九州大学-研究者情報 [井上大介 (助教) 芸術工学研究院未来共生デザイン部門]

細胞骨格の非平衡自己組織化メカニズムについて再構築実験系を用いた研究、DNAナノテクノロジーと合成生物学をベースとしたタンパク質工学、2D/3DCGやVR技術、AI技術を駆使したバイオアート作品
キーワード：細胞骨格, モータータンパク質, 自己組織化, アクティブマター, 集団運動, DNAオリガミ, 微細加工技術,
2010.11～2024.03.

従事しているプロジェクト研究

DNAオリガミを用いた細胞骨格微小管の構造デザインおよびその知見の人工材料応用
2019.03～2021.04.

研究業績

主要原著論文

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1.	Inoue Daisuke, Ohashi Keisuke, Takasuka E. Taichi, Kakugo Akira , In Vitro Synthesis and Design of Kinesin Biomolecular Motors by Cell-Free Protein Synthesis, ACS Synthetic Biology, 10.1021/acssynbio.3c00235, 12, 6, 1624-1631, 2023.06, [URL].
2.	Triclin Sarah; Inoue Daisuke; Gaillard, Jérémie; Blanchoin, Laurent.; Théry, Manuel (等貢献度), A new perspective on microtubule dynamics: destruction by molecular motors and self-repair, Comptes Rendus. Biologies*, DOI:10.5802/crbiol.59/, 344, 3, 297-310, 2021.07, [URL].
3.	Afroze, Farhana; Inoue, Daisuke; Farhana, Tamanna; Hiraiwa, Tetsuya; Akiyama, Ryo; Kabir, Arif Md. Rashedul; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira (等貢献度）, Monopolar flocking of microtubules in collective motion, Biochemical and Biophysical Research Communications*, 10.1016/j.bbrc.2021.05.037, 563, 73-78, 2021.05, [URL].
4.	Triclin, Sarah; Inoue, Daisuke; Gaillard, Jérémie; Htet, Zaw Min; DeSantis, Morgan E.; Portran, Didier; Derivery, Emmanuel; Aumeier, Charlotte; Schaedel, Laura; John, Karin; Leterrier, Christophe; Reck-Peterson, Samara L.; Blanchoin, Laurent; Théry, Manuel (等貢献度), Self-repair protects microtubules from destruction by molecular motors, Nature Materials, 10.1038/s41563-020-00905-0, 2021.01, [URL].
5.	Inoue, Daisuke; Kabir, Arif Md. Rashedul; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki, Kakugo, Akira, Mechanical Stimulation-Induced Orientation of Gliding Microtubules in Confined Microwells, Advanced Materials Interfaces, 10.1002/admi.201902013, 2020.04, [URL].
6.	Inoue, Daisuke; Gutmann, Greg; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Konagaya, Akihiko; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kakugo, Akira, Adaptation of Patterns of Motile Filaments under Dynamic Boundary Conditions, ACS nano, 10.1021/acsnano.9b01450, 2019.10, [URL].
7.	Inoue, Daisuke; Obino, Dorian; Pineau, Judith; Farina, Francesca; Gaillard, Jérémie; Guerin, Christophe; Blanchoin, Laurent; Lennon‐Duménil, Ana‐Maria; Théry, Manuel, Actin Filaments Regulate Microtubule Growth at the Centrosome, The EMBO journal, 10.15252/embj.201899630, 38, 11, e99630, 2019.03, [URL].
8.	Triclin, Sarah; Inoue, Daisuke１（等貢献度）; Gaillard, Jeremie; Htet, Zaw Min; De Santis, Morgan; Portran, Didier; Derivery, Emmanuel; Aumeier, Charlotte; Schaedel, Laura; John, Karin; Christophe, Leterrier; Samara, Reck-Peterson; Laurent, Blanchoin; Manuel, Thery, Self-Repair Protects Microtubules from their Destruction by Molecular Motors, bioRxiv*, 10.1101/499020, 499020, 2018.12, [URL].
9.	Sasaki, Ren; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Anan, Shizuka; Kimura, Atsushi P; Konagaya, Akihiko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira, Construction of Artificial Cilia from Microtubules and Kinesins through a Well-Designed Bottom-up Approach, Nanoscale, 10.1039/C7NR05099B, 10, 14, 6323-6332, 2018.02, [URL].
10.	Keya, Jakia Jannat; Inoue, Daisuke（第1著者と等貢献度）; Suzuki, Yuki; Kozai, Toshiya; Ishikuro, Daiki; Kodera, Noriyuki; Uchihashi, Takayuki; Kabir, Arif Md Rashedul; Endo, Masayuki; Sada, Kazuki, High-Resolution Imaging of a Single Gliding Protofilament of Tubulins by HS-AFM, Scientific reports*, 10.1038/s41598-017-06249-1, 7, 1, 6166, 2017.07, [URL].
11.	Inoue, Daisuke; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Sada, Kazuki; Gong, Jian Ping; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira;, Sensing Surface Mechanical Deformation Using Active Probes Driven by Motor Proteins, Nature communications, 10.1038/ncomms12557, 7, 12557, 2016.07, [URL].
12.	Inoue, Daisuke; Mahmot, Bulbul; Kabir, Arif Md Rashedul; Farhana, Tamanna Ishrat; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira, Depletion Force Induced Collective Motion of Microtubules Driven by Kinesin, Nanoscale, 10.1039/C5NR02213D, 7, 43, 18054-18061, 2015.07, [URL].
13.	Inoue, Daisuke; Kabir, Arif Md Rashedul; Mayama, Hiroyuki; Gong, Jian Ping; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira, Growth of Ring-Shaped Microtubule Assemblies through Stepwise Active Self-Organisation, Soft Matter, 10.1039/C3SM50704A, 9, 29, 7061-7068, 2013.05, [URL].
14.	Kabir, Arif Md Rashedul; Wada, Shoki; Inoue, Daisuke; Tamura, Yoshiki; Kajihara, Tamaki; Mayama, Hiroyuki; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira; Gong, Jian Ping, Formation of Ring-Shaped Assembly of Microtubules with a Narrow Size Distribution at an Air–Buffer Interface, Soft Matter, 10.1039/C2SM26441B, 8, 10863-10867, 2012.11, [URL].

