei Kitahara, Mayuko Takahashi, Sakura Iwasaki, Shoji Tatsumoto, Izumi Hara, Yoshiki Kaneko, Keiji Kinoshita, Katsushi Yamaguchi, Akihito Harada, Yasushige Ohmori, Yasuyuki Ohkawa, Yasuhiro Go, Shuji Shigenobu, Yoichi Matsuda, Takayuki Suzuki.

PLoS One   2022年3月

Uhrf1 governs the proliferation and differentiation of muscle satellite cells 査読

Hiroshi Sakai, Yuichiro Sawada, Naohito Tokunaga, Kaori Tanaka, So Nakagawa, Iori Sakakibara, Yusuke Ono, So-ichiro Fukada, Yasuyuki Ohkawa, Tadahiko Kikugawa, Takashi Saika, Yuuki Imai

iScience   25 ( 3 )   103928 - 103928   2022年3月

Tenogenic Induction From Induced Pluripotent Stem Cells Unveils the Trajectory Towards Tenocyte Differentiation. 査読 国際誌

Yuki Yoshimoto, Akiyoshi Uezumi, Madoka Ikemoto-Uezumi, Kaori Tanaka, Xinyi Yu, Tamaki Kurosawa, Shinsei Yambe, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Yusuke Sotomaru, Chisa Shukunami.

Front Cell Dev Biol.   10   780038   2022年3月

Relayed signaling between mesenchymal progenitors and muscle stem cells ensures adaptive stem cell response to increased mechanical load. 査読 国際誌

Akihiro Kaneshige, Takayuki Kaji, Lidan Zhang, Hayato Saito, Ayasa Nakamura, Tamaki Kurosawa, Madoka Ikemoto-Uezumi, Kazutake Tsujikawa, Shigeto Seno, Masatoshi Hori, Yasuyuki Saito, Takashi Matozaki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Michael Potente, Shuichi Watanabe, Thomas Braun, Akiyoshi Uezumi, So-Ichiro Fukada

Cell Stem Cell   29 ( 2 )   265 - 280.e6.   2022年2月

Direct Conversion of Human Endothelial Cells Into Liver Cancer-Forming Cells Using Nonintegrative Episomal Vectors. 査読 国際誌

Takeshi Goya, Kenichi Horisawa, Miyako Udono, Yasuyuki Ohkawa, Yoshihiro Ogawa, Sayaka Sekiya, Atsushi Suzuki.

Hepatol Commun   2022年2月

Live imaging of transcription sites using an elongating RNA polymerase II-specific probe. 査読 国際誌

J Cell Biol   221 ( 2 )   e202104134   2022年2月

Unusual nucleosome formation and transcriptome influence by the histone H3mm18 variant. 査読 国際誌

Seiya Hirai, Kosuke Tomimatsu, Atsuko Miyawaki-Kuwakado, Yoshimasa Takizawa, Tetsuro Komatsu, Taro Tachibana, Yutaro Fukushima, Yasuko Takeda, Lumi Negishi, Tomoya Kujirai, Masako Koyama, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka.

Nucleic Acids Res   50 ( 1 )   72 - 91   2022年1月

Recent advances in single-cell epigenomics. 査読 国際誌

Akihito Harada, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa.

Curr Opin Struct Bio   116 - 122   2021年12月

Totipotency of mouse zygotes extends to single blastomeres of embryos at the four-cell stage 査読 国際誌

Marino Maemura, Hiroaki Taketsuru, Yuki Nakajima, Ruiqi Shao, Ayaka Kakihara, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Yu-ichi Tsukada

Scientific Reports   11 ( 1 )   2021年12月

High-throughput single-cell epigenomic profiling by targeted insertion of promoters (TIP-seq) 査読 国際誌

Daniel A Bartlett, Vishnu Dileep, Tetsuya Handa, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Steven Henikoff, David M Gilbert.

J Cell Biol   220 ( 12 )   e202103078   2021年12月

Chromatin loading of MCM hexamers is associated with di-/tri-methylation of histone H4K20 toward S phase entry. 査読 国際誌

Yoko Hayashi-Takanaka, Yuichiro Hayashi, Yasuhiro Hirano, Atsuko Miyawaki-Kuwakado, Yasuyuki Ohkawa, Chikashi Obuse, Hiroshi Kimura, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka.

Nucleic Acids Res   49 ( 21 )   12152 - 12166   2021年12月

Discriminative feature of cells characterizes cell populations of interest by a small subset of genes. 査読 国際誌

Takeru Fujii, Kazumitsu Maehara, Masatoshi Fujita, Yasuyuki Ohkawa.

PLoS Comput Biol   17 ( 11 )   e1009579   2021年11月

Sex differences in metabolic pathways are regulated by Pfkfb3 and Pdk4 expression in rodent muscle. 査読 国際誌

Antonius Christianto, Takashi Baba, Fumiya Takahashi, Kai Inui, Miki Inoue, Mikita Suyama, Yusuke Ono, Yasuyuki Ohkawa, Ken-Ichirou Morohashi

Communications biology   4 ( 1 )   1264 - 1264   2021年11月

Neural stem/precursor cells dynamically change their epigenetic landscape to differentially respond to BMP signaling for fate switching during brain development. 査読 国際誌

Sayako Katada, Jun Takouda, Takumi Nakagawa, Mizuki Honda, Katsuhide Igarashi, Takuya Imamura, Yasuyuki Ohkawa, Shoko Sato, Hitoshi Kurumizaka, Kinichi Nakashima

Genes & development   35 ( 21-22 )   1431 - 1444   2021年11月

Integrated Analysis of Transcriptome and Histone Modifications in Granulosa Cells During Ovulation in Female Mice 査読 国際誌

Yuichiro Shirafuta, Isao Tamura, Yasuyuki Ohkawa, Ryo Maekawa, Yumiko Doi-Tanaka, Haruka Takagi, Yumiko Mihara, Masahiro Shinagawa, Toshiaki Taketani, Shun Sato, Hiroshi Tamura, Norihiro Sugino

Endocrinology   2 ( 9 )   bqab128   2021年9月

An extensive and dynamic trans-omic network illustrating prominent regulatory mechanisms in response to insulin in the liver 査読 国際誌

Fumiko Matsuzaki, Shinsuke Uda, Yukiyo Yamauchi, Masaki Matsumoto, Tomoyoshi Soga, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Keiichi I Nakayama, Shinya Kuroda, Hiroyuki Kubota.

Cell Reports   36 ( 8 )   109569   2021年8月

Genome-wide kinetic properties of transcriptional bursting in mouse embryonic stem cells 査読 国際誌

Hiroshi Ochiai, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda, Mika Yoshimura, Akihito Harada, Yukiko Shimizu, Kenta Nakano, Noriko Saitoh, Zhe Liu, Takashi Yamamoto, Tadashi Okamura, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Itoshi Nikaido

SCIENCE ADVANCES   6 ( 25 )   2021年6月

Hoxa10 mediates positional memory to govern stem cell function in adult skeletal muscle. 査読 国際誌

Kiyoshi Yoshioka, Hiroshi Nagahisa, Fumihito Miura, Hiromitsu Araki, Yasutomi Kamei, Yasuo Kitajima, Daiki Seko, Jumpei Nogami, Yoshifumi Tsuchiya, Narihiro Okazaki, Akihiko Yonekura, Seigo Ohba, Yoshinori Sumita, Ko Chiba, Kosei Ito, Izumi Asahina, Yoshihiro Ogawa, Takashi Ito, Yasuyuki Ohkawa, Yusuke Ono.

Science Advances   7 ( 24 )   eabd7924   2021年6月

Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay 査読 国際誌

Hiroaki Tachiwana, Mariko Dacher, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yosuke Seto, Ryohei Katayama, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Noriko Saitoh

ELIFE   10   2021年5月

Totipotency of mouse zygotes extends to single blastomeres of embryos at the four-cell stage. 査読 国際誌

Marino Maemura, Hiroaki Taketsuru, Yuki Nakajima, Ruiqi Shao, Ayaka Kakihara, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Yu-Ichi Tsukada.

Scientific Reports   11 ( 1 )   11167   2021年5月

Transcriptome analysis of gene expression changes upon enzymatic dissociation in skeletal myoblasts 査読 国際誌

Atsuko Miyawaki-Kuwakado, Qianmei Wu, Akihito Harada, Kosuke Tomimatsu, Takeru Fujii, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa.

Genes to Cells   2021年5月

Targeted inhibition of EPAS1-driven IL-31 production by a small-molecule compound 査読 国際誌

Yasuhisa Kamikaseda, Takehito Uruno, Kazufumi Kunimura, Akihito Harada, Kuniko Saiki, Kounosuke Oisaki, Daiji Sakata, Takeshi Nakahara, Makiko Kido-Nakahara, Motomu Kanai, Seiji Nakamura, Yasuyuki Ohkawa, Masutaka Furue, Yoshinori Fukui.

The Journal of Allergy and Clinical Immunology   2021年4月

Visualizing transcription sites in living cells using a genetically encoded probe specific for the elongating form of RNA polymerase II

Satoshi Uchino, Yuma Ito, Yuko Sato, Tetsuya Handa, Yasuyuki Ohkawa, Makio Tokunaga, Hiroshi Kimura

bioRxiv   2021年4月

H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing 査読 国際誌

Journal of Biochemistry   22 ( 3 )   2021年3月

Gene expression and functional abnormalities in XX/Sry Leydig cells 査読 国際誌

Shogo Yanai, Takashi Baba, Kai Inui, Kanako Miyabayashi, Soyun Han, Miki Inoue, Fumiya Takahashi, Yoshiakira Kanai, Yasuyuki Ohkawa, Man Ho Choi, Ken-Ichirou Morohashi

SCIENTIFIC REPORTS   11 ( 1 )   719   2021年1月

Genome-wide analysis of chromatin structure changes upon MyoD binding in proliferative myoblasts during the cell cycle 査読 国際誌

Qianmei Wu, Takeru Fujii, Akihito Harada, Kosuke Tomimatsu, Atsuko Miyawaki-Kuwakado, Masatoshi Fujita, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Journal of Biochemistry   2021年1月

Transcription factor C/EBPβ induces genome-wide H3K27ac and upregulates gene expression during decidualization of human endometrial stromal cells 査読 国際誌

520   111085   2021年1月

Subnuclear gene positioning through lamina association affects copper tolerance 査読 国際誌

Yuki Sakamoto, Mayuko Sato, Yoshikatsu Sato, Akihito Harada, Takamasa Suzuki, Chieko Goto, Kentaro Tamura, Kiminori Toyooka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Ikuko Hara-Nishimura, Shingo Takagi, Sachihiro Matsunaga

NATURE COMMUNICATIONS   11 ( 1 )   5914   2020年11月

Direct reprogramming of human umbilical vein- and peripheral blood-derived endothelial cells into hepatic progenitor cells 査読 国際誌

Hiroki Inada, Miyako Udono , Kanae Matsuda-Ito, Kenichi Horisawa, Yasuyuki Ohkawa, Shizuka Miura, Takeshi Goya, Junpei Yamamoto, Masao Nagasaki, Kazuko Ueno, Daisuke Saitou, Mikita Suyama, Yoshihiko Maehara, Wataru Kumamaru, Yoshihiro Ogawa, Sayaka Sekiya, Atsushi Suzuki.

NATURE COMMUNICATIONS   11 ( 1 )   5292   2020年10月

The Dynamics of Transcriptional Activation by Hepatic Reprogramming Factors 査読 国際誌

Kenichi Horisawa, Miyako Udono, Kazuko Ueno, Yasuyuki Ohkawa, Masao Nagasaki, Sayaka Sekiya, Atsushi Suzuki.

Molecular Cell   79 ( 4 )   660 - 676.e8   2020年8月

Tyrosine kinase inhibitors induce alternative spliced BCR-ABL Ins35bp variant via inhibition of RNA polymerase II on genomic BCR-ABL. 査読 国際誌

Junichiro Yuda, Jun Odawara, Mariko Minami, Tsuyoshi Muta, Kentaro Kohno, Kazuki Tanimoto, Tetsuya Eto, Takahiro Shima, Yoshikane Kikushige, Koji Kato, Katsuto Takenaka, Hiromi Iwasaki, Yosuke Minami, Yasuyuki Ohkawa, Koichi Akashi, Toshihiro Miyamoto.

