Updated on 2024/10/07

Information

 

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TSUCHIMOTO DAISUKE
 
Organization
Medical Institute of Bioregulation Research Promotion Unit Assistant Professor
Title
Assistant Professor
Tel
0926426797
Profile
Research of DNA repair and nucleotide pool sanitizing systems of mammals using mice, mouse cells, human cells and recombinant proteins. Support for undergraduate and graduate students in these research fields.
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Degree

  • PhD of Medical Science

Research History

  • 1990年4月-1999年3月 大塚製薬株式会社 研究員 1999年4月-2003年6月 科学技術振興事業団 研究員

    1990年4月-1999年3月 大塚製薬株式会社 研究員 1999年4月-2003年6月 科学技術振興事業団 研究員

Research Interests・Research Keywords

  • Research theme:DNA repair and nucleotide pool sanitizing system in mammalian cells

    Keyword:DNA repair, Base Excision Repair, AP endonuclease, DNA glycosylase, damaged nucleotide

    Research period: 1998.1 - 2020.3

Awards

  • 優秀ポスター賞

    2016.12   日本分子生物学会   第39回日本分子生物学会年会における優秀ポスター賞

Papers

  • APE2 Promotes AID-Dependent Somatic Hypermutation in Primary B Cell Cultures That Is Suppressed by APE1. Reviewed International journal

    Carol E Schrader, Travis Williams, Klaus Pechhold, Erin K Linehan, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)   210 ( 11 )   1804 - 1814   2023.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.4049/jimmunol.2100946

  • APE2 Is a General Regulator of the ATR-Chk1 DNA Damage Response Pathway to Maintain Genome Integrity in Pancreatic Cancer Cells Reviewed International journal

    Md Akram Hossain, Yunfeng Lin, Garrett Driscoll, Jia Li1, Anne McMahon, Joshua Matos, Haichao Zhao, @Daisuke Tsuchimoto, @Yusaku Nakabeppu, Jianjun Zhao and Shan Yan

    Frontiers in cell and developmental biology   2021.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3389/fcell.2021.738502

  • Serum Anti-oligodendrocyte Autoantibodies in Patients With Multiple Sclerosis Detected by a Tissue-Based Immunofluorescence Assay Invited Reviewed International journal

    @Yukino Miyachi , @Takayuki Fujii, @Ryo Yamasaki, @Daisuke Tsuchimoto, @Kyoko Iinuma, @Ayako Sakoda, @Shoko Fukumoto, @Takuya Matsushita, @Katsuhisa Masaki, @Noriko Isobe, @Yusaku Nakabeppu, @Jun-Ichi Kira

    FRONTIERS IN NEUROLOGY   12   2021.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3389/fneur.2021.681980

  • MTH1 and OGG1 maintain a low level of 8-oxoguanine in Alzheimer's brain, and prevent the progression of Alzheimer's pathogenesis. Reviewed International journal

    Sugako Oka, Julio Leon, Kunihiko Sakumi, Nona Abolhassani, Zijing Sheng, Daisuke Tsuchimoto, Frank M LaFerla, Yusaku Nakabeppu

    Scientific reports   11 ( 1 )   5819 - 5819   2021.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-021-84640-9

  • Cisplatin-mediated upregulation of APE2 binding to MYH9 provokes mitochondrial fragmentation and acute kidney injury. Reviewed International journal

    Yi Hu, Chun Yang, Tania Amorim, Mohsin Maqbool, Jenny Lin, Chen Li, Chuanfeng Fang, Li Xue , Ariel Kwart, Hua Fang, Mei Yin, Allison J Janocha, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu, Xiaofeng Jiang, Alex Mejia-Garcia, Faiz Anwer, Jack Khouri, Xin Qi, Qing Y Zheng, Jennifer S Yu, Shan Yan, Thomas LaFramboise, Kenneth C Anderson, Leal C Herlitz, Nikhil C Munshi, Jianhong Lin, Jianjun Zhao

    Cancer Research   81 ( 3 )   713 - 723   2021.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-20-1010

  • Neural stem cell-specific ITPA deficiency causes neural depolarization and epilepsy Reviewed International journal

    Yuichiro Koga, Daisuke Tsuchimoto, Yoshinori Hayashi, Nona Abolhassani, Yasuto Yoneshima, Kunihiko Sakumi, Hiroshi Nakanishi, Shinya Toyokuni, Yusaku Nakabeppu

    JCI Insight   5 ( 22 )   e140229   2020.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1172/jci.insight.140229.

    Repository Public URL: https://hdl.handle.net/2324/7174338

  • 8-Oxoguanine accumulation in aged female brain impairs neurogenesis in the dentate gyrus and major island of Calleja, causing sexually dimorphic phenotypes. Reviewed

    Naoki Haruyama, Sakumi Kunihiko, Atsuhisa Katogi, Daisuke Tsuchimoto, Gabriele De Luca, Margherita Bignami, Yusaku Nakabeppu

    Progress in Neurobiology   2019.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.pneurobio.2019.04.002

  • A Novel Autoantibody against Plexin D1 in Patients with Neuropathic Pain Reviewed

    Takayuki Fujii, Ryo Yamasaki, Kyoko Iinuma, Daisuke Tsuchimoto, Yoshinori Hayashi, Ban yu Saitoh, Takuya Matsushita, Mizuho A. Kido, Shinichi Aishima, Hiroshi Nakanishi, Yusaku Nakabeppu, Jun ichi Kira

    Annals of Neurology   84 ( 2 )   208 - 224   2018.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/ana.25279

  • 2-Oxoadenosine induces cytotoxicity through intracellular accumulation of 2-oxo-ATP and depletion of ATP but not via the p38 MAPK pathway Invited Reviewed International journal

    Shinji Asada, Eiko Ohta, Yoriko Akimoto, ABOLHASSANI NONA, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    SCIENTIFIC REPORTS   7   2017.7

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/s41598-017-06636-8

  • Deficiency of the base excision repair enzyme NEIL3 is associated with increased lymphocyte apoptosis, autoantibodies and predisposition to autoimmunity. Reviewed International journal

    M Massaad, J Zhou, Daisuke Tsuchimoto, J Chou, H Jabara, E Janssen, S Glauzy, B Olson, H Morbach, T Ohsumi, K Schmitz-Abe, M Kyriacos, J Kane, Kumiko Torisu, Yusaku Nakabeppu, LD Notarangelo, E Chouery, A Megarbane, PB Kang

    The Journal of Clinical Investigation   in press   2016.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • PKCη deficiency improves lipid metabolism and atherosclerosis in apolipoprotein E-deficient mice Reviewed International journal

