MATSUZAKI FUMIKO
Organization
Medical Institute of Bioregulation Medical Research Center for High Depth Omics Assistant Professor
Graduate School of Systems Life Sciences Department of Systems Life Sciences（Joint Appointment）
Title
Assistant Professor
Contact information
Tel
0926426433
Profile
私は平成14-16年度の３年間、九州大学農学部および同大学大学院生物資源環境科学府に所属し、白色腐朽担子菌Phanerochaete chrysosporiumを対象とした生化学的研究を行いました。その成果として、1) シトクロムP450という代謝酵素が触媒する新規代謝反応群の発見、2) 担子菌P450の初めての異種発現および特性解析の成功、3) メタボロミクスおよびプロテオミクスの統合解析による安息香酸添加に対する代謝応答の解明、を論文として発表致しました [Biochem. Biopys. Res. Commun. (2005); Biochem. Biopys. Res. Commun. (2006); J. Proteome Res. (2008)]。その後、平成19-23年度の5年間、同大学生体防御医学研究所細胞機能制御学部門分子医科学分野に所属し、Protrudinという小胞輸送関連分子を対象として、マウス神経芽細胞腫およびProtrudinトランスジェニックマウス脳を用いたプロテオミクスを実施し、相互作用タンパク質の同定と機能解析に関する研究を行いました [Mol. Biol. Cell. (2011); J. Biol. Chem. (2014)]。引き続き分子医科学分野において、平成24-25年度の2年間、ヒトタンパク質の網羅的な絶対定量を実現するために、三連四重極型の質量分析計を用いた新規プロテオミクス技術の開発に従事すると同時に、測定したタンパク質量と代謝物量のオミクスデータ（絶対量データ）を用いて、特に代謝ネットワークに着目した数理科学的解析の手法開発を行いました。
今後は、プロテオミクス・メタボロミクス・代謝ネットワークの数理科学的解析等の研究経験を活かしながら、細胞からマウス個体（各臓器）までを対象として、システムとしての生物の理解を深めるための手法開発をしていきたいと考えています。具体的には、細胞や臓器がそれぞれの機能を発揮するために、グローバルなネットワーク（例えば代謝ネットワーク）をどのように適応させているのかということを各階層のオミクスデータから推定し、さらにそのネットワークのダイナミクスも併せてその意義を考察することで、生物の採択している戦略を暴く糸口を摑みたいと考えています。特に、プロテオーム階層の絶対定量データは極めて重要な情報を与えますので、現在ヒトタンパク質に限られている測定手法をマウスタンパク質に拡張し、その定量情報を活用できる数理科学的手法を発展させ利用することで、より深い議論を展開したいと考えています。そして、将来的に臓器を超えたネットワークシステムの解釈が可能になれば、ヒトを対象とした個別化医療への応用も目指せるのではないかと考えています。
External link
Research Areas
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Life Science / System genome science
Degree
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Ph.D. (Kyushu University, Japan)
Research Interests・Research Keywords
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Research theme：Trans-omic analysis
Keyword：multi-omics, proteomics, bioinformatics
Research period： 2019.4 - 2025.3
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Research theme：Integrative analysis for metabolic network with multi-omics data
Keyword：transomics, metabolic network, absolute quantification
Research period： 2013.4 - 2022.3
Awards
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ポスター賞
2020.9 IIBMP2020（2020年日本バイオインフォマティクス学会年会 第9回生命医薬情報学連合大会） 時系列トランスオミクス解析
Papers
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A Topic-Centric Crowdsourced Assisted Biomedical Literature Review Framework for Academics Reviewed International coauthorship
Hodgson R., Wang J., Cristea A.I., Matsuzaki F., Kubota H.
