膵臓癌の新規治療標的の同定。特にエンハンサープロモーターにおける遺伝子発現制御領域に注目して
キーワード：全ゲノムシーケンス
2022.08～2022.08.

リキッドバイオプシー計画
キーワード：リキッドバイオプシー
2019.04～2023.03.

根治手術可能な乳がん患者に対する SK-818 の安全性評価のための医師主導治験
キーワード：医師主導治験、ＳＫ-818、ドラッグリポジショニング
2018.06～2018.06.

遺伝性消化器腫瘍のゲノム解析
キーワード：Lynch症候群大腸がん症例、多遺伝子パネル解析
2017.04～2019.03.

大腸がんの進化についての研究
キーワード：進化、大腸がん
2018.06～2018.06.

原発巣から転移巣への進化
キーワード：全エキソーム、RNAseq、ＴＣＲレパトア
2018.06～2018.06.

オールジャパン体制による食道がん等消化器難治がんの全ゲノム配列データ及び臨床情報の収集・解析と創薬開発・全ゲノム医療基盤構築
2023.04～2023.06, 代表者：柴田　龍弘, 東京大学.

難治性消化器がんの前がん病変特異的な活性化エンハンサー領域/遺伝子の可視化と創薬標的となる特異的ゲノム変異の同定
2021.04～2026.03, 代表者：三森功士, 九州大学, 九州大学.

大腸がん微小転移巣形成機構の理解による新規予防治療戦略の確立
2020.04～2022.03, 代表者：大島　正伸, 金沢大学がん進展制御研究所, 金沢大学がん進展制御研究所.

国際共同研究に資する大規模日本人がんゲノム・オミックス・臨床データ統合解析とゲノム医療推進に向けた知識基盤構築
2020.04～2022.03, 代表者：柴田龍弘, 国立研究開発法人国立がん研究センター 研究所, 国立研究開発法人国立がん研究センター 研究所.

難治がん特異的エピゲノム変異を標的にしたctDNA検出法の確立
2020.06～2022.03, 代表者：三森功士, 九州大学, 九州大学.

大腸がん細胞の多段階悪性化が制御する微小環境形成ネットワーク機構の解明と新規予防治療戦略の確立
2019.04～2022.03, 代表者：大島正伸, 金沢大学がん進展制御研究所
本研究開発課題では、マウスモデルおよびヒト検体を用いた解析により、遺伝子変異の蓄積に基づく大腸がん細胞の悪性化機構を明らかにし、悪性化がん細胞による微小環境制御機構と、がん細胞と微小環境のネットワークが誘導するがん悪性化機構を解明する。それにより、ネットワーク関連因子を標的とする新規大腸がん予防・治療戦略を確立する。その目標達成のため、大腸がんの（１）多段階悪性化機構、（２）悪性化に伴う微小環境形成、（３）微小環境制御の分子機構、（４）免疫反応・抵抗性誘導、の４項目の研究を推進する。.

微小環境多様性に連動する難治がんの分子遺伝学的多様性創成機構の解明と新たながん治療法・予測医療技術の開発
2016.05～2022.03, 代表者：柴田龍弘, 東京大学, 東京大学.

癌の再発・転移に関与するnon-coding RNAの同定とその機序解明
2011.04～2014.03, 代表者：三森功士, 九州大学病院別府病院
これまでに大腸癌および胃癌症例の原発巣および骨髄を各分画（骨髄：癌細胞分画/単球分画/CD45分画/全血分画、原発巣癌細胞、転移巣癌細胞）に分け、RNAを抽出し、microRNAマイクロアレイ, mRNA マイクロアレイを行う系の確立を行った。現在のところ、大腸癌15例胃癌5例程度であるが、microRNA-遺伝子間におけるネットワーク、および癌細胞—ニッチ細胞間での連絡についての解析を進めている。
　われわれの目的は消化器癌の転移・再発のマーカーを明らかするには循環血液あるいは骨髄液中に癌細胞を検出することを目的とするのではなく、「癌細胞側因子」と「宿主側因子」とにおいて転移再発と明確な関連を有する因子を求めることにある。両面からの俯瞰的研究により、真の予測マーカーを求める。特に多くの遺伝子を一度に抑制しうるファインチューナーとしての役割を担うmicroRNAを含むnon coding RNAは、発現の臨床的意義が注目され、ncRNA-遺伝子pathwayの同定と機能解析が急がれる。
　若手研究Ｓ助成の際、各施設毎に倫理委員会を通過した後、消化器癌患者の骨髄と末梢血液の集積を開始した。骨髄は４つの分画(癌細胞分画、マクロファージ分画、CD45陽性分画、全血)に分けて、microRNAマイクロアレイおよび遺伝子マイクロアレイを施行する。転移陽性症例特異的miRについてはマーカーとしての意義を明らかにすることはもちろんのこと、標的遺伝子pathwayを決め、機能解析をすすめさらに絞り込めるマーカーを求める。
＜大腸癌症例＞これまでに15例の症例に対して骨髄穿刺、末梢血採取を行った。Preliminaryに実施したDukes B,C8例のアレイを実施しいくつかの有力なmicroRNAを同定した。現在データの集計中である。.