    2016.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    Genome-wide association studies have shown that a non-synonymous single nucleotide polymorphism in PRKCH is associated with cerebral infarction and atherosclerosis-related complications. We examined the role of PKCη in lipid metabolism and atherosclerosis using apolipoprotein E-deficient (Apoe−/−) mice. PKCη expression was augmented in the aortas of mice with atherosclerosis and exclusively detected in MOMA2-positive macrophages within atherosclerotic lesions. Prkch+/+Apoe−/− and Prkch−/−Apoe−/− mice were fed a high-fat diet (HFD), and the dyslipidemia observed in Prkch+/+Apoe−/− mice was reduced in Prkch−/−Apoe−/− mice, with a particular reduction of serum LDL cholesterol and phospholipids. Liver steatosis, which developed in Prkch+/+Apoe−/− mice, was improved in Prkch−/−Apoe−/− mice, but glucose tolerance, adipose tissue and body weight, and blood pressure were unchanged. Consistent with improvements in LDL cholesterol, atherosclerotic lesions were decreased in HFD-fed Prkch−/−Apoe−/− mice. Immunoreactivity against 3-nitrotyrosine in atherosclerotic lesions was dramatically decreased in Prkch−/−Apoe−/− mice, accompanied by decreased necrosis and apoptosis in the lesions. ARG2 mRNA and protein levels were significantly increased in Prkch−/−Apoe−/− macrophages. These data demonstrate that PKCη deficiency improves dyslipidemia and reduces susceptibility to atherosclerosis in Apoe−/− mice, revealing that PKCη plays a role in atherosclerosis development.

    DOI: 10.1111/gtc.12402.

  • Deoxyinosine triphosphate induces MLH1/PMS2- and p53-dependent cell growth arrest and DNA instability in mammalian cells. Reviewed International journal

    Yasuto Yoneshima, Nona Abolhassani, Teruaki Iyama, Kunihiko Sakumi, Naoko Shiomi, Masahiko Mori, Tadahiro Shiomi, Tetsuo Noda, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    Scientific Reports   6   32849   2016.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/srep32849

  • MUTYH, an adenine DNA glycosylase, mediates p53 tumor suppression via PARP-dependent cell death Reviewed International journal

    Oncogenesis   2014.8

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Fosb gene products contribute to excitotoxic microglial activation by regulating the expression of complement C5a receptors in microglia. Reviewed International journal

    Hiroko Nomaru, SAKUMI Kunihiko, Atsuhisa Katogi, Yoshinori N. Ohnishi, Kosuke Kajitani, Daisuke Tsuchimoto, Eric J. Nestler, Yusaku Nakabeppu

    Glia   62 ( 8 )   1284 - 1298   2014.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1002/glia.22680.

  • Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease 2 Regulates the Expansion of Germinal Centers by Protecting against Activation-Induced Cytidine Deaminase-Independent DNA Damage in B Cells. Reviewed International journal

    Jeroen E. J. Guikema, Erin K. Linehan, Nada Esa, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu, Robert T. Woodland, Carol E. Schrader

    The Journal of Immunology   2014.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Differential expression of APE1 and APE2 in germinal centers promotes error-prone repair and A:T mutations during somatic hypermutation Reviewed International journal

    Janet Stavnezer, Erin K. Linehan, Mikayla R. Thompson, Ghaith Habboub, Anna J. Ucher, Tatenda Kadungure, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu, Carol E. Schrader

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   2014.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • 8-Oxoguanine causes neurodegeneration during MUTYH-mediated DNA base excision repair Reviewed

    Zijing Sheng, Sugako Oka, Daisuke Tsuchimoto, Nona Abolhassani, Hiroko Nomaru, SAKUMI Kunihiko, Hideaki Yamada, Yusaku Nakabeppu

    The Journal of Clinical Investigation   122 ( 12 )   4344 - 4361   2012.12

     More details

    Language:English  

    DOI: 10.1172/JCI65053

  • AP-Endonuclease 2 is necessary for normal B cell development and recovery of lymphoid progenitors after chemotherapeutic challenge. Reviewed International journal

    Jeroen E.J. Guikema, Rachel M. Gerstein, Erin K. Linehan, Erin K. Clohert, Eric Evan-Browning, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu, and Carol E. Schrader

    Journal of Immunology   186(4)   2011.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Cancer-related PRUNE2 protein is associated with nucleotides and is highly expressed in mature nerve tissues. Reviewed International journal

    Iwama E., Tsuchimoto D., Iyama T., Sakumi K., Nakagawara A., Takayama K., Nakanishi Y., and Nakabeppu Y.

    Journal of Molecular Neuroscience   2011.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • NUDT16 is a (deoxy)inosine diphosphatase, and its deficiency induces accumulation of single-strand breaks in nuclear DNA and growth arrest. Reviewed International journal

    Iyama T, Abolhassani N, Tsuchimoto D, Nonaka M, Nakabeppu Y.

    Nucleic Acids Research   38(14)   2010.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: doi:10.1093/nar/gkq249

  • NUDT16 and ITPA play a dual protective role in maintaining chromosome stability and cell growth by eliminating dIDP/IDP and dITP/ITP from nucleotide pools in mammals. Reviewed International journal

    Abolhassani N, Iyama T, Tsuchimoto D, Sakumi K, Ohno M, Behmanesh M, Nakabeppu Y.

    Nucleic Acids Res.   2010.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Apex2 is required for efficient somatic hypermutation but not for class switch recombination of immunoglobulin genes Reviewed International journal

    Sabouri Z, Okazaki IM, Shinkura R, Begum N, Nagaoka H, Tsuchimoto D, Nakabeppu Y, Honjo T

    Int. Immunol.   2009.8

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • ITPase-deficient mice show growth retardation and die before weaning Reviewed International journal

    Behmanesh M, Sakumi K, Abolhassani N, Toyokuni S, Oka S, Ohnishi YN, Tsuchimoto D, Nakabeppu Y

    Cell Death and Differentiation   2009.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Mouse RS21-C6 is a mammalian 2'-deoxycytidine 5'-triphosphate pyrophosphohydrolase that prefers 5-iodocytosine. Reviewed International journal

    Nonaka M, Tsuchimoto D, Sakumi K, Nakabeppu Y.

    FEBS J.   2009.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Galectin-1 promotes basal and kainate-induced proliferation of neural progenitors in the dentate gyrus of adult mouse hippocampus. Reviewed International journal

    Kajitani K, Nomaru H, Ifuku M, Yutsudo N, Dan Y, Miura T, Tsuchimoto D, Sakumi K, Kadoya T, Horie H, Poirier F, Noda M, Nakabeppu Y.

    Cell Death Differ.   2009.3

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Altered gene expression profiles and higher frequency of spontaneous DNA strand breaks in APEX2-null thymus. Reviewed International journal

    Dan Y, Ohta Y, Tsuchimoto D, Ohno M, Ide Y, Sami M, Kanda T, Sakumi K, Nakabeppu Y.

