2024/10/02 更新

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オオイシ ヒロアキ
大石 裕晃
OHISHI HIROAKI
所属
生体防御医学研究所 附属高深度オミクスサイエンスセンター 助教
システム生命科学府 システム生命科学専攻(併任)
職名
助教
連絡先
メールアドレス
電話番号
0926426882
プロフィール
蛍光イメージングを用いたマルチ空間オミクス技術は、DNA、RNA、タンパク質の局在を単一細胞レベルで観察可能な革新的な技術である。より高精度な技術開発に向けて、分子種の検出感度の向上に取り組んでおり、微細かつ大規模な核内での生命現象の解析を進めていく。また生細胞で高精度に特定遺伝子の転写と遺伝子座を同時に可視化技術を用いて高次ゲノム構造による転写動態制御機構の解明も進めている。

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ:ゲノムインプリンティングによる遺伝子の転写制御機構の解明を目指している。ゲノムインプリンティングは、雌雄のエピゲノム、とくにDNAメチル化の差異により、アレル間で遺伝子発現量に差が生じる現象である。この制御機構は、核内の微小環境における高次ゲノム構造、転写抑制因子、転写共役因子など、複数の要素によって調節される。この分子機構の詳細を明らかにするために、生細胞イメージングの特定領域およびマルチ空間オミクス技術を活用して研究を進めている。ゲノムインプリンティングの破綻は遺伝性疾患の原因となるため、その詳細な制御機構の解明は、ヒト疾患の病態解明や治療戦略の開発の基礎となる。

    研究キーワード:ゲノムインプリンティング

    研究期間: 2023年3月

受賞

  • 若手優秀発表賞

    2023年6月   日本細胞生物学会  

  • ポスター優秀研究員賞

    2022年6月   日本ゲノム編集学会  

  • 最優秀ポスター賞

    2014年7月   第17回生医研リトリート2014  

論文

  • Image Analysis Protocol for DNA/RNA/Immunofluorescence (IF)-seqFISH Data 国際誌

    Ohishi H., Ochiai H.

    Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   2856   419 - 432   2025年   ISSN:1064-3745

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)  

    Imaging-based spatial multi-omics technologies facilitate the analysis of higher-order genomic structures, gene transcription, and the localization of proteins and posttranslational modifications (PTMs) at the single-allele level, thereby enabling detailed observations of biological phenomena, including transcription machinery within cells and tissues. This chapter details the principles of such technologies, with a focus on DNA/RNA/immunofluorescence (IF) sequential fluorescence in situ hybridization (seqFISH). A comprehensive step-by-step protocol for image analysis is provided, covering image preprocessing, spot detection, and data visualization. For practical application, complete Jupyter Notebook codes are made available on GitHub ( https://github.com/Ochiai-Lab/seqFISH_analysis ).

    DOI: 10.1007/978-1-0716-4136-1_24

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  • Anti-phase clustering of regulatory factors shapes gene bursting

    Bitong Li, Yew Yan Wong, Neftali Flores-Rodriguez, Tara Davidson, Matthew S Graus, Valeriia Smialkovska, Hiroaki Ohishi, Angelika Feldmann, Hiroshi Ochiai, Mathias Francois

    bioRxiv   2024年9月

  • Precise immunofluorescence canceling for highly multiplexed imaging to capture specific cell states 査読

    Tomimatsu, K; Fujii, T; Bise, R; Hosoda, K; Taniguchi, Y; Ochiai, H; Ohishi, H; Ando, K; Minami, R; Tanaka, K; Tachibana, T; Mori, S; Harada, A; Maehara, K; Nagasaki, M; Uchida, S; Kimura, H; Narita, M; Ohkawa, Y

    NATURE COMMUNICATIONS   15 ( 1 )   3657   2024年5月   eISSN:2041-1723

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Nature Communications  

    Cell states are regulated by the response of signaling pathways to receptor ligand-binding and intercellular interactions. High-resolution imaging has been attempted to explore the dynamics of these processes and, recently, multiplexed imaging has profiled cell states by achieving a comprehensive acquisition of spatial protein information from cells. However, the specificity of antibodies is still compromised when visualizing activated signals. Here, we develop Precise Emission Canceling Antibodies (PECAbs) that have cleavable fluorescent labeling. PECAbs enable high-specificity sequential imaging using hundreds of antibodies, allowing for reconstruction of the spatiotemporal dynamics of signaling pathways. Additionally, combining this approach with seq-smFISH can effectively classify cells and identify their signal activation states in human tissue. Overall, the PECAb system can serve as a comprehensive platform for analyzing complex cell processes.

