2025/02/05 更新

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シバタ ヒロキ
柴田 弘紀
SHIBATA HIROKI
所属
生体防御医学研究所 研究推進ユニット 准教授
■廃止組織■ 附属トランスオミクス医学研究センター(併任)
システム生命科学府 システム生命科学専攻(併任)
医学系学府 医科学専攻(併任)
理学部 生物学科(併任)
歯学部 歯学科(併任)
職名
准教授
電話番号
0926426168
プロフィール
ゲノムの多様性と表現型に着目し主に次世代シークエンサ(NGS)を用いて、ヒト疾患を対象とした研究(1)と 非モデル生物のオーミクス研究(2)を進めている。 (1)家族性神経疾患の原因遺伝子探索 稀少な遺伝性神経疾患を対象に、エクソームシークエンシングによる変異の大量検出と、連鎖解析、発現解析、進化的保存性の検討などを組み合わせることで、責任遺伝子変異の探索を進めている。また、同定した責任遺伝子変異をマウスモデルに導入し、詳細な発症機序解明も進めている。 (2)毒蛇のオミクス研究  生物毒は、新たな創薬シーズとして近年大変注目を浴びている。我が国固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)は、毒の激烈な効果で広く知られているが、毒の作用機序には未解明な点が多い。また毒成分タンパク質遺伝子の加速進化も報告されている。当研究室では、創薬シーズ開拓と加速進化機構の解明を目指し、ハブとその近縁種の全ゲノム配列決定、転写産物カタログ化,及び島嶼集団間の遺伝的多様性の解析を進めている。また国際共同研究として、コブラ類の全ゲノム解析にも参画している。
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学位

  • 理学博士

経歴

  • Cedars Sinai Medical Center, UCLA School of Medicine, Los Angeles, LA 5/1/96-4/30/99   

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ: 痙性対麻痺の責任遺伝子DDHD1のマウスモデル作製と発症機序解明

    研究キーワード: 痙性対麻痺、DDHD1、ゲノム編集マウス、RNA-seq、メタボローム解析

    研究期間: 2015年4月

  • 研究テーマ: 家族性痙性対麻痺の遺伝解析

    研究キーワード: 痙性対麻痺、次世代シークエンサ、エクソーム解析、ゲノム編集マウス

    研究期間: 2014年4月

  • 研究テーマ: 脊髄小脳変性症の遺伝解析

    研究キーワード: 脊髄小脳変性症、連鎖解析、次世代シークエンサ、エクソーム解析

    研究期間: 2014年4月

  • 研究テーマ: ハブの島嶼集団間の毒液タンパク質多様性の解析

    研究キーワード: ハブ、トカラハブ、サキシマハブ、ミトゲノム、毒液タンパク質、遺伝的分化、遺伝的多様性、南西諸島

    研究期間: 2012年4月

  • 研究テーマ: 日本固有の毒蛇ハブの全ゲノム配列決定

    研究キーワード: ハブ、次世代シークエンサ、新規アセンブリ、スキャッフォールディング、遺伝子予測、蛇毒

    研究期間: 2012年4月

  • 研究テーマ: 日本固有の毒蛇ハブの島嶼集団間のミトゲノム多様性解析

    研究キーワード: ハブ、トカラハブ、サキシマハブ、ミトゲノム、マイクロサテライトマーカー、遺伝的分化、遺伝的多様性、南西諸島

    研究期間: 2012年4月

  • 研究テーマ: 日本固有の毒蛇ハブの全遺伝子カタログ作成

    研究キーワード: ハブ、次世代シークエンサ、cDNA、毒腺、蛇毒

    研究期間: 2011年9月

  • 研究テーマ: 家族性てんかんの遺伝解析

    研究キーワード: ミオクロヌスてんかん、連鎖解析、次世代シークエンサ、エクソーム解析

    研究期間: 2011年4月

  • 研究テーマ: 連鎖解析とエクソーム解析による家族性ニューロパチーの責任変異同定

    研究キーワード: 家族性運動感覚ニューロパチー、連鎖解析、次世代シークエンサ、エクソーム解析

    研究期間: 2010年4月

  • 研究テーマ: 統合失調症関連遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の進化学的解析

    研究キーワード: 統合失調症、グルタミン酸伝達系、分子進化、遺伝子多型、自然選択

    研究期間: 2004年4月 - 2013年3月

  • 研究テーマ: 向精神薬応答遺伝子群のマイクロアレイによる解析

    研究キーワード: PCP マイクロアレイ

    研究期間: 2003年4月

  • 研究テーマ: 脊髄小脳失調症16型の原因遺伝子探索

    研究キーワード: SCA16、小脳、運動失調、全ゲノムスキャン

    研究期間: 2002年4月 - 2006年3月

  • 研究テーマ: 統合失調症の全ゲノム関連解析

    研究キーワード: 統合失調症 マイクロサテライトマーカー DNAプール法 関連解析

    研究期間: 2002年4月

  • 研究テーマ: 家族性筋萎縮性側索硬化症の新規な原因遺伝子の単離

    研究キーワード: 筋萎縮性側索硬化症 連鎖解析 マイクロサテライトマーカー

    研究期間: 2001年4月

  • 研究テーマ: 統合失調症の全ゲノム罹患同胞対解析

    研究キーワード: 統合失調症 ノンパラメトリック連鎖解析 罹患同胞対 マイクロサテライトマーカー

    研究期間: 1999年5月 - 2004年1月

  • 研究テーマ: 統合失調症とグルタミン酸受容体遺伝子群の関連解析

    研究キーワード: 統合失調症 関連解析 SNP 連鎖不平衡 ハプロタイプ グルタミン酸受容体

    研究期間: 1999年5月

論文

  • Active expression of genes for protein modification enzymes in the venom gland of habu snakes 査読 国際誌

    #Akiko Isomoto, Eiichi Shoguchi, Kanako Hisata, Jun Inoue, #Yinrui Sun, Kenji Inaba, Noriyuki Satoh, Tomohisa Ogawa, Hiroki Shibata

    Toxins (Basel)   14   300   2022年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Genes encoding snake venom toxins have been studied extensively. However, genes involved in the modification and functioning of venom proteins are little known. Protobothrops is a genus of pit vipers, which are venomous and inhabit the Nansei (Southwest) islands of Japan, Taiwan China, Vietnam, Thailand, Myanmar, Nepal, Bhutan, and India. Our previous study decoded the genome of Protobothrops flavoviridis, a species endemic to the Nansei Islands, Japan, and revealed unique evolutionary processes of some venom genes. In this study, we analyzed genes that are highly expressed in venom glands to survey genes for candidate enzymes or chaperone proteins involved in toxin folding and modification. We found that, in addition to genes that encode venom proteins and ribosomal proteins, genes that encode protein disulfide isomerase (PDI) family members (orthologs of human P4HB and PDIA3), Selenoprotein M (SELENOM), and Calreticulin (CALR) are highly expressed in venom glands. Since these enzymes or chaperones are involved in protein modification and potentially possess protein folding functions, we propose that P4HB, SELENOM, CALR, and PDIA3 encode candidate enzymes or chaperones to confer toxic functions upon the venom transcriptome.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329585

  • Familial paroxysmal kinesigenic dyskinesia with a novel missense variant (Arg2866Trp) in NBEA. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Tomofumi Shimojo, #Takuya Morikawa, Takashi Kamada, Yusuke Uchiyama, Seiji Kurata, Ryuta Fujioka, Hiroki Shibata

    J Hum Genet.   66 ( 8 )   805 - 811   2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Paroxysmal kinesigenic dyskinesia (PKD) is a movement disorder characterized by episodic involuntary movement attacks triggered by sudden movements, acceleration, or intention to move. We ascertained two Japanese familial cases with PKD. The proband is a 22-year-old woman who had noted sudden brief (<30 s) of involuntary movements provoked by kinesigenic trigger such as starting to run, getting on a train, picking up a telephone receiver and so on at the age of 14. Interictal brain single photon emission computed tomography (SPECT) showed hyperperfusion in the left thalamus. A 46-year-old woman, the mother of the proband was also suffering from brief attacks triggered by starting to run in her high school days. On neurological examination, both showed no abnormality. Whole exome sequencing combined with rigorous filtering revealed two heterozygous nonsynonymous variants (NM_001447: c.8976G > C [p.Gln2992His] in FAT2 and NM_015678: c.8596C > T [p.Arg2866Trp] in NBEA). Real time quantitative PCR analysis of Nbea mRNA levels in the developing rat brain revealed peak at postnatal day 28 and decline at postnatal day 56. This result might match the most common clinical course of PKD from the point of view of the most common age at remission. NBEA has been reported to be responsible for neurodevelopmental disease accompanied by epilepsy. We concluded the variant in NBEA most likely to be responsible for our familial cases of PKD.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329570

  • Ddhd1 knockout mouse as a model for familial spastic paraplegia 査読 国際誌

    #Takuya Morikawa, Hiroaki Ohishi, #Kengo Kosaka, #Tomofumi Shimojo, #Akihiro Nagano, Itsuki Taniguchi, Ryuta Fujioka, Kosei Moriyama, Motoko Unoki2#, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    Biosci Rep.   41 ( 2 )   BSR20204171   2021年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We have previously reported a novel homozygous 4-bp deletion in DDHD1 as the respon- sible variant for spastic paraplegia type 28 (SPG28; OMIM#609340). The variant causes a frameshift, resulting in a functionally null allele in the patient. DDHD1 encodes phospholi- pase A1 (PLA1) catalyzing phosphatidylinositol to lysophosphatidylinositol (LPI). To clarify the pathogenic mechanism of SPG28, we established Ddhd1 knockout mice (Ddhd1[−/−]) carrying a 5-bp deletion in Ddhd1, resulting in a premature termination of translation at a position similar to that of the patient. We observed a significant decrease in foot–base angle (FBA) in aged Ddhd1(−/−) (24 months of age) and a significant decrease in LPI 20:4 (sn-2) in Ddhd1(−/−) cerebra (26 months of age). These changes in FBA were not observed in 14 months of age. We also observed significant changes of expression levels of 22 genes in the Ddhd1(−/−) cerebra (26 months of age). Gene Ontology (GO) terms relating to the nervous system and cell–cell communications were significantly enriched. We conclude that the re- duced signaling of LPI 20:4 (sn-2) by PLA1 dysfunction is responsible for the locomotive abnormality in SPG28, further suggesting that the reduction of downstream signaling such as GPR55 which is agonized by LPI is involved in the pathogenesis of SPG28.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329568

  • Intronic variant in IQGAP3 associated with hereditary neuropathy with proximal lower dominancy, urinary disturbance, and paroxysmal dry cough. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Kengo Kosaka, #Tomofumi Shimojo, Eiji Matsuura, Kazuhito Noda, Ryuta Fujioka, Shin-Ichiro Mori, Fujio Umehara, Toru Iwaki, Ken Yamamoto, Hirotomo Saitsu, Hiroki Shibata

    J Hum Genet.   65 ( 9 )   717 - 725   2020年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In 2008, we reported a clinically and genetically new type of autosomal dominant disorder of motor and sensory neuropathy with proximal dominancy in the lower extremities, urinary disturbance, and paroxysmal dry cough. To identify the nucleotide variant causative of this disease, we reanalyzed the linkage of the original Japanese pedigree including seven newly ascertained subjects with updated information. We assigned the locus of the disease to 1p13.3-q23 (maximum logarithm-of-odds score = 2.71). Exome sequencing for five patients and one healthy relative from the pedigree revealed 2526 patient-specific single- nucleotide variants (SNVs). By rigorous filtering processes using public databases, our linkage results, and functional prediction, followed by Sanger sequencing of the pedigree and 520 healthy Japanese individuals, we identified an intronic SNV in IQGAP3, a gene known to be associated with neurite outgrowth. Upon pathological examination of the sural nerve, moderate, chronic, mainly axonal neuropathy was observed. By histochemical analyses, we observed a patient-specific increase of IQGAP3 expression in the sural nerve. We concluded that the variant of IQGAP3 is associated with the disease in our pedigree.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329567

  • Alternative mRNA splicing in three venom families underlying a possible production of divergent venom proteins of the Habu snake, Protobothrops flavoviridis. 査読 国際誌

    Tomohisa Ogawa, Naoko Oda-Ueda, Kanako Hisata, Hitomi Nakamura, Takahito Chijiwa, Shousaku Hattori, #Akiko Isomoto, #Haruki Yugeta, #Shinichi Yamasaki, Yasuyuki Fukumaki, Motonori Ohno, Noriyuki Satoh, Hiroki Shibata

    Toxins   11 ( 10 )   581 - 581   2019年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Snake venoms are complex mixtures of toxic proteins encoded by various gene families that function synergistically to incapacitate prey. A huge repertoire of snake venom genes and proteins have been reported, and alternative splicing is suggested to be involved in the production of divergent gene transcripts. However, a genome-wide survey of the transcript repertoire and the extent of alternative splicing still remains to be determined. In this study, the comprehensive analysis of transcriptomes in the venom gland was achieved by using PacBio sequencing. Extensive alternative splicing was observed in three venom protein gene families, metalloproteinase (MP), serine protease (SP), and vascular endothelial growth factors (VEGF). Eleven MP and SP genes and a VEGF gene are expressed as a total of 81, 61, and 8 transcript variants, respectively. In the MP gene family, individual genes are transcribed into different classes of MPs by alternative splicing. We also observed trans-splicing among the clustered SP genes. No other venom genes as well as non-venom counterpart genes exhibited alternative splicing. Our results thus indicate a potential contribution of mRNA alternative and trans-splicing in the production of highly variable transcripts of venom genes in the habu snake.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329370

  • The habu genome reveals an evolutionary background of venom protein genes. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Takahito Chijiwa, Naoko Oda-Ueda, Hitomi Nakamura, Kazuaki Yamaguchi, Shousaku Hattori, Kazumi Matsubara, Yoichi Matsuda, Akifumi Yamashita, #Akiko Isomoto, Kazuki Mori, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Shinichi Yamasaki, Manabu Fujie, Hiroki Goto, Ryo Koyanagi, Takeshi Takeuchi, Yasuyuki Fukumaki, Motonori Ohno, Eiichi Shoguchi, Kanako Hisata, Noriyuki Satoh, Tomohisa Ogawa

    Sci Rep.   8   11300   2018年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Evolution of novel traits is a challenging subject in biological research. Several snake lineages developed elaborate venom systems to deliver complex protein mixtures for prey capture. To understand mechanisms involved in snake venom evolution, we decoded here the ~1.4-Gb genome of a habu, Protobothrops flavoviridis. We identified 60 snake venom protein genes (SV) and 224 nonvenom paralogs (NV), belonging to 18 gene families. Molecular phylogeny reveals early divergence of SV and NV genes, suggesting that one of the four copies generated through two rounds of whole genome duplication was modified for use as a toxin. Among them, both SV and NV genes in four major components were extensively duplicated after their diversification, but accelerated evolution is evident exclusively in the SV genes. Both venom-related SV and NV genes are significantly enriched in microchromosomes. The present study thus provides a genetic background for evolution of snake venom composition.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326351

  • Facultative parthenogenesis validated by DNA analyses in the green anaconda (Eunectes murinus). 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Shuichi Sakata, Yuzo Hirano, Eiji Nitasaka, Ai Sakabe.

    Plos ONE   12 ( 12 )   e0189654   2017年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In reptiles, the mode of reproduction is typically sexual. However, facultative parthenogenesis occurs in some Squamata, such as Komodo dragon (Varanus komodoensis) and Burmese python (Python bivittatus). Here, we report facultative parthenogenesis in the green anaconda (Eunectes murinus). We found two fully developed female neonates and 17 undeveloped eggs in the oviduct of a female anaconda isolated from other individuals for eight years and two months at Ueno Zoo, Japan. To clarify the zygosity of the neonates, we analyzed 18 microsatellite markers of which 16 were informative. We observed only maternal alleles and no paternal alleles for all 16 markers. To examine the possibility of the long-term sperm storage, we estimated allele frequencies in a putative parental stock by genotyping five unrelated founders. If all founders, including the mother, are originated from a single Mendelian population, then the probability that the neonates were produced by sexual reproduction with an unrelated male via long-term sperm storage was infinitesimally small (2.31E-32 per clutch). We also examined samples from two additional offspring that the mother delivered eight years before her death. We consistently observed paternal alleles in these elder offspring, indicating that the mother had switched from sexual reproduction to asexual reproduction during the eight years of isolation. This is the first case of parthenogenesis in Eunectes to be validated by DNA analysis, and suggests that facultative parthenogenesis is widespread in the Boidae.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326343

  • A novel missense variation (Q220R) of GNB4 encoding a guanine nucleotide-binding protein, beta-4 in a Japanese autosomal dominant motor and sensory neuropathy family. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Takuya Morikawa, Ryuta Fujioka, Kazuhito Noda, #Kengo Kosaka, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    Eur J Med Genet.   60 ( 9 )   474 - 478   2016年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Dominant intermediate CharcoteMarieeTooth disease F (CMTDIF) is an autosomal dominant hereditary form of CharcoteMarieeTooth disease (CMT) caused by variations in the guanine nucleotide-binding protein, subunit beta-4 gene (GNB4). We examined two Japanese familial cases with CMT. Case 1 was a 49-year-old male whose chief complaint was slowly progressive gait disturbance and limb dysesthesia that appeared at the age of 47. On neurological examination, he showed hyporeflexia or areflexia, distal limb muscle weakness, and distal sensory impairment with lower dominancy. Nerve conduction studies demonstrated demyelinating sensorimotor neuropathy with reduced action potentials in the lower limbs. Case 2 was an 80-year-old man, Case 1's father, who reported difficulty in riding a bicycle at the age of 76. On neurological examination, he showed areflexia in the upper and lower limbs. Distal sensory
    impairment in the lower limbs was also observed. Nerve conduction studies revealed mainly axonal involvement. Exome sequencing identified a novel heterozygous nonsynonymous variant (NM_021629.3:c.659T > C [p.Gln220Arg]) in GNB4 exon 8, which is known to be responsible for CMT. Sanger sequencing confirmed that both patients are heterozygous for the variation, which causes an amino acid substitution, Gln220Arg, in the highly conserved region of the WD40 domain of GNB4. The frequency of this variant in the Exome Aggregation Consortium Database was 0.000008247, and we confirmed its absence in 502 Japanese control subjects. We conclude that this novel GNB4 variant is causative for CMTDIF in these patients, who represent the first record of the disease in the Japanese
    population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326342

  • A novel frameshift mutation of DDHD1 in a Japanese patient with autosomal recessive spastic paraplegia. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, Takuya Morikawa, Ryuta Fujioka, Kengo Kosaka, Kohei Yamada, Kazuhito Noda, Gohsuke Hattori, Manabu Motomura, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    Eur J Med Genet.   59 ( 8 )   413 - 416   2016年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spastic paraplegia (SPG) type 28 is an autosomal recessive SPG caused by mutations in the DDHD1 gene. We examined a Japanese 54-years-old male patient with autosomal recessive SPG. His parents were consanguineous. He needed a wheelchair for transfer due to spastic paraplegia. There was a history of operations for bilateral hallux valgus, thoracic ossification of the yellow ligament, bilateral carpal tunnel syndrome, bilateral ankle contracture, and lumbar spinal canal stenosis. He noticed gait disturbance at age 14. He used a cane for walking in his 40s. On neurological examination, he showed hyperreflexia, spasticity, and weakness in the lower extremities and bilateral Babinski reflexes. Urinary dysfunctions and impaired vibration sense in the lower limbs were observed. By exome sequencing analysis using Agilent SureSelect and Illumina MiSeq, we identified 17,248 homozygous nucleotide variants in the patient. Through the examination of 48 candidate genes known to be responsible for autosomal recessive SPG, we identified a novel homozygous 4-bp deletion, c.914_917delGTAA, p.Ser305Ilefs*2 in exon2 of the DDHD1 gene encoding phosphatidic acid-preferring phospholipase A1 (PA-PLA1). The mutation is expected to cause a frameshift generating a premature stop codon 3-bp downstream from the deletion. In consequence, the DDHD domain that is known to be critical for PLA1 activity is completely depleted in the mutated DDHD1 protein, predicted to be a functionally null mutation of the DDHD1 gene. By Sanger sequencing, we confirmed that both parents are heterozygous for the mutation. This variation was not detected in 474 Japanese control subjects as well as the data of the 1,000G Project. We conclude that the novel mutation in DDHD1 is the causative variant for the SPG28 patient that is the first record of the disease in Japanese population.

    DOI: 10.1016/j.ejmg.2016.05.010

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326311

  • The taxonomic position and the unexpected divergence of the Habu viper, Protobothrops among Japanese subtropical islands. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Takahito Chijiwa, Shosaku Hattori, Koki Terada, Motonori Ohno, Yasuyuki Fukumaki

    Mol Phylogenet Evol.   101   91 - 100   2016年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    There are four Habu species currently recognized in Japan: Protobothrops flavoviridis from the Amami Islands and the Okinawa Islands, P. tokarensis from the Tokara Islands, P. elegans from the Yaeyama Islands and Ovophis okinabvensis from the Amami Islands and the Okinawa Islands. To clarify their taxonomic positions, we determined the complete mitochondria genome sequence (approx. 17 kb) from two specimens from two different islands each for P. flavoviridis, P. tokarensis and P. elegans as well as one specimen of O. okinavensis and reconstructed the molecular phylogeny of Protobothrops using the published sequences of related species. The maximum likelihood tree showed four major species groups within Protbothrops: Group I consisting of P. cornutus, P. dabieshanensis, P. jerdonii and P. xiangchengensis; Group II consisting of P. flavoviridis and P. tokarensis; Group III consisting of P. maolensis, P. mucrosquamatus and P. elegans; Group IV consisting of P. himalayanus and P. kaubacki. Since we observed an unexpected divergence and the paraphyly of the two samples of P. flavoviridis collected from different islands, Amami-Oshima and Okinawajima within the Group II, we expanded the analysis by increasing the number of P. flavoviridis and P. tokarensis collected from 10 islands: Amami-Oshima (5 specimens), Kakeromajima (4) and Tokunoshima (4) from the Amami Islands, Okinawajima (4), Iheyajima (4), Iejima (4), Tokashikijima (4) and Kumejima (4) from the Okinawa Islands, Kodakarajima (P. tokarensis) (4) and Takarajima (P. tokarensis) (4) from the Tokara Islands. The maximum likelihood tree of the 44 samples replicated the significant divergence of P. flavoviridis between the Amami Clade including Amami-Oshima, Kakeromajima and Tokunoshima and the Okinawa Clade including Okinawajima, Iheyajima, Iejima, Tokashikijima and Kumejima. The Amami Clade also include all specimens from the Tokara Islands currently known as an independent species, P. tokarensis, suggesting the paraphyly of the taxon, P. flavoviridis. In contrast, we observed a distinct lineage of the two specimens from the Yaeyama Islands, supporting the validity of the taxon, P. elegans as an independent species. By MCMC method, we estimated the divergence time between the Amami Clade and the Okinawa Clade to be 6.51 MYA, suggesting that the vicariance of the two clades preceded the geological separation of the Amami Islands and the Okinawa Islands (~1.5 MYA). As expected from the limited mobility of terrestrial reptiles including snakes, we observed high genetic divergence in Habu mtDNA among Japanese subtropical island populations.

    DOI: 10.1016/j.ympev.2016.04.027

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326289

  • A novel missense mutation of RYR1 in familial idiopathic hyper CK-emia 査読 国際誌

    #Ken Sano, Shiroh Miura, Toshiya Fujiwara, Ryuta Fujioka, Akiko Yorita, Kazuhito Noda, Hiroshi Kida, Koichi Azuma, Shinjiro Kaieda, Ken Yamamoto, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki, Hiroki Shibata

    J Neurol Sci.   356 ( 1-2 )   142 - 147   2015年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Persistent elevation of serum creatine kinase (CK) without any symptoms has been called idiopathic hyper CKemia
    (IHCK).We examined a four-generation Japanese pedigree of familial IHCK. Themultipoint linkage analysis
    of the pedigree showed seven clear peaks of logarithm of odds (LOD) scores (>1.4). By the exome sequencing
    followed bymultiple filtering processes,we identified one novel heterozygous nonsynonymous single nucleotide
    variant (SNV), c.7034GNC, p.S2345T in the ryanodine receptor 1 gene, RYR1 cosegregated with IHCK in the pedigree.
    Mutation Taster predicted this substitution as “disease causing” (p = 0.999). The PolyPhen-2 and PANTHER
    subPSEC scores for the substitution are 0.911 (possibly damaging) and−3.56 (probably damaging), respectively.
    We confirmed the absence of the SNV in 511 healthy Japanese individuals excluding the possibility of a normal
    variant with a very low frequency. Immunohistochemistry andWestern blotting of biopsy samples consistently
    showed the expression level of RYR1 reduced in the patient. In real-time RT-PCR, the mRNA expression level of
    RYR1 was also significantly reduced in the patient (p = 0.009). These results suggest that the novel
    nonsynonymous SNV contribute to the vulnerability of the RYR1 protein through the dominant negative effect.
    We conclude that the SNV in the RYR1 gene is one of the responsible genes of IHCK.

    DOI: 10.1016/j.jns.2015.06.035

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326288

  • DNA methylation and gene expression dynamics during spermatogonial stem cell differentiation in the early postnatal mouse testis. 査読 国際誌

    #Naoki Kubo, Hidehiro Toh, Kenjiro Shirane, Takayuki Shirakawa, Hisato Kobayashi, Sato Tetsuya, Hidetoshi Sone, Yasuyuki Sato, Shin-ichi Tomizawa, Yoshinori Tsurusaki, Hiroki Shibata, Hirotomo Saitsu, Yutaka Suzuki, Naomichi Matsumoto, Tomohiro Kono, Kazuyuki Ohbo, Hiroyuki Sasaki

    BMC Genomics   16 ( 1 )   624 - 624   2015年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: In the male germline, neonatal prospermatogonia give rise to spermatogonia, which include stem cell
    population (undifferentiated spermatogonia) that supports continuous spermatogenesis in adults. Although the levels of
    DNA methyltransferases change dynamically in the neonatal and early postnatal male germ cells, detailed genome-wide
    DNA methylation profiles of these cells during the stem cell formation and differentiation have not been reported.
    Results: To understand the regulation of spermatogonial stem cell formation and differentiation, we examined the DNA
    methylation and gene expression dynamics of male mouse germ cells at the critical stages: neonatal prospermatogonia,
    and early postntal (day 7) undifferentiated and differentiating spermatogonia. We found large partially methylated
    domains similar to those found in cancer cells and placenta in all these germ cells, and high levels of non-CG
    methylation and 5-hydroxymethylcytosines in neonatal prospermatogonia. Although the global CG methylation levels
    were stable in early postnatal male germ cells, and despite the reported scarcity of differential methylation in the adult
    spermatogonial stem cells, we identified many regions showing stage-specific differential methylation in and around
    genes important for stem cell function and spermatogenesis. These regions contained binding sites for specific
    transcription factors including the SOX family members.
    Conclusions: Our findings show a distinctive and dynamic regulation of DNA methylation during spermatogonial stem
    cell formation and differentiation in the neonatal and early postnatal testes. Furthermore, we revealed a unique
    accumulation and distribution of non-CG methylation and 5hmC marks in neonatal prospermatogonia. These findings
    contrast with the reported scarcity of differential methylation in adult spermatogonial stem cell differentiation and
    represent a unique phase of male germ cell development.

    DOI: 10.1186/s12864-015-1833-5

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326287

  • Genome-wide association study of schizophrenia using microsatellite markers in the Japanese population. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Ken Yamamoto, #Zhu Sun, Akira Oka, Hidetoshi Inoko, Tadao Arinami, Toshiya Inada, Hiroshi Ujike, Masanari Itokawa, Mamoru Tochigi, Yuichiro Watanabe, Toshiyuki Someya, Hiroshi Kunugi, Tatsuyo Suzuki, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    Psychiatr Genet.   23 ( 3 )   117 - 123   2013年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    OBJECTIVES: To search for schizophrenia susceptibility loci, we carried out a case-control study using 28601 microsatellite markers distributed across the entire genome.
    MATERIALS AND METHODS: To control the highly multiple testing, we designed three sequential steps of screening using three independent sets of pooled samples, followed by the confirmatory step using an independent sample set (>2200 case-control pairs).
    RESULTS: The first screening using pooled samples of 157 case-control pairs showed 2966 markers to be significantly associated with the disorder (P<0.05). After the second and the third screening steps using pooled samples of 150 pairs each, 374 markers remained significantly associated with the disorder. We individually genotyped all screening samples using a total of 1536 tag single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in the vicinity of ∼200 kb from the 59 positive microsatellite markers. Of the 167 SNPs that replicated the significance, we selected 31 SNPs on the basis of the levels of P values for the confirmatory association test using an independent-sample set. The best association signal was observed in rs13404754, located in the upstream region of SLC23A3. We genotyped six additional SNPs in the vicinity of rs13404754. Significant associations were observed in rs13404754, rs6436122, and rs1043160 in the cumulative samples (2617 cases and 2698 controls) (P=0.005, 0.035, and 0.011, respectively). These SNPs are located in the linkage disequilibrium block of 20 kb in size containing SLC23A3, CNPPD1, and FAM134A genes.
    CONCLUSION: Genome-wide association study using microsatellite markers suggested SLC23A3, CNPPD1, and FAM134A genes as candidates for schizophrenia susceptibility in the Japanese population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326134

  • The identification and functional implications of human-specific "fixed" amino acid substitutions in the glutamate receptor family. 査読 国際誌

    Hiroki Goto, #Kazunori Watanabe, #Naozumi Araragi, #Rui Kageyama, #Kunika Tanaka, Yoko Kuroki, Atsushi Toyoda, Masahira Hattori, Yoshiyuki Sakaki, Asao Fujiyama, Yasuyuki Fukumaki, Hiroki Shibata.

    BMC Evol Biol.   9   224   2009年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: The glutamate receptors (GluRs) play a vital role in the mediation of excitatory synaptic transmission in the central nervous system. To clarify the evolutionary dynamics and mechanisms of the GluR genes in the lineage leading to humans, we determined the complete sequences of the coding regions and splice sites of 26 chimpanzee GluR genes.
    Results: We found that all of the reading frames and splice sites of these genes reported in humans were completely conserved in chimpanzees, suggesting that there were no gross structural changes in humans after their divergence from the human-chimpanzee common ancestor. We observed low KA/KS ratios in both humans and chimpanzees, and we found no evidence of accelerated evolution. We identified 30 human-specific "fixed" amino acid substitutions in the GluR genes by analyzing 80 human samples of seven different populations worldwide. Grantham's distance analysis showed that GRIN2C and GRIN3A are the most and the second most diverged GluR genes between humans and chimpanzees. However, most of the substitutions are non-radical and are not clustered in any particular region. Protein motif analysis assigned 11 out of these 30 substitutions to functional regions. Two out of these 11 substitutions, D71G in GRIN3A and R727H in GRIN3B, caused differences in the functional assignments of these genes between humans and other apes.
    Conclusion: We conclude that the GluR genes did not undergo drastic changes such as accelerated evolution in the human lineage after the divergence of chimpanzees. However, there remains a possibility that two human-specific "fixed" amino acid substitutions, D71G in GRIN3A and R727H in GRIN3B, are related to human-specific brain function.

    その他リンク: http://www.biomedcentral.com/1471-2148/9/224

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326101

  • Association study of polymorphisms in the group III metabotropic glutamate receptor genes, GRM4 and GRM7, with schizophrenia. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Ayako Tani, #Tomoyuki Chikuhara, #Rumiko Kikuta, Mayumi Sakai, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Nakao Iwata, Norio Ozaki and Yasuyuki Fukumaki.

    Psychiatric Res.   167   88 - 96   2009年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Based on the hypothesis that a glutamatergic dysfunction is involved in the pathophysiology of schizophrenia, we have been conducting systematic studies on the association between glutamate receptor genes and schizophrenia. Here we report association studies of schizophrenia with polymorphisms in group III metabotropic glutamate receptor genes, GRM4 and GRM7. We selected 8 and 43 common SNPs distributed in the entire gene regions of GRM4 (> 111 kb) and GRM7 (> 900 kb), respectively. We scanned significant associations with schizophrenia using 100 case-control pairs of Japanese. We identified two neighboring SNPs (rs12491620 and rs1450099) in GRM7 showing highly significant haplotype association with schizophrenia surviving the FDR correction. We then performed additional typing of the two SNPs using the expanded sample set (404 cases and 420 controls) and confirmed the significant association with the disease. We conclude that at least one susceptibility locus for schizophrenia is located within or nearby GRM7, whereas GRM4 is unlikely to be a major susceptibility gene for schizophrenia in the Japanese population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326099

  • Association study of polymorphisms in the GluR7, KA1 and KA2 kainate receptor genes (GRIK3, GRIK4, GRIK5) with schizophrenia. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, #Toshihiro Aramaki, Mayumi Sakai, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    Psychiatry Res.   141   39 - 51   2006年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    On the basis of the glutamatergic dysfunction hypothesis of schizophrenia, we have been conducting a systematic study of the association of glutamate receptor genes with schizophrenia. Here we report association studies of schizophrenia with polymorphisms in three kainate receptor genes: GRIK3, GRIK4 and GRIK5. We selected 16, 24 and 5 common single nucleotide polymorphisms (SNPs) distributed in the entire gene regions of GRIK3 (N240 kb), GRIK4 (N430 kb) and GRIK5 (N90 kb), respectively. We tested associations of the polymorphisms with schizophrenia using 100 Japanese case–control pairs (the Kyushu set). We observed no significant bsingle markerQ associations with the disease in any of the 45 SNPs tested except for one (rs3767092) in GRIK3 showing a nominal level of significance. The significant association, however, disappeared after the application of the Bonferroni correction. We also observed significant haplotype associations in seven SNP pairs in GRIK3 and in four SNP pairs in GRIK4. None, however, remained significant after Bonferroni correction. We also failed to replicate the nominally significant haplotype associations in a second sample set, the Aichi set (106 cases and 100 controls). We conclude that SNPs in the gene regions of GRIK3, GRIK4 or GRIK5 do not play a major role in schizophrenia pathogenesis in the Japanese population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326035

  • Identification of single-nucleotide polymorphisms in the human N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR2D gene, GRIN2D, and association study with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Chieko Makino, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki.