    DNA Repair (Amst)   2008.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Oxidation of mitochondrial deoxynucleotide pools by exposure to sodium nitroprusside induces cell death Reviewed International journal

    Ichikawa J, Tsuchimoto D, Oka S, Ohno M, Furuichi M, Sakumi K, Nakabeppu Y

    DNA Repair   2008.3

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Two distinct pathways of cell death triggered by oxidative damage to nuclear and mitochondrial DNAs. Reviewed International journal

    Oka S, Ohno M, Tsuchimoto D, Sakumi K, Furuichi M, Nakabeppu Y

    The EMBO Journal   2008.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • APE1- and APE2-dependent DNA breaks in immunoglobulin class switch recombination Reviewed International journal

    Guikema JEJ, Kinehan EK, Tsuchimoto D, Nakabeppu Y, Strauss PR, Stavnezer J, and Schrader CE

    The Journal of Experimental Medicine   2007.11

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • A genome-wide distribution of 8-oxoguanine correlates with the preferred regions for recombination and single-nucleotide polymorphism in the human genome. Reviewed International journal

    Ohno M., Miura T., Furuichi M., Tominaga Y., Tsuchimoto D., Sakumi K. and Nakabeppu Y.

    Genome Research   2006.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Hematopoietic tissue-specific expression of mouse Neil3 for Endonuclease VIII-like protein. Reviewed International journal

    Torisu K., Tsuchimoto D., Ohnishi Y. and Nakabeppu Y.

    The Journal of Biochemistry   138 ( 6 )   763 - 772   2005.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/jb/mvi168

  • Characterization of the structure and expression of mouse Itpa gene and its related sequences in the mouse genome. Reviewed International journal

    Behmanesh B., Sakumi K., Tsuchimoto D., Torisu K., Ohnishi-Honda Y., Rancourt D.E. and Nakabeppu Y.

    DNA Research   12 ( 1 )   39 - 51   2005.2

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/dnares/12.1.39

  • A functional analysis of the DNA glycosylase activity of mouse MUTYH protein excising 2-hydroxyadenine opposite guanine in DNA. Reviewed International journal

    Ushijima Y., Tominaga Y, Miura T, Tsuchimoto D, Sakumi K and Nakabeppu Y.

    Nucleic Acids Research   33 ( 2 )   672 - 682   2005.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gki214

  • Growth retardation and dyslymphopoiesis accompanied by G2/M arrest in APEX2-null mice. Reviewed International journal

    Ide Y, Tsuchimoto D, Tominaga Y, Nakashima M, Watanabe T, Sakumi K, Ohno M, Nakabeppu Y.

    Blood   104 ( 13 )   4097 - 4103   2004.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1182/blood-2004-04-1476

  • A Mechanism of Transcriptional Regulation of the CSF-1 Gene by Interferon-gamma. Reviewed International journal

    Tsuchimoto D, Tojo A, Asano S

    Immunological Investigations   33 ( 4 )   397 - 405   2004.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1081/IMM-200038662

  • Galectin-1beta, a natural monomeric form of galectin-1 lacking its six amino-terminal residues promotes axonal regeneration but not cell death Reviewed International journal

    Miura T, Takahashi M, Horie H, Kurushima H, Tsuchimoto D, Sakumi K, Nakabeppu Y.

    Cell Death and Differentiation   11 ( 10 )   1076 - 1083   2004.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/sj.cdd.4401462

  • MUTYH prevents OGG1 or APEX1 from inappropriately processing its substrate or reaction product with its C-terminal domain Reviewed International journal

    Tominaga Y, Ushijima Y, Tsuchimoto D, Mishima M, Shirakawa M, Hirano S, Sakumi K, Nakabeppu Y.

    Nucleic Acids Research   32 ( 10 )   3198 - 3211   2004.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gkh642

  • Biological significance of the defense mechanisms against oxidative damage in nucleic acids caused by reactive oxygen species: from mitochondria to nuclei International journal

    Nakabeppu Y, Tsuchimoto D, Ichinoe A, Ohno M, Ide Y, Hirano S, Yoshimura D, Tominaga Y, Furuichi M, Sakumi K.

    Ann N Y Acad Sci.   1011   101 - 111   2004.4

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (international conference proceedings)  

    DOI: 10.1196/annals.1293.011

  • Identification and characterization of two forms of mouse MUTYH proteins encoded by alternatively spliced transcripts Reviewed International journal

    Ichinoe A, Behmanesh M, Tominaga Y, Ushijima Y, Hirano S, Sakai Y, Tsuchimoto D, Sakumi K, Wake N, Nakabeppu Y.

    Nucleic Acids Research   32 ( 2 )   477 - 487   2004.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/gkh214

  • Mutator phenotype of MUTYH-null mouse embryonic stem cells. Reviewed International journal

    Hirano S, Tominaga Y, Ichinoe A, Ushijima Y, Tsuchimoto D, Honda-Ohnishi Y,

    J Biol Chem.   278 ( 40 )   38121 - 38124   2003.10

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1074/jbc.C300316200

  • DeltaFosB, but not FosB, induces delayed apoptosis independent of cell proliferation in the Rat1a embryo cell line. Reviewed International journal

    Tahara K, Tsuchimoto D, Tominaga Y, Asoh S, Ohta S, Kitagawa M, Horie H, Nakabeppu Y

    Cell Death Differ.   10 ( 5 )   496 - 507   2003.5

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1038/sj.cdd.4401173

  • Characterization of the genomic structure and expression of the mouse Apex2 gene. Reviewed International journal

    Ide Y, Tsuchimoto D, Tominaga Y, Iwamoto Y, Nakabeppu Y.

    Genomics   81 ( 1 )   47 - 57   2003.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/S0888-7543(02)00009-5

  • Human APE2 protein is mostly localized in the nuclei and to some extent in the mitochondria, while nuclear APE2 is partly associated with proliferating cell nuclear antigen. Reviewed International journal

    Tsuchimoto D, Sakai Y, Sakumi K, Nishioka K, Sasaki M, Fujiwara T, Nakabeppu Y

    Nucleic Acids Res.   29 ( 11 )   2349 - 2360   2001.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/nar/29.11.2349

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Presentations

  • マウスモデルを用いた早期乳児てんかん性脳症(EIEE)35の発症メカニズムの解明 Invited

    土本 大介

    第64回日本小児神経学会  2022.6 

     More details

    Event date: 2022.6

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:群馬県高崎市Gメッセ群馬   Country:Japan  

  • 神経幹細胞特異的イノシン三リン酸分解酵素ノックアウトマウスは脳神経細胞脱分極とてんかん発作を示す Invited

    土本大介

    2020年度先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会  2021.2 

     More details

    Event date: 2021.2

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:東京国際フォーラムハイブリッド開催   Country:Japan  

  • Neural stem cell-specific Itpa knockout causes depolarization, epileptic seizure and early death in mice

    2020.9 

     More details

    Event date: 2020.9

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Neural stem cell specific ITPA deficiency causes depolarization of neurons, resulting in epileptic seizure and early death in mice