    DOI: 10.1038/s41467-024-47989-9

    Web of Science

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  • Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells 査読

    Kubo, N; Uehara, R; Uemura, S; Ohishi, H; Shirane, K; Sasaki, H

    NATURE COMMUNICATIONS   15 ( 1 )   3266   2024年4月   eISSN:2041-1723

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Nature Communications  

    DNA methyltransferase 3A (DNMT3A) and its catalytically inactive cofactor DNA methyltransferase 3-Like (DNMT3L) proteins form functional heterotetramers to deposit DNA methylation in mammalian germ cells. While both proteins have an ATRX-DNMT3-DNMT3L (ADD) domain that recognizes histone H3 tail unmethylated at lysine-4 (H3K4me0), the combined and differential roles of the domains in the two proteins have not been fully defined in vivo. Here we investigate DNA methylation landscapes in female and male germ cells derived from mice with loss-of-function amino acid substitutions in the ADD domains of DNMT3A and/or DNMT3L. Mutations in either the DNMT3A-ADD or the DNMT3L-ADD domain moderately decrease global CG methylation levels, but to different degrees, in both germ cells. Furthermore, when the ADD domains of both DNMT3A and DNMT3L lose their functions, the CG methylation levels are much more reduced, especially in oocytes, comparable to the impact of the Dnmt3a/3L knockout. In contrast, aberrant accumulation of non-CG methylation occurs at thousands of genomic regions in the double mutant oocytes and spermatozoa. These results highlight the critical role of the ADD-H3K4me0 binding in proper CG and non-CG methylation in germ cells and the various impacts of the ADD domains of the two proteins.

    DOI: 10.1038/s41467-024-47699-2

    Web of Science

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    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41467-024-47699-2

  • Transcription-coupled changes in higher-order genomic structure and transcription hub viscosity prolong enhancer-promoter connectivity

    Hiroaki Ohishi, Soya Shinkai, Hitoshi Owada, Takeru Fujii, Kazufumi Hosoda, Shuichi Onami, Takashi Yamamoto, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Ochiai

    bioRxiv   2023年11月

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    記述言語:その他  

    DOI: 10.1101/2023.11.27.568629

  • Precise immunofluorescence canceling for highly multiplexed imaging capturing specific cell state

    Kosuke Tomimatsu, Takeru Fujii, Ryoma Bise, Kazufumi Hosoda, Yosuke Taniguchi, Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Kanta Ando, Ryoma Minami, Tachibana Taro, Kaori Tanaka, Seiichi Mori, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Masao Nagasaki, Seiichi Uchida, Hiroshi Kimura, Masashi Narita, Yasuyuki Ohkawa

    bioRxiv   2023年10月

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    記述言語:その他  

    DOI: 10.1101/2023.10.17.561810

  • Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells

    Naoki Kubo, Ryuji Uehara, Shuhei Uemura, Hiroaki Ohishi, Kenjiro Shirane, Hiroyuki Sasaki

    bioRxiv   2023年9月

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    記述言語:その他  

    DOI: 10.1101/2023.09.07.556008

  • The DNMT3A ADD domain is required for efficient de novo DNA methylation and maternal imprinting in mouse oocytes 査読

    Ryuji Uehara, Wan Kin Au Yeung, Keisuke Toriyama, Hiroaki Ohishi, Naoki Kubo, Hidehiro Toh, Isao Suetake, Kenjiro Shirane, Hiroyuki Sasaki

    PLOS Genetics   19 ( 8 )   e1010855 - e1010855   2023年8月

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pgen.1010855

  • Organization of transcription and 3D genome as revealed by live-cell imaging. 査読 国際誌

    Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Yuko Sato, Hiroshi Kimura

    Current opinion in structural biology   81   102615 - 102615   2023年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102615

  • STREAMING-Tag System: Technology to Enable Visualization of Transcriptional Activity and Subnuclear Localization of Specific Endogenous Genes 国際誌

    Ohishi H., Ochiai H.

    Methods in Molecular Biology   2577   103 - 122   2023年   ISSN:10643745

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Methods in Molecular Biology  

    The Spliced TetO REpeAt, MS2 repeat, and INtein sandwiched reporter Gene tag (STREAMING-tag) system enables imaging of nuclear localization as well as the transcription activity of a specific endogenous gene at sub-100-nm resolution in living cells. The use of this system combined with imaging of epigenome states enables a detailed analysis of the impact of epigenome status on transcriptional dynamics. In this chapter, we describe a method for quantifying distances between Nanog gene and clusters of cofactor BRD4 using the STREAMING-tag system in mouse embryonic stem cells.