主要総説, 論評, 解説, 書評, 報告書等

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1.	井上大介, 微小管の破壊と修復：分子モーターによる微小管の新陳代謝, 生物物理, 2022.02.
2.	井上大介、角五彰, 微小管の機械的刺激への応答と適応, アグリバイオ１２月号, 2019.12.
3.	Hamant Olivier, ＠Inoue Daisuke, Bouchez David, Dumais Jacques, Mjolsness Eric, Are microtubules tension sensors?, Nature Communications, 10.1038/s41467-019-10207-y, 2019.05, [URL].
4.	井上大介、角五彰, 微小管は機械的刺激をセンシングする動的プローブである , 月刊細胞１１月号, 2019.11.
5.	井上大介、Arif Md. Rashedul Kabir、角五彰、Gong Jian Ping, Soft actuators: Materials, modeling, applications, and future perspectives, Chapter 36. ATP-Driven Bio-Machine, Springer, 0.1007/978-4-431-54767-9_34, 2014.11, [URL].
6.	井上大介、伊藤正樹、Arif Md. Rashedul Kabir、角五彰、Gong Jian Ping, 生体分子モーターの能動的自己組織化によるATP駆動型運動素子の創製と実用化に向けて, 化学工業, 2012.06.
7.	井上大介、角五彰、Gong Jian Ping, 生体分子モーターの動的自己組織化が生むエキゾチック機能, 化学工業, 2011.06.