    Daisuke Tsuchimoto, Yuichiro Koga, @Yoshinori Hayashi, Nona Abolhassani, Yasuto Yoneshima, Kunihiko Sakumi, @Hiroshi Nakanishi, @Shinya Toyokuni, Yusaku Nakabeppu

    2019.12 

     More details

    Event date: 2019.12

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  • ITPA欠損によるヒトてんかん性脳症のモデルとしての神経幹細胞特異的Itpaノックアウトマウス

    土本 大介、古賀 祐一郎、林 良憲、アボルハッサニ ノナ、米嶋 康臣、@中西 博、@豊國 伸哉、中別府 雄作

    平成30年度「先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会」  2019.1 

     More details

    Event date: 2019.1

    Language:Japanese  

    Venue:琵琶湖ホテル(滋賀県大津市浜町2−40)   Country:Japan  

  • ITPA欠損によるヒトてんかん性脳症のモデルとしての神経幹細胞特異的Itpaノックアウトマウス

    土本 大介、古賀 祐一郎、林 良憲、アボルハッサニ ノナ、米嶋 康臣、@中西 博、中別府 雄作

    第41回日本日本分子生物学会年会  2018.11 

     More details

    Event date: 2018.11

    Language:Japanese  

    Venue:パシフィコ横浜(神奈川県横浜市西区みなとみらい1−1−1)   Country:Japan  

  • Neural stem cell-specific Itpa knockout mouse as a model of human epileptic encephalopathy caused by ITPA deficiency International conference

    Daisuke Tsuchimoto, Yuichiro Koga, Yoshinori Hayashi, Nona Abolhassani,Yasuto Yoneshima, @Hiroshi Nakanishi, Yusaku Nakabeppu

    The Joint Symposium of the 13th International Symposium of the Institute Network for Biomedical Sciences and the 28th Hot Spring Harbor International Symposium 2018  2018.10 

     More details

    Event date: 2018.10

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Neural stem cell-specific Itpa knockout mouse as a model of human ITPA deficiency

    Daisuke Tsuchimoto, #Yuichiro Koga, Yoshinori Hayashi, Nona Abolhassani, Yasuto Yoneshima, @Hiroshi Nakanishi, Yusaku Nakabeppu

    2018.7 

     More details

    Event date: 2018.7 - 2018.8

    Language:English  

    Country:Japan  

  • イノシン三リン酸分解酵素ITPA欠損症のモデルマウス作製と解析

    土本 大介, 古賀 祐一郎, 米嶋 康臣, 浅田 真司, 作見 邦彦, 中別府 雄作

    平成28年度先端モデル動物支援プラットフォーム成果発表会  2017.2 

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    Event date: 2017.2

    Language:Japanese  

    Venue:大津市琵琶湖ホテル   Country:Japan  

    (デオキシ)イノシン三リン酸([d]ITP)は,(d)ATPの酸化的脱アミノ化やイノシン一リン酸(IMP)のリン酸化によって生じると考えられているが,正常な哺乳動物細胞においてはイノシン三リン酸分解酵素(ITPA)により(d)IMPへと分解されるため検出されない.最近ヒトのITPA欠損が,発育遅延や小頭症,てんかん様けいれん発作を伴い生後2,3年以内に死亡する幼児脳症の原因となる事が報告された(Kevelam SH et al., Ann Neurol. 2015 Oct;78(4):649-58).またその後,ITPAの活性低下につながる遺伝子多型と若年発症型の結核症との相関が報告された(Nakauchi A et al., Hum Genome Var. 2016 Feb 4;3:15067).
     我々は,ITPA欠損が哺乳動物中枢神経系に及ぼす影響を調べる目的で,神経幹細胞特異的にItpa遺伝子を破壊したItpa(flox/flox)/NestinCre(Tg/+)マウスを樹立した.このマウスは正常ITPAを発現する同腹仔コントロールマウスと比較して発育遅延を示し,ほぼ全てが生後約3週間で死亡した.短期間の観察中に一部のマウスで自発性てんかん様けいれん発作を認めたことから,16日齢のマウスに対して音刺激によるけいれん発作誘発を試みたところ,音刺激を与えた8匹のITPA欠損マウスは全てにおいてけいれん発作が誘発されたが,正常ITPAを発現する同腹仔コントロールマウス19匹では全く発作を認めなかった.これらのことから,ITPA欠損マウスはヒトITPA欠損脳症のよいモデルであると考えられる.
     現在,このモデルマウスを用いてITPA欠損が脳症を引き起こすメカニズムの解析を行っている.

  • イノシン三リン酸分解酵素ITPA欠損の哺乳動物細胞およびマウス中枢神経系への影響の解析

    土本 大介, 米嶋康臣, 古賀祐一郎, ABOLHASSANI NONA, 猪山 輝昭, 浅田真司, 作見 邦彦, 塩見尚子, 森雅彦, 塩見忠博, 野田哲生, 中別府 雄作

    日本分子生物学会  2016.12 

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    Event date: 2016.11 - 2016.12

    Language:Japanese  

    Venue:神奈川県横浜市パシフィコ横浜   Country:Japan  

    (デオキシ)イノシン三リン酸([d]ITP)は,(d)ATPの酸化的脱アミノ化やイノシン一リン酸(IMP)のリン酸化によって生じると考えられているが,正常な哺乳動物細胞においてはイノシン三リン酸分解酵素(ITPA)により(d)IMPへと分解されるため検出されない.昨年,ヒトのITPA欠損が発育遅延や,小頭症,けいれん,を伴う幼児脳症の原因となる事が報告された(doi: 10.1002/ana.24496).またその後,ITPAの活性低下につながる遺伝子多型と若年発症型の結核症との相関が報告された(doi: 10.1038/hgv.2015.67).  我々は,ITPA欠損が哺乳動物細胞へ与える影響を調べる目的でItpaノックアウトマウス胎仔由来線維芽細胞やITPAノックダウンヒト培養細胞の解析を行った.その結果ITPA欠損はゲノムDNA中のデオキシイノシンの蓄積をもたらすと同時に,DNAミスマッチ修復関連タンパク質複合体MLH1/PMS2に依存したDNA一本鎖切断と細胞増殖抑制を引き起こした.この時ミスマッチ塩基対認識に必須のMSH2が関与しなかったことから,ミスマッチに依存しないMLH1/PMS2の機能であることが示された.更に細胞増殖抑制はp53依存性の細胞周期G1期停止を伴っていた.  次に我々はITPA欠損がマウス中枢神経系へ与える影響を調べる目的で,神経幹細胞特異的にItpa遺伝子のエクソン5が切除されるItpa(flox/flox) /NestinCre(Tg/+)マウスを作成した.このマウスは同腹仔コントロールマウスと比較して発育遅延を示し,ほぼ全てが生後約3週間で死亡した.更に短時間の観察中に一部のマウスで自発性てんかん様けいれん発作を認めたことから,ヒトITPA欠損脳症のよいモデルであると考えられる.  これらのITPA欠損細胞およびマウスの結果から,ヒトのITPA欠損が脳症や結核症を引き起こすメカニズムを考察したい.

