2026/06/16 更新

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ムラカミ ユウスケ
村上 優介
MURAKAMI YUSUKE
所属
理学研究院 化学部門 助教
理学府 化学専攻(併任)
理学部 化学科(併任)
職名
助教
外部リンク

研究分野

  • ライフサイエンス / 生体医工学

学位

  • 博士(医学) ( 2026年3月 筑波大学 )

経歴

  • 九州大学  助教 

    2026年4月 - 現在

学歴

  • 筑波大学   グローバル教育院  

    2021年4月 - 2026年3月

研究テーマ・研究キーワード

  • 研究テーマ: 生命現象解明に向けた光技術の開発を行っています。具体的には神経科学を理解する上で重要なマウスの脳内分子の可視化を目指した、高感度な物理化学を基盤とした分子イメージングの開発を行っています。

    研究キーワード: 非線形光学、振動分光学、神経科学、バイオイメージング

    研究期間: 2026年4月 - 現在

受賞

  • 日本分光学会年次講演会若手講演賞

    2026年6月   日本分光学会  

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    受賞区分:国内学会・会議・シンポジウム等の賞 

  • コニカミノルタ光みらい若手奨励金

    2025年10月   日本光学会  

  • The 8th Taiwan International Symposium on Raman Spectroscopy (TISRS 2023) Best Poster Award

    2023年6月  

論文

  • Chromatic aberration compensation in multiplex coherent Raman microscopy using a Bessel beam 査読

    Ryosuke Oketani, Kyosuke Tanaka, Yusuke Murakami, Hideaki Kano

    Optics letters   2025年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Near-Infrared Coumarin-Hemicyanine Hybrid Dyes Bearing an Intramolecular Nucleophile for Activatable Fluorescence and Raman Imaging. 査読

    Hiroyoshi Fujioka, Ryo Sakamoto, Kotaro Hiramatsu, Yusuke Murakami, Minori Masaki, Minoru Kawatani, Satoshi Matsumoto, Ryosuke Kojima, Yasuteru Urano, Hideaki Kano, Mako Kamiya

    Analytical Chemistry   2025年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • A ferroelectric proton conductor with colossal polarization induced by in-plane symmetry breaking in a two-dimensional coordination polymer. 査読 国際共著

    Yanqing Song, Yuta Tsuji, Kunihisa Sugimoto, Takashi Kikuchi, Yuxin Shi, Yusuke Murakami, Kotaro Hiramatsu, Benjamin Le Ouay, Masaaki Ohba, Ryo Ohtani

    Chemical science   2025年7月

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    記述言語:英語  

  • Seamless Tiling and Scalable Coherent Raman Spectroscopic Analysis Reveals Developmental Maturation of Lipids in the Mouse Brain. 査読 国際共著

    Minori Masaki, Yusuke Murakami, Zuliang Hu, Ting-Hao Chen, Philippe Leproux, Masashi Yanagisawa, Hideaki Kano

    Analytical Chemistry   2025年7月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Lipids constitute approximately half of the dry weight of the brain and play a crucial role in the rapid conduction of action potentials and neurotransmission. However, the maturation of the lipid composition underlying complex brain functions matures during development remains unclear. We developed a sensitive coherent Raman spectroscopic imaging system in which the laser beam is always aligned with the optical axis of the microscope. This system enables seamless stitching-free imaging with a scalable field-of-view and broadband wavelength coverage. Using this unique combination system, we analyzed temporal and spatial changes in lipid composition from the fetal stage to adulthood across mouse brain regions. Our findings revealed that regions with a high total lipid ratio gradually expanded throughout the brain during size growth. While the total lipid ratio continuously increased, changes in lipid composition, particularly ceramide accumulation, were observed in the fiber regions during periods of increasing axonal myelination. High-resolution coherent Raman imaging of the fetal brain revealed that radial glial cells (the most undifferentiated cells) exhibited a higher total lipid ratio than the more differentiated cells. These results can be detected using this system and provide fundamental insights into lipid maturation across different brain regions and developmental stages.

  • Label-Free Visualization of Ciliary Rootlets in Mouse Brain. 査読

    Yusuke Murakami, Mutsuo Nuriya, Zuliang Hu, Masaki Tomioka, Ryosuke Oketani, Kotaro Hiramatsu, Philippe Leproux, Akihito Inoko, Sakiko Honjoh, Hideaki Kano

    Analytical Chemistry   2025年7月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Neuronal primary cilia play important roles in brain development, sensory perception, and neurogenesis. Rootletin, a fibrous protein composed of coiled-coil motifs, is a key structural component of ciliary rootlets and is essential for understanding ciliary functions. However, the precise mechanisms by which Rootletin influences ciliary dynamics and impacts neuronal function remain largely unknown, primarily due to the challenges associated with visualizing these structures. In this study, we present a label-free, rapid, and highly sensitive method for visualizing Rootletin molecules in brain tissue. This platform integrates a second harmonic generation (SHG) microscope with background reduction by a one-step chemical pretreatment. Additionally, we employed coherent anti-Stokes Raman scattering imaging to simultaneously determine the cellular regions and intracellular locations of SHG signals. Applying this multimodal multiphoton imaging approach to the mouse hippocampus revealed that neuronal ciliary rootlets exhibited highly organized and specific intracellular distributions. Moreover, measurements of cultured neurons revealed that ciliary rootlets were detected even in immature neurons. These findings highlight the utility of our label-free imaging platform in developmental and neuroscience research, providing a powerful tool for characterizing ciliary dynamics and neuronal function.