Cancer Science   111 ( 7 )   2361 - 2373   2020年7月

Genome-wide kinetic properties of transcriptional bursting in mouse embryonic stem cells. 査読 国際誌

Hiroshi Ochiai, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda, Mika Yoshimura, Akihito Harada, Yukiko Shimizu, Kenta Nakano, Noriko Saitoh, Zhe Liu, Takashi Yamamoto, Tadashi Okamura, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Itoshi Nikaido

Science advances   6 ( 25 )   eaaz6699   2020年6月

Genomic Profiling by ALaP-Seq Reveals Transcriptional Regulation by PML Bodies Through DNMT3A Exclusion 査読 国際誌

Misuzu Kurihara , Kagayaki Kato , Chiaki Sanbo , Shuji Shigenobu , Yasuyuki Ohkawa , Takeshi Fuchigami , Yusuke Miyanari

MOLECULAR CELL   78 ( 3 )   493 - 505   2020年5月

TKIs Induce Alternative Spliced BCR-ABL Ins35bp Variant via Inhibition of RNA Polymerase Ⅱ on Genomic BCR-ABL 査読 国際誌

2020年4月

The role of galanin in the differentiation of mucosal mast cells in mice 査読 国際誌

Tomoko Yamaguchi, Yumi Ikeda, Katsuhisa Tashiro, Yasuyuki Ohkawa, Kenji Kawabata

EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY   50 ( 1 )   110 - 118   2020年1月

miR-124 dosage regulates prefrontal cortex function by dopaminergic modulation 査読 国際誌

Takashi Kozuka, Yoshihiro Omori, Satoshi Watanabe, Etsuko Tarusawa, Haruka Yamamoto, Taro Chaya, Mayu Furuhashi, Makiko Morita, Tetsuya Sato, Shinichi Hirose, Yasuyuki Ohkawa, Yumiko Yoshimura, Takatoshi Hikida, Takahisa Furukawa

Scientific reports   9 ( 1 )   2019年12月

The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis 査読 国際誌

Mohamed Osama Ali Abdalla, Tatsuro Yamamoto, Kazumitsu Maehara, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Hisashi Miura, Rawin Poonperm, Ichiro Hiratani, Hideki Nakayama, Mitsuyoshi Nakao, Noriko Saitoh

Nature communications   10 ( 1 )   2019年12月

Cell competition corrects noisy Wnt morphogen gradients to achieve robust patterning in the zebrafish embryo 査読 国際誌

Yuki Akieda, Shohei Ogamino, Hironobu Furuie, Shizuka Ishitani, Ryutaro Akiyoshi, Jumpei Nogami, Takamasa Masuda, Nobuyuki Shimizu, Yasuyuki Ohkawa, Tohru Ishitani

Nature communications   10 ( 1 )   2019年12月

Chromatin-bound CRM1 recruits SET-Nup214 and NPM1c onto HOX clusters causing aberrant HOX expression in leukemia cells 査読 国際誌

Masahiro Oka, Sonoko Mura, Mayumi Otani, Yoichi Miyamoto, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Taro Tachibana, Yoshihiro Yoneda, Yasuyuki Ohkawa

eLife   8   2019年11月

Calcineurin broadly regulates the initiation of skeletal muscle-specific gene expression by binding target promoters and facilitating the interaction of the SWI/SNF chromatin remodeling enzyme 査読 国際誌

Hanna Witwicka, Jumpei Nogami, Sabriya A. Syed, Kazumitsu Maehara, Teresita Padilla-Benavides, Yasuyuki Ohkawa, Anthony N. Imbalzano

Molecular and cellular biology   39 ( 19 )   2019年10月

Cell competition corrects noisy Wnt morphogen gradients to achieve robust patterning in the zebrafish embryo. 査読 国際誌

Yuki Akieda, Shohei Ogamino, Hironobu Furuie, Shizuka Ishitani, Ryutaro Akiyoshi, Jumpei Nogami, Takamasa Masuda, Nobuyuki Shimizu, Yasuyuki Ohkawa, Tohru Ishitani

Nature communications   10 ( 1 )   4710 - 4710   2019年10月

Sustained expression of HeyL is critical for the proliferation of muscle stem cells in overloaded muscle 査読 国際誌

Sumiaki Fukuda, Akihiro Kaneshige, Takayuki Kaji, Yu Taro Noguchi, Yusei Takemoto, Lidan Zhang, Kazutake Tsujikawa, Hiroki Kokubo, Akiyoshi Uezumi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa, So Ichiro Fukada

eLife   8   2019年9月

Biochemical analysis of nucleosome targeting by Tn5 transposase 査読 国際誌

Shoko Sato, Yasuhiro Arimura, Tomoya Kujirai, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Open Biology   9 ( 8 )   2019年8月

The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis. 査読 国際誌

Mohamed Osama Ali Abdalla, Tatsuro Yamamoto, Kazumitsu Maehara, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Hisashi Miura, Rawin Poonperm, Ichiro Hiratani, Hideki Nakayama, Mitsuyoshi Nakao, Noriko Saitoh

Nature communications   10 ( 1 )   3778 - 3778   2019年8月

Dmrt factors determine the positional information of cerebral cortical progenitors via differential suppression of homeobox genes 査読 国際誌

Daijiro Konno, Chiaki Kishida, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kiyonari, Seiji Okada, Fumio Matsuzaki

Development (Cambridge)   146 ( 15 )   2019年8月

CLEC3A, MMP7, and LCN2 as novel markers for predicting recurrence in resected G1 and G2 pancreatic neuroendocrine tumors 査読

Masami Miki, Takamasa Oono, Nao Fujimori, Takehiro Takaoka, Ken Kawabe, Yoshihiro Miyasaka, Takao Ohtsuka, Daisuke Saito, Masafumi Nakamura, Yasuyuki Ohkawa, Yoshinao Oda, Mikita Suyama, Tetsuhide Ito, Yoshihiro Ogawa

Cancer Medicine   8 ( 8 )   3748 - 3760   2019年7月

Regulation of ectopic heterochromatin-mediated epigenetic diversification by the JmjC family protein Epe1 査読

Masato Sorida, Takahiro Hirauchi, Hiroaki Ishizaki, Wataru Kaito, Atsushi Shimada, Chie Mori, Yuji Chikashige, Yasushi Hiraoka, Yutaka Suzuki, Yasuyuki Ohkawa, Hiroaki Kato, Shinya Takahata, Yota Murakami

PLoS genetics   15 ( 6 )   2019年6月

Regulation of ectopic heterochromatin-mediated epigenetic diversification by the JmjC family protein Epe1. 査読 国際誌

Masato Sorida, Takahiro Hirauchi, Hiroaki Ishizaki, Wataru Kaito, Atsushi Shimada, Chie Mori, Yuji Chikashige, Yasushi Hiraoka, Yutaka Suzuki, Yasuyuki Ohkawa, Hiroaki Kato, Shinya Takahata, Yota Murakami

PLoS genetics   15 ( 6 )   e1008129   2019年6月

Anti-tumour effects of antimicrobial peptides, components of the innate immune system, against haematopoietic tumours in Drosophila mxc mutants. 査読 国際誌

Mayo Araki, Massanori Kurihara, Suzuko Kinoshita, Rie Awane, Tetsuya Sato, Yasuyuki Ohkawa, Yoshihiro H Inoue

Disease models & mechanisms   12 ( 6 )   2019年6月

Macrophage centripetal migration drives spontaneous healing process after spinal cord injury 査読

Kazu Kobayakawa, Yasuyuki Ohkawa, Shingo Yoshizaki, Tetsuya Tamaru, Takeyuki Saito, Ken Kijima, Kazuya Yokota, Masamitsu Hara, Kensuke Kubota, Yoshihiro Matsumoto, Katsumi Harimaya, Keiko Ozato, Takahiro Masuda, Tsuda Makoto, Tomohiko Tamura, Kazuhide Inoue, V. Reggie Edgerton, Yukihide Iwamoto, Yasuharu Nakashima, Seiji Okada

Science Advances   5 ( 5 )   2019年5月

Transcriptome profiling of refractory atopic keratoconjunctivitis by RNA sequencing 査読

Akira Matsuda, Yosuke Asada, Naomasa Suita, Satoshi Iwamoto, Toshiaki Hirakata, Norihiko Yokoi, Yasuyuki Ohkawa, Yukinori Okada, Takehiko Yokomizo, Nobuyuki Ebihara

Journal of Allergy and Clinical Immunology   143 ( 4 )   1610 - 1614.e6   2019年4月

Mouse polycomb group gene Cbx2 promotes osteoblastic but suppresses adipogenic differentiation in postnatal long bones 査読

Yuko Katoh-Fukui, Takashi Baba, Tetsuya Sato, Hiroyuki Otake, Yuko Nagakui-Noguchi, Miyuki Shindo, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Hideki Tsumura, Ken-Ichirou Morohashi, Maki Fukami

Bone   120   219 - 231   2019年3月

Modeling latent flows on single-cell data using the Hodge decomposition

Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa

bioRxiv   2019年3月

Locomotor Training Increases Synaptic Structure With High NGL-2 Expression After Spinal Cord Hemisection. 査読 国際誌

Kazu Kobayakawa, Kyleigh Alexis DePetro, Hui Zhong, Bau Pham, Masamitsu Hara, Akihito Harada, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, V Reggie Edgerton

Neurorehabilitation and neural repair   33 ( 3 )   225 - 231   2019年3月

Cell-autonomous and redundant roles of Hey1 and HeyL in muscle stem cells HeyL requires HeS1 to bind diverse DNA sites 査読

Yu Taro Noguchi, Miki Nakamura, Nobumasa Hino, Jumpei Nogami, Sayaka Tsuji, Takahiko Sato, Lidan Zhang, Kazutake Tsujikawa, Toru Tanaka, Kohei Izawa, Yoshiaki Okada, Takefumi Doi, Hiroki Kokubo, Akihito Harada, Akiyoshi Uezumi, Manfred Gessler, Yasuyuki Ohkawa, So Ichiro Fukada

Development (Cambridge)   146 ( 4 )   2019年2月

Locomotor Training Increases Synaptic Structure With High NGL-2 Expression After Spinal Cord Hemisection 査読

Kazu Kobayakawa, Kyleigh Alexis DePetro, Hui Zhong, Bau Pham, Masamitsu Hara, Akihito Harada, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, V. Reggie Edgerton

Neurorehabilitation and Neural Repair   2019年1月

Anti-tumour effects of antimicrobial peptides, components of the innate immune system, against haematopoietic tumours in Drosophila mxc mutants 査読

Mayo Araki, Massanori Kurihara, Suzuko Kinoshita, Rie Awane, Tetsuya Sato, Yasuyuki Ohkawa, Yoshihiro H. Inoue

DMM Disease Models and Mechanisms   12 ( 6 )   2019年1月

Pathological changes of distal motor neurons after complete spinal cord injury 査読

Kazuya Yokota, Kensuke Kubota, Kazu Kobayakawa, Takeyuki Saito, Masamitsu Hara, Ken Kijima, Takeshi Maeda, Hiroyuki Katoh, Yasuyuki Ohkawa, Yasuharu Nakashima, Seiji Okada

Molecular Brain   12 ( 1 )   2019年1月

Fetal leydig cells dedifferentiate and serve as adult leydig stem cells 査読

Yuichi Shima, Kanako Miyabayashi, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Masao Doi, Hitoshi Okamura, Kentaro Suzuki

Development (Cambridge)   145 ( 23 )   2018年12月

Ad4BP/SF-1 regulates cholesterol synthesis to boost the production of steroids 査読

Takashi Baba, Hiroyuki Otake, Miki Inoue, Tetsuya Sato, Yasuhiro Ishihara, Ju Yeon Moon, Megumi Tsuchiya, Kanako Miyabayashi, Hidesato Ogawa, Yuichi Shima, Lixiang Wang, Ryuichiro Sato, Takeshi Yamazaki, Mikita Suyama, Masatoshi Nomura, Man Ho Choi, Yasuyuki Ohkawa, Ken ichirou Morohashi