固形癌転移におけるmicroRNA profileの決定および重要なmiRNAの同定
2008.07, 代表者：三森功士, 九州大学生体防御医学研究所外科, 九州大学生体防御医学研究所外科（日本）
　消化器癌の転移・再発の成立においては、癌幹細胞と宿主側細胞とが転移形成に必須の新たな「転移巣社会」を形成すると推察されるため、両面から俯瞰的研究により転移再発機構を解明し、診断・治療の標的を求めることが重要である。このため、われわれは、平成17年度-19年度にわたり、『胃癌および大腸癌の骨髄・末梢血・リンパ節中における転移形成能を有する遊離癌細胞(Isolated Tumor Cell, ITC)の検出とその臨床応用に関する研究(九州大学 森　正樹 班長)』班を組織して、胃癌および大腸癌の転移機構の解明と真のマーカー同定のための研究を行ってきた。特に、癌細胞側の因子として、ごく最近注目されている「癌幹細胞」について、消化器癌からの分離同定を鋭意進めている。また骨髄中および末梢血液中に存在する癌細胞(各々disseminating tumor cell;DTCおよびcirculating tumor cell; CTC)をpan-CK抗体にて検出し、panCK陽性症例について原発巣のmicroarray解析を進めている。一方、宿主側因子としては、腹膜播種転移陽性胃癌患者の骨髄液と非転移胃癌患者の骨髄液よりtotal RNAを抽出し比較のためにmicroarrayを行い転移・再発を来す消化器癌症例において特異的に発現する遺伝子群を明らかにした。特に骨髄中造血幹細胞に存在することが報告された既知の遺伝子群についてその発現の臨床的意義を明らかにし報告した(Br J Cancer 2007, Clin Cancer Res 2008, Ann Surg Oncol 2008, Clin Cancer Res 2008)。
　したがって、新たな分子標的治療の真のマーカーを世界に先駆けて同定することと、多数の症例を用いて検証し確信をえることは、転移・再発機構を解明のみではなく、転移再発の診断、治療を行う上で極めて重要である。ごく最近、数十塩基のタンパク質をコードしていないRNAが，microRNA（miRNA）として働き，遺伝子発現調節をしていることが明らかになってきた。Weinbergらは原発巣におけるmiR10bが転移を制御することを明らかにしたが、消化器癌骨髄中において存在するmicro RNAと転移・予後との関係については明らかにされていない。.

臨床検体の三次元的複層分子解析によるがん多様性創出機構の実証的解明とその克服に向けた臨床応用研究
2014.04～2016.03, 代表者：加藤　護, 国立がん研究センター研究所.

体液中マイクロRNA測定技術基盤開発
2014.04～2016.03, 代表者：落谷　孝広, 国立がん研究センター研究所.

トリプルネガティブ乳がんの転移後増殖をターゲットにした新規抗がん剤の開発
2015.08～2016.03, 代表者：三森　功士, 九州大学病院別府病院.

主要原著論文

1.	Koshi Mimori, Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis, Cancer Res, 73, 7, 2059-2069, 2013.04.
2.	Nishida N, Mimori K, Fabbri M, Yokobori T, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Ishii H, Doki Y, Mori M., MicroRNA-125a-5p is an independent prognostic factor in gastric cancer,and inhibits the proliferation of human gastric cancer cells in combination with trastuzumab., Clin Cancer Res., 17, 9, 2725-33, 2011.05.
3.	Nishida N, Mimori K, Fabbri M, Yokobori T, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Ishii H, Doki Y, Mori M., MicroRNA-125a-5p is an independent prognostic factor in gastric cancer,and inhibits the proliferation of human gastric cancer cells in combination with trastuzumab., Clin Cancer Res., 17, 9, 2725-33, 2011.05.
4.	Mimori K, Yokobori T, Iwatsuki M, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Ishii H,Mori M, FHIT Suppresses Inflammatory Carcinogenic Activity by Inducing Apoptosis in Esophageal Epithelial Cells., J Nucleic Acid Invest, 2010.05.
5.	Mimori K, Druck T, Inoue H, Hansjuerg A, Berk L, Mori M, Huebner K, Croce CM. , Cancer-specific chromosome alterations in the constitutive fragile region FRA3B., Proc Natl Acad Sci (USA), 10.1073/pnas.96.13.7456, 96, 13, 7456-7461, 1999.06.
6.	Mimori K, Druck T, Inoue H, Alder H, Berk L, Mori M, Huebner K and Croce CM, Cancer-specific chromosome alterations in the constitutive fragile region FRA3B. , Proc Natl Acad Sci (U.S.A) , 10.1073/pnas.96.13.7456, 96, 13, 7456-7461, 96: 7456-61, 1999, 1999.06.