    Psychiatr Genet.   15 ( 3 )   215 - 221   2005年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Objectives: The glutamatergic dysfunction is one of the main hypotheses for the pathophysiology of schizophrenia. N-methyl-D-aspartate receptors are of major interest because phencyclidine, a non-competitive antagonist of N-methyl-D-aspartate receptors, produces a schizophrenia-like psychosis. Therefore, the genes encoding N-methyl-D-aspartate receptor subunits are strong candidates for schizophrenia susceptibility genes. We focused on the N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR2D gene in the case-control study of schizophrenia.

    Methods: We screened for polymorphisms in exons, exon-intron boundaries and the 5' upstream region of GRIN2D by direct sequencing in 32 Japanese patients. Out of the total 13 single-nucleotide polymorphisms identified, we genotyped 200-201 Japanese patients and 219-221 controls for nine common single-nucleotide polymorphisms (minor allele frequency over 0.05).

    Results: None of the nine single-nucleotide polymorphisms showed significant differences in genotype and allele frequencies between cases and controls. We observed significant associations of pairwise haplotypes in three combinations of four single-nucleotide polymorphisms, INT10SNP-EX13SNP2, EX13SNP2-EX13SNP3 and EX6SNP-EX13SNP2, with the disease even after the Bonferroni correction (P=1.094 x 10(-6), Pcorrected=2.297 x 10(-5), P=2.825 x 10(-6), Pcorrected=5.933 x 10(-5) and P=2.02 x 10(-4), Pcorrected=4.242 x 10(-3), respectively). The same results were also obtained using the false discovery rate (BL) method at the threshold P value, 2.908 x 10(-3).

    Conclusions: We conclude that the GRIN2D locus is a possible genomic region contributing to schizophrenia susceptibility in the Japanese population.

    DOI: 10.1097/00041444-200509000-00014

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325996

  • Association study of polymorphisms in the excitatory amino acid transporter 2 gene (SLC1A2) with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Xiangdong Deng, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    BMC Psychiatry   4 ( 1 )   21   2004年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: The glutamatergic dysfunction hypothesis of schizophrenia suggests that genes involved in glutametergic transmission are candidates for schizophrenic susceptibility genes. We have been performing systematic association studies of schizophrenia with the glutamate receptor and transporter genes. In this study we report an association study of the excitatory amino acid transporter 2 gene, SLC1A2 with schizophrenia.
    Methods: We genotyped 100 Japanese schizophrenics and 100 controls recruited from the Kyushu area for 11 single nucleotide polymorphism (SNP) markers distributed in the SLC1A2 region using the direct sequencing and pyrosequencing methods, and examined allele, genotype and haplotype association with schizophrenia.The positive finding observed in the Kyushu samples was re-examined using 100 Japanese schizophrenics and 100 controls recruited from the Aichi area.
    Results: We found significant differences in genotype and allele frequencies of SNP2 between cases and controls (P = 0.013 and 0.008, respectively). After Bonferroni corrections, the two significant differences disappeared. We tested haplotype associations for all possible combinations of SNP pairs. SNP2 showed significant haplotype associations with the disease (P = 9.4 × 10-5, P = 0.0052 with Bonferroni correction, at the lowest) in 8 combinations. Moreover, the significant haplotype association of SNP2-SNP7 was replicated in the cumulative analysis of our two sample sets.
    Conclusion: We concluded that at least one susceptibility locus for schizophrenia is probably located within or nearby SLC1A2 in the Japanese population.

    DOI: 10.1186/1471-244X-4-21

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325989

  • Positive associations of polymorphisms in the metabotropic glutamate receptor type 8 gene (GRM8) with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Hiromi Takaki, #Rumiko Kikuta, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Am J Med Genet.   128B ( 1 )   6 - 14   2004年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The glutamatergic dysfunction has been im- plicated in pathophysiology of schizophre- nia. The Group III metabotropic glutamate receptor 4 (mGluR4), 6, 7, and 8 are thought to modulate glutamatergic transmission in the brain by inhibiting glutamate release at the synapse. We tested association of schi- zophrenia with GRM8 using 22 single nucleo- tide polymorphisms (SNPs) with the average intervals of 40.3 kb in the GRM8 region in 100 case-control pairs for the SNPs. Although we observed significant associations of schizo- phrenia with two SNPs, SNP18 (rs2237748, allele: P1⁄40.0279; genotype: P1⁄40.0124) and SNP19 (rs2299472, allele: P 1⁄4 0.0302; geno- type: P1⁄40.0127), none of two SNPs showed significant association with disease after Bonferroni correction. Both SNP18 and SNP19 were included in a large region (>330 kb) in which SNPs are in linkage dis- equilibrium (LD) at the 30 region of GRM8. We also tested haplotype association of schizo- phrenia with constructed haplotypes of the SNPs in LD. Significant associations were detected for the combinations of SNP5-SNP6 (x2 1⁄4 18.12, df 1⁄4 3, P 1⁄4 0.0004, P corr 1⁄4 0.0924 with Bonferroni correction), SNP4-SNP5-

    DOI: 10.1002/ajmg.b.20108

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325980

  • Initial genome-wide scan for linkage with schizophrenia in the Japanese Schizophrenia Sib-pair Linkage Group (JSSLG) families. 査読 国際誌

    The Japanese Schizophrenia Sib-pair Linkage Group.

    Am J Med Genet.   120B ( 1 )   22 - 28   2003年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    To determine if there are common genes that contribute to the susceptibility for schizophrenia, first-stage genome-wide scan was carried out by genotyping 417 short-tandem repeat (STR) markers in 338 individuals from 130 families with 148 affected sib-pairs identified at 16 sites nationwide in Japan. Data was from the Japanese Schizophrenia Sib-pair Linkage Group (JSSLG), which is a multi-site collaborative study group established to create a national resource for genetic studies of schizophrenia in Japan. All subjects were Japanese, and the probands and their siblings had schizophrenia. Multipoint non-parametric linkage analysis and exclusion mapping were performed with GENEHUNTER software. Simulation studies suggested that in the absence of linkage we could expect one multipoint maximum LOD score (MLS) of 1.9 per genome scan. An MLS of 3.7 would be expected only once in every 20 genome scans and thus corresponds to a genome-wide significance of 0.05. No loci in the initial screen fulfilled the criteria for significant or suggestive evidence for linkage. Ten chromosomes (1, 2, 3, 4, 5, 8, 9, 14, 17, and 20) had at least one region with a nominal P value < 0.05. Susceptibility genes with lambdas of 3 and 2 were excluded from 98 and 70% of the genome, respectively. Our results suggest that common genes that contribute significantly to susceptibility for schizophrenia are unlikely to exist in the Japanese population.

    DOI: 10.1002/ajmg.b.20022

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7331663

  • Positive associations of polymorphisms in the metabotropic glutamate receptor type 3 gene (GRM3) with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Yo Fujii, Hiroki Shibata, #Rumiko Kikuta, #Chieko Makino, Ayako Tani, #Naotsugu Hirata, #Atsushi Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Psychiatric Genetics.   13 ( 2 )   71 - 76   2003年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Objectives: Glutamatergic dysfunction is one of the major hypotheses of schizophrenia pathophysiology. We have been conducting systematic studies on the association between glutamate receptors and schizophrenia. We focused on the metabotropic glutamate receptor type 3 gene (GRM3) as a candidate for schizophrenia susceptibility.

    Methods: We genotyped Japanese schizophrenics (n=100) and controls (n=100) for six single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in the GRM3 region at intervals of approximately 50 kb. Statistical differences in genotype, allele and haplotype frequencies between cases and controls were evaluated by the chi2 test and Fisher's exact probability test at a significance level of 0.05. Haplotype frequencies were estimated by the EM algorithm.

    Results: A case-control association study identified a significant difference in allele frequency distribution of a SNP, rs1468412, between schizophrenics and controls (P=0.011). We also observed significant differences in haplotype frequencies estimated from SNP frequencies between schizophrenics and controls. The haplotype constructed from three SNPs, including rs1468412, showed a significant association with schizophrenia (P=8.30 x 10-4).

    Conclusions: Our data indicate that at least one susceptibility locus for schizophrenia is situated within or very close to the GRM3 region in the Japanese patients.

    DOI: 10.1097/01.ypg.0000056682.82896.b0

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325979

  • Positive association of the AMPA receptor subunit GluR4 gene (GRIA4) haplotype with schizophrenia: linkage disequilibrium mapping using SNPs evenly distributed across the gene region. 査読 国際誌

    #Chieko Makino, #Yo Fujii, #Rumiko Kikuta, #Naotsugu Hirata, Ayako Tani, #Atsushi Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki

    Am J Med Genet.   116B ( 1 )   17 - 22   2003年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The glutamatergic dysfunction hypothesis suggests that genes involved in the glutamate neurotransmitter system are candidates for schizophrenia-susceptibility genes. We have been conducting systematic studies of the association between glutamate receptors and schizophrenia. We report on a positive association of some haplotypes of the AMPA receptor subunit GluR4 gene (GRIA4) with schizophrenia. We genotyped 100 Japanese schizophrenics and 100 controls for six single nucleotide polymorphism (SNP) markers distributed at intervals of about 50 kb in the GRIA4 region, and estimated the degree of linkage disequilibrium (LD) between the SNPs. We constructed haplotypes of the SNPs in LD using the EM algorithm to test their association with schizophrenia. Significant associations were detected for the combination of SNP4-5 (chi(2) = 12.54, df = 3, P = 0.0057, P = 0.029 with Bonferroni correction) and for the combination of SNP3-4-5 (chi(2) = 18.9, df = 7, P = 0.0085, P = 0.043 with Bonferroni correction). These results suggest that at least one susceptibility locus for schizophrenia is located within or very close to the GRIA4 region in Japanese.

    DOI: 10.1002/ajmg.b.10041

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325942

  • Association study of polymorphisms in the GluR6 kainate receptor gene (GRIK2) with schizophrenia. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, #Atsushi Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Psychiatry Res.   113 ( 1-2 )   59 - 67   2002年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The glutamatergic dysfunction hypothesis of schizophrenia suggests genes involved in glutamatergic transmission as candidates for schizophrenia-susceptibility genes. The GluR6 kainate receptor gene GRIK2 is located on chromosome 6q16.3-q21, a schizophrenia susceptibility region, as suggested by multiple linkage studies. We examined 15 SNPs evenly distributed in the entire GRIK2 region (>700 kb) in Japanese patients with schizophrenia (n=100) and controls (n=100). Neither genotype nor allele frequency showed a significant association with the disorder. We constructed 2-SNP haplotypes from the 15 SNPs. Although we observed three long linkage disequilibrium blocks (>150 kb) within the GRIK2 region, none of the pairwise haplotypes showed a significant association with the disorder. Therefore, we conclude that GRIK2 does not play a major role in the pathogenesis of schizophrenia in the Japanese population.

    DOI: 10.1016/S0165-1781(02)00231-7

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325941

  • Polymorphism analysis of upstream regions of the human N-methyl-D-aspartate receptor subunit NR1 gene (GRIN1): implications for schizophrenia. 査読 国際誌

    #Ayako Tani, #Rumiko Kikuta, #Kanako Itoh, #Akiko Joo, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Schizophr Res.   58 ( 1 )   83 - 86   2002年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Dysfunction of the gene for the NR1 subunit of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor (GRIN1) has been implicated in the pathogenesis of schizophrenia. In support of this hypothesis are behavioral abnormalities reminiscent of schizophrenia in mice with an attenuated expression of the NR1 subunit receptor and the reduced level of NR1 mRNA in postmortem brains of patients with schizophrenia. We screened single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the upstream region between +51 and -941 from the translation initiation codon of GRIN1 and identified 17 SNPs, 10 of which were located within the region containing the Sp1 motif and the GSG motifs. As genotyping of 191-196 Japanese patients with schizophrenia and 202-216 controls revealed no significant association between schizophrenia and the SNPs in the upstream region of GRIN1, these SNPs apparently do not play a critical role in the pathogenesis of schizophrenia in the Japanese population.

    DOI: 10.1016/S0920-9964(02)00161-5

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325940

  • Association study of polymorphisms in the coding region of the GluR5 kainate receptor gene (GRIK1) with schizophrenia. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, #Akiko Joo, #Yo Fujii, Ayako Tani, #Chieko Makino, #Naotsugua Hirata, #Rumiko Kikuta, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Psychiatr Genet.   11 ( 3 )   139 - 144   2001年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The glutamatergic dysfunction hypothesis suggests genes involved in glutamatergic transmission as candidates for schizophrenia susceptibility genes. We screened single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the entire coding sequence of the GluR5 kainate receptor gene, GRIK1, by polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism and direct sequencing. We identified six SNPs including three known ones, 522A/C (174T, synonymous), 1173C/T (391D, synonymous), and 2705C/T (902L/S), as well as three novel ones, 995C/T (332A/V), 2400C/T (800L, synonymous), and 2585A/G (862R/Q). We genotyped Japanese samples of schizophrenia (n = 193-203) and healthy controls (n = 199-215) for three SNPs those were commonly observed in our samples, 522A/C, 1173C/T, and 2705C/T. We observed no significant associations of the SNPs and their haplotypes with schizophrenia. Therefore, we conclude that GRIK1 does not play a major role in schizophrenia pathogenesis in the Japanese population.

    DOI: 10.1097/00041444-200109000-00005

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325705

  • Identification and expression of a mouse ortholog of A2BP1. 査読 国際誌

    Tim-Rasmus Kiehl, Hiroki Shibata, Tramy Vo, Duong P. Huynh, Stefan-M. Pulst

    Mamm Genome.   12 ( 8 )   595 - 601   2001年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Human ataxin-2 contains a polyglutamine repeat that is expanded in patients with spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2). Ataxin-2 is highly conserved in evolution with orthologs in mouse, Caenorhabditis elegans, and Drosophila melanogaster. It interacts at its C-terminus with ataxin-2 binding protein 1, A2BP1. This study presents a highly conserved mouse ortholog of A2BP1, designated A2bp1. The amino acid sequence of the human and mouse protein is 97.6% identical. This remarkable degree of conservation supports the fact that these proteins have an important basic function in development and differentiation. Sequence analysis reveals the existence of RNA binding motifs. The A2bp1 transcript was found in various regions of the CNS including cerebellum, cerebral cortex, brain stem, and thalamus/hypothalamus. The A2bp1 protein was detected by immunocytochemistry in the CNS and connective tissue of the mouse embryo starting at stage E11, as well as in the heart at all stages. Mouse embryos showed varying expression of A2bp1 at all stages. Previous studies in other model systems had implicated the orthologs of ataxin-2 and A2BP1 in development. This study suggests a role for A2bp1 in embryogenesis as well as in the adult nervous system, possibly mediated by a function in RNA distribution or processing.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325704

  • A novel protein with RNA binding motif binds to C-terminal ataxin-2. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Duong P. Huynh and Stefan-M. Pulst

    Human Molecular Genetics   9 ( 9 )   1303 - 1313   2000年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) is caused by expansion of a polyglutamine tract in ataxin-2, a protein of unknown function. Using the yeast two- hybrid system, we identified a novel protein, A2BP1 (ataxin-2 binding protein 1) which binds to the C- terminus of ataxin-2. Northern blot analysis showed that A2BP1 was predominantly expressed in muscle and brain. By immunocfluorescent staining, A2BP1 and ataxin-2 were both localized to the trans-Golgi network. Immunocytochemistry showed that A2BP1 was expressed in the cytoplasm of Purkinje cells and dentate neurons in a pattern similar to that seen for ataxin-2 labeling. Western blot analysis of subcel- lular fractions indicated enrichment of A2BP1 in the same fractions as ataxin-2. Sequence analysis of the A2BP1 cDNA revealed an RNP motif that is highly conserved among RNA-binding proteins. A2BP1 had striking homology with a human cDNA clone, P83A20, of unknown function and at least two copies of A2BP1 homologs are found in the Caenorhabditis elegans genome database. A2BP1 and related proteins appear to form a novel gene family sharing RNA-binding motifs.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325619

  • RNA-primed PCR. 査読 国際誌

    Hiroki Shibata, Tomoko Tahira, Kenshi Hayashi

    Genome Res.   5 ( 4 )   400 - 403   1995年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We show that RNA can serve as a primer in PCR. Use of rTth DNA polymerase is essential because it has strong reverse transcriptase activity. RNA primers can be obtained by in vitro transcription and are less costly than DNA primers, which are chemically synthesized. RNA-primed PCR also opens the possibility that a specific amplification reaction can be achieved in the absence of knowledge of the target nucleotide sequence.

    DOI: 10.1101/gr.5.4.400

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7178542

  • Molecular evolution of the duplicated Amy locus in the Drosophila melanogaster species subgroup: concerted evolution only in coding region and an excess of nonsynonymous substitutions in speciation. 査読 国際誌

    #Hiroki Shibata, Tsuneyuki Yamazaki

    Genetics   141 ( 1 )   223 - 236   1995年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    From the analysisof restriction maps of the Amy region in eight sibling species belonging to the
    Drosophilamelanogaster species subgroup, we herein show that the patterns of duplication of the Amy gene are almost the same in all species. Thisindicates that duplication occurred before speciation within this species subgroup. From the nucleotide sequence data, we show a strong within-species similarity between the duplicated loci in the Amy coding region. This is in contrast to a strong similarity in the 5’ and 3‘ flanking regions within each locus (proximal or distal) throughout the species subgroup. This means that concerted evolution occurred only in the Amy coding region and that differentiated evolution between the duplication occurred in the flanking regions. Moreover, when comparing the species, we also found a significant excess of nonsynonymous substitutions.In particular, all the fixed substitutions specific to D.erecta were found to be nonsynonymous. We thus conclude that adaptive protein evolution occurred in the lineage of D. erecta that is a “specialist” species for host plants and probably also occurs in the process of speciation in general.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7178541

  • Hexanucleotide repeat expansion in SCA36 reduces the expression of genes involved in ribosome biosynthesis and protein translation

    Morikawa, T; Miura, S; Uchiyama, Y; Hiruki, S; Sun, YR; Fujioka, R; Shibata, H

    JOURNAL OF HUMAN GENETICS   69 ( 9 )   411 - 416   2024年9月   ISSN:1434-5161 eISSN:1435-232X

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Journal of Human Genetics  

    Hereditary spinocerebellar ataxia (SCA) is a group of clinically and genetically heterogeneous inherited disorders characterized by slowly progressive cerebellar ataxia. We ascertained a Japanese pedigree with autosomal dominant SCA comprising four family members, including two patients. We identified a GGCCTG repeat expansion of intron 1 in the NOP56 gene by Southern blotting, resulting in a molecular diagnosis of SCA36. RNA sequencing using peripheral blood revealed that the expression of genes involved in ribosomal organization and translation was decreased in patients carrying the GGCCTG repeat expansion. Genes involved in pathways associated with ribosomal organization and translation were enriched and differentially expressed in the patients. We propose a novel hypothesis that the GGCCTG repeat expansion contributes to the pathogenesis of SCA36 by causing a global disruption of translation resulting from ribosomal dysfunction.

    DOI: 10.1038/s10038-024-01260-7

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  • Involvement of the splicing factor SART1 in the BRCA1-dependent homologous recombination repair of DNA double-strand breaks

    Ozaki, K; Kato, R; Yasuhara, T; Uchihara, Y; Hirakawa, M; Abe, Y; Shibata, H; Kawabata-Iwakawa, R; Shakayeva, A; Kot, P; Miyagawa, K; Suzuki, K; Matsuda, N; Shibata, A; Yamauchi, M

    SCIENTIFIC REPORTS   14 ( 1 )   18455   2024年8月   ISSN:2045-2322

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Scientific Reports  

    Although previous studies have reported that pre-mRNA splicing factors (SFs) are involved in the repair of DNA double-strand breaks (DSBs) via homologous recombination (HR), their exact role in promoting HR remains poorly understood. Here, we showed that SART1, an SF upregulated in several types of cancer, promotes DSB end resection, an essential first step of HR. The resection-promoting function of SART1 requires phosphorylation at threonine 430 and 695 by ATM/ATR. SART1 is recruited to DSB sites in a manner dependent on transcription and its RS domain. SART1 is epistatic with BRCA1, a major HR factor, in the promotion of resection, especially transcription-associated resection in the G2 phase. SART1 and BRCA1 accumulate at DSB sites in an interdependent manner, and epistatically counteract the resection blockade posed by 53BP1 and RIF1. Furthermore, chromosome analysis demonstrated that SART1 and BRCA1 epistatically suppressed genomic alterations caused by DSB misrepair in the G2 phase. Collectively, these results indicate that SART1 and BRCA1 cooperatively facilitate resection of DSBs arising in transcriptionally active genomic regions in the G2 phase, thereby promoting faithful repair by HR, and suppressing genome instability.

    DOI: 10.1038/s41598-024-68926-2

    Web of Science

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    PubMed

  • Duodenal microbiome in chronic kidney disease(タイトル和訳中)

    Kondo Masahiro, Torisu Takehiro, Nagasue Tomohiro, Shibata Hiroki, Umeno Junji, Kawasaki Keisuke, Fujioka Shin, Matsuno Yuichi, Moriyama Tomohiko, Kitazono Takanari

    Clinical and Experimental Nephrology   28 ( 4 )   263 - 272   2024年4月   ISSN:1342-1751

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    記述言語:英語   出版者・発行元:(一社)日本腎臓学会  

  • Episodic ataxia type 2 with a novel missense variant (Leu602Arg) in <i>CACNA1A</i>

    Miura, S; Watanabe, E; Senzaki, K; Hiruki, S; Matsumoto, S; Morikawa, T; Uchiyama, Y; Kurata, S; Ochi, M; Ohyagi, Y; Shibata, H

    HUMAN GENOME VARIATION   11 ( 1 )   3   2024年1月   ISSN:2054-345X eISSN:2054-345X

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Human Genome Variation  

    Autosomal dominant episodic ataxia type 2 (EA2) is caused by variants in CACNA1A. We examined a 20-year-old male with EA symptoms from a Japanese family with hereditary EA. Cerebellar atrophy was not evident, but single photon emission computed tomography showed cerebellar hypoperfusion. We identified a novel nonsynonymous variant in CACNA1A, NM_001127222.2:c.1805T>G (p.Leu602Arg), which is predicted to be functionally deleterious; therefore, this variant is likely responsible for EA2 in this pedigree.

    DOI: 10.1038/s41439-023-00261-w

    Web of Science

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    PubMed

  • Episodic ataxia type 2 with a novel missense variant (Leu602Arg) in CACNA1A. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Emina Watanabe, Kensuke Senzaki, #Shigeyoshi Hiruki, Sayaka Matsumoto, Takuya Morikawa, Yusuke Uchiyama, Seiji Kurata, Masayuki Ochi, Yasumasa Ohyagi, Hiroki Shibata

    Hum Genome Var.   11 ( 1 )   3   2024年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Autosomal dominant episodic ataxia type 2 (EA2) is caused by variants in CACNA1A. We examined a 20-year-old male with EA symptoms from a Japanese family with hereditary EA. Cerebellar atrophy was not evident, but single photon emission computed tomography showed cerebellar hypoperfusion. We identified a novel nonsynonymous variant in CACNA1A, NM_001127222.2:c.1805T>G (p.Leu602Arg), which is predicted to be functionally deleterious; therefore, this variant is likely
    responsible for EA2 in this pedigree.

    DOI: doi: 10.1038/s41439-023-00261-w.

    その他リンク: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2023.1155998/full

  • CACNA1A遺伝子に新規ミスセンス変異(Leu602Arg)を有する反復発作性運動失調症2型(Episodic ataxia type 2 with a novel missense variant(Leu602Arg) in CACNA1A)

    Miura Shiroh, Watanabe Emina, Senzaki Kensuke, Hiruki Shigeyoshi, Matsumoto Sayaka, Morikawa Takuya, Uchiyama Yusuke, Kurata Seiji, Ochi Masayuki, Ohyagi Yasumasa, Shibata Hiroki

    Human Genome Variation   11   1 - 3   2024年1月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Nature Publishing Group  

    反復発作性運動失調症(EA)2型患者のCACNA1A遺伝子から、新規の非同義変異が認められたため報告する。症例は20歳の日本人男性で、小児期から短時間で消失する運動失調を認め、典型的なEA2表現型を呈していた。また、母親と母方の祖父も20歳時まで同様の運動失調症状が認められ、16歳の弟と9歳の妹も同様の運動失調症状を呈していた。なお、画像所見では脳MRIでは明らかな小脳萎縮が確認できなかったが、脳SPECTにより小脳と脳幹および外側後頭葉で血流量の低下が観察された。エクソームシーケンシングにより、患者のCACNA1A遺伝子から新規のヘテロ接合性非同義変異c.1805T>G;p.Leu602Argが同定され、Sangerシーケンシングにより確認された。なお、本変異は機能的に有害と予測され、ACMG/AMP/CAPガイドラインによりlikely pathogenicに分類された。本例から、患者がEA症状を主訴とする際に脳MRIで小脳萎縮が認められなくても、脳SPECTで小脳の血流量低下を精査することが推奨された。

  • Duodenal microbiome in chronic kidney disease. 査読 国際誌

    #Masahiro Kondo, Takehiro Torisu, Tomohiro Nagasue, Hiroki Shibata, Junji Umeno, Keisuke Kawasaki, Shin Fujioka, Yuichi Matsuno, Tomohiko Moriyama, Takanari Kitazono

    Clin Exp Nephrol.   2023年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background The intestinal microbiome is involved in the pathogenesis of chronic kidney disease (CKD). Despite its impor- tance, the microbiome of the small intestinal mucosa has been little studied due to sampling difficulties, and previous studies have mainly focused on fecal sources for microbiome studies. We aimed to characterize the small intestinal microbiome of CKD patients by studying the microbiome collected from duodenal and fecal samples of CKD patients and healthy controls. Methods Overall, 28 stage 5 CKD patients and 21 healthy participants were enrolled. Mucosal samples were collected from the deep duodenum during esophagogastroduodenoscopy and fecal samples were also collected. The 16S ribosomal RNA gene sequencing using Qiime2 was used to investigate and compare the microbial structure and metagenomic function of the duodenal and fecal microbiomes.
    Results The duodenal flora of CKD patients had decreased alpha diversity compared with the control group. On the basis of taxonomic composition, Veillonella and Prevotella were significantly reduced in the duodenal flora of CKD patients. The tyrosine and tryptophan metabolic pathways were enhanced in the urea toxin-related metabolic pathways based on the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes database.
    Conclusion The small intestinal microbiome in CKD patients is significantly altered, indicating that increased intestinal permeability and production of uremic toxin may occur in the upper small intestine of CKD patients.

    DOI: 10.1007/s10157-023-02434-x

    その他リンク: https://doi.org/10.1007/s10157-023-02434-x (2023).

  • Case report: Frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis caused by a missense variant (p.Arg89Trp) in the valosin-containing protein gene

    Miura, S; Hiruki, S; Okada, T; Takei, SI; Senzaki, K; Okada, Y; Ochi, M; Tanabe, Y; Ochi, H; Igase, M; Ohyagi, Y; Shibata, H

    FRONTIERS IN GENETICS   14   1155998   2023年5月   ISSN:1664-8021 eISSN:1664-8021

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Frontiers in Genetics  

    Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 6, also known as amyotrophic lateral sclerosis 14, is an autosomal dominant, progressive neurodegenerative disorder caused by various mutations in the valosin-containing protein gene. In this report, we examined a 51-year-old female Japanese patient with frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis. The patient began noticing gait disturbances at the age of 45 years. Neurological examination at the age of 46 years met the Awaji criteria for clinically probable amyotrophic lateral sclerosis. At the age of 49 years, she tended to have poor mood and an aversion to activity. Her symptoms gradually worsened. She required a wheelchair for transport and had difficulty communicating with others because of poor comprehension. She then began to frequently exhibit irritability. Eventually, she was admitted to the psychiatric hospital because uncontrollable violent behavior throughout the day. Longitudinal brain magnetic resonance imaging revealed progressive brain atrophy with temporal dominance, non-progressive cerebellar atrophy, and some non-specific white matter intensities. Brain single photon emission computed tomography showed hypoperfusion in the bilateral temporal lobes and cerebellar hemispheres. Clinical exome sequencing revealed the presence of a heterozygous nonsynonymous variant (NM_007126.5, c.265C>T; p.Arg89Trp) in the valosin-containing protein gene, which was absent in the 1000 Genomes Project, the Exome Aggregation Consortium Database, and the Genome Aggregation Database, and was predicted to be “damaging” by PolyPhen-2 and “deleterious” using SIFT with a Combined Annotation Dependent Depletion score of 35. We also confirmed the absence of this variant in 505 Japanese control subjects. Therefore, we concluded that the variant in the valosin-containing protein gene was responsible for the symptoms of this patient.

    DOI: 10.3389/fgene.2023.1155998

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  • Case Report: Frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis caused by a missense variant (p.Arg89Trp) in the valosin-containing protein gene. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Emina Watanabe, Kensuke Senzaki, #Shigeyoshi Hiruki, Sayaka Matsumoto, Takuya Morikawa, Yusuke Uchiyama, Seiji Kurata, Masayuki Ochi, Yasumasa Ohyagi, Hiroki Shibata

    Front Genet.   14   1155998   2023年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Frontotemporal dementia and/or amyotrophic lateral sclerosis 6, also known as amyotrophic lateral sclerosis 14, is an autosomal dominant, progressive neurodegenerative disorder caused by various mutations in the valosin- containing protein gene. In this report, we examined a 51-year-old female Japanese patient with frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis. The patient began noticing gait disturbances at the age of 45 years. Neurological examination at the age of 46 years met the Awaji criteria for clinically probable amyotrophic lateral sclerosis. At the age of 49 years, she tended to have poor mood and an aversion to activity. Her symptoms gradually worsened. She required a wheelchair for transport and had difficulty communicating with others because of poor comprehension. She then began to frequently exhibit irritability. Eventually, she was admitted to the psychiatric hospital because uncontrollable violent behavior throughout the day. Longitudinal brain magnetic resonance imaging revealed progressive brain atrophy with temporal dominance, non- progressive cerebellar atrophy, and some non-specific white matter intensities. Brain single photon emission computed tomography showed hypoperfusion in the bilateral temporal lobes and cerebellar hemispheres. Clinical exome sequencing revealed the presence of a heterozygous nonsynonymous variant (NM_007126.5, c.265C>T; p.Arg89Trp) in the valosin-containing protein gene, which was absent in the 1000 Genomes Project, the Exome Aggregation Consortium Database, and the Genome Aggregation Database, and was predicted to be “damaging” by PolyPhen-2 and “deleterious” using SIFT with a Combined Annotation Dependent Depletion score of 35. We also confirmed the absence of this variant in 505 Japanese control subjects. Therefore, we concluded that the variant in the valosin-containing protein gene was responsible for the symptoms of this patient.

    その他リンク: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2023.1155998/full

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326352

  • Oleic acid-containing phosphatidylinositol is a blood biomarker candidate for SPG28 査読 国際誌

    Takuya Morikawa, Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Kosei Moriyama, Gohsuke Hattori, Ryuta Fujioka, Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    Biomedicines   11 ( 4 )   1092   2023年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Hereditary spastic paraplegia is a genetic neurological disorder characterized by spasticity of the lower limbs, and spastic paraplegia type 28 is one of its subtypes. Spastic paraplegia type 28 is a hereditary neurogenerative disorder with an autosomal recessive inheritance caused by loss of function of DDHD1. DDHD1 encodes phospholipase A1, which catalyzes phospholipids to lysophospholipids such as phosphatidic acids and phosphatidylinositols to lysophosphatidic acids and lysophoshatidylinositols. Quantitative changes in these phospholipids can be key to the pathogenesis of SPG28, even at subclinical levels. By lipidome analysis using plasma from mice, we globally examined phospholipids to identify molecules showing significant quantitative changes in Ddhd1 knockout mice. We then examined reproducibility of the quantitative changes in human sera including SPG28 patients. We identified nine kinds of phosphatidylinositols that show significant increases in Ddhd1 knockout mice. Of these, four kinds of phosphatidylinositols replicated the highest level in the SPG28 patient serum. All four kinds of phosphatidylinositols contained oleic acid. This observation suggests that the amount of oleic acid-containing PI was affected by loss of function of DDHD1. Our results also propose the possibility of using oleic acid-containing PI as a blood biomarker for SPG28.

    その他リンク: https://www.mdpi.com/2227-9059/11/4/1092

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329596

  • Oleic Acid-Containing Phosphatidylinositol Is a Blood Biomarker Candidate for SPG28

    Morikawa, T; Takahashi, M; Izumi, Y; Bamba, T; Moriyama, K; Hattori, G; Fujioka, R; Miura, S; Shibata, H

    BIOMEDICINES   11 ( 4 )   2023年4月   ISSN:2227-9059 eISSN:2227-9059

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Biomedicines  

    Hereditary spastic paraplegia is a genetic neurological disorder characterized by spasticity of the lower limbs, and spastic paraplegia type 28 is one of its subtypes. Spastic paraplegia type 28 is a hereditary neurogenerative disorder with an autosomal recessive inheritance caused by loss of function of DDHD1. DDHD1 encodes phospholipase A1, which catalyzes phospholipids to lysophospholipids such as phosphatidic acids and phosphatidylinositols to lysophosphatidic acids and lysophoshatidylinositols. Quantitative changes in these phospholipids can be key to the pathogenesis of SPG28, even at subclinical levels. By lipidome analysis using plasma from mice, we globally examined phospholipids to identify molecules showing significant quantitative changes in Ddhd1 knockout mice. We then examined reproducibility of the quantitative changes in human sera including SPG28 patients. We identified nine kinds of phosphatidylinositols that show significant increases in Ddhd1 knockout mice. Of these, four kinds of phosphatidylinositols replicated the highest level in the SPG28 patient serum. All four kinds of phosphatidylinositols contained oleic acid. This observation suggests that the amount of oleic acid-containing PI was affected by loss of function of DDHD1. Our results also propose the possibility of using oleic acid-containing PI as a blood biomarker for SPG28.

