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1.	伊藤浩史, 低温による生物リズムの消失「温度ストレスによる生体応答ダイナミクス」, 2023.04.
2.	Hiroshi Ito, Theoretical aspects of temperature effect on cyanobacterial circadian clock in Cyanobacterial Physiology From Fundamentals to Biotechnology, 2022.05.
3.	Ito H, Murayama Y, Kawamoto N, Seki M Iwasaki, H., Circadian Rhythms in Bacteria and Microbiomes, 2021.06, Damped Oscillation in the Cyanobacterial Clock System.
4.	伊藤浩史, 生物リズムの生まれ方、種生物学研究, 種生物学会, 2015.12.
5.	Ito H, Dynamics of Circadian Oscillation in the SCN, 2014.06, A reconsideration of loss of circadian rhythms under low temperature conditions.

1.	Motohide Seki, Hiroshi Ito, Evolution of self-sustained circadian rhythms is facilitated by seasonal change of daylight, 10.1098/rspb.2022.0577, 2022.11.
2.	Takuma Sugi, Hiroshi Ito, Masaki Nishimura, Ken H. Nagai, C. elegans collectively forms dynamical networks, Nature communications, 10.1038/s41467-019-08537-y, 10, 1, 2019.01, [URL], Understanding physical rules underlying collective motions requires perturbation of controllable parameters in self-propelled particles. However, controlling parameters in animals is generally not easy, which makes collective behaviours of animals elusive. Here, we report an experimental system in which a conventional model animal, Caenorhabditis elegans, collectively forms dynamical networks of bundle-shaped aggregates. We investigate the dependence of our experimental system on various extrinsic parameters (material of substrate, ambient humidity and density of worms). Taking advantage of well-established C. elegans genetics, we also control intrinsic parameters (genetically determined motility) by mutations and by forced neural activation via optogenetics. Furthermore, we develop a minimal agent-based model that reproduces the dynamical network formation and its dependence on the parameters, suggesting that the key factors are alignment of worms after collision and smooth turning. Our findings imply that the concepts of active matter physics may help us to understand biological functions of animal groups..
3.	Murayama Y, Kori H, Oshima C, Kondo T, Iwasaki H, Ito H, Low temperature nullifies the circadian clock in cyanobacteria through Hopf bifurcation, Proceedings of National Academy of Sciences, 114, 5641-5646, 2017.05, Cold temperatures lead to nullification of circadian rhythms in many organisms. Two typical scenarios explain the disappearance of rhythmicity: the first is oscillation death, which is the transition from self-sustained oscillation to damped oscillation that occurs at a critical temperature. The second scenario is oscillation arrest, in which oscillation terminates at a certain phase. In the field of nonlinear dynamics, these mechanisms are called the Hopf bifurcation and the saddle-node on an invariant circle bifurcation, respectively. Although these mechanisms lead to distinct dynamical properties near the critical temperature, it is unclear to which scenario the circadian clock belongs. Here we reduced the temperature to dampen the reconstituted circadian rhythm of phosphorylation of the recombinant cyanobacterial clock protein KaiC. The data led us to conclude that Hopf bifurcation occurred at ∼19 °C. Below this critical temperature, the self-sustained rhythms of KaiC phosphorylation transformed to damped oscillations, which are predicted by the Hopf bifurcation theory. Moreover, we detected resonant oscillations below the critical temperature when temperature was periodically varied, which was reproduced by numerical simulations. Our findings suggest that the transition to a damped oscillation through Hopf bifurcation contributes to maintaining the circadian rhythm of cyanobacteria through resonance at cold temperatures..
4.	Shingo Gibo, Hiroshi Ito, Discrete and ultradiscrete models for biological rhythms comprising a simple negative feedback loop, Journal of Theoretical Biology, 2015.05.
5.	Yuuki Kawasaki, Hiroshi Ito(corresponding author), Hisashi Kajimura, Equilibrium frequency of endosymbionts in multiple infections based on the balance between vertical transmission and cytoplasmic incompatibility, PLoS ONE*, 10.1371/journal.pone.0094900, 9, e94900, 2014.04.
6.	Nakajima M, Ito H, Kondo T.(Equally contributed), In vitro regulation of circadian phosphorylation rhythm of cyanobacterial clock protein KaiC by KaiA and KaiB, FEBS Letters*, 10.1016/j.febslet.2010.01.016, 584, 898-902, 2010.01.
7.	Ito H, Mutsuda M, Murayama Y, Tomita J, Hosokawa N, Terauchi K, Sugita C, Sugita M, Kondo T, Iwasaki H. (Equally contributed), Cyanobacterial daily life with Kai-based circadian and diurnal genome-wide transcriptional control in Synechococcus elongatus., Proceedings of National Academy of Sciences* , 10.1073/pnas.0902587106, 106 (2009), 14168-14173, 2011.07.
8.	Ito H, Kageyama H, Mutsuda M, Nakajima M, Oyama T, Kondo T., Autonomous synchronization of the circadian KaiC phosphorylation rhythm, Nature Structural and Molecular Biology, 10.1038/nsmb1312, 14, 1084-1088, 2007.11, [URL].
9.	Yoshida T, Murayama Y, Ito H, Kageyama H, Kondo T. (Equally contributed), Non-parametric entrainment of the in vitro circadian phosphorylation rhythm of cyanobacterial KaiC by temperature cycle , Proceedings of National Academy of Sciences, 10.1073/pnas.0806741106, 106, 1648-1653, 2009.01.