    DOI: 10.1007/978-1-0716-2724-2_8

    Scopus

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  • STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity 査読

    Hiroaki Ohishi, Seiru Shimada, Satoshi Uchino, Jieru Li, Yuko Sato, Manabu Shintani, Hitoshi Owada, Yasuyuki Ohkawa, Alexandros Pertsinidis, Takashi Yamamoto, Hiroshi Kimura, Hiroshi Ochiai

    Nature Communications   2022年12月

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-022-35286-2

  • STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity

    Hiroaki Ohishi, Seiru Shimada, Satoshi Uchino, Jieru Li, Yuko Sato, Manabu Shintani, Hitoshi Owada, Yasuyuki Ohkawa, Alexandros Pertsinidis, Takashi Yamamoto, Hiroshi Kimura, Hiroshi Ochiai

    bioRxiv   2022年1月

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    記述言語:その他   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1101/2022.01.06.472721

  • The DNMT3A PWWP domain is essential for the normal DNA methylation landscape in mouse somatic cells and oocytes. 査読 国際誌

    Kanako Kibe, Kenjiro Shirane, Hiroaki Ohishi, Shuhei Uemura, Hidehiro Toh, Hiroyuki Sasaki

    PLoS genetics   17 ( 5 )   e1009570   2021年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pgen.1009570

  • Ddhd1 knockout mouse as a model of locomotive and physiological abnormality in familial spastic paraplegia. 査読 国際誌

    Takuya Morikawa, Hiroaki Ohishi, Kengo Kosaka, Tomofumi Shimojo, Akihiro Nagano, Itsuki Taniguchi, Ryuta Fujioka, Kosei Moriyama, Motoko Unoki, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    Bioscience reports   41 ( 2 )   2021年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1042/BSR20204171

  • Characterization of genetic-origin-dependent monoallelic expression in mouse embryonic stem cells. 査読 国際誌

    Hiroaki Ohishi, Wan Kin Au Yeung, Motoko Unoki, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kenjiro Shirane, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

    Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   25 ( 1 )   54 - 64   2020年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/gtc.12736

  • Poorly controlled diabetes during pregnancy and lactation activates the Foxo1 pathway and causes glucose intolerance in adult offspring. 査読 国際誌

    Yukihiro Inoguchi, Kenji Ichiyanagi, Hiroaki Ohishi, Yasutaka Maeda, Noriyuki Sonoda, Yoshihiro Ogawa, Toyoshi Inoguchi, Hiroyuki Sasaki

    Scientific reports   9 ( 1 )   10181 - 10181   2019年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41598-019-46638-2

  • Zfp281 Shapes the Transcriptome of Trophoblast Stem Cells and Is Essential for Placental Development. 査読 国際誌

    Takashi Ishiuchi, Hiroaki Ohishi, Tetsuya Sato, Satoshi Kamimura, Masayoshi Yorino, Shusaku Abe, Atsushi Suzuki, Teruhiko Wakayama, Mikita Suyama, Hiroyuki Sasaki

    Cell reports   27 ( 6 )   1742 - 1754   2019年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.celrep.2019.04.028

  • Role of UHRF1 in de novo DNA methylation in oocytes and maintenance methylation in preimplantation embryos. 査読 国際誌

    Shoji Maenohara, Motoko Unoki, Hidehiro Toh, Hiroaki Ohishi, Jafar Sharif, Haruhiko Koseki, Hiroyuki Sasaki

    PLoS genetics   13 ( 10 )   e1007042   2017年10月

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    記述言語:英語  

    DOI: 10.1371/journal.pgen.1007042

  • Potential role for S100A4 in the disruption of the blood-brain barrier in collagen-induced arthritic mice, an animal model of rheumatoid arthritis. 査読 国際誌

    T Nishioku, K Furusho, A Tomita, H Ohishi, S Dohgu, H Shuto, A Yamauchi, Y Kataoka

    Neuroscience   189   286 - 92   2011年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.neuroscience.2011.05.044

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書籍等出版物

  • イメージングによる空間配置情報を保持した1細胞トランスクリプトーム解析ーseqFISH+

    大石 裕晃

    羊土社  2020年12月 

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    担当ページ:総ページ数:267p   記述言語:日本語  