  • Exploring liquid–liquid phase separation in vitro and in vivo using multimodal nonlinear optical imaging 査読 国際共著

    Yusuke Murakami, Mia Obuchi, Hiroshi Kamizawa, Shinichi Miyazaki, Akihiro Kishimura, Ryosuke Oketani, Kotaro Hiramatsu, Philippe Leproux, Yu Hayashi, Kentaro Shiraki, Hideaki Kano

    Analytical Science   2025年3月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Molecular Fingerprinting of Mouse Brain Using Ultrabroadband Coherent Anti-Stokes Raman Scattering (CARS) Microspectroscopy Empowered by Multivariate Curve Resolution-Alternating Least Squares (MCR-ALS). 査読 国際共著

    Yusuke Murakami, Masahiro Ando, Ayako Imamura, Ryosuke Oketani, Philippe Leproux, Sakiko Honjoh, Hideaki Kano

    Chemical & biomedical imaging   2024年10月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Backward multiplex coherent anti-Stokes Raman (CARS) spectroscopic imaging with electron-multiplying CCD (EM-CCD) camera 査読 国際共著

    Yusuke Murakami, Minami Yoshimura, WJ Niels Klement, Atsuki Oda, Ryo Sakamoto, Miho Yakabe, Atsushi Matsumoto, Ryosuke Oketani, Philippe Leproux, Junichi Ikenouchi, Wesley R Browne, Hideaki Kano

    Optics Continuum   2023年9月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Opalescence arising from network assembly in antibody solution 査読

    Yoshitaka Nakauchi, Suguru Nishinami, Yusuke Murakami, Toshihiko Ogura, Hideaki Kano, Kentaro Shiraki

    Molecular pharmaceutics   2022年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

  • Spectroscopic second and third harmonic generation microscopy using a femtosecond laser source in the third near-infrared (NIR-III) optical window. 査読

    Yusuke Murakami, Minori Masaki, Shinichi Miyazaki, Ryosuke Oketani, Yu Hayashi, Masashi Yanagisawa, Sakiko Honjoh, Hideaki Kano

    Biomedical optics express   2022年2月

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    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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書籍等出版物

  • Coherent Anti-Stokes Raman Scattering (CARS) Microscopy and its Applications in Life Sciences

    Shinichi Miyazaki, Yusuke Murakami, Sakiko Honjoh, Yu Hayashi, Hideaki Kano(担当:共著)

    Taylor and Francis 

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    記述言語:英語   著書種別:教科書・概説・概論

講演・口頭発表等

  • Toward label-free molecular imaging of whole brain and brain cells using ultra-broadband multiplex CARS microspectroscopy

    第99 回日本生理学会大会 特別国際シンポジウム JST-CREST Opt Bio”/WPI-IIIS Joint Symposium  2022年3月 

  • Toward Whole Brain Label-free Molecular Imaging with Single-cell Resolution Using Ultra-broadband Multiplex CARS Microspectroscopy

    2022年2月  SPIE

  • Nonlinear optical imaging of biological tissues using a 1.55 μm femtosecond laser source

    Tsukuba conference  2021年9月 

  • 広帯域電子共鳴CARS/CSRS顕微分光法の開発

    2026年6月  日本分光学会

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    開催地:福井  

  • Molecular Identification of Second harmonic generation (SHG) sources in Mouse brain by Multimodal imaging with ultra-broadband multiplex coherent anti Stokes Raman scattering (CARS)

    2023年  SPIE

  • Label-free Sub-cellular Imaging of Mouse Brain using Multiplex CARS and SHG Microspectroscopy”,

    8th Asian Spectroscopy Conference  2023年9月 

  • Multimodal imaging of whole mouse brain using Ultra-broadband multiplex coherent anti-Stokes Raman scattering (CARS) and second harmonic generation (SHG)

    The 8th Taiwan International Symposium on Raman Spectroscopy (TISRS 2023)  2023年6月 

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共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 新規in vivo非線形ラマン分光イメージング法の開発による睡眠制御機構の解明

    研究課題/領域番号:23KJ0267  2023年4月 - 2026年3月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  

教育活動概要

  • 分野の垣根を越えて、多様な知識や技術を柔軟に組み合わせられる人材の育成に力を入れています。特に、光を利用して、これまで目で捉えることのできなかった生命現象や生体分子を可視化する技術の開発を教育に取り入れています。学生が光学、化学、生物学などの幅広い分野を横断的に学び、得られた画像や分光情報から、生物の構造や機能を分子・化学的な視点で理解できる力を養うことを目指しています。また、装置の構築から試料の観察、データ解析、結果の考察までを一貫して経験することで、自ら課題を発見し、異なる分野の知識を活用しながら解決策を考えられる実践的な研究能力を育成します。