    DOI: 10.3390/biomedicines11041092

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

  • Hereditary Congenital Methemoglobinemia Diagnosed at the Age of 79 Years: A Case Report

    ナカタ モリヒト, ヨコタ ナオコ, タバタ カズヒコ, 森川 拓弥, 柴田 弘紀, ケンザカ ツネアキ

    Medicina   59 ( 3 )   615   2023年3月   eISSN:16489144

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)  

    Background: Cardiopulmonary disorders are the most common cause of central cyanosis, and methemoglobinemia is often overlooked in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. In most cases, methemoglobinemia is acquired and hereditary congenital methemoglobinemia is rare. Only a few case reports of congenital methemoglobinemia can be found in PubMed. To date, only four cases of congenital methemoglobinemia diagnosed after the age of 50 years have been reported. / Case Presentation: A 79-year-old Japanese woman presented at our hospital with the chief complaints of dyspnea and cyanosis. She exhibited cyanosis of the lips and extremities, and her SpO2 was 80%, with oxygen administration at 5 L/min. Blood gas analysis revealed a PaO2 of 325.4 mmHg and methemoglobin level of 36.9%. The SpO2 and PaO2 values were dissociated, and methemoglobin levels were markedly elevated. Genetic analysis revealed a nonsynonymous variant in the gene encoding nicotinamide adenine dinucleotide cytochrome (NADH) B5 reductase 3 (CYB5R3), and the patient was diagnosed with congenital methemoglobinemia. Conclusions: It is important to consider methemoglobinemia in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. At 79 years of age, our patient represents the oldest patient with this diagnosis. This report indicates that it is crucial to consider the possibility of methemoglobinemia regardless of the patient’s age.

    CiNii Research

  • Hereditary Congenital Methemoglobinemia Diagnosed at the Age of 79 Years: A Case Report 査読 国際誌

    Marohito Nakata, Naoko Yokota, Kazuhiko Tabata, Takuya Morikawa, Hiroki Shibata, Tsuneaki Kenzaka

    Medicina (Kaunas)   59 ( 3 )   615   2023年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: Cardiopulmonary disorders are the most common cause of central cyanosis, and methemoglobinemia is often overlooked in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. In most cases, methemoglobinemia is acquired and hereditary congenital methemoglobinemia is rare. Only a few case reports of congenital methemoglobinemia can be found in PubMed. To date, only four cases of congenital methemoglobinemia diagnosed after the age of 50 years have been reported. Case Presentation: A 79-year-old Japanese woman presented at our hospital with the chief complaints of dyspnea and cyanosis. She exhibited cyanosis of the lips and extremities, and her SpO2 was 80%, with oxygen administration at 5 L/min. Blood gas analysis revealed a PaO2 of 325.4 mmHg and methemoglobin level of 36.9%. The SpO2 and PaO2 values were dissociated, and methemoglobin levels were markedly elevated. Genetic analysis revealed a nonsynonymous variant in the gene encoding nicotinamide adenine dinucleotide cytochrome (NADH) B5 reductase 3 (CYB5R3), and the patient was diagnosed with congenital methemoglobinemia. Conclusions: It is important to consider methemoglobinemia in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. At 79 years of age, our patient represents the oldest patient with this diagnosis. This report indicates that it is crucial to consider the possibility of methemoglobinemia regardless of the patient’s age.

    その他リンク: https://www.mdpi.com/1648-9144/59/3/615

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7173585

  • Hereditary Congenital Methemoglobinemia Diagnosed at the Age of 79 Years: A Case Report

    Nakata, M; Yokota, N; Tabata, K; Morikawa, T; Shibata, H; Kenzaka, T

    MEDICINA-LITHUANIA   59 ( 3 )   2023年3月   ISSN:1010-660X eISSN:1648-9144

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Medicina (Lithuania)  

    Background: Cardiopulmonary disorders are the most common cause of central cyanosis, and methemoglobinemia is often overlooked in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. In most cases, methemoglobinemia is acquired and hereditary congenital methemoglobinemia is rare. Only a few case reports of congenital methemoglobinemia can be found in PubMed. To date, only four cases of congenital methemoglobinemia diagnosed after the age of 50 years have been reported. Case Presentation: A 79-year-old Japanese woman presented at our hospital with the chief complaints of dyspnea and cyanosis. She exhibited cyanosis of the lips and extremities, and her SpO2 was 80%, with oxygen administration at 5 L/min. Blood gas analysis revealed a PaO2 of 325.4 mmHg and methemoglobin level of 36.9%. The SpO2 and PaO2 values were dissociated, and methemoglobin levels were markedly elevated. Genetic analysis revealed a nonsynonymous variant in the gene encoding nicotinamide adenine dinucleotide cytochrome (NADH) B5 reductase 3 (CYB5R3), and the patient was diagnosed with congenital methemoglobinemia. Conclusions: It is important to consider methemoglobinemia in the differential diagnosis of patients with central cyanosis. At 79 years of age, our patient represents the oldest patient with this diagnosis. This report indicates that it is crucial to consider the possibility of methemoglobinemia regardless of the patient’s age.

    DOI: 10.3390/medicina59030615

    Web of Science

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    PubMed

  • A Japanese family with dystonia due to a pathogenic variant in <i>SGCE</i>

    Morikawa, T; Miura, S; Fan, LM; Watanabe, E; Fujioka, R; Motooka, H; Yasumoto, S; Uchiyama, Y; Shibata, H

    HUMAN GENOME VARIATION   9 ( 1 )   29   2022年8月   ISSN:2054-345X eISSN:2054-345X

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Human Genome Variation  

    Dystonia (DYT) is a heterogeneous neurological disorder, and there are many types of DYT depending on the responsible genes. DYT11 is an autosomal dominant DYT caused by functional variants in the SGCE gene. We examined a Japanese patient with myoclonic dystonia. By using exome analysis, we identified a rare variant in the SGCE gene, NM_003919.3: c.304C > T [Arg102*], in this patient. Therefore, this patient has been molecularly diagnosed with DYT11. By Sanger sequencing, we confirmed that this variant was paternally inherited in this patient. By allele-specific PCR, we confirmed that the maternally inherited normal allele of SGCE was silenced, and only the paternally inherited variant allele was expressed in this patient. Despite the pathogenicity, identical variants have been recurrently reported in eight independent families from different ethnicities, suggesting recurrent mutations at this mutational hotspot in SGCE.

    DOI: 10.1038/s41439-022-00207-8

    Web of Science

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  • A Japanese family with dystonia due to a pathogenic variant in SGCE. 査読 国際誌

    Takuya Morikawa, Shiroh Miura, #Luoming Fan, #Emina Watanabe, Ryuta Fujioka, Hiromichi Motooka, Shingo Yasumoto, Yusuke Uchiyama, Hiroki Shibata

    Hum Genome Var.   9   29   2022年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Dystonia (DYT) is a heterogeneous neurological disorder, and there are many types of DYT depending on the responsible genes. DYT11 is an autosomal dominant DYT caused by functional variants in the SGCE gene. We examined a Japanese patient with myoclonic dystonia. By using exome analysis, we identified a rare variant in the SGCE gene, NM_003919.3: c.304C > T [Arg102*], in this patient. Therefore, this patient has been molecularly diagnosed with DYT11. By Sanger sequencing, we confirmed that this variant was paternally inherited in this patient. By allele-specific PCR, we confirmed that the maternally inherited normal allele of SGCE was silenced, and only the paternally inherited variant allele was expressed in this patient. Despite the pathogenicity, identical variants have been recurrently reported in eight independent families from different ethnicities, suggesting recurrent mutations at
    this mutational hotspot in SGCE.

    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41439-022-00207-8

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329591

  • SGCE遺伝子の病的変異に起因したジストニアの日本人家系(A Japanese family with dystonia due to a pathogenic variant in SGCE)

    Morikawa Takuya, Miura Shiroh, Fan Luoming, Watanabe Emina, Fujioka Ryuta, Motooka Hiromichi, Yasumoto Shingo, Uchiyama Yusuke, Shibata Hiroki

    Human Genome Variation   9   1 - 3   2022年8月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Nature Publishing Group  

    SGCE遺伝子に病的変異が検出された、ミオクローヌス性ジストニア症候群の日本人症例を報告した。症例は19歳女性で、不随意運動の家族歴は有さなかったが、8歳時に右手けいれんを発症し、右手で物を把持することが困難になった。また、症状は精神的ストレスにより悪化し、徐々に左手にも症状が及んだため、クロナゼパム投与が施行された。投薬後、症状は劇的に改善され、ミオクローヌス性ジストニア症候群と診断された。また、エクソームシーケンシングを行ったところ、SGCE遺伝子に稀な変異c.304C>T[Arg102*]が同定されたため、遺伝性ジストニアDYT11と確定診断された。遺伝子解析結果から、さらに、患者と両親のSangerシーケンシングを行ったところ、これらの変異が父性遺伝であることが確認され、アレル特異的PCR法により、母性遺伝によるSGCE遺伝子の正常アレルがサイレンシングされ、父性遺伝した変異型アレルのみ発現したことが明らかにされた。なお、これらの病的変異は、民族が異なる血縁関係のない8家系にも報告されていることから、本変異はホットスポット変異による反復突然変異と考えられた。

  • The Compositional Structure of the Small Intestinal Microbial Community via Balloon-Assisted Enteroscopy

    Nagasue, T; Hirano, A; Torisu, T; Umeno, J; Shibata, H; Moriyama, T; Kawasaki, K; Fujioka, S; Fuyuno, Y; Matsuno, Y; Esaki, M; Kitazono, T

    DIGESTION   103 ( 4 )   308 - 318   2022年7月   ISSN:0012-2823 eISSN:1421-9867

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Digestion  

    Introduction: An association has been found between human-gut microbiota and various diseases (e.g., metabolic disease) by analyzing fecal or colonic microbiota. Despite the importance of the small intestinal microbiota, sampling difficulties prevent its full analysis. We investigated the composition and metagenomic functions of microbiota along the small intestine and compared them with the microbiota from feces and from other gastrointestinal (GI) sites. Methods: Mucosal samples from the six GI sites (stomach, duodenum, distal jejunum, proximal ileum, terminal ileum, and rectum) were collected under balloon-assisted enteroscopy. Fecal samples were collected from all participants. The microbial structures and metagenomic functions of the small intestinal mucosal microbiota were compared with those from feces and other GI sites using 16S ribosomal RNA gene sequencing. Results: We analyzed 133 samples from 29 participants. Microbial beta diversity analysis showed that the jejunum and ileum differed significantly from the lower GI tract and the feces (p < 0.001). Jejunal and duodenal microbiotas formed similar clusters. Wide clusters spanning the upper and lower GI tracts were observed with the ileal microbiota, which differed significantly from the jejunal microbiota (p < 0.001). Veillonella and Streptococcus were abundant in the jejunum but less so in the lower GI tract and feces. The metagenomic functions associated with nutrient metabolism differed significantly between the small intestine and the feces. Conclusions: The fact that the compositional structures of small intestinal microbiota differed from those of fecal and other GI microbiotas reveals that analyzing the small intestinal microbiota is necessary for association studies on metabolic diseases and gut microbiota.

    DOI: 10.1159/000524023

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  • Active Expression of Genes for Protein Modification Enzymes in Habu Venom Glands

    Isomoto, A; Shoguchi, E; Hisata, K; Inoue, J; Sun, YR; Inaba, K; Satoh, N; Ogawa, T; Shibata, H

    TOXINS   14 ( 5 )   2022年5月   eISSN:2072-6651

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Toxins  

    Genes encoding snake venom toxins have been studied extensively. However, genes involved in the modification and functioning of venom proteins are little known. Protobothrops is a genus of pit vipers, which are venomous and inhabit the Nansei (Southwest) islands of Japan, Tai-wan China, Vietnam, Thailand, Myanmar, Nepal, Bhutan, and India. Our previous study decoded the genome of Protobothrops flavoviridis, a species endemic to the Nansei Islands, Japan, and revealed unique evolutionary processes of some venom genes. In this study, we analyzed genes that are highly expressed in venom glands to survey genes for candidate enzymes or chaperone proteins involved in toxin folding and modification. We found that, in addition to genes that encode venom proteins and ribosomal proteins, genes that encode protein disulfide isomerase (PDI) family members (orthologs of human P4HB and PDIA3), Selenoprotein M (SELENOM), and Calreticulin (CALR) are highly expressed in venom glands. Since these enzymes or chaperones are involved in protein modification and potentially possess protein folding functions, we propose that P4HB, SELENOM, CALR, and PDIA3 encode candidate enzymes or chaperones to confer toxic functions upon the venom transcriptome.

    DOI: 10.3390/toxins14050300

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  • The compositional structure of the small intestinal microbial community via balloon-assisted enteroscopy 査読 国際誌

    #Tomohiro Nagasue, Atsushi Hirano, Takehiro Torisu, Junji Umeno, Hiroki Shibata, Tomohiko Moriyama, Keisuke Kawasaki, Shin Fujioka, Yuta Fuyuno, Yuichi Matsuno, Motohiro Esaki, Takanari Kitazono

    Digestion   8 ( 1 )   1 - 11   2022年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Introduction: An association has been found between human-gut microbiota and various diseases (e.g., metabolic disease) by analyzing fecal or colonic microbiota. Despite the importance of the small intestinal microbiota, sampling difficulties prevent its full analysis. We investigated the composition and metagenomic functions of microbiota along the small intestine and compared them with the microbiota from feces and from other gastrointestinal (GI) sites. Methods: Mucosal samples from the six GI sites (stomach, duodenum, distal jejunum, proximal ileum, terminal ileum, and rectum) were collected under balloon-assisted enteroscopy. Fecal samples were collected from all participants. The microbial structures and metagenomic functions of the small intestinal mucosal microbiota were compared with those from feces and other GI sites using 16S ribosomal RNA gene sequencing. Results: We analyzed 133 samples from 29 participants. Microbial beta diversity analysis showed that the jejunum and ileum differed significantly from the lower GI tract and the feces (p < 0.001). Jejunal and duodenal microbiotas formed similar clusters. Wide clusters spanning the upper and lower GI tracts were observed with the ileal microbiota, which differed significantly from the jejunal microbiota (p < 0.001). Veillonella and Streptococcus were abundant in the jejunum but less so in the lower GI tract and feces. The metagenomic functions associated with nutrient metabolism differed significantly between the small intestine and the feces. Conclusions: The fact that the compositional structures of small intestinal microbiota differed from those of fecal and other GI microbiotas reveals that analyzing the small intestinal microbiota is necessary for association studies on metabolic diseases and gut microbiota.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329584

  • One-year clinical efficacy and safety of indigo naturalis for active ulcerative colitis: a real-world prospective study 査読 国際誌

    #Yuichi Matsuno, Takehiro Torisu, Junji Umeno, Hiroki Shibata, Atsushi Hirano, Yuta Fuyuno, Yasuharu Okamoto, Shin Fujioka, Keisuke Kawasaki, Tomohiko Moriyama, #Tomohiro Nagasue, Keizo Zeze, Yoichiro Hirakawa, Shinichiro Kawatoko, Yutaka Koga, Yoshinao Oda, Motohiro Esaki, Takanari Kitazono

    Intest Res.   20 ( 2 )   260 - 268   2022年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background/Aims: Recent studies suggested a favorable effect of indigo naturalis (IN) in inducing remission for refractory ul- cerative colitis (UC), however, the maintenance effect of IN for patients with UC remains unknown. Therefore, we conducted a prospective uncontrolled open-label study to analyze the efficacy and safety of IN for patients with UC. Methods: Patients with moderate to severe active UC (clinical activity index [CAI] ≥ 8) took 2 g/day of IN for 52 weeks. CAI at weeks 0, 4, 8, and 52 and Mayo endoscopic subscore (MES) and Geboes score (GS) at weeks 0, 4, and 52 were assessed. Clinical remission (CAI ≤ 4), mucosal healing (MES ≤ 1), and histological healing (GS ≤ 1) rates at each assessment were evaluated. Overall adverse events (AEs) during study period were also evaluated. The impact of IN on mucosal microbial composition was assessed using 16S ribosomal RNA gene sequences. Results: Thirty-three patients were enrolled. The rates of clinical remission at weeks 4, 8, and 52 were 67%, 76%, and 73%, respectively. The rates of mucosal healing at weeks 4 and 52 were 48% and 70%, respectively. AEs occurred in 17 patients (51.5%) during follow-up. Four patients (12.1%) showed severe AEs, among whom 3 manifested acute colitis. No significant alteration in the mucosal microbial composition was observed with IN treatment. Conclusions: One-year treatment of moderate to severe UC with IN was effective. IN might be a promising therapeutic option for maintaining remis- sion in UC, although the relatively high rate of AEs should be considered. (Intest Res 2022;20:260-268)

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7161613

  • One-year clinical efficacy and safety of indigo naturalis for active ulcerative colitis: a real-world prospective study

    Matsuno, Y; Torisu, T; Umeno, J; Shibata, H; Hirano, A; Fuyuno, Y; Okamoto, Y; Fujioka, S; Kawasaki, K; Moriyama, T; Nagasue, T; Zeze, K; Hirakawa, Y; Kawatoko, S; Koga, Y; Oda, Y; Esaki, M; Kitazono, T

    INTESTINAL RESEARCH   20 ( 2 )   260 - +   2022年4月   ISSN:1598-9100

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Intestinal Research  

    Background/Aims: Recent studies suggested a favorable effect of indigo naturalis (IN) in inducing remission for refractory ulcerative colitis (UC), however, the maintenance effect of IN for patients with UC remains unknown. Therefore, we conducted a prospective uncontrolled open-label study to analyze the efficacy and safety of IN for patients with UC. Methods: Patients with moderate to severe active UC (clinical activity index [CAI] ≥ 8) took 2 g/day of IN for 52 weeks. CAI at weeks 0, 4, 8, and 52 and Mayo endoscopic subscore (MES) and Geboes score (GS) at weeks 0, 4, and 52 were assessed. Clinical remission (CAI ≤ 4), mucosal healing (MES ≤ 1), and histological healing (GS ≤ 1) rates at each assessment were evaluated. Overall adverse events (AEs) during study period were also evaluated. The impact of IN on mucosal microbial composition was assessed using 16S ribosomal RNA gene sequences. Results: Thirty-three patients were enrolled. The rates of clinical remission at weeks 4, 8, and 52 were 67%, 76%, and 73%, respectively. The rates of mucosal healing at weeks 4 and 52 were 48% and 70%, respectively. AEs occurred in 17 patients (51.5%) during follow-up. Four patients (12.1%) showed severe AEs, among whom 3 manifested acute colitis. No significant alteration in the mucosal microbial composition was observed with IN treatment. Conclusions: One-year treatment of moderate to severe UC with IN was effective. IN might be a promising therapeutic option for maintaining remission in UC, although the relatively high rate of AEs should be considered. (Intest Res 2022;20:260-268

    DOI: 10.5217/ir.2021.00124

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  • グアニル酸による PC―12細胞への効果

    藤岡 竜太, 岡本 昭, #範 駱鳴, 三浦 史郎, 柴田 弘紀

    別府大学短期大学部紀要   41   73 - 77   2022年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329783

  • 日本人の家族性無症候性高CK血症におけるDAG1遺伝子の新規1bp欠失変異(A novel 1-bp deletion variant in DAG1 in Japanese familial asymptomatic hyper-CK-emia)

    Fan Luoming, Miura Shiroh, Shimojo Tomofumi, Sugino Hirotoshi, Fujioka Ryuta, Shibata Hiroki

    Human Genome Variation   9   1 - 3   2022年2月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Nature Publishing Group  

    広島県に居住する日本人親子からDAG1遺伝子の新規変異が検出され、無症候性(特発性)高クレアチンキナーゼ血症(ASCK)が認められたため報告した。家族構成は両親と14歳と10歳の男児2人と発端者の11歳女児1人の5人家族で、父親ときょうだい3人から血清中CK高値が認められたが、明確な神経学的異常はみられなかった。次に、発端者である長女と次男の弟について、全エクソームシークエンシングとSangerシークエンシングを行ったところ、DAG1遺伝子のエクソン3領域に、新規の1bp欠失変異c.930delC:p.R311Gfs*70が共通して同定された。これらの変異により、コドン477領域で未成熟な翻訳終止が生じ、必須となるDAG1ドメインが完全に欠如したタンパク質産生が惹起されたと推測された。なお、本例で認められたDAG1遺伝子の新規の1塩基欠失変異は、ASCKの顕性遺伝(優性遺伝)による病原性変異と推測された。

  • A novel 1-bp deletion variant in <i>DAG1</i> in Japanese familial asymptomatic hyper-CK-emia

    Fan, LM; Miura, S; Shimojo, T; Sugino, H; Fujioka, R; Shibata, H

    HUMAN GENOME VARIATION   9 ( 1 )   4   2022年1月   ISSN:2054-345X eISSN:2054-345X

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  • A novel 1-bp deletion variant in DAG1 in Japanese familial asymptomatic hyper-CK-emia 査読 国際誌

    #Luoming Fan, Shiroh Miura, #Tomofumi Shimojo, Hirotoshi Sugino, Ryuta Fujioka, Hiroki Shibata

    Hum Genome Var.   9 ( 1 )   4   2022年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Asymptomatic hyper-CK-emia (ASCK) is characterized by persistent elevation of creatine kinase (CK) in serum without any neurological symptoms. We ascertained a two-generation family of ASCK patients without clear neurological abnormalities except for the high levels of serum CK (810.5 ± 522.4 U/L). We identified a novel 1-bp deletion variant in the DAG1 gene shared by the patients in the family (NM_001177639: exon 3: c.930delC:p.R311Gfs*70). The variant causes premature termination of translation at codon 477, resulting in a protein product completely devoid of the essential DAG1 domain. Since ASCK has been associated with DAG1 in only one case carrying compound heterozygous missense variants, our new finding of a novel 1-bp deletion revealed the previously unknown dominant effect of DAG1 on ASCK.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329583

  • Detection of novel fusion genes by next generation sequencing-based targeted RNA-sequencing analysis in adenoid cystic carcinoma of head and neck. 査読 国際誌

    Eri Shibata, Kei-ichi Morita, Kou Kayamori, Shoichiro Tange, Hiroki Shibata, Yosuke Harazono, Yasuyuki Michi, Tohru Ikeda, Hiroyuki Harada, Issei Imoto, Tetsuya Yoda

    Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol.   132 ( 4 )   426 - 433   2021年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Objective. Adenoid cystic carcinoma (AdCC) is a rare, indolent salivary gland tumor that is reported to be driven by fusion genes. However, MYB/MYBL1-NFIB fusions have been detected in only <60% of all AdCC cases and the oncogenic driver mutations in approximately 40% of AdCC remain unknown. Our aim was to identify novel gene fusions in AdCC.
    Study Design. We investigated 20 AdCC cases using a targeted RNA-sequencing panel to identify gene fusions and performed qRT-PCR to assess MYB, MYBL1, and NFIB expression levels.
    Results. A total of 36 fusion transcripts in 15 cases were detected and validated by Sanger sequencing. The MYB-NFIB and MYBL1-NFIB fusion genes were detected in nine and three cases, respectively, in a mutually exclusive manner. Furthermore, novel gene fusions, namely NFIB-EPB41L2, MAP7-NFIB, NFIB-MCMDC2, MYBL1-C8orf34, C8orf34-NFIB, and NFIB-CASC20, were identified. Among them, NFIB-EPB41L2 and NFIB-MCMDC2 are thought to activate MYB and MYBL1 expression, respectively, through the insertion of a genomic segment in proximity to MYB and MYBL1 genes, respectively.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329580

  • Gastric microbiota in patients with Helicobacter pylori-negative gastric MALT lymphoma. 査読 国際誌

    #Takahide Tanaka, Yuichi Matsuno, Takehiro Torisu, Hiroki Shibata, Atsushi Hirano, Junji Umeno, Keisuke Kawasaki, Shin Fujioka, Yuta Fuyuno, Tomohiko Moriyama, Motohiro Esaki, Takanari Kitazono

    Medicine (Baltimore) 100 (38): e27287 (2021).   100 ( 38 )   e27287   2021年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    To investigate the mucosal microbiota in the stomach of patients with Helicobacter pylori-negative mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma by means of metagenomic analysis.
    Although some gastric MALT lymphomas are associated with the presence of H. pylori, other gastric MALT lymphomas occur independently of H. pylori infection. The pathogenesis of H. pylori-negative MALT lymphoma remains unclear.
    Mucosal biopsy specimens were collected from the gastric body from 33 MALT lymphoma patients with gastric lesions, including both H. pylori-infection naïve patients and posteradication patients, as well as 27 control participants without H. pylori infection or cancer. Subsequently, the samples were subjected to 16S rRNA gene sequencing. Quantitative insights into microbial ecology, linear discriminant analysis effect size, and phylogenetic investigation of communities by reconstruction of unobserved states softwares were used to analyze the participants’ microbiota.
    H. pylori-negative MALT lymphoma patients had significantly lower alpha diversity (P = .04), compared with control participants. Significant differences were evident in the microbial composition (P = .04), as determined by comparison of beta diversity between the 2 groups. Taxonomic composition analysis indicated that the genera Burkholderia and Sphingomonas were significantly more abundant in MALT lymphoma patients, while the genera Prevotella and Veillonella were less abundant. Functional microbiota prediction showed that the predicted gene pathways “replication and repair,” “translation,” and “nucleotide metabolism” were downregulated in MALT lymphoma patients.
    H. pylori-negative MALT lymphoma patients exhibited altered gastric mucosal microbial compositions, suggesting that altered microbiota might be involved in the pathogenesis of H. pylori-negative MALT lymphoma.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329577

  • A Japanese hereditary spastic paraplegia family with a rare nonsynonymous variant in the SPAST gene. 査読 国際誌

    #Takuya Morikawa, Shiroh Miura, Takahisa Tateishi, Kazuhito Noda, Hiroki Shibata

    Hum Genome Var.   8 ( 21 )   2021年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spastic paraplegia (SPG) type 4 is an autosomal dominant SPG caused by functional variants in the SPAST gene. We examined a Japanese family with three autosomal dominant SPG patients. These patients presented with typical symptoms of SPG, such as spasticity of the lower limbs. We identified a rare nonsynonymous variant, NM_014946.4: c.1252G>A [p.Glu418Lys], in all three family members. This variant has previously been reported in a Russian SPG family as a “likely pathogenic” variant. Ascertainment of additional patients carrying this variant in an unrelated Japanese SPG family further supports its pathogenicity. Molecular diagnosis of SPG4 in this family with hereditary spastic paraplegia is confirmed.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329574

  • Ancient Jomon genome sequence analysis sheds light on migration patterns of early East Asian populations. 査読 国際誌

    Takashi Gakuhari, Shigeki Nakagome, Simon Rasmussen, Morten E. Allentoft, Takehiro Sato, Thorfinn Korneliussen, Blánaid Ní Chuinneagáin, Hiromi Matsumae, Kae Koganebuchi, Ryan Schmidt, Souichiro Mizushima, Osamu Kondo, Nobuo Shigehara, Minoru Yoneda, Ryosuke Kimura, Hajime Ishida, Tadayuki Masuyama, Yasuhiro Yamada, Atsushi Tajima, Hiroki Shibata, Atsushi Toyoda, Toshiyuki Tsurumoto, Tetsuaki Wakebe, Hiromi Shitara, Tsunehiko Hanihara, Eske Willerslev, Martin Sikora, Hiroki Oota

    Commun Biol.   3 ( 1 )   437 - 437   2020年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Anatomically modern humans reached East Asia more than 40,000 years ago. However, key questions still remain unanswered with regard to the route(s) and the number of wave(s) in the dispersal into East Eurasia. Ancient genomes at the edge of the region may elucidate a more detailed picture of the peopling of East Eurasia. Here, we analyze the whole-genome sequence of a 2,500-year-old individual (IK002) from the main-island of Japan that is characterized with a typical Jomon culture. The phylogenetic analyses support multiple waves of migration, with IK002 forming a basal lineage to the East and Northeast Asian genomes examined, likely representing some of the earliest-wave migrants who went north from Southeast Asia to East Asia. Furthermore, IK002 shows strong genetic affinity with the indigenous Taiwan aborigines, which may support a coastal route of the Jomon-ancestry migration. This study highlights the power of ancient genomics to provide new insights into the complex history of human migration into East Eurasia.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329620

  • Mucosal dysbiosis in patients with gastrointestinal follicular lymphoma. 査読 国際誌

    #Keizo Zeze, Atsushi Hirano, Takehiro Torisu, Motohiro Esaki, Hiroki Shibata, Tomohiko Moriyama, Junji Umeno, Shin Fujioka, Yasuharu Okamoto, Yuta Fuyuno, Yuichi Matsuno, Takanari Kitazono

    Hematol Oncol.   38 ( 2 )   181 - 188   2020年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Because the pathogenesis of gastrointestinal follicular lymphoma (GI-FL) remains unclear, no standardized treatment strategy has been established. Of the gastrointes- tinal lymphomas, gastric mucosa-associated lymphoid tissue lymphomas are strongly associated with Helicobacter pylori; hence, the microbiota may be involved in GI-FL pathogenesis. However, the association between GI-FL and the microbiota remains uninvestigated. Therefore, we compared the mucosal microbiotas of GI-FL patients with those of controls to identify microbiota changes in GI-FL patients. Mucosal biopsy sam- ples were obtained from the second portion of the duodenum from 20 GI-FL patients with duodenal lesions and 20 controls. Subsequent 16S rRNA gene sequencing was per- formed on these samples. QIIME pipeline and LEfSe software were used to analyze the microbiota. The GI-FL patients had significantly lower alpha diversity (P = .049) than did the controls, with significant differences in the microbial composition (P = .023) evalu- ated by the beta diversity metrics between the two groups. Comparing the taxonomic compositions indicated that the genera Sporomusa, Rothia, and Prevotella and the family Gemellaceae were significantly less abundant in the GI-FL patients than in the controls. GI-FL patients presented altered duodenal mucosal microbial compositions, suggesting that the microbiota might be involved in the GI-FL pathogenesis.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329565

  • Discovery of the gene encoding novel Small Serum Protein (SSP), SSP-6, of Protobothrops flavoviridis snake and evolutionary pathway of SSPs. 査読 国際誌

    #Kento Inamaru, #Ami Takeuchi, #Marie Maeda, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki, Naoko Oda-Ueda, Shosaku Hattori, Motonori Ohno, Takahito Chijiwa

    Toxins (Basel)   12 ( 3 )   177 - 177   2020年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Small serum proteins (SSPs) are low-molecular-weight proteins in snake serum with affinities for various venom proteins. Five SSPs, PfSSP-1 through PfSSP-5, have been reported in Protobothrops flavoviridis (“habu”, Pf) serum so far. Recently, we reported that the five genes encoding these PfSSPs are arranged in tandem on a single chromosome. However, the physiological functions and evolutionary origins of the five SSPs remain poorly understood. In a detailed analysis of the habu draft genome, we found a gene encoding a novel SSP, SSP-6. Structural analysis of the genes encoding SSPs and their genomic arrangement revealed the following: (1) SSP-6 forms a third SSP subgroup; (2) SSP-5 and SSP-6 were present in all snake genomes before the divergence of non- venomous and venomous snakes, while SSP-4 was acquired only by venomous snakes; (3) the composition of paralogous SSP genes in snake genomes seems to reflect snake habitat differences; and (4) the evolutionary emergence of SSP genes is probably related to the physiological functions of SSPs, with an initial snake repertoire of SSP-6 and SSP-5. SSP-4 and its derivative, SSP-3, as well as SSP-1 and SSP-2, appear to be venom-related and were acquired later.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329564

  • Growth responses of PC-12 cells to dried shiitake (Lentinula edodes) extract.

    Ryuta Fujioka, Akira Okamoto, #Akihiro Nagano, #Takuya Morikawa, Hiroki Shibata

    Bulletin of Bepppu University Junior College   39   63 - 67   2020年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329785

  • The Indian cobra genome and transcriptome enables comprehensive identification of venom toxins. 査読 国際誌

    Kushal Suryamohan, Sajesh P. Krishnankutty, Joseph Guillory, Matthew Jevit, Markus S. Schröder, Meng Wu, Boney Kuriakose, Oommen K. Mathew, Rajadurai C. Perumal, Ivan Koludarov, Leonard D. Goldstein, Kate Senger, Mandumpala Davis Dixon, Dinesh Velayutham, Derek Vargas, Subhra Chaudhuri, Megha Muraleedharan, Ridhi Goel, Ying-Jiun J. Chen, Aakrosh Ratan, Peter Liu, Brendan Faherty, Guillermo de la Rosa, Hiroki Shibata, Miriam Baca, Meredith Sagolla, James Ziai, Gus A. Wright, Domagoj Vucic, Sangeetha Mohan, Aju Antony, Jeremy Stinson, Donald S. Kirkpatrick, Rami N. Hannoush, Steffen Durinck, Zora Modrusan, Eric W. Stawiski, Kristen Wiley, Terje Raudsepp, R. Manjunatha Kini, Arun Zachariah, Somasekar Seshagiri

    Nat Genet.   52   106 - 117   2020年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Snakebite envenoming is a serious and neglected tropical disease that kills ~100,000 people annually. High-quality, genome- enabled comprehensive characterization of toxin genes will facilitate development of effective humanized recombinant anti- venom. We report a de novo near-chromosomal genome assembly of Naja naja, the Indian cobra, a highly venomous, medically important snake. Our assembly has a scaffold N50 of 223.35 Mb, with 19 scaffolds containing 95% of the genome. Of the 23,248 predicted protein-coding genes, 12,346 venom-gland-expressed genes constitute the ‘venom-ome’ and this included 139 genes from 33 toxin families. Among the 139 toxin genes were 19 ‘venom-ome-specific toxins’ (VSTs) that showed venom- gland-specific expression, and these probably encode the minimal core venom effector proteins. Synthetic venom reconstituted through recombinant VST expression will aid in the rapid development of safe and effective synthetic antivenom. Additionally, our genome could serve as a reference for snake genomes, support evolutionary studies and enable venom-driven drug discovery.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329619

  • TDRKH is a candidate gene responsible for an autosomal dominant distal hereditary motor neuropathy. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, #Kengo Kosaka, Ryuta Fujioka, Yusuke Uchiyama, #Tomofumi Shimojo, #Takuya Morikawa, Azusa Irie, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    Eur J Med Genet.   62 ( 12 )   103594   2019年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spinocerebellar ataxia 27 (SCA27) is an autosomal dominant SCA caused by variants in the fibroblast growth factor 14 (FGF14) gene. We examined a Japanese SCA patient whose deceased father also suffered from SCA. The patient was a 63-year-old male. He graduated from junior high school but received no further education. The predominant complaint was slowly progressive dysarthria and gait disturbance, which appeared at age 47. He showed pathological saccadic dysmetria, saccadic intrusions into smooth pursuit eye movements, dysarthria, and limb and truncal ataxia. His gait was wide-based but he did not require a walking stick. Limb muscle strength was intact. Deep tendon reflexes were normal or slightly reduced. Pathological reflexes were absent. He demonstrated mildly impaired vibration sense in the lower limbs. There was no urinary dysfunction. Brain MRI showed cerebellar atrophy without brainstem involvement. We first confirmed the absence of repeat expansion in genes known to be responsible for SCAs 1–3, 6–8, 10, 12, 17, 36 and dentatorubral-pallidoluysian atrophy. By exome analysis, we identified a novel heterozygous variant (NM_004115, c.529A>T; Lys177X) in exon 4 of the FGF14 gene. This variant is expected to generate a truncated FGF14 protein lacking the heparin binding sites, those are likely to modify the activity of FGF14. We confirmed the absence of the variant in 502 healthy Japanese individuals by Sanger sequencing. There is no record of the variant in public databases. We conclude that the novel variation in FGF14 is causative for SCA27 in this patient.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326909

  • Unique structure (construction and configuration) and evolution of the array of small serum protein genes of Protobothrops flavoviridis snake. 査読 国際誌

    Takahito Chijiwa, #Kento Inamaru, #Ami Takeuchi, #Marie Maeda, #Kazuaki Yamaguchi, Hiroki Shibata, Shosaku Hattori, Naoko Oda-Ueda, Motonori Ohno

    Biosci Rep.   39 ( 7 )   BSR20190560 - BSR20190560   2019年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326916

  • Correlation analysis between thyroid-related hormones and the plasma concentration of amino acids.