Communications Biology   1 ( 1 )   2018年12月

Prolonged inhibition of hepatocellular carcinoma cell proliferation by combinatorial expression of defined transcription factors 査読

Yasuo Takashima, Kenichi Horisawa, Miyako Udono, Yasuyuki Ohkawa, Atsushi Suzuki

Cancer Science   109 ( 11 )   3543 - 3553   2018年11月

Prolonged inhibition of hepatocellular carcinoma cell proliferation by combinatorial expression of defined transcription factors. 査読 国際誌

Yasuo Takashima, Kenichi Horisawa, Miyako Udono, Yasuyuki Ohkawa, Atsushi Suzuki

Cancer science   109 ( 11 )   3543 - 3553   2018年11月

Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome. 査読 国際誌

Yasuhiro Arimura, Masae Ikura, Risa Fujita, Mamiko Noda, Wataru Kobayashi, Naoki Horikoshi, Jiying Sun, Lin Shi, Masayuki Kusakabe, Masahiko Harata, Yasuyuki Ohkawa, Satoshi Tashiro, Hiroshi Kimura, Tsuyoshi Ikura, Hitoshi Kurumizaka

Nucleic acids research   46 ( 19 )   10007 - 10018   2018年11月

Genome-wide analysis of the spatiotemporal regulation of firing and dormant replication origins in human cells 査読

Nozomi Sugimoto, Kazumitsu Maehara, Kazumasa Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Masatoshi Fujita

Nucleic Acids Research   46 ( 13 )   6683 - 6696   2018年7月

The Autism-Related Protein CHD8 Cooperates with C/EBPβ to Regulate Adipogenesis 査読

23 ( 7 )   1988 - 2000   2018年5月

Direct reprogramming of spiral ganglion non-neuronal cells into neurons Toward ameliorating sensorineural hearing loss by gene therapy 査読

Teppei Noda, Steven J. Meas, Jumpei Nogami, Yutaka Amemiya, Ryutaro Uchi, Yasuyuki Ohkawa, Koji Nishimura, Alain Dabdoub

Frontiers in Cell and Developmental Biology   6 ( FEB )   2018年2月

Identification of miR-305, a microRNA that promotes aging, and its target mRNAs in Drosophila 査読

Makiko Ueda, Tetsuya Sato, Yasuyuki Ohkawa, Yoshihiro H. Inoue

Genes to Cells   23 ( 2 )   80 - 93   2018年2月

Cryo-EM structure of the nucleosome containing the ALB1 enhancer DNA sequence 査読

Yoshimasa Takizawa, Hiroki Tanaka, Shinichi Machida, Masako Koyama, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Paul A. Wade, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka

Open Biology   8 ( 3 )   2018年1月

MNase, as a probe to study the sequence-dependent site exposures in the +1 nucleosomes of yeast 査読

Di Luo, Daiki Kato, Jumpei Nogami, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka, Hidetoshi Kono

Nucleic acids research   46 ( 14 )   7124 - 7137   2018年1月

Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome 査読

Yasuhiro Arimura, Masae Ikura, Risa Fujita, Mamiko Noda, Wataru Kobayashi, Naoki Horikoshi, Jiying Sun, Lin Shi, Masayuki Kusakabe, Masahiko Harata, Yasuyuki Ohkawa, Satoshi Tashiro, Hiroshi Kimura, Tsuyoshi Ikura, Hitoshi Kurumizaka

Nucleic acids research   46 ( 19 )   10007 - 10018   2018年1月

Roles of histone H3.5 in human spermatogenesis and spermatogenic disorders 査読

K. Shiraishi, A. Shindo, Akihito Harada, H. Kurumizaka, H. Kimura, Yasuyuki Ohkawa, H. Matsuyama

Andrology   6 ( 1 )   158 - 165   2018年1月

Histone methyltransferase G9a is a key regulator of the starvation-induced behaviors in Drosophila melanogaster 査読

Kouhei Shimaji, Ryo Tanaka, Toru Maeda, Mamiko Ozaki, Hideki Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Masamitsu Yamaguchi

Scientific Reports   7 ( 1 )   2017年12月

Ser7 of RNAPII-CTD facilitates heterochromatin formation by linking ncRNA to RNAi 査読

Takuya Kajitani, Hiroaki Kato, Yuji Chikashige, Chihiro Tsutsumi, Yasushi Hiraoka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Chikashi Obuse, Damien Hermand, Yota Murakami

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   114 ( 52 )   E11208 - E11217   2017年12月

Persistent detection of alternatively spliced BCR-ABL variant results in a failure to achieve deep molecular response 査読

Junichiro Yuda, Toshihiro Miyamoto, Jun Odawara, Yasuyuki Ohkawa, Yuichiro Semba, Masayasu Hayashi, Koichi Miyamura, Mitsune Tanimoto, Kazuhito Yamamoto, Masafumi Taniwaki, Koichi Akashi

Cancer Science   108 ( 11 )   2204 - 2212   2017年11月

Histone methyltransferase G9a is a key regulator of the starvation-induced behaviors in Drosophila melanogaster. 査読 国際誌

Kouhei Shimaji, Ryo Tanaka, Toru Maeda, Mamiko Ozaki, Hideki Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Masamitsu Yamaguchi

Scientific reports   7 ( 1 )   14763 - 14763   2017年11月

The novel heme-dependent inducible protein, SRRD regulates heme biosynthesis and circadian rhythms 査読

Yuka Adachi, Mana Umeda, Asako Kawazoe, Tetsuya Sato, Yasuyuki Ohkawa, Sakihito Kitajima, Shingo Izawa, Ikuko Sagami, Shigeru Taketani

Archives of Biochemistry and Biophysics   631   19 - 29   2017年10月

Biochemical and immunological characterization of a novel monoclonal antibody against mouse leukotriene B₄ receptor 1 査読

Fumiyuki Sasaki, Tomoaki Koga, Kazuko Saeki, Toshiaki Okuno, Saiko Kazuno, Tsutomu Fujimura, Yasuyuki Ohkawa, Takehiko Yokomizo

PLoS One   12 ( 9 )   2017年9月

Evolution of the sperm methylome of primates is associated with retrotransposon insertions and genome instability 査読

Kei Fukuda, Yukihiro Inoguchi, Kenji Ichiyanagi, Tomoko Ichiyanagi, Yasuhiro Go, Masashi Nagano, Yojiro Yanagawa, Noboru Takaesu, Yasuyuki Ohkawa, Hiroo Imai, Hiroyuki Sasaki

Human Molecular Genetics   26 ( 18 )   3508 - 3519   2017年9月

Interaction of reactive astrocytes with type i collagen induces astrocytic scar formation through the integrin-N-cadherin pathway after spinal cord injury 査読

Masamitsu Hara, Kazu Kobayakawa, Yasuyuki Ohkawa, Hiromi Kumamaru, Kazuya Yokota, Takeyuki Saito, Ken Kijima, Shingo Yoshizaki, Katsumi Harimaya, Yasuharu Nakashima, Seiji Okada

Nature Medicine   23 ( 7 )   818 - 828   2017年7月

Alterations in Fetal Leydig Cell Gene Expression during Fetal and Adult Development 査読

Kanako Miyabayashi, Yuichi Shima, Miki Inoue, Tetsuya Sato, Takashi Baba, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Ken-Ichirou Morohashi

Sexual Development   11 ( 2 )   53 - 63   2017年5月

GWAS of clinically defined gout and subtypes identifies multiple susceptibility loci that include urate transporter genes 査読

Akiyoshi Nakayama, Hirofumi Nakaoka, Ken Yamamoto, Masayuki Sakiyama, Amara Shaukat, Yu Toyoda, Yukinori Okada, Yoichiro Kamatani, Takahiro Nakamura, Tappei Takada, Katsuhisa Inoue, Tomoya Yasujima, Hiroaki Yuasa, Yuko Shirahama, Hiroshi Nakashima, Seiko Shimizu, Toshihide Higashino, Yusuke Kawamura, Hiraku Ogata, Makoto Kawaguchi, Yasuyuki Ohkawa, Inaho Danjoh, Atsumi Tokumasu, Keiko Ooyama, Toshimitsu Ito, Takaaki Kondo, Kenji Wakai, Blanka Stiburkova, Karel Pavelka, Lisa K. Stamp, Nicola Dalbeth, Yutaka Sakurai, Hiroshi Suzuki, Makoto Hosoyamada, Shin Fujimori, Takashi Yokoo, Tatsuo Hosoya, Ituro Inoue, Atsushi Takahashi, Michiaki Kubo, Hiroshi Ooyama, Toru Shimizu, Kimiyoshi Ichida, Nariyoshi Shinomiya, Tony R. Merriman, Hirotaka Matsuo

Annals of the Rheumatic Diseases   76 ( 5 )   869 - 877   2017年5月

Thymine DNA glycosylase modulates DNA damage response and gene expression by base excision repair-dependent and independent mechanisms 査読

Tomohumi Nakamura, Kouichi Murakami, Haruto Tada, Yoshihiko Uehara, Jumpei Nogami, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hisato Saitoh, Hideo Nishitani, Tetsuya Ono, Ryotaro Nishi, Masayuki Yokoi, Wataru Sakai, Kaoru Sugasawa

Genes to Cells   22 ( 4 )   392 - 405   2017年4月

Structure and function of human histone H3.Y nucleosome. 査読 国際誌

Tomoya Kujirai, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Kazumitsu Maehara, Shinichi Machida, Akihisa Osakabe, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Nucleic acids research   45 ( 6 )   3612 - 3612   2017年4月

ROLES OF HISTONE H3.5 IN HUMAN SPERMATOGENESIS AND SPERMATOGENIC DISORDERS 査読

Koji Shiraishi, Aya Shindo, Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Hideyasu Matsuyama

JOURNAL OF UROLOGY   197 ( 4 )   E85 - E85   2017年4月

Erratum Structure and function of human histone H3.Y nucleosome (Nucleic acids research (2016) 44 13 (6127-6141)) 査読

Tomoya Kujirai, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Kazumitsu Maehara, Shinichi Machida, Akihisa Osakabe, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Nucleic acids research   45 ( 6 )   2017年4月

Periostin Promotes Scar Formation through the Interaction between Pericytes and Infiltrating Monocytes/Macrophages after Spinal Cord Injury 査読

Kazuya Yokota, Kazu Kobayakawa, Takeyuki Saito, Masamitsu Hara, Ken Kijima, Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada, Ken Okazaki, Kohei Ishihara, Shigeo Yoshida, Akira Kudo, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

American Journal of Pathology   187 ( 3 )   639 - 653   2017年3月

Control of tissue size and development by a regulatory element in the yorkie 3'UTR 査読

Takanari Umegawachi, Hideki Yoshida, Hiromu Koshida, Momoko Yamada, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Henry M. Krause, Masamitsu Yamaguchi

American Journal of Cancer Research   7 ( 3 )   673 - 687   2017年1月

Role of Ad4-binding protein/steroidogenic factor 1 in regulating NADPH production in adrenocortical Y-1 cells 査読 国際誌

Bing Li, Takashi Baba, Kanako Miyabayashi, Tetsuya Sato, Yuichi Shima, Tomomi Ichinose, Daisuke Miura, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Ken-Ichirou Morohashi

Endocrine Journal   64 ( 3 )   315 - 324   2017年1月

Differential lactate and cholesterol synthetic activities in XY and XX Sertoli cells 査読

Yurin Shishido, Takash Baba, Tetsuy Sato, Yuich Shima, Kanak Miyabayashi, Mik Inoue, Haruhik Akiyama, Hirosh Kimura, Yoshiakir Kanai, Yasuhir Ishihara, Shogo Haraguchi, Akir Miyazaki, Damjan Rozman, Takesh Yamazaki, Man Ho Choi, Yasuyuki Ohkawa, Mikit Suyama, Ken-Ichirou Morohashi

Scientific Reports   7   2017年1月

A one-step immunostaining method to visualize rodent muscle fiber type within a single specimen 査読

Shoko Sawano, Yusuke Komiya, Riho Ichitsubo, Yasuyuki Ohkawa, Mako Nakamura, Ryuichi Tatsumi, Yoshihide Ikeuchi, Wataru Mizunoya

