Curved EFC/F-BAR domain dimers are joined end to end into a filament for membrane invagination in endocytosis 査読 国際誌

Shimada, A., Niwa, H., Tsujita, K., Suetsugu, S., Nitta, K., Hanawa-Suetsugu, K., Akasaka, R., Nishino, Y., Toyama, M., Chen, L., Liu, Z.J., Wang, B.C., Yamamoto, M., Terada, T., Miyazawa, A., Tanaka, A., Sugano, S., Shirouzu, M., Nagayama, K., Takenawa, T. and Yokoyama, S.

Cell   129 ( 4 )   2007年5月

The core FH2 domain of diaphanous-related formins is an elongated actin binding protein that inhibits polymerization 査読 国際誌

Shimada, A., Nyitrai, M., Vetter, I.R., Kuhlmann, D., Bugyi, B., Narumiya, S., Geeves, M.A. and Wittinghofer, A.

Mol. Cell   13 ( 4 )   2004年2月

Structural and mutational studies of the recognition of the arginine tRNA-specific major identity element, A20, by arginyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Shimada, A., Nureki, O., Goto, M., Takahashi, S. and Yokoyama S

Proc. Natl. Acad. Sci. USA   98 ( 24 )   2001年11月

Structural basis for anticodon recognition by discriminating glutamyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Sekine, S., Nureki, O., Shimada, A., Vassylyev, D.G. and Yokoyama S

Nat. Struct. Biol.   8 ( 3 )   2001年3月

Structural basis for double-sieve discrimination of L-valine from L-isoleucine and L-threonine by the complex of tRNA(Val) and valyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Fukai, S., Nureki, O., Sekine, S., Shimada, A., Tao, J., Vassylyev, D.G. and Yokoyama, S.

Cell   103 ( 5 )   2000年11月

Enzyme structure with two catalytic sites for double-sieve selection of substrate 査読 国際誌

Nureki, O., Vassylyev, D.G., Tateno, M., Shimada, A., Nakama, T., Fukai, S., Konno, M., Hendrickson, T.L., Schimmel, P. and Yokoyama, S.

Science   280 ( 5363 )   1998年4月

Effects of targeting signal mutations in a mitochondrial presequence on the spatial distribution of the conformational ensemble in the binding site of Tom20. 査読 国際誌

Xiling Han, Nobuo Maita, Atsushi Shimada, Daisuke Kohda

Protein Science   2022年10月

Ca²⁺-induced structural changes and intramolecular interactions in N-terminal region of diacylglycerol kinase alpha 査読 国際誌

Takahashi D., Yonezawa K., Okizaki Y., Caaveiro J.M.M., Ueda T., Shimada A., Sakane F., Shimizu N.

Protein Science   31   e4365   2022年6月

Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal Tim21 as the case study 査読

Siqin Bala, Shoko Shinya, Arpita Srivastava, Marie Ishikawa, Atsushi Shimada, Naohiro Kobayashi, Chojiro Kojima, Florence Tama, Osamu Miyashita, Daisuke Kohda

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects   2019年1月

Tethering an N-Glycosylation Sequon-Containing Peptide Creates a Catalytically Competent Oligosaccharyltransferase Complex. 査読 国際誌

Shunsuke Matsumoto, Yuya Taguchi, Atsushi Shimada, Mayumi Igura, Daisuke Kohda

56 ( 4 )   602 - 611   2017年1月

Rational design of crystal contact-free space in protein crystals for analyzing spatial distribution of motions within protein molecules. 査読 国際誌

Rei Matsuoka, Atsushi Shimada, Yasuaki Komuro, Yuji Sugita, Daisuke Kohda

Protein Sci.   25 ( 3 )   754 - 768   2016年3月

TRPV4 channel activity is modulated by direct interaction of the ankyrin domain to PI(4,5)P2 査読 国際誌

Nobuaki Takahashi, Sayaka Hamada-Nakahara, Yuzuru Itoh, Kazuhiro Takemura, Atsushi Shimada, Yoshifumi Ueda, Manabu Kitamata, Rei Matsuoka, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Yosuke Senju, Masayuki X. Mori, Shigeki Kiyonaka, Daisuke Kohda, Akio Kitao, Yasuo Mori, Shiro Suetsugu

Nature Communications   5   Article number: 4994   2014年6月

Crystal structure of the C-terminal globular domain of the third paralog of the Archaeoglobus fulgidus oligosaccharyltransferases 査読 国際誌

Shunsuke Matsumoto, Atsushi Shimada, Daisuke Kohda

BMC STRUCTURAL BIOLOGY   13   2013年7月

Actin filament bundling and different nucleating effects of mouse Diaphanous-related formin FH2 domains on Actin/ADF and Actin/Cofilin complexes 査読 国際誌

Machaidze, G., Sokoll, A., Shimada, A., Lustig, A., Mazur, A., Wittinghofer, A., Aebi, U. and Mannherz, H.G.