    Ryuta Fujioka, Junko Nagai, Yoshihiro Yamanishi, Hiroki Shibata

    Bulletin of Bepppu University Junior College   38   17 - 23   2019年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    Thyroid-related hormones (TRHs) are involved the regulation of endocrine function and metabolic processes of the thyroid gland, and hyperthyroidism is known to cause tremors, weight loss, and excessive sweating. As a part of examining the relationship between TRHs and the metabolism of amino acid in the plasma, we analyzed the correlation between TRHs and plasma levels of amino acids using samples from seven healthy volunteers. We measured three types of TRHs: thyroid-stimulating hormone (TSH), free triiodothyronine (FT3), and free thyroxine (FT4) in addition to 39 different amino acids including the 20 proteinogenic amino acids in the plasma collected from the healthy volunteers. We observed significant correlations between levels of taurine and FT4 (p = 0.018), valine and FT4 (p = 0.043), hydroxyproline and TSH (p = 0.049), and citrulline and TSH (p = 0.011). We also observed a correlation between the levels of hydroxyproline and citruline (p = 0.0079). These results suggest that the interaction between hydroxyproline and citrulline may be involved in plasma amino acid metabolism of TRHs.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326350

  • Spinocerebellar ataxia 27 with a novel nonsense variant (Lys177X) in FGF14. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, Kengo Kosaka, Ryuta Fujioka, Yusuke Uchiyama, Tomofumi Shimojo, Takuya Morikawa, Azusa Irie, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    Eur J Med Genet.   62   172 - 176   2018年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spinocerebellar ataxia 27 (SCA27) is an autosomal dominant SCA caused by variants in the fibroblast growth factor 14 (FGF14) gene. We examined a Japanese SCA patient whose deceased father also suffered from SCA. The patient was a 63-year-old male. He graduated from junior high school but received no further education. The predominant complaint was slowly progressive dysarthria and gait disturbance, which appeared at age 47. He showed pathological saccadic dysmetria, saccadic intrusions into smooth pursuit eye movements, dysarthria, and limb and truncal ataxia. His gait was wide-based but he did not require a walking stick. Limb muscle strength was intact. Deep tendon reflexes were normal or slightly reduced. Pathological reflexes were absent. He demonstrated mildly impaired vibration sense in the lower limbs. There was no urinary dysfunction. Brain MRI showed cerebellar atrophy without brainstem involvement. We first confirmed the absence of repeat expansion in genes known to be responsible for SCAs 1–3, 6–8, 10, 12, 17, 36 and dentatorubral-pallidoluysian atrophy. By exome analysis, we identified a novel heterozygous variant (NM_004115, c.529A>T; Lys177X) in exon 4 of the FGF14 gene. This variant is expected to generate a truncated FGF14 protein lacking the heparin binding sites, those are likely to modify the activity of FGF14. We confirmed the absence of the variant in 502 healthy Japanese individuals by Sanger sequencing. There is no record of the variant in public databases. We conclude that the novel variation in FGF14 is causative for SCA27 in this patient.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326907

  • Ancient genomics reveals four prehistoric migration waves into Southeast Asia. 査読 国際誌

    Hugh McColl, Fernando Racimo, Lasse Vinner, Fabrice Demeter, Takashi Gakuhari, J. Víctor Moreno-Mayar, George van Driem, Uffe Gram Wilken, Andaine Seguin-Orlando, Constanza de la Fuente Castro, Sally Wasef, Rasmi Shoocongdej, Viengkeo Souksavatdy, Thongsa Sayavongkhamdy, Mohd Mokhtar Saidin, Morten E. Allentoft, Takehiro Sato, Anna-Sapfo Malaspinas, Farhang A. Aghakhanian, Thorfinn Korneliussen, Ana Prohaska, Ashot Margaryan, Peter de Barros Damgaard, Supannee Kaewsutthi, Patcharee Lertrit, Thi Mai Huong Nguyen, Hsiao-chun Hung, Thi Minh Tran, Huu Nghia Truong, Giang Hai Nguyen, Shaiful Shahidan, Ketut Wiradnyana, Hiromi Matsumae, Nobuo Shigehara, Minoru Yoneda, Hajime Ishida, Tadayuki Masuyama, Yasuhiro Yamada, Atsushi Tajima, Hiroki Shibata, Atsushi Toyoda, Tsunehiko Hanihara, Shigeki Nakagome, Thibaut Deviese, Anne-Marie Bacon, Philippe Duringer, Jean-Luc Ponche, Laura Shackelford, Elise Patole-Edoumba, Anh Tuan Nguyen, Bérénice Bellina-Pryce, Jean-Christophe Galipaud, Rebecca Kinaston, Hallie Buckley, Christophe Pottier, Simon Rasmussen, Tom Higham, Robert A. Foley, Marta Mirazón Lahr, Ludovic Orlando, Martin Sikora, Maude E. Phipps, Hiroki Oota, Charles Higham, David M. Lambert, Eske Willerslev

    Science   361   88 - 92   2018年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The human occupation history of Southeast Asia (SEA) remains heavily debated. Current evidence suggests that SEA was occupied by Hòabìnhian hunter-gatherers until ~4000 years ago, when farming economies developed and expanded, restricting foraging groups to remote habitats. Some argue that agricultural development was indigenous; others favor the “two-layer” hypothesis that posits a southward expansion of farmers giving rise to present-day Southeast Asian genetic diversity. By sequencing 26 ancient human genomes (25 from SEA,1 Japanese Jōmon), we show that neither interpretation fits the complexity of Southeast Asian history: Both Hòabìnhian hunter-gatherers and East Asian farmers contributed to current Southeast Asian diversity, with further migrations affecting island SEA and Vietnam. Our results help resolve one of the long-standing controversies in Southeast Asian prehistory.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329610

  • A new targeted capture method using bacterial artificial chromosome (BAC) libraries as baits for sequencing relatively large genes 査読 国際誌

    #Kae Koganebuchi, Takashi Gakuhari, Hirohiko Takeshima, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Satoshi Kasagi, Takehiro Sato, Atsushi Tajima, Hiroki Shibata, Motoyuki Ogawa, Hiroki Oota

    PLoS One   13 ( 7 )   e0200170   2018年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    To analyze a specific genome region using next-generation sequencing technologies, the enrichment of DNA libraries with targeted capture methods has been standardized. For enrichment of mitochondrial genome, a previous study developed an original targeted capture method that use baits constructed from long-range polymerase chain reaction (PCR) amplicons, common laboratory reagents, and equipment. In this study, a new targeted capture method is presented, that of bacterial artificial chromosome (BAC) double capture (BDC), modifying the previous method, but using BAC libraries as baits for sequencing a relatively large gene. We applied the BDC approach for the 214 kb autosomal region, ring finger protein 213, which is the susceptibility gene of moyamoya disease (MMD). To evaluate the reliability of BDC, cost and data quality were compared with those of a commercial kit. While the ratio of duplicate reads was higher, the cost was less than that of the commercial kit. The data quality was sufficiently the same as that of the kit. Thus, BDC can be an easy, low-cost, and useful method for analyzing individual genome regions with substantial length.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326349

  • An albino mutant of the Japanese rat snake (Elaphe climacophora) carries a nonsense mutation in the tyrosinase gene. 査読 国際誌

    #Shuzo Iwanishi, Shohei Zaitsu, Hiroki Shibata, Eiji Nitasaka

    Genes Genet Syst.   93   163 - 167   2018年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The Japanese rat snake (Elaphe climacophora) is a common species in Japan and is widely distributed across the Japanese islands. An albino mutant of the Japanese rat snake (“pet trade” albino) has been bred and traded by hobbyists for around two decades because of its remarkable light-yellowish coloration with red eyes, attributable to a lack of melanin. Another albino Japanese rat snake mutant found in a natural population of the Japanese rat snake at high frequency in Iwakuni City, Yamaguchi Prefecture is known as “Iwakuni no Shirohebi”. It has been conserved by the government as a natural monument. The Iwakuni albino also lacks melanin, having light-yellowish body coloration and red eyes. Albino mutants of several organisms have been studied, and mutation of the tyrosinase gene (TYR) is responsible for this phenotype. By determining the sequence of the TYR coding region of the pet trade albino, we identified a nonsense mutation in the second exon. Furthermore, RT-PCR revealed that TYR transcripts were not detected in this snake. These findings suggest that mutation of TYR is responsible for the albino phenotype of the pet trade line of the Japanese rat snake. However, the Iwakuni albino did not share this TYR mutation; thus, these two albino lines differ in their origins.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326906

  • A comparison of the microbial community structure between inflamed and non-inflamed sites in patients with ulcerative colitis. 査読 国際誌

    #Atushi Hirano, Junji Umeno, Yasuharu Okamoto, Hiroki Shibata, Yoshitoshi Ogura, Tomohiko Moriyama, Takehiro Torisu, Shin Fujioka, Yuta Fuyuno, Yutaka Kawarabayashi, Takayuki Matsumoto, Takanari Kitazono, Motohiro Esaki

    J Gastroenterol Hepatol.   33   1590 - 1597   2018年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background and Aim: The gut microbiota is suggested to play an important role in the pathogenesis of ulcerative colitis (UC). However, interindividual and spatial variations hamper the identification of UC-related changes. We thus investigated paired mucosa-associated microbiota obtained from both inflamed and non-inflamed sites of UC patients and corresponding sites of non-inflammatory bowel disease (IBD) controls.
    Methods: Mucosal biopsies of both inflamed and non-inflamed sites were obtained from 14 patients with active UC of the left-sided or proctitis type. Paired mucosal biopsies of the corresponding sites were obtained from 14 non-IBD controls. The microbial community structure was investigated using 16S ribosomal RNA gene sequences, followed by data analysis using QIIME and LEfSe softwares.
    Results: Microbial alpha diversity in both inflamed and non-inflamed sites was significantly lower in UC patients compared with non-IBD controls. There were more microbes of the genus Cloacibacterium and the Tissierellaceae family, and there were less microbes of the genus Neisseria at the inflamed site when compared with the non-inflamed site in UC patients. Decreased abundance of the genera Prevotella, Eubacterium, Neisseria, Leptotrichia, Bilophila, Desulfovibrio, and Butyricimonas was evident at the inflamed site of UC patients compared with the corresponding site of non-IBD controls. Among these taxa, the genera Prevotella and Butyricimonas were also less abundant at the noninflamed site of UC patients compared with the corresponding site in non-IBD controls.
    Conclusions: Mucosal microbial dysbiosis occurs at both inflamed and non-inflamed sites in UC patients. The taxa showing altered abundance in UC patients might mediate colonic inflammation.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326348

  • 家族歴のない脊髄小脳失調症6型の遺伝学的解析

    藤岡竜太, 三浦史郎, 山田浩平, 柴田弘紀

    別府大学短期大学紀要   37   87 - 91   2018年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    電位依存性カルシウムチャネルα1Aサブユニット遺伝子であるCACNA1A遺伝子上にあるDNAの三塩基配列CAGリピートの異常伸長が脊髄小脳失調症6型(Spinocerebellar ataxia type 6: SCA6)の発症に関わることが知られている。SCA6の原因遺伝子であるCACNA1A遺伝子上ではCAGリピート数が健常者では4から19, 罹患者では21から33となる。また、SCA6は家族歴のある常染色体優性遺伝性の罹患者が多く、日本では優性遺伝性の脊髄小脳失調症の約30%を占めている。本研究では孤発性(非遺伝性)のSCA6の罹患者および両親の末梢血検体を使用し、遺伝学的解析によるCAGリピート異常から家族歴の遺伝性を検証した。結果としてSCA6の罹患者はCAGリピートの異常伸長(変異アレルでリピート数23)が認められた。さらに遺伝学的解析により両親とも健常であるが、おそらく父親由来の正常アレルから罹患者の変異アレルに表現促進現象が起こったのではないかと示唆された。これらのことから孤発性の症例でも遺伝学的解析により原因の究明ができる可能性が考えられる。

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329784

  • A new mutation of congenital methemoglobinemia exacerbated after methylene blue treatment. 査読 国際誌

    Fuminori Yamaji, Akio Soeda, Hiroki Shibata, #Takuya Morikawa, Kodai Suzuki, Shozo Yoshida, Shinji Ogura.

    Acute Med Surg.   5   199 - 201   2018年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Case: Methylene blue is useful for the treatment of methemoglobinemia. However, even after the patient’s methemoglobin (metHb)
    rate has improved, careful observation is important because they could have undiagnosed congenital methemoglobinemia. In this
    case, a 67-year-old man underwent gastrointestinal endoscopy with the use of lidocaine for local anesthesia. During the examination,
    he complained of dyspnea and had low SpO2 despite normal PaO2 and SaO2. He was transferred to our department as a suspected
    case of acquired methemoglobinemia.
    Outcome: The patient’s metHb level was 26.2%. We administered methylene blue i.v. and his metHb level subsequently decreased
    to 1.6%. However, his metHb level gradually increased to 18.2%, and we suspected that he had congenital methemoglobinemia. We
    administered riboflavin and ascorbic acid orally, and his metHb level decreased to 6.4%. We also obtained genomic DNA from the
    patient and identified a novel variant of CYB5R3.
    Conclusion: We report a novel variant of congenital methemoglobinemia that deteriorated after methylene blue treatment.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326344

  • DNA methylation of the Klf14 gene region on whole blood provide prediction for the chronic inflammation at the adipose tissue. 査読 国際誌

    #Chihiro Iwaya, Hidetoshi Kitajima, Ken Yamamoto, Yasutaka Maeda, Noriyuki Sonoda, Hiroki Shibata, Toyoshi Inoguchi.

    Biochem Biophys Res Commun.   497   908 - 915   2018年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Krüppel-Like Factor 14 (KLF14) gene, which appears to be a master regulator of gene expression in the adipose tissue and have previously been associated with BMI and Type 2 diabetes (T2D) by large genome-wide association studies. In order to find predictive biomarkers for the development of T2D, it is necessary to take epigenomic changes affected by environmental factors into account. This study focuses on ageing and obesity, which are T2D risk factors, and examines epigenetic changes and inflammatory changes. We investigated DNA methylation changes in the Klf14 promoter region in different organs of mice for comparing aging and weight. We found that methylation levels of these sites were increased with aging and weight in the spleen, the adipose tissue, the kidney, the lung, the colon and the whole blood cells. In addition, in the spleen, the adipose tissue and the whole blood, these epigenetic changes were also significantly associated with inflammatory levels. Moreover, not only Klf14, but also expression levels of some downstream genes were decreased with methylation in the spleen, the adipose tissue and the whole blood cells. Taken together, our results suggest that methylation changes of Klf14 in those tissues may be associated with changes in gene expression and inflammation on the adipose tissue of obesity and T2D. In addition, the methylation changes in the whole blood cells may serve as a predictive epigenetic biomarker for the development of T2D.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326347

  • Genome-wide DNA methylation analysis reveals hypomethylation in the low-CpG promoter regions in lymphoblastoid cell lines. 査読 国際誌

    #Itsuki Taniguchi, #Chihiro Iwaya, Keizo Ohnaka, Hiroki Shibata, Ken Yamamoto

    Hum Genomics.   11   8 - 8   2017年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: Epidemiological studies of DNA methylation profiles may uncover the molecular mechanisms through
    which genetic and environmental factors contribute to the risk of multifactorial diseases. There are two types of
    commonly used DNA bioresources, peripheral blood cells (PBCs) and EBV-transformed lymphoblastoid cell lines (LCLs),
    which are available for genetic epidemiological studies. Therefore, to extend our knowledge of the difference in DNA
    methylation status between LCLs and PBCs is important in human population studies that use these DNA sources to
    elucidate the epigenetic risks for multifactorial diseases. We analyzed the methylation status of the autosomes for 192
    and 92 DNA samples that were obtained from PBCs and LCLs, respectively, using a human methylation 450 K array.
    After excluding SNP-associated methylation sites and low-call sites, 400,240 sites were subjected to analysis using a
    generalized linear model with cell type, sex, and age as the independent variables.
    Results: We found that the large proportion of sites showed lower methylation levels in LCLs compared with PBCs,
    which is consistent with previous reports. We also found that significantly different methylation sites tend to be located
    on the outside of the CpG island and in a region relatively far from the transcription start site. Additionally, we
    observed that the methylation change of the sites in the low-CpG promoter region was remarkable. Finally, it was
    shown that the correlation between the chronological age and ageing-associated methylation sites in ELOVL2 and
    FHL2 in the LCLs was weaker than that in the PBCs.
    Conclusions: The methylation levels of highly methylated sites of the low-CpG-density promoters in PBCs decreased
    in the LCLs, suggesting that the methylation sites located in low-CpG-density promoters could be sensitive to
    demethylation in LCLs. Despite being generated from a single cell type, LCLs may not always be a proxy for DNA from
    PBCs in studies of epigenome-wide analysis attempting to elucidate the role of epigenetic change in disease risks.
    Keywords: DNA methylation, Lymphoblastoid cell lines, Epigenome-wide analysis, Epigenetic epidemiology, Human
    methylation array

    DOI: 10.1186/s40246-017-0106-6

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326341

  • Unverricht-Lundborg病検体を使用したPCRによるCSTB(Cystatin B)遺伝子の異常リピートの検討

    藤岡竜太, 三浦史郎, #青木浩介, 本岡大道, 柴田弘紀

    別府大学短期大学紀要   36   71 - 75   2017年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    CSTB(Cystatin B)遺伝子の異常リピートにより引き起こされる進行性ミオクローヌスてんかんの一病型であるウンフェルリヒト・ルントボルク病(Unverricht-Lundborg disease:ULD)の可能性のある検体の遺伝子解析研究である。進行性ミオクローヌスてんかんの中でCSTB(Cystatin B)遺伝子のリピート異常が原因の疾患はULDとして知られている。ULDを調べるために放射性同位体(Radioisotope:RI)を使用したサザンブロッティングによる解析が行われる。そこで本研究では、簡便なポリメラーゼ連鎖反応(Polymerase chain reaction: PCR)を使用してCSTBの異常リピートの検出を試み、診断手法の確立およびULDの診断に寄与できないか検討した。PCRの結果、健常者と比較して患者では異常リピートと考えられるDNA増幅を確認したがサンガーシークエンスによる配列確認により異常リピートではなく、別の配列の挿入が示唆される結論に至った。

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329781

  • Structural comparison and evolution of filaggrin gene within primates. 査読 国際誌

    Vanessa Romero, Kazuyoshi Hosomichi, Hiroki Shibata, Hirofumi Nakaoka, Ituro Inoue

    BMC Evol Biol.   17 ( 1 )   10 - 10   2017年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: The evolutionary dynamics of repeat sequences is quite complex, with some duplicates never
    having differentiated from each other. Two models can explain the complex evolutionary process for repeated
    genes—concerted and birth-and-death, of which the latter is driven by duplications maintained by selection.
    Copy number variations caused by random duplications and losses in repeat regions may modulate molecular
    pathways and therefore affect phenotypic characteristics in a population, resulting in individuals that are able to
    adapt to new environments. In this study, we investigated the filaggrin gene (FLG), which codes for filaggrin—an
    important component of the outer layers of mammalian skin—and contains tandem repeats that exhibit copy
    number variation between and within species. To examine which model best fits the evolutionary pathway for
    the complete tandem repeats within a single exon of FLG, we determined the repeat sequences in crab-eating
    macaque (Macaca fascicularis), orangutan (Pongo abelii), gorilla (Gorilla gorilla), and chimpanzee (Pan troglodytes)
    and compared these with the sequence in human (Homo sapiens).
    Results: In this study we compared concerted and birth-and-death evolution models, commonly used for gene
    copies. We found that there is high nucleotide diversity between filaggrin repeat regions, which fits the birth-anddeath
    model. Phylogenetic analyses also suggested that independent duplication events created the repeat sequences
    in crab-eating macaques and orangutans, while different duplication and loss events created the repeats in gorillas,
    chimpanzees, and humans. Comparison of the repeat sequences detected purifying selection within species and
    lineage-specific duplications across species. We also found variation in the length of the repeated region within
    species such as chimpanzee and crab-eating macaque.
    Conclusions: We conclude that the copy number variation in the repeat sequences of FLG between primates
    may be a consequence of species-specific divergence and expansion.
    Keywords: Filaggrin, Copy number variation, Birth-and-death evolution, Duplication/loss

    DOI: 10.1186/s12862-016-0851-5.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326340

  • SPTBN2にミスセンス変異を認めた脊髄小脳失調症

    藤岡竜太, 三浦史郎, 貴田浩志, 柴田弘紀

    別府大学短期大学紀要   35   11 - 16   2016年2月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)  

    本研究は、日本人の脊髄小脳失調症 (Spinocerebellar ataxia: SCA)症例の遺伝解析研究である。本症例は臨床的にSCAタイプ5に矛盾せず、頭部MRI画像では小脳萎縮が認められ、脳幹は保たれていた。遺伝学的解析により、SCA5の原因遺伝子であるβ-IIIスペクトリン遺伝子(SPTBN2)の新規非同義変異(c.924 G>C, p. E308D)が認められた。その遺伝子は細胞骨格たんぱく質をコードして 11番染色体に位置しており、E308Dの変異はホットスポットに局在していた。日本人健常者507人を検討した結果、9人が同様の変異を有していた。したがって、SCA5の責任遺伝子内のミスセンス変異であるE308Dが責任変異ではない可能性が示唆された。

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7329773

  • The finding of a group IIE phospholipase A2 gene in a specified segment of Protobothrops flavoviridis genome and its possible evolutionary relationship to group IIA phospholipase A2 genes. 査読 国際誌

    #Kazuaki Yamaguchi, Takahito Chijiwa, Naoki Ikeda, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki, Naoko Oda-Ueda, Shosaku Hattori, Motonori Ohno

    Toxins   6   3471 - 3487   2014年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/toxins6123471

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326138

  • Diversity in the matrix structure of eggshells in the testudines (reptilia). 査読 国際誌

    Satoshi Kusuda, Yuichirou Yasukawa, Hiroki Shibata, Tomomi Saito, Osamu Doi, Yutaka Ohya, Norio Yoshizaki

    Zoolog Sci.   30 ( 5 )   2013年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The eggshells of 56 chelonians were examined by electron microscopy and X-ray diffractometry. They were classified into six types in terms of the matrix structure of their calcareous layer; type I was composed of a thin calcareous layer with minerals in an amorphous structure; type II with shell units composed of mammillary cores calcified with aragonite crystals; type III with shell units composed of mammillary cores, plus a single palisade layer also calcified with aragonite crystals, and with each shell unit separated; type IV with shell units the same as type III, but tightly packed together; type V with shell units composed of mammillary cores plus two palisade layers; and type VI with a cuticle layer calcified with calcite crystals over the same structure as that of type V. X-ray diffraction analyses at the outer surface of eggshells showed a gradual change in crystal disposition from the random disposition of type II to the single direction-oriented disposition of type V. The shell height was approximately parallel to the development of the palisade-layer matrix. The limiting membrane of all eggshell types was perforated with canals and that of type I was partially missing. Type I had a parchment shell, types II and III had a pliable shell (some were rigid) and types IV to VI had rigid shells. The present study showed that the hardness of eggshells can be determined by the composition of the shell matrices, as shell matrices are the framework for mineralization.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326132

  • Crohn’s disease risk alleles on the NOD2 locus have been maintained by natural selection on standing variation. 査読 国際誌

    #Shigeki Nakagome, Shuhei Mano, Lukasz Kozlowski, Janusz M. Bujnicki, Hiroki Shibata, Yasuaki Fukumaki, Judith R. Kidd, Kenneth K. Kidd, Shoji Kawamura, Hiroki Oota

    Mol Biol Evol.   156 ( 7 )   2012年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Risk alleles for complex diseases are spread widely throughout human populations. However, little is known about the geographic distribution of risk allele frequencies, which may contribute to geographic differences in disease susceptibility and prevalence. Here we focus on Crohn’s disease (CD) as a model for the evolutionary study of complex disease alleles. Recent genome-wide association studies and classical linkage analyses have identified more than 70 susceptible genomic regions for CD in Europeans, but only a few have been confirmed in non-European populations. Our analysis of eight European-specific susceptibility genes using HapMap data shows that at the NOD2 locus the CD-risk alleles are linked with a haplotype specific to CEU at a frequency that is significantly higher compared to the entire genome. We subsequently examined nine global populations and found that the CD-risk alleles spread through hitchhiking with a high-frequency haplotype (H1) exclusive to Europeans. To examine the neutrality of NOD2, we performed phylogenetic network analyses, coalescent simulation, protein structural prediction, characterization of mutation patterns, and estimations of population growth and time to most recent common ancestor (TMRCA). We found that while H1 was significantly prevalent in European populations, the H1 TMRCA predated human migration out of Africa. H1 is likely to have undergone negative selection because (i) the root of H1 genealogy is defined by a pre-existing amino acid substitution that causes serious conformational changes to the NOD2 protein, (ii) the haplotype has almost become extinct in Africa, and (iii) the haplotype has not been affected by the recent European expansion reflected in the other haplotypes. Nevertheless, H1 has survived in European populations, suggesting that the haplotype is advantageous to the populations. We propose that several CD-risk alleles, which destabilize and disrupt the NOD2 protein, have been maintained by natural selection on standing variation because the deleterious haplotype of NOD2 is advantageous in diploid individuals due to heterozygote advantage and/or intergenic interactions.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326126

  • Positive association of phencyclidine-responsive genes, PDE4A and PLAT, with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Xiangdong Deng, #Hiromi Takaki, #Lixiang Wang, Tosihide Kuroki, Tatsuo Nakahara, Kijiro Hashimoto, Hideaki Ninomiya, Tadao Arinami, Toshiya Inada, Hiroshi Ujike, Masanari Itokawa, Mamoru Tochigi, Yuichiro Watanabe, Toshiyuki Someya, Hiroshi Kunugi, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki

    Am J Med Genet Neuropsychiatr Genet.   156 ( 7 )   850 - 858   2011年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spastic paraplegia type 4 (SPG4) is the most common autosomal dominant hereditary SPG caused by mutations in the SPAST gene. We studied the four- generation pedigree of a Japanese family with autosomal dominant hereditary SPG both clinically and genetically. Twelve available family members (ten affected; two unaffected) and two spouses were enrolled in the study. The clinical features were hyperreflexia in all four limbs, spasticity of the lower extremities, impaired vibration sense, mild cognitive impairment confirmed by the Wechsler Adult Intelligence Scale—Third Edition, and peripheral neuropathy confirmed by neurophysiological examinations. All four female patients experienced miscarriages. The cerebrospinal fluid tau levels were mildly increased in two of three patients examined. Linkage analyses revealed the highest logarithm of odds score of 2.64 at 2p23-p21 where the SPAST gene is located. Mutation scanning of the entire exonic regions of the SPAST gene by direct sequencing revealed no mutations. Exonic copy number analysis by real- time quantitative polymerase chain reaction revealed hetero- zygous deletion of exons 1 to 4 of the SPAST gene. Breakpoint analysis showed that the centromeric breakpoint was located within intron 4 of SPAST while the telomeric breakpoint was located within intron 3 of the neighboring DPY30 gene, causing a deletion of approximately 70 kb ranging from exons 1 to 3 of DPY30 to exons 1 to 4 of SPAST. To our knowledge, this is the first report of SPG4 associated with partial deletions of both the SPAST and DPY30 genes. The partial heterozygous deletion of DPY30 could modify the phenotypic expression of SPG4 patients with this pedigree.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326125

  • Partial SPAST and DPY30 deletions in a Japanese spastic paraplegia type 4 family. 査読 国際誌

    Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Hiroshi Kida, Kazuhito Noda, Takayuki Toyama, Naoka Iwasaki, Akiko Iwaki, Mitsuyoshi Ayabe, Hisamichi Aizawa, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki.

    Neurogenetics   12 ( 1 )   25 - 31   2010年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Spastic paraplegia type 4 (SPG4) is the most common autosomal dominant hereditary SPG caused by mutations in the SPAST gene. We studied the four- generation pedigree of a Japanese family with autosomal dominant hereditary SPG both clinically and genetically. Twelve available family members (ten affected; two unaffected) and two spouses were enrolled in the study. The clinical features were hyperreflexia in all four limbs, spasticity of the lower extremities, impaired vibration sense, mild cognitive impairment confirmed by the Wechsler Adult Intelligence Scale—Third Edition, and peripheral neuropathy confirmed by neurophysiological examinations. All four female patients experienced miscarriages. The cerebrospinal fluid tau levels were mildly increased in two of three patients examined. Linkage analyses revealed the highest logarithm of odds score of 2.64 at 2p23-p21 where the SPAST gene is located. Mutation scanning of the entire exonic regions of the SPAST gene by direct sequencing revealed no mutations. Exonic copy number analysis by real- time quantitative polymerase chain reaction revealed hetero- zygous deletion of exons 1 to 4 of the SPAST gene. Breakpoint analysis showed that the centromeric breakpoint was located within intron 4 of SPAST while the telomeric breakpoint was located within intron 3 of the neighboring DPY30 gene, causing a deletion of approximately 70 kb ranging from exons 1 to 3 of DPY30 to exons 1 to 4 of SPAST. To our knowledge, this is the first report of SPG4 associated with partial deletions of both the SPAST and DPY30 genes. The partial heterozygous deletion of DPY30 could modify the phenotypic expression of SPG4 patients with this pedigree.

    その他リンク: http://www.springerlink.com/content/d87437661v732711/

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326123

  • Association analysis of the glutamic acid decarboxylase 2 and the glutamine synthetase genes (GAD2, GLUL) with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Shinsaku Arai, Hiroki Shibata, Mayumi Sakai, Hideaki Ninomiya, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki.

    Psychiatric Genet.   19 ( 1 )   6 - 13   2009年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326097

  • Hereditary motor and sensory neuropathy with proximal dominancy in the lower extremities, urinary disturbance, and paroxysmal dry cough. 査読 国際誌

    #Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Hiroshi Kida, Kazuhito Noda, Ken Yamamoto, Akiko Iwaki, Mitsuyoshi Ayabe, Hisamichi Aizawa, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki

    J Neurol Sci.   273 ( 1-2 )   88 - 92   2008年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We studied a four-generation pedigree of a Japanese family with hereditary neuropathy to elucidate the genetic basis of this disease. Twelve members of the family were enrolled in this study. The clinical features were neurogenic muscle weakness with proximal dominancy in the lower extremities, sensory involvement, areflexia, fine postural tremors, painful muscle cramps, elevated creatine kinase levels, recurrent paroxysmal dry cough, and neurogenic bladder. We performed a genome-wide search using genetic loci spaced at about 13 Mb intervals. Although nine chromosomes (1, 3, 4, 5, 6, 10, 17, 19, and 22) had at least one region in which the logarithm of odds (LOD) score was over 1.0, no loci fulfilled the criteria for significant evidence of linkage. Moreover, we analyzed an extra 14 markers on 3p12–q13 (the locus of hereditary motor and sensory neuropathy, proximal dominant form) and an extra five markers on 3p22–p24 (the locus of hereditary sensory neuropathy with chronic cough) and observed LOD scores of b−3 on both 3p12–q13 and 3p22–p24. Mutation scanning of the entire coding regions of the MPZ and PMP22 genes revealed no mutations. We conclude that the disorder described here is a newly classified hereditary motor and sensory neuropathy with autosomal dominant inheritance.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326092

  • Association study of polymorphisms in the neutral amino acid transporter genes SLC1A4, SLC1A5 and the glycine transporter genes SLC6A5, SLC6A9 with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Xiangdong Deng, #Noriaki Sagata, #Naoko Takeuchi, #Masami Tanaka, Hideaki Ninomiya, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki

    BMC Psychiatry   8 ( 1 )   2008年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: Based on the glutamatergic dysfunction hypothesis for schizophrenia pathogenesis, we have been performing systematic association studies of schizophrenia with the genes involved in glutametergic transmission. We report here association studies of schizophrenia with SLC1A4, SLC1A5 encoding neutral amino acid transporters ASCT1, ASCT2, and SLC6A5, SLC6A9 encoding glycine transporters GLYT2, GLYT1, respectively.
    Methods: We initially tested the association of 21 single nucleotide polymorphisms (SNPs) distributed in the four gene regions with schizophrenia using 100 Japanese cases-control pairs and examined allele, genotype and haplotype association with schizophrenia. The observed nominal significance were examined in the full-size samples (400 cases and 420 controls).
    Results: We observed nominally significant single-marker associations with schizophrenia in SNP2 (P = 0.021) and SNP3 (P = 0.029) of SLC1A4, SNP1 (P = 0.009) and SNP2 (P = 0.022) of SLC6A5. We also observed nominally significant haplotype associations with schizophrenia in the combinations of SNP2-SNP7 (P = 0.037) of SLC1A4 and SNP1-SNP4 (P = 0.043) of SLC6A5. We examined all of the nominal significance in the Full-size Sample Set, except one haplotype with insufficient LD. The significant association of SNP1 of SLC6A5 with schizophrenia was confirmed in the Full-size Sample Set (P = 0.018).
    Conclusion: We concluded that at least one susceptibility locus for schizophrenia may be located within or nearby SLC6A5, whereas SLC1A4, SLC1A5 and SLC6A9 are unlikely to be major susceptibility genes for schizophrenia in the Japanese population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325999

  • Heterozygous deletion of ITPR1, but not SUMF1 in spinocerebellar ataxia type 16. 査読 国際誌

    Akiko Iwaki, Yuji Kawano Y, #Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Dai Matsuse, Wei Li, Hirokazu Furuya, Yasumasa Ohyagi, Takayuki Taniwaki, Jun-ichi Kira, Yasuyuki Fukumaki

    J Med Genet.   45 ( 1 )   32 - 35   2008年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We have previously mapped autosomal dominant spinocerebellar ataxia (SCA) 16 to 3p26, overlapping with the locus of SCA15. Recently, partial deletions of ITPR1 and the neighbouring SUMF1 in the SCA15 and two additional families were reported. In the present study we determined the copy number of these genes by real time quantitative polymerase chain reaction (PCR) and found a heterozygous deletion of exons 1-48 of ITPR1, but not SUMF1 in SCA16. Breakpoint analysis revealed that the size of the deletion is 313,318 bp and the telomeric breakpoint is located in the middle of their intergenic region. Our data provide evidence that haploinsufficiency of ITPR1 alone causes SCA16 and SCA15.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326033

  • Association study of polymorphisms in the glutamate transporter genes SLC1A1, SLC1A3 and SLC1A6 with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Xiangdong Deng, Hiroki Shibata, #Naoko Takeuchi, #Shinako Rachi, Mayumi Sakai, Hideaki Ninomiya, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet.   144 ( 3 )   271 - 278   2007年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Based on the glutamatergic dysfunction hypothesis for schizophrenia pathogenesis, we have been performing systematic association studies of schizophrenia with the glutamate receptor and transporter genes. We report here association studies of schizophrenia with three glutamate transporter genes SLC1A1, SLC1A3, and SLC1A6 encoding the glutamate transporters EAAT3, EAAT1, and EAAT4, respectively. We initially performed the screening of the total 25 single nucleotide polymorphisms (SNPs) distributed in the three gene regions using 100 out of 400 Japanese cases and 100 out of 420 Japanese controls. After controlling the false discovery rate (FDR) at level 0.05, we observed significant associations of schizophrenia with a genotype of SNP4 (rs2097837, P = 0.007) and with haplotypes of SNP2-SNP5 (P = 7.5 x 10(-5)) and SNP3-SNP5 (P = 9.0 x 10(-4)) in the SLC1A6 region. The haplotype of SNP2-SNP5 of SLC1A6 even showed marginally significant association with the disease in the full-size sample (400 cases and 420 controls, P = 0.031). We concluded that at least one susceptibility locus for schizophrenia may be located within or nearby SLC1A6, whereas SLC1A1 and SLC1A3 are unlikely to be major susceptibility genes for schizophrenia in the Japanese population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326034

  • The CNTN4 locus at 3p26 is a candidate gene of SCA16 査読 国際誌

    #Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Hirokazu Furuya, Yasumasa Ohyagi, Manabu Osoegawa, Yasushi Miyoshi, Hiromi Matsunaga, #Atsushi Shibata, #Naoki Matsumoto, Akiko Iwaki, Takayuki Taniwaki, Kikuchi H, Jun-ichi Kira, Yasuyuki Fukumaki

    Neurology   67 ( 7 )   1236 - 1241   2006年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Objective: To identify of the gene responsible for the onset of spinocerebellar ataxia type 16 (SCA16). Methods: We reanalyzed the linkage of the original Japanese pedigree using updated information, including three additional subjects. We then screened all exons located in the critical region. Results: We reassigned the locus of SCA16 to 3p26.2-pter (maximum logarithm-of-odds score 􏰂 5.177) and identified only one point mutation (4,256C¡T) in the 3= untranslated region of the contactin 4 gene (CNTN4) on chromosome 3p26.2-26.3, which cosegregated with the disease. This mutation was not detected in 520 control subjects; moreover, we revised the phenotype of SCA16 from pure to complicated SCA. Conclusion: The contactin 4 gene (CNTN4) is associated with cerebellar degeneration in spinocerebellar ataxia type 16. Additional studies are necessary to prove 4,256C¡T to be a causative mutation.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7326080

  • Genome-wide high-density SNP linkage analysis of 236 Japanese families supports the existence of schizophrenia loci on chromosomes 1p, 14q and 20p. 査読 国際誌

    The Japanese Schizophrenia Sib-Pair Linkage Group (JSSLG).