PLoS One   11 ( 11 )   2016年11月

Kupffer cells induce Notch-mediated hepatocyte conversion in a common mouse model of intrahepatic cholangiocarcinoma 査読

Maiko Terada, Kenichi Horisawa, Shizuka Miura, Yasuo Takashima, Yasuyuki Ohkawa, Sayaka Sekiya, Kanae Matsuda-Ito, Atsushi Suzuki

Scientific Reports   6   2016年10月

MRG15 is required for pre-mRNA splicing and spermatogenesis 査読

Naoki Iwamori, Kaoru Tominaga, Tetsuya Sato, Kevin Riehle, Tokuko Iwamori, Yasuyuki Ohkawa, Cristian Coarfa, Etsuro Ono, Martin M. Matzuk

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   113 ( 37 )   E5408 - E5415   2016年9月

CHD8 haploinsufficiency results in autistic-like phenotypes in mice. 査読 国際誌

Yuta Katayama, Masaaki Nishiyama, Hirotaka Shoji, Yasuyuki Ohkawa, Atsuki Kawamura, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Toru Takumi, Tsuyoshi Miyakawa, Keiichi I Nakayama

Nature   537 ( 7622 )   675 - 679   2016年9月

LATS2 positively regulates polycomb repressive complex 2 査読

Kosuke Torigata, Okuzaki Daisuke, Satomi Mukai, Akira Hatanaka, Fumiharu Ohka, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Yasuyuki Ohkawa, Norikazu Yabuta, Yutaka Kondo, Hiroshi Nojima

PLoS One   11 ( 7 )   2016年7月

Structure and function of human histone H3.Y nucleosome. 査読 国際誌

Tomoya Kujirai, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Kazumitsu Maehara, Shinichi Machida, Akihisa Osakabe, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Nucleic acids research   44 ( 13 )   6127 - 41   2016年7月

TLR signals posttranscriptionally regulate the cytokine trafficking mediator sortilin 査読

Toshiki Yabe-Wada, Shintaro Matsuba, Kazuya Takeda, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Yasuyuki Ohkawa, Toshiyuki Takai, Haifeng Shi, Caroline C. Philpott, Akira Nakamura

Scientific Reports   6   2016年5月

The feasibility of in vivo imaging of infiltrating blood cells for predicting the functional prognosis after spinal cord injury 査読

Kazuya Yokota, Takeyuki Saito, Kazu Kobayakawa, Kensuke Kubota, Masamitsu Hara, Masaharu Murata, Yasuyuki Ohkawa, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Scientific Reports   6   2016年5月

Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing 査読

Wataru Kobayashi, Motoki Takaku, Shinichi Machida, Hiroaki Tachiwana, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Scientific Reports   6   2016年4月

Histone H4 lysine 20 acetylation is associated with gene repression in human cells 査読

Jun Ya Kaimori, Kazumitsu Maehara, Yoko Hayashi-Takanaka, Akihito Harada, Masafumi Fukuda, Satoko Yamamoto, Naotsugu Ichimaru, Takashi Umehara, Shigeyuki Yokoyama, Ryo Matsuda, Tsuyoshi Ikura, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Naohito Nozaki, Shiro Takahara, Toshifumi Takao, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Yoshitaka Isaka

Scientific Reports   6   2016年4月

Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2 査読

Masayasu Hayashi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yuichiro Semba, Kensuke Kudo, Hidehisa Takahashi, Shinya Oki, Chikara Meno, Kenji Ichiyanagi, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa

Journal of Cellular Biochemistry   117 ( 3 )   780 - 792   2016年3月

Isolation and characterization of Fetal Leydig progenitor cells of male mice 査読

Miki Inoue, Yuichi Shima, Kanako Miyabayashi, Kaori Tokunaga, Tetsuya Sato, Takashi Baba, Yasuyuki Ohkawa, Haruhiko Akiyama, Mikita Suyama, Ken-Ichirou Morohashi

Endocrinology   157 ( 3 )   1222 - 1233   2016年3月

Identification of low-abundance proteins in serum via the isolation of HSP72 complexes 査読

Masako Tanaka, Masayuki Shiota, Takafumi Nakao, Ryo Uemura, Satoshi Nishi, Yasuyuki Ohkawa, Masaki Matsumoto, Maki Yamaguchi, Mayuko Osada-Oka, Azusa Inagaki, Katsuyuki Takahashi, Keiichi Nakayama, Min Gi, Yasukatsu Izumi, Katsuyuki Miura, Hiroshi Iwao

Journal of Proteomics   136   214 - 221   2016年3月

CHD8 haploinsufficiency results in autistic-like phenotypes in mice 査読

Yuta Katayama, Masaaki Nishiyama, Hirotaka Shoji, Yasuyuki Ohkawa, Atsuki Kawamura, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Toru Takumi, Tsuyoshi Miyakawa, Keiichi Nakayama

Nature   537 ( 7622 )   675 - 679   2016年1月

Histone H3.5 forms an unstable nucleosome and accumulates around transcription start sites in human testis 査読

Takashi Urahama, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Yuko Sato, Koji Shiraishi, Norihiro Sugino, Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Wataru Kagawa, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Epigenetics and Chromatin   9 ( 1 )   2016年1月

Exploration of nucleosome positioning patterns in transcription factor function 査読

Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Scientific Reports   6   2016年1月

Chromatin-prebound Crm1 recruits Nup98-HoxA9 fusion to induce aberrant expression of Hox cluster genes 査読

Masahiro Oka, Sonoko Mura, Kohji Yamada, Percival Sangel, Saki Hirata, Kazumitsu Maehara, Koichi Kawakami, Taro Tachibana, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Yoshihiro Yoneda

eLife   5 ( JANUARY2016 )   2016年1月

Distribution of histone H4 modifications as revealed by a panel of specific monoclonal antibodies 査読

Yoko Hayashi-Takanaka, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Takashi Umehara, Shigeyuki Yokoyama, Chikashi Obuse, Yasuyuki Ohkawa, Naohito Nozaki, Hiroshi Kimura

Chromosome Research   23 ( 4 )   753 - 766   2015年12月

Genomewide identification of target genes of histone methyltransferase dG9a during Drosophila embryogenesis 査読

Kouhei Shimaji, Takahiro Konishi, Shintaro Tanaka, Hideki Yoshida, Yasuko Kato, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Hiroshi Kimura, Masamitsu Yamaguchi

Genes to Cells   20 ( 11 )   902 - 914   2015年11月

Histone chaperone CAF-1 mediates repressive histone modifications to protect preimplantation mouse embryos from endogenous retrotransposons 査読

Yuki Hatanaka, Kimiko Inoue, Mami Oikawa, Satoshi Kamimura, Narumi Ogonuki, Eiichi N. Kodama, Yasuyuki Ohkawa, Yuichi Tsukada, Atsuo Ogura

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   112 ( 47 )   14641 - 14646   2015年11月

Influence of DNA methylation on positioning and DNA flexibility of nucleosomes with pericentric satellite DNA 査読

Akihisa Osakabe, Fumiya Adachi, Yasuhiro Arimura, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka

Open Biology   5 ( 10 )   2015年10月

Engrafted Neural Stem/Progenitor Cells Promote Functional Recovery through Synapse Reorganization with Spared Host Neurons after Spinal Cord Injury. 査読 国際誌

Kazuya Yokota, Kazu Kobayakawa, Kensuke Kubota, Atsushi Miyawaki, Hideyuki Okano, Yasuyuki Ohkawa, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Stem cell reports   5 ( 2 )   264 - 77   2015年8月

Agplus A rapid and flexible tool for aggregation plots 査読

Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Bioinformatics   31 ( 18 )   3046 - 3047   2015年7月

Sex determination. foxl3 is a germ cell-intrinsic factor involved in sperm-egg fate decision in medaka. 査読 国際誌

Toshiya Nishimura, Tetsuya Sato, Yasuhiro Yamamoto, Ikuko Watakabe, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Satoru Kobayashi, Minoru Tanaka

Science (New York, N.Y.)   349 ( 6245 )   328 - 31   2015年7月

Cdt1-binding protein GRWD1 is a novel histone-binding protein that facilitates MCM loading through its influence on chromatin architecture. 査読 国際誌

Nozomi Sugimoto, Kazumitsu Maehara, Kazumasa Yoshida, Shuhei Yasukouchi, Satoko Osano, Shinya Watanabe, Masahiro Aizawa, Takashi Yugawa, Tohru Kiyono, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Masatoshi Fujita

Nucleic acids research   43 ( 12 )   5898 - 911   2015年7月

Foxl3 is a germ cell-intrinsic factor involved in sperm-egg fate decision in medaka 査読

Toshiya Nishimura, Tetsuya Sato, Yasuhiro Yamamoto, Ikuko Watakabe, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Satoru Kobayashi, Minoru Tanaka

Science   349 ( 6245 )   328 - 331   2015年7月

Opposing calcium-dependent signalling pathways control skeletal muscle differentiation by regulating a chromatin remodelling enzyme 査読

Nature Communications   6   2015年6月

PSMC5, a 19S proteasomal ATPase, regulates cocaine action in the nucleus accumbens 査読

Yoko H. Ohnishi, Yoshinori N. Ohnishi, Takanori Nakamura, Mizuki Ohno, Pamela J. Kennedy, Ohkawa Yasuyuki, Akinori Nishi, Rachael Neve, Teruhisa Tsuzuki, Eric J. Nestler

PloS one   10 ( 5 )   2015年5月

A cluster of noncoding RNAs activates the ESR1 locus during breast cancer adaptation 査読

Saori Tomita, Mohamed Osama Ali Abdalla, Saori Fujiwara, Haruka Matsumori, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hirotaka Iwase, Noriko Saitoh, Mitsuyoshi Nakao

Nature Communications   6   2015年4月

SWI/SNF chromatin-remodeling complexes function in noncoding RNA-dependent assembly of nuclear bodies 査読

Tetsuya Kawaguchi, Akie Tanigawa, Takao Naganuma, Yasuyuki Ohkawa, Sylvie Souquere, Gerard Pierron, Tetsuro Hirose, Joan A. Steitz

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   112 ( 14 )   4304 - 4309   2015年4月

A genome-wide analysis identifies a Notch-RBP-Jk-IL-7Ra axis that controls IL-17-Producing γδ T cell homeostasis in mice 査読

194 ( 1 )   243 - 251   2015年1月

MED26 regulates the transcription of snRNA genes through the recruitment of little elongation complex 査読

Hidehisa Takahashi, Ichigaku Takigawa, Masashi Watanabe, Delnur Anwar, Mio Shibata, Chieri Tomomori-Sato, Shigeo Sato, Amol Ranjan, Chris W. Seidel, Tadasuke Tsukiyama, Wataru Mizushima, Masayasu Hayashi, Yasuyuki Ohkawa, Joan W. Conaway, Ronald C. Conaway, Shigetsugu Hatakeyama

Nature Communications   6   2015年1月

Engrafted Neural Stem/Progenitor Cells Promote Functional Recovery through Synapse Reorganization with Spared Host Neurons after Spinal Cord Injury 査読

Kazuya Yokota, Kazu Kobayakawa, Kensuke Kubota, Atsushi Miyawaki, Hideyuki Okano, Yasuyuki Ohkawa, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Stem Cell Reports   5 ( 2 )   264 - 277   2015年1月

Cdt1-binding protein GRWD1 is a novel histone-binding protein that facilitates MCM loading through its influence on chromatin architecture 査読

Nozomi Sugimoto, Kazumitsu Maehara, Kazumasa Yoshida, Shuhei Yasukouchi, Satoko Osano, Shinya Watanabe, Masahiro Aizawa, Takashi Yugawa, Tohru Kiyono, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Masatoshi Fujita

Nucleic Acids Research   43 ( 12 )   5898 - 5911   2015年1月

Regulation of RNA polymerase II activation by histone acetylation in single living cells 査読

Timothy J. Stasevich, Yoko Hayashi-Takanaka, Yuko Sato, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Kumiko Sakata-Sogawa, Makio Tokunaga, Takahiro Nagase, Naohito Nozaki, James G. McNally, Hiroshi Kimura

Nature   516 ( 7530 )   272 - 275   2014年12月

Interleukin-10-producing plasmablasts exert regulatory function in autoimmune inflammation. 査読 国際誌