主要学会発表等

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1.	井上大介, 微小管とアクチンの物理的クロストークによるネットワークサイズ制御, 第４５回日本分子生物学会年会, 2022.11.
2.	井上大介, Cytoskeletal Self-organization and Molecular Bioart, Symposium on Active Matters , 2022.11.
3.	井上大介, 生体分子モーターの試験管内合成システムの開拓, 第１４回分子モーター討論会, 2022.07.
4.	井上大介, 精密分子集積技術を用いた、分子人工筋肉の合成, 2022年吉田学術教育振興会贈呈式, 2022.11.
5.	井上大介, サイエンス＆バイオビジュアリゼーション, 身心一体科学研究会公開講演会2022, 2022.09.
6.	井上大介, In vitro 細胞骨格モデルによる微小管-アクチンクロストークの可視化, 身心一体科学研究会公開講演会2022, 2022.09.
7.	井上大介, 細胞骨格のマイクロ・ナノスケールでの空間配置制御法, 第８６回日本植物学会, 2022.09.
8.	Inoue Daisuke, Control of Microtubules in Collective Motion by Microflow Channel, 分子サイバネ国際ワークショップ, 2022.03.
9.	＠井上大介, 細胞骨格の微細加工技術 , 分子サイバネティクス領域セミナー, 2022.02.
10.	Inoue Daisuke, Fantastic Voyage in VRCell world, VIZBI - Visualizing Biological Data, 2021.03, [URL].
11.	Inoue Daisuke, Designing artificial microtubule nucleus by DNA nanotube, ASCB Cell Bio Virtual 2020, 2020.05, [URL].
12.	井上大介, 微小管のIn vitro自己組織化, 植物細胞生物研究会2020, 2020.10.
13.	Inoue Daisuke, Artificial γ-TuRC made by DNA origami, 第58回日本生物物理学会年会, 2020.09.
14.	Inoue Daisuke, Design of microtubule lattice structures using DNA origami seeds, EMBO/EMBL Symposium Microtubules from atoms to complex systems, 2020.06.
15.	Daisuke Inoue, Franky Djutanta, Rizal F. Hariadi, Design of microtubule lattice structures using programmable DNA origami seeds, The 20th RIES-HOKUDAI International Symposium, 2019.12.

作品・ソフトウェア・データベース等

1.	井上大介, Midjourney, ACS Synthetic Biology Volume 12, issue 6, 2023の表紙, 2023.06 画像精製AI Midjourneyで絵素材を作成し、それらをコラージュした作品, [URL].
2.	井上大介, Midjourney, Nanotech2023におけるパネル展示絵素材提供, 2023.02 Nanotech2023におけるパネル展示絵素材提供、AI技術を取り入れて作成したバイオアート作品.
3.	Inoue Daisuke, Micropatterning of reconstituted microtubules, 2022.03 マイクロパターニング技術により、細胞骨格微小管で文字を描き、株式会社オプトラインと共同開発した全反射蛍光顕微鏡により撮影したバイオアート作品, [URL].
4.	Inoue, Daisuke, VRCell World, 2021.05 細胞内の世界を再現したVR世界。VISBI 2021で発表。VR-SNS「VRChat」内で一般公開中。World名「VRCell world」, World ID: wrld_2a19ff33-f57f-40fe-92e1-3c7105f4c5db , [URL].
5.	Inoue, Daisuke, Inside back cover image for Chemical Communications, issue 8, 2020, 2020.01, [URL].
6.	Inoue, Daisuke; Kabir, Arif Md. Rashedul; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki, Kakugo, Akira, Cover image for Advanced Materials Interfaces vol7, No13, 2020, 2020.06, [URL].
7.	Inoue, Daisuke; Gutmann, Greg; Nitta, Takahiro; Kabir, Arif Md Rashedul; Konagaya, Akihiko; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Hess, Henry; Kakugo, Akira, Inside cover image for ACS Nano, vol13, 2019, 2019.11, [URL].
8.	Inoue, Daisuke; Obino, Dorian; Pineau, Judith; Farina, Francesca; Gaillard, Jérémie; Guerin, Christophe; Blanchoin, Laurent; Lennon‐Duménil, Ana‐Maria; Théry, Manuel, Front cover image for The EMBO Journal, vol38, 2019, 2019.06, [URL].
9.	Inoue, Daisuke, Illustrations for DNA origami and biomolecular motor based artificial muscle, 2019.05, [URL].
10.	Sasaki, Ren; Kabir, Arif Md Rashedul; Inoue, Daisuke; Anan, Shizuka; Kimura, Atsushi P; Konagaya, Akihiko; Sada, Kazuki; Kakugo, Akira, Front cover image for Nanoscale, issue 14, 2018, 2018.02, [URL].
11.	Inoue, Daisuke, Illustration for "Dissipation of contractile forces: the missing piece in cell mechanics.", Molecular Biology of the Cell, 28, 1825-1832, 2017, 2017.07 細胞内アクチン収縮に関する総説論文の挿絵イラスト, [URL].
12.	Inoue, Daisuke; Mahmot, Bulbul; Kabir, Arif Md Rashedul; Farhana, Tamanna Ishrat; Tokuraku, Kiyotaka; Sada, Kazuki; Konagaya, Akihiko; Kakugo, Akira, Front cover image for Nanoscale, issue 43, 2015, 2015.07, [URL].
13.	Kabir Arif, Md Rashedul, Wada Shoki, Inoue Daisuke, Tamura Yoshiki, Kajihara Tamaki, Mayama Hiroyuki, Sada Kazuki, Kakugo Akira, Gong Jian Ping, Front cover image for SoftMatter, issue 42, 2012, 2012.09, [URL].