講演・口頭発表等

  • 胚性幹細胞における単アリル性発現遺伝子はゲノム及び付随したエピゲノムによって制御される

    大石 裕晃, 鵜木 元香, 一柳 健司, 福田 渓, 白根 健次郎, 前之原 章司, 佐渡 敬, 佐々木 裕之

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 胚性幹細胞における単アレル性発現遺伝子の由来とその転写制御

    大石 裕晃, 鵜木 元香, 福田 渓, 堀 恭平, 前之原 章司, 千葉 初音, 佐渡 敬, 佐々木 裕之

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 胎児期および授乳期の血糖コントロール不良の母体糖尿病への暴露は仔の成長後の耐糖能と肝代謝に影響を与える

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    日本体質医学会雑誌  2019年2月 

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    開催年月日: 2019年2月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 胎児期および授乳期の血糖コントロール不良の母体糖尿病への暴露は仔の成長後の耐糖能と肝代謝に影響を与える

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    日本体質医学会雑誌  2018年8月 

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    開催年月日: 2018年8月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 血糖コントロール不良の母体糖尿病が仔の耐糖能異常および肝代謝にもたらす影響

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 前田 泰孝, 園田 紀之, 小川 佳宏, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    日本臨床分子医学会学術総会プログラム・抄録集  2018年4月 

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    開催年月日: 2018年4月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 血糖コントロール不良の母体糖尿病は仔の耐糖能異常および肝臓における代謝関連遺伝子の発現変化を性差をもって引き起こす

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 前田 泰孝, 園田 紀之, 小川 佳宏, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    糖尿病  2018年4月 

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    開催年月日: 2018年4月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 母体糖尿病が仔の表現型および遺伝子発現へ与える長期的な影響

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 前田 泰孝, 小川 佳宏, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • DDHD1の新規責任変異の同定とCRISPR/Cas9によるDdhd1ノックアウトマウスの作成

    森川 拓弥, 三浦 史郎, 大石 裕晃, 藤岡 竜太, 森山 耕成, 小坂 健悟, 下條 智史, 柴田 弘紀

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • マウス卵子のDNAメチル化確立におけるDnmt3aのADDドメインの役割の解明

    鳥山 敬祐, 白根 健次郎, 大石 裕晃, 佐々木 裕之

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • マウス卵子及び体細胞のDNAメチル化確立におけるDnmt3a PWWPドメインの役割

    木部 加奈子, 白根 健次郎, 大石 裕晃, 佐々木 裕之

    生命科学系学会合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 母体糖尿病が仔の表現型および遺伝子発現へ与える長期的な影響

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 前田 泰孝, 小川 佳宏, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    日本内分泌学会雑誌  2017年4月 

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    開催年月日: 2017年4月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 母体糖尿病が仔の表現型および遺伝子発現へ与える長期的な影響

    井口 志洋, 一柳 健司, 大石 裕晃, 前田 泰孝, 小川 佳宏, 井口 登與志, 佐々木 裕之

    糖尿病  2017年4月 

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    開催年月日: 2017年4月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 原発性免疫不全症"ICF症候群"の原因遺伝子ZBTB24とCDCA7の機能解析

    伊藤 雄哉, 新田 洋久, 鵜木 元香, 大石 裕晃, Thijssen Peter E., Velasco Guillaume, 吉原 美奈子, 須山 幹太, Francastel Claire, Van Der Maarel Silvere M., 佐々木 裕之

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • Transcriptional regulation of monoallelically expressed genes in ground-state embryonic stem cells

    Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kyohei Hori, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:英語  

    国名:その他  

  • 卵子形成過程および初期胚発生におけるUhrf1の重要性

    前之原 章司, 鵜木 元香, 小倉 淳郎, 井上 貴美子, 山縣 一夫, 堀 真由子, Sharif Jafar, 古関 明彦, 藤 英博, 大石 裕晃, 植田 幸嗣, 佐々木 裕之

    日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集  2015年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • Zfp57 is Essential for Transcriptional Regulation of Monoallelic Gene Expression in Ground-State Embryonic Stem Cells

    Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS  2014年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2014年12月

    記述言語:英語  

    国名:その他  

  • コラーゲン誘導関節炎マウスのパンヌスにおけるCyclophilin AとCD147の発現増加とその局在

    三浦 哲平, 西奥 剛, 大石 裕晃, 津曲 康輔, 山内 淳史, 首藤 英樹, 片岡 泰文

    日本薬学会年会要旨集  2011年3月 

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    開催年月日: 2011年3月

    記述言語:日本語  

    国名:その他  

  • 転写活性化状態における遺伝子周辺の粘性上昇がエンハンサーとプロモーターの接触時間を延長させる.