Proceedings of the 15th International Conference on Educational Data Mining, EDM 2022 2022 （ ISBN:9781733673631 ）
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An extensive and dynamic trans-omic network illustrating prominent regulatory mechanisms in response to insulin in the liver. Reviewed International journal
Fumiko Matsuzaki, Shinsuke Uda, Yukiyo Yamauchi, Masaki Matsumoto, Tomoyoshi Soga, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Keiichi I Nakayama, Shinya Kuroda, Hiroyuki Kubota
Cell reports 36 ( 8 ) 109569 - 109569 2021.8
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Michiko Shirane, Mariko Wada, Keiko Morita, Nahoki Hayashi, Reina Kunimatsu, Yuki Matsumoto, Fumiko Matsuzaki, Hirokazu Nakatsumi, Keisuke Ohta, Yasushi Tamura, Keiichi I Nakayama
Nature communications 11 ( 1 ) 4576 2020.9
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Osamu Maruyama, Fumiko Matsuzaki
19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2019 Proceedings - 2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2019 11 - 17 2019.10
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DegSampler Collapsed Gibbs sampler for detecting E3 binding sites Reviewed
Osamu Maruyama, Fumiko Matsuzaki
18th IEEE International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2018 Proceedings - 2018 IEEE 18th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering, BIBE 2018 1 - 9 2018.12
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Kiyota Sakai, Fumiko Matsuzaki, Lisa Wise, Yu Sakai, Sadanari Jindou, Hirofumi Ichinose, Naoki Takaya, Masashi Kato, Hiroyuki Wariishi, Motoyuki Shimizu
Applied and Environmental Microbiology 84 ( 22 ) 2018.11
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Hiroyuki Kubota, Shinsuke Uda, Fumiko Matsuzaki, Yukiyo Yamauchi, Shinya Kuroda
Cell Systems 2018.7
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A large-scale targeted proteomics assay resource based on an in vitro human proteome Reviewed International journal
Masaki Matsumoto, Fumiko Matsuzaki, Kiyotaka Oshikawa, Naoki Goshima, Masatoshi Mori, Yoshifumi Kawamura, Koji Ogawa, Eriko Fukuda, Hirokazu Nakatsumi, Tohru Natsume, Kazuhiko Fukui, Katsuhisa Horimoto, Takeshi Nagashima, Ryo Funayama, Keiko Nakayama, Keiichi Nakayama
NATURE METHODS 14 ( 3 ) 251 - 258 2017.3
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Protrudin Regulates Endoplasmic Reticulum Morphology and Function Associated with the Pathogenesis of Hereditary Spastic Paraplegia Reviewed International journal
Yutaka Hashimoto, Michiko Shirane, Fumiko Matsuzaki, Shotaro Saita, Takafumi Ohnishi, Keiichi Nakayama
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 289 ( 19 ) 2014.5
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Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation Reviewed International journal
Fumiko Matsuzaki, Michiko Shirane, Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama
MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 22 ( 23 ) 2011.12
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Proteomic and metabolomic analyses of the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium exposed to exogenous benzoic acid Reviewed International journal
Fumiko Matsuzaki, Motoyuki Shimizu, Hiroyuki Wariishi
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 7 ( 6 ) 2008.6
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Molecular characterization of cytochrome P450 catalyzing hydroxylation of benzoates from the white-rot fungus Phaherochaete chrysosporzum Reviewed International journal
Fumiko Matsuzaki, Hiroyuki Wariishi
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 334 ( 4 ) 2005.9
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Functional diversity of cytochrome P450s of the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium Reviewed International journal
Fumiko Matsuzaki, Hiroyuki Wariishi
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 324 ( 1 ) 2004.11
Books
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疾患原因遺伝子・タンパク質の解析技術と創薬/診断技術への応用～エピゲノム、トランスクリプトーム、マルチオミクス、オープンデータベースの利活用～
（ Role： Joint author生体内のインスリン作用に着目したトランスオミクス解析）
技術情報協会 2022.3 （ ISBN:9784861048777 ）
Presentations
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マウス肝臓トランスオミクスによる分子制御機構の可視化 Invited
＠松崎 芙美子, ＠湯通堂 紀子, ＠山内 幸代, ＠宇田 新介, @松本 雅記, ＠中山 敬一, ＠久保田 浩行
日本プロテオーム学会2024年大会・第20回日本臨床プロテオゲノミクス学会 合同大会 2024.6
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トランスオミックネットワーク作成による分子制御機構の可視化
＠松崎 芙美子, ＠湯通堂 紀子, ＠山内 幸代, ＠宇田 新介, @松本 雅記, ＠中山 敬一, ＠久保田 浩行
日本プロテオーム学会2023年大会 2023.7
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トランスオミックネットワーク作成による分子制御機構の可視化 Invited
