農学研究院 環境農学部門
(併任)植物フロンティア研究センター, システムLSI研究センター, マス・フォア・イノベーション連係学府, 生物資源環境科学府 環境農学専攻, 農学部 生物資源環境学科, 農学研究院 附属アクアバイオリソース創出センター
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 材料力学、機械材料、環境・農学 / 農業環境工学、農業情報工学、社会基盤(土木・建築・防災) / 地盤工学、社会基盤(土木・建築・防災) / 土木材料、施工、建設マネジメント
総合理工学研究院 連携融合理工学部門
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 計測工学、ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 材料力学、機械材料
工学研究院 航空宇宙工学部門
(併任)工学部 航空宇宙工学科, 工学府 航空宇宙工学専攻
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 材料力学、機械材料、ナノテク・材料 / 複合材料、界面
システム情報科学研究院 情報エレクトロニクス部門
(併任)マス・フォア・イノベーション連係学府, システム情報科学府 電気電子工学専攻, 工学部 電気情報工学科
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 計測工学
システム情報科学研究院 情報エレクトロニクス部門
(併任)システム情報科学府 電気電子工学専攻, 工学部 電気情報工学科
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 通信工学
総合理工学研究院 環境理工学部門
(併任)総合理工学府 総合理工学専攻, 工学部 融合基礎工学科
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 熱工学
高等研究院
(併任)医用生体工学研究センター, 工学研究院 化学工学部門
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / バイオ機能応用、バイオプロセス工学、ライフサイエンス / 生体医工学
薬学研究院 臨床薬学部門
(併任)薬学部 臨床薬学科
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / バイオ機能応用、バイオプロセス工学、ライフサイエンス / 生物物理学
システム情報科学研究院 情報エレクトロニクス部門
(併任)医用生体工学研究センター, 超伝導システム科学研究センター, ■廃止組織■ 附属高度ICT人材教育開発センター, 日本エジプト科学技術連携センター, システムLSI研究センター, マス・フォア・イノベーション連係学府, システム情報科学府 電気電子工学専攻, 工学部 電気情報工学科
ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 電子デバイス、電子機器
システム情報科学研究院 情報エレクトロニクス部門
(併任)プラズマナノ界面工学センター, システム情報科学府 電気電子工学専攻, マス・フォア・イノベーション連係学府, 工学部 電気情報工学科
エネルギー / プラズマ科学、エネルギー / プラズマ応用科学、ナノテク・材料 / 応用物理一般、ナノテク・材料 / 薄膜、表面界面物性、ものづくり技術(機械・電気電子・化学工学) / 電子デバイス、電子機器