Masanori Matsumoto, Akemi Baba, Takafumi Yokota, Hiroyoshi Nishikawa, Yasuyuki Ohkawa, Hisako Kayama, Axel Kallies, Stephen L Nutt, Shimon Sakaguchi, Kiyoshi Takeda, Tomohiro Kurosaki, Yoshihiro Baba

Immunity   41 ( 6 )   1040 - 51   2014年12月

Genome-wide analysis of histone modifications in human endometrial stromal cells 査読

Isao Tamura, Yasuyuki Ohkawa, Tetsuya Sato, Mikita Suyama, Kosuke Jozaki, Maki Okada, Lifa Lee, Ryo Maekawa, Hiromi Asada, Shun Sato, Yoshiaki Yamagata, Hiroshi Tamura, Norihiro Sugino

Molecular Endocrinology   28 ( 10 )   1656 - 1669   2014年10月

Acute hyperglycemia impairs functional improvement after spinal cord injury in mice and humans. 査読 国際誌

Kazu Kobayakawa, Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Kensuke Kubota, Yasuyuki Ohkawa, Junji Kishimoto, Kazuya Yokota, Ryosuke Ideta, Keiichiro Shiba, Hidetoshi Tozaki-Saitoh, Kazuhide Inoue, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Science translational medicine   6 ( 256 )   256ra137   2014年10月

Establishment of neutralizing rat monoclonal antibodies for fibroblast growth factor-2 査読

Masako Tanaka, Maki Yamaguchi, Masayuki Shiota, Yukiko Kawamoto, Katsuyuki Takahashi, Azusa Inagaki, Mayuko Osada-Oka, Akihito Harada, Hideki Wanibuchi, Yasukatsu Izumi, Katsuyuki Miura, Hiroshi Iwao, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   33 ( 4 )   261 - 269   2014年8月

Erratum Heterochromatin dynamics during the differentiation process revealed by the DNA methylation reporter mouse, MethylRO (Stem Cell Reports (2014) 2 (910-924)) 査読

Jun Ueda, Kazumitsu Maehara, Daisuke Mashiko, Takako Ichinose, Tatsuma Yao, Mayuko Hori, Yuko Sato, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Kazuo Yamagata

Stem Cell Reports   3 ( 1 )   2014年7月

Heterochromatin dynamics during the differentiation process revealed by the DNA methylation reporter mouse, methylRO 査読

Jun Ueda, Kazumitsu Maehara, Daisuke Mashiko, Takako Ichinose, Tatsuma Yao, Mayuko Hori, Yuko Sato, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Kazuo Yamagata

Stem Cell Reports   2 ( 6 )   910 - 924   2014年6月

Identification of myelin transcription factor 1 (MyT1) as a subunit of the neural cell type-specific lysine-specific demethylase 1 (LSD1) complex 査読

Atsushi Yokoyama, Katsuhide Igarashi, Tetsuya Sato, Kiyoshi Takagi, Maky I. Otsuka, Yurina Shishido, Takashi Baba, Ryo Ito, Jun Kanno, Yasuyuki Ohkawa, Ken-Ichirou Morohashi, Akira Sugawara

Journal of Biological Chemistry   289 ( 26 )   18152 - 18162   2014年6月

Hsc70 contributes to cancer cell survival by preventing Rab1A degradation under stress conditions 査読

Masako Tanaka, Saya Mun, Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa, Azusa Inagaki, Soichi Sano, Katsuyuki Takahashi, Yasukatsu Izumi, Mayuko Osada-Oka, Hideki Wanibuchi, Masayo Yamagata, Tokihito Yukimura, Katsuyuki Miura, Masayuki Shiota, Hiroshi Iwao

PLoS One   9 ( 5 )   2014年5月

Glycolytic genes are targets of the nuclear receptor Ad4BP/SF-1 査読

Takashi Baba, Hiroyuki Otake, Tetsuya Sato, Kanako Miyabayashi, Yurina Shishido, Chia Yih Wang, Yuichi Shima, Hiroshi Kimura, Mikako Yagi, Yasuhiro Ishihara, Shinjiro Hino, Hidesato Ogawa, Mitsuyoshi Nakao, Takeshi Yamazaki, Dongchon Kang, Yasuyuki Ohkawa, Mikita Suyama, Bon Chu Chung, Ken-Ichirou Morohashi

Nature Communications   5   2014年4月

Generation of a monoclonal antibody for INI1/hSNF5/BAF47 査読

Akihito Harada, Masayasu Hayashi, Yuuki Kuniyoshi, Yuichiro Semba, Satoko Sugahara, Taro Tachibana, Yasuyuki Ohkawa, Masatoshi Fujita

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   33 ( 1 )   49 - 51   2014年2月

Production of a monoclonal antibody for C/EBPβ The subnuclear localization of C/EBPβ in mouse L929 cells 査読

33 ( 1 )   34 - 37   2014年2月

Acute hyperglycemia impairs functional improvement after spinal cord injury in mice and humans 査読

Kazu Kobayakawa, Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Kensuke Kubota, Yasuyuki Ohkawa, Junji Kishimoto, Kazuya Yokota, Ryosuke Ideta, Keiichiro Shiba, Hidetoshi Saitoh, Kazuhide Inoue, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Science Translational Medicine   6 ( 256 )   2014年1月

The PPARγ locus makes long-range chromatin interactions with selected tissue-specific gene loci during adipocyte differentiation in a protein kinase a dependent manner 査読

9 ( 1 )   2014年1月

SraTailor Graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data 査読

Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno

Genes to Cells   19 ( 12 )   919 - 926   2014年1月

Interleukin-10-producing plasmablasts exert regulatory function in autoimmune inflammation 査読

Masanori Matsumoto, Akemi Baba, Takafumi Yokota, Hiroyoshi Nishikawa, Yasuyuki Ohkawa, Hisako Kayama, Axel Kallies, Stephen L. Nutt, Shimon Sakaguchi, Kiyoshi Takeda, Tomohiro Kurosaki, Yoshihiro Baba

Immunity   41 ( 6 )   1040 - 1051   2014年1月

Visualization Of Normal and Malignant Epigenetic Regulation In Hematopoiesis Utilizing Newly-Developed Histone Variant H3.3 Chipseq Analysis 査読

Odawara Jun, Miyawaki Kohta, Yuda Junichiro, Hayashi Masayasu, Maehara Kazumitsu, Shima Takahiro, Kikushige Yoshikane, Ohkawa Yasuyuki, Akashi Koichi

BLOOD   122 ( 21 )   2013年11月

Human TREX component Thoc5 affects alternative polyadenylation site choice by recruiting mammalian cleavage factor I 査読

Jun Katahira, Daisuke Okuzaki, Hitomi Inoue, Yoshihiro Yoneda, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa

Nucleic Acids Research   41 ( 14 )   7060 - 7072   2013年8月

Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos 査読

Keiko Kitajima, Shinya Oki, Yasuyuki Ohkawa, Tomoyuki Sumi, Chikara Meno

Developmental Biology   380 ( 2 )   222 - 232   2013年8月

Therapeutic activities of engrafted neural stem/precursor cells are not dormant in the chronically injured spinal cord 査読

Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Kensuke Kubota, Kazu Kobayakawa, Kazuya Yokota, Yasuyuki Ohkawa, Keiichiro Shiba, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Stem Cells   31 ( 8 )   1535 - 1547   2013年8月

β-Catenin signaling regulates Foxa2 expression during endometrial hyperplasia formation 査読

32 ( 29 )   3477 - 3482   2013年7月

A panel of specific monoclonal antibodies directed against various phosphorylated histones H3 査読

Tomohiko Yoshimi, Yasuyuki Ohkawa, Masayuki Azuma, Taro Tachibana

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   32 ( 2 )   119 - 124   2013年4月

Ly6C+Ly6G-Myeloid-derived suppressor cells play a critical role in the resolution of acute inflammation and the subsequent tissue repair process after spinal cord injury 査読

Hirokazu Saiwai, Hiromi Kumamaru, Yasuyuki Ohkawa, Kensuke Kubota, Kazu Kobayakawa, Hisakata Yamada, Takehiko Yokomizo, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Journal of Neurochemistry   125 ( 1 )   74 - 88   2013年4月

Direct isolation and RNA-seq reveal environment-dependent properties of engrafted neural stem/progenitor cells 査読

Hiromi Kumamaru, Yasuyuki Ohkawa, Hirokazu Saiwai, Hisakata Yamada, Kensuke Kubota, Kazu Kobayakawa, Koichi Akashi, Hideyuki Okano, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Nature Communications   3   2012年11月

Myeloperoxidase exacerbates secondary injury by generating highly reactive oxygen species and mediating neutrophil recruitment in experimental spinal cord injury 査読

Kensuke Kubota, Hirokazu Saiwai, Hiromi Kumamaru, Takeshi Maeda, Yasuyuki Ohkawa, Yasuaki Aratani, Tetsuo Nagano, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Spine   37 ( 16 )   1363 - 1369   2012年7月

Surf4 modulates STIM1-dependent calcium entry 査読

Yoko Fujii, Masayuki Shiota, Yasuyuki Ohkawa, Akemi Baba, Hideki Wanibuchi, Tatsuo Kinashi, Tomohiro Kurosaki, Yoshihiro Baba

Biochemical and Biophysical Research Communications   422 ( 4 )   615 - 620   2012年6月

Age-related differences in cellular and molecular profiles of inflammatory responses after spinal cord injury 査読

Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Yasuyuki Ohkawa, Hisakata Yamada, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

Journal of Cellular Physiology   227 ( 4 )   1335 - 1346   2012年4月

An improved restriction enzyme accessibility assay for analyzing changes in chromatin structure in samples of limited cell number

Yasuyuki Ohkawa, Chandrashekara Mallappa, Caroline S Dacwag Vallaster, Anthony N. Imbalzano

Myogenesis Methods and Protocols   798   531 - 542   2012年1月

Isolation of nuclei from skeletal muscle satellite cells and myofibers for use in chromatin immunoprecipitation assays

Yasuyuki Ohkawa, Chandrashekara Mallappa, Caroline S Dacwag Vallaster, Anthony N. Imbalzano

Myogenesis Methods and Protocols   798   517 - 530   2012年1月

The classification of mRNA expression levels by the phosphorylation state of RNAPII CTD based on a combined genome-wide approach 査読

Jun Odawara, Akihito Harada, Tomohiko Yoshimi, Kazumitsu Maehara, Taro Tachibana, Seiji Okada, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa

BMC Genomics   12   2011年10月

Generation of a rat monoclonal antibody specific for Hsp72 査読

Masako Tanaka, Masayuki Shiota, Seiji Okada, Akihito Harada, Jun Odawara, Saya Mun, Hiroshi Iwao, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   30 ( 4 )   397 - 400   2011年8月

Flow cytometric sorting of neuronal and glial nuclei from central nervous system tissue 査読

Seiji Okada, Hirokazu Saiwai, Hiromi Kumamaru, Kensuke Kubota, Akihito Harada, Masahiro Yamaguchi, Yukihide Iwamoto, Yasuyuki Ohkawa

Journal of Cellular Physiology   226 ( 2 )   552 - 558   2011年2月

Chromatin accessibility and transcription factor binding at the PPARγ2 promoter during adipogenesis is protein kinase A-dependent 査読

226 ( 1 )   86 - 93   2011年1月

Ossification of the posterior longitudinal ligament of the lumbar spine A case series 査読

Seiji Okada, Takeshi Maeda, Hirokazu Saiwai, Yasuyuki Ohkawa, Keiichiro Shiba, Yukihide Iwamoto

Neurosurgery   67 ( 5 )   1311 - 1318   2010年11月

Generation of a rat monoclonal antibody specific for heat shock cognate protein 70 査読

Masayuki Shiota, Hirokazu Saiwai, Saya Mun, Akihito Harada, Seiji Okada, Jun Odawara, Masako Tanaka, Hiroshi Iwao, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 5 )   453 - 456   2010年10月

Myogenic microRNA expression requires ATP-dependent chromatin remodeling enzyme function 査読