J. Mol. Biol.   403 ( 4 )   2010年10月

Loss of RanGEF/Pim1 activity abolishes the orchestration of Ran-mediated mitotic cellular events in S.Pombe 査読 国際誌

Hirose, E., Mukai, M., Shimada, A., Nishitani, H., Shibata, Y. and Nishimoto, T.

Genes Cells   11 ( 1 )   2006年1月

Mechanism of molecular interactions for tRNA(Val) recognition by valyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Fukai, S., Nureki, O., Sekine, S., Shimada, A., Vassylyev, D.G. and Yokoyama, S.

RNA   9 ( 1 )   2003年1月

Crucial role of the HIGH-loop lysine for the catalytic activity of arginyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Sekine, S., Shimada, A., Nureki, O., Cavarelli, J., Moras, D., Vassylyev, D.G. and Yokoyama, S.

J. Biol. Chem.   276 ( 6 )   2001年2月

Gene cloning, expression, crystallization and preliminary X-ray analysis of Thermus thermophilus arginyl-tRNA synthetase 査読 国際誌

Shimada, A., Nureki, O., Dohmae, N., Takio, K. and Yokoyama, S.

Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr.   57 (Pt2)   2001年2月

The 2.0 Å crystal structure of Thermus thermophilus methionyl-tRNA synthetase reveals two RNA-binding modules 査読 国際誌

8 ( 2 )   2000年2月

クラスリン依存性エンドサイトーシスにおけるタンパク質-タンパク質相互作用 招待

嶋田 睦, 山口 淳子, 神田 大輔

第15回日本蛋白質科学会年会  2015年6月 

SGIP1 μ homology domainによるEps15認識機構の構造的基盤

山口 淳子, 神田 大輔, 嶋田 睦

平成26年度日本生化学会九州支部例会  2014年5月 

Structural basis for the recognition of tandem DPF motifs by the SGIP1 μ homology domain 国際会議

2014年2月 

Cdc42によるCIP4ファミリータンパク質のクラスリン被覆ピットへの局在機構の構造的基盤 招待

嶋田 睦, 末次 志郎, 松永 笑子, 外山 光俊, 寺田 貴帆, 白水 美香子, 竹縄 忠臣, 山本 雅貴, 横山 茂之

第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

脂質二重膜中の膜タンパク質の迅速高分解能イメージングパイプライン 招待

湯通堂 紀子,嶋田 睦

第11回TR推進合同フォーラム・ライフサイエンス技術交流会  2024年1月 

Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal: Tim21 as the case study

#Siqin Bala, @Shoko Shinya, @Arpita Srivastava, #Marie Ishikawa, Atsushi Shimada, @Naohiro Kobayashi, @Chojiro Kojima, @Florence Tama, @Osamu Miyashita, Daisuke Kohda

2019年12月 

DGKα活性制御の分子基盤: N末端RVH領域へのCa2+結合の物理化学的解析

高橋大輔， 嶋田睦， Jose Caarveiro, 阿部義人， 植田正， @坂根郁夫

2019年度日本生化学会九州支部例会  2019年6月 

Mechanistic models of endocytosis based on the structural studies on endocytic proteins 招待 国際会議

Atsushi Shimada

Scientific Seminar  2018年7月 

短い繰り返しモチーフであるDPFモチーフの繰り返し数の増加によるSGIP1 μ homology domainへの親和性向上機構

嶋田 睦, 山口 淳子, 神田 大輔

第16回日本蛋白質科学会年会  2016年6月 

SGIP1 μ homologyドメインによる2つの連続するDPF配列認識機構の構造的基盤

山口 淳子, 神田 大輔, 嶋田 睦

第87回日本生化学会大会  2014年10月 

Structural basis for the recognition of Eps15 by the SGIP1 μ homology domain 国際会議

2014年8月 

SGIP1 μ homologyドメインによるEps15認識機構の構造的基盤

山口 淳子, 神田 大輔, 嶋田 睦

第14回日本蛋白質科学会年会  2014年6月 

植物の新規アクチン結合ドメインとアクチンの複合体の結晶構造解析 招待

嶋田 睦

新学術領域研究「構造細胞生物学」第4回全体会議  2013年6月 

Cdc42による CIP4のクラスリン被覆ピットへの局在機構の構造的基盤

嶋田 睦, 末次 志郎, 松永 笑子, 外山 光俊, 寺田 貴帆, 白水 美香子, 竹縄 忠臣, 山本 雅貴, 横山 茂之

第12回日本蛋白質科学会年会  2012年6月 

Structural basis of Cdc42-mediated Cdc42-interacting protein 4 (CIP4) recruitment to clathrin-coated pits 国際会議