    Am J Hum Genet.   77   937 - 944   2005年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The Japanese Schizophrenia Sib-Pair Linkage Group (JSSLG) is a multisite collaborative study group that was organ- ized to create a national resource for affected sib pair (ASP) studies of schizophrenia in Japan. We used a high- density single-nucleotide–polymorphism (SNP) genotyping assay, the Illumina BeadArray linkage mapping panel (version 4) comprising 5,861 SNPs, to perform a genomewide linkage analysis of JSSLG samples comprising 236 Japanese families with 268 nonindependent ASPs with schizophrenia. All subjects were Japanese. Among these families, 122 families comprised the same subjects analyzed with short tandem repeat markers. All the probands and their siblings, with the exception of seven siblings with schizoaffective disorder, had schizophrenia. After excluding SNPs with high linkage disequilibrium, we found significant evidence of linkage of schizophrenia to chromosome 1p21.2-1p13.2 (LOD p 3.39) and suggestive evidence of linkage to 14q11.2 (LOD p 2.87), 14q11.2- q13.2 (LOD p 2.33), and 20p12.1-p11.2 (LOD p 2.33). Although linkage to these regions has received little attention, these regions are included in or partially overlap the 10 regions reported by Lewis et al. that passed the two aggregate criteria of a meta-analysis. Results of the present study—which, to our knowledge, is the first genomewide analysis of schizophrenia in ASPs of a single Asian ethnicity that is comparable to the analyses done of ASPs of European descent—indicate the existence of schizophrenia susceptibility loci that are common to different ethnic groups but that likely have different ethnicity-specific effects.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7331664

  • Association Study of polymorphisms in synaptic vesicle-associated genes, SYN2 and CPLX2, with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Hee Jae Lee, Ji Young Song, Jong Woo Kim, Sheng-Yu Jin, Mi Suk Hong, Jin Kyoung Park, Joo-Ho Chung, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki

    Behav Brain Funct.   1   15   2005年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Background: The occurrence of aberrant functional connectivity in the neuronal circuit is one of the integrative theories of the etiology of schizophrenia. Previous studies have reported that the protein and mRNA levels of the synapsin 2 (SYN2) and complexin 2 (CPLX2) genes were decreased in patients with schizophrenia. Synapsin 2 and complexin 2 are involved in synaptogenesis and the modulation of neurotransmitter release. This report presents a study of the association of polymorphisms of SYN2 and CPLX2 with schizophrenia in the Korean population.
    Methods: Six single nucleotide polymorphisms (SNPs) and one 5-bp insertion/deletion in SYN2 and five SNPs in CPLX2 were genotyped in 154 Korean patients with schizophrenia and 133 control patients using direct sequencing or restriction fragment length polymorphism analysis. An intermarker linkage disequilibrium map was constructed for each gene.
    Results: Although there was no significant difference in the genotypic distributions and allelic frequencies of either SYN2 or CPLX2 polymorphisms between the schizophrenia and control groups, the two-way haplotype analyses revealed significant associations with the disease (P < 0.05 after Bonferroni correction). The three-way haplotype analyses also revealed a significant association of SYN2 with schizophrenia (P < 0.001 after Bonferroni correction).
    Conclusion: These results suggest that both SYN2 and CPLX2 may confer susceptibility to schizophrenia in the Korean population.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325991

  • Structure and polymorphisms of the human metabotropic glutamate receptor type 2 gene (GRM2): analysis of association with schizophrenia. 査読 国際誌

    #Akiko Joo, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Hiroaki Kawasaki, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    Mol Psychiatry.   6 ( 2 )   186 - 192   2001年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Metabotropic glutamate receptors (mGluRs) belong to the class of GTP-binding protein coupled receptors and consist of eight different subtypes. The subtype 2 metabotropic glutamate receptor (mGluR2) gene (GRM2) is one of the possible candidate genes for schizophrenia. Phencyclidine (PCP)-induced increase in glutamate efflux and schizophrenia-like behavioral abnormalities were reduced by pretreatment of the mGluRII agonist LY354740 in rats and its effects are mediated via mGluR2. To evaluate involvement of the mGluR2 gene in the pathogenesis of schizophrenia, we isolated the human mGluR2 gene and determined the transcription initiation site, the entire nucleotide sequence and the chromosomal localization. The hmGluR2 gene spans 13 kb with six exons, including one non-coding exon. The gene was mapped to chromosome 3 p12-p11 by Radiation Hybrid Panel analysis. We screened polymorphisms in the coding exons of the mGluR2 gene, using the SSCP procedure. The thirteen polymorphisms identified included ten missense, one silent mutation and two one-base substitutions in the 5'-untranslated region. We genotyped 213 Japanese schizophrenics and 220 controls to study the association of polymorphisms in the mGluR2 gene with schizophrenia. As we found no statistically significant differences in allele frequencies of each polymorphism, these polymorphisms apparently do not play a major role in schizophrenia.

    DOI: 10.1038/sj.mp.4000841

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325658

  • Association analysis of polymorphisms in the upstream region of the human dopamine D4 receptor gene (DRD4) with schizophrenia and personality traits. 査読 国際誌

    #Hiroshi Mitsuyasu, #Naotsugu Hirata, #Yasuyoshi Sakai, Hiroki Shibata, Yasuhiko Takeda, Hideaki Ninomiya, Hiroaki Kawasaki, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    J Hum Genet.   46 ( 1 )   26 - 31   2001年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The human dopamine D4 receptor (DRD4) is of major interest in molccular studies of schizophrenia and personality traits. We examined the association of schizophrenia and polymorphisms in the upstream region of the DRD4 gene (-768G>A in the negative modulator region; -521C>T, -376C >T, and -291C>T in the cell type-specific promoter region; and -616C>G between the two regions) in 208 schizophrenic patients and 210 normal controls. No significant difference in genotype and allele frequencies was observed between the two groups, indicating that these polymorphisms do not make a major contribution to the pathogenesis of schizophrenia. We also studied the association of polymorphisms in the upstream region and a 48-bp repeat polymorphism in exon III of the DRD4 gene with personality traits in 173 Japanese individuals who completed the temperament and character inventory (TCI). The -768G>A polymorphism was significantly associated with reward dependence (P= 0.044), while no significant association was observed between novelty seeking and polymorphisms in the upstream region or the exon III repeat polymorphism of the DRD4 gene.

    DOI: 10.1007/s100380170120

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325700

  • The ortholog of human ataxin-2 is essential for early embryonic patterning in C. elegans. 査読 国際誌

    Tim-Rasmus Kiehl, Hiroki Shibata, Stefan-M. Pulst

    J Mol Neurosci.   15 ( 3 )   231 - 241   2000年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Ataxin-2, the gene product of the human spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) gene, is a protein of unknown function. Ataxin-2 interacts with ataxin-2-binding-protein 1 (A2BP1), a member of a novel family of putative RNA-binding proteins. Because the sequences of ataxin-2 and A2BP1 are evolutionarily conserved, we investigated functional aspects and expression pattern in the nematode Caenorhabditis elegans. Human ataxin-2 has 20.1% amino acid identity and 43.9% similarity to its C. elegans ortholog, designated ATX-2, that encodes a predicted 1026 aa protein. One of the worm orthologs of human A2BP1 is the numerator element FOX-1, with an overall 29.8% aa identity. We studied the expression pattern of atx-2 using the endogenous promotor coupled with a GFP expression vector. Atx-2 was widely expressed in the adult worm with strong expression in muscle and nervous tissue. It was also heavily expressed in the embryo. In order to elucidate the function of atx-2 and fox-1, we conducted RNA interference (RNAi) studies. The interfering dsRNA was introduced into larval L4 stage worms of the N2 strain by microinjection or soaking. DsRNA representing the full-length atx-2 gene resulted in arrested embryonic development in the offspring of all 58 microinjected worms. Nomarski imaging showed embryos in different stages of developmental arrest, indicating an essential role of atx-2 for early embryonic development. When fox-1 was targeted by RNAi, there was a marked reduction in the number of eggs per worm. The results presented here underline previous findings about the interaction of human ataxin-2 and A2BP1.

    DOI: 10.1385/JMN:15:3:231

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7325621

  • Molecular analysis of a-thalassemia in Nepal: correlation with malaria endemicity. 査読 国際誌

    #Yasuyoshi Sakai, Shigeru Kobayashi, Hiroki Shibata, Hiroyasu Furuumi, Toshiyasu Endo, Supan Fucharoen, Shinjiro Hamano, Gopal P. Acharya, Terukazu Kawasaki, Yasuyuki Fukumaki

    J Hum Genet.   45 ( 3 )   127 - 132   2000年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Thalassemia is a prevalent hereditary disorder characterized by impaired synthesis of globin chains. It has been suggested that the high frequency of thalassemia might reflect heterozygote advantage due to reduced susceptibility to malaria. In Nepal, malaria has often occurred in places below the altitude of 1,200m. We carried out a microepidemiological study on thalassemia in two neighboring populations in Nepal, the Danuwar and the Tamang. Settlements of the Danuwar are located below the limit of the malarial zone (1,200m in altitude), whereas those of the Tamang are found in malaria-free uplands. Three heterozygotes for hemoglobin E (HbE) were observed in the Danuwars. We detected one type (-alpha3.71) of alpha+-thalassemia that involves a deletion of 3.7kb, leading to a loss of one of two alpha-globin genes, in the Danuwars, at a high gene frequency of 63%, while the gene frequency in the Tamangs was only 5%. Analysis of the alpha-globin gene cluster revealed that four different haplotypes were associated with the type of alpha+-thalassemia in the Danuwars. Nucleotide sequences of the D-loop region in the mitochondrial DNA of the two populations indicated a similar nucleotide diversity in each population. The fixation index, FST, representing the degree of genetic differentiation estimated from mitochondrial DNA diversities (FST, 0.05), was smaller than that obtained from the gene frequencies of alpha-thalassemia (FST, 0.55). If we assume neutral molecular evolution in the D-loop region of mitochondrial DNA, these results suggest that the high frequency of alpha+-thalassemia may be due to biological adaptation to the malarial environment rather than to events such as a bottleneck.

    DOI: 10.1007/s100380050198

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7182011

  • A high resolution PAC and BAC map of the SCA2 region. 査読 国際誌

    #Tamilla Nechiporuk, #Alex Nechiporuk, Soodabeh Sahba, Karla Figueroa, Hiroki Shibata, Xiao-Ning Chen, Julie R. Korenberg, Pieter de Jong, Stefan-M. Pulst

    Genomics   1997年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The spinocerebellar ataxia type 2 (SCA2) gene has been localized to chromosome 12q24.1. To characterize this region and to aid in the identification of the SCA2 gene, we have constructed a 3.9-Mb physical map, which covers markers D12S1328 and D12S1329 known to flank the gene. The map comprises a contig of 84 overlapping yeast artificial chromosomes (YACs), P1 artificial chromosomes (PACs), and bacterial artificial chromosomes (BACs) onto which we placed 82 PCR markers. We localized eight genes and expressed sequence tags on this map, many of which had not been precisely mapped before. In contrast to YACs, which showed a high degree of chimerism and deletions in this region, PACs and BACs were stable. Only 1 in 65 PACs contained a small deletion, and 2 in 18 BACs were chimeric. The high-resolution physical map, which was used in the identification of the SCA2 gene, will be useful for the positional cloning of other disease genes mapped to this region.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7178702

  • Molecular evolution of the 5'-flanking regions of the duplicated Amy genes in Drosophila melanogaster species subgroup. 査読 国際誌

    #Eisaku Okuyama, #Hiroki Shibata, Hidenori Tachida, Tsuneyuki Yamazaki

    Mol Biol Evol.   13 ( 4 )   574 - 583   1996年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The nucleotide sequences of the 5'-flanking regions of the duplicated Amy genes in eight sibling species belonging to the melanogaster species subgroup are analyzed. In Drosophila melanogaster, a region of about 450 bp immediately upstream of the translation initiation site of the two paralogous genes (the proximal and distal genes) has sequence similarities. However, we could not detect any significant sequence similarity in the region more upstream than -450. This result indicates that the coding regions of the ancestral Amy gene were duplicated together with 450 bp of the 5'-flanking region as one unit. Multiple alignment of these 450-bp sequences in the proximal and distal genes of all eight species revealed a mosaic pattern of highly conserved and divergent regions. The conserved regions included almost all the putative regulatory elements identified in previous analyses of the sequences. A phylogenetic analysis of the aligned sequences shows that these 450-bp sequences are clustered into the proximal and the distal groups. As a whole, the divergence between groups in this region is very large in contrast to that in the coding regions. Based on the divergence between groups, the 450-bp region is divided into two subregions. We found that the ratios of the divergence between groups to that within groups differ in the two subregions. From these observations, we discuss a possibility of positive selection acting on the subregion immediately upstream of the Amy coding region to cause divergence of regulatory elements of the paralogous genes.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7178701

  • Evolutionary relationship and sequence variation of a-amylase variants encoded by duplicated genes in the Amy locus of Drosophila melanogaster. 査読 国際誌

    #Nobuyuki Inomata, #Hiroki Shibata, #Eisaku Okuyama, Tsuneyuki Yamazaki

    Genetics   141 ( 1 )   237 - 244   1995年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    To infer the genealogical relationships of alpha-amylase electromorphs of Drosophila melanogaster, we determined the nucleotide sequences of a collection of electromorphs sampled throughout the world. On average there were 1.0 amino acid substitutions between identical electromorphs and 3.9 between different electromorphs, respectively. We found that the evolution of AMY1 through AMY6 electromorphs occurred by sequential accumulation of single amino acid substitutions each causing one charge difference. The nucleotide diversities at synonymous sites within Amy1,Amy2,Amy3,Amy4 and Amy6 were 0.0321, 0.0000, 0.0355, 0.0059 and 0.0030, respectively. We also obtained evidence of genetic exchanges, such as intrachromosomal recombination, interchromosomal recombination or gene conversion, between the two duplicated Amy genes as well as among the alleles.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7177979

  • A comparative study of the enzymological features of a-amylase in the Drosophila melanogaster species subgroup. 査読 国際誌

    #Hiroki Shibata, Tsuneyuki Yamazaki

    Jpn J Genet.   69 ( 3 )   251 - 258   1994年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A comparative study was done on the enzymological features of alpha-amylase among six sibling species belonging to the Drosophila melanogaster species subgroup. The pH optima were 7.6 for D. melanogaster, D. mauritiana and D. simulans and 7.4 for D. erecta, D. teissieri and D. yakuba. The temperature optima were commonly 37 C in all species studied. However, there are two types of temperature dependence; a strict one as observed in D. melanogaster, D. mauritiana and D. simulans, and a flat one as observed in D. erecta, D. teissieri and D. yakuba. These separations are consistent with the general phylogeny within this species subgroup. The substrate dependence was almost the same in all the species studied. The Vmax and Km were also estimated for each species. We found clear differences in the enzymological features between the species. Thus these differences might reflect an adaptation of the amylase enzyme system to speciation in this species subgroup.

    DOI: 10.1266/jjg.69.251

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7177978

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書籍等出版物

  • Venomics study of Protobothrops flavoviridis snake: Habu snake venomics: How venom proteins have evolved?

    Tomohisa Ogawa, Hiroki Shibata(担当:共著)

    IntechOpen  2020年4月 

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    記述言語:英語   著書種別:学術書

    Venomics projects have been conducted to disclose the divergent profiles and evolution of various venomous animals. Here, we describe the venomics project including genome and transcriptome of Habu snake leading to drug discovery.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7332369

  • 毒ヘビ全書

    田原義太慶, 柴田弘紀, 友永達也(担当:共著)

    グラフィック社  2020年2月 

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    担当ページ:ISBN 978-4-76613-313-4   記述言語:日本語   著書種別:一般書・啓蒙書

  • 大蛇全書

    田原義太慶, 柴田弘紀, 友永達也(担当:共著)

    グラフィック社  2022年3月 

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    担当ページ:ISBN 978-4766135589.   記述言語:日本語   著書種別:一般書・啓蒙書

  • 大蛇全書

    田原 義太慶, 友永 達也, 柴田 弘紀

    グラフィック社  2022年    ISBN:9784766135589

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    記述言語:日本語  

    CiNii Books

  • Proteomic analysis of venomous fang matrix proteins of Protobothrops flavoviridis (Habu) snake. In: Endo K, Kogure T, Nagasawa H. (eds) Biomineralization: From Molecular and Nano-structural Analyses to Environmental Science.

    Tomohisa Ogawa, Asa Sekikawa, Hajime Sato, Koji Muramoto, Hiroki Shibata, Shosaku Hattori(担当:共著)

    Springer Nature, Singapore (2018).  2018年10月 

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    記述言語:英語   著書種別:学術書

    Venomous animals have specialized venom delivery apparatus such as nematocysts, stings, and fangs in addition to the poisonous organs consisting venom gland or sac, which produce and stock the venom. Snake is one of the major venomous animals, of which fangs are connected to the venom gland to inject the venom into prey. Snake’s venomous fangs showed the unique characteristics including mechanical strength and chemical stability. Especially, Protobothrops flavoviridis (habu) snake fangs showed the resistance against its venom digestive proteases, whereas the bones and teeth of mouse were completely digested in the gastrointestinal tract, although habu fangs were also drawn into the body with the prey. These observations suggest that structural differences exist between venomous fangs and mammalian bones and teeth. In this study, to reveal the molecular properties of venomous snake fangs, the matrix proteins of P. flavoviridis (habu) snake venom fang were analyzed by using proteomics experiments using 2D-PAGE and TOF MS/MS analyses. As a result, several biomineralization-related proteins such as vimentin, tectorin, adaptin, and collagen were identified in the venomous fang matrix proteins. Interestingly, the inhibitory proteins against venomous proteins such as metalloproteinase and PLA2 were also identified in fang’s matrix proteins.

    リポジトリ公開URL: https://hdl.handle.net/2324/7332364

  • ヒトは病気とともに進化した

    柴田 弘紀(担当:共著)

    勁草書房  2013年12月 

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    担当ページ:ヒトは病気とともに進化した(長谷川真理子、太田博樹編)(「第七章: ヒトらしさの起源」の執筆を担当)   記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • 医学大辞典

    柴田弘紀(担当:共著)

    医学書院  2003年2月 

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    担当ページ:医学大辞典 伊藤正男、井村裕夫、高久史麿 総編集 3項目   記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • 未知遺伝子多型の検索法

    柴田弘紀、服巻保幸(担当:共著)

    医薬ジャーナル社  2001年9月 

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    担当ページ:薬物動態・作用と遺伝子多型 澤田康文他編、pp74-86   記述言語:日本語   著書種別:学術書

  • 新女性医学体系第28巻 遺伝の基礎と臨床

    柴田弘紀、服巻保幸(担当:共著)

    中山書店  2000年5月 

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    担当ページ:新女性医学体系第28巻 遺伝の基礎と臨床 DNA・遺伝子診断の基礎 PCR法大濱紘三編、pp81-89   記述言語:日本語   著書種別:学術書

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講演・口頭発表等

  • Ddhd1 knockout mouse as a model for familial spastic paraplegia. 国際会議

    #Takuya Morikawa, Hiroaki Ohishi, #Kengo Kosaka, #Tomofumi Shimojo, #Akihiro Nagano, Itsuki Taniguchi, @Ryuta Fujioka, @Kosei Moriyama, Motoko Unoki, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, @Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    70th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2020年10月 

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    開催年月日: 2020年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • A nonsense variant in the ARSD gene associated with young-onset Parkinson’s disease. 国際会議

    Shiroh Miura, Tomofumi Shimojo, Ryuta Fujioka, Yusuke Uchiyama, Hiroki Shibata

    The European Human Genetics Conference 2020  2020年6月 

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    開催年月日: 2020年6月

    記述言語:英語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:Berlin (virtual conference)   国名:ドイツ連邦共和国  

  • ハブベノミクス研究:多様な毒タンパク質は、どのように生み出されるのか?

    小川智久、上田直子、千々岩崇仁、佐藤矩行、柴田弘紀

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    開催年月日: 2019年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Ddhd1 knockout mice as a model for familial spastic paraplegia.

    Takuya Morikawa, Shiroh Miura, Hiroaki Ohishi, Kengo Kosaka, Tomofumi Shimojo, Akihiro Nagano, Ryuta Fujioka, Kosei Moriyama, Motoko Unoki, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, Hiroki Shibata

    日本人類遺伝学会第64回大会  2019年11月 

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    開催年月日: 2019年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎   国名:日本国  

  • Diversity and evolution of venom protein genes of a Japanese endemic pit viper, habu, Protobothrops flavoviridis. 招待 国際会議

    Hiroki Shibata

    The 1st NUS-FU-KU Joint Symposium on Biochemistry in FUKUOKA  2019年10月 

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    開催年月日: 2019年10月

    記述言語:英語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:Fukuoka, Fukuoka   国名:日本国  

  • Habu snake (Protobothrops flavoviridis) genome study: Genomic architecture implicated in the multiplication and accelerated evolution of venom protein.v 国際会議

    Hiroki Shibata H, Naoko Oda-Ueda, Takahito Chijiwa, Hitomi Nakamura, Kazuaki Yamaguchi, Shosaku Hattori, Kazumi Matsubara, Yoichi Matsuda, Ryo Koyanagi, Yasuyuki Fukumaki, Motonori Ohno, Eiichi Shoguchi, Noriyuki Satoh, Tomohisa Ogawa

    EMBO/EMBL Symposium: Systems Genetics: From Genomes to Complex Traits  2019年9月 

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    開催年月日: 2019年9月 - 2019年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Heidelberg   国名:ドイツ連邦共和国  

  • Identification of non-venom protein genes highly expressed in the venom gland of habu (Protobothrops flavoviridis) and their potential contribution to the quality control of venom proteins. 国際会議

    Akiko Isomoto, Kanako Hisata, Jun Inoue, Eiichi Shoguchi, Noriyuki Satoh, Tomohisa Ogawa, Hiroki Shibata

    20th World Congress of the International Society of Toxinology  2019年9月 

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    開催年月日: 2019年9月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Buenos Aires   国名:アルゼンチン共和国  

  • Genetic analysis of autosomal dominant motor and sensory neuropathy with proximal dominancy in the lower extremities, urinary disturbance, and paroxysmal dry cough. 国際会議

    Shiroh Miura, Kengo Kosaka, Ryuta Fujioka, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    The European Human Genetics Conference 2019  2019年6月 

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    開催年月日: 2019年6月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Gothenburg   国名:スウェーデン王国  

  • Ddhd1 knockout mouse as a model for familial spastic paraplegia. 国際会議

    Takuya Morikawa, Shiroh Miura, Hiroaki Ohishi, Kengo Kosaka, Tomofumi Shimojo, Akihiro Nagano, Ryuta Fujioka, Kosei Moriyama, Motoko Unoki, Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, Hiroki Shibata

    The European Human Genetics Conference 2019  2019年6月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年6月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Gothenburg   国名:スウェーデン王国  

  • Whole genome sequencing of a Japanese endemic pit viper, habu, Protobothrops flavoviridis reveals accelerated evolution of venom protein genes enriched in microchromosomal regions. 招待 国際会議

    Hiroki Shibata

    Integrative Organismal Biology Symposium: Integrating Structural Biology with ‘Omics in Asia-Pacific’  2019年6月 

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    開催年月日: 2019年6月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:National Tsing Hua University, Hsinchu   国名:台湾  

  • ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定から明らかになった毒液関連遺伝子群の多重化および加速進化と染色体構造との関係.

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 小田-上田直子, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 小柳亮, 竹内猛, 服巻保幸, 大野素徳, 将口栄一, 久田香奈子, 佐藤矩行, 小川智久

    日本爬虫両棲類学会第57回大会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:麻布大学(相模原)   国名:日本国  

  • Exome sequencing in sporadic patients with young-onset parkinsonism reveals novel candidates. 国際会議

    Miura S, Shimojo T, Kosaka K, Fujioka R, Taniwaki T, Shibata H.

    2018 American Neurological Association Annual Meeting  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Atlanta   国名:アメリカ合衆国  

  • Whole genome sequencing of a Japanese endemic pit viper, habu, Protobothrops flavoviridis reveals accelerated evolution of venom protein genes enriched in microchromosomal regions. 国際会議

    Shibata H, Chijiwa T, Oda-Ueda N, Yamaguchi K, Hattori S, Matsubara K, Matsuda Y, Isomoto A, Koyanagi R, Hisata K, Fukumaki Y, Ohno M, Shoguchi E, Satoh N, Ogawa T.

    The International Society of Toxinology 2018 European Section Congress  2018年9月 

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    開催年月日: 2018年9月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Yerevan   国名:アルメニア共和国  

  • Whole genome sequencing of a Japanese endemic pit viper, habu, Protobothrops flavoviridis reveals accelerated evolution of venom protein genes enriched in microchromosomal regions. 国際会議

    Shibata H, Chijiwa T, Oda-Ueda N, Yamaguchi K, Hattori S, Matsubara K, Matsuda Y, Koyanagi R, Hisata K, Fukumaki Y, Ohno M, Shoguchi E, Satoh N, Ogawa T.

    SMBE 2018  2018年7月 

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    開催年月日: 2018年7月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Yokohama   国名:日本国  

  • A novel nonsense variant (Lys177X) of FGF14 in a Japanese patient with autosomal dominant spinocerebellar ataxia. 国際会議

    Miura S, Kosaka K, Fujioka R, Uchiyama Y, Taniwaki T, Shimojo T, Shibata H.

    The European Human Genetics Conference 2018  2018年6月 

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    開催年月日: 2018年6月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Milan   国名:イタリア共和国  

  • ハブゲノム解読により明らかになった毒関連遺伝子の進化.

    小川智久, 千々岩崇仁, 小田-上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森一樹, 田代康介, 久原哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 小柳亮, 竹内猛, 服巻保幸, 大野素徳, 将口栄一. 久田香奈子, 佐藤矩行, 柴田弘紀

    第40回日本分子生物学会年会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • A novel missense variation (Q220R) of GNB4 encoding a guanine nucleotide-binding protein, beta-4 in a Japanese neuropathy family. 国際会議

    Shiroh Miura, Takuya Morikawa, Ryuta Fujioka, Kazuhito Noda, Kengo Kosaka, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    The European Human Genetics Conference 2017  2017年5月 

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    開催年月日: 2017年5月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Copenhagen   国名:デンマーク王国  

  • Accelerated evolution of venom protein genes in the habu genome. 国際会議

    Hiroki Shibata

    Global Symposium GEM <Genome Evolution at Mishima>  2017年3月 

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    開催年月日: 2017年3月

    記述言語:英語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:National Institute of Genetics, Shizuoka   国名:日本国  

  • Habu snake genome reveals the evolutionary strategy for generating the venom-related genes. 国際会議

    Tomohisa Ogawa, Takahito Chijiwa, Naoko Oda-Ueda, Hitomi Nakamura, Shousaku Hattori, Kazumi Matsubara, Yoichi Matsuda, Kazuki Mori, Kosuke Tashiro, Shinichi Yamasaki, Manabu Fujie, Hiroki Goto, Ryo Koyanagi, Yasuyuki Fukumaki, Motonori Ohn, Eiichi Shoguchi, Kanako Hisata, Noriyuki Satoh, Hiroki Shibata

    Global Symposium GEM <Genome Evolution at Mishima>  2017年3月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年3月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:National Institute of Genetics, Shizuoka   国名:日本国  

  • ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定から明らかになった毒液関連遺伝子群の多重化と加速進化および染色体構造との関係

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, 服巻保幸

    第39回日本分子生物学会年会  2016年12月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:横浜、パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 脊髄小脳変性症に関わる新規責任遺伝子の同定

    森川拓弥, 三浦史郎, 小坂健悟, 藤岡竜太, 佐野 謙, 頼田章子, 内山雄介, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    第39回日本分子生物学会年会  2016年12月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜、パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定から明らかになった毒液関連遺伝子群の多重化と加速進化および染色体構造との関係

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, 服巻保幸

    第55回日本爬虫両棲類学会大会  2016年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:琉球大学   国名:日本国  

  • Heterozygous missense mutation in SEC24A encoding a coat protein complex II vesicle associated with autosomal dominant spinocerebellar ataxia. 国際会議

    Takuya Morikawa, Shiroh Miura, Kengo Kosaka, Ryuta Fujioka, Ken Sano, Akiko Yorita, Kosuke Aoki, Yusuke Uchiyama, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    66th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2016年10月 

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    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Vancouver   国名:カナダ  

  • A missense mutation in the PPIG gene encoding the peptidyl-prolyl isomerase G in patients with autosomal dominant benign adult familial myoclonic epilepsy. 国際会議

    Ryuta Fujioka, Shiroh Miura, Kohei Yamada, Takuya Morikawa, Hiromichi Motooka, Yasuhiro Aso, Noriyuki Kimura, Ken Sano, Ken Yamamoto, Takayuki Taniwaki, Hiroki Shibata

    66th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2016年10月 

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    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Vancouver   国名:カナダ  

  • 毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定から明らかになった毒液関連遺伝子群の多重化と染色体構造との関係

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, 服巻保幸

    第89回日本生化学会大会  2016年9月 

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    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:仙台国際センター   国名:日本国  

    Whole genome sequencing of a Japanese endemic pit viper, habu, Protobothrops flavoviridis reveals venom-related genes enriched in microchromosomal regions.

  • SPG28の発症に関わるDDHD1内の新規ホモ接合変異の同定

    森川拓弥, 三浦史郎, 藤岡竜太, 小坂健悟, 山田浩平, 服部剛典, 本村学, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第88回大会  2016年9月 

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    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:日本大学国際関係学部北口校舎、三島、静岡   国名:日本国  

  • 連鎖解析とエクソームシーケンスによる新規ニューロパチー家系の疾患責任遺伝子変異の同定

    小坂健悟, 三浦史郎, 佐野謙, 藤岡竜太, 才津浩智, 谷脇考恭, 山本健, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第88回大会  2016年9月 

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    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:日本大学国際関係学部北口校舎、三島、静岡   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定と遺伝子モデルの作製

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, Yasuyuki Fukumaki

    第63回トキシンシンポジウム  2016年7月 

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    開催年月日: 2016年7月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ほほえみの宿 滝の湯、天童   国名:日本国  

  • Homozygous 4-bp deletion in the DDHD1 gene, resulting the complete deletion of DDHD domain, as a causative variant in a SPG28 patient.