1.	伊藤浩史, 時間生物学と微分幾何学の融合による波形データ解析手法の提案, 学術変革　A「データ記述科学」領域会議, 2024.01.
2.	Hiroshi Ito, Fabrication of Biological Rhythms and Patterns, ReCAPS 10th Anniversary Seminar, 2023.11.
3.	Hiroshi Ito, Observation of Circadian Rhythms of Non-model Plants via Gene Gun, Plant and Chronobiology Talks for Youth, 2023.11.
4.	Hiroshi Ito, What makes cellular clock more precise?, 時間生物学会年会, 2022.09.
5.	Hiroshi Ito, Fabrication of biological oscillators and patterns, Adaptive Motion of Animals and Machines, 2023.06.
6.	伊藤浩史, 概日リズムと温度に関する理論的研究または落ちこぼれの時間生物学, 時間生物学会, 2018.10.
7.	伊藤浩史, Exposing light, temperature and electric stimulations to squid’s ultradian rhythm, 九州山口沖縄リズム研究会６, 2017.04.
8.	伊藤浩史, Chronobiology based on amplitude, 時間生物学会, 2018.10.
9.	伊藤浩史, Enhancement of circadian amplitude via resonance , circadian clock of cyanobacteria during 1991-2017, 2017.03.
10.	伊藤浩史, Circadian rhythms under low temperature conditions, 時間生物学会, 2016.11.
11.	伊東晋、伊藤浩史, シアノバクテリア概日リズムダークパルスに対する頑健性, 時間生物学会, 2016.11.
12.	伊藤浩史, ケンサキイカ色素胞収縮リズムの温度依存性, 頭足類学を紡ぐ, 2015.08.
13.	伊藤浩史, 生物リズムの制御：光・温度・電気, 九州山口リズム研究会第四回, 2015.03.
14.	伊藤浩史, 生物リズムと温度, 時間生物学会年会, 2014.11.
15.	上妻多紀子、伊藤浩史, 植物の概日リズムに及ぼす環境温度の影響, 時間生物学会年会, 2014.11.
16.	大島千明、伊藤浩史, 低温下におけるシアノバクテリアの概日リズムの共鳴現象, 時間生物学会年会, 2014.11.
17.	伊東晋、牧野雄一郎、伊藤浩史, シアノバクテリア概日リズムに対する短いダークパルスが与える影響, 時間生物学会年会, 2014.11.
18.	儀保伸吾、伊藤浩史, 差分法・超離散法による体内時計のモデル化, 時間生物学会年会, 2014.11.
19.	伊藤浩史, ケンサキイカ色素胞から探るリズムと温度の関係, 動物行動学会, 2014.11.
20.	伊藤浩史, ケンサキイカの色素胞収縮リズムの温度依存性 , 日本動物学会年会, 2014.09.
21.	伊藤浩史, Cyanobacterial circadian clock is nullified by low temperature through Hopf bifurcation, JSMB/SMB 2014, 2014.07.
22.	伊藤浩史, 生物リズムと温度, 九州山口リズム研究会第三回, 2014.03.
23.	伊藤浩史, Cyanobacterial circadian rhythms are nullified under low temperature conditions via Hopf bifurcation , Q-bio winter, 2013.02.
24.	伊藤浩史, Cyanobacterial circadian rhythms are nullified under low temperature conditions via Hopf bifurcation , AROB 2013, 2013.01.
25.	伊藤浩史, 村山依子, 郡宏, 八木田和弘, 低温環境下の概日リズムの普遍性, 時間生物学会, 2012.09.
26.	伊藤浩史, 村山依子, 郡宏, 八木田和弘, 低温環境下の概日リズムの普遍性, 時間生物学会, 2012.09.
27.	伊藤浩史, 縮約の思想と生物学, 定量生物の会第四回年会, 2012.01, 第三回年会に引き続き、カピカピの理論研究者と、乾ききりたくない実験研究者の問答形式によって、理論研究者の生命現象に対する経験、知識、ものの見方についてお伝えします。そのようなものが果たして生物学の実験研究の役に立つのか？これを考えるためにも、まずは共有することから始めたいと思います。　今回は生物のリズム現象に話題を絞ります。例えば、毎日の寝起きのリズムを作る概日時計や、体節の節構造を作るときに現れる遺伝子発現のリズムなどが良い例です。さて、リズムという現象をどのように研究していけばいいのでしょうか？　一つは、解像度をできる限りあげて、リズムを生み出す分子メカニズムを明らかにするという立場があります。ここ10年ほどは分子生物学のツールの発展に伴ってこのアプローチは成功し、リズムの生成に関係する分子をたくさん同定しました。この結果わかってきたことの1つは、分子の種類や、分子のネットワークはリズムごとに異なっていて、必ずしも共通性があるわけではないということです。　一方、理論研究者の持つ「縮約」という思想は、「むしろ解像度を下げて現象を観察せよ」という教えです。逆説的ですが、逆に見えていなかった共通性が見えてくることがあります。そして様々な現象を見通しよく理解する助けになることがあります。このチュートリアルでは、神経発火や概日リズムを具体例に、理論研究者が縮約の視点からどのように現象と向き合っているのかを解説します。また、理論的視点から取り組んだ実験研究についても紹介します。.

年度	外国語雑誌査読論文数	日本語雑誌査読論文数	国際会議録査読論文数	国内会議録査読論文数	合計
2023年度	2	1	0	0	3
2022年度	3				3
2016年度	2	1			3
2015年度	2				2
2014年度	2				2
2013年度	2	1			3
2012年度	1	1			2

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