主要学会発表等

1.	三森功士、高角 康志、井上裕、飯沼 久恵、渡邊 昌彦、田中淳一、工藤 進英、望月 英隆、楠 正人、山田一隆、森 正樹、杉原 健一 , 次世代シークエンサーを用いた真の発癌・転移高リスク者を検出するnon coding RNAの同定と外科診療における意義, 第111回日本外科学会, 2011.04, 背景】癌診療における外科医の研究目標は、1) 発癌高リスク者を囲い込み根治術例を増やすことと、2)再発高リスク患者の早期発見による根治切除例を増やすことにあり、これを実現する真の標的分子を同定したい。他方、ごく最近全ゲノムで蛋白質翻訳領域は僅か２％で9割は転写産物(microRNAを含むnon-codingRNA)として存在することが明らかとなり、真のマーカー同定のため次世代シークエンサー(NGS)による全転写産物の解析が全世界で始まっている。【対象と方法】1)発癌因子:大腸癌1758検体と健常者2962検体を集積し、全ゲノム関連遺伝子多型解析(GWAS)。癌107例原発巣よりLMDにて癌細胞採取後RNA抽出し遺伝子アレイを実施。10例はNGSにて(全転写産物解析)を実施し、発現遺伝子とのネットワーク解析をスーパーコンピュータにて実施。2)転移因子:癌転移は癌細胞と宿主側(ニッチ)細胞群の連携で成立する。大腸癌20例の骨髄を癌細胞と宿主側３分画にFACSしmiRアレイおよびNGSにて全転写産物を解析した。【結果】1)発癌因子:大腸発癌関連多型として10p14が同定され、同多型上には既知の遺伝子は存在しないが、NGS解析により多型近傍にncRNAを同定し、多型に代わる臨床的有用性を確認した。2)転移因子:NGSにより転移陽性例特異的発現ncRNA群を同定した。ncRNAによる遺伝子制御機構は極めて複雑でありNGSでは解析情報量も多く、スーパーコンピュータによる解析技術を要した。【考察】臨床的意義を有する重要なncRNAとその経路が次々と同定されることが予想される。外科切除標本や血液・骨髄標本が解析上必須であることから、外科医は標本提供のみならず知識・技術を理解し主導的役割で臨床研究を進めていきたい。.
2.	Mimori K, Clinical Significance of microRNA in Cancer Niches. , MD Anderson, Research Meeting, 2009.03.
3.	Mimori K, Saiki, Y, Mori, M., Comprehensive Analysis of the Clinical Significance of Inducing Pluripotent Stemness-Related Gene Expression in Colorectal Cancer Cells, 62th Society of Surgical Oncology (Phoenix), 2009.03.
4.	Mimori K, Comprehensive analysis of Genetic and Epidemiologic Risk Factors for Colorectal Cancer in Japan: Results of SNP, CGH and gene array analysis. , Department of Molecular Virology, Immunology and Medical Genetics Seminar, 2009.03.
5.	Koshi Mimori and Masaki Mori, IDENTIFICATION OF THE BONA-FIDE INDICATOR OF THE RECURRENCE AND METASTASIS IN SOLID CANCERS. , 第11回日独がんワークショップ, 2007.11.
6.	Mimori K, Nishida K, Ieta K, Nakamura Y, Tanaka F, Sasaki A, Inoue H, Alonso MA and Mori M., Loss of MAL Expression in Precancerous (Dysplastic) Lesion of the Esophagus, 59th Society of Surgical Oncology, 2006.03.
7.	Mimori K, Ishii H, Okamoto M, Barnard GF, Huebner K, Croce CM and Mori M, Identification of Bona-fide Characteristics of Esophageal Cancer by Adenoviral-FHIT Treatment, 58th Society of Surgical Oncology, 2005.03.

特許出願・取得

所属学会名

学協会役員等への就任

学会大会・会議・シンポジウム等における役割

学会誌・雑誌・著書の編集への参加状況

学術論文等の審査

海外渡航状況, 海外での教育研究歴