  • イノシン三リン酸分解酵素ITPAの組織特異的欠損 マウス作成と解析

    土本 大介, 古賀 祐一郎, 米嶋康臣, 浅田 真司, 中別府 雄作

    日本分子生物学会/日本生化学会合同年会  2015.12 

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    Event date: 2015.12

    Language:Japanese  

    Venue:兵庫県神戸市ポートピアホテル   Country:Japan  

  • デオキシイノシン三リン酸の蓄積はミスマッチ修復タンパク質MLH1に依存した細胞周期の遅延をもたらす

    土本 大介, 米嶋 康臣, ABOLHASSANI NONA, 猪山 輝昭, 作見 邦彦, 塩見 尚子, 森 雅彦, 塩見 忠博, 野田 哲生, 中別府 雄作

    日本分子生物学会総会  2014.11 

     More details

    Event date: 2014.11

    Language:Japanese  

    Venue:神奈川県横浜市   Country:Japan  

    DNA中に蓄積した損傷塩基は突然変異や細胞死を引き起こすため、様々な疾患の原因となる。我々は、DNA中の損傷塩基の起源としてヌクレオチドプール中に生じたの損傷ヌクレオチドに注目している。損傷ヌクレオチドはDNAに取り込まれることによりDNA損傷応答を引起こすと考えられる。このような損傷ヌクレオチドの多くは特異的加水分解酵素によって分解されることで、DNAへの取込みが抑制されている。
     デオキシイノシン三リン酸(dITP)はdATPの酸化的脱アミノ化によって生じる損傷ヌクレオチドである。これまでに我々は、ほ乳動物細胞にはdITPを加水分解するinosine triphosphatase(ITPA)や、nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16(NUDT16)が存在し、dITPの蓄積を抑えていることを明らかにしてきた。HeLa MR細胞ではNUDT16のノックダウンにより細胞増殖の抑制および核DNAに一本鎖切断の蓄積を認めたが、ミスマッチ修復(MMR)に必須の遺伝子MLH1の発現抑制によりこれらの現象は解除された。また、MLH1のナンセンス変異を両アリルに持つHCT116細胞はITPAノックダウンの影響を受けなかったが、この細胞に正常なMLH1配列をノックインしたH414細胞ではITPAノックダウンによる細胞増殖の抑制を認めた。
     今回、ITPAノックダウンにより細胞増殖が抑制されたH414細胞をフローサイトメトリーにより解析したところ、S期の細胞の減少と同時にG1期とG2期のそれぞれの細胞集団の増加を認めた。次に、ITPAをノックダウンしたH414細胞の培地にデオキシイノシンを添加したところさらなる細胞増殖の抑制を認めたが、イノシンでは何ら効果を認めなかった。この結果は、dITPの蓄積が細胞増殖抑制の原因になっていることを示している。現在、ミスマッチ修復において損傷部位の認識に関わるMSH2の欠損の影響や細胞周期チェックポイント機構に対する阻害剤の影響を解析しており、それらの結果も合わせて報告する。

  • デオキシイノシン三リン酸の蓄積はミスマッチ修復機構に依存した細胞増殖抑制とゲノム不安定性を引き起こす

    米嶋 康臣, 土本 大介, アボルハッサニ ノナ, 猪山 輝昭, 作見 邦彦, 塩見 尚子, 森 雅彦, 塩見 忠博, 中別府 雄作

    第36回日本分子生物学会年会、ポスター発表(2013年12月4日2P-0150)  2013.12 

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    Event date: 2013.12

    Language:Japanese  

    Venue:兵庫県神戸市神戸ポートアイランド(神戸国際会議場、神戸国際展示場、神戸ポートピアホテル)   Country:Japan  

    DNAの損傷は遺伝子変異や細胞死を引き起こすとともに、様々な疾患の原因となる。また、細胞内の遊離ヌクレオチドの損傷体は、DNAに取り込まれることによりDNA損傷の一因となる。このような損傷ヌクレオチドの多くは特異的加水分解酵素によって分解除去される。
     デオキシイノシン三リン酸(dITP)はdATPの酸化的脱アミノ化によって生じる損傷ヌクレオチドである。これまでに我々は、哺乳動物細胞にはdITPを加水分解するinosine triphosphatase(ITPA)や、nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16(NUDT16)が存在し、dITPの蓄積を抑えていることを明らかにしてきた。
     今回我々は、dITP分解酵素欠損による細胞増殖抑制とDNA中のデオキシイノシン(dI)の認識排除機構との関連性を調べた。HeLa MR細胞において、NUDT16のノックダウンを行うと細胞増殖抑制および核DNA一本鎖切断の蓄積を認めたが、DNAミスマッチ修復(MMR)に必須の遺伝子MLH1の発現抑制によりこれらの現象は解除された。また、MLH1のナンセンス変異を両アリルに持つHCT116細胞、およびこの細胞に正常なMLH1配列をノックインしたH414細胞を用いて、ITPAノックダウンの影響を解析したところ、MLH1に依存した細胞増殖抑制の誘導を認めた。次に、dIを含むオリゴ二本鎖DNAとHeLa MR細胞の核抽出物を用いたゲルシフトアッセイを行ったところ、dI:デオキシグアノシン(dG)ペアを含むDNAとMMRタンパク質との特異的結合が確認された。さらに抗MSH6抗体を加えるとこの結合は消失した。
     以上の結果から、細胞中に蓄積した遊離dITPが複製時にDNAに取り込まれ、dIがdGと塩基対を形成した場合に、MMRによる認識とそれに続く修復機構に依存して細胞増殖抑制が誘導されると考えられた。

  • 2-OH-ATPによる細胞増殖抑制と細胞死に関与する遺伝子の網羅的解析

    瀧口友香, 太田詠子, 土本 大介, 作見 邦彦, 中別府 雄作

    日本遺伝学会第84回大会(演題番号2C-05)  2012.9 

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    Event date: 2012.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:福岡市九州大学医学部百年講堂・同窓会館   Country:Japan  

    これまでに我々は、ATPの酸化体である2-OH-ATPおよびその脱リン酸化体である2-OH-adenosineが酸化プリンヌクレオチド分解酵素MTH1の欠損マウス細胞においてp38 MAPK経路を介した細胞増殖抑制と細胞死を誘導し, ヒトMTH1の発現がこれを抑制することを見出してきた。今回これらの細胞障害に関わる因子を明らかにするためMth1-/-マウス細胞およびヒトMTH1発現マウス細胞を用いて,2-OH-adenosine処理による転写プロファイルの変化をGeneChip Arrayを用いて解析した。変化を認めた遺伝子のうち,細胞増殖抑制や細胞死に関わる遺伝子に関してReal-time PCRで発現の確認を行った。