    森川拓弥, 三浦史郎, 山田浩平, 服部剛典, 小坂健悟, 藤岡竜太, 本村学, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    The 13th International Congress of Human Genetics  2016年4月 

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    開催年月日: 2016年4月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:国立京都国際会館   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定と遺伝子モデルの作製

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, Yasuyuki Fukumaki

    第54回日本爬虫両棲類学会大会  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東邦大学習志野キャンパス   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定と遺伝子モデルの作製

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 中村仁美, 服部正策, 松原和純, 松田洋一, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 山崎慎一, 藤江学, 後藤大輝, 将口栄一, 久田香奈子, 小柳亮, 佐藤矩行, 大野素徳, Yasuyuki Fukumaki

    第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定と遺伝子モデルの作製

    柴田弘紀, 千々岩崇仁, 上田直子, 服部正策, 小柳亮, 久田香奈子, 佐藤矩行, 大野素徳, Yasuyuki Fukumaki, 小川智久

    第87回日本遺伝学会大会  2015年9月 

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    開催年月日: 2015年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東北大学   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノムシークエンスと繰り返し配列の解析

    柴田弘紀, 山本真由美, タケット奈々, 小川智久, 森一樹, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 久原 哲, 大野素徳, 服巻保幸

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

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    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:札幌   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノムシークエンスと繰り返し配列の解析

    柴田弘紀, 山本真由美, タケット奈々, 小川智久, 森一樹, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 久原 哲, 大野素徳, 服巻保幸

    日本爬虫両棲類学会第52回大会  2013年11月 

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    開催年月日: 2013年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:札幌   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノムシークエンスと繰り返し配列の解析

    柴田弘紀, 山本真由美, タケット奈々, 小川智久, 森一樹, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 久原 哲, 大野素徳, 服巻保幸

    第85回日本遺伝学会大会  2013年9月 

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    開催年月日: 2013年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:日吉   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノムシークエンスと繰り返し配列の解析

    柴田弘紀, 山本真由美, タケット奈々, 小川智久, 森一樹, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 久原 哲, 大野素徳, 服巻保幸

    第15回日本進化学会大会  2013年8月 

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    開催年月日: 2013年8月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:つくば   国名:日本国  

  • Linkage-Exome approach to identify the responsible variant for a novel type of hereditary neuropathy

    藤原敏弥, 柴田 弘紀, 三浦史郎, 山本真由美, 貴田浩志, 野田和人, 加來庸一郎, 岩城 明子, 綾部光芳, 谷脇考恭, 服巻 保幸

    第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

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    開催年月日: 2012年12月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Genetic divergence of mitochondria genome sequence among island populations of Japanese Habu snakes, Protobothrops.

    柴田 弘紀, 山本真由美, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 大野素徳, 服巻 保幸

    第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

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    開催年月日: 2012年12月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 連鎖・エクソームアプローチによる新規家族性ニューロパチーの変異検索

    藤原敏弥, 柴田 弘紀, 三浦史郎, 山本真由美, 貴田浩志, 野田和人, 加來庸一郎, 岩城 明子, 綾部光芳, 谷脇考恭, 服巻 保幸

    第84回日本遺伝学会大会  2012年9月 

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    開催年月日: 2012年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Linkage-assisted exome sequencing to identify the responsible variant for a novel type of hereditary motor and sensory neuropathy with proximal dominancy in the lower extremities found in a single Japanese family. 国際会議

    Shibata H, Miura S, Kida H, Noda K, Kaku Y, Iwaki A, Ayabe M, Taniwaki T, Fukumaki Y.

    Human Genome Meeting 2012  2012年3月 

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    開催年月日: 2012年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:シドニー   国名:オーストラリア連邦  

  • Exome sequencing approach to identify the responsible variant for a novel type of hereditary motor and sensory neuropathy with proximal dominancy in the lower extremities found in a Japanese descent. 国際会議

    Shibata H, Miura S, Kida H, Noda K, Kaku Y, Iwaki A, Ayabe M, Taniwaki T, Fukumaki Y.

    12th International Congress of Human Genetics / 61st Annual Meeting of The American Society of Human Genetics, Montreal, Canada  2011年10月 

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    開催年月日: 2011年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:モントリオール   国名:カナダ  

  • Resequencing of dopamine receptor genes DRD1 and DRD2 as schizophrenia susceptibility genes revealed non-neutral process possibly associated with schizophrenia.

    Yu Liang, Yasuyuki Fukumaki, Hiroki Shibata

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会  2010年12月 

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    開催年月日: 2010年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Resequencing of the catechol-O-methyltransferase gene, COMT revealed non-neutral processes associated with schizophrenia. 国際会議

    Hiroki Shibata, Maiko Uchida, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki

    60th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2010年11月 

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    開催年月日: 2010年11月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ワシントンDC   国名:アメリカ合衆国  

  • 統合失調症感受性遺伝子COMTに見出される中立進化からの逸脱

    柴田弘紀、内田麻衣子、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第55回大会  2010年10月 

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    開催年月日: 2010年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:さいたま   国名:日本国  

  • 統合失調症関連候補遺伝子としてのPCP応答遺伝子探索と関連解析

    鄧 湘東、柴田弘紀、高木宏美、王 麗香、黒木俊秀、中原 辰雄、橋本喜次郎、岩田仲生、尾崎紀夫、有波忠雄、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第55回大会  2010年10月 

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    開催年月日: 2010年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:さいたま   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性遺伝子COMTに見出される中立進化からの逸脱

    柴田弘紀、内田麻衣子、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    第82回日本遺伝学会大会  2010年9月 

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    開催年月日: 2010年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:札幌   国名:日本国  

  • 統合失調症の原因を進化的手法で探る〜天才とナントカは紙一重か?〜

    柴田弘紀

    第12回日本進化学会大会  2010年8月 

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    開催年月日: 2010年8月

    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific balancing selection in GRIN2B upstream region. 国際会議

    Hiroki Shibata, Kunika Tanaka, Kazunori Watanabe, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki.

    International Symposium on Biodiversity Sciences: Genome, Evolution and Environment  2010年7月 

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    開催年月日: 2010年7月 - 2010年8月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の集団遺伝学手法による自然選択の検出

    柴田弘紀、田中邦佳、渡邉和典、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    第5回日本統合失調症学会  2010年3月 

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    開催年月日: 2010年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • マイクロサテライトマーカーを用いた統合失調症のゲノムワイド関連解析

    服巻保幸、山本 健、岡 晃、猪子英俊、有波忠雄、岩田仲生、尾崎紀夫、柴田弘紀

    第5回日本統合失調症学会  2010年3月 

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    開催年月日: 2010年3月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性遺伝子としてのCOMT遺伝子の分子進化学的解析

    内田麻衣子、服巻保幸、柴田弘紀

    第32回日本分子生物学会年会  2009年12月 

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    開催年月日: 2009年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific balancing selection in the GRIN2B upstream region. 国際会議

    Hiroki Shibata, Kazunori Watanabe, Kunika Tanaka, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki.

    59th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2009年10月 

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    開催年月日: 2009年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ホノルル   国名:アメリカ合衆国  

  • Genome-wide association study of schizophrenia using STR markers. 国際会議

    Yasuyuki Fukumaki Y, Ken Yamamoto, Zhu Sun, Akira Oka, Hidetoshi Inoko, Tadao Arinami, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Hiroki Shibata.

    59th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2009年10月 

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    開催年月日: 2009年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ホノルル   国名:アメリカ合衆国  

  • 高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析:代謝調節型グルタミン酸受容体遺伝子群における自然選択の検出

    柴田弘紀、森田 彩、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第54回大会  2009年9月 

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    開催年月日: 2009年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 統合失調症のSTRマーカーによるゲノムワイド関連解析

    服巻保幸、山本 健、孫 竹、岡 晃、猪子英俊、有波忠雄、岩田仲生、尾崎紀夫、柴田弘紀

    日本人類遺伝学会第54回大会  2009年9月 

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    開催年月日: 2009年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析:代謝調節型グルタミン酸受容体遺伝子群における自然選択の検出

    柴田弘紀、森田 彩、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    第81回日本遺伝学会大会  2009年9月 

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    開催年月日: 2009年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:松本   国名:日本国  

  • 高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析:代謝調節型グルタミン酸受容体遺伝子群における自然選択の検出

    柴田弘紀、森田 彩、後藤大輝、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    第11回日本進化学会大会  2009年9月 

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    開催年月日: 2009年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:札幌   国名:日本国  

  • Molecular Evolutionary Study Of The Ionotropic Glutamate-Receptor Gene Family As Schizophrenia Susceptibility Genes: Human-Specific Balancing Selection In GRIN2B Upstream Region 国際会議

    Hiroki Shibata, Kunika Tanaka K, Kazunori Watanabe, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki.

    The 8th International Workshop on Advanced Genomics: Expansion of Genome Science, Tokyo, Japan.  2009年6月 

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    開催年月日: 2009年6月

    開催地:東京   国名:日本国  

    Molecular Evolutionary Study Of The Ionotropic Glutamate-Receptor Gene Family As Schizophrenia Susceptibility Genes: Human-Specific Balancing Selection In GRIN2B Upstream Region

  • Comparative analysis of glutamate receptor gene family between human and chimpanzee

    柴田弘紀、後藤大輝、渡邉和典、黒木陽子、豊田 敦、服部正平、榊 佳之、藤山秋佐夫、服巻保幸

    第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大会  2008年12月 

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    開催年月日: 2008年12月

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Association study of phencyclidine-responsive genes with schizophrenia 国際会議

    Xiangdong Deng, Hiroki Shibata, Toshihide Kuroki, Tatsuo Nakahara, Kijiro Hashimoto, Hideaki Ninomiya, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    58th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2008年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年11月

    開催地:Philadelphia   国名:アメリカ合衆国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific non-neutral pattern observed in GRIN2B upstream region. 国際会議

    Hiroki Shibata, Kunika Tanaka, Kazunori Watanabe, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki.

    XX International Congress of Genetics  2008年10月 

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    開催年月日: 2008年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:大阪   国名:日本国  

  • Search for schizophrenia susceptibility loci focusing on PCP-responsive genes as candidates. 国際会議

    Yasuyuki Fukumaki, Xiangdong Deng, Toshihide Kuroki, Tatsuo Nakahara, Kijiro Hashimoto, Hideaki Ninomiya, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Hiroki Shibata .

    XX International Congress of Genetics  2008年10月 

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    開催年月日: 2008年10月

    開催地:大阪   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析 II

    柴田弘紀、渡邉和典、田中邦佳、森田 彩、後藤大輝 、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第53回大会  2008年9月 

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    開催年月日: 2008年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 高次脳機能に関連するイオンチャンネル型グルタミン酸受容体遺伝子群14種の上流調節領域における分子進化学的解析

    柴田弘紀、渡邉和典、田中邦佳、森田 彩、後藤大輝 、間野修平、竹中 修、服巻保幸

    第80回日本遺伝学会大会  2008年9月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • 統合失調症関連遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析

    柴田弘紀

    第10回日本進化学会大会  2008年8月 

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    開催年月日: 2008年8月

    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific non-neutral pattern observed in GRIN2B upstream region 国際会議

    Hiroki Shibata, Kunika Tanaka, Kazunori Watanabe, Hiroki Goto, Shuhei Mano, Osamu Takenaka, Yasuyuki Fukumaki.

    XX International Congress of Genetics  2008年7月 

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    開催年月日: 2008年7月

    開催地:Berlin   国名:ドイツ連邦共和国  

  • 進化医学序説:なぜ病気は存在するのか?

    服巻保幸、小林 茂、柴田弘紀

    第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会合同大会  2007年12月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • グルタミン酸受容体遺伝子群におけるヒト特異的アミノ酸置換の同定と上流領域の分子進化学的解析

    田中邦佳、渡邉和典、蔭山瑠衣、後藤大輝、蘭 直純、黒木陽子、豊田 敦、服部正平、榊 佳之、藤山秋佐夫、服巻保幸、柴田弘紀

    分子生物学会2006フォーラム  2006年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析

    柴田弘紀、田中邦佳、渡邉和典、蔭山瑠衣、後藤大輝、蘭 直純、黒木陽子、豊田 敦、服部正平、榊 佳之、藤山秋佐夫、服巻保幸

    第52回日本人類遺伝学会、  2007年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 統合失調症関連遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析

    柴田弘紀、田中邦佳、渡邉和典、後藤大輝、竹中 修、服巻保幸

    日本遺伝学会第79回大会  2007年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:岡山   国名:日本国  

  • 統合失調症関連遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析 招待

    柴田弘紀

    国立遺伝学研究所研究会シンポジウム「ヒトゲノム多様性に基づく進化医学の発展」  2007年10月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:国立遺伝学研究所、三島   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific non-neutral pattern observed in GRIN2B upstream region. 国際会議

    Shibata H, Tanaka K, Watanabe K, Goto H, Takenaka O, Fukumaki Y.

    57th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2007年10月 

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    開催地:米国サンディエゴ   国名:日本国  

  • ベノミクス研究により明らかになった毒蛇ハブの新規毒成分の機能と毒関連特殊機能の進化

    小川 智久, 柴田 弘紀, 上田 直子, 佐藤 矩行, 服部 正策, 日高 將文, 二井 勇人

    第96回日本生化学会大会  2023年11月 

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    開催年月日: 2023年10月 - 2023年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡国際会議場、マリンメッセ福岡   国名:日本国  

  • 毒蛇ハブのゲノム解析で明らかになった毒液タンパク質遺伝子の進化 招待

    柴田 弘紀, 上田 直子, 千々岩 崇仁, 中村 仁美, 服部 正策, 服巻 保幸, 大野 素徳, 佐藤 矩行, 小川 智久

    第96回日本生化学会大会  2023年11月 

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    開催年月日: 2023年10月 - 2023年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡国際会議場、マリンメッセ福岡   国名:日本国  

  • ハブ毒腺トランスクリプトミクスおよび全ゲノム配列の集団間比較解析

    #孫 崟瑞, #汪 趙楠, 小川 智久, 柴田 弘紀

    東京大学医科学研究所 奄美病害動物研究施設 第3棟改築記念シンポジウム  2023年10月 

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    開催年月日: 2023年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:アマホーム PLAZA (奄美市市民交流センター)   国名:日本国  

  • 毒蛇ハブのゲノム解析で明らかになった毒タンパク質遺伝子の進化 招待

    柴田 弘紀

    東京大学医科学研究所 奄美病害動物研究施設 第3棟改築記念シンポジウム  2023年10月 

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    開催年月日: 2023年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:アマホーム PLAZA (奄美市市民交流センター)   国名:日本国  

  • ハブ毒腺トランスクリプトミクスの集団間比較解析

    #孫 崟瑞, #汪 趙楠, 小川 智久, 柴田 弘紀

    第69回トキシンシンポジウム  2023年9月 

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    開催年月日: 2023年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都産業大学   国名:日本国  

  • ヒメハブ血清中に含まれる毒中和因子 Small serum protein:SSP 遺伝子アレイの島間比較による進化過程の考察

    矢内翔貴, 原尾朔弥, 竹内亜美, 前田真理恵, 柴田弘紀, 服部正策, 小田-上田直子, 千々岩崇仁

    第69回トキシンシンポジウム  2023年9月 

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    開催年月日: 2023年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都産業大学   国名:日本国  

  • 先天性白内障を伴う痙性対麻痺家系における責任遺伝子変異の探索

    #渡邊 笑奈、三浦 史郎、#比留木 成美、#孫 崟瑞、柴田 弘紀

    日本遺伝学会第95回大会  2023年9月 

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    開催年月日: 2023年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:熊本大学   国名:日本国  

  • Familial retinitis pigmentosa with neuromuscular symptoms carrying a novel nonsense variant in RDH11. 国際会議

    #Shigeyoshi Hiruki, Shiroh Miura, Saho Fujishita, Hiroki Shibata

    XXIII International Congress of Genetics  2023年7月 

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    開催年月日: 2023年7月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場   国名:日本国  

  • 毒蛇ハブのゲノム解析で明らかになった毒液遺伝子の進化 招待

    柴田弘紀

    令和5年度 日本環境変異原ゲノム学会 公開シンポジウム「有毒生物と遺伝子変異〜遺伝子変異のメカニズム〜」  2023年6月 

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    開催年月日: 2023年6月

    記述言語:日本語   会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:慶應大学薬学部   国名:日本国  

  • 孤発性young-onset Parkinson's diseaseの遺伝解析

    三浦史郎, #渡邊笑奈, #比留木成美, 森川拓弥, 内山雄介, 柴田弘紀

    第64回日本神経学会学術大会  2023年6月 

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    開催年月日: 2023年5月 - 2023年6月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:幕張メッセ   国名:日本国  

  • RDH11の新規ナンセンス変異を持つ神経および筋肉症状を併発する家族性網膜色素変性症

    #比留木成美, 三浦史郎, 藤下幸穂, 柴田弘紀

    第46回日本分子生物学会年会  2022年12月 

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    開催年月日: 2022年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場   国名:日本国  

  • RNA-seq of induced-neuronal cells revealed abnormal splicing of IQGAP3 in motor and sensory neuropathy.

    #Luoming Fan, Noriaki Sagata, Takahiro A. Kato, Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    第46回日本分子生物学会年会  2022年12月 

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    開催年月日: 2022年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場   国名:日本国  

  • ハブ毒腺トランスクリプトミクスおよび全ゲノム配列の集団間比較解析

    #孫 崟瑞, #汪 趙楠, 小川 智久, 柴田 弘紀

    第46回日本分子生物学会年会  2022年12月 

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    開催年月日: 2022年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場   国名:日本国  

  • 常染色体優性運動神経障害および感覚神経障害におけるグアニンヌクレオチド交換因子の異常な過剰発現

    #範 駱鳴, #孫 崟瑞, 藤岡 ⻯太, 三浦 史郎, 柴田 弘紀

    第45回日本分子生物学会年会  2022年12月 

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:幕張メッセ   国名:日本国  

  • 比較ゲノミクスとタンパク質構造予測から推定されたヘビSmall Serum Proteins(SSPs)の進化

    竹林聖純, 磯本明子, 日高將文, 二井勇人, 柴田弘紀, 小川智久

    第45回日本分子生物学会年会  2022年12月 

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    開催年月日: 2022年11月 - 2022年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:幕張メッセ   国名:日本国  

  • 沖縄島におけるサキシマハブ,タイワンハブ,在来種ハブの交雑状況の遺伝学的調査

    富永 篤, 寺田考紀, 嘉陽翔太, 上江洲安史, 柴田弘紀, 戸田 守, 岡 慎一郎, 太田英利

    日本爬虫両棲類学会第61回大会  2022年11月 

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    開催年月日: 2022年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:琉球大学   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝性運動および感覚神経障害に関連するIQGAP3のイントロン変異の機能分析

    #範 駱鳴, #孫 崟瑞, 森川拓弥, 藤岡竜太, 三浦史郎, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第94回大会  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北海道大学   国名:日本国  

  • エクソーム解析を用いた若年発症パーキンソン病の責任変異の探索

    #渡邊笑奈, 三浦史郎, 柴田弘紀, 内山雄介

    日本遺伝学会第94回大会  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北海道大学   国名:日本国  

  • 全ゲノムデータからの日本産ハブ属4集団の集団動態解析

    #孫 崟瑞, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第94回大会  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北海道大学   国名:日本国  

  • RDH11の新規ナンセンス変異を持つ神経および筋肉症状を併発する家族性網膜色素変性症

    #比留木成美, 三浦史郎, 藤下幸穂, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第94回大会  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:北海道大学   国名:日本国  

  • ヒメハブ血清に含まれる毒中和因子:SSPをコードする遺伝子アレイのゲノム構造解析

    #矢内翔貴, #原尾朔弥, #竹内亜美, #前田真理恵, 柴田弘紀, 服部正策, 小田-上田直子, 千々岩崇仁

    第68回トキシンシンポジウム  2022年9月 

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    開催年月日: 2022年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • 比較ゲノミクスとタンパク質構造予測から推定されたヘビSmall Serum Proteins(SSPs)の進化

    @稲丸賢人, @竹内亜美, @前田真理恵, 柴田弘紀, 服巻保幸, @上田直子, @服部正策, 大野素徳, @千々岩崇仁

    第44回日本分子生物学会年会  2021年12月 

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    開催年月日: 2021年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • A novel 1-bp deletion variant in DAG1 in Japanese familial idiopathic hyper CK-emia

    #Luoming Fan, @Shiroh Miura, #Tomofumi Shimojo, @Hirotoshi Sugino, @Ryuta Fujioka, Hiroki Shibata

    第44回日本分子生物学会年会  2021年12月 

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    開催年月日: 2021年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • 人工抗毒素産生系開発に向けた抗毒素のレパトア解析

    #孫 崟瑞, #範 駱鳴, @小川 智久, 柴田 弘紀

    第67回トキシンシンポジウム  2021年9月 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • 南西諸島14島からの109個体を用いたハブの集団構造解析

    #比留木成美, 手島康介, @寺田考紀, @服部正策, 柴田 弘紀

    日本遺伝学会第93回大会  2021年9月 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • 波紋筋病(Rippling muscle disease)家系の遺伝解析

    #範 駱鳴, #青木 浩介, #永野 明宏, @荒畑 創, @古谷 博和, 柴田 弘紀

    日本遺伝学会第93回大会  2021年9月 

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    開催年月日: 2021年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • Functional analysis of IQGAP3 as a causative gene of autosomal dominant hereditary motor and sensory neuropathy

    #Luoming Fan, #Kengo Kosaka, #Akihiro Nagano, #Tomofumi Shimojo, #Takuya Morikawa, @Ryuta Fujioka, @Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    第43回日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    開催年月日: 2020年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • Ddhd1 knockout mouse as a model for familial spastic paraplegia

    #Takuya Morikawa, @Shiroh Miura, Hiroaki Ohishi, #Kengo Kosaka, #Tomofumi Shimojo, #Akihiro Nagano, Itsuki Taniguchi, @Ryuta Fujioka, @Kosei Moriyama, Motoko Unoki ,Masatomo Takahashi, Motonao Nakao, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Hiroyuki Sasaki, Hiroki Shibata

    第43回日本分子生物学会年会  2020年12月 

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    開催年月日: 2020年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • Functional analysis of a TDRKH variant associated with autosomal dominant motor neuropathy

    #Luoming Fan, #Akihiro Nagano, #Kengo Kosaka, #Tomofumi Shimojo, #Takuya Morikawa, @Ryuta Fujioka, @Shiroh Miura, Hiroki Shibata

    日本遺伝学会第92回大会  2020年9月 

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    開催年月日: 2020年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • 痙性対麻痺28型の発症メカニズムの解明とバイオマーカー探索

    #森川拓弥, @三浦史郎, #大石裕晃, #小坂健悟, #下條智史, #永野明宏, 谷口愛樹, @藤岡竜太, @森山耕成, 鵜木元香, 高橋政友, 中尾素直, 和泉自泰, 馬場健史, 佐々木裕之, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第92回大会  2020年9月 

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    開催年月日: 2020年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:オンライン   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝性運動性ニューロパチー家系で同定したTDRKH変異の機能解析

    永野明宏、小坂健悟、三浦史郎、下條智文、長田周治、森川拓弥、藤岡竜太、野村拓夫、谷脇考恭、柴田弘紀

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    開催年月日: 2019年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 新規ニューロパチー家系で同定した新規IQGAP3内変異の遺伝学的解析

    下條 智史, 三浦 史郎, 小坂 健悟, 松浦 英治, 野田 和人, 藤岡 竜太, 森 慎一郎, 梅原 藤雄, 岩城 徹, 山本 健, 才津 浩智, 柴田 弘紀

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    開催年月日: 2019年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 家族性痙性対麻痺のモデルであるDdhd1ノックアウトマウスの解析

    森川拓弥、三浦史郎、大石裕晃、小坂健悟、下條智史、永野明宏、藤岡竜太、森山耕成、鵜木元香、高橋政友、中尾素直、和泉自泰、馬場健史、佐々木裕之、柴田弘紀

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    開催年月日: 2019年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • ホンハブのSSP遺伝子アレイの決定と獲得過程

    稲丸 賢人、竹内 亜美、前田真理恵、柴田 弘紀、服巻 保幸、上田 直子、服部 正策、大野 素徳、千々岩 崇仁

    第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

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    開催年月日: 2019年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • ホンハブのSSP遺伝子アレイの決定と獲得過程

    稲丸 賢人、竹内 亜美、前田真理恵、柴田 弘紀、服巻 保幸、上田 直子、服部 正策、大野 素徳、千々岩 崇仁

    日本爬虫両棲類学会第58回大会  2019年11月 

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    開催年月日: 2019年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:岡山理科大学、岡山   国名:日本国  

  • Genetic analysis of autosomal dominant paroxysmal kinesigenic dyskinesia (PKD).

    Tomofumi Shimojo, Shiroh Miura, Kengo Kosaka, Takuya Morikawa, Kosuke Aoki, Takashi Kamada, Hiroki Shibata

    日本人類遺伝学会第64回大会  2019年11月 

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    開催年月日: 2019年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎   国名:日本国  

  • Genetic analysis of autosomal dominant paroxysmal kinesigenic dyskinesia (PKD). 国際会議

    Tomofumi Shimojo, Shiroh Miura, Kengo Kosaka, Takuya Morikawa, Kosuke Aoki, Takashi Kamada, Hiroki Shibata

    69th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics,  2019年10月 

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    開催年月日: 2019年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Houston, TX   国名:アメリカ合衆国  

  • Exome sequencing in familial paroxysmal kinesigenic dyskinesia reveals novel candidates 国際会議

    Shiroh Miura, Tomofumi Shimojo, Takashi Kamada, Hiroki Shibata

    2019 American Neurological Association Annual Meeting  2019年10月 

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    開催年月日: 2019年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:St. Louis, MO   国名:アメリカ合衆国  

  • 新規ニューロパチー家系で同定した新規IQGAP3内変異の遺伝学的解析.

    下條智史, 三浦史郎, 小坂健悟, 佐野謙, 藤岡竜太, 才津浩智, 谷脇孝恭, 山本健, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第91回大会  2019年9月 

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    開催年月日: 2019年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福井   国名:日本国  

  • 家族性痙性対麻痺のモデルであるDdhd1ノックアウトマウスの解析.

    #森川拓弥, @三浦史郎, #大石裕晃, #小坂健悟, #下條智史, #永野明宏, @藤岡竜太, @森山耕成, 鵜木元香, 高橋政友, 中尾素直, 和泉自泰, 馬場健史, 佐々木裕之, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第91回大会  2019年9月 

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    開催年月日: 2019年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福井   国名:日本国  

  • The association study between HLA genotype and mucosal microbial composition in patients with inflammatory bowel diseases. 国際会議

    Hirano A, Shibata H, Kakuta Y, Nagasaki M, Tokunaga K, Khor SS, Kawai Y, Umeno J, Torisu T, Kitazono T, Esaki M.

    2019 Crohn’s and Colitis Congress  2019年2月 

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    開催年月日: 2019年2月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Las Vegas   国名:アメリカ合衆国  

  • ホンハブのSmall Serum Protein(SSP)遺伝子アレイの特異な構造と進化.

    稲丸賢人, 千々岩崇仁, 竹内亜美, 前田真理恵, 山口和晃, 柴田弘紀, 服部正策, 上田直子, 大野素徳.

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • 脊髄小脳失調症27型で同定したFGF14内の新規ナンセンス変異.

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 森川拓弥, 内山雄介, 谷脇考恭, 柴田弘紀.

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝発作性運動誘発性ジスキネシア家系で同定したFAT2内の新規非同義変異.

    下條智史, 三浦史郎, 小坂健悟, 青木浩介, 鎌田崇嗣, 柴田弘紀.

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • CRISPR/Cas9によって作成したDdhd1ノックアウトマウスの解析.

    森川拓弥, 三浦史郎, 大石裕晃, 小坂健悟, 下條智史, 永野明宏, 鵜木元香, 佐々木裕之, 柴田弘紀.

    第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

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    開催年月日: 2018年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • 伊川津・縄文人ゲノムからみた東アジア人類集団の形成史.

    覚張隆史, 中込滋樹, Martin Sikora, Simon Rasmussen, Morten Allentoft, 佐藤丈寛, Thorfinn Korneliussen, Blánaid Ní Chuinneagáin, 松前ひろみ, 小金渕佳江, Ryan Schmidt, 茂原信生, 米田穣, 木村亮介, 石田肇, 増山禎之, 山田康弘, 田嶋敦, 柴田弘紀, 豊田敦, 埴原恒彦, Eske Willerslev, 太田博樹.

    第72回日本人類学会大会  2018年10月 

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    開催年月日: 2018年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:国立遺伝学研究所(三島)   国名:日本国  

  • 脊髄小脳失調症27型で同定したFGF14内の新規ナンセンス変異.

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 森川拓弥, 内山雄介, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    日本人類遺伝学会第63回大会  2018年10月 

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    開催年月日: 2018年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • 孤発性パーキンソン病における責任遺伝子の探索.

    下條智史, 三浦史郎, 小坂健悟, 森川拓弥, 谷脇考恭, 柴田弘紀.

    日本人類遺伝学会第63回大会  2018年10月 

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    開催年月日: 2018年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜(横浜)   国名:日本国  

  • エクソーム解析によってFGF14内に新規ナンセンス変異を認めた脊髄小脳失調症27型の一例.

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 森川拓弥, 内山雄介, 谷脇考恭, 柴田弘紀.

    日本遺伝学会第90回大会  2018年9月 

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    開催年月日: 2018年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:奈良先端科学技術大学院大学(奈良)   国名:日本国  

  • DDHD1内の新規変異の同定とノックアウトマウスの作製.

    森川拓弥, 三浦史郎, 小坂健悟, 下條智文, 永野明宏, 柴田弘紀.

    日本遺伝学会第90回大会  2018年9月 

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    開催年月日: 2018年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:奈良先端科学技術大学院大学(奈良)   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝発作性運動誘発性ジスキネシア家系における責任遺伝子の探索.

    下條智史, 三浦史郎, 青木浩介, 谷脇孝恭, 柴田弘紀.

    日本遺伝学会第90回大会  2018年9月 

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    開催年月日: 2018年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:奈良先端科学技術大学院大学(奈良)   国名:日本国  

  • A new targeted enrichment method, “BAC-double capture,” for ancient DNA analysis. 国際会議

    Koganebuchi K, Gakuhari T, Kasagi S, Sato T, Tajima A, Shibata H, Ogawa M, Oota H.

    8th International Symposium on Biomolecular Archaeology ISBA 2018  2018年9月 

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    開催年月日: 2018年9月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Jena   国名:ドイツ連邦共和国  

  • A new targeted-capture method using bacterial artificial chromosome (BAC) as baits exclusively developed for sequencing relatively large loci of ancient DNA. 国際会議

    Koganebuchi K, Gakuhari T, Takeshima H, Kasagi S, Sato T, Tajima A, Shibata H, Ogawa M, Oota H.

    SMBE 2018  2018年7月 

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    開催年月日: 2018年7月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Yokohama   国名:日本国  

  • Whole genome analysis of the Jomon remain reveals deep lineage of East Eurasian populations. 国際会議

    Gakuhari T, Sikora M, Rasmussen S, Allentoft M, Sato T, Korneliussen T, Matsumae M, Shigehara N, Yoneda M, Ishida H, Masuda Y, Yamada Y, Tajima A, Shibata H, Toyoda A, Hanihara T, Nakagome S, Willerslev E, Oota H.

    SMBE 2018  2018年7月 

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    開催年月日: 2018年7月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Yokohama   国名:日本国  

  • 遺伝学的に新規と考えられる常染色体優性遺伝性遠位型運動ニューロパチー.

    三浦史郎, 小坂健悟, 長田周治, 野村拓夫, 藤岡竜太, 下條智史, 谷脇考恭, 柴田弘紀.

    第59回日本神経学会学術大会  2018年5月 

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    開催年月日: 2018年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ロイトン札幌(札幌)   国名:日本国  

  • ハブゲノム解読から見出された新規Three-finger toxinsの発現と機能解析.

    土生津光, 齋藤浩唯, 柴田弘紀, 大野素徳, 服部正策, 松井崇, 田中良和, 村本光二, 小川智久

    第40回日本分子生物学会年会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝運動性ニューロパチー家系で同定したTDRKH内の新規非同義変異.

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 長田周治, 森川拓弥, 藤岡竜太, 野村拓夫, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • DDHD1の新規責任変異の同定とCRISPR/Cas9によるDdhd1ノックアウトマウスの作成.

    森川拓弥, 三浦史郎, 大石裕晃, 藤岡竜太, 森山耕成, 小坂健悟, 下條智史, 柴田弘紀

    第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同年次大会  2017年12月 

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    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • エクソーム解析及び連鎖解析を用いたRippling muscle disease (RMD)における新規責任遺伝子変異の同定.

    青木浩介, 荒畑創, 古谷博和, 柴田弘紀

    第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同年次大会  2017年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • SSPをコードする新規遺伝子の発見とSSP遺伝子の獲得過程の考察.

    稲丸賢人, 千々岩崇仁, 柴田弘紀, 服巻保幸, 服部正策, 大野素徳

    第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同年次大会  2017年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • 「岩国のシロヘビ」アルビノ変異原因遺伝子の同定.

    岩西修造, 財津将平, 柴田弘紀, 仁田坂英二

    第40回日本分子生物学会年会  2017年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • 末梢血におけるKLF14遺伝子領域のDNAメチル化は2型糖尿病の発症を予測しうる.

    岩谷千寿, 柴田弘紀, 山本健, 北島秀俊, 前田泰孝, 園田紀之, 小川佳宏, 井口登與志

    第40回日本分子生物学会年会  2017年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド(神戸)   国名:日本国  

  • アオダイショウにおけるアルビノ変異体の遺伝子解析:「岩国のシロヘビ」のアルビノ変異原因遺伝子の同定.

    岩西修造, 財津将平,柴田弘紀, 仁田坂英二

    本爬虫両棲類学会第56回大会  2017年11月 

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    開催年月日: 2017年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:熊本大学(熊本)   国名:日本国  

  • EWAS研究で得られたKLF14遺伝子領域のエピゲノム変化は脂肪組織の炎症と相関する.

    岩谷千寿, 北島秀俊,山本健,前田泰孝, 園田紀之, 柴田弘紀, 井口登與志

    日本人類遺伝学会第62回大会  2017年11月 

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    開催年月日: 2017年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場(神戸)   国名:日本国  

  • DDHD1の新規責任変異の同定とノックアウトマウスの作成.

    森川拓弥, 三浦史郎, 大石裕晃, 藤岡竜太, 小坂健悟, 下條智史, 森山耕成, 柴田弘紀

    日本人類遺伝学会第62回大会  2017年11月 

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    開催年月日: 2017年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場(神戸)   国名:日本国  

  • 常染色体優性遺伝運動性ニューロパチー家系で同定したTDRKH内の新規非同義変異.