Molecular and Cellular Biology   30 ( 13 )   3176 - 3186   2010年7月

Monoclonal antibodies 6D2 and 8H3 against mouse Chd2 査読

Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 3 )   270   2010年6月

Rat monoclonal antibody specific for MyoD 査読

Akihito Harada, Yasuyuki Ohkawa, Shinpei Ao, Jun Odawara, Seiji Okada, Masayuki Azuma, Yuko Nishiyama, Mako Nakamura, Taro Tachibana

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 3 )   255 - 258   2010年6月

Rat monoclonal antibody specific for the chromatin remodeling factor, CHD1 査読

Saori Yoshimura, Akihito Harada, Jun Odawara, Masayuki Azuma, Seiji Okada, Mako Nakamura, Yasuyuki Ohkawa, Taro Tachibana

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 3 )   237 - 240   2010年6月

Monoclonal antibody specific for Dhx9/NDHII/RHA 査読

Manato Kotani, Akihito Harada, Jun Odawara, Masayuki Azuma, Seiji Okada, Yuko Nishiyama, Mako Nakamura, Taro Tachibana, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 3 )   259 - 261   2010年6月

Monoclonal antibody 8E3 against mouse Dhx9/NDHII/RHA 査読

Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 3 )   269   2010年6月

The LTB4-BLT1 axis mediates neutrophil infiltration and secondary injury in experimental spinal cord injury. 査読 国際誌

Hirokazu Saiwai, Yasuyuki Ohkawa, Hisakata Yamada, Hiromi Kumamaru, Akihito Harada, Hideyuki Okano, Takehiko Yokomizo, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

The American journal of pathology   176 ( 5 )   2352 - 66   2010年5月

Generation of a rat monoclonal antibody specific for Chd2 査読

Akihito Harada, Saori Yoshimura, Jun Odawara, Masayuki Azuma, Seiji Okada, Mako Nakamura, Taro Tachibana, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 2 )   173 - 177   2010年4月

A rat monoclonal antibody against the chromatin remodeling factor CHD5 査読

Saori Yoshimura, Tomohiko Yoshimi, Yasuyuki Ohkawa, Masayuki Azuma, Taro Tachibana

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 1 )   63 - 66   2010年2月

Production of a rat monoclonal antibody specific for Myf5. 査読 国際誌

Akihito Harada, Seiji Okada, Jun Odawara, Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Mayumi Aoki, Mako Nakamura, Yuko Nishiyama, Yasuyuki Ohkawa

Hybridoma (2005)   29 ( 1 )   59 - 62   2010年2月

Production of a rat monoclonal antibody specific for Myf5 査読

Akihito Harada, Seiji Okada, Jun Odawara, Hiromi Kumamaru, Hirokazu Saiwai, Mayumi Aoki, Mako Nakamura, Yuko Nishiyama, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 1 )   59 - 62   2010年2月

Monoclonal antibody 1H7A10 against mouse Brm 査読

Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 1 )   82   2010年2月

Monoclonal antibody 1E2G4 against mouse Myf5 査読

Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 1 )   74   2010年2月

Monoclonal antibodies 2F12H4 and 3C3F1 against mouse Pax7 査読

Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   29 ( 1 )   83   2010年2月

The LTB4-BLT1 axis mediates neutrophil infiltration and secondary injury in experimental spinal cord injury 査読

Hirokazu Saiwai, Yasuyuki Ohkawa, Hisakata Yamada, Hiromi Kumamaru, Akihito Harada, Hideyuki Okano, Takehiko Yokomizo, Yukihide Iwamoto, Seiji Okada

American Journal of Pathology   176 ( 5 )   2352 - 2366   2010年1月

Generation of a rat monoclonal antibody specific for Pax7 査読

Akihito Harada, Seiji Okada, Hirokazu Saiwai, Mayumi Aoki, Mako Nakamura, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   28 ( 6 )   451 - 453   2009年12月

Production of a rat monoclonal antibody against Brg1 査読

Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada, Mako Nakamura, Saori Yoshimura, Taro Tachibana

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   28 ( 6 )   463 - 466   2009年12月

Generation of a rat monoclonal antibody specific for Brm 査読

Seiji Okada, Akihito Harada, Hirokazu Saiwai, Mako Nakamura, Yasuyuki Ohkawa

Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy   28 ( 6 )   455 - 458   2009年12月

Does ossification of the posterior longitudinal ligament affect the neurological outcome after traumatic cervical cord injury? 査読

Seiji Okada, Takeshi Maeda, Yasuyuki Ohkawa, Katsumi Harimaya, Hirokazu Saiwai, Hiromi Kumamaru, Yoshihiro Matsumoto, Toshio Doi, Takayoshi Ueta, Keiichiro Shiba, Yukihide Iwamoto

Spine   34 ( 11 )   1148 - 1152   2009年5月

Erratum Mutation of the SNF2 family member Chd2 affects mouse development and survival (Journal of Cellular Physiology (2006) 209, (162-171)) 査読

Concetta G.A. Marfella, Yasuyuki Ohkawa, Andrew H. Coles, David S. Garlick, Stephen N. Jones, Anthony N. Imbalzano

Journal of cellular physiology   212 ( 2 )   2007年8月

Myogenin and the SWI/SNF ATPase Brg1 maintain myogenic gene expression at different stages of skeletal myogenesis 査読

Yasuyuki Ohkawa, Saori Yoshimura, Chiduru Higashi, Concetta G A Marfella, Caroline S. Dacwag, Taro Tachibana, Anthony N. Imbalzano

Journal of Biological Chemistry   282 ( 9 )   6564 - 6570   2007年3月

The protein arginine methyltransferase Prmt5 is required for myogenesis because it facilitates ATP-dependent chromatin remodeling 査読

Molecular and Cellular Biology   27 ( 1 )   384 - 394   2007年1月

Mutation of the SNF2 family member Chd2 affects mouse development and survival 査読

Concetta G A Marfella, Yasuyuki Ohkawa, Andrew H. Coles, David S. Garlick, Stephen N. Jones, Anthony N. Imbalzano

Journal of Cellular Physiology   209 ( 1 )   162 - 171   2006年10月

Mutation of the SNF2 family member Chd2 affects mouse development and survival. 査読 国際誌

Concetta G A Marfella, Yasuyuki Ohkawa, Andrew H Coles, David S Garlick, Stephen N Jones, Anthony N Imbalzano

Journal of cellular physiology   209 ( 1 )   162 - 71   2006年10月

The microphthalmia-associated transcription factor requires SWI/SNF enzymes to activate melanocyte-specific genes 査読

Ivana L. De La Serna, Yasuyuki Ohkawa, Chiduru Higashi, Chaitali Dutta, Jules Osias, Naveen Kommajosyula, Taro Tachibana, Anthony N. Imbalzano

Journal of Biological Chemistry   281 ( 29 )   20233 - 20241   2006年7月

Chromatin remodelling in mammalian differentiation Lessons from ATP-dependent remodellers 査読

Ivana L. De La Serna, Yasuyuki Ohkawa, Anthony N. Imbalzano

Nature Reviews Genetics   7 ( 6 )   461 - 473   2006年6月

Skeletal muscle specification by myogenin and Mef2D via the SWI/SNF ATPase Brg1 査読

Yasuyuki Ohkawa, Concetta G A Marfella, Anthony N. Imbalzano

EMBO Journal   25 ( 3 )   490 - 501   2006年2月

MyoD targets chromatin remodeling complexes to the myogenin locus prior to forming a stable DNA-bound complex 査読

Ivana L. De La Serna, Yasuyuki Ohkawa, Charlotte A. Berkes, Donald A. Bergstrom, Caroline S. Dacwag, Stephen J. Tapscott, Anthony N. Imbalzano

Molecular and Cellular Biology   25 ( 10 )   3997 - 4009   2005年5月

SWI/SNF chromatin remodeling complex is obligatory for BMP2-induced, Runx2-dependent skeletal gene expression that controls osteoblast differentiation 査読

Daniel W. Young, Jitesh Pratap, Amjad Javed, Brian Weiner, Yasuyuki Ohkawa, Andre Van Wijnen, Martin Montecino, Gary S. Stein, Janet L. Stein, Anthony N. Imbalzano, Jane B. Lian

Journal of Cellular Biochemistry   94 ( 4 )   720 - 730   2005年3月

SWI/SNF chromatin remodeling complex is obligatory for BMP2-induced, Runx2-dependent skeletal gene expression that controls osteoblast differentiation. 査読 国際誌

Daniel W Young, Jitesh Pratap, Amjad Javed, Brian Weiner, Yasuyuki Ohkawa, Andre van Wijnen, Martin Montecino, Gary S Stein, Janet L Stein, Anthony N Imbalzano, Jane B Lian

Journal of cellular biochemistry   94 ( 4 )   720 - 30   2005年3月

Epiregulin as a Major Autocrine/Paracrine Factor Released from ERK- and p38MAPK-Activated Vascular Smooth Muscle Cells 査読

Masanori Takahashi, Ken'ichiro Hayashi, Kenji Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Toshi Komurasaki, Akira Kitabatake, Akira Ogawa, Wataru Nishida, Masahiko Yano, Morito Monden, Kenji Sobue

Circulation   108 ( 20 )   2524 - 2529   2003年11月

Epiregulin as a major autocrine/paracrine factor released from ERK- and p38MAPK-activated vascular smooth muscle cells. 査読 国際誌

Masanori Takahashi, Ken'ichiro Hayashi, Kenji Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Toshi Komurasaki, Akira Kitabatake, Akira Ogawa, Wataru Nishida, Masahiko Yano, Morito Monden, Kenji Sobue

Circulation   108 ( 20 )   2524 - 9   2003年11月

Vascular remodeling induced by naturally occurring unsaturated lysophosphatidic acid in vivo 査読

Kenji Yoshida, Wataru Nishida, Ken'ichiro Hayashi, Yasuyuki Ohkawa, Akira Ogawa, Junken Aoki, Hiroyuki Arai, Kenji Sobue

Circulation   108 ( 14 )   1746 - 1752   2003年10月

Vascular remodeling induced by naturally occurring unsaturated lysophosphatidic acid in vivo. 査読 国際誌

Kenji Yoshida, Wataru Nishida, Ken'ichiro Hayashi, Yasuyuki Ohkawa, Akira Ogawa, Junken Aoki, Hiroyuki Arai, Kenji Sobue

Circulation   108 ( 14 )   1746 - 52   2003年10月

Calcineurin-mediated pathway involved in the differentiated phenotype of smooth muscle cells 査読

Yasuyuki Ohkawa, Ken'ichiro Hayashi, Kenji Sobue

Biochemical and Biophysical Research Communications   301 ( 1 )   78 - 83   2003年1月

Calcineurin-mediated pathway involved in the differentiated phenotype of smooth muscle cells. 査読 国際誌

Yasuyuki Ohkawa, Ken'ichiro Hayashi, Kenji Sobue

Biochemical and biophysical research communications   301 ( 1 )   78 - 83   2003年1月

A triad of serum response factor and the GATA and NK families governs the transcription of smooth and cardiac muscle genes 査読

Wataru Nishida, Mako Nakamura, Syunsuke Mori, Masanori Takahashi, Yasuyuki Ohkawa, Satoko Tadokoro, Kenji Yoshida, Kunio Hiwada, Ke N.Ichiro Hayashi, Kenji Sobue

Journal of Biological Chemistry   277 ( 9 )   7308 - 7317   2002年3月

A triad of serum response factor and the GATA and NK families governs the transcription of smooth and cardiac muscle genes. 査読 国際誌

Wataru Nishida, Mako Nakamura, Syunsuke Mori, Masanori Takahashi, Yasuyuki Ohkawa, Satoko Tadokoro, Kenji Yoshida, Kunio Hiwada, Ken'ichiro Hayashi, Kenji Sobue

The Journal of biological chemistry   277 ( 9 )   7308 - 17   2002年3月

Phenotypic modulation of vascular smooth muscle cells induced by unsaturated lysophosphatidic acids 査読

Ken'ichiro Hayashi, Masanori Takahashi, Wataru Nishida, Kenji Yoshida, Yasuyuki Ohkawa, Akira Kitabatake, Junken Aoki, Hiroyuki Arai, Kenji Sobue

Circulation Research   89 ( 3 )   251 - 258   2001年8月

Phenotypic modulation of vascular smooth muscle cells induced by unsaturated lysophosphatidic acids 査読

K Hayashi, M Takahashi, W Nishida, K Yoshida, Y Ohkawa, A Kitabatake, J Aoki, H Arai, K Sobue

CIRCULATION RESEARCH   89 ( 3 )   251 - 258   2001年8月

骨格筋分化における高次クロマチン構造解析

原田　哲仁, 大川 恭行（ 担当： 共著）

細胞工学　Vol.31 No.8  2012年8月 

An improved restriction enzyme accessibility assay (REAA) for analyzing changes in chromatin structure in samples of limited cell number.