  • イノシン三リン酸によるゲノム不安定化機構と細胞内イノシン三リン酸生成経路の解明

    米嶋 康臣, 土本 大介, 作見 邦彦, 野田 哲生, 中別府 雄作

    日本遺伝学会第84回大会(演題番号2E-02)  2012.9 

     More details

    Event date: 2012.9

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:福岡   Country:Japan  

    イノシンヌクレオチドは、一部はプリンヌクレオチド合成経路の前駆体として生合成されている一方で、アデノシンヌクレオチドのC6位の脱アミノ化反応によっても生じる。(デオキシ)イノシン三リン酸((d)ITP)はゲノムDNA不安定化やATP依存性タンパク質の機能阻害など、さまざまな生体障害を引き起こすと考えられる。我々は哺乳動物細胞の(d)ITPおよび(デオキシ)イノシン二リン酸の分解酵素としてITPAとNUDT16をそれぞれ同定して来た。今回、ITPA欠損マウス由来初代線維芽細胞を用いて(d)ITPによるゲノムDNA不安定化分子機構と細胞内(d)ITP生成経路の検討を行った。

  • ほ乳動物細胞におけるデオキシイノシンヌクレオチドによるゲノム不安定化機構とその防御システム

    土本大介、猪山輝昭、アボルハッサニ・ノナ、米嶋康臣、作見邦彦、塩見尚子、森雅彦、塩見忠博、中別府雄作

    第34回日本分子生物学会年会  2011.12 

     More details

    Event date: 2011.12

    Language:Japanese  

    Venue:神奈川県横浜市、パシフィコ横浜   Country:Japan  

  • ほ乳動物細胞におけるデオキシイノシンヌクレオチドによるゲノム不安定化とその防御機構

    土本大介、猪山輝昭、アボルハッサニ・ノナ、米嶋康臣、作見邦彦、中別府雄作

    日本遺伝学会  2011.9 

     More details

    Event date: 2011.9

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:京都府京都市、京都大学農学部   Country:Japan  

  • NUDT16 is a (deoxy)inosine diphosphatase, and its deficiency induces accumulation of single-strand breaks in nuclear DNA and growth arrest International conference

    Teruaki Iyama, Nona Abolhassani, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    The 7th Global COE International Symposium and 6th Young Investigators Forum  2011.2 

     More details

    Event date: 2011.2

    Country:Indonesia  

  • NUDT16 is a (deoxy)inosine diphosphatase, and its deficiency induces accumulation of single-strand breaks in nuclear DNA and growth arrest International conference

    Teruaki Iyama, Nona Abolhassani, Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology, Genomic Instability and DNA Repair  2011.2 

     More details

    Event date: 2011.2

    Country:United States  

  • NUDT16は(デオキシ)イノシン二リン酸分解酵素であり、その欠損は核DNAの一本鎖切断の蓄積と増殖抑制をもたらす

    土本大介、猪山輝昭、アボルハッサニ ノナ、野中麻里、中別府雄作

    2010.12 

     More details

    Event date: 2010.12

    Venue:神戸ポートアイランド   Country:Japan  

  • An increased expression of NUDT16 with IDP/dIDP hydrolyzing activity in immortalized ITPA-null mouse embryonic fibroblasts suppressed ITPA-deficient phenotypes

    Nona Abolhassani, Teruaki Iyama, Daisuke Tsuchimoto, Kunihiko Sakumi, Mizuki Ohno, Behmanesh Mehrdad, Yusaku Nakabeppu

    2009.12 

     More details

    Event date: 2009.12

    Country:Japan  

  • Human NUDT16 is a novel nucleotide pool sanitizing enzyme hydrolyzing (deoxy)inosine diphosphate to (deoxy)inosine monophosphate

    Daisuke Tsuchimoto, Teruaki Iyama, Nona Abolhassani, Yusaku Nakabeppu

    2009.12 

     More details

    Event date: 2009.12

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Human NUDT16 Is a Novel Nucleotide Pool Sanitizing Enzyme Hydrolyzing (Deoxy)Inosine Diphosphate to (Deoxy)Inosine Monophosphate.

    Teruaki Iyama, Daisuke Tsuchimoto, Nona Abolhassani, Yusaku Nakabeppu

    The 49th annual meeting of the American Society for Cell Biology  2009.12 

     More details

    Event date: 2009.12

    Country:Japan  

  • ヒトNUDT16は(デオキシ)イノシン二リン酸を(デオキシ)イノシン一リン酸に加水分解する新規ヌクレオチドプール浄化酵素である

    土本大介、猪山輝昭、アボルハッサニ・ノナ、中別府雄作

    第20回DNA複製・組換え・修復ワークショップ  2009.11 

     More details

    Event date: 2009.11

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:滋賀県彦根市琵琶湖コンファレンスセンター   Country:Japan  

  • 神経芽腫予後関連タンパク質Prune2の全長フォームの同定

    土本大介、岩間映二、野中麻里、作見邦彦、中別府雄作

    第32回日本神経科学大会  2009.9 

     More details

    Event date: 2009.9

    Language:Japanese  

    Venue:名古屋国際会議場   Country:Japan  

  • 新規損傷ヌクレオチド浄化酵素ITPBP2の同定と機能解析

    土本大介、猪山輝昭、吉田奈桜子、中別府雄作

    2008.12 

     More details

    Event date: 2008.12

    Language:Japanese  

    Venue:神戸ポートアイランド   Country:Japan  

  • 新規cAMP phosphodiesteraseの同定と癌転移に関与する可能性の検討

    岩間映二、土本大介、中別府雄作

    2008.12 

     More details

    Event date: 2008.12

    Venue:神戸ポートアイランド   Country:Japan  

  • Neil3遺伝子改変マウスにおける末梢白血球減少

    土本大介,鳥巣久美子,中別府雄作

    第28回日本分子生物学会年会  2005.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:福岡市   Country:Japan  

  • ITP結合タンパク質ITPBP1の生化学的特性

    野中麻里、土本大介、太田詠子、作見邦彦、中別府雄作

    日本分子生物学会2006フォーラム  2006.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名古屋   Country:Japan  

  • ATP固定化樹脂を用いた損傷ヌクレオチド結合タンパク質の探索

    土本大介、野中麻里、太田詠子、作見邦彦、中別府雄作

    日本分子生物学会2006フォーラム  2006.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名古屋   Country:Japan  

  • ITP結合タンパク質ITPBP1の生物学的特性の解析

    野中麻里、土本大介、太田詠子、作見邦彦、中別府雄作

    日本分子生物学会  2007.12 

     More details

    Venue:パシフィコ横浜   Country:Japan  

  • NUDT16 is a (deoxy)inosine diphosphatase, and its deficiency induces accumulation of single-strand breaks in nuclear DNA and growth arrest. International conference