Atsushi Shimada

The 21st Hot Spring Harbor Symposium jointly with 9th Global-COE International Symposium Cell Migration in Biology and Medicine -8th Young Investigators Forum-  2012年1月 

Structural basis of Cdc42-mediated Cdc42-interacting protein 4 (CIP4) recruitment to clathrin-coated pits 国際会議

Atsushi Shimada

10th Global-COE International Symposium and 7th Young Investigators Forum  2011年12月 

Cdc42によるCdc42-interacting protein 4 (CIP4) のクラスリン被覆ピットへの局在機構の構造的基盤

嶋田 睦

日本生物物理学会九州支部例会  2011年12月 

連続フェムト秒結晶構造解析により解明されたアンジオテンシン受容体の構造

嶋田 睦

秀潤社、細胞工学別冊、最新バイオ論文総集編1   2015年9月

Structural basis for amino acid and tRNA recognition by class I aminoacyl-tRNA synthetases

Nureki, O., Fukai, S., Sekine, S., Shimada, A., Terada, T., Nakama, T., Shirouzu, M., Vassylyev, D.G. and Yokoyama, S.

Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol.   2001年1月

シンポジウムオーガナイザーと座長

第55回　日本生物物理学会年会  （ 熊本大学 黒髪地区 ） 2017年9月

実行委員

第55回日本生物物理学会年会  （ 熊本 ） 2017年9月

座長（Chairmanship）

第39回日本分子生物学会年会  （ 横浜 ） 2016年11月 - 2016年7月

座長（Chairmanship）

第19回 九州大学 生体防御医学研究所リトリート2016  （ 熊本 ） 2016年7月

座長（Chairmanship）

第16回日本蛋白質科学会年会  （ 福岡 ） 2016年6月

司会（Moderator） 国際学術貢献

2015年11月

学術調査官

役割：審査・評価

文部科学省  2014年8月 - 2016年7月

座長（Chairmanship）

第17回　生体防御医学研究所リトリート2014  （ ホテルセキヤ，熊本 ） 2014年7月

座長（Chairmanship）

平成26年度日本生化学会九州支部例会  （ 九州大学病院キャンパスコラボステーションI (福岡) ） 2014年5月

座長（Chairmanship）

第16回　生体防御医学研究所リトリート2013，第7回　理医連携リトリート  （ 熊本 ） 2013年8月

創薬を革新する新規の膜タンパク質構造解析技術の汎用化

2023年

令和5年度 橋渡し研究プログラム シーズH

JST大学発新産業創出プログラム (START) 大学・エコシステム推進型 PARKS起業活動支援プログラム GAP・NEXT 「創薬を革新する新規の膜タンパク質構造解析技術」

2022年9月 - 2023年3月

創薬を革新する新規の膜タンパク質構造解析技術

2022年

大学発ベンチャー創出推進のための事業 (文部科学省)

膜タンパク質の新規構造解析技術の開発

研究課題/領域番号：21K06033  2021年 - 2023年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

令和3年度 九州・大学発ベンチャー振興会議研究助成金/新規膜タンパク質構造解析技術の開発とその創薬展開

2021年

大学発ベンチャー事業シーズ育成支援プログラム「生体高分子の立体構造解析のための革新的試料調製法の産業利用」

2020年4月 - 2020年11月

生体高分子の立体構造解析のための革新的試料調製法の産業利用

2020年

大学発ベンチャー事業シーズ育成支援プログラム (九大ギャップファンド)

クラスリン依存性エンドサイトーシスにおけるクラスリン重合進行機構の構造的基盤

研究課題/領域番号：17K07309  2017年 - 2019年

日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

植物の新規アクチン結合ドメインとアクチンの複合体の結晶構造解析

研究課題/領域番号：25121726  2013年 - 2014年

日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

九州大学P&P D2タイプ　「膜輸送および小胞体‐ミトコンドリア間相互作用に関与するタンパク質ファミリーの構造機能解析」

2012年4月 - 2013年3月

九州大学(日本) 

細胞のがん化に関与するエンドサイトーシス機構の構造的基盤

研究課題/領域番号：24687014  2012年 - 2014年

科学研究費助成事業  若手研究(A)