    大石裕晃, 新海創也, 大和田一志, 藤井健, 細田一史, 大浪修一, 山本卓, 大川恭行, 落合博

    第41 回染色体ワークショップ・第 22 回核ダイナミクス研究会  2024年1月 

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • 転写バーストにおける高次ゲノム構造と転写制御関連因子クラスターの空間的関係.

    大石裕晃、新海創也、大和田一志、大浪修一、山本卓、大川恭行、落合博

    第46回日本分子生物学会年会  2023年12月 

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

  • STREAMING-tagによる転写活性と転写制御関連因子の時空間的な関連性の解明.

    大石 裕晃、島田 聖瑠、内野 哲志、Jieru Li、佐藤 優子、新谷 学文、大和田 一志、大川 恭行、Pertsinidis Alexandros、山本 卓、木村 宏、落合 博

    第75回日本細胞生物学会大会  2023年6月 

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    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    国名:日本国  

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MISC

  • 特定RNA分子/DNA領域のライブイメージング技術

    大石 裕晃, 落合 博

    生体の科学   2023年6月

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    記述言語:その他  

  • 【CRISPR最新ツールボックス 高効率・高精度なゲノム編集から遺伝子座の制御・検出まであなたの研究を拡張する!】CRISPR-Cas9システムによる特定遺伝子座ライブイメージング

    大石 裕晃, 落合 博

    実験医学   2021年5月

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    CRISPR-Cas9システムを利用したゲノム編集技術は、基礎研究利用に留まらず、医療応用や、有用畜産物の作出など、広く革新をもたらしている。一方で、DNAを切断しないCas9変異体を用いることで、ゲノム編集とは異なる応用も可能である。その1つが、CRISPR-Cas9システムを利用した特定遺伝子座のライブイメージングである。本稿では、特定ゲノム領域の可視化の意義、CRISPR-Cas9による生細胞イメージングのツールボックス、さらに本技術を利用した応用研究を紹介し、今後の展望も踏まえて議論する。(著者抄録)

  • 【1細胞解析-技術と応用】技術 ライブイメージングによる1細胞動態解析

    大石 裕晃, 落合 博

    医学のあゆみ   2021年3月

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    記述言語:日本語  

    光学顕微鏡が普及し、肉眼では見えない細胞などの微細構造を観察できるようになり、多くの新しい生命現象の発見を支えてきた。とくに蛍光顕微鏡とその関連技術は、培養細胞のみならず、厚い組織切片、オルガノイド、生体などにおいて、特定分子の細胞内"動態"や発現量の"経時的変化"の測定を可能にし、創薬や病因同定などの医学分野にも深く関係している。本稿では、蛍光の原理および、1細胞レベルでのライブイメージングに用いられる蛍光顕微鏡、およびその派生技術である共焦点顕微鏡、多光子励起顕微鏡、ライトシート顕微鏡について解説する。さらに、1細胞レベルでの動態解析の重要性、蛍光ラベル化法、疾患オルガノイドを例にした医療への応用について解説する。(著者抄録)

  • Transcriptional regulation of monoallelically expressed genes in ground-state embryonic stem cells

    Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kyohei Hori, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2015年12月

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    記述言語:英語  

  • Zfp57 is Essential for Transcriptional Regulation of Monoallelic Gene Expression in Ground-State Embryonic Stem Cells

    Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   2014年12月

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    記述言語:英語  

所属学協会

  • 日本分子生物学会

  • 日本細胞生物学会

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  • 日本ゲノム編集学会

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  • 日本エピジェネティクス研究会

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 蛍光イメージングによる時空間的なゲノムインプリンティング制御機構の解明

    研究課題/領域番号:22K15084  2022年 - 2024年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

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    資金種別:科研費

  • 新規KRAB-ZNF タンパク質によるエピジェネティック修飾の維持伝達機構の解明

    研究課題/領域番号:14J03854  2014年 - 2015年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

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    資金種別:科研費

  • ゲノムインプリンティングにおいてUHRF1が果たす役割の解明

    研究課題/領域番号:24613005  2012年 - 2014年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

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    資金種別:科研費