    Teruaki Iyama, Nona Abolhassani, Daisuke Tsuchimoto, Mari Nonaka, Yusaku Nakabeppu

    The 7th 3R Symposium  2010.10 

     More details

    Language:English  

    Country:Japan  

  • Role of 8-oxoguanine accumulated in nuclear or mitochindrial DNA in the development of Alzheimer's disease

    2016.12 

     More details

    Event date: 2016.11 - 2016.12

    Language:Japanese  

    Country:Japan  

  • AP-1転写因子を構成するFosb遺伝子産物による 補体受容体遺伝子C5ar1発現制御機構の解析

    森岡 紀子, 能丸 寛子, Julio Leon, 加藤木 敦央, 土本 大介, 作見 邦彦, 中別府 雄作

    日本分子生物学会/日本生化学会合同年会  2015.12 

     More details

    Event date: 2015.12

    Language:Japanese  

    Venue:兵庫県神戸市ポートピアホテル   Country:Japan  

  • X線照射によるプリンヌクレオシド修飾の包括的 解析

    秋本 頼子, ABOLHASSANI NONA, Erika Castillo, 土本 大介, 中別府 雄作

    日本分子生物学会/日本生化学会合同年会  2015.12 

     More details

    Event date: 2015.12

    Language:Japanese  

    Venue:兵庫県神戸市ポートピアホテル   Country:Japan  

  • ヒトミトコンドリア型AP endonuclease 候補のcDNAクローニング

    土本大介、中別府雄作

    1998年第21回日本分子生物学会年会  1998.12 

     More details

    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • マウス新規AP endonuclease候補遺伝子APE2のクローニングと遺伝子欠損ES細胞株の樹立

    井手康人,冨永洋平,土本大介,酒井康成,今磯泰幸,中別府雄作

    2000年第23回日本分子生物学会年会  2000.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • Human APE2 protein is mostly localized in the nuclei and to some extent in the mitochondria, while nuclear APE2 is partly associated with proliferating cell nuclear antigen.

    Daisuke Tsuchimoto, Yusaku Nakabeppu

    2001.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • 大腸菌Endonuclease VIII (Nei) 類似タンパク質NEIL3をコードする ヒトおよびマウス遺伝子のゲノム構造と発現解析

    土本 大介、○鳥巣(中原)久美子、中別府 雄作

    2002年第25回日本分子生物学会年会  2002.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜   Country:Japan  

  • MUTYH protects an intermediate of base excision repair by itself in DNA from a double-strand break caused by OGG1 and APEX1

    2002.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • Repair mechanism of misincorporated adenine opposite 8-oxoG by mammalian MutY homolog, MUTYH: its relevance to mutagenesis and carcinogenesis Invited

    Daisuke Tsuchimoto, Yasuhiro Ushijima, Yohei Tominaga, Seiki Hirano, Akimasa Ichinoe, Kunihiko Sakumi, and Yusaku Nakabeppu

    2003.10 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Country:Japan  

  • Establishment and characterization of APEX2 null mice International conference

    Daisuke Tsuchimoto, Yasuhito Ide, Manabu Nakashima, Takeshi Watanabe and Yusaku Nakabeppu

    2003.10 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Country:Japan  

  • APEX2欠損マウスの樹立とその解析

    土本大介,井手康人,中島学,渡邊武,中別府雄作

    2003年第26回日本分子生物学会年会  2003.12 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • APEX2欠損マウスにおける抗オブアルブミン抗体産生の遅延

    土本大介,井手康人,中島学,渡邊武,中別府雄作

    第27回日本分子生物学会年会  2004.12 

     More details

    Venue:神戸   Country:Japan  

  • NUDT16 and ITPA play a dual protective role in maintaining chromosome stability and cell growth by eliminating dIDP/IDP and dITP/ITP from nucleotide pools in mammals. International conference

    Nona Abolhassani, Teruaki Iyama, Daisuke Tsuchimoto, SAKUMI Kunihiko, Ohno Mizuki, Mehrdad Behmanesh, Yusaku Nakabeppu

    The 7th 3R Symposium  2010.10 

     More details

    Language:English  

    Country:Japan  

  • 発達性てんかん性脳症の分子病態に迫る マウスモデルを用いた早期乳児てんかん性脳症EIEE35の発症メカニズムの解明

    土本 大介

    脳と発達  2022.5  (一社)日本小児神経学会

     More details

    Language:Japanese  

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MISC

  • 酸化的DNA 損傷と防御機構

    土本 大介, 中別府 雄作

    別冊・医学のあゆみ「レドックスUPDATE」   2015.7

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

    生物にとって,ゲノムDNA に保持された遺伝情報を細胞から細胞へ,親から子へと正確に伝え維持する
    ことはもっとも基本的な生物学的機能であるが,ゲノムDNA やその前駆体のヌクレオチドは,酸素呼吸や
    免疫応答などの過程で生じる活性酸素によって酸化される危険につねにさらされている.ゲノムDNA に酸
    化損傷が蓄積すると,突然変異や細胞死を引き起こすことで癌や変性疾患の原因となる.これに対抗する防
    御機構として,生物は酸化損傷DNA 修復や酸化ヌクレオチド排除のためのシステムを備えている.

  • A comprehensive screening system for damaged nucleotide-binding proteins.

    Tsuchimoto D, Iyama T, Nonaka M, Abolhassani N, Ohta E, Sakumi K, and Nakabeppu Y.

    Mutation Research   2010.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • 酸化的DNA損傷と防御機構

    土本大介,中別府雄作

    別冊・医学のあゆみ 『レドックス-ストレス防御の医学』   2005.7

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • ミトコンドリアDNAの酸化損傷に対する防御機構の生物学的重要性

    土本大介,中別府雄作

    実験医学   2003.9

     More details

    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

  • Biological Significance of the Defense Mechanisms against Oxidative Damage in Nucleic Acids Caused by Reactive Oxygen Species: from Mitochondria to Nuclei,

    Nakabeppu, Y., D. Tsuchimoto, A. Ichinoe, M. Ohno, Y. Ide, S. Hirano, D. Yoshimura, Y. Tominaga, M. Furuichi, and K. Sakumi,

    Ann NY Acad Sci, (in press)   2003.1

     More details

    Language:English   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

Industrial property rights

Patent   Number of applications: 0   Number of registrations: 1
Utility model   Number of applications: 0   Number of registrations: 0
Design   Number of applications: 0   Number of registrations: 0
Trademark   Number of applications: 0   Number of registrations: 0

Professional Memberships

  • The molecular biology society of Japan

  • Japan Neuroscience Society

Academic Activities

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2020

     More details

    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2019

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    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