膜輸送および小胞体‐ミトコンドリア間相互作用に関与するタンパク質ファミリーの構造機能解析

2012年

九州大学P&P D2タイプ

エンドサイトーシスにおける小胞形成機構の構造的基盤

研究課題/領域番号：20687006  2008年 - 2011年

科学研究費助成事業  若手研究(A)

生命医科学特論III

2022年6月 - 2022年8月   夏学期

最新トピックスから学ぶ生命科学入門

2021年12月 - 2022年2月   冬学期

生命医科学特論Ⅲ

2021年6月 - 2021年8月   夏学期

生命医科学特論III

2020年6月 - 2020年8月   夏学期

生命医科学特別研究

2020年4月 - 2021年3月   通年

構造生命科学講究

2020年4月 - 2021年3月   通年

学際開拓創成セミナーI

2019年10月 - 2020年3月   後期

生命医科学特論III

2019年6月 - 2019年8月   夏学期

生命医科学特別研究

2019年4月 - 2020年3月   通年

構造生命科学講究

2019年4月 - 2020年3月   通年

最新トピックスから学ぶ生命科学入門Ⅱ

2018年12月 - 2019年2月   冬学期

生命医科学特論III

2018年6月 - 2018年8月   夏学期

生命医科学特別研究

2018年4月 - 2019年3月   通年

構造生命科学講究

2018年4月 - 2019年3月   通年

生命医科学特論III

2017年10月 - 2017年12月   秋学期

構造生命科学講究

2017年4月 - 2018年3月   通年

生命医科学特別研究

2017年4月 - 2018年3月   通年

最新トピックスから学ぶ生命科学入門I

2017年4月 - 2017年6月   春学期

構造生物学特論

2016年10月 - 2017年3月   後期

構造生命科学講究

2016年4月 - 2017年3月   通年

生命医科学特別研究

2016年4月 - 2017年3月   通年

最新トピックスから学ぶ生命科学入門I

2016年4月 - 2016年9月   前期

学際開拓創成セミナーII

2015年10月 - 2016年3月   後期

学際開拓創成セミナーI

2015年10月 - 2016年3月   後期

構造生命科学講究

2015年4月 - 2016年3月   通年

生命医科学特別研究

2015年4月 - 2016年3月   通年

構造生物学特論

2014年10月 - 2015年3月   後期

ゲノム生体高分子学講究

2014年4月 - 2015年3月   通年

生命医科学特別研究

2014年4月 - 2015年3月   通年

学際開拓創成セミナーI

2013年10月 - 2014年3月   後期

博士論文指導演習

2013年4月 - 2014年3月   通年

生命医科学特別研究

2013年4月 - 2014年3月   通年

ゲノム生体高分子学講究

2013年4月 - 2014年3月   通年

学際開拓創成セミナーII

2013年4月 - 2013年9月   前期

学際開拓創成セミナーI

2012年10月 - 2013年3月   後期

構造生物学特論

2012年10月 - 2013年3月   後期

博士論文指導演習

2012年4月 - 2013年3月   通年

生命医科学特別研究

2012年4月 - 2013年3月   通年

ゲノム生体高分子学講究

2012年4月 - 2013年3月   通年

2019年10月   役割：参加   名称：令和元年度馬出地区４部局合同男女共同参画FD

主催組織：部局

2019年2月   役割：参加   名称：生体防御医学研究所ＦＤ（情報セキュリティ関連ＦＤ）

主催組織：部局

2018年11月   役割：参加   名称：2018年度 生体防御医学研究所 研究・教育FD

主催組織：部局

2018年10月   役割：参加   名称：平成30年度馬出地区4部局合同男女共同参画FD

主催組織：部局

2017年10月   役割：参加   名称：平成２９年度 男女共同参画FD

主催組織：部局

2017年5月   役割：参加   名称：電子教材著作権講習会

主催組織：全学

2016年10月   役割：参加   名称：馬出地区キャンパス FD

主催組織：部局

2012年4月   役割：参加   名称：平成24年度第1回全学FD（新任教員の研修）

主催組織：全学

理化学研究所など、細胞外から細胞内へ分子を取り込む細胞膜陥入機構を解明 新聞・雑誌

日経産業新聞  2007年5月

細胞による外部分子取り込み　機能タンパク質を解明 新聞・雑誌

日刊工業新聞  2007年5月

2001年6月 - 2003年9月

滞在国名1：ドイツ連邦共和国   滞在機関名1：Max Planck Institute of Molecular Physiology

2017年1月 - 現在   研究所 生体防御医学研究所放射線取扱副主任者

2013年1月 - 現在   研究所 九州大学生体防御医学研究所 多階層生体防御システム研究拠点　共同利用・共同研究委員