＠松崎 芙美子, ＠湯通堂 紀子, ＠山内 幸代, ＠宇田 新介, ＠和泉 自泰, ＠高橋 政友, ＠中尾 素直, ＠油屋 駿介, ＠馬場 健史, 曽我 朋義, ＠菊竹 智恵, ＠須山 幹太, ＠原田 哲仁, ＠前原 一満, ＠大川 恭行, 松本 雅記, ＠中山 敬一, 黒田 真也, ＠久保田 浩行
第45回日本分子生物学会年会 2022.12
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Trans-omic analysis of insulin response in the liver International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Masaki Matsumoto, Tomoyoshi Soga, @Kazumitsu Maehara, @Yasuyuki Ohkawa, @Keiichi I. Nakayama, Shinya Kuroda, @Hiroyuki Kubota
The 31st Hot Spring Harbor International Symposium: Expanding views on Systems biology and Immunology 2022.11
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A Topic-Centric Crowdsourced Assisted Biomedical Literature Review Framework for Academics International conference
Ryan Hodgson, Jingyun Wang, Alexandra Cristea, @Fumiko Matsuzaki, @Hiroyuki Kubota
The 15th International Conference on Educational Data Mining (EDM 2022) 2022.7
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Trans-omic analysis of insulin response in the liver Invited International conference
@Fumiko Matsuzaki,@Shinsuke Uda,@Yukiyo Yamauchi,@Hiroyuki Kubota
ISEGB2022 (International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022) 2022.3
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肝臓インスリン応答の時系列トランスオミクス解析 Invited
＠松崎 芙美子
IIBMP2021（2021年日本バイオインフォマティクス学会年会 第10回生命医薬情報学連合大会） 2021.9
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時系列トランスオミクス解析
＠松崎 芙美子, ＠宇田 新介, ＠山内 幸代, 松本 雅記, 曽我 朋義, ＠前原 一満, ＠大川 恭行, ＠中山 敬一, 黒田 真也, ＠久保田 浩行
IIBMP2020（2020年日本バイオインフォマティクス学会年会 第9回生命医薬情報学連合大会） 2020.9
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Integrated analysis through multiple molecular layers: transomic network dynamics International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Masaki Matsumoto, Tomoyoshi Soga, @Kazumitsu Maehara, @Yasuyuki Ohkawa, @Keiichi I. Nakayama, Shinya Kuroda, @Hiroyuki Kubota
The 29th Hot Spring Harbor International Symposium 2020.2
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時系列トランスオミクス解析
松崎 芙美子, 宇田 新介, 山内 幸代, 松本 雅記, 曽我 朋義, 前原 一満, 大川 恭行, 中山 敬一, 黒田 真也, 久保田 浩行
第42回日本分子生物学会年会 2019.12
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Time Series Transomics: Integrated analysis through multiple molecular layers International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Masaki Matsumoto, Tomoyoshi Soga, @Kazumitsu Maehara, @Yasuyuki Ohkawa, @Keiichi I. Nakayama, Shinya Kuroda, @Hiroyuki Kubota
The 20th International Conference on Systems Biology 2019.11
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Time Series Transomics: Integrated analysis through multiple molecular layers International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Hiroyuki Kubota
2nd Diversity Symposium 2019.3
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Time Series Transomics: Integrated analysis through multiple molecular layers International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Masaki Matsumoto, @Keiichi I. Nakayama, @Hiroyuki Kubota
1st International symposium on interdisciplinary approaches to integrative understanding of biological signaling networks 2019.2
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時系列トランスオミクス解析
@松崎 芙美子, @宇田 新介, @山内 幸代, 黒田 真也, @久保田 浩行
定量生物学の会 第九回年会 2019.1
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TRANSOMICS: Integrated Analysis Through Multiple Molecular Layers International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Hiroyuki Kubota
The 19th International Conference on Systems Biology 2018.10
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TRANSOMICS: Integrated Analysis Through Multiple Molecular Layers International conference
@Fumiko Matsuzaki, @Shinsuke Uda, @Yukiyo Yamauchi, @Kazumitsu Maehara, @Yasuyuki Ohkawa, @Masaki Matsumoto, @Keiichi I. Nakayama, @Hiroyuki Kubota
The Joint Symposium of the 13th International Symposium of the Institute Network for Biomedical Sciences and the 28th Hot Spring Harbor International Symposium 2018 2018.10
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トランスオミクスデータを用いた代謝システム解析の試み
松﨑 芙美子
JSBi九州地域部会セミナー 2017.3
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糖尿病モデルラットにおけるインスリン時間情報コードの破綻の検証
下條 智史, 宇田 新介, 松﨑 芙美子, 久保田 浩行
新学術領域「数理シグナル」第一回公開シンポジウム 2017.2
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インスリン作用の統合的理解に向けた多階層オミクス解析
松﨑 芙美子, 宇田 新介, 久保田 浩行
新学術領域「数理シグナル」第一回公開シンポジウム 2017.2
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定量的トランスオミクス解析の試み
松﨑 芙美子, 宇田 新介, 久保田 浩行
定量生物学の会 第八回年会 2017.1
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糖尿病モデルラットにおけるインスリン時間情報コードの破綻の検証
下條 智史, 宇田 新介, 松﨑 芙美子, 久保田 浩行
定量生物学の会 第八回年会 2017.1
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ヒト全代謝酵素の絶対定量と代謝システム解析