学会活動

所属学会名

アメリカ細胞生物学会

日本生物物理学会

学会大会・会議・シンポジウム等における役割

2022.09.09～2022.09.09, Design x Bioinformatics Workshop, 企画立案, 運営.

2022.11.22～2022.11.22, Symposium on Active Matters, 企画立案・運営, セッションチェア.

2022.09.26～2022.09.27, 身心一体科学研究会公開講演会, 企画立案, 運営, セッションチェア.

学会誌・雑誌・著書の編集への参加状況

2022.03～2022.09, Journal of Integrative Bioinformatics, 国際, 編集委員.

学術論文等の審査

年度	外国語雑誌査読論文数	日本語雑誌査読論文数	国際会議録査読論文数	国内会議録査読論文数	合計
2022年度	2				2
2021年度	1				1

受賞

2022 Optics Photo Contest Prize, IDEX Health & Science , Semrock, 2022.03.

Les Prix 2021 de l'Academmie des Sciences, フランス科学アカデミー, 2021.12.

日本学術振興会特別研究員DC2/PD採用, 日本学術振興会, 2014.04.

平成30年風戸研究奨励賞, 公益財団法人風戸研究奨励会, 2019.03.

上原記念生命科学財団リサーチフェローシップ, 2016.01.

15th RIES-Hokudai International Symposium, 北海道大学電子科学研究所, 2015.12.

卓越研究員事業採用, 日本学術振興会, 2019.10.

北海道大学平成25年度理学研究院研究者養成支援金, 北海道大学, 2013.07.

研究資金

科学研究費補助金の採択状況(文部科学省、日本学術振興会)

2023年度～2024年度, 学術変革領域研究(A), 代表, ミニマル人工脳の構築に向けた、細胞骨格制御ツールボックスの開拓.

2021年度～2022年度, 学術変革領域研究(A), 代表, 細胞の極性形成機構を模倣した神経細胞型分子ユニットの開発.

2020年度～2023年度, 若手研究, 代表, DNAプレ-プログラミングによる生体分子モーターマイクロ・ナノデバイスの構築.

日本学術振興会への採択状況(科学研究費補助金以外)

2019年度～2023年度, 卓越研究員事業, 代表, 細胞のデザイナー“細胞骨格”に習う自己組織化デザイン.

2014年度～2015年度, 特別研究員, 代表, 微小管能動的自己組織化における力学刺激の効果.

共同研究、受託研究(競争的資金を除く)の受入状況

2021.04～2022.03, 代表, 微小管アスター位置決めの試験管内アッセイ系の構築に向けた線虫ダイニンの精製技術の確立.

寄附金の受入状況

2022年度, 公益財団法人吉田学術教育振興会 , 吉田学術教育振興会令和4年度学術奨励金.

2020年度, 公益財団法人日揮・実吉奨学会, 日揮・実吉奨学会研究助成金 / 動くDNAナノ構造体のアセンブリ技術の構築.

2019年度, 公益財団法人風戸研究奨励会, 風戸研究奨励費/DNAオリガミを用いた細胞骨格微小管のデザイン.

2016年度, 上原記念生命科学財団, 上原記念生命科学財団リサーチフェローシップ.

学内資金・基金等への採択状況

2021年度～2021年度, 令和３年度エネルギー研究教育機構若手研究者・博士課程学生支援プログラム, 代表, ATP駆動型アクティブ流体による高感度バイオセンサーデバイスのデザイン.

2021年度～2021年度, QRプログラムわかばチャレンジ, 代表, マイクロコンタクトプリンティング法を用いた人工細胞骨格モデルの構築.

2013年度～2013年度, 理学研究院研究者養成支援金採用, 代表, 微小管の脱動的自己組織化における外部刺激の影響に感する研究.

2015年度～2015年度, ナノテクプラットフォーム研究設備の試行的利用, 代表, 微小管の動的自己組織化における空間的制約効果の影響.

九大関連コンテンツ

pure2017年10月2日から、「九州大学研究者情報」を補完するデータベースとして、Elsevier社の「Pure」による研究業績の公開を開始しました。

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