OhkawaY., Mallappa C., Dacwag CS., Imbalzano AN.（ 担当： 共著）

2011年10月 

Isolation of nuclei from skeletal muscle satellite cells and myofibers for use in chromatin immunoprecipitation assays.

Ohkawa Y., Mallappa C., Dacwag CS., Imbalzano AN.（ 担当： 共著）

2011年10月 

創薬研究を加速する空間オミクス技術

落合博, 大川恭行（ 担当： 共著）

羊土社 実験医学 増刊  2024年5月 

1細胞エピゲノム

原田 哲仁，大川 恭行（ 担当： 共著）

ニューサイエンス社 月刊細胞  2023年7月 

クロマチン構造における転写制御の理解に向けた技術開発

原田 哲仁,富松 航佑,武 千湄,大川恭行（ 担当： 共著）

公益財団法人金原一郎記念医学医療振興財団･医学書院 生体の科学  2023年6月 

少数細胞エピゲノム解析技術の開発

原田 哲仁，大川 恭行（ 担当： 共著）

2021年12月 

空間トランスクリプトーム技術の最前線

沖真弥, 大川恭行（ 担当： 共著）

羊土社 実験医学 2021年9月号  2021年8月 

ヒストン修飾解析・クロマチン構造解析

富松航佑, 大川 恭行（ 担当： 共著）

株式会社メディカルドゥ 遺伝子医学MOOK36 2021年  2021年4月 

シングルセルでのエピゲノム情報の計測技術

原田 哲仁，大川 恭行（ 担当： 共著）

羊土社 実験医学 2020年5月号  2021年4月 

ヒストン修飾解析・クロマチン構造解析

富松航佑, 大川 恭行（ 担当： 共著）

株式会社メディカルドゥ 遺伝子医学MOOK36  2021年4月 

1細胞エピゲノム解析技術開発の最前線

大川 恭行,原田 哲仁,前原 一満（ 担当： 共著）

医歯薬出版株式会社 週刊医学のあゆみ  2021年3月 

scRNA-seqを用いた細胞系譜の軌跡推定

前原一満, 大川恭行（ 担当： 共著）

羊土社 実験医学 増刊 2020年  2020年12月 

空間オミクス実現に向けたエピゲノム解析技術

小松 哲郎，大川 恭行（ 担当： 共著）

ニューサイエンス社、月間細胞  2020年5月 

クロマチン挿入標識法（ChIL）による単一細胞エピゲノム解析

原田 哲仁,大川 恭行（ 担当： 共著）

羊土社, 実験医学 2019年増刊号  2019年12月 

クロマチン構造が規定する骨格筋分化

小松 哲郎,大川 恭行

羊土社；実験医学  2018年4月 

細胞分化にともなうクロマチン変動メカニズムの解明

大川 恭行

新学術領域「クロマチン動構造」第四回領域会議  2016年7月 

Cell fate decision on chromatin by MyoD

2015年12月 

マウス胚性幹細胞 (mESC) におけるヘテロクロマチンを介した多分化能維持機構

林　正康, 小田原　淳, 仙波　雄一郎, 國吉　勇輝, 工藤　健介, 前原 一満, 原田 哲仁, 沖 真弥, 目野 主税, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

The Diversity of Mouse Histone H3 Variants 招待 国際会議

International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function  2015年8月 

クロマチンコード解読への挑戦 -NGS解析の展開-

大川 恭行

第33回内分泌代謝学サマーセミナー  2015年7月 

ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能

原田 哲仁, 前原 一満, 大川 恭行

NGS現場の会  2015年7月 

細胞分化にともなうクロマチン変動メカニズムの解明

大川 恭行

新学術領域研究「クロマチン動構造」第３回班会議  2015年5月 

クロマチン構造にプログラムされた骨格筋分化能～エピゲノム解析で解読するヒストンバーコード～ 招待

大川 恭行

千葉大学医学研究院開催セミナー  2015年4月 

The diversity of mouse histone H3 variants. 国際会議

Epigenomics (Z2)  2015年3月 

骨格筋分化能はヒストンH3バリアントの取り込みによって制御されている

原田 哲仁, 大川 恭行

日本農芸化学会 2015 大会  2015年3月 

N6-methyladenosine is required for the processing of MyoD pre-mRNA for maintaining skeletal muscle differentiation potential. 国際会議

Keystone Symposia Chromatin and Epigenetics (C2)  2016年3月 

ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能 招待

大川 恭行

国際高等研究所 クロマチン・デコーディング研究会  2015年3月 

ヒストンH3バリアントの多様性

大川 恭行

ヒストンバリアント研究会  2015年2月 

High order chromatin remodeling in skeletal muscle differentiation 招待

2015年2月 

次世代シークエンサーによるエピゲノム解析　 ～大規模情報処理パイプラインへの取り組み～ 招待

大川 恭行

京都大学学術情報メディアセンターセミナー  2015年1月 

異種間ハイブリドーマを用いた全トランスクリプトーム解析

國吉　勇輝, 前原 一満, 原田 哲仁, 平田　早季, 加藤　倫子, 浦崎　渚, 立花　太郎, 藤田 雅俊, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

ヒストンH3バリアントの多様性

大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

骨格筋分化能はヒストンH3バリアントの取り込みによって制御される

原田 哲仁, 前原 一満, 佐藤 優子, 木村　宏, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

骨格筋芽細胞C2C12細胞に細胞周期特異的に発現する遺伝子の同定

工藤　健介, 國吉　勇輝, 仙波 雄一郎, 林　正康, 小田原　淳, 前原 一満, 原田 哲仁, 沖 英次, 前原 喜彦, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

ヌクレオソーム配置パターンが表現する転写因子機能

前原 一満, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

ヒストンH3バリアントの多様性

大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

骨格筋分化能はヒストンH3バリアントの取り込みによって制御される

原田 哲仁, 前原 一満, 佐藤 優子, 木村　宏, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

ES細胞におけるChd2クロマチンリモデリング因子の機能解析

仙波　雄一郎, 小田原　淳, 林　正康, 工藤　健介, 國吉　勇輝, 前原 一満, 原田 哲仁, 立花 太郎, 沖 真弥, 目野 主税, 大川 恭行

第37回日本分子生物学年会  2014年11月 

クロマチンの機能的エレメントとして働くヌクレオソーム配置パターンの探索

前原 一満, 大川 恭行

定量生物学の会  2014年11月 

骨格筋分化における空間クロマチン制御へのアプローチ

大川 恭行

定量生物学の会  2014年11月 

クロマチン構造制御による骨格筋分化運命機構の解明

大川 恭行

第二回 若手による骨格筋細胞研究会  2014年11月 

骨格筋分化におけるヒストンバリアントによるエピゲノム制御 招待

大川 恭行

第87回日本生化学会大会  2014年10月 

ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能形成

大川 恭行

新学術領域研究 「性差構築の分子基盤」第６回領域会議  2014年10月 

ヒストンバリアントによる遺伝子選択 ～ヒストンバーコード解析の新たな展開～ 招待

大川 恭行

第75回日本癌学会学術総会  2014年9月 

ヒストンバリアントが制御する骨格筋分化能～ヒストンバーコード説の新たな展開～ 招待

大川 恭行

基礎生物学研究所　招聘セミナー講演  2014年9月 

Incorporation of Histone H3 Variants Dictates the Lineage Potential of Skeletal Muscle 国際会議

FASEB;Science Research Conferences  2014年7月 

細胞分化にともなうクロマチン変動メカニズムの解明

大川 恭行

第2回「動的クロマチン構造と機能」班会議・若手交流ワークショップ  2014年7月 

機能を表現するヌクレオソーム配置パターンの探索

前原 一満, 大川 恭行

第2回「動的クロマチン構造と機能」班会議・若手交流ワークショップ  2014年7月 

選択的なヒストンH 3 バリアントの取り込みは骨格筋分化能を決定づける

原田　哲仁, 前原 一満, 大川 恭行

第2回「動的クロマチン構造と機能」班会議・若手交流ワークショップ  2014年7月 

選択的なヒストンH3バリアントの取り組みは骨格筋分化能を決定づける

原田　哲仁, 大川 恭行

第66回日本細胞生物学会大会  2014年6月 

Exploring nucleosome positioning patterns act as a functional component of chromatin structure 国際会議

2014年6月 

Diversity of histone H3 variants on mouse genome 国際会議

2014年6月 

Incorporation of Histone H3 Variants Dictates Myogenesis 国際会議

2014年6月 

The balance of histone H3 variants around transcription start sites dictates cell differential potential 国際会議

Keystone Symposia  2014年2月 

The formation of nucleosome positioning patterns flanked by transcription factor binding site 国際会議

Keystone Symposia  2014年2月 

骨格筋分化運命を決定するゲノムマーキング機構 招待

大川 恭行

2014年1月 

ヒストンH3バリアントの選択的取り込みは骨格筋分化能を支配する

原田　哲仁, 前原 一満, 大川 恭行

第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

単一のChIP-Seqデータを使った細胞分化におけるヌクレオソーム配置と転写因子結合の一体的解析

大川 恭行, 前原　一満

第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

RNA polymerase IIのC末端ドメイン構造の非リン酸化修飾の網羅的解読

小田原　淳, 前原　一満, 原田　哲仁, 赤司 浩一, 大川 恭行

第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

マウス胚性幹細胞においてChromodomain Helicase DNA binding protein (Chd5)はOct3/4と共役して未分化性の維持に寄与する

林　正康, 小田原　淳, 原田　哲仁, 前原 一満, 赤司 浩一, 大川 恭行

第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

ヒストンH3バリアントは骨格筋分化能を決定する

大川 恭行, 原田　哲仁, 前原 一満

第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

骨格筋分化運命決定のメカニズムを追う～クロマチン構造からみる筋形成～ 招待

大川 恭行

第一回若手による骨格筋研究会  2013年11月 

クロマチン構造から解く遺伝子発現制御機構の解明 招待

大川 恭行

新学術領域研究「動く細胞と秩序」第3回若手の会  2013年11月 

Epigenomic approach unveils cell fate decision 招待

2013年9月 

ヒストンバリアントによる細胞運命制御 招待

大川 恭行

（独）国立成育研究医療センター招待講演  2013年9月 

High order chromatin regulation in skeletal muscle differentiation

2013年9月 

Histone bariants determine the lineage potential of skeletal muscle 国際会議

Fukuoka Internasional Symposium on Genomics & Epigenomics 2013  2013年9月 

性差を構築するクロマチン構造基盤の解明

大川 恭行

新学術領域研究「性差構築の分子基盤」第5回領域会議  2013年9月 

生命を形作る道の暗号を解読する

大川 恭行

一般公開シンポジウム「DNAをあやつる生物のしくみ」  2013年8月 

Exhaustive decoding of RNA polymerase II C-terminal domain non-phosphorylation modification.

2013年8月 

細胞分化にともなうクロマチン変動メカニズムの解明

大川 恭行

新学術領域研究「動的クロマチン構造と機能」第１回班会議  2013年8月 

細胞分化における高次クロマチン構造制御機構 招待

大川 恭行

千里ライフサイエンスセミナー「エピジェネティクス制御からの生命活動の理解とその展望」  2013年7月 

共局在性を評価する回帰モデルとENCODEデータセットを用いたChlP-seqデータの複数サンプル比較解析法

前原　一満, 小田原　淳, 原田　哲仁, 大川 恭行

第65回日本細胞生物学会大会  2013年6月 

ヒストンバリアントH3.3による細胞運命決定

大川 恭行

第65回日本細胞生物学会大会  2013年6月 

ヒストンバリアントによる骨格筋運命決定

大川 恭行, 原田　哲仁

第7回日本エピジェネティクス研究会年会  2013年5月 

A novel approach to identify mutations responsible for leukemogenesis based on epigenetic inforimation.