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
第6回数理デザイン道場 2016.6
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Absolute quantification of all human metabolic enzymes and metabolic systems analysis International conference
Fumiko Matsuzaki, Masaki Matsumoto, Kiyotaka Oshikawa, Fumihide Shiraishi, Keiichi Nakayama
International Symposium on Synthetic Systems Biology 2015.9
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ヒト全代謝酵素の絶対定量と代謝システム解析
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
第13回日本プロテオーム学会大会 2015.7
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Absolute quantification of all human metabolic enzymes and metabolic systems analysis Invited International conference
Fumiko Matsuzaki, Masaki Matsumoto, Kiyotaka Oshikawa, Keiichi Nakayama
First symposium: From genes to human diseases 2015.3
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Absolute quantification of all human metabolic enzymes and metabolic systems analysis International conference
Fumiko Matsuzaki, Masaki Matsumoto, Kiyotaka Oshikawa, Keiichi Nakayama
The Third BMIRC International Symposium for Virtual Physiological Human 2015.3
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ヒト全代謝酵素の絶対定量と代謝システム解析
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
定量生物学の会 第七回年会 2015.1
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Absolute quantification of all human metabolic enzymes and metabolic systems analysis
Fumiko Matsuzaki, Masaki Matsumoto, Kiyotaka Oshikawa, Keiichi Nakayama
The 37th annual meeting of the molecular biology society of Japan 2014.11
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次世代ターゲットプロテオミクスによるヒト全代謝経路の絶対定量マッピング Invited
松本 雅記, 押川 清孝, 松﨑 芙美子, 五島 直樹, 夏目 徹, 中山 敬一
第87回生化学会大会 2014.10
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ヒト全代謝酵素の絶対定量によるがん代謝ネットワークの統合解析 Invited
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
第87回生化学会大会 2014.10
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ヒト全代謝酵素の絶対定量とグローバル代謝の数理解析
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
第2回数理デザイン道場 2014.7
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ヒト全代謝酵素の絶対定量とグローバル代謝の数理解析
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 中山 敬一
定量生物学の会 第六回年会 2013.11
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Absolute quantification of all metabolic enzymes by information-based proteomics and computational analysis for cancer metabolism International conference
Fumiko Matsuzaki, Masaki Matsumoto, Kiyotaka Oshikawa, Keiichi Nakayama
Symposium on complex biodynamics and networks 2013.11
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タンパク質相互作用ネットワークにおける相互作用強度特性の探索
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 押川 清孝, 高見 知代, 中山 敬一
第10回ネットワーク生態学シンポジウム 2013.9
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情報基盤プロテオミクスによるヒトプロテオームの絶対定量
松本 雅記, 松﨑 芙美子, 押川 清孝, 高見 知代, 小山田 浩二, 白石 文秀, 中山 敬一
生命情報科学若手の会 第4回研究会 2013.3
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Protrudinが関与する遺伝性痙性対麻痺の病態メカニズム
橋本 寛, 松﨑 芙美子, 細田 將太郎, 大西 隆史, 中山 敬一, 白根 道子
第35回日本分子生物学会年会 2012.12
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情報基盤プロテオミクスによるヒトプロテオームの絶対定量
松本 雅記, 松﨑 芙美子, 高見 知代, 小山田 浩二, 中山 敬一
定量生物学の会 第五回年会 2012.11
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Absolute quantification of all metabolic enzymes by information-based proteomics and computational analysis for cancer metabolism Invited
Fumiko Matsuzaki
2014.9
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Accurate and absolute quantification of human proteome by large-scale targeted proteomics Invited
Masaki Matsumoto, Fumiko Matsuzaki, Kiyotaka Oshikawa, Koji Oyamada, Naoki Goshima, Tohru Natsume, Keiichi Nakayama
The 85th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society 2012.12
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白色腐朽菌 Phanerochaete chrysosporium の有する多様なシトクロム P450 分子種
松﨑 芙美子, 割石 博之
第55回日本生物工学会大会 2003.9
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リグニン分解のシステム解析を目指したPhanerochaete chrysosporiumのゲノム解析
割石 博之, 志水 元亨, 平塚 宣博, 湯田 直樹, 松﨑 芙美子, 廣瀬 宣子, 野中 大輔
第48回リグニン討論会 2003.10
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担子菌P450分子多様性におけるマイクロエキソンの役割
平塚 宣博, 一瀬 博文, 栗原 宏征, 松﨑 芙美子, 志水 元亨, 割石 博之
第3回糸状菌分子生物学コンファレンス 2003.11
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A proteomic differential display analysis of Phanerochaete chrysosporium against sulfur depletion International conference
Motoyuki Shimizu, Fumiko Matsuzaki, Naoki Yuda, Hiroyuki Wariishi
1st International Fungal Proteomics Symposium 2004.10
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Functional Diversity of Cytochrome P450 derived Metabolic Reactions in the White-rot Fungus Phanerochaete chrysosporium.