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 長田周治, 森川拓弥, 藤岡竜太, 野村拓夫, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    日本人類遺伝学会第62回大会  2017年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸国際会議場(神戸)   国名:日本国  

  • 古代ゲノム解析への応用に向けたBACダブルキャプチャー法の検討

    小金渕佳江, 覚張隆史, 武島弘彦, 笠木聡, 佐藤丈寛, 田嶋敦, 柴田弘紀, 小川元之, 太田博樹

    第71回日本人類学会大会  2017年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京大学本郷キャンパス(東京)   国名:日本国  

  • An attempt of a new method, “BAC-double capture,” for applying to ancient genome analysis. 国際会議

    Koganebuchi K, Gakuhari T, Kasagi S, Sato T, Tajima A, Shibata H, Ogawa M, Oota H.

    U. of Ryukyus & OIST Joint Symposium 2017  2017年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Okinawa   国名:日本国  

  • Heterozygous missense variant in TDRKH encoding tudor and KH domain-containing protein associated with autosomal dominant motor neuropathy. 国際会議

    Kosaka K, Miura S, Shimojo T, Nagata S, Morikawa T, Fujioka R, Nomura T, Taniwaki T, Shibata H.

    67th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics,  2017年10月 

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    開催年月日: 2017年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Orlando   国名:アメリカ合衆国  

  • A case of familial Rippling muscle disease showing mosaic pattern of caveolin-3 in muscle biopsy suggesting an immunologic mechanism. 国際会議

    Furuya H, Arahata H, Furuta K, Shibata H, Fuji N.

    American Neurological Association’s (ANA) 2017 Annual Meeting  2017年10月 

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    開催年月日: 2017年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:San Diego   国名:アメリカ合衆国  

  • 常染色体優性遺伝運動性ニューロパチー家系で同定したTDRKH内の新規非同義変異

    小坂健悟, 三浦史郎, 下條智史, 長田周治, 森川拓弥, 藤岡竜太, 野村拓夫, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第89回大会  2017年9月 

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    開催年月日: 2017年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:岡山大学   国名:日本国  

  • 「岩国のシロヘビ」のアルビノ変異遺伝子の同定

    岩西修造, 財津将平, 柴田弘紀, 仁田坂英二

    日本遺伝学会第89回大会  2017年9月 

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    開催年月日: 2017年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:岡山大学   国名:日本国  

  • Charcot-Marie-Tooth病におけるGNB4内の新規ミスセンス変異の同定

    森川拓弥, 三浦史郎, 藤岡竜太, 野田和人, 小坂健悟, 谷脇孝恭, 柴田弘紀

    日本遺伝学会第89回大会  2017年9月 

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    開催年月日: 2017年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:岡山大学   国名:日本国  

  • Investigate of epigenetic biomarkers for pre-type 2 diabetes. 国際会議

    Chihiro Iwaya, Ken Yamamoto, Yasutaka Maeda, Noriyuki Sonoda, Hiroki Shibata, Toyoshi Inoguchi

    53rd Annual Meeting of the European Association for the Study of Diabetes  2017年9月 

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    開催年月日: 2017年9月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Lisbon   国名:ポルトガル共和国  

  • 肥満マウスにおけるKlf14遺伝子領域のエピゲノム変化と炎症との関連

    岩谷千寿, 柴田弘紀, 山本健, 北島秀俊, 池田陽介, 前田泰孝, 園田紀之, 小川佳宏, 井口登與志

    日本肥満学会第22回アディポサイエンス・シンポジウム  2017年8月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年8月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:千里ライフサイエンスセンター(大阪府豊中市)   国名:日本国  

  • The relation between epigenome changes of Klf14 region and chronic inflammation in obese mice. 国際会議

    Chihiro Iwaya, Yuka Kimura, Yosuke Ikeda, Hidetoshi Kitajima, Ken Yamamoto, Hiroki Shibata, Yasutaka Maeda, Noriyuki Sonoda, Yoshihiro Ogawa, Toyoshi Inoguchi

    American Diabetes Associaten, the 77th Scientific Sessions  2017年6月 

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    開催年月日: 2017年6月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:San Diego   国名:アメリカ合衆国  

  • 縄文時代人骨の古代ゲノム解析~3000年前の劣化DNAをいかにして読むか~

    覚張隆史, Ryan Schmidt, 佐藤丈寛, 松前ひろみ, Martin Sikora, Korneliussen Sand Thorfinn, Peter Damgaard, 埴原恒彦, 小川元之, 木村亮介, 石田肇, 設楽博己, 山田康弘, 柴田弘紀, 田嶋敦, Eske Willerslev, 太田博樹

    NGS現場の会 第五回研究会  2017年5月 

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    開催年月日: 2017年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:仙台、仙台国際センター   国名:日本国  

  • 脂肪細胞におけるKLF14遺伝子のエピゲノム変化-加齢と肥満糖尿病における変化

    岩谷千寿, 木村裕佳, 池田陽介, 山本健, 北島秀俊, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 小川佳宏, 井口登與志

    第60回日本糖尿病学会年次学術総会  2017年5月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋、名古屋国際会議場   国名:日本国  

  • 脂肪細胞におけるKLF14遺伝子のDNAメチル化変化が及ぼす炎症性変化

    岩谷千寿, 木村裕佳, 池田陽介, 山本健, 北島秀俊, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 小川佳宏, 井口登與志

    第90回日本内分泌学会学術総会  2017年4月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年4月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都、ロームシアター京都   国名:日本国  

  • A comparison study of the mucosa-associated microbiota between inflamed and non-inflamed sites in ulcerative colitis patients. 国際会議

    Atsushi Hirano, Junji Umeno, Hiroki Shibata, Takanari Kitazono, Motohiro Esaki

    The 12th Congress of ECCO (European Crohn’s and Colitis Organisation)  2017年2月 

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    開催年月日: 2017年2月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Barcelona   国名:スペイン  

  • 脂肪細胞におけるKLF14遺伝子のエピゲノム変化が及ぼす炎症性変化

    岩谷千寿, 榊 裕佳, 池田陽介, 山本健, 北島秀俊, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 小川佳宏, 井口 登與志

    第31回日本糖尿病・肥満動物学会年次学術集会  2017年2月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年2月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:はまぎんホール ヴィアマーレ、横浜   国名:日本国  

  • Investigate of epigenetic biomarkers for pre-type 2 diabetes. 国際会議

    Chihiro Iwaya, Hidetoshi Kitajima, Ken Yamamoto, Hiroki Shibata, Noriyuki Sonoda, Toyoshi Inoguchi

    Human Genome Meeting 2017  2017年2月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2017年2月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Barcelona   国名:スペイン  

  • クサリヘビ科ヘビの分泌型ホスホリパーゼA2(PLA2)をコードする遺伝子クラスター領域の解析

    稲丸賢人, 千々岩崇仁, 山口和晃, 林みず紀, 柴田弘紀, 上田直子, 服部正策, 大野素徳

    第39回日本分子生物学会年会  2016年12月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜、パシフィコ横浜   国名:日本国  

  • KLF14遺伝子のエピゲノム変化が及ぼす脂肪細胞における炎症性変化及び代謝変化

    岩谷千寿, 山本健, 北島秀俊, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 井口 登與志

    第39回日本分子生物学会年会  2016年12月 

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    開催年月日: 2016年11月 - 2016年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜、横浜   国名:日本国  

  • 長期単独飼育されたオオアナコンダから発見された幼蛇

    坂部あい, 坂田修一, 平野雄三, 仁田坂 英二, 柴田弘紀

    第55回日本爬虫両棲類学会大会  2016年11月 

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    開催年月日: 2016年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:琉球大学   国名:日本国  

    Virgin pregnancy of Green anaconda (Eunectes murinus) in long-term captivity.

  • 糖尿病における炎症性変化とKLF14遺伝子エピゲノム変化の関連

    岩谷千寿, 山本健, 北島秀俊, 榊裕佳, 池田陽介, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 井口 登與志

    第54回日本糖尿病学会九州地方会  2016年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:かごしま県民交流センター   国名:日本国  

  • 古代ゲノムシークエンシングのための技術改良

    太田博樹, 覚張隆史, ライアン・シュミット, 勝村啓史, 松前ひろみ, 埴原恒彦, 小川元之, 柴田弘紀, 佐伯和信, 分部哲秋, 弦本敏行, 佐藤丈寛, 木村亮介, 石田 肇

    第69回日本人類学会大会  2016年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:産業技術総合研究所臨海副都心センター、東京   国名:日本国  

  • ウクライナ・ヴァティーバ洞穴出土人骨の古遺伝学的解析

    ライアン・W・シュミット, 覚張隆史, 太田博樹, 松前ひろみ, 柴田弘紀, ジョーダン・カーステン, ミハイオ・ソハトスキー

    第69回日本人類学会大会  2016年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:産業技術総合研究所臨海副都心センター、東京   国名:日本国  

  • 渥美半島における縄文時代人骨の古代 DNA 分析

    覚張隆史, ライアン・W・シュミット, 松前ひろみ, 勝村啓史, 太田博樹, 埴原恒彦, 小川元之, 柴田弘紀, 茂原信生, 近藤 修, 米田 穣, 増山禎之, 設楽博己, 山田康弘

    第69回日本人類学会大会  2016年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:産業技術総合研究所臨海副都心センター、東京   国名:日本国  

  • KLF14遺伝子のエピゲノム変化に注目した糖尿病バイオマーカーの検証

    岩谷千寿, 北島秀俊, 山本健, 柴田弘紀, 前田 泰孝, 園田 紀之, 井口 登與志

    第66回日本体質医学会総会  2016年9月 

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    開催年月日: 2016年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:和歌山県JAビル   国名:日本国  

  • The preliminary report for the deep sequencing of the prehistoric Jomon genome from the Japanese archipelago.

    覚張隆史, Ryan Schmidt, Martin Sikora, Thorfinn Sand Korneliussen, 松前ひろみ, 佐藤丈寛, 勝村啓史, 小金渕佳江, 西村貴孝, 中込滋樹, 間野修平, 清水健太郎, 柴田弘紀, 今西規, 田嶋敦, 河村正二, 設楽博己, 茂原信生, Eske Willerslev

    Society for Molecular Biology and Evolution Conference 2016  2016年7月 

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    開催年月日: 2016年7月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Gold Coast, QLD   国名:オーストラリア連邦  

  • クサリヘビ科ヘビの毒ホスホリパーゼA2遺伝子の形成と起源

    山口和晃, 千々岩崇仁, 池田直樹, 林みず紀, 柴田弘紀, 上田-小田直子, Yasuyuki Fukumaki, 服部正策, 大野素徳

    第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 新生仔マウスの精原幹細胞の形成と分化における 全ゲノムDNAメチル化およびトランスクリプトーム解析

    久保直樹, 藤 英博, 白根健次郎, 白川峰征, 小林久人, 佐藤哲也, 曾根秀利, 佐藤康人, 富澤信一, 鶴崎美徳, 柴田弘紀, 才津浩智, 鈴木 穣, 松本直通, 須山幹太, 河野友宏, 大保和之, 佐々木 裕之

    第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会  2015年12月 

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    開催年月日: 2015年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸ポートアイランド   国名:日本国  

  • 渥美半島における縄文時代人骨の古代DNA分析

    覚張隆史, ライアン・シュミット, 松前ひろみ, 勝村啓史, 太田博樹, 埴原恒彦, 小川元之, 柴田弘紀, 水嶋崇一郎, 茂原信生, 近藤修, 米田穣, 増山禎之, 設楽博己, 山田康弘

    第69回日本人類学会大会  2015年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:産業技術総合研究所 臨海副都心センター   国名:日本国  

  • 古代ゲノムシークエンシングのための技術改良

    太田博樹, 覚張隆史, ライアン・シュミット, 勝村啓史, 松前ひろみ, 埴原恒彦, 小川元之, 柴田弘紀, 佐伯和信, 分部哲秋, 弦本敏行, 佐藤丈寛, 木村亮介, 石田肇

    第69回日本人類学会大会  2015年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2015年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:産業技術総合研究所 臨海副都心センター   国名:日本国  

  • ヒト常染色体の1遺伝子座NGS解析に向けた低コストターゲットキャプチャー法の検討

    小金渕佳江, 覚張隆史, 笠木聡, 柴田弘紀, 太田博樹

    NGS現場の会第四回研究会  2015年7月 

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    開催年月日: 2015年7月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:つくば国際会議場、筑波   国名:日本国  

  • アオダイショウにおけるアルビノ変異の原因遺伝子の解析

    財津将平, 柴田弘紀, 仁田坂 英二

    日本動物学会九州支部 (第68回)、九州沖縄植物学会 (第65回)、日本生態学会九州地区会 (第60回)  2015年5月 

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    開催年月日: 2015年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡大学、福岡   国名:日本国  

  • 連鎖・エクソーム解析による常染色体優性ミオクローヌスてんかんの責任遺伝子検索

    山田浩平, 三浦史郎, 藤岡竜太, 佐野謙, 山本 健, 谷脇考恭, 柴田弘紀

    第37回日本分子生物学会年会  2014年11月 

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    開催年月日: 2014年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:パシフィコ横浜、横浜   国名:日本国  

  • A novel missense mutation of ryanodine receptor 1 (RYR1) in a Japanese idiopathic hyper CK-emia family 国際会議

    Ken Sano, Shiroh Miura, Toshiya Fujiwara, Ken Yamamoto, Akiko Yorita, Kazuhito Noda, Hiroshi Kida, Koichi Azuma, Shinjiro Kaieda, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki, Hiroki Shibata

    64th Annual Meeting of The American Society of Human Genetic  2014年10月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2014年10月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:San Diego, CA   国名:アメリカ合衆国  

  • ハブ(Protobothrops flavoviridis)の全ゲノム配列決定の現状と展望

    柴田弘紀, 山本真由美, タケット奈々, 小川智久, 森 一樹, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 久原 哲, 大野素徳, 服巻保幸

    日本動物学会九州支部 (第67回)、九州沖縄植物学会 (第64回)、日本生態学会九州地区会 (第59回)、沖縄生物学会(第51回)合同沖縄大会  2014年5月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2014年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:琉球大学   国名:日本国  

  • マウス新生仔期の精原幹細胞の分化におけるメチローム変動

    久保直樹, 藤英博, 白根健次郎, 白川峰征, 神里亮人, 曾根秀利, 佐藤康人, 鶴崎美徳, 富澤信一, 柴田弘紀, 才津浩智, 松本直通, 大保和之, 佐々木裕之

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

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    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • クサリヘビ科グループIIEホスホリパーゼA2の発見と,ホンハブのグループIIA毒性ホスホリパーゼA2との進化的関与

    山口和晃, 千々岩崇仁, 柴田弘紀, 上田直子, 服部正策, 大野素徳

    第36回日本分子生物学会年会  2013年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2013年12月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 九州地域の孤発性および家族性筋萎縮性側索硬化症(ALS)の遺伝子解析

    古谷 博和, 渡邉 暁博, 荒畑 創, 河野 祐治, 藤井 直樹, 藤原敏弥, 鉾之原 敏博, 岩城 明子, 柴田 弘紀, 服巻 保幸

    第35回日本分子生物学会年会  2012年12月 

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    開催年月日: 2012年12月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 日本産ハブ属(Protobothrops属)の島集団間におけるmtDNAの遺伝的分化

    柴田 弘紀, 山本真由美, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 大野素徳, 服巻 保幸

    日本爬虫両棲類学会第51回大会  2012年11月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2012年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:愛知県豊田市   国名:日本国  

  • カメ類における卵殻構造の多様性

    楠田哲士, 安川雄一郎, 柴田 弘紀, 吉崎範夫

    日本爬虫両棲類学会第51回大会  2012年11月 

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    開催年月日: 2012年11月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:愛知県豊田市   国名:日本国  

  • Gene analysis of familial and sporadic amyotrophic lateral sclerosis (ALS) in Kyushu island of Japan. 国際会議

    古谷 博和, 渡邉 暁博, 荒畑 創, 河野 祐治, 藤井 直樹, 藤原敏弥, 鉾之原 敏博, 岩城 明子, 柴田 弘紀, 服巻 保幸

    62nd Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2012年11月 

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    開催年月日: 2012年11月

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:San Francisco   国名:アメリカ合衆国  

  • NOD2 遺伝子座におけるクローン病原因変異の地域特異性

    中込滋樹, 間野修平, Lukasz Kozlowski, Janusz M. Bujnicki, 柴田 弘紀, 服巻 保幸, Judith R. Kidd, Kenneth K. Kidd, 河村正二, 太田博樹

    日本人類遺伝学会第57回大会  2012年10月 

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    開催年月日: 2012年10月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 日本産ハブ属(Protobothrops属)の島集団間におけるmtDNAの遺伝的分化

    柴田 弘紀, 山本真由美, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 大野素徳, 服巻 保幸

    第84回日本遺伝学会大会  2012年9月 

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    開催年月日: 2012年9月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 日本産ハブ属(Protobothrops属)の島集団間におけるmtDNAの遺伝的分化

    柴田 弘紀, 山本真由美, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 大野素徳, 服巻 保幸

    第14回日本進化学会大会  2012年8月 

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    開催年月日: 2012年8月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • カメ類ミトコンドリアゲノムにおける翻訳フレームシフトの分子進化

    山田知江美, 柴田 弘紀, 熊澤慶伯

    第14回日本進化学会大会  2012年8月 

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    開催年月日: 2012年8月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の島集団間の遺伝的分化

    柴田 弘紀, 山本真由美, 千々岩崇仁, 服部正策, 上田直子, 大野素徳, 服巻 保幸

    平成24年度日本生化学会九州支部例会  2012年5月 

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    開催年月日: 2012年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 奄美大島ハブの情報基盤としての遺伝子カタログの作製

    中村仁美、柴田弘紀、森一樹、田代康介、久原哲、千々岩崇仁、服部正策、大野素徳、服巻保幸、上田直子

    平成24年度日本生化学会九州支部例会  2012年5月 

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    開催年月日: 2012年5月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 日本固有の毒蛇ハブ(Protobothrops flavoviridis)の島集団間の遺伝的分化

    柴田弘紀、山本真由美、千々岩崇仁、服部正策、上田直子、大野素徳、服巻保幸

    平成24年度日本生化学会九州支部例会  2012年5月 

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    開催年月日: 2012年5月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 奄美大島ハブの情報基盤としての遺伝子カタログの作製

    中村仁美, 柴田 弘紀, 森 一樹, 田代 康介, 久原 哲, 千々岩崇仁, 服部正策, 大野素徳, 服巻 保幸, 上田直子

    平成24年度日本生化学会九州支部例会  2012年5月 

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    開催年月日: 2012年5月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Non-neutral evolution observed in schizophrenia susceptibility genes.

    Hiroki Shibata

    第34回日本分子生物学会年会  2011年12月 

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    開催年月日: 2011年12月

    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 連鎖・エクソームアプローチによる新規家族性ニューロパチーの変異検索

    服巻保幸、三浦史郎、山本真由美、貴田浩志、野田和人、加來庸一郎、岩城明子、綾部光芳、谷脇考恭、柴田弘紀

    第34回日本分子生物学会年会  2011年12月 

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    開催年月日: 2011年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 連鎖解析とエクソームシークエンシングの併用による家族性運動感覚ニューロパチーの責任変異探索

    柴田弘紀、三浦史郎、貴田浩志、野田和人、加來庸一郎、岩城明子、綾部光芳、谷脇考恭、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第56回大会  2011年11月 

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    開催年月日: 2011年11月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:千葉   国名:日本国  

  • Population specific susceptibility to Crohn’s disease and signals of natural selection on standing variation. 国際会議

    Nakagome S, Mano S, Kozlowski L, Bujnicki JM, Shibata H, Fukumaki Y, Kidd JR, Kidd KK, Kawamura S, Oota H.

    12th International Congress of Human Genetics / 61st Annual Meeting of The American Society of Human Genetics, Montreal, Canada  2011年10月 

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    開催年月日: 2011年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:モントリオール   国名:カナダ  

  • カメ類のミトコンドリアゲノムにおける分子進化速度の不均一性

    山田知江美、柴田弘紀、熊澤慶伯

    第13回日本進化学会大会  2011年7月 

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    開催年月日: 2011年7月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都   国名:日本国  

  • Resequencing of C2orf24 as a schizophrenia susceptibility gene revealed by GWAS with STR markers.

    Zhu Sun, Hiroki Shibata, Yasuyuki Fukumaki

    第33回日本分子生物学会年会、第83回日本生化学会大会合同大会  2010年12月 

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    開催年月日: 2010年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific balancing selection in GRIN2B upstream region. 国際会議

    Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Hiroshi Kida, Akiko Iwaki, Mitsuyoshi Ayabe, Hisamichi Aizawa, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki

    60th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2010年11月 

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    開催年月日: 2010年11月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:ワシントンDC   国名:アメリカ合衆国  

  • SPASTおよびDPY30遺伝子の部分欠失を伴うSPG4家系

    三浦史郎、柴田弘紀、貴田浩司、野田和人、岩城明子、綾部光芳、相澤久道、谷脇考恭、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第55回大会  2010年10月 

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    開催年月日: 2010年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:さいたま   国名:日本国  

  • Molecular evolutionary study of the ionotropic glutamate-receptor gene family as schizophrenia susceptibility genes: human-specific balancing selection in GRIN2B upstream region. 国際会議

    Shiroh Miura, Hiroki Shibata, Kazuhito Noda, Yoichiro Kaku, Hiroshi Kida, Akiko Iwaki, Mitsuyoshi Ayabe, Hisamichi Aizawa, Takayuki Taniwaki, Yasuyuki Fukumaki

    135th Annual Meeting of American Neurological Association  2010年10月 

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    開催年月日: 2010年10月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:サンフランシスコ   国名:アメリカ合衆国  

  • Alcohol dehydrogenase (ADH) gene cluster in primates. 国際会議

    Hiroki Ooota, Rajinder Kaul, Hiroki Shibata, Atsushi Toyoda, Akio Fujiyama, William C. Speed, Judith R. Kidd, Maynard Olson, Shoji Kawamura, Kenneth K. Kidd

    International Primatological Society XXIII Congress  2010年9月 

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    開催年月日: 2010年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都   国名:日本国  

  • 筋萎縮性側索硬化症におけるFUS遺伝子変異の同定

    鉾之原敏博、三浦史郎、岩城明子、柴田弘紀、立石貴久、菊池仁志、古谷博和、吉良潤一、服巻保幸

    第32回日本分子生物学会年会  2009年12月 

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    開催年月日: 2009年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 軽症福山型筋ジストロフィー患者2名のfukutin遺伝子ハプロタイプ解析

    古谷博和、三浦史郎、柴田弘紀、服巻保幸

    第32回日本分子生物学会年会  2009年12月 

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    開催年月日: 2009年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • アルコール脱水素酵素遺伝子クラスターの霊長類における比較ゲノム解析

    太田博樹、Rajinder Kaul、Maynard Olson、柴田弘紀、河村正二、William C. Speed、Judith R. Kidd、Kenneth K. Kidd

    第32回日本分子生物学会年会  2009年12月 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年12月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 筋萎縮性側索硬化症の日本人1家系におけるFUS遺伝子変異の同定

    鉾之原敏博、三浦史郎、岩城明子、柴田弘紀、立石貴久、菊池仁志、古谷博和、吉良潤一、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第54回大会  2009年9月 

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    開催年月日: 2009年9月

    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体遺伝子群の上流調節領域の分子進化学的解析 II

    森田 彩、竹中 修、服巻 保幸、柴田 弘紀

    第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大会  2008年12月 

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    開催年月日: 2008年12月

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 脊髄小脳失調症16型の原因はIP3受容体遺伝子のハプロ不全である

    岩城明子、河野祐治、三浦史郎、柴田弘紀、山本 健、松瀬 大、李 魏、古谷博和、大八木保政、谷脇考恭、吉良潤一、服巻保幸

    日本人類遺伝学会第53回大会  2008年9月 

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    開催年月日: 2008年9月

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Locus-wide association study in the 5q33.1 region for schizophrenia susceptibility genes 国際会議

    Goto H, Shibata H, Takaji M, Ninomiya H, Tashiro N, Jarusuraisin N, Fukumaki Y.

    55th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics  2005年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Salt Lake City   国名:アメリカ合衆国  

  • ローカスワイド関連解析による統合失調症感受性遺伝子の探索

    後藤 大輝、柴田 弘紀、高司 雅史、二宮英彰、田代 信維、Ngamwong JARUSURAISIN 、服巻 保幸

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡  

  • 脊髄小脳失調症16型の原因遺伝子の探索

    三浦 史郎、柴田 弘紀、古谷 博和、松永 宏美、三好 安、小副川 学、大八木 保政、山田 猛、谷脇 考恭、吉良 潤一、服巻 保幸

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡  

  • 中性アミノ酸トランスポーター1型及び2型遺伝子(SLC1A4, SLC1A5)と統合失調症の関連解析

    竹内 尚子、境 真由美、? 湘東、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、岩田 仲生、尾崎 紀夫、服巻 保幸

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡  

  • Association study of the glutamate transporter genes, SLC1A3 and SLC1A6 with schizophrenia in the Japanese population.

    Xiandong Deng, Shinako Rachi, Mayumi Sakai, Naoko Takeuchi, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Nakao Iwata, Norio Ozaki, Yasuyuki Fukumaki

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡  

  • ヒト-チンパンジー分岐後におけるグルタミン酸受容体遺伝子群の分子進化学的解析

    柴田 弘紀、後藤 大輝、田中 邦佳、黒木 陽子、豊田 敦、服部 正平、榊 佳之、藤山 秋佐夫、服巻 保幸

    第28回日本分子生物学会年会  2005年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡  

  • グルタミン酸および中性アミノ酸トランスポーター遺伝子群と統合失調症との関連解析

    竹内 尚子、? 湘東、柴田 弘紀、良知 姿子、境 真由美、二宮 英彰、田代 信維、岩田 仲生、尾崎 紀夫、服巻 保幸

    第51回日本人類遺伝学会大会  2006年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:米子  

  • Association study of polymorphisms in the glutamate transporter genes, SLC1A1, SLC1A3, SLC1A6 and the neutral amino acid transporter genes SLC1A4, SLC1A5 with schizophrenia. 国際会議

    Deng X, Takeuchi N, Shibata H, Rachi S, Sakai M, Ninomiya H, Iwata N, Ozaki N, Fukumaki Y.

    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress  2006年7月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都  

  • Locus-wide association study of schizophrenia with 43 genes located in the 5q33.1 region. 国際会議

    Shibata H, Goto H, Takaji M, Ninomiya H, Tashiro N. Jarusuraisin N, Fukumaki Y.

    11th International Congress of Human Genetics  2006年8月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Brisbane   国名:オーストラリア連邦  

  • Locus-wide association study of 43 genes in the 5q33.1 region with schizophrenia. 国際会議

    Shibata H, Goto H, Takaji M, Ninomiya H, Tashiro N. Jarusuraisin N, Fukumaki Y.

    The 8th International Meeting on Human Genome Variation and Complex Genome Analysis  2006年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Hong Kong   国名:中華人民共和国  

  • グルタミン酸および中性アミノ酸トランスポーター遺伝子群と統合失調症との関連解析

    竹内 尚子、鄧 湘東、柴田 弘紀、良知 姿子、境 真由美、二宮 英彰、田代 信維、岩田 仲生、尾崎 紀夫、服巻 保幸

    第51回日本人類遺伝学会大会  2006年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:米子   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体サブユニットGluR1,GluR2遺伝子(GRIA1,GRIA2)の多型と統合失調症との関連解析

    新井 伸作, 柴田 弘紀, 境 真由美, 高司 雅史, 小島 理恵子, 菊田 るみこ, 二宮 英彰, 服巻 保幸

    分子生物学会2006フォーラム  2006年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • グルタミン酸脱炭酸酵素遺伝子GAD2とグルタミン合成酵素遺伝子GLULの多型と統合失調症との関連解析

    新井伸作、柴田弘紀、境 真由美、二宮秀彰、岩田仲生、尾崎紀夫、服巻保幸

    第52回日本人類遺伝学会、  2007年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • Association study of polymorphisms in the neutral amino acid transporter genes SLC1A4, SLC1A5 and the glycine transporter genes SLC6A9, SLC6A5 with schizophrenia. 国際会議

    Deng X, Sagata N, Takeuchi N,Tanaka M, Shibata H, Ninomiya H, Iwata N, Ozaki N, Fukumaki Y.

    The XVth World Congress of Psychiatric Genetics  2007年10月 

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    開催地:米国ニューヨーク   国名:日本国  

  • イオンチャンネル型グルタミン酸受容体遺伝子群14種の上流調節領域の分子進化学的解析

    渡邉和典、田中邦佳、後藤大輝、竹中 修、服巻保幸、柴田弘紀

    第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会合同大会、  2007年12月 

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    開催地:横浜   国名:日本国  

  • フェンシクリジン(PCP)応答性遺伝子群を対象とした統合失調症感受性遺伝子の探索

    鄧 湘東、柴田弘紀、黒木俊秀、中原辰雄、橋本喜二郎、二宮英彰、岩田仲生、尾崎紀夫、服巻保幸

    第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会合同大会  2007年12月 

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    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 統合失調症とグルタミン酸脱炭酸酵素遺伝子およびグルタミン合成酵素遺伝子(GAD2, GLUL)の多型との関連解析

    新井伸作、柴田弘紀、境 真由美、二宮秀彰、岩田仲生、尾崎紀夫、服巻保幸

    第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会合同大会  2007年12月 

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    国名:日本国  

  • ヘビ類におけるアルビノ変異の原因遺伝子の解析

    財津将平, 柴田弘紀, 仁田坂 英二

    第53回日本爬虫両棲類学会大会  2014年11月 

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    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸山手大学   国名:日本国  

  • 統合失調症感受性候補領域5q33.1におけるローカスワイド関連解析

    後藤大輝、柴田弘紀、高司雅史、二宮英彰、田代信維、Ngamwong JARUSURAISIN 、服巻保幸

    2005年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Amphiphysin I遺伝子(AMPH)と精神分裂病との関連解析

    村田 慎也、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2001年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体3型遺伝子(GRM3)と精神分裂病との関連解析

    藤井 洋、柴田 弘紀、牧野 千絵子、菊田 るみこ、谷 綾子、平田 直嗣、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2001年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Association study of polymorphisms in the GluR5 kainate receptor gene (GRIK1) with schizophrenia.

    Shibata H, Joo A, Fujii Y, Tani A, Makino C, Hirata N, Kikuta R, Ninomiya H, Tashiro N, Fukumaki Y

    日本分子生物学会年会  2001年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体サブタイプ4(GRIA4)遺伝子と精神分裂病との関連解析

    牧野 千絵子、藤井 洋、菊田 るみこ、谷 綾子、平田 直嗣、柴田 篤志、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2001年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • NMDA型グルタミン酸受容体サブユニット1遺伝子(GRIN1)の5'上流領域における多型:精神分裂病との関連解析

    谷 綾子、菊田 るみこ、伊藤 加奈子、城尾 晶子、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2001年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • グルタミン酸受容体遺伝子群と精神分裂病との関連解析

    柴田 弘紀、谷 綾子、藤井 洋、菊田 るみこ、牧野 千絵子、平田 直嗣、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本遺伝学会大会  2002年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • 多因子病の遺伝因子をさがせ-精神分裂病とグルタミン酸受容体遺伝子群の関連解析

    柴田 弘紀

    日本遺伝学会大会  2002年10月 

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    会議種別:シンポジウム・ワークショップ パネル(公募)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Association studies of the metabotropic glutamate receptor genes, GRM3 and GRM4, with schizophrenia. 国際会議

    Tani A, Fujii Y, Shibata H, Kikuta R, Makino C, Hirata N, Shibata A, Ninomiya T, Tashiro N, Fukumaki Y.

    The Xth World Congress of Psychiatric Genetics.  2002年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Brussels   国名:ベルギー王国  

  • Association study of the metabotropic glutamate receptor type 3 gene (GRM3) with schizophrenia in the Thai population. 国際会議

    Jarusuraisin N, Takaji M, Shibata H, Fukumaki Y.

    4th HUGO Pacific Meeting and 5th Asia-Pacific Conference on Human Genetics.  2002年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Pattaya   国名:タイ王国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体3型、4型および7型遺伝子(GRM3、GRM4、GRM7)における多型の精神分裂病との関連解析

    谷 綾子、柴田 弘紀、藤井 洋、平田 直嗣、高司 雅史、築原 智之、牧野 千絵子、菊田 るみこ、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本人類遺伝学会大会  2002年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • カイニン酸型およびAMPA型グルタミン酸受容体遺伝子(GRIK2、GRIA3、GRIA4)と精神分裂病との関連解析

    柴田 弘紀、菊田 るみこ、牧野 千絵子、藤井 洋、平田 直嗣、谷 綾子、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本人類遺伝学会大会  2002年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:名古屋   国名:日本国  

  • ラットubiquitin-activating enzyme E1, Chr X遺伝子(Ube1x)のメタンフェタミン投与による発現変化とUBE1の統合失調症(精神分裂病)との関連解析

    平田 直嗣、濱村 みつ子、柴田 弘紀、小澤 秀俊、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体サブタイプ3遺伝子(GRIA3)と統合失調症(精神分裂病)との関連解析

    菊田 るみこ、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Identification of single-nucleotide polymorphisims in the human N-methyl D-aspartate receptor subunit NR2D gene (GRIN2D) and association study with schizophrenia.

    Chieko Makino, Toshihiro Aramaki, Hiroki Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Association study of polymorphisms in the GluR6 kainate receptor gene (GRIK2) with schizophrenia.

    Hiroki Shibata, Atsushi Shibata, Hideaki Ninomiya, Nobutada Tashiro, Yasuyuki Fukumaki

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体3型遺伝子(GRM3)と統合失調症(精神分裂病)との関連解析II ミ GRM3内の統合失調症感受性を決定する多型の検出

    高司 雅史、藤井 洋、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体8型遺伝子(GRM8)と統合失調症(精神分裂病)との関連解析

    高木 宏美、菊田 るみこ、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体4型および1型遺伝子(GRM4, GRM1)における多型と統合失調症(精神分裂病)との関連解析

    谷 綾子、向野 雅彦、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体7型遺伝子(GRM7)と統合失調症(精神分裂病)との関連解析

    築原 智之、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2002年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:横浜   国名:日本国  

  • Association studies of schizophrenia with evenly distributed SNPs in the metabotropic glutamate receptor gene regions. 国際会議

    Fukumaki Y, Tani A, Takaji M, Fujii Y, Shibata H.