  • Screening of academic papers

    Role(s): Peer review

    2018

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    Type:Peer review 

    Number of peer-reviewed articles in foreign language journals:1

    Number of peer-reviewed articles in Japanese journals:1

Research Projects

  • イノシン三リン酸分解酵素欠損の分子病態解明

    Grant number:21K06869  2021 - 2024

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    土本 大介

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    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

    イノシン三リン酸(ITP)は非正規プリンヌクレオチドである。ITP分解酵素(ITPA)欠損は重篤な乳幼児てんかん性脳症と拡張型心筋症を引き起こす。我々はITPA欠損マウスモデルの作成に成功し、心筋筋繊維構造の乱れや脳神経細胞の静止膜電位上昇を伴うてんかん発作などの重要な知見を明らかにした。本研究では、①「ITPA欠損症」の分子病態のさらなる解明を行い、②ITP産生経路の解明と並行してITP産生阻害作用を持つ化合物を探索して「ITPA欠損症」治療法を開発する。さらに、③日本人に多いITPA遺伝子の94C>A(P32T)マイナーアレルが脳神経系や心筋へ与える影響について解析する。

    CiNii Research

  • イノシン三リン酸分解酵素欠損症の分子病態解明とそれを利用した治療法開発

    Grant number:18K06960  2018 - 2020

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

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    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 活性酸素による脳機能障害とその防御機構の解明

    Grant number:17H01391  2017 - 2019

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

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    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • ATPの酸化体によるシグナル伝達

    Grant number:23117713  2011 - 2012

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

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    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 環境ストレスによるヌクレオチドプールの恒常性破綻の分子病態と制御機構の解明

    Grant number:22221004  2010 - 2014

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(S)

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s)  Grant type:Scientific research funding

  • ATPおよびGTPの酸化体による細胞内シグナル伝達機構の解明

    Grant number:21117512  2009 - 2010

    日本学術振興会・文部科学省  科学研究費助成事業  新学術領域研究

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • マウスを用いたDNAおよび遊離ヌクレオチドの品質管理機構欠損の分子病態解析

    Grant number:19390114  2007 - 2009

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

  • 遺伝子改変マウスをモデルとしたDNA塩基除去修復欠損の分子病態解明

    Grant number:16390119  2004 - 2006

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Scientific research funding

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Class subject

  • 核酸と生命

    2024.6 - 2024.7  

  • 核酸と生命

    2023.6 - 2023.8   Summer quarter

  • 核酸と生命

    2022.6 - 2022.8   Summer quarter

  • 核酸と生命

    2021.6 - 2021.8   Summer quarter

  • 遺伝子生化学

    2021.4 - 2022.3   Full year

  • 医科学ゼミナール

    2021.4 - 2022.3   Full year

  • 博士論文応用演習

    2021.4 - 2022.3   Full year

  • 細胞病理学

    2021.4 - 2022.3   Full year

  • 核酸と生命

    2020.6 - 2020.8   Summer quarter

  • 神経化学

    2020.4 - 2021.3   Full year

  • 行動生理

    2020.4 - 2021.3   Full year

  • 専攻コア統合科目「基礎医学研究者養成コース入門(1)-(4)」

    2020.4 - 2021.3   Full year

  • 総合医学 II /総合生命科学 II (研究室配属).

    2020.4 - 2020.9   First semester

  • 核酸と生命

    2019.6 - 2019.8   Summer quarter

  • 細胞病理学

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 遺伝子生化学

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 脳機能制御学研究法

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 分子神経科学

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 神経化学

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 行動生理

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 専攻コア統合科目「基礎医学研究者養成コース入門(1)-(4)」

    2019.4 - 2020.3   Full year

  • 総合医学 II /総合生命科学 II (研究室配属).

    2019.4 - 2019.9   First semester

  • 核酸と生命

    2018.6 - 2018.8   Summer quarter

  • 医科学ゼミナール

    2018.4 - 2019.3   Full year

  • 博士論文応用演習

    2018.4 - 2019.3   Full year

  • 細胞病理学

    2018.4 - 2019.3   Full year

  • 遺伝子生化学

    2018.4 - 2019.3   Full year

  • 遺伝子生化学

    2017.4 - 2018.3   Full year

  • 細胞病理学

    2017.4 - 2018.3   Full year

  • 医科学ゼミナール

    2017.4 - 2018.3   Full year

  • 博士論文応用演習

    2017.4 - 2018.3   Full year

  • 医科学ゼミナール(修士)

    2016.4 - 2017.3   Full year

  • 博士論文演習

    2016.4 - 2017.3   Full year

  • 専攻コア選択科目 「細胞病理学」

    2016.4 - 2017.3   Full year

  • 専攻コア選択科目 「遺伝子生化学」

    2016.4 - 2017.3   Full year

  • 基礎医学実習 「基礎医学研究者養成コース入門(1)〜(4)」

    2016.4 - 2017.3   Full year

  • 遺伝子生化学

    2015.4 - 2016.3   Full year

  • 細胞病理学

    2015.4 - 2016.3   Full year

  • 医科学ゼミナール

    2015.4 - 2016.3   Full year

  • 博士論文応用演習

    2015.4 - 2016.3   Full year

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FD Participation

  • 2022.9   Role:Participation   Title:全学FD「M2Bシステムの使い方 ~新機能を中心に紹介~」

    Organizer:University-wide

  • 2019.10   Role:Participation   Title:令和元年度馬出地区4部局合同男女共同参画FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2019.9   Role:Participation   Title:M2B学習支援システム講習会☆入門編☆(馬出地区)09:30~11:30

    Organizer:University-wide

  • 2019.9   Role:Participation   Title:2019年度第4回全学FD M2B学習支援システム講習会

    Organizer:University-wide

  • 2019.2   Role:Participation   Title:情報セキュリティ関連FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2018.10   Role:Panelist   Title:平成30年度馬出地区4部局合同男女共同参画FD

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2017.10   Role:Participation   Title:平成29年度 部局男女共同参画FD(第一部:講演「無意識のバイアスからの開放:ダイバーシティのススメ」、第二部:公開討論会)

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2016.10   Role:Participation   Title:馬出地区キャンパスFD 「なぜ今『女性活躍推進法』か? —男女共同参画の必要性と九州大学における取組み—」

    Organizer:[Undergraduate school/graduate school/graduate faculty]

  • 2007.4   Role:Participation   Title:平成19 年度第1回全学FD

    Organizer:University-wide

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Media Coverage

  • 医療面において、てんかん性脳症発症の仕組み解明の研究成果が紹介された。 Newspaper, magazine

    西日本新聞  2020.12

     More details

    医療面において、てんかん性脳症発症の仕組み解明の研究成果が紹介された。

  • 早期乳児てんかん性脳症発症のメカニズム解明の研究成果が紹介された。 Newspaper, magazine

    科学新聞  2020.11

     More details

    早期乳児てんかん性脳症発症のメカニズム解明の研究成果が紹介された。