Fumiko Matsuzaki, Hiroyuki Wariishi
7th International Symposium on Cytochrome P450 Biodiversity and Biotechnology 2004.8
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白色腐朽菌由来P450/P450レダクターゼ融合タンパク質PcCYP17aの機能解析
志水 元亨, 松﨑 芙美子, 廣末 慎嗣, 有沢 章, 恒川 博, 割石 博之
第55回日本木材学会大会 2005.3
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Phanerochaete chrysosporium の安息香酸に対する細胞応答機構の解明
松﨑 芙美子, 志水 元亨, 割石 博之
第55回日本木材学会大会 2005.3
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担子菌の有するシトクロム P450 の分子種多様性：生物機能システムの再構築
割石 博之, 平塚 宣博, 松﨑 芙美子, 廣末 慎嗣, 武田 耕治, 恒川 博
日本農芸化学会2005年度大会 2005.11
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Phanerochaete chrysosporiumの安息香酸に対する細胞応答機構の解明
松﨑 芙美子, 志水 元亨, 割石 博之
第49回リグニン討論会 2005.11
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Molecular characterization of a fused protein of P450 and P450 reductase PcCYP17a from the white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium International conference
Motoyuki Shimizu, Fumiko Matsuzaki, Shinji Hirosue, Akira Arisawa, Hiroshi Tsunekawa, Hiroyuki Wariishi
International Symposium on Wood Science and Technologies; 50th Anniversary of The Japan Wood Research Society 2005.11
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Proteome of the White-rot Basidiomycete Phanerochaete chrysosporium grown in Cellulose Medium International conference
Motoyuki Shimizu, Fumiko Matsuzaki, Shinji Hirosue, Akira Arisawa, Hiroshi Tsunekawa, Hiroyuki Wariishi
The annual meeting of the Society for Industrial Microbiology 2006.8
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Protrudin interacts with KIF5 and regulates neural function
2009.12
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Identification of components in the complex with protrudin and elucidation of their roles in neuronal function International conference
Fumiko Matsuzaki, Michiko Shirane, Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama
The Joint Symposium of the 5th International Symposium of Institute Network and the International Symposium Commemorating Inauguration of Kanazawa University Cancer Research Institute 2010.6
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Protrudin is a novel adaptor protein of KIF5 and regulates neuronal function
2010.12
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Protrudin is a novel adaptor protein of KIF5 and regulates neuronal function International conference
Fumiko Matsuzaki, Michiko Shirane, Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama
6th young investigators forum 2011.2
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ヒトプロテオーム絶対定量プロジェクト：網羅的ターゲットプロテオミクスの開発と応用 Invited
中山 敬一, 松本 雅記, 押川 清孝, 松﨑 芙美子
第10回日本プロテオーム学会大会 2012.7
MISC
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Trans-omic network illustrating prominent regulatory mechanisms
松崎芙美子, 湯通堂紀子, 山内幸代, 宇田新介, 和泉自泰, 高橋政友, 中尾素直, 油屋駿介, 馬場健史, 曽我朋義, 菊竹智恵, 須山幹太, 原田哲仁, 前原一満, 大川恭行, 松本雅記, 中山敬一, 黒田真也, 久保田浩行
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022
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がん代謝
松﨑 芙美子, 松本 雅記, 中山 敬一
がん分子標的治療 2014.6
Professional Memberships
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日本プロテオーム学会
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The molecular biology society of japan
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定量生物学の会
Academic Activities
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Facilitator International contribution
The 31st Hot Spring Harbor International Symposium: Expanding views on Systems biology and Immunology （ Online Japan ） 2022.11
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オーガナイザー
第２回トランスオミクス医学研究会ワーキンググループ （ 九州大学 ） 2016.9
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オーガナイザー
第1回トランスオミクス医学研究会ワーキンググループ （ 九州大学 ） 2016.3
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座長（Chairmanship） International contribution
2011.2
Research Projects
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肥満過程における分子間制御ネットワーク変化を俯瞰する
Grant number：24K09424 2024 - 2026
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
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第33回加藤記念研究助成
2022
Grant type：Donation
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多階層ネットワーク作成を可能にするオミクスデータ統合ワークフローの開発
2020
数理・データサイエンスに関する教育・支援プログラム
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
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Grant number：18K15011 2018 - 2022
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Early-Career Scientists
Matsuzaki Fumiko
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
In this project, skeletal muscle composition was analyzed in terms of molecular concentration/proportion, and their temporal variation over four hours after insulin administration. A molecular interaction network consisting of approximately 10,000 insulin-responsive molecules (nodes) was constructed based on this analysis. This network illustrates about 20,000 interactions (edges) among metabolites, RNAs, and proteins that changed in their phosphorylation or expression levels. Such a comprehensive analysis provided an overview of major regulatory processes within skeletal muscles in response to insulin. Our investigation model enabled the design of scalable methods that could integrate multiple sources to characterize and visualize biologically relevant molecular interactions.