    Human Genome Meeting 2003  2003年4月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Cancun   国名:メキシコ合衆国  

  • Association study of polymorphisms in the glutamate receptor genes, GRIK2, GRIA4, and GRM3 with Japanese schizophrenia. 国際会議

    Shibata H, Fujii Y, Makino C, Kikuta R, Hirata N, Tani A, Takaji M, Shibata A, Ninomiya H, Tashiro N, Fukumaki Y.

    International Congress of Genetics  2003年7月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Melbourne   国名:オーストラリア連邦  

  • 統合失調症の遺伝解析の現状

    柴田 弘紀、服巻 保幸

    日本進化学会大会  2003年8月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:福岡   国名:日本国  

  • Association studies of schizophrenia with the metabotropic glutamate receptor genes, GRM1, GRM5 regions. 国際会議

    Kikuta R, Tani A, Takaki, H, Takaji M, Shibata H, Ninomiya H, Tashiro N, Fukumaki Y.

    World Congress of Psychiatric Genetics  2003年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Quebec   国名:カナダ  

  • 代謝型グルタミン酸受容体1型、5型遺伝子(GRM1、GRM5)と統合失調症との関連解析

    菊田 るみこ、谷 綾子、高木 宏美、向野 雅彦、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本人類遺伝学会大会  2003年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎   国名:日本国  

  • NMDA型グルタミン酸受容体サブユニットNR2D遺伝子(GRIN2D)の多型検索と統合失調症との関連解析

    柴田 弘紀、牧野 千絵子、二宮 英彰、田代 信雄、服巻 保幸

    日本人類遺伝学会大会  2003年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎   国名:日本国  

  • 等間隔に配置したSNPによる代謝型グルタミン酸受容体遺伝子群と統合失調症との関連解析

    服巻 保幸、柴田 弘紀、谷 綾子、藤井 洋、高木 宏美、平田 直嗣、菊田 るみこ、牧野 千絵子、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信維

    日本精神行動遺伝医学会  2003年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:長崎   国名:日本国  

    服巻 保幸、柴田 弘紀、谷 綾子、藤井 洋、高木 宏美、平田 直嗣、菊田 るみこ、牧野 千絵子、柴田 篤志、二宮 英彰、田代 信維

  • Association study of polymorphisms in two metabotropic glutamate receptor genes, GRM3 and GRM8 with schizophrenia. 国際会議

    Shibata H, Fujii Y, Takaji M, Takaki H, Kikuta R, Makino C, Tani A, Hirata N, Shibata A, Ninomiya H, Tashiro N, Fukumaki Y.

    American Society of Human Genetics  2003年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Los Angeles   国名:日本国  

  • Association and linkage disequilibrium between synapsin 2 and complexin2 gene and Korean schizophrenia. 国際会議

    Lee HJ, Kim JW, Kim MK, Kim SJ, Jin SY, Hong MS, Park HJ, Shin DH, Chung J, Shibata H, Fukumaki Y.

    American Society of Human Genetics  2003年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Los Angeles   国名:アメリカ合衆国  

  • 興奮性グルタミン酸トランスポーターEAAT2遺伝子(SLC1A2)の多型と統合失調症との関連解析

    鄧 湘東、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2003年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体サブタイプ1型遺伝子(GRIA1)と統合失調症との関連解析

    高司 雅史、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、岩田 仲生、尾崎 紀夫、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2003年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • 代謝型グルタミン酸受容体5型遺伝子(GRM5)の多型と統合失調症との関連解析

    菊田 るみこ、高木 宏美、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2003年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • カイニン酸型グルタミン酸受容体4型遺伝子(GRIK4)と統合失調症との関連解析

    柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2003年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • カイニン酸型グルタミン酸受容体サブタイプ3型遺伝子(GRIK3)と統合失調症との関連解析

    荒巻 敏寛、柴田 弘紀、二宮 英彰、田代 信維、岩田 仲生、尾崎 紀夫、服巻 保幸

    日本分子生物学会年会  2003年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • グルタミン酸トランスポーターEAAT2遺伝子(SLC1A2)およびEAAT3遺伝子(SLC1A1)と統合失調症との関連解析

    服巻 保幸、鄧 湘東、柴田 弘紀、岩田 仲生、尾崎 紀夫、二宮 英彰、田代 信維

    第12回日本精神行動遺伝医学会  2004年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

  • Association studies of schizophrenia with the ionotropic and metabotropic glutamate receptor genes.

    Fukumaki Y, Kikuta R, Makino C, Shibata H, Ninomiya H, Tashiro N.

    54th Annual Meeting of The American Society of Human Genetics.  2004年10月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Toronto   国名:カナダ  

  • Association study of polymorphisms in the GluR6, GluR7, KA1 and KA2 kainate receptor genes (GRIK2, GRIK3, GRIK4, GRIK5) with schizophrenia. 国際会議

    Shibata H, Aramaki T, Shibata A, Sakai M, Ninomiya H, Tashiro N, Iwata N, Ozaki N, Fukumaki Y.

    5th HUGO Pacific Meeting and 5th Asia-Pacific Conference on Human Genetics  2004年11月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:Biopolis   国名:シンガポール共和国  

  • グリシントランスポーター1型及び2型遺伝子(SLC6A9, SLC6A5)と統合失調症との関連解析

    佐方功明、田中正視、柴田弘紀、二宮 英彰、田代 信維、岩田仲生、尾崎紀夫、服巻 保幸

    第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Association study of the glutamate transporter gene, SLC1A1 with schizophrenia in the Japanese population.

    Deng X, Shibata H, Ninomiya H, Tashiro N, Fukumaki Y.

    第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体2型遺伝子(GRIA2)及びカイニン酸型グルタミン酸受容体5型遺伝子(GRIK5)と統合失調症との関連解析

    柴田弘紀、小島理恵子、二宮 英彰、田代 信維、服巻 保幸

    第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • AMPA型グルタミン酸受容体サブタイプ3遺伝子(GRIA3)と統合失調症との関連解析

    菊田るみこ、柴田弘紀、二宮 英彰、田代 信維、服巻 保幸

    第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:神戸   国名:日本国  

  • Association study of the glutamate transporter genes, SLC1A1 and SLC1A2 with schizophrenia in the Japanese population. 国際会議

    Deng X, Shibata H, Ninomiya H, Tashiro N, Iwata N, Ozaki N, Fukumaki Y.

    Humann Genome Meeting 2005  2005年4月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:京都   国名:日本国  

  • 脳機能と遺伝子多型の関連の研究 I. 記憶と代謝型グルタミン酸受容体遺伝子多型

    實藤雅文、濱本香織、吉良龍太郎、柴田弘紀、中島大輔、鳥巣浩幸、酒井康成、武本環美、岩山真理子、服巻保幸、原 寿郎

    第47回日本小児神経学会総会  2005年5月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:熊本   国名:日本国  

  • 脊髄小脳失調症16型の遺伝解析

    三浦史郎、柴田弘紀、古谷博和、松永宏美、三好安、小副川学、大八木保政、山田猛、谷脇考恭、吉良潤一、服巻保幸

    第50回日本人類遺伝学会大会  2005年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:倉敷   国名:日本国  

  • 5q33.1領域における統合失調症感受性遺伝子の検索

    後藤大輝、柴田弘紀、高司雅史、二宮英彰、田代信維、服巻保幸

    第50回日本人類遺伝学会大会  2005年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:倉敷   国名:日本国  

    Locus-wide association study in the 5q33.1 region for schizophrenia susceptibility genes.

  • グルタミン酸受容体遺伝子群のヒトとチンパンジーにおける分子進化学的解析

    柴田弘紀、後藤大輝、田中邦佳、黒木陽子、豊田 敦、服部正平、榊 佳之、藤山秋佐夫、服巻保幸

    第77回日本遺伝学会大会  2005年9月 

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    会議種別:口頭発表(一般)  

    開催地:東京   国名:日本国  

    Molecular evolution of the glutamate receptor gene family since the human-chimpanzee divergence.

  • 孤発性young-onset Parkinson's diseaseの遺伝解析

    三浦 史郎, 渡邊 笑奈, 比留木 成美, 森川 拓弥, 内山 雄介, 柴田 弘紀

    臨床神経学  2023年9月  (一社)日本神経学会

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    記述言語:日本語  

  • 動物毒って特異性が高いだけじゃない!どんどん拡がる面白い世界 毒蛇ハブのゲノム解析で明らかになった毒液タンパク質遺伝子の進化

    柴田 弘紀, 上田 直子, 千々岩 崇仁, 中村 仁美, 服部 正策, 服巻 保幸, 大野 素徳, 佐藤 矩行, 小川 智久

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2023年10月  (公社)日本生化学会

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    記述言語:日本語  

  • 動物毒って特異性が高いだけじゃない!どんどん拡がる面白い世界 ベノミクス研究により明らかになった毒蛇ハブの新規毒成分の機能と毒関連特殊機能の進化

    小川 智久, 柴田 弘紀, 上田 直子, 佐藤 矩行, 服部 正策, 日高 將文, 二井 勇人

    日本生化学会大会プログラム・講演要旨集  2023年10月  (公社)日本生化学会

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    記述言語:日本語  

  • NBEA遺伝子の新規ミスセンス変異は発作性運動誘発性ジスキネジアの原因となりうる

    三浦 史郎, 鎌田 崇嗣, 下條 智史, 森川 拓弥, 内山 雄介, 柴田 弘紀

    臨床神経学  2022年10月  (一社)日本神経学会

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    記述言語:日本語  

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MISC

  • 「ベノミクス研究」の最前線:動物毒は,どのように進化してきたのか?

    小川智久, 柴田弘紀.

    化学と生物   2019年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

    35 億年あまりの永い進化の産物である地球上の多種多様な生物. それらのなかには「毒素」という武器をもつ生物も存在します. これらの毒生物は, どのように進化して毒をもつに至ったのでしょうか? 近年ゲノム解析技術の進展により, モデル生物以外のゲノムも解析することが可能となり, 生物進化を読み解くための一つの重要なツールとなっています. 毒動物のゲノム解読や個々の毒成分の全容をプロテオームやトランスクリプトーム解析により明らかにする「ベノミクス研究」も進められてきました. ここでは, 毒蛇ハブのゲノム解読を中心に, 「ベノミクス研究」の最前線について解説します.

  • 統合失調症のリスク変異に関する進化的考察

    柴田弘紀

    生物の科学 遺伝   2013年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • Glutamate receptor genes as candidates for schizophrenia susceptibility

    Fukumaki Y, Shibata H

    Drug Develop Res.   2003年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • 連鎖不平衡

    柴田弘紀

    分子精神医学 先端医学社   2003年4月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

  • RNAプライマーを用いたPCR

    古川宗一郎、柴田弘紀、林 健志

    実験医学増刊 (林 健志他編) 羊土社   1997年1月

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    記述言語:日本語   掲載種別:記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)  

産業財産権

特許権   出願件数: 1件   登録件数: 2件
実用新案権   出願件数: 0件   登録件数: 0件
意匠権   出願件数: 0件   登録件数: 0件
商標権   出願件数: 0件   登録件数: 0件

所属学協会

  • 日本人類遺伝学会

  • 米国人類遺伝学会

  • 日本分子生物学会

  • 日本遺伝学会

  • 日本進化学会

  • 日本爬虫両棲類学会

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委員歴

  • 日本遺伝学会   評議員   国内

    2023年4月 - 2024年3月   

学術貢献活動

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2023年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:10

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2022年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:8

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2021年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:8

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2020年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:8

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2019年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:3

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2018年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:3

  • 学術論文等の審査

    役割:査読

    2017年

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    種別:査読等 

    外国語雑誌 査読論文数:3

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 眼症状を伴う遺伝性神経筋疾患の新規疾患単位の確立

    研究課題/領域番号:23K06853  2023年4月 - 2027年3月

    科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    三浦 史郎, 柴田 弘紀

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    資金種別:科研費

    白内障や網膜色素変性症といった眼科的疾患と痙性対麻痺やミオパチーといった内科的疾患を同時に患っている患者は少なくないと思われるが、実臨床では別々の疾患として眼科や内科・小児科に通院されているケースが多いと推測される。研究代表者は眼症状と神経筋症状が単一の遺伝的原因で生じていると考えられる2家系を見出した。1家系目は若年発症の網膜色素変性症、精神発達遅滞、側弯症を伴う筋萎縮症家系であるが、遺伝性筋疾患や遺伝性ニューロパチーの既知責任遺伝子に変異を認めず、2家系目は先天性白内障を伴う痙性対麻痺家系である。本研究では、各疾患の臨床像および責任遺伝子変異を明らかにする。

    CiNii Research

  • 協和キリン奨学寄附金/人工抗毒素産生系開発にむけた毒蛇咬症患者の高精度レパトア情報の整備

    2023年

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    資金種別:寄附金

  • ゲノム情報に基づく動物特殊機能の進化および分子基盤解明と高機能センサーへの展開

    研究課題/領域番号:22K19097  2022年6月 - 2024年3月

    科学研究費助成事業  挑戦的研究(萌芽)

    小川 智久, 柴田 弘紀

      詳細を見る

    資金種別:科研費

    本研究は,マムシ亜科毒ヘビが特異的に持つピット器官受容体であるTRPチャネルの構造と機能,および進化を明らかにし,生物進化に基づく新規センサーデバイス開発に資する。そのため,ヒメハブゲノム解読によるTRPチャネル群の遺伝子構造と進化の解明,TRPチャネルタンパク質の機能解析,クライオ電子顕微鏡による構造解析と赤外線感受機構の解明を行う。特殊機能の作用機序の解明は,「加速進化のメカニズム 」など動物進化のパラダイム的転換を図るものとなり,本研究を挑戦的研究として進める意義がある。

    CiNii Research

  • 協和キリン奨学寄附金/人工抗毒素産生系開発に向けた免疫ウマの一細胞レパトア解析

    2022年

      詳細を見る

    資金種別:寄附金

  • 第一三共奨学寄付プログラム/発作性運動誘発性ジスキネシアの新規責任遺伝子同定と病態解明に関する研究

    2021年

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    資金種別:寄附金

  • 協和キリン奨学寄附金/人工抗毒素産生系開発に向けた免疫ウマの一細胞レパトア解析

    2021年

      詳細を見る

    資金種別:寄附金

  • アジアのコブラ類の全ゲノム解析 国際共著

    2019年6月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究分担者 

  • 第一三共奨学寄付プログラム/発作性運動誘発性ジスキネシアの遺伝解析研究

    2019年

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    資金種別:寄附金

  • ゲノム情報を用いたハブ毒タンパク質の包括的多様性および進化過程の解明

    研究課題/領域番号:18H02498  2018年 - 2021年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    柴田 弘紀, 小川 智久

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

    沖縄本島、小宝島、西表島産個体の全ゲノムアセンブリを取得し(先進ゲノム支援による)、金属プロテアーゼなどの毒液タンパク質遺伝子族で、集団間でクラスター構造が異なることを見出した。また14島計150個体のmtDNA配列を取得し集団遺伝学的解析を行い、ハブの集団構造には地理的要因が強く影響することを示した。また、9島47個体の毒腺のRNAseqで、集団間で有意に発現量の異なる遺伝子を同定したが毒液タンパク質遺伝子はほぼ含まれていなかった。一方毒液の2D解析では、集団間で発現パターンの明確な違いが観察された。そのため毒液タンパク質発現の集団間の差異は、翻訳/修飾レベルで生じている可能性が示唆された。

    CiNii Research

  • 第一三共奨学寄付プログラム/発作性運動誘発性ジスキネシアの遺伝解析研究

    2018年

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    資金種別:寄附金

  • 第一三共奨学寄付プログラム/発作性運動誘発性ジスキネシアの遺伝解析研究

    2017年

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    資金種別:寄附金

  • 遺伝子間相互作用解析を活用した口唇口蓋裂疾患感受性遺伝子の解明

    研究課題/領域番号:16K11689  2016年 - 2019年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者  資金種別:科研費

  • エイジングに伴うエピゲノム変化に注目した糖尿病バイオマーカーの解明(岩谷千寿)

    2016年 - 2017年

    日本学術振興会  特別研究員

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    資金種別:共同研究

  • 痙性対麻痺のモデルマウスの解析

    2014年4月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究代表者 

  • 第1番染色体に連鎖する新規遺伝性ニューロパチーの分子基盤解明

    研究課題/領域番号:26460411  2014年 - 2016年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究分担者  資金種別:科研費

  • ミトゲノム解析と核マーカータイピングによる日本産ハブ属3種の遺伝的集団構造の研究

    研究課題/領域番号:25440214  2013年 - 2015年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • 日本固有の毒蛇ハブの島嶼集団間の多様性解析

    2012年4月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究代表者 

  • 毒蛇ハブとその近縁種の全ゲノム解析

    2012年4月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究代表者 

  • 日本固有の毒蛇ハブの全遺伝子カタログ作成

    2011年9月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究代表者 

  • 連鎖解析と次世代シークエンサによるターゲッテドリシークエンスによる疾患責任変異探索

    2010年4月

    九州大学生体防御医学研究所 

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    担当区分:研究代表者 

  • 統合失調症感受性遺伝子多型の進化医学的解析

    研究課題/領域番号:21590360  2009年 - 2011年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • ヒト高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析

    研究課題/領域番号:20017021  2008年 - 2009年

    科学研究費助成事業  特定領域研究

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • 精神疾患関連遺伝子群の分子進化学的研究

    2007年4月

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    担当区分:研究代表者 

  • ヒト高次脳機能関連遺伝子群の分子進化学的解析

    研究課題/領域番号:20017021  2007年 - 2008年

    科学研究費助成事業  特定領域研究

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • 統合失調症関連遺伝子群を突破口とした”humanness”の起源の解明

    研究課題/領域番号:18017020  2006年 - 2007年

    科学研究費助成事業  特定領域研究

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • グルタミン酸受容体遺伝子群のヒト上科における多様性と”humanness”の起源

    研究課題/領域番号:17018027  2005年

    科学研究費助成事業  特定領域研究

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • ローカスワイド関連解析による統合失調症感受性遺伝子の探索と同定〜多面的アプローチによる候補遺伝子探索と大規模検体による関連解析

    2005年

    第37回内藤記念科学奨励金(研究助成)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:受託研究

  • グルタミン酸受容体遺伝子群のチンパンジー配列の決定と比較解析

    2004年4月

    九州大学 生体防御医学研究所 遺伝情報実験センター ゲノム機能学 (日本) 

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    担当区分:研究代表者 

  • 統合失調症モデル動物脳における遺伝子発現:DNA microarrayによる解析

    2003年4月

    国立肥前療養所(日本) 

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    担当区分:研究分担者 

  • 精神分裂病感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の包括的研究

    2002年4月

    九州大学 生体防御医学研究所 遺伝情報実験センター ゲノム機能学(日本) 

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    担当区分:研究代表者 

  • 精神分裂病感受性遺伝子としてのグルタミン酸受容体遺伝子群の包括的研究

    研究課題/領域番号:14704056  2002年 - 2004年

    科学研究費助成事業  若手研究(A)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

  • グルタミン酸受容体遺伝子群の多型検索及び精神分裂病との相関解析

    2000年4月 - 2002年3月

    九州大学 生体防御医学研究所 遺伝情報実験センター ゲノム機能学 (日本) 

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    担当区分:研究代表者 

  • グルタミン受容体遺伝子群の多型検索及び精神分裂病との相関解析

    研究課題/領域番号:12771455  2000年 - 2001年

    科学研究費助成事業  奨励研究(A)

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    担当区分:研究代表者  資金種別:科研費

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教育活動概要

  • 歯学部の「人類遺伝学」を主宰している(平成26年〜)。
    理学部生物学科の「人類遺伝学」を主宰している(平成25年〜)。
    医学部の「遺伝学/生体の構造と機能 VI」を一部担当している(平成26年〜)。
    システム生命科学府の「生命医科学特論」を一部担当している(平成29年〜)。
    システム生命科学府の「ゲノム医科学基礎」を主宰した(平成25年〜平成26年)。
    システム生命科学府の「ゲノム医科学特論」を主宰した(平成25年〜平成30年)。
    医学部生命科学科の「生命医科学概論 I」を一部担当した(平成25年)。
    医学部の「生命医科学研究入門」を一部担当している(平成27年〜)。
    基幹教育科目の「最新トピックスから学ぶ生命科学入門」を一部担当している(平成28年〜)。
    韓国・慶煕大学で統合失調症の遺伝解析に関する特別講議を行った(2003年6月3日)

担当授業科目

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2024年4月 - 2024年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2024年4月 - 2024年9月   前期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門

    2023年12月 - 2024年2月   冬学期

  • 生命医科学研究入門

    2023年10月 - 2024年3月   後期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2023年10月 - 2024年3月   後期

  • 生命医科学特論 III

    2023年6月 - 2023年8月   夏学期

  • ゲノム医科学講究

    2023年4月 - 2024年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーI

    2023年4月 - 2024年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2023年4月 - 2024年3月   通年

  • 人類遺伝学(理学部)

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2023年4月 - 2023年9月   前期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門

    2022年12月 - 2023年2月   冬学期

  • 生命医科学研究入門

    2022年10月 - 2023年3月   後期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2022年10月 - 2023年3月   後期

  • ゲノム医科学講究

    2022年4月 - 2023年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーI

    2022年4月 - 2023年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2022年4月 - 2023年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2022年4月 - 2022年9月   前期

  • 生命医科学特論 I

    2022年4月 - 2022年6月   春学期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門

    2021年12月 - 2022年2月   冬学期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2021年10月 - 2022年3月   後期

  • 生命医科学特論IV

    2021年6月 - 2021年8月   夏学期

  • ゲノム医科学講究

    2021年4月 - 2022年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーI

    2021年4月 - 2022年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2021年4月 - 2022年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2021年4月 - 2021年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2021年4月 - 2021年9月   前期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門

    2020年12月 - 2021年2月   冬学期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2020年10月 - 2021年3月   後期

  • 生命医科学特論IV

    2020年10月 - 2020年12月   秋学期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2020年4月 - 2021年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2020年4月 - 2021年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2020年4月 - 2021年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2020年4月 - 2020年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2020年4月 - 2020年9月   前期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2019年10月 - 2020年3月   後期

  • 生命医科学特論IV

    2019年10月 - 2019年12月   秋学期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門Ⅲ

    2019年10月 - 2019年12月   秋学期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2019年4月 - 2020年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2019年4月 - 2020年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2019年4月 - 2020年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2019年4月 - 2019年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2019年4月 - 2019年9月   前期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2018年10月 - 2019年3月   後期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門Ⅲ

    2018年10月 - 2018年12月   秋学期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2018年4月 - 2019年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2018年4月 - 2019年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2018年4月 - 2019年3月   通年

  • 生命医科学研究入門

    2018年4月 - 2018年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2018年4月 - 2018年9月   前期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2018年4月 - 2018年9月   前期

  • 生命医科学特論I

    2018年4月 - 2018年6月   春学期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門 II

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • ゲノム医科学特論

    2017年10月 - 2018年3月   後期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2017年4月 - 2018年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2017年4月 - 2018年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2017年4月 - 2018年3月   通年

  • 生命医科学研究入門

    2017年4月 - 2017年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2017年4月 - 2017年9月   前期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2017年4月 - 2017年9月   前期

  • 生命医科学特論I

    2017年4月 - 2017年6月   春学期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 最新トピックスから学ぶ生命科学入門 II

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 生命医科学研究入門

    2016年10月 - 2017年3月   後期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2016年4月 - 2017年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2016年4月 - 2017年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2016年4月 - 2017年3月   通年

  • ゲノム医科学基礎

    2016年4月 - 2016年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2016年4月 - 2016年9月   前期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2016年4月 - 2016年9月   前期

  • ゲノム医科学特論

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 生命医科学研究入門

    2015年10月 - 2016年3月   後期

  • 学際開拓創成セミナーI

    2015年4月 - 2016年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2015年4月 - 2016年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2015年4月 - 2016年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2015年4月 - 2015年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2015年4月 - 2015年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2015年4月 - 2015年9月   前期

  • ゲノム医科学特論

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 遺伝学/生体の構造と機能 VI

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • 生命科学概論 I

    2014年10月 - 2015年3月   後期

  • ゲノム医科学講究

    2014年4月 - 2015年3月   通年

  • 生命医科学特別研究

    2014年4月 - 2015年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーI

    2014年4月 - 2015年3月   通年

  • ゲノム医科学基礎

    2014年4月 - 2014年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2014年4月 - 2014年9月   前期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2014年4月 - 2014年9月   前期

  • 生命科学概論 I

    2013年10月 - 2014年3月   後期

  • 生命医科学特別研究

    2013年4月 - 2014年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーI

    2013年4月 - 2014年3月   通年

  • 学際開拓創成セミナーII

    2013年4月 - 2014年3月   通年

  • ゲノム医科学講究

    2013年4月 - 2014年3月   通年

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2013年4月 - 2013年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2013年4月 - 2013年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2013年4月 - 2013年9月   前期

  • ゲノム医科学特論

    2012年10月 - 2013年3月   後期

  • 人類遺伝学(歯学部)

    2012年4月 - 2012年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2012年4月 - 2012年9月   前期

  • 人類遺伝学(理学部)

    2012年4月 - 2012年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2011年10月 - 2012年3月   後期

  • 人類遺伝学

    2011年4月 - 2011年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2011年4月 - 2011年9月   前期

  • 人類生物学

    2011年4月 - 2011年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2010年10月 - 2011年3月   後期

  • 人類遺伝学

    2010年4月 - 2010年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2010年4月 - 2010年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2010年4月 - 2010年9月   前期

  • 人類生物学

    2010年4月 - 2010年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2009年4月 - 2009年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2009年4月 - 2009年9月   前期

  • ゲノム医科学基礎

    2009年4月 - 2009年9月   前期

  • 人類生物学

    2009年4月 - 2009年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2008年10月 - 2009年3月   後期

  • 人類遺伝学

    2008年4月 - 2008年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2008年4月 - 2008年9月   前期

  • ゲノム機能学基礎

    2008年4月 - 2008年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2007年10月 - 2008年3月   後期

  • ゲノム機能学基礎

    2007年4月 - 2007年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2007年4月 - 2007年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2007年4月 - 2007年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2006年10月 - 2007年3月   後期

  • ゲノム機能学基礎

    2006年4月 - 2006年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2006年4月 - 2006年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2006年4月 - 2006年9月   前期

  • ゲノム機能学特論

    2005年10月 - 2006年3月   後期

  • ゲノム機能学基礎

    2005年4月 - 2005年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2005年4月 - 2005年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2005年4月 - 2005年9月   前期

  • ゲノム機能学基礎

    2004年4月 - 2004年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2004年4月 - 2004年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2004年4月 - 2004年9月   前期

  • ゲノム機能学基礎

    2003年4月 - 2003年9月   前期

  • 人類遺伝学

    2003年4月 - 2003年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2003年4月 - 2003年9月   前期

  • 生物物理学研究法

    2002年4月 - 2002年9月   前期

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FD参加状況

  • 2023年8月   役割:参加   名称:SENTAN-Q の目指すもの:九州大学におけるダイバーシティ推進

    主催組織:部局

  • 2023年4月   役割:参加   名称:職場における落とし穴

    主催組織:部局

  • 2021年12月   役割:参加   名称:学術論文の購読と投稿とこれから

    主催組織:部局

  • 2021年7月   役割:参加   名称:ハゲタカジャーナルの実態と対策

    主催組織:部局

  • 2020年12月   役割:参加   名称:システム生命科学府「障害のある学生の合理的配慮」に関するFD

    主催組織:部局

  • 2020年11月   役割:参加   名称:令和2年度馬出地区4部局合同男女共同参画FD

    主催組織:部局

  • 2019年10月   役割:参加   名称:令和元年度馬出地区4部局合同男女共同参画FD

    主催組織:部局

  • 2019年2月   役割:参加   名称:情報セキュリティ関連FD

    主催組織:部局

  • 2018年10月   役割:参加   名称:医師のための働き方見直し〜ワークライフバランスとダイバーシティの観点から〜

    主催組織:部局

  • 2016年10月   役割:参加   名称:馬出地区キャンパスFD「なぜ今『女性活躍推進法』か?    —男女共同参画の必要性と九州大学における取組み—」

    主催組織:部局

  • 2016年6月   役割:参加   名称:平成28年度第2回 全学FD「教育の質向上支援プログラム成果発表会」

    主催組織:全学

  • 2011年12月   役割:参加   名称:システム生命科学府FD「システム生命科学府のグローバル化について」

    主催組織:部局

  • 2010年10月   役割:参加   名称:システム生命科学府FD「アカデミックハラスメントについてー問題の共有と防止に向けてー」

    主催組織:部局

  • 2009年1月   役割:参加   名称:平成20年度第3回 全学FD「教育GPを通じた教育改革」

    主催組織:全学

  • 2008年12月   役割:参加   名称:システム生命科学府平成20年度FDセミナー「大学院教育GPについて」

    主催組織:部局

  • 2008年2月   役割:参加   名称:システム生命科学府FD研修会「研究・教育者等のキャリアパスの育成と課題について」

    主催組織:部局

  • 2007年4月   役割:参加   名称:平成19年第1回 全学FD「新任教員の研修」

    主催組織:全学

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他大学・他機関等の客員・兼任・非常勤講師等

  • 2024年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2023年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2022年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2021年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2020年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2019年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2018年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2017年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2016年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2015年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2014年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2013年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2012年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2011年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

  • 2010年  福岡大学  区分:非常勤講師  国内外の区分:国内 

    学期、曜日時限または期間:前期

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社会貢献・国際連携活動概要

  • 「バイオインフォマティクス夏の学校」に講師として参加しPCRに関する実習を行った(2010年7月4日)
    「ミニゲノムひろば2009 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2009年12月20日)
    「ゲノムひろば2009 in アキバ」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2009年08月01-02日)
    「ミニゲノムひろば2008 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2008年12月21日)
    「ゲノムひろば2008 in 名古屋」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2008年10月25-26日)
    「ミニゲノムひろば2007 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2007年12月23日)
    「ミニゲノムひろば2006 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2006年12月10日)
    「ゲノムひろば2005 in 福岡〜生命のからくりを分子でみる」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2005年12月11日)
    「ゲノムひろば2004 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2004年07月31-08月01日)
    九州北部税理士会博多支部研修会において「DNAの不思議」と題したセミナーをおこなった(2003年12月04日)
    「ゲノムひろば2003 in 京都」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2003年11月08-09日)
    「ゲノムひろば2003 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2003年11月01-02日)
    「ゲノムひろば2002 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した(2002年11月16-17日)

社会貢献活動

  • 「バイオインフォマティクス夏の学校」に講師として参加しPCRに関する実習を指導した。

    福岡県高等学校生物部会、九州大学大学院システム生命科学府  九州大学大学院 システム生命科学府講義棟  2010年7月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:セミナー・ワークショップ

  • 「ミニゲノムひろば2009 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  エルガーラ 大ホール 福岡  2009年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2009 in アキバ」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  AKIBA_SQUARE 秋葉原  2009年8月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ミニゲノムひろば2008 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  パピヨン24 ガスホール 福岡  2008年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2008 in 名古屋」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  名古屋大学 豊田講堂・シンポジオンホール  2008年10月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ミニゲノムひろば2007 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  イムズホール 福岡  2007年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ミニゲノムひろば2006 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  イムズホール 福岡  2006年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2005 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  エルガーラホール 福岡  2005年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2004 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  エルガーラホール 福岡  2004年7月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 九州北部税理士会博多支部で「DNAの不思議」と題した研修会を行った

    九州北部税理士会  九州北部税理士会博多支部  2003年12月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:セミナー・ワークショップ

  • 「ゲノムひろば2003 in 京都」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  京都三井ホール  2003年11月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2003 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  エルガーラホール 福岡  2003年11月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

  • 「ゲノムひろば2002 in 福岡」に参加し一般の方々に研究成果を報告した

    文部科学省科学研究費 特定領域研究ゲノム4領域  エルガーラホール 福岡  2002年11月

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    対象:社会人・一般, 学術団体, 企業, 市民団体, 行政機関

    種別:講演会

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メディア報道

  • ハブ毒オミクス研究の紹介(スタジオ出演) テレビ・ラジオ番組

    NHK「サイエンスZero」  2022年7月

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    ハブ毒オミクス研究の紹介(スタジオ出演)

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    子供の科学(2018年10月号)  2018年10月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    赤旗  2018年8月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    産経新聞  2018年8月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    南海日日新聞  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の論文発表にともなう研究の紹介 テレビ・ラジオ番組

    琉球朝日放送(QAB)  2018年7月

     詳細を見る

    ハブ全ゲノム解読の論文発表にともなう研究の紹介

  • ハブ全ゲノム解読の論文発表にともなう研究の紹介 テレビ・ラジオ番組

    琉球放送(RBC)  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の論文発表にともなう研究の紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    朝日新聞  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    読売新聞  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    琉球新報  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

  • ハブ全ゲノム解読の研究紹介 新聞・雑誌

    沖縄タイムス  2018年7月

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    ハブ全ゲノム解読の研究紹介

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海外渡航歴

  • 2019年12月

    滞在国名1:台湾   滞在機関名1:国立清華大学

  • 2003年6月

    滞在国名1:大韓民国   滞在機関名1:慶煕大学

学内運営に関わる各種委員・役職等

  • 2023年4月 - 現在   全学 九州大学動物実験委員会 委員

  • 2023年4月 - 現在   全学 九州大学遺伝子組換え実験安全管理委員会 副委員長

  • 2021年7月 - 2023年3月   地区 九州大学医系地区部局観察研究倫理審査委員会 委員

  • 2021年4月 - 2023年3月   全学 九州大学遺伝子組換え実験安全管理委員会 委員

  • 2018年4月 - 2020年3月   全学 入学者選抜研究委員会委員

  • 2015年4月 - 現在   全学 九州大学アイソトープ統合安全管理センター委員会委員

  • 2015年4月 - 2021年6月   地区 九州大学医系地区部局ヒトゲノム・遺伝子解析研究倫理審査委員会委員

  • 2014年4月 - 現在   全学 九州大学放射線障害防止委員会委員

  • 2014年4月 - 現在   研究所 生体防御医学研究所放射線取扱主任者

  • 2011年4月 - 現在   センター エピゲノムネットワーク研究センター

  • 2010年10月 - 2014年3月   全学 ゲノム解析コンソーシアム構成員

  • 2008年7月 - 2015年3月   全学 アイソトープ総合センター委員会

  • 2005年9月 - 2014年4月   研究所 生体防御医学研究所放射線取扱副主任

  • その他 生体防御医学研究所放射線取扱主任者

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