2013年5月 

次世代シークエンサーによる細胞分化運命決定メカニズムの解明 招待

大川 恭行

第56回日本腎臓学会学術総会  2013年5月 

ヒストンバリアントによる骨格筋分化制御機構

大川 恭行

第１回ヒストンバリアント研究会  2013年3月 

Chd2 incorporates H3.3 to mark myogenic genes. 招待 国際会議

2013年1月 

選択的なヒストンバリアントH3.3の取り込みによる造血細胞分化運命決定機構の解明

小田原　淳, 林　正康, 前原　一満, 原田　哲仁, 赤司 浩一, 大川 恭行

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

Chd2依存的なH3.3マーキングが筋発生における骨格筋遺伝子のbivalent geneの形成に必要である

原田　哲仁, 前原　一満, 小田原　淳, 大川 恭行

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

mRNA新規小胞体標的化機構の分子メカニズムの解明

梅河内 隆成, 臼井 一馬, 佐藤 哲也, 須山 幹太, 大川 恭行, 山口 政光, 吉田 英樹

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

高次クロマチン構造制御による骨格筋分化制御 招待

大川 恭行

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

組織特異的転写因子Ad4BP/SF-1による解糖系遺伝子群の転写を介したグルコース代謝制御

馬場 崇, 大竹 博之, 佐藤 哲也, 宮林 香奈子, 宍戸 祐里菜, 嶋 雄一, 木村 宏, 大川 恭行, 須山 幹太, 諸橋 憲一郎

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

ショウジョウバエヒストンメチル基転移酵素dG9aは複眼形態形成過程においてEGFR経路の制御に関与する

嶋路 耕平, 小西 貴大, 田中 伸太朗, 木村 宏, 大川 恭行, 佐藤 哲也, 須山 幹太, 吉田 英樹, 山口 政光

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

マウス亜種間におけるエピゲノム多型の解析

一柳 健司, 一柳 朋子, 藤 英博, 大川 恭行, 佐々木 裕之

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

CHD5(Chromodomain helicase DNA binding protein 5)はマウスの胚性幹細胞においてH3.1と結合して遺伝子発現を抑制しうる

林　正康, 小田原　淳, 原田　哲仁, 前原　一満, 赤司 浩一, 大川 恭行

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

Cdt1結合蛋白質GRWD1は複製ライセンシングおよび細胞増殖に関わる新規ヒストンシャペロンである

杉本 のぞみ, 安河内 周平, 前原　一満, 清野 透, 胡桃坂 仁志, 大川 恭行, 藤田 雅俊

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

成獣ライディッヒ細胞における新規Ad4BP/SF-1標的遺伝子の同定

大竹 博之, 馬場 崇, 佐藤 哲也, 嶋 雄一, 宮林 香奈子, 木村 宏, 大川 恭行, 須山 幹太, 諸橋 憲一郎

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

RNA-seq解析によるフィトクロムBの選択的スプライシング制御の標的遺伝子同定とその機能推定

柴田 磨己, 四方 明格, 牛島 智一, 大川 恭行, 久原 哲, 松下 智直

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

共局在回帰モデルとENCODEデータセットを介したChIP-seqデータの多サンプル比較解析

前原　一満, 小田原　淳, 原田　哲仁, 大川 恭行

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

ショウジョウバエ転写因子DREFを中心とした転写制御ネットワーク：DREFの標的としてのHippo経路関連遺伝子の同定

藤原 俊介, 堀井 健志, 平塚 賢, 大川 恭行, 佐藤 哲也, 須山 幹太, 吉田 英樹, 山口 政光

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

モノクローナル抗体を用いたリン酸化ヒストンH3の解析

吉見 智彦, 大川 恭行, 東 雅之, 立花 太郎

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

ヒストンバリアントによるゲノムマーキングが骨格筋分化運命決定する 招待

大川 恭行

第13回Wakoつくばフォーラム「細胞運命の制御メカニズム」  2012年11月 

遺伝子をすべて見る研究への試み ―多様化するエピゲノム解析― 招待

大川 恭行

HPCIワークショップ2012（日本バイオインフォマティクス学会 創薬インフォマティクス研究会）  2012年11月 

ヒストンバリアントH3.3取り込みによる骨格筋分化運命決定 招待

大川 恭行

平成24年度遺伝研研究会「染色体ドメインの形成と機能発現機構」  2012年10月 

「Deep sequecerによる実戦的解析　副題：ChIPseq解析からトランスクリプトーム解析でのトラブルシューティング」 招待

大川 恭行

第4回新学術領域研究「性差構築の分子基盤」領域会議  2012年10月 

遺伝子をすべて見る研究への挑戦

大川　恭行

「京」シンポジウム　新生命科学分野開拓とスーパーコンピュータ「京」  2012年8月 

高次クロマチン構造における細胞分化運命決定

大川　恭行

第33回日本炎症・再生医学会  2012年7月 

骨格筋分化における高次クロマチン構造制御機構の解明

大川　恭行

新学術領域「遺伝情報収納・発現・継承の時空間場」・第5回班会議  2012年6月 

ヒストンバリアントH3.3取り込みによる骨格筋分化運命決定

大川　恭行

第6回日本エピジェネティクス研究会年会  2012年5月 

次世代シークエンサーを用いた高次クロマチン構造解析 招待

大川　恭行

大阪大学生命機能研究科コロキアム  2012年1月 

Chd-2 dependent deposition of H3.3 is required for myogenic cell fate. 国際会議

KEYSTONE SYMPOSIA  2012年1月 

Control of gene expression through the phosphorylation of Ser2 and Ser5 of RNAPⅡ: A combined analysis for ChIPseq and RNAseq. 国際会議

2012年1月 

The deposition of histone varients is the basis of chromatin structual changes in cell fate decision.

Yasuyuki Ohkawa, Jun Odawara, Akihito Harada

2011年12月 

Control of gene expression through the phosphorylation of Ser2 and Ser5 of RNAPⅡ: A combined analysis for ChIPseq and RNAseq.

第34回日本分子生物学会年会  2011年12月 

Visualization for nuclear distribution of PPARδ in myoblast.

第34回日本分子生物学会年会  2011年12月 

Chd-2 dependent deposition of H3.3 is crucial for Brg1 recruitment in myogenesis.

Akihito Harada, Jun Odawara, Kazumitu Maehara, Tomohiko Yoshimi, Saori Yoshimura, Taro Tachibana, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

2011年12月 

Chd-2 dependent deposition of H3.3 is crucial for Brg1 recruitment in myogenesis.

Akihito Harada, Jun Odawara, Kazumitu Maehara, Tomohiko Yoshimi, Saori Yoshimura, Taro Tachibana, Hitoshi Kurumizaka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa

2011年12月 

次世代シークエンサーを用いた高次クロマチン構造解析

大川　恭行

新学術領域研究「遺伝情報場」 第2回異分野融合workshop  2011年11月 

次世代シークエンサーを用いた高次クロマチン構造解析 招待

大川　恭行

「サイエンス交流会」次世代ｼｰｸｴﾝｻｰをもちいた最先端ｹﾞﾉﾑ解析  2011年7月 

次世代シークエンサーによる細胞分化運命決定メカニズムの解明 招待

大川　恭行

岡山大学　守屋研究室　セミナー  2011年7月 

分化遺伝子選択における時空間制御機構の解明

大川　恭行

新学術領域研究「遺伝情報場」班会議  2011年6月 

Spatial re-organization of regulatory sequences temporally controls gene expression.

Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada, Anthony Imbalzano

2010年12月 

骨格筋分化へ運命決定するクロマチンリモデリング因子Chd2によるゲノムマーキング機構

大川　恭行

H22年度遺伝研研究会「細胞核超分子複合体の動態とその機能」  2010年10月 

高次クロマチン構造変換が決定する細胞分化運命

大川　恭行

分子細胞生物学セミナー  2010年7月 

Chd2 determines myogenic cell fate 国際会議

The 8th Stem Cell Research Symposium  2010年5月 

Spatial re-organization of regulatory sequences in myogenesis.

Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada and Anthony Imbalzano

2009年12月 

Genomic clustering accompanies cellular differentiation to temporally control gene expression 国際会議

The 8th International Workshop on advanced Genomics [Expansion of Genome Science]  2009年6月 

連続免疫染色法による高解像度空間オミクスの開発 招待

大川恭行

2024年2月 

組織形成を理解するための単一細胞マルチオミクスの開発 招待

大川恭行

創薬医学講座  2024年2月 

組織形成を理解するための単一細胞マルチオミクスの開発 招待

原田 哲仁、富松航佑、藤井健、大川恭行

第46回日本分子生物学会  2023年11月 

Developing single-cell multi-omics to understand tissue formation 招待 国際会議

Yasuyuki Ohkawa

2023年11月 

マルチオミクスの開発と実践 招待

大川恭行

東京大学薬学系研究科大学院講義  2023年11月 

組織形成を理解するための単一細胞マルチオミクスの開発 招待

大川恭行

奈良県立医科大学講演  2023年10月 

Comprehensive Analysis of Signal Transduction Activation Pathways through Sequential Immunostaining 国際会議

Yasuyuki Ohkawa

Single Cell Genomics Conference 2023  2023年10月 

遺伝子発現制御を包括的に解析する技術の開発 招待

大川恭行

2023年度国立遺伝学研究所クロマチン研究会（NIG-JOINT）  2023年10月 

トランスクリプトミクスで迫る細胞分化能 招待

大川恭行

大阪大学産業科学研究所セミナー  2023年9月 

組織形成を理解するための単一細胞マルチオミクスの開発

大川恭行

＜MBL＞ 第34回 高遠シンポジウム  2023年8月 

空間オミクスの現状と高度化

大川恭行

令和4年度BINDSシンポジウム  2022年8月 

トランスクリプトミクスによる筋再生過程の高深度解析 招待

大川恭行

第9回日本筋学会学術集会/第10回筋ジストロフィー医療研究会  2023年8月 

クロマチン構造レベルで理解するゲノムワイドな遺伝子発現制御 招待

大川恭行

生物科学特別講義  2023年5月 

骨格筋幹細胞の運命決定を遺伝子発現制御から理解する　～単一細胞エピゲノム解析から空間マルチオミクスへの展開～ 招待

大川恭行

生物科学セミナー  2023年5月 

Development of spatial multi-omics for understanding skeletal muscle aging 招待 国際会議

Yasuyuki Ohkawa

1st Symposium on "Skeletal muscle cells in Growth and Disease"  2023年5月 

単一細胞マルチオミクスによる骨格筋分化制御機構の解明 招待

大川恭行

第6回運動器と健康研究会  2023年3月 

Spatial multi-omics for understanding chromatin dynamics 招待

2023年1月 

データから変化を取り出す新たな単一細胞解析技術 招待

大川恭行

【富士フイルム】講演  2023年1月 

Single-cell multi-targeted chromatin integration labeling technology for understanding chromatin dynamics 招待 国際会議

Yasuyuki Ohkawa

CSHA meeting on Integrative Epigenetics in Plants  2022年12月 

空間オミクス技術によるクロマチン構造制御メカニズムの解明 招待

大川恭行

第95回日本生化学会大会  2022年11月 

細胞恒常性を担うシグナルと遺伝子発現の制御 招待

大川恭行

第16回日本臨床ストレス応答学会  2022年11月 

高深度解析による全ゲノムレベルの単一細胞オミクスへの挑戦 招待

大川恭行

2022年10月 

単一細胞軌跡追跡によるクロマチンダイナミクスの解明 招待

大川恭行

2022年度国立遺伝学研究所クロマチン研究会  2022年10月 

Chromatin regulation during skeletal muscle regeneration 招待

Yasuyuki Ohkawa

2022年10月 

骨格筋分化のクロマチンダイナミクス 招待

大川恭行

日本遺伝学会第94回大会  2023年9月 

Spatial multi-omics for understanding gene expression regulated by cell-cell interaction 招待 国際会議

Yasuyuki Ohkawa

Japan-UK Regulation through Chromatin Conference  2022年8月