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分子階層横断的な数理モデル構築による肝臓システム特性の解明
2016
ＱＲプログラム・わかばチャレンジ
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
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ネットワークダイナミクスの数理的解析によるインスリン情報伝達機構の解明
Grant number：15KT0108 2015 - 2017
日本学術振興会 科学研究費助成事業 基盤研究(C)
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
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情報基盤定量プロテオミクスで全身代謝ネットワークを可視化する
Grant number：25830143 2013 - 2014
科学研究費助成事業 若手研究(B)
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
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網羅的タンパク質絶対定量技術を用いた個体レベルでの代謝システム解析
2013
九州大学教育研究プログラム・研究拠点形成プロジェクト（Ｐ＆Ｐ）D-2 タイプ
Authorship：Principal investigator Grant type：On-campus funds, funds, etc.
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プロトルーディン結合タンパク質の探索・機能解析による神経突起形成メカニズムの解明
Grant number：08J05427 2008 - 2010
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
Authorship：Principal investigator Grant type：Scientific research funding
Class subject
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生命医科学特論Ⅱ
2024.6 - 2024.8 Summer quarter
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生命医科学特論IV
2023.6 - 2023.8 Summer quarter
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生命医科学特論IV
2022.6 - 2022.8 Summer quarter
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生命医科学特論Ⅱ
2021.6 - 2021.8 Summer quarter
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生命医科学特論II
2020.6 - 2020.8 Summer quarter
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医化学実習
2019.10 - 2020.3 Second semester
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生命医科学特論II
2019.4 - 2019.6 Spring quarter
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医化学実習
2018.10 - 2019.3 Second semester
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生命医科学特論IV
2018.10 - 2018.12 Fall quarter
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生命医科学特論IV
2017.12 - 2018.2 Winter quarter
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医化学実習
2017.10 - 2018.3 Second semester
-
医化学実習
2016.10 - 2017.3 Second semester
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医化学実習
2015.10 - 2016.3 Second semester
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医化学実習
2014.4 - 2014.9 First semester
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Topics in medical life sciences Ⅱ
2024.6 - 2024.8 Summer quarter
FD Participation
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2024.4 Role：Participation Title：生体防御医学研究所FD 法務コンプライアンス関連FD
Organizer：[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]
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2024.3 Role：Participation Title：医学部・医学系学府合同教育FD 大学病院の苦悩と医学研究の課題
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2023.11 Role：Participation Title：GakuNin RDMデータ活用セミナー これからの研究データ管理を探る
Organizer：University-wide
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2022.9 Role：Participation Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD・臨床教育研修センターきらめきプロジェクト講演会
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2022.2 Role：Planning Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD
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2021.7 Role：Participation Title：生体防御医学研究所FD 科学論文出版関連
Organizer：[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]
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2020.11 Role：Participation Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD
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2020.11 Role：Participation Title：事件等発生時の学生対応に関するFD・SD
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2019.10 Role：Participation Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD
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2018.10 Role：Participation Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD
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2017.10 Role：Planning Title：馬出地区４部局合同男女共同参画FD
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2016.10 Role：Participation Title：馬出地区キャンパスFD
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2014.4 Role：Participation Title：新任教員の研修
Organizer：University-wide